4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Meprin A subunit beta
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
2FOPA 1IAAA 1O4ZA 5JMCA 1VIWB 3RMYA 3LJTA 1VAVA 4AGRA 1G9CA 1WLCA 1YYNA 1OM7A 3ZXHA 2ARBA 3Q9OA 2FHRA 5JVVA 1QJJA 2FOJA 2C9AA 3LILA 1YY6A 4J4MA 1H9PA 1PWVA 3HY9A 1GSLA 4FVLA 4LBQB 1LOFC 1DQ5A 4TZDA 5H9SA 2E51A 3LE9A 1MVEA 4O1VA 5T55A 3IVQA 4I7BA 1YI7A 1L0AA 966CA 5HCBA 1A78A 1HLCA 4PQ9A 1Z0HA 4JCKA 2ZGNA 2OW1A 3WV3A 4RL7A 2A6XA 1WW7A 4ZKTB 1LU1A 1S0EA 4C9ZA 4LBLA 4XBHA 4R9AA 2PHUA 3FLPA 5GZGA 2ZGMA 4PKRA 3B92A 1IACA 1F5FA 2F1ZA 1R1HA 2GNMA 1JBCA 1Y7BA 1GKBA 3ZSMA 1MR5A 1CIZA 1Y8JA 3R05A 4YFZA 5BOYA 5DZEA 4XILA 2I47A 3HY7A 1IS6A 4GR3A 1KZZA 1YQYA 4XTPA 3AP6A 1W6QA 4YG6A 1DYKA 3JUUA 2A6YA 3EDGA 3IVVA 2UURA 3ZSJA 2D3RA 1AKLA 1LHUA 4ATEA 2D6PA 1HDKA 4Y20A 3LSEA 5EXOA 5DUWA 2FMDA 1MMQA 3UVCA 1AJOA 4FVVA 1DQ2A 2PJTA 1Q8SA 2ZACA 4H3XA 1BKZA 3FBYA 4IQPA 1DIWA 3HDBA 1G86A 5KXCA 3WDWA 2K9CA 3NV3A 3NV4A 4ISRA 3IN9A 2EXHA 2DYCA 1OS2A 2WT0A 3H0OA 4PKUA 1Y93A 4Q8LA 4AVSA 4XMAA 2R1BA 2Y6CA 3BA0A 4G9LA 1ND1A 3VI1A 4Y1VA 1HV5A 1WLWA 5CA6A 1IAGA 1CJPA 3P24A 4FOWA 1FX5A 2JDZA 3ZYRA 1KJLA 4XXPA 2POJA 2WNEA 5IT6A 5F9TA 1Q8VA 3IKWA 4IUWA 3N2VA 2NZ9A 1BIWA 2DURA 4WVWA 1MNCA 3AZZA 4XXAA 5GALA 5GLTA 2JKBA 1AXYA 2DU0A 5GLUA 1CONA 3POYA 3AFKA 1ROSA 1LB4A 4M3CE 1FAYA 4WF6A 1H9WA 1XUDA 4UW6A 4P9XA 2NM1A 1QOTA 3RRDA 2A7AA 3T2TA 4ON1A 3AYEA 3EWJA 3DL1A 3KMCA 1RITA 4XM7A 4FPKA 3V65A 3MW3A 2ARXA 1GZWB 2D6NA 3PVOA 3HN1A 1BQPA 1Q8OA 3VKLA 2W08A 3I7GA 1KITA 3ILRA 2CL2A 1ENQA 4WKEA 5GZEA 2JT5A 2GMMA 1WW6A 2W68A 4GA9A 1QOOA 1AJKA 5EYYA 2G4IA 4BPZA 2FV9A 1DMTA 1DQ4A 4XJAA 4AUOA 2JE9A 1JUIA 1D5JA 1SLAA 4AXQA 3M2MA 4SLIA 2A6ZA 4GHUA 3USNA 2GDFA 1LOFA 2RHPA 2ZGRA 3WVJA 3WLUA 5DUUA 4YZ3A 1OM6A 4AIGA 1BXHA 2LALA 1GE6A 2W13A 1UEAA 3RQ0A 3BTAA 2ZMNA 1ZXVA 4FU4A 5H9PA 1GXDA 1MACA 5IK7A 4Y1YA 1KUHA 5L79A 4K1ZA 3VTGA 1S0FA 5GM0A 2ENRA 5DG1A 3N7LA 1HFSA 5CXAA 2NN8A 3IM0A 2AREA 5E89A 3WDUA 1UTTA 3G42A 1KUFA 1GE5A 1ZP5A 2ZHNA 5EWSA 1IOAA 1VLNA 1BKCA 4GWNA 2PHWA 4BM8A 1CA4A 3V64A 1MS5A 1UN1A 2VY0A 1H71P 3WOGA 1IABA 2A70A 2X3BA 1G9BA 1O0QA 4FPYA 1W6PB 3WNXA 4BLJA 2PHTA 1W6NB 1QKQA 5H9MA 3AJZA 1QNYA 3ZJBA 1V6JA 2OVUA 1DTHA 1YRZA 4FPEA 1IADA 4DPNA 4I7CA 3G5CA 1AYKA 4CTHA 3M3EA 4YW5A 5T5LA 4ISQA 3K7LA 1D8MA 1R55A 2JSDA 2ZGPA 4X3GA 2K2GA 2NYYA 1PWUA 5IK8A 4DD8A 1LU2A 3ZVXA 1JJ9A 2JT6A 2E2DA 4NO4A 5B5PA 3ZUKA 4PCRA 1FLSA 4L63A 3WUDA 2DV9A 3PVNA 1YP1A 2A3WA 5JLVA 5B5OA 1QIBA 5F5QA 4ILWD 3ZYPA 2C5DA 1FNYA 1GZWA 5CZMA 3M1HA 1LODA 3M3OA 1I1IP 3POSA 3LIRA 4PKVA 1HQWA 4GALA 1R1JA 4CTEA 4WZVA 3AZYA 1ZXCA 3OHOA 3TSKA 1PWPA 3OGGA 5KXBA 3QLQA 3OY8A 4LBKA 2D44A 3AYDA 1I1EA 4CA1A 2ERPA 2J83A 2P3IA 4JA1A 3OJBA 4Q1RA 1JH1A 1QDCA 4LBOA 1XFUA 1HY7A 1D7XA 2R1DA 2GALA 1W6QB 4HL0A 3UK9A 1GNZA 4R3VA 4WK7A 3QCWA 2ZGTA 2GKWA 3MQSC 4FPCA 3HBUP 1S0CA 1LJ7A 2BQPA 3AYCA 3BOPA 2ZHLA 4P14A 3HB2P 1ULEA 1G9FA 4YM3A 1YXWA 4WVVA 2DVGA 3BODA 1C57A 5GLWA 1SATA 2DDFA 2R49A 1LHNA 4WKIA 5DG2A 1K7IA 1XFYA 1Q3AA 2TCLA 3Q2GA 4I35A 1KQRA 3KRYA 2DDYA 3V0BA 4LBJA 2VH9A 4XBQA 4FOYA 1OM8A 2WKKA 2OW0A 2EXKA 4Q27A 3RSJA 1LOGA 1AX0A 2ES3A 1BM6A 3ZXFA 5JOZA 2GN3A 4PKQA 1W6PA 3SHIA 1BUVM 2UWCA 3ZXJA 4UW5A 4MYEA 1W6NA 2O3EA 3WG2A 5I2ZA 4R9DA 2DW0A 2D6LX 4H82A 1LGNA 1KUGA 1G8WA 5T50A 2CKIA 2R0FA 2WQZC 1IAEA 1QUAA 1B3DA 4YG3A 2WT2A 5GJ6A 2Z42A 1QOSA 3HYGA 3W58A 2CWMA 2AENA 3N7KA 3L0VA 1HKDA 1YIFA 1DQ1A 3MA2A 1N47A 4ASMB 1KAPP 4H2EA 1H30A 3FFZA 4M4EA 1EB6A 1F3VB 2E3XA 3NWKA 2D6KA 2A6WA 2D3SA 3TVCA 4K20A 4YZ2A 4DPEA 2D3PA 2ZZJA 1GYKA 1DLLA 3OYWB 1ZVXA 1XQNA 4XZPA 2FOOA 2JJ6A 1JW6A 2OY4A 1G05A 1MS1A 1CK7A 1KDKA 4FQZA 3VUOA 2YXSA 1SBFA 3O5SA 4YZ1A 4JIJA 4Q26A 3DPFA 4Y22A 4JP4A 5H8XA 3HMYA 4XOGA 456CA 2P34A 3M3QA 1BKCE 4PKWA 2AYKA 2CLTA 4JPAA 3ZXKA 1YO8A 2WO9A 1KUIA 1BQQM 4H49A 3DUIA 3VKNA 1JK3A 1G4KA 4A7BA 3WDVA 3TT4A 4UW4A 1LGCA 4ATFA 4M01A 830CA 2YV8A 1S0DA 4DQAA 1N1YA 5JOYA 1F9KA 2A3YA 2OI0A 2DU1A 4YGCA 2CR2A 1FV3A 4XIKA 1DGLA 5GZDA 5CUHA 1EAKA 3LUNA 4XMIA 3MW4A 3LMCA 3RG0A 1NXD1 5IUQA 4GJHA 3O12A 3WDTA 1LEDA 1KDMA 1GZCA 2A25A 1SLMA 1JOJA 2WT1A 1MVQA 1FYUA 2ZHMA 3LCPA 5JOXA 4ITCA 1G9KA 4W65A 2SLIA 2TEPA 2W39A 4YW1A 3SH3A 5DZFA 1F31A 4ZXKA 2OVZA 3N2UA 3VV1A 1ULCA 5AVAA 2DUOA 1N3QA 2F1XA 2P37A 1ZA4A 1S4BP 2HU6A 5BPAA 3DGTA 4R9BA 3ENRA 2JE7A 2GMPA 3AZXA 3ZXLA 1ULGA 1OKQA 1N1VA 1LHOA 1V6LA 4PBOA 1QIAA 2GN7A 2CTVA 1AX2A 3HDAP 2ZGUA 1C3IA 3F19A 4PKSA 1EUBA 3MEPA 1ZS0A 2YY1A 4U2AA 2D6MA 4YZ4A 2AIGP 5KXEA 2Q5TA 4KBBA 1S0IA 1YCMA 4DS0A 1LESA 4NOTA 2GNTA 1W6OB 3ATGA 3KHIA 3HQHA 1D8FA 2ERFA 4FQ4A 1CR7A 2DVAA 5H9QA 3IPVB 1JKYA 1DHKB 2DTYA 5D1TA 2AR6A 2L0RA 3OYWA 1JYCA 2V73A 3WCRA 2GNBA 4Y1XA 2WOAA 4H1QA 1RINA 3E8RA 2J0TA 3U1RA 5I4OA 1VALA 3VKMA 5HCFA 1CPMA 1MS3A 3A0NA 4M00A 1GO7P 2V5YA 5DXDA 4Y26A 3OY8B 1K2FA 1KBCA 5CNAA 2CYFA 1D0JA 2VXRA 1C1LA 3LQBA 1KRIA 3RTTA 3N36A 1R1IA 5GLVA 3DNGA 3OBRA 4YFWA 1HFCA 3O2XA 1V6KA 4YSIA 1JAQA 1QGLA 4YM0A 2W0DA 1D00A 4BMEA 1SACA 5E1TA 3AK0A 4YM1A 3Q2HA 2OUJA 1SRPA 1ULDA 3HQIA 3K7NA 1CN1A 3T1MA 1AF9A 4Z8BA 1AVBA 3MQRA 4YW3A 1A8DA 1LCLA 1DQ6A 1MS9A 1SU3A 5D7WA 1JYIA 1Q8PA 1WBFA 5E8AA 2ZGLA 4JJQA 4AYUA 2VU9A 2OVXA 4JQGA 3NV2A 3IMNA 4YGDA 4FXQA 3R4UA 5FRAA 2E7QA 1AF0A 5D3CA 3HQLA 1G7YA 3OHLA 3HQMA 2F1WA 3EHXA 3SLIA 1MS4A 1CZYA 2UWAA 3V0BB 3ZSKA 2X3CA 2I2SA 4YLZA 2PHRA 2JIHA 2GNDA 4Q8KA 1QNWA 1C1FA 1U0AA 1C4RA 4GF1A 4GUYA 2EXIA 3GALA 4BQ1A 1R54A 1SLCA 3LJZA 3USUA 1HTDA 1TEIA 2PELA 3ZSLA 4XCTA 1O0TA 2YROA 1LHWA 5HCAA 1N1TA 1D01A 5KXDA 1LULA 5CB7A 4YZ5A 3WCSA 2EIGA 3O0VA 1CIWA 3F15A 2DUQA 1MMRA 4GWMA 2ZGSA 3FUQA 2AN6A 3KECA 5D2BA 2D6OX 2PHXA 1LB5A 5DUXA 1CGFA 1LGBA 1W6OA 4D69A 3ILNA 1WD3A 3F16A 3AYAA 1SLBA 1RF3A 4AYKA 3I7IA 3LIKA 4C1WA 3IPVA 1SFYA 1LTEA 3LGPA 1SBEA 2YZ4A 1LECA 4PKTA 5JMYA 3D6EA 3ZVSA 4EFSA 3A4UA 4H55A 1SLIA 2MZEA 3AP4A 2KM2A 1W0OA 2OY2A 1PZ7A 2ERQA 2ZKNA 1CESA 1UKGA 3O0WA 1D0AA 1ZTQA 3U4XA 4GR0A 1S1AA 1WUVA 4FPOB 4Y22B 4L6TA 2CWSA 2WSUA 1WW5A 1OS9A 3INAA 4I30A 1FV2A 2DUPA 1N3PA 1RMZA 3CKIA 1PZ9A 1VAMA 1ENSA 1FLKA 4LBQD 2CY6A 4XJ9A 2VW0A 2R16A 1QMJA 2X3AA 3V0AB 3R4SA 5IK4A 3BIWE 2O36A 1JANA 4AGGA 1CVNA 1MZ6A 3RS6A 3AP5A 2Z2DA 2JECA 1CGEA 3LEAA 3SITA 3AJYA 1SLNA 1AX1A 4HANA 4F83A 1AZDA 1OQ1A 3FLTA 2JNPA 1N1SA 1ATLA 3TS4A 1UL9A 4Q1LA 5E88A 1R1ZA 2V4BA 5LABA 4XJUA 3WV6A 2X7MA 3B00A 3UJQA 1FNZA 2P3JA 1BSWA 4XHBA 2SBAA 5D1SA 1IKPA 4H30A 4DRRA 4K8UA 2XXNA 3DWBA 2D43A 3SH4A 5GLZA 3AZVA 4YG0A 1WNIA 4P9YA 1ENRA 1UPSA 1XFWA 3LKAA 1V6NA 3SNMA 3TAYA 1JIZA 2MZIA 1IS4A 3WDXA 3N35A 4YGEA 1LOAA 1WLDA 1X50A 1L6JA 1MS0A 4DRVA 4XYXA 5I3MA 1GBGA 2P2KA 1C8TA 4I03A 4FOVA 5L7FA 1ONAA 1I73A 1RIRA 4K21A 4GXLA 5EYXA 4XM8A 3MPPG 1V6OA 2NP0A 4Y1ZA 4GKXA 3ILFA 4FPHA 4L19A 4Y1UA 3WV2A 2WLQA 2P3KA 5I12A 3B69A 1FATA 3B01A 2XS3A 3C2UA 3WV1A 1B09A 3AP9A 1V6MA 2D7FA 5FREA 4BMBA 2RJQA 1UMSA 1Z78A 2EAKA 2NMNA 3WG3A 3L0TA 3T1LA 2W14A 4AVVA 2OW2A 3UJOA 3WG4A 2PHFA 1DQ0A 4XJZA 2EXJA 2XG3A 1UMTA 4YGBA 4K1YA 3V0AA 1QICA 1D2SA 2YMZA 3B3QE 3PJQA 3B2ZA 4PBPA 4XM6A 3IVBA 5LK5A 4HMAA 4QKZA 1LEMA 2ZMLA 1QSCA 4A3WA 1OFSA 4H84A 2ZGOA 4Q2FA 4GR8A 2LTNA 2R0HA 2D1NA 3LJGA 2KRJA 1SLLA 4DV8A 1O4YA 4Z8MA 1USNA 2D1OA 1UMZA 1WW4A 2HYKA 4CZSA 1WD4A 4XIOA 1SMPA 5IK5A 1FM1A 3WDYA 1Y0VA 3PVEA 4L8QA 1BQOA 3MW2A 3A0KA 2W15A 2N8RA 4YM2A 2E7TA 1A86A 5H9RA 4JC1A 1CA9A 2MLSA 2VW2A 3AX4A 4FP2A 1MZ5A 1JAOA 3USUB 5JDBA 1LOBA 3O0XA 1SLTA 4UW3A 1BZSA 1ASTA 2A6VA 1PWWA 1JAPA 1XFZA 2W12A 2OXUA 2ZAAA 3POWA 1XFXA 4XHXA 2MLRA 2AGSA 3LUMA 4G0DA 4LBQA 3AP7A 2NMOA 2A75A 1AXKA 3O64A 3LQ0A 1UAIA 2VUAA 1W6MB 4GQLA 1HOVA 4DF9A 1NLSA 3LSDA 5DUVA 5JOWA 3ASIA 1UZYA 1CGLA 3OPZA 2DW2A 1A85A 1ZM1A 1Q56A 1FLLA 4AWDA 4HX3A 1APNA 3KEKA 4IJOA 2W52A 4AVTA 1CXVA 3F1AA 2ZBJA 4BOWA 1S0GA 2E6VA 1QF3A 3EDHA 4Y24A 3P1VA 3ELMA 1YOUA 2ZHKA 1IS5A 2OW9A 3RMXA 4XJ8A 3PMEA 4WZFA 2WJSA 2JD4A 1URXA 1I76A 3I4IA 3WG1A 1SBDA 4XBNA 4GKYA 1GO8P 3APBA 3D5OA 1UX6A 1W0PA 2ZGQA 4YW4A 3N7MA 3N7JA 1GNHA 1MMPA 1LHVA 4M3CB 5GZCA 4LBMA 3DSLA 1LENA 3WHTA 2DVBA 2USNA 2DWRA 4LBNA 1XURA 2AH2A 3KWVC 1XUCA 2YB9A 1GICA 2GMEA 4FPGA 4FPLA 1CAQA 1CQ9A 2EF6A 4FP3A 4IN9A 1A3KA 1S0JA 5I0LA 4WV8A 3VKFC 4XDQA 3AYKA 3FUOA 4XE9A 2E53A 3W59A 4XTMA 4CRQA 1IS3A 1JIWP 4RA0A 1V00A 3SISA 3TB0A 3NX7A 1N3OA 3WZ1A 5T52A 3EHYA 2UWBA 1ULFA 1YZEA 3HBVP 3SH5A 1G9DA 3FLRA 2MZHA 4PF5A 3LK8A 4YW2A 2ZA9A 2OZRA 3AXDA 3EDZA 1PWQA 1GKDA 4AGVA 1G12A 4U36A 2XB6C 4I7DA 2DTWA 3JU9A 2ZGKA 2DVDA 1BKCI 3OBTA 1IKQA 1GLHA 2DVFA 3F17A 5GZFA 3AXEA 4XJWA 1GV9A 2OW4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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