4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Meprin A subunit beta
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
1LODA 4AGGA 2CNAA 3AJYA 3WUCA 1CVNA 3LSDA 4FPFA 3WV6A 2VW1A 2USNA 4YGDA 3ZVSA 2P3IA 4JJQA 2N8RA 3HBUP 2E3XA 1LTEA 4YSIA 2W15A 5DG2A 1F3VB 1C1LA 2TEPA 2A3XA 2DW1A 3WVJA 3UL2A 1DTHA 1BZWA 3EHXA 2BQPA 2JD4A 3WV1A 3V65A 4AYUA 1IS6A 3D6EA 3V0BB 2F1WA 2JE9A 1MACA 5CAZA 3USUB 5KXCA 4AIGA 2OW1A 1WD3A 3AYAA 1VAMA 3AYDA 3OBTA 2X7MA 1ENRA 3HDBA 4A3WA 2MZHA 1D7XA 3WDYA 5DUVA 4Y1UA 3V96B 5GM0A 5EWSA 5BYNA 2UURA 3NV3A 3HY7A 3U1RA 3A0NA 3ZXEA 1IKQA 3ZSKA 5GZEA 1SLBA 2XS4A 1FLSA 4DPEA 5D7WA 2MLRA 1I1IP 1ULEA 1SCRA 4XTMA 2DDFA 3RMYA 2EXJA 1XFVA 1Q8PA 1BM6A 1HQWA 3GBOA 1N3QA 1GICA 2YIGA 3N35A 1QDCA 1QF3A 5I12A 1G4KA 3ZYPA 1FX5A 3HN1A 3OBRA 2E2DA 1Y93A 3M3EA 3NWKA 4YM3A 3WDVA 3LJTA 3KHIA 3B8ZA 2CYFA 3AP4A 1DHKB 2JT5A 4G9LA 2OVZA 3LCPA 3TVCA 2JKBA 3K7LA 1W6NA 3EDHA 3VKFC 5H9SA 5CB7A 2SRTA 4M4EA 1YI7A 1QNYA 1OS2A 1WD4A 1SCSA 4HL0A 2ZGRA 1BQQM 1WBFA 3ZXFA 4YG3A 3AFKA 1QOSA 1ZXCA 4PKTA 2ZGKA 2W13A 3T1LA 2KM2A 3MQSC 3Q2GA 5GZGA 4JPAA 1PZ9A 4GALA 5L79A 5GLWA 4XJ9A 966CA 2AREA 4LBJA 1CA9A 4IUWA 2E7TA 3KMCA 2QPJA 1W6MA 1JHNA 1LOFC 3F1AA 1HV5A 1C3IA 5F9TA 4WK7A 2A3WA 3EDZA 4UW3A 2CL2A 1W6QB 3FUQA 1DQ4A 4LBOA 3UJQA 2W52A 1W6OA 2WT0A 3SH3A 1AX1A 5T50A 4Z8MA 3KQRA 4XDQA 1FM1A 1CQRA 3M3OA 1BYHA 4I7DA 2ZA9A 5D3CA 3O0WA 1I1EA 1R1JA 3BOPA 1LENA 4H1QA 1G05A 5H9MA 3RSJA 4PBPA 1MZ6A 2JECA 2A6YA 4WF6A 2D43A 5D1UA 3R05A 5GALA 5JLVA 1DFQA 4W65A 2E7QA 5BOTA 4ZKTB 3R4UA 5IK5A 1GE6A 2P37A 1SLTA 4Y22B 1FAYA 1OMJA 3OHLA 456CA 4H82A 4K20A 5T5LA 3OY8A 2DW0A 3ZSLA 4YGBA 2AIGP 1CXVA 4GUYA 4Y1YA 4BPZA 1UL9A 4M3CE 3N2UA 3W59A 4H30A 3VUOA 2CWSA 2FV5A 4XTPA 3IM0A 4WZVA 1G86A 2EAKA 3PVEA 1LGBA 4XMIA 4JCKA 4LBQD 4GKYA 4Q27A 2ZGNA 1KJLA 2L0RA 1WW5A 4FQZA 4IN9A 1G9DA 2D1NA 5JVVA 4K21A 2HYKA 2PHRA 4LBLA 4AWDA 3WLUA 3AZXA 2DVAA 3A4UA 1Q8SA 1WCSA 4H84A 1WW6A 1LHWA 2DU1A 5CNAA 4BQ1A 4Z8BA 4YW2A 4XIOA 1S4BP 3Q2HA 3LILA 3QLQA 3FLPA 4EFSA 4U2AA 4FPCA 3DWBA 4Y26A 3WNXA 4NOTA 4QKZA 3KM5A 3HQLA 2GNDA 2ZKNA 1JYIA 1LB6A 2YXSA 4PKWA 1R1ZA 4AXQA 2PHXA 1QJJA 1UTZA 5GLZA 3F15A 4YZ2A 5H8XA 3E8RA 3SISA 2E51A 3L0VA 3P24A 2ZGSA 5GZDA 1ULGA 2VUAA 1UX6A 4DD8A 1WNIA 3BTAA 4H2EA 1C1FA 5IK7A 3APBA 3DPEA 1JW6A 1RITA 2NZ9A 1W6QA 3MA2A 4D69A 2R0HA 2ZMLA 1MS9A 2GMMA 1RIRA 1XFUA 5HCBA 3F18A 1ND1A 4FPEA 3LUMA 1HKDA 1RINA 3SITA 5GZCA 2WKKA 3FFZA 2P34A 4FOQA 2ZGUA 4YM2A 3RTTA 4LBQA 5T54A 1LGCA 4BLIA 3O2XA 2DVBA 1AF0A 2CKIA 1FV2A 2W14A 4GKXA 1C8TA 1WLCA 3EDIA 3NX7A 1CESA 3VI1A 4YZ5A 4M00A 3LSEA 4I35A 2WT2A 2Q5TA 3WV3A 3F17A 3ASIA 4Q1RA 1N1YA 4AVVA 4FVLA 1CR7A 4XM7A 3AJZA 4C9ZA 1BSWA 1DGLA 4P9YA 2Z42A 1CIZA 3USNA 3B69A 4I7CA 1NLSA 5GLTA 3JU9A 4WVVA 5JOYA 3HU6A 1S0BA 4GHUA 1L0AA 2NYYA 4RA0A 1YXWA 1W6NB 3QCWA 4SLIA 3F16A 1QJIA 2FOJA 1UPSA 4PKVA 2W08A 2AR6A 3WHUA 3PJQA 4Q1LA 2ARBA 2E6VA 2VU9A 4K8UA 1QSCA 1SRPA 1SLLA 1SLCA 3LKAA 1G9KA 1G9BA 4YZ1A 5I4OA 1H71P 1I73A 4YW3A 1UEAA 4DPNA 3AYKA 1W6MB 3I7IA 2D44A 1GE7A 2Y6DA 1ASTA 1SATA 3MW4A 1GKCA 4FOWA 2D3RA 4GXLA 2OUHA 3AK0A 2XS3A 2PHTA 3T2TA 4HANA 1MVEA 1FNZA 2ERPA 1LHVA 4JIJA 3WCRA 1W6OB 2JSDA 3AXEA 1HQLA 1WUVA 1UMSA 3HB2P 3MPPG 1JN2P 2DVDA 2DURA 3POYA 2A71A 2NP0A 4PBOA 3RQ0A 3IVVA 3WV2A 2P3JA 1CGEA 3LQBA 3EDGA 1BUDA 4P9XA 2D3SA 4XBQA 1GNZA 2GNBA 1SU3A 3WOGA 5GLUA 1KQRA 1XURA 1EB6A 3AXDA 1XFYA 3BIWE 4GR8A 1K7IA 4DRRA 4FPKA 3JUUA 1LOAA 1ONAA 2OVUA 1ATLA 3FLRA 1D0HA 3HQMA 1D5JA 1YQYA 5T5PA 2OXWA 3AYUA 2PHWA 4UW4A 4FVVA 3WG4A 2HU6A 4XILA 5CBLA 5T5OA 3CKIA 4CA1A 3OY8B 4XXAA 1DQ1A 1A86A 1C57A 1QICA 1JYCA 2ZGOA 2W68A 2OUJA 1YOUA 4L19A 1VALA 2DU0A 3UK9A 2OW2A 4AYKA 3LUNA 4CZSA 1B8YA 1MS1A 2MZIA 2LALA 1V00A 2X3CA 2ZGQA 1JIZA 2C9AA 3B01A 2OXZA 4I03A 1V6LA 4FPHA 1LU1A 1V6MA 2D6LX 4JRAA 4WV8A 3IPVB 1GBGA 3LQ0A 1S0EA 2KRJA 1YZEA 1DZQA 4BLJA 1S0IA 3BA0A 1OM8A 4Q8LA 1BUVM 3I8TA 4F83A 1GNHA 3L2YA 5B5PA 1B3DA 1I3HA 5BOYA 4PKQA 2OW4A 3KEKA 3HMYA 1JH1A 1AX0A 2D7FA 1YCMA 3VV1A 2ES3A 1FBLA 1SLAA 1SFYA 3T1MA 1W0PA 2ZHNA 1HY7A 4FPOB 4GR0A 4R9AA 2NMOA 1LOBA 1SBDA 1A78A 1QOOA 5JOWA 5I3MA 2D3PA 4BMEA 3HY9A 1VIWB 2CR2A 4XBHA 1HTDA 1DYKA 3RRDA 4Y1XA 1G7YA 2ZABA 4G0DA 2YV8A 1GZ9A 2DV9A 2UWBA 2FHRA 3CNAA 3ZVXA 3AP9A 1LHUA 1N3OA 4AUOA 3LIRA 2AYHA 3N3HA 4RL7A 4AGRA 3M3CA 2ZGPA 2F1ZA 1BJQA 3B9CA 3BODA 1AJKA 4HX3A 4FPJA 4AGVA 1BXHA 1G9AA 1JAOA 3DSLA 1GLHA 1MZ5A 4ATFA 1MMRA 2JIHA 2V5YA 4LBQB 4BMBA 1IKPA 2NM1A 1H9PA 1JIWP 1OM7A 3EHYA 4O1VA 1CQ9A 1Q3AA 2AUYA 2R1BA 1S0FA 2D6PA 1Q8QA 1LEDA 5DUUA 5GZFA 1KUIA 4M01A 4YFZA 2D1OA 5T52A 1FATA 1KAPP 4ISRA 1JBCA 3OGGA 1AXZA 3SHIA 4HMAA 2YMZA 3WCSA 1DBNA 1GZCA 2RHPA 5KXDA 4XJ8A 4IJOA 2DUQA 1Y7BA 3WUDA 1AYKA 3ZXHA 1OKQA 2OXUA 1NXD1 4XJWA 1YO8A 1G8WA 4XM8A 1ZVXA 1PWUA 4Y1ZA 2ERFA 1O4ZA 3VKMA 3LMCA 4PKSA 3HBVP 3M3QA 1LOGA 1D0AA 1GANA 3C2UA 2UWCA 2D6NA 1AF9A 2VW0A 3OHOA 4IQPA 4J4MA 5L73A 3ELMA 3B3QE 5DUWA 1QNWA 1ULDA 4ZXKA 5I2ZA 1K7QA 4FP2A 3IPVA 1G9CA 1AX2A 2NMNA 1ENQA 2DTYA 1LEMA 2E53A 2A3YA 4YW1A 4H76A 5EYXA 2GN7A 1SLMA 4JC1A 2G4IA 3WHTA 5CUHA 1Z78A 1ZTQA 3N2VA 4BOWA 2ENRA 5CZMA 1MMBA 4I7BA 5DZGA 2A25A 3MEPA 2ZMKA 1MMPA 2ZGTA 2DUPA 4NO4A 1HFCA 1GE5A 1QU0A 3HSVA 2PELA 2CLTA 4YW4A 1QKQA 4Y20A 4YGEA 2EXIA 1SBEA 1RF3A 2LTNA 3HYGA 5IUQA 3M2MA 2VW2A 1WLDA 3AZWA 1JXNA 4FPGA 2UU8A 1JJ9A 5CXAA 4DS0A 1G12A 3ILFA 2ZACA 4C1XA 4R3VA 4JA1A 1AZDA 3WG3A 2WO8A 1PZ8A 3TAYA 4WKIA 2NN8A 1D01A 3N7KA 2AYKA 3FLTA 2OY2A 2FOPA 1QOTA 4XZPA 2POJA 2F1YA 3WDXA 4CRQA 4KBBA 5EXOA 2VY0A 3FUOA 1ULCA 4XOGA 2EROA 3AYCA 1WLWA 4K1ZA 2V4BA 1MS0A 4LBKA 4FPYA 1JKYA 1JANA 3NV2A 4XBLA 3TT4A 5H9QA 1OS9A 1APNA 4YG6A 5JOXA 2A75A 5H9PA 1ZMSA 1XFWA 2D6MA 3N36A 4CTHA 1KDMA 2GALA 1ZS0A 1GO8P 4BM8A 2WSUA 1USNA 1O0QA 3VKNA 2O3EA 1Y0VA 1FV3A 1OM6A 1LB4A 5BPAA 1HDKA 3RTSA 1V6OA 1DQ2A 1KZZA 2XB6C 4X3GA 2R16A 1UKGA 2ZGLA 2X3AA 2Z2DA 3NV1A 1URXA 1LGNA 1WW7A 3O5SA 2B7YA 4FQ4A 1S0CA 1LOEA 1PZ7A 1QDOA 2CTVA 3HQIA 1ZP5A 4DV8A 1KDKA 2PJTA 1CJPA 4I30A 4M3CA 2SBAA 5DXDA 2OY4A 4ON1A 4WZFA 2ZBJA 1GZWA 4Q26A 3HR9A 2WT1A 1LJ7A 2V73A 3DNGA 1SLIA 3I4IA 5L7FA 1O0TA 5FRAA 4ZR5A 2WLQA 3IKWA 4C1WA 5HCAA 1CZZA 2WNEA 5DUXA 3MW2A 4XXPA 2A8HA 4R9BA 1BZSA 2AN6A 1ENSA 4YZ4A 3WG2A 2H0BA 1F9KA 4KG9A 2DYCA 2MZEA 1IS5A 3O0XA 1FLKA 1IOAA 1XQNA 1R1IA 1ZXVA 3GNEA 2ZHKA 1VLNA 4FOVA 3LJGA 1V6JA 2D6OX 1QIAA 2DTWA 3O0VA 1KRIA 1LB5A 1EUBA 1LU2A 3LK8A 3N7JA 1U0AA 1ULFA 1IAGA 1W0OA 3KRYA 2W0DA 2A6ZA 3LJZA 4XJZA 3D5OA 5GJ6A 3LGPA 3LIKA 1BQOA 1UZZA 1Z0HA 4MYEA 1WW4A 1D2SA 4YGCA 3Q9OA 1N47A 1Q8OA 2JJ6A 1S1AA 1OO9A 1G49A 1W6PA 3DL1A 3EWJA 2ZAAA 3ATGA 2UWAA 5E8AA 5SV8A 2J83A 4XYXA 1MMQA 2ARXA 2OI0A 2AGSA 1KUFA 4YZ3A 3I7GA 3ZXJA 1LOCA 3WDTA 5DG1A 5E1TA 1XFXA 1LECA 3DGTA 4YM0A 1N1TA 3TSKA 1EPWA 1MNCA 3W58A 3LE9A 3KWVC 1I76A 3HDAP 3AP7A 2JE7A 1LHOA 1PWQA 1GSLA 1FNYA 1KUHA 3AYEA 3PVNA 5GLVA 1S0GA 5CA6A 5E89A 1AKLA 4DRVA 4XCTA 1SLNA 2YROA 5E88A 1N1VA 1ZA4A 2K2GA 1MS4A 1JAPA 1AJOA 2FOOA 1DYPA 4PKRA 4XJUA 1MVQA 1JAQA 3ZSMA 2YZ4A 1R1HA 1OFSA 2GKWA 1DQ5A 1PWPA 2RJPA 4FP3A 1PWWA 5B5OA 3WG1A 5I0LA 1H30A 3OYWA 3R4SA 1LULA 1CPNA 1BKCA 1RM8A 2D6KA 4L63A 2AENA 2OW9A 1HFSA 1J7NA 3IN9A 1CA4A 1A85A 3B00A 4ILWD 4XHBA 4GJHA 3ILNA 2C5DA 2JNPA 4Y20B 3ZPYA 1XFZA 2VH9A 2DWRA 1MS3A 1Q56A 3A0KA 4U36A 1K7GA 2WO9A 2K9CA 4GQLA 3DUIA 2DVFA 4XBNA 3IMNA 2XXNA 5H9RA 5DZFA 5JOZA 2ZMNA 4PQ9A 1V6IA 1IS3A 2VXRA 4CTEA 2XG3A 3LEAA 4DQAA 2WOAA 2ZGMA 2ZHLA 3RS6A 1FYUA 2P3KA 2SLIA 5F5QA 1GKBA 2WJSA 1RMZA 1CGFA 4YW5A 1BIWA 1Z3JA 4YG0A 2WQZC 3DPFA 2A7AA 4YFWA 1A8DA 4TYSA 3OJBA 3V64A 4AVTA 4R9DA 4LBMA 5T55A 4H3XA 3SNMA 4Q1PA 4XM6A 1KBCA 4A7BA 3POSA 4ITCA 3VKOA 5JMCA 2O36A 4XIKA 3O64A 1R54A 2R1DA 1WBLA 1CZYA 3PVOA 3UJOA 4GA9A 1IAEA 3KECA 1SACA 1JK3A 3RG0A 3ZUKA 1N1SA 4JQGA 1S0JA 2TCLA 3P1VA 3V0AB 3K7NA 4YM1A 4DFSA 4R9CA 1LOFA 3SH4A 2YB9A 3V0BA 3IVBA 4P9WA 1HLCA 1QGLA 3SLIA 4GWNA 3RMXA 3USUA 3N7MA 1S0DA 1Q8VA 5IT6A 2JT6A 1ROSA 1MS5A 1QIBA 1CPMA 1IAAA 3OPZA 1IABA 3AZYA 1KUKA 4M3CB 1HOVA 3ZXLA 1GZWB 4DF9A 1XUCA 2GMEA 1OQ1A 3AIGA 3VTGA 3G42A 1F5FA 3N7LA 1X50A 4L6TA 5IK4A 1G9FA 1F31A 2EIGA 1YRZA 2CWMA 1PWVA 4UW5A 4TZDA 3NV4A 4K1YA 3ZXKA 4H49A 2A6WA 1DIWA 4WVWA 5HCFA 1D0JA 4XMAA 1H9WA 4M3CF 1KITA 5D2BA 2A70A 1YYNA 1MR5A 4FOYA 4YLZA 2FMDA 1C4RA 4H55A 4GWMA 2R0FA 4GR3A 1Y8JA 4JP4A 3M1HA 1LCLA 3POWA 5I43A 2DVGA 3D4KA 2J0TA 5JDBA 1BQPA 1DQ6A 4FPLA 4Q8KA 1UTTA 3GALA 1JUIA 1L6JA 3AP6A 1TEIA 2OW0A 3FBYA 2ERQA 1AVBA 1LHNA 2W12A 5KXBA 5IK8A 4GF1A 3ZJBA 3AP5A 2F1XA 4OZXA 4PF5A 1W6PB 2A6VA 3ILRA 1CONA 3MW3A 1D8FA 1J1TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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