4GWMA

Crystal structure of human promeprin beta
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
573
structure length
561
Chain Sequence
ENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Meprin A subunit beta
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 174
structure length 561
sequence length 573
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwmA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwmA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwmA01
1C8TA 4MYEA 3MW3A 1ENRA 5KXEA 1H9PA 2VW1A 2FOJA 1UPSA 2ZGKA 3AZVA 1IAEA 4DFSA 3EDIA 5CUHA 3O0XA 4LBOA 3USUB 1W6QB 2D3PA 2UWCA 3WHTA 3QCWA 3RS6A 3KMEA 3N2UA 4IQPA 2CR2A 3T1MA 3LGPA 1O4YA 5JOZA 3F1AA 1ULGA 2ZKNA 4XXPA 4YSIA 3VTGA 4XBLA 4M3CF 3LK8A 4R3VA 3NV2A 3HDAP 4WZVA 4YLZA 1LOCA 1CIWA 2P37A 3LMCA 4FPKA 3USUA 4H84A 3WDVA 4FP2A 4YW4A 1MS5A 3D4KA 2P3KA 1AJOA 1MNCA 3EHYA 3RMYA 2GNDA 1A85A 4YGEA 4Q27A 4Y22B 1Q8SA 4M3CA 2I47A 1HQWA 5H9RA 4H76A 1IS5A 1BXHA 5D1UA 3MEPA 1GZCA 4YW5A 5DUVA 2Y6DA 5DZEA 1JBCA 4XJWA 4C1WA 2WO9A 1UZYA 1SBDA 4Y1XA 3ZXFA 1C4RA 4J4MA 1RMZA 1XFYA 2VH9A 1GYKA 3AP9A 5GJ6A 2CYFA 1CJPA 4FQ4A 5T54A 3ZUKA 3WCRA 4SLIA 1IACA 4JJQA 4Y1VA 1IADA 3DWBA 3VKFC 2SRTA 5GLUA 1LEDA 1QGLA 1EUBA 1WLWA 1WCSA 5CAZA 4LBQD 5T5PA 2C5DA 2NN8A 2P3JA 3B2ZA 1GNHA 2EXKA 4Q8KA 2D6NA 1I76A 4K20A 2NMNA 3LUMA 1C57A 2YROA 4DRRA 4CZSA 1YI7A 3OBTA 1LULA 2JE9A 3ZSMA 2H0BA 4ITCA 2RHPA 2ZGUA 3EHXA 1MS4A 4LBQA 4XMIA 2F1XA 1QMJA 3KEJA 1KJLA 4XHXA 5HCAA 1QUAA 2ZGOA 3O64A 1L6JA 5I0LA 3WG1A 1RF3A 2FMDA 2DURA 3UL2A 1CN1A 3LJGA 2D3SA 5E89A 3SH3A 1FLSA 1GKCA 2GALA 5GZCA 2CY6A 4YM2A 3GALA 1I1EA 3F15A 2HYKA 2ES3A 2GMMA 1LGBA 2W13A 4ILWD 4XMAA 3AYUA 1GANA 2ZA9A 1FX5A 3WHUA 1WUVA 1LJ7A 3WDXA 4GR8A 1FAYA 3AP5A 1OO9A 5DUWA 1ULFA 3OJBA 2X3CA 1ULCA 3VUOA 2POJA 3AZZA 4H49A 1BKCA 2YIGA 3G5CA 3WOGA 4PBOA 1HLCA 3WNXA 2Z2DA 2W15A 4R9BA 1SCRA 1BKZA 3QLQA 2F1ZA 2OVXA 1GICA 1QJIA 4RL7A 1CIZA 4H30A 1KDMA 2J83A 3N35A 4XJZA 3AZYA 4Q26A 3SITA 1QOOA 1UN1A 5F9TA 2DW1A 2F1WA 3AK0A 1Q8OA 1G8WA 2D3RA 3AFKA 3E8RA 1Y93A 4AVVA 2JDZA 2JNPA 4L6TA 5BOTA 5T52A 1B09A 3SH4A 4CRQA 3SH5A 2JJ6A 1KQRA 4YGDA 3MW4A 1G9CA 2AENA 3IVVA 3AYEA 1FNZA 1R55A 4F83A 4CA1A 1CGEA 1V6JA 4Q2FA 1F31A 1S1AA 2X3BA 2V5YA 5GZFA 1CXVA 4XM8A 4C9ZA 3APBA 3R05A 1DMTA 1G05A 2MZIA 4WV8A 1BQPA 4ZR5A 4GR0A 3SLIA 2E3XA 4LBMA 4XCTA 1Y7BA 3K7LA 2E51A 4H2EA 1LHWA 1YIFA 4FPEA 3N7KA 1OM7A 1LGNA 1QJJA 4IJOA 5KXDA 1LU2A 2OXUA 2GMPA 5JDBA 1W0PA 5DZFA 3FUOA 1N3OA 2N8RA 1MS8A 1N1SA 3LILA 4YZ5A 1JKYA 3AIGA 1G9AA 1BZSA 3WUDA 1V6KA 1J1TA 4XHBA 1V00A 1V6LA 1JN2P 1QF3A 3M3CA 2DDFA 2ZHNA 5H9PA 2Q5TA 1Z0HA 2L0RA 5L73A 1C7KA 2OXZA 1BM6A 1CR7A 3O0VA 3VKLA 1O4ZA 4JP4A 3TSKA 2CTVA 3MQSC 4LBJA 4FVLA 1YYNA 2SLIA 1KZZA 3AP4A 3KWVC 2W14A 4BLIA 1MS0A 1XFXA 3LE9A 1D00A 1CGFA 3WUCA 3ZSJA 5IK4A 1DLLA 2E53A 1V6OA 1D0AA 3POWA 1G9DA 3BA0A 5E1TA 1MS9A 3V96B 4Y20A 1G7YA 2SBAA 5IUQA 4H82A 4YZ4A 2K2GA 3SISA 4FOVA 3WLUA 1WW4A 4DQAA 4NOTA 3HSVA 1AXYA 3WDWA 1GE5A 4AIGA 2ZZJA 2D7FA 2NMOA 5I3MA 3DGTA 2ZHLA 4Q1RA 2X7MA 1HKDA 5EYYA 4PKVA 1SLLA 4BMBA 2AR6A 1B3DA 5CB7A 3AYKA 1ZXCA 3WG4A 3NV3A 4C1XA 2AGSA 1PWUA 4AXQA 5LABA 2JECA 5HCBA 2XB6C 1FBLA 5CA6A 1D0HA 4BQ1A 2ZMNA 3POYA 4PKWA 1XFZA 3EDZA 1LOBA 3AJZA 3IN9A 1FATA 5HCFA 2TCLA 4W65A 1ENQA 2MZHA 3PMEA 2WLQA 1H71P 2WO8A 2OW9A 1HY7A 3M1HA 2LALA 4GF1A 2JKBA 3ENRA 1BJQA 1IKPA 3HQMA 1LB5A 1KJRA 1PWWA 2I2SA 2O36A 4Y1YA 3HY7A 2ZGNA 4O1VA 4AYUA 1WNIA 3ZXJA 1MACA 1PWVA 3WVJA 5GLVA 4G9LA 1DZQA 3ZPYA 2OUJA 2WSVA 1WW7A 4PKSA 2JT5A 3T1LA 4XJAA 4Y24A 4I7DA 5I2ZA 2D1OA 2KRJA 1AX2A 4XILA 4GJHA 4DF9A 1XFWA 1GXDA 1C1FA 2OVUA 1I1IP 3N2VA 5AVAA 2OW0A 1PWPA 2A6YA 1A3KA 3HQIA 3IKWA 4M3CB 1UAIA 4UW3A 3ZVXA 1G49A 5KXCA 1TEIA 3ZXEA 4AUOA 2AIGP 1UL9A 2C9AA 3USNA 4LBNA 1V6MA 1EPWA 2MLRA 4WZFA 3CNAA 3VKOA 4YZ1A 2OI0A 2UU8A 2FHRA 1GZWA 1VLNA 1BQQM 3OYWA 2PHFA 3ZJBA 1QOTA 4FQZA 1LB6A 1I3HA 1X50A 4XOGA 1FLKA 4ZKTB 4M4EA 1OS2A 3KHIA 1SLIA 2ZGSA 1SBEA 4L8QA 1W6NA 2A7AA 4XE9A 4ON1A 1LOGA 2ZGLA 4AVTA 1H30A 3N36A 4U36A 1WW6A 1GO7P 1K7QA 1DQ6A 3KEKA 2CWSA 3L2YA 1SMPA 5T5JA 2OW2A 3HB2P 4GHUA 2R0HA 3WG3A 4XXAA 1DQ0A 3BTAA 1JAOA 1KUIA 1MR5A 5GZDA 1RM8A 2DTWA 1XFUA 2DDYA 1Z78A 4LBQB 1IABA 1LHOA 2O3EA 1IAGA 5JOWA 3DPEA 2FOPA 1MMRA 3DPFA 4FXYP 3HDBA 1FLLA 2E6VA 4L19A 3HR9A 4IUWA 4YZ2A 3V64A 3ZXLA 1D8FA 1HDKA 3LJTA 5B5PA 1G4KA 3TVCA 2OY4A 1GBGA 2PHUA 5F5QA 2R16A 1LU1A 1S0EA 3B01A 2AYKA 3B8ZA 1UMTA 3DUIA 3O12A 3AXEA 5IK5A 3LCPA 2USNA 3M2MA 1V6IA 1D5JA 4FPYA 2OW4A 3CKIA 2D43A 4JIJA 3HYGA 1K7GA 3AP6A 3RMXA 5T50A 1D01A 2A5ZA 1QDOA 1V6NA 2OZRA 1MZ5A 1Y8JA 1QICA 4FOYA 4XBNA 3F17A 4JA1A 1NXD1 2YB9A 3WV3A 1LECA 1QNYA 1FV3A 1JOJA 1UEAA 2UWBA 4I30A 2ERPA 5D1TA 3LJZA 3VI1A 1EB6A 1LOFC 4ATEA 1SCSA 1YY6A 1DYPA 3HBUP 1YP1A 3AYAA 2GKWA 2DVBA 4XBQA 1QIAA 4YG3A 1LOAA 3PJQA 2GDFA 1CONA 1ONAA 1N3PA 4Q1LA 2DW0A 3EWJA 3A4UA 1APNA 1DFQA 5T55A 2RJQA 2W68A 1DQ4A 1KITA 1H9WA 4H3XA 1SRPA 3TS4A 5L79A 1W6MA 2EXHA 1Q8PA 5GLTA 1YO8A 5FREA 4BOWA 2DVGA 1W6OA 4DRVA 1BSWA 5E8AA 5DZGA 4DV8A 1F9KA 1AX0A 4PBPA 4YGBA 3ILNA 2P2KA 4XJ8A 1LHVA 2D6KA 2NZ9A 3FUQA 1UTZA 3LQ0A 3M3QA 3HU6A 2DYCA 3IVQA 2WT1A 3UJQA 4PKRA 3LIRA 5H9QA 2W0DA 3M3EA 1WW5A 4FVVA 830CA 4WKIA 4GR3A 5IT6A 4Y1UA 1KUHA 1AF9A 1QOSA 5JOXA 1AXZA 2D44A 4I7BA 3K7NA 1AZDA 4JPAA 2D1NA 4I35A 3Q2HA 1AJKA 3WDUA 1XURA 1J7NA 1S0DA 2ENRA 3RRDA 3ZXKA 1Q56A 1ND1A 2W12A 4AGVA 3V65A 4YGCA 5BPAA 2NYYA 2YY1A 1LTEA 2A6ZA 2WT0A 2DVDA 1RITA 1N1TA 1KUKA 2ZMLA 2ZGPA 1LB4A 1ZMSA 3N7JA 2A70A 5GLZA 3WV2A 3TT4A 2JE7A 1DTHA 3B92A 5JMCA 2BQPA 2AREA 2EROA 4JRAA 2EIGA 2P3IA 5B5OA 2WT2A 4I03A 1VAMA 1VIWB 1DYKA 4R9AA 2D6OX 2JD4A 1JIWP 1YXWA 2D6MA 4X3GA 2AUYA 2EXIA 1JW6A 3B3QE 3V0BA 3P24A 3ILFA 3A0KA 1XUDA 2ZHKA 1MMQA 4TZDA 2X3AA 3ZYPA 3AJYA 2GNTA 4YW3A 2OW1A 3RTSA 4Y20B 4A7BA 1AX1A 4DS0A 1QNWA 1MVEA 3LKAA 1DQ1A 3F19A 3V0AA 1S0IA 1CQ9A 4GUYA 1OFSA 2CWMA 1AF0A 1ROSA 1BQOA 2WQZC 2GN3A 1WBFA 4NO4A 4FPOB 1F5FA 2CL2A 1YQYA 4Z8BA 1K7IA 2ERQA 3PVOA 2XXNA 5KXBA 2EXJA 1JAQA 3N7LA 5GZEA 1CZZA 3I8TA 1ATLA 1CESA 1UMZA 2WOAA 5BOYA 1ZP5A 1OM6A 2DW2A 1UKGA 3IPVA 2D6LX 1S0BA 3HN1A 3DL1A 3W59A 3D5OA 1MS1A 3ZVSA 5SV8A 1SLMA 2E7QA 2K9CA 4XTMA 2DVFA 4PKTA 1JUIA 1XUCA 4XZPA 3ELMA 1JIZA 4ATFA 2D6PA 1KBCA 1LODA 4K1ZA 3B9CA 3P1VA 3OPZA 3UVCA 3KECA 1JHNA 5I43A 2P34A 1A8DA 4ASMB 2ZACA 2ZBJA 1PZ9A 3AYDA 1R1ZA 5FRAA 2EAKA 5LK5A 1KRIA 4AGGA 5EWSA 1D7XA 3KRYA 4GXLA 1I73A 4Q1PA 4JC1A 3LQBA 2Z42A 1VAVA 2XS4A 3NX7A 2HU6A 3ZXHA 2NP0A 1BIWA 4XM7A 5DUXA 4ZXKA 1CA4A 1N1VA 3TB0A 2FV5A 3AZWA 4PKUA 5E88A 1JYIA 3HMYA 3ZYRA 3LIKA 1D0JA 3MW2A 2A3YA 3BOPA 3ATGA 4GQLA 1QU0A 3N7MA 4GKYA 5D2BA 5D3CA 4FPJA 2VU9A 1AKLA 2V73A 2KM2A 4GA9A 3Q2GA 1YCMA 4AVSA 1D8MA 3FLPA 4HL0A 1HV5A 966CA 2VXRA 1Q3AA 4Q8LA 2ZHMA 1W0OA 2VY0A 5CZMA 4GWNA 4P9YA 1EAKA 1O0QA 5GZGA 4YZ3A 4PCRA 1JAPA 1QDCA 3NV1A 4XDQA 4UW4A 1SLBA 1GZWB 3VV1A 4DD8A 2ZABA 3OYWB 1GSLA 3OGGA 2LTNA 1GKBA 2ZGQA 3WCSA 2R1BA 1LGCA 4Y26A 5CBLA 1HFSA 4K21A 2ZGRA 3AP7A 1W6QA 1UX6A 1MS3A 3M3OA 1N3QA 3BIWE 1LHUA 3DSLA 4BPZA 1S4BP 1W6NB 3WG2A 1PZ7A 2JT6A 3GBOA 3AZXA 5EYXA 4EFSA 2MZEA 2A25A 1C3IA 1CGLA 1CK7A 4DPEA 4KG9A 4D69A 3C2UA 4PQ9A 2VW0A 1SLNA 3LSDA 2W39A 1KAPP 1S0JA 1S0FA 3ILRA 4HANA 4GALA 2EALA 2J0TA 4XM6A 1OQ1A 1BYHA 4LBLA 3F18A 1IKQA 3I4IA 5CXAA 4K1YA 5H9SA 3FBYA 1ZTQA 3ZSLA 4Y22A 3A0NA 1GLHA 3R4UA 1GKDA 2ARBA 5JVVA 1BKCE 1C1LA 3Q9OA 1G12A 4BMEA 2CLTA 4XIKA 3AX4A 1G9BA 1HQLA 2XS3A 3MA2A 3OBRA 3O2XA 1KUGA 2FV9A 2VUAA 1Y0VA 2ZAAA 3WV6A 3U1RA 4AGRA 1AVBA 1SFYA 5GM0A 4CTEA 3WV1A 2R0FA 1QIBA 1LOEA 3O5SA 1GZ9A 4ISQA 2R1DA 2F1YA 1SU3A 1WBLA 5L7FA 1RINA 4BLJA 3WDTA 2JIHA 4TYSA 2E7TA 1GE6A 4DPNA 1IS3A 1PWQA 4FOQA 1A86A 3KQRA 4LBKA 1FYUA 5D7WA 1HOVA 5IK7A 3ASIA 2WNEA 1SLAA 1ASTA 1G9FA 3JUUA 5H9MA 4I7CA 3I7GA 1UTTA 2RJPA 2DV9A 1OM8A 4AYKA 3SNMA 1U0AA 2ARXA 2DUQA 2GNMA 2PHWA 4YG6A 1VALA 4YM3A 3INAA 1BUDA 4M00A 2XG3A 3RQ0A 1R1JA 2PELA 2PHRA 3KM5A 2W08A 4HX3A 2GN7A 1HFCA 3BODA 4GKXA 2QPJA 2DWRA 4WVVA 4YW2A 1Q8VA 1N1YA 1KUFA 1W6PB 1BKCI 1LESA 3HQHA 1JYCA 4R9DA 1W6MB 2AH2A 1GO8P 3IM0A 1GV9A 4G0DA 2DTYA 3H0OA 5GLWA 1W6OB 1Q8QA 4L63A 1PZ8A 1FV2A 5DG1A 1KDKA 1WD3A 1G86A 4XBHA 1DGLA 4KBBA 3WDYA 2AYHA 2OVZA 1W6PA 2DUOA 1LENA 4GWMA 3L0VA 2PJTA 5DUUA 2CKIA 3AXDA 1RIRA 3I7IA 3NV4A 1IS6A 2VW2A 1SBFA 2DU1A 4BM8A 2TEPA 3O0WA 1USNA 2OXWA 1DQ5A 3EDGA 4P9WA 3EDHA 1YOUA 3FFZA 1BUVM 1DIWA 2A75A 1YZEA 1MVQA 3FLTA 1S0CA 2PHXA 1AXKA 4FP3A 4YM0A 3PVEA 4IN9A 4FPLA 1CZYA 2A71A 5I4OA 4ISRA 2YXSA 3OY8B 1B8YA 1ZXVA 1SLTA 3TAYA 1F3VB 2YMZA 1LEMA 1ZM1A 2ERFA 5GALA 1JK3A 5DXDA 2AN6A 4Y1ZA 3U4XA 2EF6A 1D2SA 2YZ4A 1IOAA 3UK9A 1FNYA 1K2FA 3G42A 2CNAA 3HY9A 1IS4A 1R54A 2A8HA 2UWAA 2B7YA 3B00A 4H1QA 4XTPA 1QKQA 3OY8A 1IAAA 1DHKB 3DNGA 4YG0A 1ZVXA 4YM1A 4FU4A 1MZ6A 2DU0A 1OS9A 4FPCA 3RSJA 3D6EA 3MPPG 1O0TA 1S0GA 1WD4A 1XQNA 1MMPA 2R49A 5DG2A 3NWKA 4H55A 1CAQA 3V0BB 2E2DA 1SLCA 5H8XA 5T5OA 4P9XA 3W58A 1GE7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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