1IC8 | Genus

Total Genus 50

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	50
sequence length	190
structure length	170
Chain Sequence	KELENLSPEEAAHQKAVVETLLQEDPWRVAKMVKSYLQQHNIPQREVVDTTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREVAQQFTHARNRFKWGPASQQILFQAYERQKNPSKEERETLVEECNRAECIQRGVSPSQAQGLGSNLVTEVRVYNWFANRRKEEA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transcription/dna
source organism	Homo sapiens
publication title	Diabetes mutations delineate an atypical POU domains in HNF1-Alpha pubmed doi rcsb
molecule keywords	5'-D(CPTPTPGPGPTPTPAPAPTPAPAPTPTPCPAPCPCP*
total genus	50
structure length	170
sequence length	190
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2001-03-30

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.60	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Homeodomain-like	1ic8A02
1.10.260.40	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	434 Repressor (Amino-terminal Domain)	lambda repressor-like DNA-binding domains	1ic8A01

1XC5A 1QPIA 3TP0A 4DYCA 2GM4A 2EBYA 3Q0VA 3I4NJ 4IEJA 4JX4A 3JRBA 4IWRA 1JT0A 1JKRC 3H3VK 1JKOC 2O9LA 1ZAYA 1MH4A 3GBFA 2L7FP 4IHVA 3Q3SA 1IV6A 3OQNA 3JRAA 4Z58A 1NEQA 4X4FA 1AKHB 1RESA 2JN6A 2YS9A 1A6IA 1EF4A 4JX6A 5F1JA 2PUAA 1UXDA 3G1MA 2GRMA 3RQIA 3LFPA 2CU7A 4UUSB 3JRDA 3RKQA 5EG0A 3JRIA 2NVXJ 1I50J 5IP9J 2HSGA 1O4XA 5K98B 3SCGA 1ZGWA 2PPXA 2IV1A 4DZPA 2GZUA 4YG1A 4BY7J 4A3CJ 5IPAA 2XPWA 3A03A 2CUEA 4PU8A 3IH3A 2HQ5A 2TCTA 2LCVA 5K7ZA 4M3EA 1IGNA 4BY1J 5FLVA 2LYLA 2NS8A 2KEIA 1PUFB 2EZLA 1JT6A 3BR0A 3GTKJ 1JJ6C 3OP9A 1K61A 1BDHA 2IU7A 3BTCA 1FIAA 1RZRA 4V2GA 5E3OA 3FYAA 1SANA 3CQZJ 3DEWA 1IRZA 1H88C 2MQKA 1UTXA 5E3NA 1POUA 4X4CA 4MFEA 4X4EA 2DTZA 1UG2A 3S8QA 4A3KJ 1LCCA 2EZIA 3FKIJ 3GTMJ 4QIWN 1WI3A 2ZB9A 4XICA 1ZZ7A 2IAIA 5F08A 4D5FA 4XRMA 4XRSA 1IJWC 2AXVA 1R9TJ 2ID6A 1PRUA 1TWFJ 1YSEA 1APLC 3JRCA 4C3JJ 4A3GJ 2EWTA 3TW6A 3TW7A 2XPUA 3ZQFA 2R92J 5M5XJ 2R5YB 2XI8A 1XS9A 2KEKA 2HOSA 3LSPA 2XPVA 1S7EA 2FQ4A 2ICPA 4A93J 3OSFA 1L1MA 5EZHA 4A3MJ 1RKTA 3BTLA 3VK0A 2M9HA 5FKLA 5EGOA 3BTIA 1ZZ8A 1JTYA 2R63A 1ORKA 2M0CA 1IUFA 3S15J 4JP0A 5F0CA 2KDZA 1ZUGA 2DA3A 1U78A 3HOZJ 2N8GA 1DWKA 1NK2P 2AUWA 3FMYA 1JFSA 4YG4A 2YU9J 3SCFA 2KEJA 2EBIA 2B5AA 2JA5J 3OIOA 1ZS4A 1GVDA 4QTRA 1MBKA 1R69A 4GQMA 1WPKA 1JJ8C 1QQAA 2HYJA 3ZQLA 2GRLA 2X9DA 2AO9A 5C4JJ 4ABZA 1AKHA 1GV5A 2L49A 4V2FA 4MO7A 5GPCA 1IC8A 3BR5A 2HDDA 2D5VA 2L7ZA 3IVPA 2HXIA 4BXXJ 3F51A 1JFTA 1LMB3 1PNRA 3CROL 2Y31A 2OPTA 1POGA 1BA5A 4C3IJ 2VPRA 4L5EA 5C4XJ 1Y7YA 3CECA 2JK3A 2L7MP 4MCTA 1GUUA 3HBLA 3D1NI 5E3MA 3BT9A 4A69C 2BNNA 4DW6A 2LR8A 4I8TA 3HKZN 2EZKA 3IV5A 3RZZA 2CUFA 1GT0C 2LYSA 3JRHA 5FJ8J 1ETXA 1B72B 2DMUA 2L0KA 1WCMJ 4A3JJ 1HDPA 2RAEA 3PO3J 4W1UA 2E19A 3LSRA 5EYRA 2ECCA 2R5ZA 2PUDA 2MGQA 1TC3C 2VKVA 1XG1A 3LSGA 1YRNA 1OFCX 2MW8A 1F43A 1GV2A 1ZK8A 2XGEA 2KT0A 3BG3A 3BQYA 4JX5A 5F0HA 1AHDP 1MBGA 3VPRA 1NERA 4X4BA 2LYJA 3JXCL 5J1UA 3GTOJ 2PE5A 1UXCA 4A3EJ 2OF7A 3LISA 1ZZBA 3NAUA 2WIUB 2L8NA 3IH4A 3BR1A 3GTGJ 3JRGA 2P81A 4A3BJ 1ZKGA 3ZQCA 3S14J 3LOCA 4I6RA 2PMZN 2E2IJ 1W0TA 3SCHA 2K9QA 5C44J 2R5YA 1JWLA 1RPEL 1IG7A 1QVTA 4M3DA 1JUPA 3HDDA 3HOVJ 4NDWA 3OOUA 1ITYA 4RDUA 1MNMC 4MLOA 1B8IB 1VI0A 1I6HJ 4XRSG 4C2MJ 2LYRA 1T56A 3LSJA 1UHSA 5K7FA 2R5ZB 3OMTA 4IVZA 2NVYJ 1OSLA 9ANTA 1VF9A 3BG5A 2BNMA 2GBYA 1YRNB 3OSGA 4BBSJ 3KJXA 2IBDA 3FIWA 4EEFG 4GHJA 4YBAA 5F27A 1QP7A 4IA8A 2EF8A 3DCFA 2FJ1A 2NOGA 1EFAA 2IUOA 1BL0A 2DJNA 3SFIA 2E1OA 4Z5DA 2LTPA 1IDZA 2HOTA 2FD5A 5FKMA 2Y0SN 1I3QJ 2CQQA 2VKEA 1OCTC 4AUXA 2ME6A 3NARA 5JLWA 4MCXA 3O9XA 3FK7A 2PUCA 2LYKA 2EH3A 2R1JL 3GTJJ 4M3FA 3U3WA 2EZHA 1CQTA 2PUBA 1X57A 2M34A 1GDTA 4J1XA 1HLVA 1ZQ3P 2L9RA 2TRTA 3O8HA 4FISA 2XB0X 1ZZ6A 1FJLA 4D7MA 3FK6A 3MLFA 2LFBA 1ETKA 1PERL 1QRYA 3JXDL 2LYQA 4JQDA 3RZOJ 2NS7A 3G7DA 5FKNA 3S1MJ 2AWIA 3CMYA 1WIZA 1H8AC 3BQZA 4FBIA 3HZIB 1XWRA 1ZVVA 1OJLA 2WB1N 2LD5A 1B72A 2AXZA 4FTHA 1Y9QA 4W97A 3Q0UA 3A01B 1OCPA 3S1QJ 3GBGA 4PU7A 2O7OA 2X6OA 2O4AA 3WHBA 4Y52J 1B0NA 3QPLA 4B4CA 3H0GJ 4MIMA 2H8RA 1PRAA 2AXUA 2FJRA 1ETQA 4S0HB 1JUSA 3BR2A 4X6AJ 2EQRA 2HXOA 2KPJA 2ECBA 2XB5A 3BR6A 5IYBJ 5K7HA 1W0UA 2WAQN 1WGXA 4FE4A 1ZZCA 3HOYJ 3JRFA 4AYBN 5FKKA 5E3LA 4B1RA 3PO2J 2KZ8A 1ZR2A 2MEZA 1MSEC 4FN3A 5GPAA 3G1OA 4J1WA 4JCXA 1WH8A 5J1YA 3F52A 4X4DA 3Q0WA 3CCYA 3KZ3A 2HOAA 1ENHA 4X4GA 1VNDA 1FTZA 4HNVA 4A3LJ 1A5JA 3ZQHA 4FCYA 3PXPA 1K83J 2DMTA 2LP0A 1HF0A 1QPZA 2W48A 4QSHA 4Y7NJ 4NDLA 5DTDA 3GTLJ 4PU4C 1MBEA 1G2HA 4BKXA 4A3DJ 4I6UA 4MFDA 4JYKA 2H1KA 3DNVB 1IDYA 3FYMA 4AC0A 2A6CA 2PUEA 3HB9A 2JA8J 1ZTRA 2QF7A 2IVBA 3I4MJ 4I6ZA 2GLOA 1WETA 1ZPQA 2K40A 3LNQA 1B8IA 1WH6A 3BS3A 3ZQIA 1WH7A 1U8BA 3OQMA 3BR3A 3JXBC 1Z0XA 1D5YA 2LKXA 2ID3A 3O8GA 2DMQA 2CSFA 5FKOA 1E3OC 3SJMA 1JKQC 3M4OJ 5M3FJ 3K7AJ 1FIPA 3BTJA 2MSYA 1QP4A 1SFOJ 3BDNA 5A7LA 3ZHMA 1F36A 5BNGA 5J1RA 1U9NA 1Q1VA 3EUSA 1NTCA 3IH2A 2AHQA 3CLCA 4DZJA 4J19A 2IVGA 1JH9A 1MH3A 5EZGA 3GTPJ 2JCGA 2XCJA 4F8DA 3KXAA 2XSDC 3B7HA 4DYQA 2WUSR 4X4IA 4G12A 2QCOA 2K9SA 3HOXJ 4O8BA 1X2MA 1Y1VJ 4UUTA 3FISA 2JWTA 1UMQA 3G1LA 1TWGJ 1QVUA 5EF6A 3JR9A 2PIJA 2E2HJ 5JLXA 2NVTJ 2Y9YA 2O8KA 1BJZA 3TEDA 2VI6A 4IHXA 3HOUJ 3F6WA 3G5GA 5M5YJ 4YARA 2JVLA 3QYXA 1ETYA 1AU7A 2BJCA 2NVQJ 4CYCA 4RBOA 3GN5B 5EDNA 4XK4A 3QQAA 1P7IA 5IYDJ 5M3MJ 3WHCA 4GFBA 2G0EA 2LY9A 3ZHIA 2CROA 4M6VA 2ME0A 3S2DJ 1LCDA 3JREA 5IOZA 4YG7B 4X4HA 3A01A 4M3BA 3TP3A 5EEAA 3S2HJ 1ZZ9A 1DU0A 5M5WJ 4A3FJ 1DW9A 1ADRA 4OB4A 2XRLA 1Z77A 1RIOA 3QPSA 2M2EA 5IYCJ 3S17J 1ETWA 1ZR4A 1RKWA 2MG4A 1LE8B 2O49A 3HGYA 3BG9A 4XIDA 2YUSA 5FLMJ 1WH5A 2ICTA 1MSFC 2DA1A 2IEKA 1SQ8A 3PM1A 4X1EA 2LK2A 2PUGA 2OFYA 4B3AA 2O38A 1QQBA 2Y2ZA 3QF3A 2DA5A 4DYRA 2IVQA 2CJJA 1P7JA 4D5CA 4Z5CA 4IHWA 1JKPC 4JCYA 1HDDC 1ETVA 3HEFA 2B63J 4M3GA 3SDGA 5IP6A 2VUMJ 2DA7A 1LQCA 5C3EJ 2HINA 2JA6J 1RPWA 4CYCB 1CJGA 1TWCJ 2AW6A 4BBRJ 5IP7J 2LLKA 2Y30A 2LYPA 1X58A 4I6TA 1FEXA 2DMPA 5EG0B 3CDLA 1LFUP 3M3YJ 4D7NA 2DN0A 1R63A 4Y42A 4I76A 3MKLA 3QWGA 4Z59A 3K2AA 1JGGA 3TRBA 1RETA 2DA2A 1MBHA 3F0CA 4Z5HA 2DA6A 1LLIA 1X2NA 2XGCA 1QP0A 3UFDA 2DA4A 3ZKCA 3UKGA 1NK3P 2XGDA 3W6VA 2BNOA 1DU6A 4PU3C 1LFBA 3H5TA 3C2BA 3B6CA 1PRVA 2COBA 2CQXA 3A02A 1T33A 3B6AA 2JJ7A 3MN2A 5GP9A 2DMNA 2JA7J 3OQOA 1U9OA 1Y1WJ 2XIUA 3ZOBA 1H89C 4FE7A 2ELKA 3E7LA 4IHYA 3S1NJ 2CRGA 4LOCA 1TWHJ 3ZQGA 2HI3A 1HOMA 1BDIA 1BW6A 2XJ3A 2I10A 1JUMA 2JMWA 1FTTA 2X48A 4A3IJ 3GTQJ 1MBFA 3GN5A 2LVSA 2K9NA 3BD1A 1MBJA 2M8GX 1RR7A 4UUSA 2R7ZJ 2Y9ZA 1BW5A 5HODA 3HM5A 5F04A 2FX0A 1VPWA 1ETOA 2WV1A 3MVPA 1TWAJ 2R93J 3RZDJ 3L1PA 3S1RJ 4C3HJ 3S16J 2OR1L 1JTXA 3R1FA 3HGGA 1HCRA 2PUFA 5EGOB 2E2JJ 5IOYA 5F0FA 3HOWJ 5J3LA 1X2LA 1LE8A 1PUFA 5DS9A 1VFCA 3QQ6A 1RZSA 2R0QC 1RZRD
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2GM4A 4DYCA 2PXDA 5GTHC 3Q0VA 4IEJA 2JRTA 2GQQA 1JT0A 2LREA 3ROUA 2BE5F 4KN4X 3OS1A 2DFEA 5LGTA 1ZAYA 3IWFA 2P7CB 4GO1A 1X1CA 4AIKA 4GXOA 1B1BA 2DTRA 3OL4A 4X4FA 3PUFA 3CO7C 2YS9A 3N4MA 3H5AA 4CCLA 5F1JA 4IRIA 3G1MA 2W7NA 3RQIA 2IT0A 3LFPA 2HSGA 1P4XA 3QOPA 4GDFA 2PXKA 4EM0B 1R5GA 1G8XA 3SCGA 1ZGWA 3QOXA 3GO5A 4BYYA 3PNVA 4UVAA 4DZPA 2BZTA 2VIXA 3D0SA 2V9KA 2KFDA 1X1BA 4CZZA 5IPAA 5HLIA 3CLQA 2HU9A 3ZXSA 4CZCA 5DTQA 3IH3A 1Z21A 2HQ5A 2HZDA 2B7EA 2TCTA 3TO9A 4DBQA 2LCVA 3S8PA 1QHHD 1V5FA 4RGXA 2LYLA 3U2RA 4ER7A 1JT6A 2PXVA 2OZUA 3TMOA 2QBYB 3GFJA 2ZNYA 2Z5UA 1W7PD 3LSHA 3I53A 4I0AA 4B3XA 3E1SA 4IQ4A 4ITVA 4WX9A 2NXNB 4MNUA 5E3OA 5BMZA 2QSHX 3DEWA 2V1XA 4QPQA 3CJQB 1H9GA 2A68F 2EA4A 3BZKA 5E3NA 1POUA 5E1WA 4MFEA 1MMNA 4X4EA 2DTZA 4FHTA 5LRSA 3CCEI 1HSJA 2DW4A 2EZIA 3FKIJ 4G7ZF 2PJRA 4II3A 2Z16A 3BOQA 5F08A 4CCMA 2LKSA 4LK1F 1H9TA 2AXVA 1P2FA 4BEHA 1XGSA 2LSOA 1FOYA 1R7JA 1USTA 4RM3A 3JRCA 4A3GJ 3AAFA 1IN7A 2MFZA 1R5HA 5LRRA 2KEKA 2PQ8A 1XS9A 4RB1A 2HOSA 1S72I 2HKOA 2GIZA 3K4JA 2XXQA 2LLVA 2PXPA 3OYHA 1L1MA 2LDUA 2E5NA 2Q8KA 3VK0A 1T98A 1ZRCA 3SQNA 3BTIA 2FRHA 3A0HC 3TO7A 3ZMVA 3ZMZA 2KDZA 2DA3A 1LVAA 1W7PA 5E8GA 3SDBA 4G7HF 2N8GA 4LD5A 2EINH 2JUCA 4ZTJA 1JFSA 2YU9J 1VQLI 2GWRA 2Z3YA 3OIOA 1FPQA 4XMYA 4QTRA 2KIMA 2YX4A 1ZARA 4M9XA 1WPKA 4NNJA 3TKYA 5L3EA 1JJ8C 1QQAA 1YHQI 2L01A 3CP8A 2GRLA 2K7LA 4LLGF 3SFZA 5GTIC 2X9DA 4CHUA 3PQKA 2VXDA 2JZYA 1AKHA 1GV5A 5B5EC 2IS2A 5GPCA 5FD5A 2JRMA 2A6EF 1SC7A 5FRMA 1IN4A 2CFXA 2HXIA 1D3YA 2L7ZA 3NQOA 2FEZA 2WC2A 1JFTA 1VQ9I 1ZAOA 1B59A 2CFOA 3MZ8A 1BA5A 4BE1A 4XSZF 1EKEA 4L5EA 4CDGA 2BV6A 2L7MP 4K2EA 2D45A 2OU2A 4MCTA 3JTGA 3EQLF 3CO6C 4ER0A 2BHZA 1X19A 3DBLB 2OUMA 1NG6A 1ZH5A 3HKZN 2EZKA 5FJ8J 1B72B 4F7ZA 2M4GA 1S8NA 2GA1A 1Y0UA 2E19A 2K9LA 1FYMA 2ECCA 2X1CA 3CF5F 3A0BC 3T1BA 2V26A 5AIPA 3VSLA 3CC2I 4V19K 3O2PE 1F43A 3LSGA 2LBFB 2MW8A 3FMQA 4E7KA 1GV2A 5J6XA 3DQVC 1I27A 1AA7A 2KT0A 1M1EB 2L5QA 2MA3A 4CCOA 1AHDP 5F0HA 3L2CA 3K4MA 4M73A 2YU3A 1UXCA 4AIJA 3H9GA 1X1AA 3F8CA 4G9YA 2L8NA 2E1MB 3JRGA 2P81A 3H5RA 1S6LA 4UVCA 3LOCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XC5 A;  1QPI A;  3TP0 A;  4DYC A;  2GM4 A;  2EBY A;  3Q0V A;  3I4N J;  4IEJ A;  4JX4 A;  3JRB A;  4IWR A;  1JT0 A;  1JKR C;  3H3V K;  1JKO C;  2O9L A;  1ZAY A;  1MH4 A;  3GBF A;  2L7F P;  4IHV A;  3Q3S A;  1IV6 A;  3OQN A;  3JRA A;  4Z58 A;  1NEQ A;  4X4F A;  1AKH B;  1RES A;  2JN6 A;  2YS9 A;  1A6I A;  1EF4 A;  4JX6 A;  5F1J A;  2PUA A;  1UXD A;  3G1M A;  2GRM A;  3RQI A;  3LFP A;  2CU7 A;  4UUS B;  3JRD A;  3RKQ A;  5EG0 A;  3JRI A;  2NVX J;  1I50 J;  5IP9 J;  2HSG A;  1O4X A;  5K98 B;  3SCG A;  1ZGW A;  2PPX A;  2IV1 A;  4DZP A;  2GZU A;  4YG1 A;  4BY7 J;  4A3C J;  5IPA A;  2XPW A;  3A03 A;  2CUE A;  4PU8 A;  3IH3 A;  2HQ5 A;  2TCT A;  2LCV A;  5K7Z A;  4M3E A;  1IGN A;  4BY1 J;  5FLV A;  2LYL A;  2NS8 A;  2KEI A;  1PUF B;  2EZL A;  1JT6 A;  3BR0 A;  3GTK J;  1JJ6 C;  3OP9 A;  1K61 A;  1BDH A;  2IU7 A;  3BTC A;  1FIA A;  1RZR A;  4V2G A;  5E3O A;  3FYA A;  1SAN A;  3CQZ J;  3DEW A;  1IRZ A;  1H88 C;  2MQK A;  1UTX A;  5E3N A;  1POU A;  4X4C A;  4MFE A;  4X4E A;  2DTZ A;  1UG2 A;  3S8Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1IC8A

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Chord Diagram

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