5CLS | Genus

Total Genus 125

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	125
sequence length	369
structure length	369
Chain Sequence	KVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGQYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Spiroepoxytriazoles Are Fumagillin-like Irreversible Inhibitors of MetAP2 with Potent Cellular Activity. pubmed doi rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Methionine aminopeptidase 2
total genus	125
structure length	369
sequence length	369
ec nomenclature	ec 3.4.11.18: Methionyl aminopeptidase.
pdb deposition date	2015-07-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	5clsA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	5clsA01

4U6WA 4IKUA 4B09A 4EVIA 4RGXA 1XCVA 4L18B 1O7LA 2FMLA 3CUQA 1MZBA 1ZRFA 1I1SA 3Q9VA 4EGYA 2E7XA 3ABTA 3J80Z 4U0VA 4ESFA 5LRSA 2GTXA 2P9AA 2NAZA 2IT0A 2GZWA 4O3MA 2G6PA 3IU7A 2XKOA 3E6MA 3WU1B 1QGPA 2FXAA 2COMA 1XNZA 2IA1A 1ONVA 3WGIA 1V4RA 2XIGA 2DLLA 1R5HA 2RQPA 4OIOF 1S29A 4S2RP 3BWGA 1ZG5A 2QBYB 1KQ0A 1XGMA 4LMYA 3K9TA 3BJ6A 4E70A 2DK5A 3I54A 3CB5A 4FX4A 3IWFA 1FLIA 3DKWA 4AIKA 5J6XA 5DD8A 2D1HA 2HTSA 4LB6B 1U5TA 1TBXA 3E5XA 2ZKZA 1S3JA 3CB6A 3TDZC 3HHGA 3K69A 1CF7B 3ECOA 3WTWC 4RB2C 1XGSA 3ZN0A 4FUKA 3RJPA 3E3VA 1D8KA 1S8NA 2DU9A 1FC3A 1SD6A 3SZPA 1Y0UA 2DQLA 3GWZA 4O5VA 1QNTA 2E1CA 2DTRA 1YVMA 4KICA 4A6VA 2WWYA 5ICFA 5J8CA 3GW2A 1DPRA 4IVNA 1WL9A 5HLIA 1TQPA 3PQJA 2Q94A 4L9JA 1O3TA 2PBIA 4IRGA 3P9CA 1HW5A 5JFRA 3FXQA 3EETA 3L00A 1R58A 4U71A 3GX4X 4L0ZB 4UV9A 1O7FA 1W2MA 2HYFA 2QZ8A 1U8RA 1W7PD 4BHCA 5LGNA 3P9IA 2VXZA 5IT9Z 2KRFA 3CJNA 2BN7A 2XRNA 1F9NA 2P7VB 1FOKA 1ZH5A 4EM1A 1QBJA 4H0EA 4ZYEA 3BJAA 2NNYA 5E8IA 2P6TA 4UVCA 3PQKA 3MAJA 4Q48A 2LNBA 2FBKA 3H92A 4ZZDA 5HDNA 2ZNYA 2L4MA 4FLLA 3U2RA 2ZSGA 3MR1A 2VE8A 1DP7P 3SXYA 1STZA 1FP1D 4LD5A 3R0AA 4IJAA 5IT9K 3V7SA 4KIBA 4MATA 1KU9A 1QXZA 1YO5C 2HFHA 4A12A 1YW7A 4ENKA 3O2PE 2EFQA 1HSJA 3SHFA 2EV6A 4K2EA 4ZYGA 2ZJ2A 4P96A 2EVMA 2XHKA 1FNNA 2ZCWA 4UVBA 3PKDA 3KZYA 2A61A 4XLNF 2DT5A 5E5BA 4GYIA 2RC4A 2J5PA 2XUBA 2XKPA 4HXXA 5ED4A 2JPCA 5ILSA 3N97A 1WKMA 2H94A 4B8XA 1WN1A 2DPDA 2IW2A 2DFIA 4DQ2A 3FM3A 1FWZA 3C3WA 4OIPF 1O57A 1TTYA 4HF1A 4U73A 3CTZA 3I71A 4FO8A 3L7GA 2WC2A 1FYLA 4PDKA 3CUQB 1WBQA 3GUDA 1VTNC 3FM5A 1IXCA 2GU6A 5HDKA 2GZ5A 1JHFA 4KMFA 3ISPA 1LB2A 4ZWUA 3RKXA 1YYVA 4I98B 2XAGA 3ZMDA 2UXXA 3MEXA 3IKTA 1TQIA 2H6CA 4M9XA 1XDUA 1O3QA 1MJ9A 5DDGA 3SZTA 2Z99A 1YQAA 5DUIA 1XB4A 1OPCA 3VOEA 2L54A 2MH9A 3NEUA 2HKOA 3QP6A 3F8MA 2NS0A 1T0FA 3C7JA 2GG7A 2F5EA 1OYIA 4LLGF 1Z6TA 4G94A 1U5TB 3QU3A 5L3FA 1R1TA 3KLNA 3WTUC 1IN5A 1B9NA 5K5QA 1AOYA 2EJRA 2UZKA 3DV8A 2MLKA 3K1MA 2HOWA 2P98A 4R1HA 1DDNA 4CDGA 2MC3A 4ON0A 4N9HA 1ZYRF 4R8HA 4A0ZA 4YFKF 4ZZLA 3RVAA 4KYWA 1SFEA 4CGZA 3MATA 1T6SA 4RB3C 4AIJA 3KE2A 2HYGD 1ZLJA 4G7OF 1BBYA 1YS7A 2F5DA 3D0SA 1XD7A 1XMAA 2NQ7A 3F6OA 4PGHA 2VBWA 4GGGA 1UCRA 2LSOA 4L5JA 1REPC 1ZG3A 2LF7A 4HOBA 3BIPA 3M9AA 3W6JB 2V1UA 3FF5A 3MZYA 2AS5F 1OR7A 2KIFA 4OIQF 4HV6A 4RB1A 2ZMEA 5CVUA 3EYIA 3HTSB 2ZNZA 4HA8A 1ZARA 3L2CA 4YIIA 4RS8A 5BQTA 1XSXA 3LFKA 2EB7A 1M35A 4GYGA 2BHAA 3TOAA 1HBXG 2ETHA 5CIKA 1KA8A 2Q0OA 3WTVC 4IECA 4M6YA 3S6BA 3C18A 1GHCA 2RNJA 1EH7A 3JTGA 3KP7A 1B6AA 2MD5A 1JE8A 4ESJA 5D4RA 3IRRA 3BROA 2VC0A 4CO8A 1YJ3A 1ODDA 2Q93A 4ZH4F 2BE5F 2P4WA 3TGNA 1XDSA 1X3UA 2LDUA 3BJOA 1P2FA 1T2KA 4M73A 3DPLC 2QWWA 4XSXF 1WQ2A 4IF4A 5LRRA 2O8XA 4P9UA 2HOEA 1L0OC 5KK1A 1OKRA 3TO9A 3HUGA 3KP2A 4OIRF 2R3SA 2HWVA 2W25A 3HOTA 5LHHA 2Z9OA 4A5NA 3FHZA 1XMKA 2QVOA 5D4SA 3LA2A 3BY6A 1ZREA 3MQ0A 4YFXF 3J7AO 1WRJA 2EVCA 2OBPA 1LDKB 3GFIA 1BC7C 2W85A 4KT5C 5A2QK 1JGSA 2IPQX 1FX7A 2D2WA 2YX4A 5D5WB 2L02A 3ELKA 2E1NA 4RGZ1 2GA2A 4MTEA 3R60A 4S05A 2A6HF 5ICCA 3MX6A 4ZNGA 1OYYA 4LLLA 6PAXA 4U7DA 1DPUA 2VC1A 2ZFWA 2Z33A 4M72A 4G9YA 1LDDA 3GVAA 1ULYA 3KLOA 1R1VA 2FEZA 4OINF 5K5RA 3KEOA 5LLQA 1Y1NA 3RORA 3BZ6A 3TAVA 1O0XA 3Q9SA 3V8KA 5BPIA 5JHUA 3TO7A 4D0PA 3VB2A 3PKAA 4EJOA 2PJPA 1FYKA 3D27A 1SFXA 2R7DA 4UVAA 3CLOA 3REOA 1C22A 5LEKA 3KCCA 4P55A 2CO5A 4OMZA 1KYZA 5HS9A 2BWTA 1J75A 4FLIA 2FSWA 4Z2YA 2EA4A 3PKCA 2QUFA 4KDPA 2EV5A 3I0TA 3LAJA 3I5UA 5ERIA 5CE6A 5AIQA 3WTSC 4MEYF 2A07F 2DI3A 3CO6C 2C6YA 4BHPA 4LLNA 3CO7C 5LGUA 1QXYA 2VBXA 1EH6A 4MEXF 3KP6A 2B0LA 1WL6A 2ZXJA 2YR2A 3LA3A 3GO5A 3V8JA 3HRTA 3FMRA 3J80K 4RAYA 3NQOA 2BWVA 1G3YA 1QPMA 2V6CA 4G7HF 3L7WA 2UWMA 2K02A 3S2WA 1XN7A 4FT8A 4YFNF 2XAHA 3P9KA 3E5UA 4U7BA 3G3ZA 1KGSA 3G73A 3HRSA 1CGPA 3C1DA 3PFIA 3DEUA 4NQWA 1W4MA 4KUMA 5F1RA 2HKXA 2MH2A 2ZMEB 1K78A 5LEJA 4O6JA 2X4HA 3P7NA 4Q4ZF 3M8FA 4M9ZA 1A16A 2CWEA 2FF4A 1PDNC 3V7RA 2CG4A 2QENA 3ZQ7A 2ZO4A 3K2ZA 4G6DA 1YTYA 3F8CA 2OU2A 5HLGA 2IJLA 5CVIA 1JAWA 3F23A 3LWFA 2VOPA 1IRGA 3Q6DA 3PKBA 1FPQA 4IRHA 4FHTA 2HQNA 1I6XA 2DK8A 2P99A 1FSHA 5J8FA 1GXPA 1USSA 3KP3A 4B28A 2P5LC 2WV0A 3DXJF 1HKTA 4LK1F 2QQAA 1H0MA 4NB5A 1G4DA 3JAMZ 1JXSA 2RV8A 3RIRA 2HDCA 2MATA 3I64A 3GEZA 4L9NA 2RDPA 2XGXA 4WXCA 3HHHA 1MATA 3MZHA 2GG8A 4WCGA 5DUKA 1IUYA 3E5QA 4N9IA 2ELHA 3WTZA 2V1DA 4IKTA 1C24A 1BIBA 2LF8A 4L9VA 1ZG1A 3BP8A 5CLSA 2BHBA 4EM0B 1R22A 2FRHA 1PUEE 3KZZA 4LJZF 2W57A 4IHTA 1A04A 3TDUC 4U1BA 2F5CA 2RGVA 2J5OA 2OD5A 2M5WA 5CVRA 1LQ1A 2PLYA 4EM2A 2DQRA 1PP8F 1HKSA 1R5GA 2GU5A 1H9GA 1EV7A 2V9VA 1QO0D 4IKRA 2P5VA 3TB5A 1QZYA 4A5MA 2M87A 3F21A 3KEQA 5BS6A 5CDLA 1XGNA 4UV8A 2K4JA 2STWA 3T1BA 3B02A 4N0BA 2NYXA 3E6BA 1O3RA 1Z05A 1TLHB 3RKYA 1TW3A 2L01A 2NNNA 3KETA 4F7ZA 1S6LA 3DFGA 2X0LA 2A68F 3F8FA 1PV9A 1GVJA 1I27A 2Q92A 1P6RA 3U9GA 1TNTA 2GA1A 5DD4A 1U6GA 4MQVA 5DEQA 1UHMA 2M8EA 5HVQC 2PEXA 4RZYA 3GF2A 1LEBA 1SD4A 1RIOH 2CGPA 1E2XA 2EA2A 1ZRDA 3IU8A 4KN7X 1T38A 1U78A 3BDDA 4BH9A 4L5IA 3T0YA 2AXLA 3CTAA 2MLGA 2CYYA 4M74A 4CICA 5FB2A 3WTXC 3RPQA 4S2TP 2M1BA 5D5VB 1KYWA 4EV0A 4QWQA 2Q2EA 2UXNA 1HQCA 3TOBA 1F5TA 3AAFA 5E1ZB 2HEOA 2OA4A 2FBIA 2BHDA 2FBHA 1R1UA 3ZMUA 1SD7A 4U70A 2PN6A 1IRFA 1UFMA 4IDYA 3T5XA 2KIMA 2WTEA 3Q5FA 3RI4A 3DQVC 4FLJA 2R7FA 4HYEA 5CNXA 3IG4A 1K78B 4A6EA 4Y17A 2NQ6A 2BV6A 4S00A 1R23A 3V7CA 3LAPA 2DW4A 1G3WA 1GXQA 1YS6A 2GG9A 3CUOA 1FBUA 2OZ6A 2NRAC 4RZZA 1TW2A 3OOPA 5CVVA 2W24A 2KJBA 3I4PA 5LHGA 2LKPA 3U1DA 4ZYDA 2GXGA 4I2OA 4QR8A 4U76A 2HTJA 4MHGA 1S7AA 4AIHA 4L0YB 1HSTA 4LFUA 5CDVA 4WX9A 3COAC 1Z7UA 2VBYA 1LVAA 2RN7A 5FLXZ 4EGZA 2H27A 2JZYA 2V3YA 4ZWPA 4IHSA 4P9FA 3WTYC 2IA2A 1KU7A 1HKQA 3LQRA 4PGGA 1RI7A 4AWXB 4XRFA 2OZUA 1G6NA 2KKOA 2BB7A 3HRMA 5HS8A 5CYVA 1UHWA 1QQIA 2PMUA 1I5ZA 2CSOA 4BHBA 3RTRA 2V3XA 2IA0A 3I53A 4EJTA 2Y75A 3O6BB 1J9IA 1MD0A 1P4XA 5H20A 2EWNA 2Y48A 4ENNA 3FMQA 5E20A 4A0XA 4LGWA 2VODA 1R00A 3WGGA 1SAXA 2G9WA 3H3UA 1Z1DA 1QZZA 3E97A 4KIGA 4Q47A 2FQ3A 2H09A 2GU4A 5TRDA 5K1YA 2QLZA 1CHMA 4G8XA 2FMYA 3MCZA 2M30A 1KU3A 1LEAA 1B9MA 1JHHA 1IW7F 3K1NA 1HXDA 1IN4A 5D5UB 2A69F 2YU3A 3IRQA 2JTVA 1D8JA 2Z3YA 1J7KA 2EFWA 2VT2A 4EQQA 4RB0A 3DPTA 1MKMA 4HX7A 1H9TA 5LHIA 2IVMA 4LK0F 1KU2A 2K4BA 5DYMA 5D6EA 2KIUA 3BIQA 5ILUA 4M9SA 4KM3A 2MA3A 3KFWX 1XSDA 5DCFA 4BXUA 2DPUA 1IN8A 1BC8C 4PCQA 4MTDA 5BPDA 2TDXA 3HSEA 4OOKA 5AIPA 4KMUX 3F8NA 4PNCA 2JT1A 3NRVA 4U6JA 3LA7A 4IRIA 2OAZA 3E6DA 1FT9A 5D5XB 3EQLF 3IL2A 5BOXA 2G7UA 4I01A 3CUQC 3O3KA 4A6DA 2ZBKA 4IF7A 1IN6A 1G3TA 5DV5A 3MFKA 4EGEA 2BGCA 4A2UA 3QU6A 2P5KA 1WSUA 1C27A 4HX4A 4U0YA 1W7PA 3EDPA 4IXAA 3IU9A 2EK5A 2E7WA 3T8RA 2MBFA 2EFOA 2O61A 1WWXA 3L24A 3QOPA 1V3FA 1YIOA 4TV7A 2A3SA 3L9FA 3ULQB 2QQ9A 2GG0A 3F72A 2GG3A 2F2EA 4ENJA 1XSVA 4U88A 3BOQA 1DUXC 5ICEA 5D8LB 3WGHA 3KP5A 4KFCA 3VFZA 3WTTC 3JW4A 4KNYA 4MNUA 5HOOA 3RYPA 2D1VA 3EUHA 1E17A 2CFXA 3HTUA 1U5TC 4EJUA 1SFUA 2IRFG 1RUOA 3EYYA 1HW2A 1FBQA 4CXFA 4Y15A 2YX7A 3I59A 1Z9CA 2HGCA 2K86A 2DAOA 4HDVA 2A5YB 1XCBA 4EJWA 1W5SA 5E18F 2ESNA 3FXUA 5E1XA 1G3SA 2XAFA 4LG0A 5E17F 1BI0A 4IPAA 2EV0A 3HSFA 4GXOA 5HS7A 1B59A 5CJ9A 1MJAA 1D3YA 4AVPA 3GZ5A 3K0LA 2ACJA 4U75A 5DCMA 4IKSA 1RZ4A 1RUNA 1C0WA 3WU0A 3FWEA 1UB9A 4XSZF 4S01A 2B3KA 1YW8A 5D6FA 2FOKA 2GG5A 4HLYA 2GXBA 4DNCA 4I7HA 3R4KA 3RDIA 5FCFA 4Q5SF 4P5OA 1J5YA 2VBZA 4WF2A 2EFNA 2F5FA 4UNOA 1F1ZA 2QQBA 4U6EA 3HIFA 3KP4A 1ZAOA 2O0YA 4I0BA 3JSPA 2O3FA 4HQMA 2EVOA 2P8TA 4R79A 4IU6A 2FNAA 3QP5A 2B3HA 3LSTA 4RGRA 3DP7A 1KP0A 3IKVA 1RNLA 3BPXA 1J2XA 2HS5A 4RAZA 2OQRA 3R61A 2CW0F 3WG9A 1S7OA 4QLCU 2HZTA 3SFZA 3OV8A 1C23A 4G7ZF 4A6WA 3R0JA 4CYDA 3VEPA 1N51A 4PZJA 2BYVE 2H6BA 2OQGA 2OKNA 5FFZA 1L3LA 3ECHA 3J81Z 3GZ6A 5L3CA 3ERED 5FCHA 2M45A 4GO1A 2V3ZA 1IXRC 4UUVA 3WE2A 1MJBA 3JAMK 2HR3A 2XV4S 3FX3A 4HZFA 1W5TA 1Z91A 1SMTA 5FD6A 2RKHA 2BWUA 1ZHFA 2PQ8A 2YSRA 5L3EA 1BI1A 2Q95A 3HRUA 1YFHA 1O3SA 4HF0A 1P4WA 2PMHA 5BMZA 3F8BA 3J81K 4Z7MA 4PV4A 3W6KB 2GWRA 4HBLA 3ZMTA 4U6ZA 4Y13A 3ROUA 1T39A 1AWCA 4M71A 4KIFA 3IWZA 4HLXA 3ZMVA 4JQFA 4ZYHA 2IP2A 1W7PB 4HX8A 4JK1X 3BPVA 4KN4X 1R7JA 3B73A 5L3BA 3ML6A 5KVRA 1IAWA 4JBAA 3V8LA 4CHUA 3HSRA 3MWMA 1R36A 1J59A 2BHCA 1IXSB 3M8EA 1LJ9A 1LDJA 4FKCA 4FO7A 3GFLA 4BQAA 1LNWA 4UHTA 4RGSA 2DBBA 2HQRA 4LB5A 2BWXA 4YIFA 4YG2F 2CQKA 1ON2A 4HF2A 4BNCA 2BH3A 2L4AA 5ICGA 3H3ZA 4BAYA 2Q8KA 5H6QA 1TNSA 2GAUA 2GGBA 4CZZA 5JVTA 1MDMA 3FMSA 1BN5A 1BOAA 5HDGA 2XROA 2QYOA 2XASA 1B1BA 1FZPB 3I59B 4EJVA 4U6CA 3VODA 2A6EF 2BEOA 2XAQA 2KJCA 1MGTA 1B4AA 2PI0A 3M1EA 3F3XA 2BWYA 4R60A 4NHJA 1IZ1A 2DO7A 5IT3A 2XAJA 4LG0B 4MQ9F 1SD5A 2Y0MA 3SQNA 1IN7A 1ZLKA 5FFXA 2GG2A 2STTA 1IF1A 2K7LA 2VE9A 1SMYF 1J0RA 1FSEA 2V79A 4WK8F 4FLKA 2QM3A 2QBYA 2VOOA 5DCMB 1ZRCA 2L3DA 5JR3A 5CDEA 1WI9A 4BYYA 1ON1A 5L3GA 3GXOA 3K1PA 4AD9A 1ZGJA 5HLHA 1PP7U 1P92A 2EFPA 2O6GE 3JSOA 2GGCA 3QAHA 4OOIA 4I09A 4WXDA 2XVCA 3ZN1A 1NHAA 2P7CB 2PFBA 4KA4A 4HAMA 4GCVA 4WXHA 3F6VA 1CF7A 1HW1A 1K79A 1ZN2A 1XGOA 5F64A 2GU7A 4EMSA 3TKYA 4I0AA 5K5OA 3D5LA 5FD5A 2FA5A 1U2WA 3QPHA 1OMIA 1D5VA 5EEHA 3LQQA 4U69A 3RYRA 3ZP5A 2P6SA 3R6SA 4ASNA 2V1XA 2G7HA 5D8KB 1WY2A 3WE3A 3GLXA 5LGTA 2VONA 1W7VA 4OU0A 4FX0A 2ESHA 2IW5A 2VT3A 1P4AA 3BITA 3ZPLA 2JPBA 2O03A 3WODF 3RPUA 3FXRA 2GQQA 3GFJA 3HOSA 4ENMA 5FLXK 4I02A 2K27A 2FE3A 3GFMA 1KQ9A 2Z5UA 1BM9A 1KQ8A 4A0YA 4XLPF 1BI2A 1FP2A 5L3DA 2D45A 1U3EM 3T8TA 4HDUA 2ISYA 3ZMSA 3N4MA 1F4KA 5A2QZ 4WWCA 3IC7A 4OMYA 1EH8A 1K6OA 3DF8A 1ZGAA 2JRTA 1USTA 2B3LA 1C21A 1WLRA 1BJAA 5F6FA 3FZVA 2BWWA 2YPRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MDM B;  1BI3 A;  4JUQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5CLSA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations