5JFR | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	369
structure length	366
Chain Sequence	KVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGQYRIHAGKTVPIVKGTRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Discovery of potent, reversible MetAP2 inhibitors via fragment based drug discovery and structure based drug design-Part 2. pubmed doi rcsb
molecule tags	Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Methionine aminopeptidase 2
total genus	122
structure length	366
sequence length	369
ec nomenclature	ec 3.4.11.18: Methionyl aminopeptidase.
pdb deposition date	2016-04-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	5jfrA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	5jfrA01

1IN5A 2A68F 3RKXA 4EVIA 2VC0A 1JHHA 5FLXZ 2ZMEB 4U69A 4MEXF 5CDLA 3BJOA 1H9GA 1HQCA 2G9WA 3WTXC 3PKBA 3WGGA 1OPCA 5H20A 4YFNF 5HS9A 5BPIA 2MC3A 5TJJA 2R7FA 3R61A 3F8FA 3HHGA 1IUYA 2PMHA 2Q93A 1B59A 3N97A 4CYDA 3P7NA 4U6ZA 2G7HA 4ESJA 1REPC 3DPLC 3QPHA 2DPUA 2GG5A 4A12A 4LK0F 1QNTA 5IT9Z 2E1CA 3TB5A 1KYZA 2BWTA 4N9HA 4KIBA 1KYWA 3LAJA 1FYMA 3Q9VA 1R1TA 1ODDA 1ZHFA 4M9ZA 5KK1A 2EFOA 1O0XA 3WU1B 1R36A 1U5TC 1XMKA 4UV9A 3K1MA 1J59A 1JXSA 3V7SA 4EM1A 4FO7A 4KIFA 1W4MA 3MZHA 2EFPA 4EM2A 1BBYA 4EGEA 4G7OF 3QU3A 4EJVA 2ZMEA 3U2RA 1JE8A 2PFBA 4H0EA 1BN5A 2H09A 5HDGA 3E6CC 3V7RA 5JFRA 2MBFA 3DPTA 4PV4A 3FHZA 3CDHA 1XSVA 1KU9A 4RGSA 1LDJA 1W2MA 2H6CA 1S3JA 2DK8A 5L3BA 2M5WA 2P5KA 4MQVA 1J7KA 3BITA 2DU9A 1E17A 1SMYF 2DPDA 1DPRA 5F1RA 1FY7A 2W25A 1FLIA 1WY2A 3JAMZ 1R22A 3IU7A 3O6BB 2QBYB 3TKYA 5CLSA 3HYIA 3KP7A 2F2EA 2NRAC 2MA3A 1PDNC 3I71A 4IRHA 4EV0A 4ESBA 1SD7A 2IPQX 4IF7A 1FBUA 2GG0A 4GCVA 1L3LA 3DV8A 2E7WA 2H27A 5FGMA 4LJZF 1W5SA 4RS8A 4M73A 4IDYA 2XAJA 2D45A 2M45A 3WGHA 3GYHX 2K7LA 1R5GA 4UVBA 2L3DA 5LGTA 5TRDA 1A16A 1XD7A 1QZZA 3PKAA 1GXPA 1F9NA 3MR1A 3J81Z 3WTTC 5F64A 4M72A 3CLOA 2QZ8A 2XV4S 4HDUA 1YW7A 2ZBKA 4Q47A 2H6BA 2CWEA 1QO0D 4XRFA 2K27A 3F6OA 1PP7U 1BJAA 1FSEA 2XAFA 1Q1HA 2QBYA 1MGTA 3HRUA 4G6QA 1TNSA 2IA2A 5J8CA 3ZP5A 1UHWA 1LNWA 1K79A 1TLHB 2EA2A 1SFUA 1MJAA 4U6WA 1EV7A 4GGGA 1UHMA 2ZSGA 2LDUA 1R58A 4U7BA 4FUKA 2IRFG 4A6DA 2NQ7A 3CJNA 4G9YA 4JK1X 4I09A 5ILUA 2D1VA 1ZLJA 2O03A 5JVTA 5D5WB 1EH6A 5CVJA 5DCFA 3CUQC 5ILSA 3T5XA 3D27A 1GXQA 5CVIA 4EGYA 5D6FA 1P2FA 4Z7MA 3TAVA 1FT9A 5HOOA 2JPBA 1FOKA 1LB2A 2GQQA 4U71A 2BEOA 4KN7X 4KDPA 2GA2A 3D0SA 5DD8A 4OU0A 4RGRA 3JSPA 2EVOA 2GG3A 1AOYA 2P98A 1OYWA 2PLYA 4OIRF 3RI4A 1C22A 1ZARA 3OOPA 1B6AA 3M8EA 1H0MA 2A6HF 3QRFF 1YFHA 4HA8A 1OYYA 2OQRA 1C24A 2VOOA 4NHJA 4MATA 1RIOH 2FNPA 4IJAA 4FKCA 4ZH4F 2EB7A 1V4RA 4I98B 4XSXF 3QOPA 1KQ0A 2W57A 4RZZA 2WV0A 2KKOA 2CFXA 2NYXA 4OINF 4BHCA 2GU7A 5HS7A 1K7AA 4KIGA 3CTZA 1TNTA 4Y13A 4MTEA 4RB1A 4LD5A 2HKOA 3BDDA 4I0AA 3MATA 1G3TA 2BB7A 4KM3A 4I7HA 3EETA 5ICCA 4CGZA 3MFKA 5D5UB 3H3ZA 5LEJA 3WODF 2HYFA 2IVMA 3F72A 4S00A 1S6LA 3REOA 1O3TA 1HW1A 2UZKA 4GYGA 1Z6TA 1ON1A 4ENJA 2IA1A 2GIVA 1SAXA 5ICGA 4WK8F 1S29A 1O7LA 2RNJA 4HQEA 1YS6A 2FSWA 1FSHA 3I59B 1ZAOA 3M8FA 1S7OA 3LQRA 1B9MA 2FMYA 2GWRA 3SZTA 3QPTA 5CVUA 2HKXA 2OZUA 3T0YA 2MD5A 4BXUA 2QM3A 2OQGA 2VBXA 1J0RA 4CICA 3LA7A 3E6BA 3B73A 4U76A 1XN7A 2GG2A 4FHTA 2EFWA 4HX4A 3P9KA 4WF2A 3P9IA 4BHPA 3CB6A 2V9VA 2ESNA 4R8HA 2O61A 2P7VB 1GHCA 2NS0A 3GX4X 1N51A 2KIUA 2ELHA 1ZYRF 4EJOA 2Y48A 4U75A 1XNZA 1I27A 5CVVA 4LLLA 2GG8A 2STWA 4ZWUA 3TDZC 3IG4A 1G3WA 3HUGA 3R0JA 2C6YA 2M30A 3HRMA 2FOKA 3F6VA 3WU0A 4HQMA 1T38A 3F21A 4R79A 3PFIA 4HAMA 2WTEA 2YR2A 1R5HA 2PQ8A 2PI0A 3IU8A 4QR8A 3T1BA 3KZYA 3EUHA 3JTHA 4L9NA 5AONA 1TTYA 2GXGA 4KMUX 4ENKA 3WTVC 3IHUA 5LHGA 3PQJA 3L9FA 1TQPA 3QP5A 5HVQC 2DQRA 5D8LB 2BGCA 1U3EM 3RDIA 3KETA 1IRGA 3GW2A 2EVMA 5L3FA 3WE2A 1I5ZA 3KP4A 4PZJA 3ZN1A 3HOTA 4FLKA 2AS5F 2BH3A 2XAGA 1FC3A 1LEBA 3E6DA 3ELKA 4DNCA 2RQPA 4KMFA 3HSFA 3GZ6A 4KN4X 2HWVA 3I0TA 2EVCA 1BC8C 1LVAA 2ZXJA 3GFJA 2KJCA 3KE2A 5FCHA 4HLXA 3HTSB 3ABTA 2TDXA 2P9AA 4IKRA 3RPUA 2J5PA 4A6VA 1R1UA 1U78A 2DTRA 5DDGA 1D3YA 2G7UA 2BHDA 3LSTA 4RGZ1 4KYWA 3BPVA 1QXZA 1W7PD 4MHGA 2JPCA 5D8KB 5HDKA 3DFGA 3H3UA 1ZN2A 4CZZA 4G7ZF 3ABUA 1YO5C 1IF1A 1PUEE 1YQAA 3VB2A 3TDUC 5CYVA 2IP2A 5CE6A 4IPAA 1P92A 5ICEA 4FLIA 2DAOA 2PJPA 2HOEA 2QUFA 4JQFA 3QAHA 2G6PA 1XGOA 2A6EF 1HW5A 5E20A 5AIQA 1OR7A 2BHAA 4L0ZB 1QXWA 2QENA 5LGUA 4WX9A 2F5CA 4OOKA 4ON0A 3KFWX 1XB4A 2LKPA 5ED4A 1FBSA 3GEZA 4F7ZA 3V4GA 1SD6A 1YG2A 5EEGA 4AIKA 4HW0A 3NQOA 3T8RA 2GG7A 4ASNA 5L3GA 1O3SA 2FEZA 2BWSA 4EJTA 1C0WA 2M1BA 3OV8A 5ICFA 4R1HA 3F8MA 4UXNA 3FXQA 4RAZA 4OMYA 1ON2A 2B3LA 4EMSA 2GGBA 1U8RA 1HXDA 4WCGA 3GO5A 4N0BA 2VT3A 3U1DA 2BV6A 4G94A 2V1XA 1DUXC 3FX3A 1A04A 1DPUA 2P6TA 4AVPA 3BJAA 1SFXA 3L7GA 1QGPA 2NNNA 2EV5A 3K9TA 1XSXA 2XROA 1CHMA 4ETSA 2K86A 3L09A 1WQ2A 2PG4A 3LA3A 4M6XA 4D0PA 3E3VA 4HDVA 4I2OA 3WTSC 4EJWA 2HS5A 4A6WA 4Z2YA 3ZMDA 1STZA 3ROUA 3VOEA 4KNYA 1ZREA 2RC4A 2FBHA 3HOSA 2BBYA 1CF7B 1KU3A 3PQKA 3S2WA 2HYGD 4O6JA 4IKUA 3DP7A 3BROA 4M9XA 4S04A 1ULYA 4QLCU 2VBZA 3K1NA 4IVNA 2ZFWA 5L3CA 3Q5FA 3TO6A 2W24A 3RYRA 4PCQA 2HFHA 2JRTA 1MDMB 1I1SA 1T98A 1KQ9A 2P6SA 1TQMA 2X4HA 5H6QA 1FP1D 1I1GA 1P4AA 5DCMB 1W7PB 4DQ2A 3SQNA 3NRVA 3RYPA 2PEXA 2STTA 2J5OA 3ERED 3VODA 1ZG5A 1XGNA 2Z5UA 5E5BA 2BN7A 2Q94A 2OA4A 2Q8KA 3GZ5A 2YPRA 1T39A 2DW4A 4N9IA 5LLQA 4LB5A 1FYKA 4A5NA 3DQVC 2EWNA 1IN7A 2JSCA 2XHKA 3SHFA 4M71A 2A3SA 2A69F 4HF2A 3V7CA 3WE3A 4IKTA 5E17F 2CSOA 1CF7A 2FU4A 4AIJA 2RDPA 1IXRC 5DD4A 3CTAA 1YTYA 4U6EA 3ZMUA 3GLXA 4IECA 3O2PE 2BHBA 1MDMA 3F8NA 2O8XA 2ZKZA 1FYLA 1P4XA 3LAPA 1JAWA 1CGPA 5DCMA 4IHSA 4E70A 2A61A 2L54A 3FWEA 2IW2A 5K5RA 4U0VA 2L01A 4A5MA 4ZNGA 1D8JA 1MATA 3BZ6A 1XCVA 2ADUA 2MLGA 3ECHA 3LQQA 2BWUA 4ZWPA 2KIFA 1YYVA 2E7XA 5K1YA 3S6BA 3EDPA 3AAFA 4PGHA 4HF1A 4P96A 4B28A 3VEPA 3BIQA 4G7HF 1W7VA 2BWWA 3R60A 2V3YA 5FFXA 3IRRA 1C23A 1F1ZA 4U7DA 1K6OA 4XLPF 5JHUA 4HOBA 1HSJA 4U6JA 2Y75A 1KQ8A 5DUIA 2BHCA 2LSOA 4L5IA 2Q0OA 2XIGA 2VXZA 2QWWA 3DKWA 2UXNA 4P5OA 3Q6DA 2XKPA 1Z6RA 3CO7C 3PKDA 4YFKF 1ONVA 3JSOA 5D5XB 3GWZA 3GFMA 4HBLA 1J2XA 1WBQA 1I6XA 1UFMA 1HKTA 1YW8A 3M1EA 1HBXG 2P7CB 2FQ3A 2EV6A 4MTDA 2BWXA 3RVAA 3IRQA 5CDVA 1R1VA 1O3RA 1BOAA 1L0OC 3FF5A 2F5EA 2HTSA 1XMAA 2VBYA 2MLKA 1B4AA 4L9TA 2P5VA 1Z7UA 3WTZA 4CHUA 1WL6A 2BWVA 1FX7A 2GXBA 3B02A 2FXAA 2PN6A 5FCFA 5BS6A 4IKSA 1TW2A 4A2UA 4BAYA 4B09A 2EFNA 2FRHA 4Q4ZF 3FMSA 2RN7A 3TO7A 3KP2A 1B9NA 5CIKA 2GZ5A 3ZMZA 2IA0A 1U2WA 5DV5A 3IWFA 4U88A 5HS8A 3F8BA 5DYMA 3TQNA 1MJ9A 5H6RA 4AWXB 1S8NA 2B0LA 1O7FA 4I0BA 3KP5A 3RKWA 1IN8A 3SZPA 3MX6A 4LB6B 4ENNA 1ZRDA 1B1BA 2R3SA 5CDEA 1AWCA 2RKHA 4M6YA 1LQ1A 2XAQA 5LRSA 2B3HA 2Z99A 2F5FA 1YLFA 3I59A 4BHBA 4Y15A 3WTUC 1J5YA 5E8IA 1HKSA 2CW0F 3EQLF 5E8GA 4LLGF 2W85A 4RB3C 3E5XA 4ENMA 3L2CA 5BPDA 3NEUA 2QQAA 2KRFA 2BWYA 3L24A 1QXYA 5A2QK 4K2EA 3E6MA 1UB9A 3DF8A 1D8KA 2LNBA 2OD5A 3K2ZA 3RKYA 4L0YB 5LHIA 1OKRA 4FT8A 2QLZA 3ZQ7A 2WC2A 2FMLA 4GYIA 2CG4A 1WSUA 4S2RP 3MQ0A 2OKNA 1D5VA 1BI3A 1USTA 2DFIA 3BIPA 2FBKA 4RGXA 5EEHA 2DLLA 1F5TA 5K5OA 4HV6A 2ISYA 3GFLA 2MH9A 4TV7A 1WRJA 4S01A 2D2WA 1ZGAA 1IXSB 3ISPA 3IKTA 3DXJF 2V3ZA 3ML6A 1Z05A 4LFUA 2Z9OA 2O0YA 3DEUA 4NB5A 2A07F 4UNOA 2NQ6A 1BI0A 4Q48A 1KU2A 3SXYA 4UUVA 3ZPLA 2VE8A 4HXXA 3FMRA 2Z3YA 4PGGA 1XGSA 3KLOA 2IW5A 4XSZF 1IZ1A 1J9IA 3VFZA 2ZNYA 1FP2A 1R00A 2ZCWA 5CJ9A 1C27A 4HV5A 1FBQA 1FPQA 5LRRA 2WWYA 3COAC 2Q95A 2ZO4A 4LMYA 2LF8A 4U0YA 3H92A 1BI2A 1PP8F 2P4WA 1HSTA 1XDUA 2HR3A 3HRSA 2YU3A 3R6SA 2P8TA 2GA1A 3Q9SA 4PNCA 1G6NA 3BOQA 1YW9A 5HDNA 4S05A 1Z9CA 2Q92A 2HGCA 1KGSA 5FO5A 1FWZA 3SFZA 2VN2A 5FLXK 1R23A 1OYIA 4YIIA 5CVRA 4NQWA 4XBFA 2GU4A 5K5QA 3QP6A 4JUQA 2O3FA 3MAJA 2ZJ2A 1WKMA 4JBAA 4IRIA 4HYEA 2Q96A 3CUOA 1RUOA 4PDKA 1EH7A 3M9AA 2MH2A 1WL9A 1IXCA 3HIFA 1T2KA 2HQNA 4P9FA 4A0XA 1KU7A 2VOPA 3K69A 2L4AA 4EQQA 4EM0B 3MWMA 2VT2A 5LEKA 1QPMA 4UVCA 2DO7A 2NNYA 4U73A 4GO1A 5IT9K 1R7JA 3CUQB 2M87A 3KCCA 5D5VB 2O6GE 4OMZA 3CB5A 2RVCA 4BNCA 2E1NA 3BY6A 1P6RA 2HQRA 3E97A 5D4RA 2IJLA 4U1BA 1MZBA 3W6JB 1ZH5A 3C1DA 2VBWA 4KT5C 5LHHA 1S7AA 2V6CA 3WG9A 4OIOF 3KEQA 1NHAA 5ILVA 4HLYA 4U70A 3L7WA 2VONA 1SMTA 3L00A 1K78B 4OIQF 1SD4A 2YX7A 4OIPF 1HW2A 2GAUA 3IC7A 4AD9A 2K4JA 4RAYA 3BP8A 3F8CA 1LDKB 5F6FA 1RZ4A 5BMZA 4L9VA 3V8LA 2QQBA 2YSRA 1V3FA 4CO8A 4RB2C 2RGVA 2M8EA 1SFEA 3WTYC 2V1DA 4IF4A 1PV9A 4GXOA 4AIHA 3JAMK 3I5UA 3CUQA 5IT3A 1XGMA 2EFQA 5FD6A 3RJPA 3G3ZA 2HEOA 3IU9A 1IRFA 1E2XA 4U6CA 1H9TA 3M7GA 2B3KA 2OBPA 3C3WA 3LWFA 4MEYF 4RZYA 4M74A 2BE5F 4KICA 2H94A 2XASA 3I64A 1IN6A 5L3EA 1YVMA 2LF7A 5KVRA 5LGNA 1XDSA 2DQLA 4WXHA 2L4MA 5DEQA 3JW4A 2PBIA 3GVAA 3IWZA 3FZVA 4CDGA 1G3SA 4EGZA 5E1XA 1K78A 2ZNZA 4P55A 3U9GA 4A0ZA 2QYOA 3KP3A 1RUNA 5HLGA 1ZG3A 4LG0B 2Q2EA 3CO6C 4HF0A 4ZWOA 3J81K 2GG9A 3TOBA 2XRNA 1HKQA 2X0LA 3ZMVA 1BC7C 2XKOA 1UCRA 3F22A 3KP6A 1FNNA 4MNUA 4A6EA 2Y0MA 3BWGA 5ERIA 2XVCA 2DT5A 4I01A 2MATA 3I53A 1TW3A 2HOWA 1YS7A 1MJBA 1ZRCA 2EV0A 1Y0UA 3FM5A 3KLNA 4I02A 1BIBA 1IAWA 2D1HA 3MEXA 1M35A 4YFXF 1WI9A 3O3KA 3R0AA 2W84A 3ZMTA 2ACJA 4LLNA 1Z1DA 5D4SA 1LEAA 1W7PA 4HZFA 5E18F 5FB2A 2KJBA 3R4KA 5LBQA 1Y1NA 3P9CA 1KP0A 3FMQA 2EA4A 3F23A 4S2TP 4ZYDA 3W6KB 5E1ZB 4LG0A 4M9SA 3TOAA 3GF2A 2OU2A 3ZMSA 4RB0A 2AXLA 4Y17A 5J6XA 4BQAA 3F3XA 1RNLA 3KEOA 3I58A 1VTNC 1EH8A 5FD5A 4YG2F 3ZN0A 4WWCA 1F4KA 3RORA 5BOXA 1LJ9A 1P4WA 4XLNF 4WXCA 2FE3A 3PKCA 4MQ9F 1G4DA 3V8KA 5D6EA 3V8JA 1OMIA 3HSEA 1XCBA 2DBBA 2XUBA 3C18A 4QWQA 2XAHA 2DK5A 4A0YA 3RPQA 1IN4A 1ZG1A 2GTXA 3TO9A 4UHTA 3I4PA 4HX7A 2FNAA 4IU6A 4IHTA 4WXDA 3WTWC 3HSRA 3IL2A 3RIRA 1GVJA 2RV8A 2YX4A 3N4MA 5JI6A 2GGCA 3FXRA 5L3DA 3BJ6A 2VE9A 4IXAA 2HTJA 2XGXA 1ZRFA 1O57A 2JZYA 5J8FA 2KIMA 3J7AO 5HLIA 4FX0A 4ZYHA 3G73A 3BPXA 3FM3A 1QBJA 1X3UA 2K02A 4ZZLA 4L18B 5BQTA 4P9UA 1MD0A 3D5LA 1JGSA 1YIOA 4BH9A 4ZYGA 2V1UA 4MGRA 1BIAA 3LFKA 4HX8A 3GUDA 5DUKA 1JHFA 3IKVA 2DI3A 2CQKA 5HLHA 2R7DA 1SD5A 3HTUA 4LK1F 1BM9A 2JTVA 3J80Z 4KFCA 3K0LA 1LDDA 2F5DA 2ISZA 3ECOA 3ULQB 1U6GA 1TBXA 2QVOA 4O5VA 3RTRA 4YIFA 1MKMA 1T6SA 5E1WA 5A2QZ 2L02A 2Z33A 2GZWA 4UV8A 4ZZDA 1U5TB 3EYYA 3EYIA 3J80K 1TQIA 2EK5A 2JT1A 4LGWA 2EJRA 1WLRA 1RI7A 3TGNA 1KA8A 4UVAA 2OZ6A 4G6DA 4CXFA 1C21A 1USSA 2UXXA 3KZZA 4B8XA 4FX4A 1ZLKA 2PMUA 4IRGA 1WN1A 2COMA 1Z91A 4EJUA 2GU6A 3GXOA 4OOIA 2OAZA 2CYYA 2P99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1XSD A;  4R60 A;  3E5U A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5JFRA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations