1IC8 | Genus

Total Genus 50

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	50
sequence length	190
structure length	170
Chain Sequence	KELENLSPEEAAHQKAVVETLLQEDPWRVAKMVKSYLQQHNIPQREVVDTTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREVAQQFTHARNRFKWGPASQQILFQAYERQKNPSKEERETLVEECNRAECIQRGVSPSQAQGLGSNLVTEVRVYNWFANRRKEEA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Diabetes mutations delineate an atypical POU domains in HNF1-Alpha pubmed doi rcsb
molecule tags	Transcription/dna
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	5'-D(CPTPTPGPGPTPTPAPAPTPAPAPTPTPCPAPCPCP*
total genus	50
structure length	170
sequence length	190
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2001-03-30

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.60	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Homeodomain-like	1ic8A02
1.10.260.40	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	434 Repressor (Amino-terminal Domain)	lambda repressor-like DNA-binding domains	1ic8A01

4FISA 4LOCA 2IBDA 1VI0A 1WIZA 1RETA 2Y31A 3CCYA 1ZUGA 3B7HA 3MLFA 4GQMA 3A01A 3PO2J 3BTLA 3DCFA 3G7DA 3TEDA 1ORKA 1L1MA 2LK2A 3QWGA 2PUBA 2EBIA 1QQAA 2HQ5A 5M3MJ 5IOZA 4A3FJ 4X4EA 5DTDA 1B72A 2QCOA 3GTKJ 4MFDA 3F52A 2DN0A 5FKOA 2TRTA 5F1JA 3WHBA 4XRSA 3CECA 2LYSA 4X4DA 1FTTA 1ZR2A 2MGQA 5C3EJ 5IP7J 2GRMA 3PM1A 4D5FA 4UUSB 2IAIA 2IVGA 2DMUA 4FE7A 2XGEA 3RKQA 1POGA 4C3HJ 5IPAA 1IUFA 1RKWA 2Y9YA 5GPAA 3GBFA 1X2NA 2AHQA 2WUSR 1U9NA 5EZHA 5FJ8J 1PUFA 3B6AA 2YUSA 1JUMA 3UFDA 2PUDA 4DYCA 3A02A 3BDNA 3D1NI 1A6IA 2HOTA 3CLCA 3B6CA 3PXPA 2HSGA 3TRBA 3GTOJ 4I6ZA 2EQRA 3HOUJ 4MIMA 2JA7J 2CSFA 3HOZJ 1ZZCA 2HINA 2ECCA 2Y0SN 3RQIA 5C44J 5K98B 4C2MJ 1Y1WJ 3GTLJ 3HBLA 4JX4A 2Y30A 5F0HA 5EG0A 3S2DJ 2QF7A 1AKHB 2K9QA 4J1XA 3JREA 2PUEA 4A3CJ 1UXCA 3BD1A 2DMTA 2L7FP 1MBJA 3JRGA 1DW9A 2M9HA 2NS8A 2E2IJ 4XK4A 3E7LA 2ICTA 1QRYA 1LLIA 3QPLA 2E2JJ 4Z5DA 3LSGA 4YG4A 1G2HA 2R5ZB 4L5EA 1QPIA 2ZB9A 1JT6A 2M8GX 3OSGA 2HDDA 1BDIA 2JN6A 1BDHA 1ZR4A 2LYJA 2VI6A 5EGOB 2JA5J 4RBOA 1LMB3 2MG4A 4A3KJ 1D5YA 4Z5CA 4G12A 1HLVA 2KT0A 2XIUA 1U8BA 3BQZA 1TWAJ 1ETWA 3BG9A 3MVPA 3ZQGA 1CJGA 1P7IA 2EWTA 2HXIA 4A69C 3S1MJ 2LVSA 1GV2A 3HOYJ 1DWKA 1YSEA 4PU3C 4CYCB 2O49A 1UTXA 1MBGA 2WAQN 2K9SA 1YRNA 4A3GJ 3OQMA 3OQOA 2HOSA 4NDLA 9ANTA 3KJXA 3HGYA 3RZZA 1R9TJ 3ZQLA 2ME6A 1OFCX 5FLMJ 3CROL 3DEWA 3JRAA 1JH9A 3BR0A 1XC5A 1ZZ7A 2L7MP 2L8NA 4QIWN 1I3QJ 3BQYA 3VK0A 1NEQA 4JX6A 3VPRA 1B8IA 1LCDA 1ETVA 4J1WA 2ME0A 1X57A 1JUSA 3K2AA 5GPCA 4YARA 2CUFA 4A3IJ 4FTHA 2PUAA 2LD5A 3GTQJ 2IUOA 3W6VA 1PRUA 2AXZA 2LCVA 4V2FA 2XPWA 1JT0A 2XRLA 5EF6A 1WH6A 2R92J 2WB1N 1LCCA 4UUTA 4XICA 1EF4A 3A01B 2NVQJ 3FYMA 2PIJA 3G5GA 4FE4A 3RZDJ 3QF3A 5IYBJ 5E3NA 2AXVA 4YG1A 4JCXA 3GN5A 4AYBN 3IVPA 1ADRA 1GV5A 2VKEA 1JJ6C 3JR9A 4F8DA 1RPWA 2IEKA 1NK3P 5FKLA 3JRDA 1IGNA 2JJ7A 1B72B 2FJRA 1BJZA 4M3DA 5E3OA 1JGGA 3LSPA 2RAEA 3BTJA 1VNDA 2N8GA 1ETXA 1UG2A 4B4CA 5DS9A 1QPZA 2L49A 1ZKGA 1UHSA 4M3GA 1TWGJ 2XCJA 5K7HA 4A3LJ 1K83J 3KXAA 1JUPA 3BTIA 3EUSA 2CRGA 4IHVA 3M3YJ 3LSRA 1QQBA 2IV1A 2LLKA 2JMWA 5J3LA 4HNVA 1DU0A 1WH5A 5K7FA 5JLWA 1PRVA 3F6WA 3JRBA 4BY1J 2JA6J 1PUFB 4DYRA 3HKZN 5J1RA 2WIUB 2FX0A 1QP0A 2AO9A 1FTZA 1IDYA 3TP0A 4V2GA 3HOVJ 3LFPA 1A5JA 4IA8A 3S1QJ 3BG5A 3OOUA 3ZQIA 2IVQA 4X6AJ 1NK2P 3NARA 2PMZN 4X4HA 3ZHMA 1JKQC 5EG0B 1BW5A 5C4XJ 1ZZ6A 2DA7A 2NVYJ 4MO7A 3FYAA 1RESA 4IEJA 5M5XJ 3TP3A 3O8HA 1RR7A 2DMNA 2PPXA 1RKTA 3BR6A 1GUUA 3NAUA 1JKRC 3I4NJ 2LR8A 2VPRA 4RDUA 3OIOA 1HF0A 3SJMA 3HB9A 3LNQA 2LY9A 5GP9A 2AUWA 1WI3A 2CQXA 5FKKA 4C3JJ 2VUMJ 3GBGA 2ICPA 3R1FA 3HM5A 4D5CA 5IYDJ 3K7AJ 1SFOJ 5E3LA 2GLOA 1OCTC 3PO3J 4IVZA 3H5TA 1VPWA 1X2LA 1I50J 3BR5A 3HGGA 1EFAA 1FEXA 4A3MJ 2KPJA 2HYJA 1ETQA 1U9OA 4M3FA 1SQ8A 3FISA 1RPEL 4NDWA 1JTXA 3I4MJ 1WETA 3KZ3A 1PRAA 2P81A 5F0CA 2JVLA 1BA5A 2R63A 3GTMJ 1O4XA 1ENHA 3JXCL 3JXDL 2O7OA 1YRNB 3H3VK 2MQKA 2NOGA 2BJCA 2PUCA 3S1RJ 3JRHA 5F04A 3F0CA 5F08A 4DW6A 1BL0A 1R63A 2CUEA 1ETYA 4FN3A 2KEIA 4J19A 2Y2ZA 1GT0C 1B8IB 2XGDA 3Q3SA 5IP6A 2VKVA 2DA3A 2HOAA 3IH4A 4X1EA 2OR1L 1GVDA 4JYKA 1NTCA 4I6UA 1I6HJ 2FJ1A 3CQZJ 2LYLA 2CQQA 2H1KA 1AHDP 4M6VA 3HDDA 1WCMJ 2XSDC 2B63J 1TWCJ 4GFBA 1AU7A 4DYQA 4XRSG 2DA2A 2AWIA 2CROA 5K7ZA 2LYKA 1RZRD 2GRLA 3SFIA 3GN5B 2FD5A 4JP0A 1ITYA 2D5VA 1JKOC 3BT9A 4EEFG 4MCXA 2DMPA 4AC0A 4DZPA 4Y42A 3FKIJ 2NS7A 1XWRA 4O8BA 2EBYA 3CDLA 3ZOBA 2X6OA 3BS3A 3M4OJ 5FKMA 3SCGA 2EH3A 3DNVB 1HDPA 5EEAA 3CMYA 3SCHA 2Y9ZA 2E1OA 3HEFA 2O8KA 1IDZA 3ZQHA 4Z5HA 1LE8A 1LQCA 1FIAA 2EZKA 3OSFA 2G0EA 2KEJA 4IHWA 1H89C 2MEZA 3G1OA 4W1UA 2R1JL 1X58A 3QQAA 1POUA 1ZAYA 5M5WJ 3FIWA 1ZZ8A 2M2EA 4JCYA 3QYXA 3UKGA 3RZOJ 4X4GA 3Q0UA 3QQ6A 1T33A 4M3BA 1SANA 1IV6A 1ZK8A 2EZHA 4YG7B 2DTZA 2XGCA 4IHYA 4GHJA 1ZGWA 5HODA 3S8QA 4YBAA 2BNNA 4MCTA 2GZUA 2OFYA 3ZKCA 1MBHA 3ZHIA 3IV5A 3JXBC 1LFUP 1H8AC 2E19A 4X4CA 1IRZA 3OMTA 1Y1VJ 1OJLA 4QTRA 2L7ZA 3JRIA 1RIOA 2PUFA 5M5YJ 2EZIA 1IC8A 1F43A 1MNMC 3TW6A 3S16J 3FK7A 5EDNA 3HOXJ 1APLC 1IG7A 4X4FA 1MH4A 4AUXA 3IH2A 2R5YA 2ID6A 3S2HJ 1PERL 4PU8A 2DA1A 1JFTA 3OP9A 2JA8J 2EZLA 2LYQA 2MW8A 3A03A 2K9NA 3BR2A 2ELKA 5EYRA 1QP4A 2BNMA 1ZTRA 1VFCA 2OF7A 2A6CA 2XI8A 1JJ8C 1WPKA 5E3MA 2NVXJ 2DJNA 1ZPQA 4A3JJ 4Z59A 4BXXJ 3SDGA 1CQTA 1Q1VA 2AXUA 1PNRA 4XIDA 3F51A 2LFBA 3LISA 1OCPA 4D7NA 1DU6A 2XB0X 2LKXA 4D7MA 3IH3A 1ZS4A 2CJJA 4S0HB 1R69A 2CU7A 3O8GA 2ECBA 2L0KA 3JRFA 2KDZA 5M3FJ 5IYCJ 4FCYA 1XG1A 4IHXA 3G1MA 1FJLA 4I6TA 3SCFA 2X48A 1ZZBA 4B1RA 3S17J 2TCTA 3HZIB 1WGXA 2GM4A 3BTCA 1MSEC 2LYPA 1MSFC 2KEKA 4UUSA 2WV1A 1HCRA 1Y7YA 1Z0XA 5J1YA 3C2BA 4ABZA 4A93J 2M0CA 4BBSJ 2YS9A 4BY7J 3Q0VA 2L9RA 3MKLA 1U78A 5IOYA 2BNOA 4M3EA 2PUGA 4X4IA 1TWFJ 3GTGJ 1JWLA 4XRMA 1B0NA 2IU7A 2COBA 1IJWC 1UMQA 2O4AA 3BR3A 4Z58A 2NVTJ 5J1UA 2ID3A 3S14J 3BR1A 1Y9QA 2K40A 2OPTA 1RZRA 1MBFA 2AW6A 1HOMA 1LFBA 4Y7NJ 4IWRA 2E2HJ 1RZSA 4A3EJ 1Z77A 1W0TA 3FK6A 2I10A 4MLOA 3U3WA 2O38A 2JK3A 2IVBA 5IP9J 5JLXA 4A3BJ 5EZGA 2XJ3A 2XPVA 1AKHA 1XS9A 4JQDA 1X2MA 1S7EA 1QVUA 4PU7A 2XB5A 1GDTA 2DA4A 2R7ZJ 1TWHJ 3Q0WA 1LE8B 1UXDA 4FBIA 2H8RA 1VF9A 3O9XA 1T56A 1WH7A 4JX5A 2DA5A 1MBEA 2R5ZA 2DA6A 3TW7A 4Y52J 2R93J 3G1LA 5F27A 4X4BA 4C3IJ 1W0UA 1ETOA 4BBRJ 3FMYA 3L1PA 2PE5A 4I76A 2MSYA 4I6RA 1P7JA 1E3OC 5EGOA 1ZVVA 3BG3A 3ZQCA 1ZQ3P 2EF8A 4A3DJ 1H88C 2LP0A 4W97A 2HXOA 2M34A 3H0GJ 1HDDC 5A7LA 4B3AA 1OSLA 3ZQFA 5C4JJ 5F0FA 3LOCA 1F36A 5BNGA 4QSHA 2R0QC 3HOWJ 3GTPJ 2B5AA 2KZ8A 3QPSA 4CYCA 3WHCA 1ZZ9A 2FQ4A 2LTPA 3GTJJ 1FIPA 2W48A 2X9DA 1QVTA 1BW6A 2JWTA 4MFEA 4PU4C 5FKNA 2DMQA 4I8TA 1K61A 1JKPC 1JTYA 4DZJA 2YU9J 4OB4A 3OQNA 2R5YB 2HI3A 1TC3C 1MBKA 3MN2A 2O9LA 3S15J 3LSJA 1JFSA 1NERA 2JCGA 5FLVA 4BKXA 2GBYA 1ETKA 1QP7A 3S1NJ 3JRCA 1MH3A 2LYRA 1WH8A 2XPUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3W2VA 2LREA 2BVLA 3HRTA 3KYLA 4IQJA 3CUQB 1RETA 4XN3A 3CCYA 4I0AA 2D2WA 4XQFA 4GQMA 1YX3A 3A01A 3BTLA 3I59B 1O3QA 1ORKA 5K1YA 4A12A 3H5AA 2PXUA 3BOQA 1QQAA 1D0ZA 3HIFA 5M3MJ 3HL2A 4RA2A 5DTDA 3KX2A 3L2QA 1K4SA 4MFDA 1O7FA 4UB8C 4XONA 3K1MA 4HNTA 5F1JA 3IP4B 5EEHA 1FWZA 5LEKA 3AAFA 1YJ9I 4X4DA 1ZR2A 2WADA 3BJOA 4D5FA 1FSEA 3C1DA 5D5UB 4IHSA 3F8MA 4WK8F 4LK0F 1WRJA 3W3CA 2BV6A 1T98A 1IUFA 1Z9CA 1WJBA 3OMYA 1X2NA 2AHQA 5H6QA 1KZHA 3R60A 3ZXSA 4NHJA 5DD8A 3LQXA 4IKFA 3RYRA 1YHQI 4Q47A 1QZYA 2PMUA 3D1NI 2VQCA 3PXPA 1J9IA 5CPRB 2QUFA 1R1TA 3ZPXA 4A0XA 2EQRA 4M9SA 3HOZJ 3JSPA 1ZZCA 4NC7A 2E36A 4C2MJ 3V7SA 1ZG3A 2EJRA 2BXZA 4PJLA 5EG0A 2IRFG 3BP8A 1OCOH 3GXOA 1R4NB 1AKHB 3KP5A 2KRCA 4A3CJ 1D3YA 4L9VA 1F4KA 3JRGA 2HKXA 3CDHA 3HPHA 3QWLA 4XLEA 2ICTA 3OYDA 2Z1DA 1SMTA 1P2FA 3KE2A 2E2JJ 3LSGA 4YG4A 1ON2A 2OD5A 2V1DA 3D5LA 1QHHD 2ZB9A 2HDDA 2E7WA 2JN6A 3BPXA 5GAHJ 4OMYA 2LYJA 4BGDA 5KHDA 5E8GA 1BOBA 2MG4A 1IV8A 4AIJA 4ENMA 1D5YA 4Z5CA 3LA2A 4G12A 2KT0A 2HZTA 3BQZA 3KLOA 2UWMA 1CJGA 3ZQGA 2EWTA 2K5CA 4EGYA 2LBFA 3PNVA 1ODDA 4LB5A 4XNFA 2BY2A 4IJAA 1GV2A 3HOYJ 3ME5A 2O49A 4A3GJ 2K9SA 1YRNA 4RMNA 4XKBA 2STWA 4U0WA 1JHHA 3M8JA 2XGXA 2L9SA 3CCQI 3ZQLA 1X1PA 1JH9A 3M1EA 3FX3A 4BHCA 1U3EM 3D5RC 3FHNA 3JAMK 3LAPA 5FRNA 3OKZA 5F1RA 4FETA 3BQYA 4JX6A 1B8IA 3FZVA 1ETVA 2EILH 4J1WA 1LDJA 2RNJA 3W2WA 2XVCA 1Y39A 2OJED 5GPCA 4YARA 4D0PA 4PK4A 5FLXZ 1R6RA 3Q9SA 3HG9A 3KZZA 4L5IA 2VJ4A 1SEUA 1PRUA 2AXZA 2LCVA 4CA0A 1JT0A 3LL7A 1V5EA 2KHMA 1FSHA 2QVOA 1J09A 5J47A 3V42A 4EMSA 3A01B 1XDSA 1IXRC 2V6EA 4WXDA 1BM9A 4IHTA 5E3NA 2JVHA 2BHZA 3DU5A 4AYBN 4B43A 2QSHX 1JJ6C 2HFZA 3WGGA 3MFKA 1RPWA 2IEKA 3JRDA 1MMAA 1KQ9A 4Y4RA 3HJEA 4M3DA 2DTRA 1D8KA 4A0YA 1JGGA 3B73A 3MZYA 4YEJA 4ZZLA 5EJCA 1I39A 1YS7A 1UG2A 1IN6A 3ROUA 2L49A 1UHSA 3DV8A 4RB0A 2C6YA 2XCJA 2PXEA 4ENKA 3QYFA 2MYSA 3KXAA 2J5PA 3BTIA 2CV1A 3EUSA 3M3YJ 2ZFUA 2R7TA 2DPUA 3ASNH 5E1XA 2EINH 5GAGi 1S7OA 3TOAA 3R0JA 4E7ZA 2VJ5A 2PXBA 3P9CA 3Q9VA 3OYJA 1FTZA 1ZARA 2V3CC 3FDYA 2XSJC 1IUYA 2VOPA 4IA8A 2W00A 3E6BA 2FEZA 2FNPA 5F6FA 2KQRA 2L7KA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FIS A;  4LOC A;  2IBD A;  1VI0 A;  1WIZ A;  1RET A;  2Y31 A;  3CCY A;  1ZUG A;  3B7H A;  3MLF A;  4GQM A;  3A01 A;  3PO2 J;  3BTL A;  3DCF A;  3G7D A;  3TED A;  1ORK A;  1L1M A;  2LK2 A;  3QWG A;  2PUB A;  2EBI A;  1QQA A;  2HQ5 A;  5M3M J;  5IOZ A;  4A3F J;  4X4E A;  5DTD A;  1B72 A;  2QCO A;  3GTK J;  4MFD A;  3F52 A;  2DN0 A;  5FKO A;  2TRT A;  5F1J A;  3WHB A;  4XRS A;  3CEC A;  2LYS A;  4X4D A;  1FTT A;  1ZR2 A;  2MGQ A;  5C3E J;  5IP7 J;  2GRM A;  3PM1 A;  4D5F A;  4UUS B;  2IAI A;  2IVG A;  2DMU A;  4FE7 A;  2XGE A;  3RKQ A;  1POG A;  4C3H J;  5IPA A;  1IUF A;  1RKW A;  2Y9Y A;  5GPA A;  3GBF A;  1X2N A;  2AHQ A;  2WUS R;  1U9N A;  5EZH A;  5FJ8 J;  1PUF A;  3B6A A;  2YUS A;  1JUM A;  3UFD A;  2PUD A;  4DYC A;  3A02 A;  3BDN A;  3D1N I;  1A6I A;  2HOT A;  3CLC A;  3B6C A;  3PXP A;  2HSG A;  3TRB A;  3GTO J;  4I6Z A;  2EQR A;  3HOU J;  4MIM A;  2JA7 J;  2CSF A;  3HOZ J;  1ZZC A;  2HIN A;  2ECC A;  2Y0S N;  3RQI A;  5C44 J;  5K98 B;  4C2M J;  1Y1W J;  3GTL J;  3HBL A;  4JX4 A;  2Y30 A; 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 2DA4 A;  2R7Z J;  1TWH J;  3Q0W A;  1LE8 B;  1UXD A;  4FBI A;  2H8R A;  1VF9 A;  3O9X A;  1T56 A;  1WH7 A;  4JX5 A;  2DA5 A;  1MBE A;  2R5Z A;  2DA6 A;  3TW7 A;  4Y52 J;  2R93 J;  3G1L A;  5F27 A;  4X4B A;  4C3I J;  1W0U A;  1ETO A;  4BBR J;  3FMY A;  3L1P A;  2PE5 A;  4I76 A;  2MSY A;  4I6R A;  1P7J A;  1E3O C;  5EGO A;  1ZVV A;  3BG3 A;  3ZQC A;  1ZQ3 P;  2EF8 A;  4A3D J;  1H88 C;  2LP0 A;  4W97 A;  2HXO A;  2M34 A;  3H0G J;  1HDD C;  5A7L A;  4B3A A;  1OSL A;  3ZQF A;  5C4J J;  5F0F A;  3LOC A;  1F36 A;  5BNG A;  4QSH A;  2R0Q C;  3HOW J;  3GTP J;  2B5A A;  2KZ8 A;  3QPS A;  4CYC A;  3WHC A;  1ZZ9 A;  2FQ4 A;  2LTP A;  3GTJ J;  1FIP A;  2W48 A;  2X9D A;  1QVT A;  1BW6 A;  2JWT A;  4MFE A;  4PU4 C;  5FKN A;  2DMQ A;  4I8T A;  1K61 A;  1JKP C;  1JTY A;  4DZJ A;  2YU9 J;  4OB4 A;  3OQN A;  2R5Y B;  2HI3 A;  1TC3 C;  1MBK A;  3MN2 A;  2O9L A;  3S15 J;  3LSJ A;  1JFS A;  1NER A;  2JCG A;  5FLV A;  4BKX A;  2GBY A;  1ETK A;  1QP7 A;  3S1N J;  3JRC A;  1MH3 A;  2LYR A;  1WH8 A;  2XPU A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1IC8A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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