4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Meprin A subunit beta
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
4F83A 1WW5A 3KQRA 2QPJA 2PHRA 5D1TA 1Z3JA 1LB6A 3I4IA 2I47A 2P3JA 2OW9A 1D00A 4JA1A 5AVAA 5E88A 5CB7A 2E7TA 2P34A 3EHXA 1JANA 1QGLA 1EUBA 1JIZA 1O0QA 2W15A 1DQ5A 4I35A 3JU9A 4NOTA 3HQLA 4FPHA 2GKWA 2DW1A 5BPAA 4YZ4A 1QOOA 2X3AA 2VUAA 4AGVA 2R49A 3ZSKA 1YCMA 1QJIA 1CK7A 3TS4A 4H30A 5BOTA 4YZ5A 1JN2P 2ZA9A 2OY2A 1ZS0A 4JQGA 2WNEA 3AZXA 4LBQB 3SH3A 4XXPA 2D3PA 1W0PA 2JT5A 3P24A 1JYIA 3O0XA 4YZ3A 4Q8KA 1JAQA 2VY0A 2FOJA 4K1ZA 1C8TA 1BIWA 2ERQA 5JMYA 1OQ1A 3AP4A 4Y1VA 1VALA 1PWUA 4XE9A 4GKXA 5LABA 4L6TA 1OKQA 5DZGA 4YW2A 3ZXKA 2AGSA 2L0RA 1A3KA 1KBCA 5I4OA 2ZGQA 3LJGA 2PHXA 3AZVA 2C5DA 1RIRA 3N7KA 2OW1A 5IK7A 3ENRA 1BUDA 1S0CA 5GZGA 4O1VA 4XZPA 3SLIA 1C7KA 1KDKA 2SLIA 2ZHMA 3NV1A 5I2ZA 1CQ9A 2ZGLA 2OW4A 2DDFA 1LOFC 3WVJA 4IQPA 3HQIA 2CKIA 4XJAA 3BTAA 3SNMA 3SITA 5T50A 4H3XA 1VAVA 3I7IA 5DUUA 2ZZJA 4D69A 2EXKA 3R4SA 4A3WA 2D6MA 1DQ2A 4CA1A 5I3MA 1RMZA 4ZKTB 1FLSA 3EDZA 2BQPA 1S0EA 3I8TA 1DQ6A 3LE9A 1KITA 2X7MA 3ZXEA 3N36A 4M3CE 4IJOA 2DVFA 3LQBA 3RMXA 3RS6A 1GE5A 1LGNA 1S0BA 3LKAA 4UW6A 1CQRA 3LGPA 4BMEA 2E51A 1PZ7A 2O3EA 1FV3A 3LUNA 2A6XA 1KUFA 5EYYA 2PHUA 1LB5A 1SATA 2G4IA 1BM6A 3M3QA 4YW3A 1F3VB 4Y1YA 1LULA 3NWKA 1W6QB 456CA 4LBQA 3ZSLA 2WKKA 1V6JA 1AVBA 1JAOA 3WDVA 2XG3A 4XMAA 5DXDA 3IM0A 3LJZA 5T54A 5D1SA 1H9WA 1O4YA 1GANA 2X3CA 1MS1A 1SACA 1IACA 1QU0A 2TEPA 2ERPA 3LQ0A 4FPKA 3MW2A 1S0GA 1XURA 4G0DA 2E7QA 1JAPA 3TAYA 3N7LA 4PBPA 2V4BA 2EAKA 3UL2A 2OXWA 5GZFA 4WZFA 1MNCA 1LEMA 1JKYA 4JC1A 1VIWB 3MPPG 3EHYA 1BQPA 3HSVA 3ZJBA 3DGTA 1Q8QA 4UW3A 1OM8A 4P9YA 2ZHLA 4YM2A 5I0LA 3WG4A 2ZGPA 1UAIA 1LCLA 1BYHA 1BXHA 5CUHA 2NMOA 1PZ9A 1Q3AA 3SISA 3DUIA 1KDMA 1YI7A 1W6PB 2OVXA 2E6VA 3IPVA 3T1MA 4Q1RA 1HFCA 4Y24A 4PKRA 2E3XA 2DDYA 3RTSA 1DIWA 4K8UA 3LSEA 2W12A 3AIGA 5EYXA 1ULGA 3T2TA 3WG1A 1Y7BA 1LHOA 3ELMA 1SCSA 4UW4A 3MW4A 4XBNA 4XHBA 1QMJA 1DQ0A 4Y1ZA 3WG2A 1I76A 3ZXLA 4DRRA 2D1NA 1F9KA 1QICA 4YZ1A 3FLTA 4M00A 2DVBA 1CGEA 2CR2A 5GZDA 5IK4A 1XFZA 4GWMA 2R1BA 4FPFA 1MZ6A 4JIJA 3HN1A 3ZXJA 1D5JA 5HCFA 3ILNA 3APBA 2LALA 3WCRA 2ERFA 5BOYA 3ZPYA 1N47A 2YY1A 4U36A 3D4KA 1R54A 5T5LA 1HTDA 1JBCA 2VH9A 1SFYA 1PWVA 2OW2A 3HDBA 1V6NA 3AXDA 1SLNA 4BOWA 4FVLA 1G7YA 2AENA 4WV8A 1IKQA 5SV8A 5B5PA 1V6OA 2D44A 3OYWA 1CAQA 1IAAA 3A0NA 2NZ9A 3KHIA 4XJUA 1WW6A 1ENRA 3MQSC 2F1YA 4ITCA 4XTMA 4AWDA 1URXA 2D6NA 4JRAA 4HMAA 1SBDA 4C1XA 1YRZA 2AN6A 1S0FA 2A70A 1VLNA 1RM8A 2DW0A 1CVNA 4DPNA 1CGFA 4AVSA 4YFZA 1Y8JA 3DL1A 1MMPA 3ZVSA 2GNBA 1G12A 3VKNA 1S0DA 1USNA 2ZGNA 4Z8MA 2JD4A 2FOPA 5FREA 2ZHNA 5JOZA 3KRYA 2EIGA 4CZSA 1XFYA 1DHKB 3N2VA 5IK8A 1GZWA 4TYSA 1QUAA 3ZXHA 2NYYA 1C1FA 3WCSA 5JDBA 1W6OA 4XBQA 4AYUA 1LJ7A 3WNXA 2A6ZA 1G9AA 1ULDA 1OO9A 2W52A 3AYDA 3WV1A 1D8MA 1D0AA 4XOGA 5GZCA 1L0AA 3GBOA 3POSA 3L2YA 1S4BP 4LBOA 5GLWA 3VUOA 2WT1A 3EDGA 5H9RA 2ZGOA 4XIOA 1SLMA 4P9WA 1V00A 3ASIA 2B7YA 2ZGKA 3K7LA 1MS9A 3HQHA 1LECA 3MW3A 3R4UA 5GLVA 2ZGUA 1FATA 4DD8A 4FPOB 4PKWA 1KQRA 2ZBJA 2D3RA 1HQLA 5E8AA 2NN8A 4EFSA 3RRDA 5BYNA 1CA9A 1GKCA 2W68A 5GLUA 5GALA 1MMRA 2DVGA 5DG2A 4DPEA 4OZXA 4I30A 1I1IP 1ZA4A 4YW4A 1G49A 1AJOA 4WK7A 3P1VA 1UN1A 2Y6DA 1SCRA 3LMCA 5L7FA 2CYFA 1ULFA 3E8RA 1UTZA 2LTNA 1IS3A 3LIRA 1FM1A 2GNTA 3HY7A 3O5SA 1AF0A 1CJPA 3BODA 2EALA 2FHRA 2JE7A 4GA9A 1GE7A 2R0HA 1QIAA 2OVZA 2WO9A 4ILWD 1CIZA 2SBAA 2MZIA 2A3YA 1H71P 1YO8A 5DG1A 4Y1XA 4LBQD 1R1IA 1APNA 1CGLA 3EDIA 4SLIA 4WVVA 4M3CB 4YZ2A 4GALA 2JIHA 2OW0A 2K9CA 1UTTA 3TVCA 4R9DA 1DBNA 1N1TA 2AIGP 1Q8PA 1WNIA 4NO4A 1IS6A 1Z78A 1IAGA 3POWA 4Y26A 2A3XA 3RQ0A 3HY9A 2ZABA 4P9XA 1PZ8A 4GXLA 2A71A 1KUGA 1Q8SA 1OM6A 1AXYA 5JVVA 4DF9A 1SLCA 4Y1UA 2AR6A 1FAYA 1LEDA 1DLLA 1LENA 2YMZA 5GLTA 3FUOA 4PKVA 1JXNA 3I7GA 1KRIA 3USUA 2A7AA 1N3QA 4XYXA 2NMNA 2GNDA 3ZSJA 1XFWA 2DTYA 1YY6A 3TB0A 1AXZA 1KZZA 1L6JA 4XCTA 1MS3A 1BKCI 1DYKA 4FPLA 1SRPA 1BJQA 3KEJA 2DVDA 1A85A 1UL9A 2R0FA 3KM5A 3OY8B 4H55A 1HQWA 1QKQA 3WDXA 2J83A 1OS9A 3DPEA 2JE9A 1G9FA 1V6LA 2ZMNA 2F1XA 1ASTA 2ZMLA 4P14A 1OS2A 2UURA 4DV8A 2A6YA 3WUCA 4XBLA 3IPVB 4XMIA 3RG0A 4ASMB 5H9PA 2PJTA 4XJZA 2ZMKA 4FPYA 5T52A 3D5OA 1R1ZA 1R1HA 4FQZA 2A8HA 1K7GA 4X3GA 3V0BA 1I3HA 1AYKA 4H76A 3VKMA 1GO8P 3VTGA 4UW5A 1I73A 1LOCA 5CZMA 2XXNA 2A25A 2OVUA 4C9ZA 3GNEA 1F5FA 5GJ6A 4BM8A 2CLTA 3HR9A 3SHIA 4M3CF 2MLRA 3HU6A 3LUMA 3AP6A 1K2FA 3AYAA 3AX4A 4JCKA 4M3CA 3G5CA 3B01A 4W65A 4YM3A 2VXRA 3HB2P 1KJRA 4XDQA 1PWQA 2PHWA 4XHXA 3W58A 1G9BA 4R9CA 2J0TA 2DV9A 2AREA 3WV2A 5T5PA 5D7WA 4GWNA 1C3IA 4YG3A 1LHWA 4PKSA 1G8WA 2ARBA 2KM2A 1G9DA 2CWSA 3MQRA 1R55A 4H82A 1YYNA 3UJQA 3OYWB 1F31A 2DU1A 3HYGA 1AXKA 2JSDA 2NP0A 1LU1A 2WT2A 1QIBA 1JHNA 1Y93A 2Z2DA 4G9LA 1S0JA 2ZGTA 3GALA 1KJLA 1MS4A 2DVAA 5DUWA 1BUVM 3ZYPA 3INAA 4CRQA 1GZ9A 3O12A 2GMEA 1Y0VA 1UZYA 1FNZA 4YLZA 2W39A 3IN9A 4GHUA 4YGCA 4H2EA 1UMTA 2E2DA 3OY8A 1ZP5A 5KXEA 3N35A 3ZYRA 4AIGA 4AYKA 3ATGA 3IVVA 2DU0A 1RF3A 3T1LA 1BKCE 4DRVA 3IKWA 5E1TA 4YM0A 3AK0A 1XQNA 1QNWA 2O36A 1GZWB 1C57A 2NM1A 4MYEA 3D6EA 3AYKA 3F1AA 3Q9OA 3N3HA 1W6OB 4Z8BA 3VV1A 1LOAA 3IMNA 3AYUA 3SH4A 5DZEA 3OHOA 2EF6A 2AYHA 1SU3A 1YP1A 2RHPA 1NXD1 4FPGA 5FRAA 3LJTA 3BA0A 3AP9A 2MLSA 3ZXFA 4I7DA 4M01A 3FLRA 4Q2FA 2Y6CA 4Q8LA 3FFZA 3B9CA 4PCRA 2OUHA 2USNA 1XFXA 1DYPA 1HY7A 1OM7A 1QJJA 1BSWA 1GLHA 2WQZC 2XS4A 3HQMA 1LOEA 1UEAA 3ZVXA 5CA6A 2AYKA 2ZGMA 5L73A 4C1WA 2WSVA 3LILA 1W0OA 2H0BA 3Q2GA 3AZWA 4AGGA 1IS5A 2VW1A 3OPZA 2FV5A 4ZR5A 2XB6C 4WVWA 2D3SA 1C1LA 5I43A 1LESA 4H1QA 1XUDA 1QF3A 2GN7A 1QNYA 4I7BA 2FMDA 4L8QA 1VAMA 1S1AA 3AZYA 1OMJA 5CBLA 2P3IA 5CXAA 2GMPA 3L0TA 1KUIA 1MZ5A 4WKEA 3B69A 4FU4A 1JYCA 5D3CA 4BQ1A 3R05A 4AUOA 1MVEA 1SBFA 1MR5A 3A0KA 1HLCA 3DPFA 3QCWA 3U4XA 5H9QA 4XXAA 1LOFA 1FLLA 2YZ4A 1FX5A 1IAEA 3AJZA 3PVEA 1WD3A 3AYEA 3QLQA 4FOQA 1CZYA 3G42A 4R9BA 1B8YA 5GZEA 2A75A 3N7MA 4K1YA 3USNA 3AZZA 5T5OA 3O64A 1GV9A 3WLUA 1JK3A 2WJSA 1LHVA 4FP2A 2HYKA 3B3QE 5CAZA 1JIWP 1DGLA 1H30A 1OFSA 3HDAP 3WDTA 2ZACA 1D01A 3V65A 3TSKA 4XM7A 3ILRA 1ONAA 1IOAA 4YG6A 2W0DA 3WDYA 4YW5A 1EB6A 1MACA 1B09A 1ZXCA 4XILA 3FUQA 2A6WA 1WD4A 3USUB 4R3VA 2UU8A 2ZAAA 1IABA 3LIKA 4Q1LA 2WOAA 5KXDA 5IT6A 1KAPP 2YROA 1D2SA 1GYKA 2PHTA 1WLCA 1QOTA 1GNZA 3FLPA 3WOGA 1JUIA 1N1SA 1DFQA 1CPMA 1D8FA 1U0AA 2V73A 2D7FA 2OI0A 4PF5A 2MZHA 1FBLA 2GMMA 1GNHA 4Y20A 5CNAA 2ZHKA 3ZSMA 1AX0A 2OY4A 1CXVA 2D6PA 1R1JA 4K21A 1YIFA 3M2MA 3KMEA 1GE6A 1BQOA 5F5QA 2JECA 1SLBA 5JOWA 1GSLA 2UWBA 3VKOA 2YXSA 1FYUA 4PBOA 1A8DA 4QKZA 1ND1A 3Q2HA 3V0BB 4AVVA 5EWSA 4GUYA 1WLDA 5JMCA 2JNPA 2RJQA 1AX2A 1YZEA 3NX7A 1O0TA 1YOUA 3V0AB 1JOJA 4LBMA 1A86A 3ILFA 1GO7P 3OHLA 1CIWA 1AZDA 4HX3A 3KECA 4AGRA 1FLKA 1UMZA 5GLZA 2DWRA 2D43A 2OUJA 1KUHA 2XS3A 3UVCA 3DWBA 1GICA 1B3DA 4H84A 1D0HA 5IUQA 4L63A 1SLTA 3OGGA 3MA2A 1IS4A 1ULEA 1W6NB 4CTHA 3OBRA 2P2KA 2EXHA 1K7IA 3N7JA 1GZCA 4PQ9A 2W14A 5JOXA 2YIGA 3IVQA 4ATFA 2ENRA 3HBUP 3UK9A 3KMCA 4ISRA 5HCBA 2JDZA 1WBLA 1FNYA 966CA 5DUVA 1EAKA 2HU6A 2WT0A 4DFSA 2ARXA 3JUUA 2GALA 3F16A 1H9PA 3FBYA 1BQQM 2DW2A 1LTEA 3MEPA 2ZGRA 3N2UA 1UX6A 2D1OA 1SMPA 2AUYA 3CNAA 2Z42A 4FXYP 3U1RA 4IUWA 2A5ZA 3F18A 1AX1A 3M1HA 1QSCA 1GKBA 4FOWA 2EROA 1PWWA 3VKLA 2JJ6A 4I03A 2TCLA 2C9AA 4YM1A 3B00A 1DZQA 1K7QA 1O4ZA 4GKYA 3RTTA 1JJ9A 2JT6A 1IADA 1MVQA 3L0VA 1DMTA 4WZVA 3O0WA 4FVVA 1D0JA 1LOGA 2R1DA 1BZWA 3WG3A 2A6VA 3V0AA 5H9MA 3V96B 3C2UA 1LOBA 1Q56A 2FOOA 4I7CA 5H8XA 1AKLA 4Q26A 4FOVA 2DTWA 2P3KA 4RA0A 2UWAA 5JLVA 4JJQA 1X50A 1QDCA 3B2ZA 3AJYA 1PWPA 4A7BA 4BMBA 2VW0A 3M3CA 1GXDA 1Q8VA 3KWVC 4FQ4A 4PKTA 1W6NA 3WUDA 1LB4A 1W6MB 4LBKA 1RITA 3OBTA 1G9CA 1YXWA 1CA4A 2SRTA 5KXCA 4ZXKA 5KXBA 2OZRA 3UJOA 3BIWE 4LBNA 4J4MA 2RJPA 1ROSA 2W08A 4JP4A 1UPSA 4AXQA 4ATEA 3F15A 2DYCA 1TEIA 2CL2A 1ZXVA 1G4KA 4YGEA 1XFVA 4YFWA 4M4EA 2P37A 4HANA 4XJWA 2DUOA 1UMSA 3IVBA 4ISQA 3F17A 4YGDA 4FPCA 1V6IA 2F1ZA 1MS0A 3H0OA 3LCPA 1WUVA 2DUQA 1LGBA 3RSJA 4BLIA 5D1UA 1JW6A 2PELA 1WBFA 1WW4A 1ZTQA 1ZVXA 2N8RA 1BZSA 2JKBA 2D6KA 2WLQA 3HMYA 1IKPA 2CY6A 1Z0HA 4XM6A 2F1WA 4RL7A 4FPEA 3NV3A 4ON1A 2GDFA 1CR7A 1BKCA 1ATLA 1D7XA 1SLIA 2YV8A 1FV2A 3PMEA 1CESA 1SLLA 4XTPA 3K7NA 3EDHA 830CA 5EXOA 1C4RA 1SBEA 5DUXA 2GN3A 2DUPA 3F19A 4Q1PA 5B5OA 3POYA 4XJ8A 3WV3A 1BKZA 1QDOA 2YB9A 3NV4A 2VU9A 5F9TA 1QOSA 1EPWA 3EWJA 2FV9A 4GJHA 3CKIA 4YW1A 3AXEA 3B92A 4Q27A 2POJA 4BPZA 3WV6A 1MS5A 4LBLA 1LGCA 4DS0A 3WDWA 3AFKA 3PVNA 1KUKA 1HFSA 3RMYA 3A4UA 1ENQA 5H9SA 4GR8A 1W6MA 2GNMA 1CN1A 3B8ZA 2X3BA 2DURA 1DQ4A 1SLAA 4Y22B 3M3OA 1G86A 1ZM1A 3SH5A 4Y20B 1MMQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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