4GWMA

Crystal structure of human promeprin beta
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
573
structure length
561
Chain Sequence
ENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Meprin A subunit beta
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 174
structure length 561
sequence length 573
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwmA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwmA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwmA01
1BUVM 2YMZA 1S1AA 4PCRA 3P24A 4H84A 3O0WA 1PWUA 1ASTA 1CZZA 3D4KA 5CBLA 2R16A 3ENRA 3OYWA 2Z2DA 1KJRA 1CXVA 4H30A 4FU4A 1UN1A 1AX1A 2GNTA 1GE5A 1GZCA 1LEMA 2OZRA 4YGCA 4GR3A 3RMXA 5HCFA 2VW1A 2D43A 3L2YA 1GSLA 2DVBA 1UAIA 4LBJA 4DRVA 5D2BA 2ERPA 1JYCA 1QF3A 2WNEA 5I3MA 3AX4A 1CQ9A 4PKSA 1MS3A 4GKYA 1KAPP 3VI1A 2DVGA 4FP3A 3M3EA 4DV8A 5I0LA 3MW2A 1SBDA 1H9WA 1V00A 4XTPA 4RA0A 3P1VA 5HCBA 4Y1YA 2AR6A 2YB9A 2K2GA 1OM6A 1GZWA 3KMEA 3OGGA 2ES3A 4I7CA 3IN9A 1YY6A 1GXDA 3AJYA 3G5CA 1IS4A 1PZ9A 1SCSA 2D44A 1A78A 2H0BA 2R0HA 4Y22A 1I1EA 1N3QA 1MMQA 4I30A 1ZXVA 3HQMA 5D1TA 1JAPA 1B09A 1IACA 1WLDA 5GZFA 3USNA 3HQIA 5IT6A 3N35A 4FPKA 1ULEA 2A25A 2W15A 1AKLA 4P9WA 3EHYA 1S0EA 3AJZA 2PHTA 1AXZA 5EWSA 5L79A 4JIJA 1LENA 2EROA 1MS9A 2AYHA 4Q8KA 4F83A 1DQ2A 2JJ6A 1UKGA 3W58A 1QSCA 3F16A 3OBTA 1BZWA 4JA1A 5CNAA 4U36A 2MZIA 1AYKA 4YG6A 1YYNA 4GF1A 1CZYA 1WUVA 3EDZA 1S0IA 1ND1A 3BODA 1SLCA 1CVNA 3ZXHA 3LMCA 1W0PA 4JP4A 3LJTA 1ULDA 1YOUA 1LHVA 3WDTA 4AWDA 2A3WA 1SLIA 3A4UA 1IS3A 1D0JA 4XIOA 2DTWA 1CR7A 1DQ4A 1IKPA 1LODA 2D6LX 4WZVA 3C2UA 2X7MA 1ATLA 1JK3A 3B8ZA 3WHUA 5JOZA 2EXKA 2FHRA 4IJOA 4IQPA 4WK7A 5AVAA 1A3KA 4XXPA 1BKZA 2GMEA 4L19A 2VU9A 5DZGA 4XE9A 1V6LA 4Y1XA 5F5QA 3RS6A 4WVWA 2DVDA 4LBMA 1ZS0A 1HDKA 1MVQA 4AYUA 1GKBA 1JKYA 5E1TA 4AGVA 4AUOA 3V0AB 1CGFA 4GR0A 4AGGA 1S0JA 2UWAA 4GKXA 4FVVA 1MACA 2D6MA 1LB5A 1G49A 3FLTA 1BJQA 4FXQA 4AXQA 1UL9A 5IK7A 1W6NB 1UMTA 2WQZC 5CZMA 1SACA 3CNAA 3LIKA 2NZ9A 3T1LA 3RTSA 3RRDA 4XJAA 3ZXJA 1G9BA 2ZGRA 3M3CA 1BUDA 1UZYA 1QUAA 1VLNA 5FRAA 1CGLA 3RG0A 5BYNA 4JQGA 1OM7A 1K7IA 1SLTA 2WKKA 4XJWA 4XBQA 1LGNA 1D5JA 4H55A 1LGCA 3LE9A 1MZ6A 4U2AA 3N3HA 2A6XA 1QU0A 3TB0A 4YFZA 2ZHLA 1URXA 1YI7A 4PBOA 3V0BB 1CGEA 4CZSA 2OXUA 3N36A 1MZ5A 2DUPA 4I03A 1S0CA 1WW6A 1HY7A 2K9CA 3R4UA 4YM3A 1SMPA 2VUAA 4BOWA 1KUKA 1Y7BA 4Y20B 2JE9A 4ATEA 2AH2A 3KEJA 4Q1LA 1FV2A 1R1ZA 2A6VA 1I76A 1HOVA 5BOTA 3DWBA 3FFZA 1C7KA 1S0GA 2CLTA 2QPJA 1QNWA 4JRAA 3SH5A 3HYGA 1DQ1A 2YZ4A 3IVQA 2DTYA 2ZHNA 3HQHA 1XFUA 5IK8A 1AJKA 1ZP5A 3VKLA 1UTTA 3L0VA 4AVTA 2HU6A 1XQNA 4Q1RA 3SHIA 3IPVB 1SBFA 4XIKA 1CPMA 4MYEA 3DL1A 3VKOA 4XBHA 2ZGNA 5GLWA 2OVUA 1VALA 3MA2A 1OQ1A 2SBAA 1HV5A 3V0AA 3NV2A 1EUBA 2XG3A 4LBNA 1JBCA 2UWBA 1WLWA 4PKUA 1K2FA 3N7MA 1W6NA 5L7FA 1GNHA 2W13A 4K1YA 1OKQA 4KBBA 2OW0A 1VIWB 3AP9A 4HMAA 4GWNA 1JN2P 3ZYRA 1LHWA 3O0VA 1BIWA 3WV6A 4BM8A 5I12A 1MS8A 2OW4A 2RHPA 4P9XA 3O12A 1JXNA 1AXKA 1PWWA 3O2XA 3LGPA 2WO9A 1G9CA 2Y6CA 3WG3A 3FBYA 5KXBA 1SLBA 2DW2A 4PKTA 1ZA4A 3O5SA 4CA1A 3F1AA 5DUXA 3FLPA 2VW0A 2DDFA 3T2TA 1LOFA 4FOYA 3HY7A 4XHBA 3SH4A 1VAVA 3ZSKA 3OHOA 3LIRA 1DYKA 1G05A 4Y20A 3M3OA 4PKQA 5IK5A 3AK0A 1UTZA 2XS3A 2LTNA 4HL0A 1W0OA 1XFWA 1V6NA 1XFZA 3I7IA 456CA 1X50A 3ZSJA 1SBEA 1R1IA 1RMZA 5F9TA 3AXEA 2D6KA 3N7JA 1QKQA 1L6JA 5DG1A 1UZZA 2ZHMA 3LJGA 4BMEA 3F15A 1DIWA 2XS4A 1MS0A 1WLCA 1PZ7A 2AREA 5GZEA 4YG3A 1JAQA 3RMYA 2JKBA 1UMSA 3A0NA 2R1BA 4R9CA 4K8UA 2C9AA 2MLRA 4XJUA 2ZABA 3U4XA 3MQRA 4GJHA 5CAZA 2ZMNA 1PZ8A 2CYFA 1BZSA 1USNA 5LK5A 2VY0A 1BXHA 3POWA 5CB7A 4FQZA 2JT6A 4NO4A 1XFVA 2YIGA 4FVLA 3TSKA 3TS4A 1UPSA 1B3DA 1R1JA 2CKIA 5DZFA 1BKCI 3NV4A 4GALA 3AZXA 3NV3A 4ASMB 1QOSA 5EYXA 2PELA 3PVNA 3M1HA 1LHUA 2WSVA 5T55A 3POSA 1LOBA 1W6QB 1JYIA 3K7NA 3MQSC 4K1ZA 4Z8MA 3L0TA 1D00A 3RSJA 1HTDA 4Q27A 4YM0A 3T1MA 2OVZA 3ZXFA 2RJPA 1D7XA 3CKIA 1CESA 1FNZA 3PMEA 1D0AA 3NWKA 3DSLA 2VH9A 1V6OA 3OY8A 1Y8JA 2AENA 1XFXA 1OMJA 2W68A 2OVXA 1Q3AA 3WCRA 1SRPA 4XM8A 2ZHKA 3ILFA 2GNDA 1IAGA 2JNPA 3FUQA 3B9CA 3FLRA 2WO8A 4GUYA 1IADA 2XB6C 4ITCA 5H8XA 1Q8QA 3APBA 5B5PA 4HANA 4Q1PA 3PJQA 1I73A 2DV9A 1C57A 2YXSA 1N1TA 4YFWA 1LB4A 1WW7A 1F9KA 1J1TA 3AP4A 2ERQA 2V73A 1ENQA 4YW4A 3HBVP 4X3GA 5T52A 3EWJA 1APNA 3LEAA 1EB6A 3LUMA 5E89A 1GKCA 2E3XA 2L0RA 5GLTA 4TZDA 2FMDA 3UK9A 1G9AA 1NLSA 4R9DA 2ZAAA 4WV8A 1FM1A 1YO8A 2OW2A 4XTMA 2VW2A 3DGTA 2OW1A 1W6MB 2ARBA 1ONAA 4YW2A 1JIWP 4HX3A 2NM1A 2GDFA 1CA9A 1ENRA 5DZEA 1N3PA 2AYKA 3WDWA 1KRIA 1GYKA 4Y24A 3TVCA 1Q56A 3GALA 2ZGLA 2E7QA 5JOXA 1QNYA 4XM6A 1W6QA 4JC1A 2ZMLA 4FOQA 3N7LA 1CIZA 1DQ6A 1BQQM 5B5OA 2AN6A 2FOOA 1AVBA 4Q2FA 1D0HA 1D8MA 4XCTA 1W6OB 4XZPA 1OS9A 1DBNA 3OBRA 1DFQA 1I3HA 1W6PA 5GLUA 1RIRA 4XOGA 4YM2A 1CQRA 2P3IA 4ZXKA 3W59A 4YM1A 1FATA 3F17A 4C1WA 1SLMA 4RL7A 1FLKA 1UEAA 2W12A 4H1QA 1PWPA 3NV1A 3KHIA 2D6OX 3WV3A 3LSEA 2NP0A 1HQWA 5DG2A 3SNMA 5JMYA 1JUIA 3G42A 3VKFC 5BPAA 1R54A 1LCLA 1BYHA 2Y6DA 5JOWA 1UMZA 5T5JA 4UW3A 2WOAA 1LOEA 4R9AA 1ZMSA 1RF3A 4IN9A 3IM0A 2SRTA 2MZHA 2DUOA 2P34A 4M3CE 3AZZA 1RM8A 2A3YA 3A0KA 1ROSA 4ILWD 2ZGUA 3IMNA 2OW9A 4BQ1A 1RITA 4UW6A 2WJSA 4SLIA 3KMCA 1Z78A 3IKWA 3INAA 3AP6A 1W6MA 1R1HA 1G8WA 1PWVA 5FREA 4J4MA 1G9KA 1AF9A 1SLLA 1Q8SA 1V6KA 3WV2A 2PHFA 1DYPA 5I2ZA 4EFSA 2E2DA 1LU2A 5KXCA 4UW4A 1YXWA 1QGLA 1WBFA 3OPZA 5D1SA 1ENSA 4FPJA 1XUDA 4GA9A 4ATFA 1QMJA 3WOGA 1IKQA 2X3BA 3WDYA 3LILA 4Y26A 4FXYP 2EXHA 1FX5A 1ZM1A 4XBNA 2DW0A 3B92A 3WG4A 5SV8A 3HSVA 1QICA 2PHXA 3N7KA 3AYUA 1QDOA 4IUWA 1W6OA 2WT2A 1H30A 4FPHA 1KDMA 4XM7A 1O0QA 2GMMA 5GALA 3ATGA 4CTHA 2WT0A 4DS0A 5DUUA 4Y1VA 2BQPA 1D2SA 3Q2HA 5GLZA 2DVFA 2PHRA 4QKZA 4YW3A 1OM8A 3HDBA 2O36A 3DUIA 4YSIA 4AGRA 4FPCA 4YGBA 2PHUA 2A70A 3B2ZA 1GBGA 4O1VA 1V6IA 2PJTA 4YZ4A 2EALA 3TAYA 1LHNA 1Z0HA 4YGEA 3POYA 1N1YA 1QOTA 5T54A 1G9DA 1FBLA 1KZZA 1LOCA 2CWSA 1EAKA 2HYKA 1Z3JA 2OY4A 2FV5A 2XXNA 3KECA 2V4BA 1QJJA 3ZXEA 3AYCA 1KUGA 4XMIA 2R1DA 3HN1A 3B69A 1TEIA 1WNIA 1FNYA 3AYKA 3LJZA 3VV1A 1QIBA 1CAQA 4D69A 3ASIA 1C1LA 2A5ZA 4LBOA 4I7DA 3WV1A 1AX0A 4PQ9A 5GZDA 1GLHA 2JSDA 1AF0A 3RTTA 4ON1A 1GO7P 1BQPA 2UWCA 1G86A 1CPNA 4M4EA 1K7QA 4XBLA 2EXIA 1HFCA 4OZXA 3N2UA 1NXD1 2F1XA 2FOPA 3OY8B 2NYYA 2B7YA 2E53A 3VTGA 3I4IA 3SH3A 2ZGTA 2WSUA 3AYEA 4R3VA 2OUHA 1SFYA 4DFSA 1C8TA 3LQBA 3WUCA 1WD3A 3U1RA 1Y0VA 4DPEA 1OFSA 4UW5A 4AYKA 4K21A 2O3EA 3VKMA 5D1UA 1GO8P 1KDKA 2AUYA 5GLVA 966CA 4PKRA 3WG1A 2OY2A 3BOPA 2JDZA 1LECA 1G12A 2D7FA 1YIFA 1GE7A 3O64A 2D6PA 3PVEA 3Q9OA 2DU1A 1DQ0A 2GNMA 5HCAA 4L6TA 2ZACA 4A7BA 4FOWA 1FV3A 3JUUA 4FOVA 4FP2A 5GM0A 2DWRA 3UJOA 3ILRA 3ZXKA 3QCWA 3WZ1A 1LOAA 3ILNA 2GN3A 3O0XA 4WKEA 4L8QA 4LBKA 2DU0A 4H2EA 1O0TA 1DLLA 5JOYA 1WW5A 1QIAA 4M3CF 1KUHA 1KJLA 1ULFA 1LULA 2I47A 2A3XA 2W0DA 4H82A 3UVCA 2CL2A 3WHTA 5H9SA 1DMTA 5H9MA 5DUVA 4XILA 3UL2A 1YQYA 5D7WA 4I35A 4WKIA 1BQOA 1LEDA 2R0FA 3AYDA 2DW1A 3WUDA 2GALA 3BA0A 3LUNA 1ZVXA 3MEPA 2ZBJA 4FPGA 3WDXA 3AZYA 4Z8BA 1UX6A 2JT5A 4WZFA 3ZPYA 4YZ3A 2VXRA 1GV9A 4M3CA 5JLVA 1V6MA 3HR9A 4KG9A 1GICA 5I4OA 1F31A 2CTVA 1RINA 1W6PB 2GKWA 2D6NA 5JMCA 2D3SA 1ULGA 1LU1A 2ZKNA 1Q8VA 1D01A 4AVSA 2DUQA 2JD4A 2N8RA 3LQ0A 3H0OA 4Q26A 1LB6A 3QLQA 3E8RA 4XXAA 4GXLA 2UU8A 4FPYA 1WCSA 4DQAA 3ZVXA 1MR5A 1DQ5A 5T5LA 5KXDA 1JAOA 3WCSA 3BTAA 2JIHA 3HBUP 1WD4A 3M3QA 3ZVSA 1C3IA 1Y93A 1F3VB 3OHLA 4H76A 1GNZA 3KQRA 3USUB 5CXAA 5LABA 2OXWA 3B3QE 4C1XA 1GE6A 2A7AA 1CONA 1PWQA 2EF6A 3DPFA 3LKAA 4Y1UA 2I2SA 2Z42A 5H9RA 5DUWA 2Q5TA 2ZZJA 1BKCE 2ZGPA 4G9LA 5I43A 2X3CA 1JJ9A 2A6WA 3VUOA 3WDVA 1FLLA 1HFSA 4WVVA 4FPOB 2ZGMA 2R49A 3LSDA 1YRZA 4Y1ZA 4XJ9A 3KEKA 2UURA 1KQRA 2YROA 4YW1A 1AZDA 2G4IA 1ZXCA 4WF6A 4ISRA 1G4KA 4PKVA 3AIGA 4FPFA 1H9PA 4R9BA 3IVBA 4AVVA 1YZEA 2EXJA 1KUFA 4LBQB 2D1NA 2J83A 5JVVA 1OO9A 1QOOA 5GZGA 2E51A 5CUHA 1C4RA 2AIGP 3SISA 1LESA 2EIGA 1HLCA 2TEPA 5DXDA 3DPEA 4GHUA 5E8AA 4L63A 3V65A 1IAAA 1D8FA 4BLIA 1L0AA 3B00A 3EDIA 3HMYA 1C1FA 2GMPA 5T50A 1CJPA 3R05A 1WW4A 2GN7A 4PBPA 3HU6A 2OI0A 1N47A 5E88A 1XUCA 3AYAA 3MW4A 2DDYA 1MS5A 2ENRA 4YG0A 1SLNA 2DURA 1MMBA 1FYUA 2A8HA 3HB2P 3I8TA 1G7YA 1S0BA 3SITA 5CA6A 3TT4A 1O4ZA 1CN1A 5GZCA 2ZGQA 4BMBA 3HQLA 3EHXA 1F5FA 2ZA9A 1VAMA 3F19A 1AX2A 2DYCA 2JE7A 2C5DA 4W65A 2P2KA 2F1WA 1EPWA 3USUA 1MVEA 3WDUA 3HY9A 3AXDA 2FV9A 4H3XA 2E7TA 2ZGKA 3GNEA 1IS6A 2D3RA 1KUIA 1YP1A 3D5OA 1DHKB 2W39A 4GQLA 3LCPA 4YGDA 1KBCA 2RJQA 3GBOA 3EDGA 1AJOA 1DTHA 1R55A 3FUOA 1OS2A 1SATA 4BPZA 4PF5A 1IAEA 1XFYA 4JJQA 1FLSA 4XDQA 3I7GA 3KRYA 2P3JA 1MS4A 830CA 4XJ8A 1JW6A 1CA4A 2W52A 3WLUA 4FPEA 1A85A 2MLSA 1HQLA 2LALA 1DZQA 3IVVA 3ZYPA 1JOJA 5EXOA 1N3OA 4XYXA 1XURA 4G0DA 2ERFA 3N2VA 3JU9A 2P37A 2EAKA 5KXEA 1S4BP 3PVOA 4P14A 1Q8PA 4LBQA 1JIZA 2YY1A 4FPLA 2CR2A 1GZ9A 2D1OA 1S0FA 3WVJA 2MZEA 5GJ6A 4K20A 1GKDA 2A71A 4BLJA 3AZWA 2P3KA 4YZ5A 5T5OA 2W14A 4M00A 1WBLA 4GR8A 4JPAA 2JECA 1B8YA 3SLIA 3WNXA 1J7NA 4Q8LA 4I7BA 3B01A 1N1VA 1MNCA 1KITA 1IS5A 2NN8A 4CTEA 2A6ZA 2D3PA 5EYYA 1QDCA 3DNGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4XUN A;  4JHT A;  3D6E A;  3J8F 1;  3OG2 A;  2ZX2 A;  5F39 A;  4ZU4 A;  1AL0 G;  3WG2 A;  1AYN 2;  1GOF A;  1XB9 A;  1OC1 A;  1AXY A;  5C8C A;  2YUE A;  5BNO C;  2XJQ A;  3S7E A;  3ACG A;  1MS1 A;  2Y26 A;  3H8O A;  1MMP A;  2VZP A;  1BM6 A;  2C1F A;  2ZGS A;  2B5H A;  3KQ4 B;  1LJ7 A;  3EB7 A;  4COY A;  4LIU A;  3TOJ A;  1SPP B;  4WVM B;  5ANN A;  1PGW 1;  2ZMK A;  3AZV A;  1LTE A;  1S0D A;  3ES1 A;  5FMD A;  2V5Y A;  5C3S A;  1ZZ9 A;  1A8D A;  4AVB A;  2POJ A;  2PLV 1;  4LHN A;  2NMN A;  4UAP A;  3VD3 A;  2ARC A;  1YWK A;  2XKO A;  3VKN A;  1Y9Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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