4GWMA

Crystal structure of human promeprin beta
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
573
structure length
561
Chain Sequence
ENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Meprin A subunit beta
total genus 174
structure length 561
sequence length 573
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwmA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwmA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwmA01
2CNAA 3IKWA 4WVWA 4IQPA 3DPEA 3WV6A 4YG6A 1SMPA 3O2XA 5GZCA 2GKWA 3ZXEA 1LGNA 4ASMB 1GZ9A 1AX2A 2OUJA 4Y1ZA 3HU6A 1LU2A 5E88A 1IOAA 1G9CA 4P9WA 4R9BA 1XFZA 4XXAA 1GICA 5GM0A 4R9AA 2EXJA 1LU1A 4LBKA 3K7NA 3T1MA 5DZFA 2HYKA 1L0AA 2OZRA 3AYKA 4Z8BA 2V5YA 3LEAA 1QNYA 1BQOA 1LEMA 4H3XA 3QCWA 4M3CF 1PWVA 2A7AA 3O12A 3NV3A 4Q8KA 3WLUA 2O36A 4X3GA 4Q1LA 1VLNA 2WSUA 2AYKA 3MW4A 1SLAA 3VTGA 1V6MA 1SATA 1GKDA 3WDWA 3V0BB 1OO9A 2UU8A 3F16A 2X3BA 2A75A 1JANA 3MA2A 1JAQA 5H8XA 5BOYA 2PHFA 1G12A 5D7WA 3WVJA 2A6XA 3LCPA 3WHUA 1FM1A 1YZEA 4PKQA 3RMYA 1SBEA 3Q9OA 1MMBA 1LB5A 1Z3JA 4FOYA 1CQRA 2OVZA 1KAPP 3F19A 2Y6CA 3GBOA 1QDCA 3AYDA 1QKQA 1WUVA 4H55A 4P9XA 4PKWA 2D3SA 1GZWA 2E6VA 1ND1A 1BQQM 1IS3A 4FVLA 1C4RA 1DHKB 5CZMA 1DQ6A 4XIKA 5D1UA 4XJUA 4PKTA 1QICA 4ZKTB 2R49A 2EAKA 3B3QE 2OW4A 3OY8B 1JAOA 1FV3A 5DUUA 1GKBA 1QU0A 2AGSA 1IKQA 3N35A 2DW1A 1SLLA 2RJPA 1WLWA 2X7MA 4C1WA 2OI0A 2W08A 3ZXKA 1Q8OA 3KM5A 3AX4A 2AYHA 1DGLA 2A25A 2D1OA 2RHPA 1JUIA 2ZGMA 4PKSA 3F1AA 2ZA9A 1XFYA 1F3VB 1D0JA 3VUOA 1G9AA 1W6OB 1BUDA 1KDKA 3WG1A 5DUVA 5F9TA 3AJYA 1LHOA 3T1LA 2OVUA 3Q2HA 3V0BA 4PKRA 3V96B 1A85A 3W59A 2A6WA 4FP3A 1F5FA 5CUHA 2W39A 1S0IA 5SV8A 2WSVA 5LK5A 2MLSA 2L0RA 2YIGA 1VAMA 4GKXA 2W14A 4XMAA 3O0WA 4SLIA 3LGPA 1UX6A 1YXWA 3USUB 4FVVA 2OXWA 1G86A 4G9LA 1XFWA 4RL7A 2POJA 4GALA 1ZTQA 3AXDA 2MZIA 1O0QA 3LIKA 1R55A 3OBTA 4P14A 1S4BP 3NV4A 1N1SA 2W52A 1DQ5A 5JOYA 2TEPA 1HFSA 1UMTA 3B2ZA 3V65A 1PZ8A 456CA 3CKIA 3HBVP 4ATEA 3D4KA 5T5LA 1SLMA 2JDZA 4BPZA 1N1TA 3TVCA 1A78A 2DU1A 5L7FA 1LOFA 1V00A 2DUPA 2SBAA 1MNCA 4AWDA 4BQ1A 1DQ0A 5T52A 4GWMA 2K9CA 4M01A 1N1YA 3HQHA 2WJSA 1S0DA 1JYCA 2FMDA 3OY8A 3KRYA 4JP4A 2VH9A 1BM6A 4GUYA 4ATFA 1MVQA 2P3IA 2ZGRA 5DG1A 3LJZA 1JIZA 1ENQA 3ZPYA 3APBA 1O0TA 1KUHA 1CN1A 4K8UA 3FLTA 1UTTA 4KBBA 4FPYA 2A3WA 1WW4A 4XCTA 1Q8PA 3UK9A 4LBJA 1J7NA 1CPNA 5D1SA 2ZKNA 4FXYP 3VKOA 3ZSLA 1W6QB 1LGBA 2WQZC 1C7KA 2R16A 5KXBA 1A86A 1LGCA 3BIWE 3WG2A 1CAQA 3LQ0A 3AXEA 3R05A 4G0DA 1QDOA 2OW1A 1LJ7A 3A0KA 4YGDA 4YM3A 5CA6A 2D1NA 3MEPA 2EXHA 5EWSA 1MS4A 1WW5A 1OM6A 1DTHA 1S0JA 4WKEA 4OZXA 4WF6A 2ZHMA 1W6OA 4QKZA 5IK4A 1G4KA 2NM1A 3IPVB 2JE9A 5BOTA 2D6MA 2D6NA 2NMOA 2XXNA 3TSKA 1O4YA 2WT0A 1S0GA 4JC1A 4YG0A 4XIOA 1QGLA 5JOXA 1QSCA 5E1TA 5DUWA 2G4IA 4YGBA 2D43A 1Y7BA 3M3CA 4L63A 3USUA 2XB6C 3VV1A 3V64A 1HV5A 1HTDA 3DGTA 4Y1YA 5IK5A 2LALA 4FOQA 3INAA 1BKCI 3TT4A 4M3CE 2D6OX 1N47A 1K7IA 3MW2A 1WCSA 4UW3A 3LJGA 2A70A 2JD4A 2D6PA 4XM7A 3HQLA 2Z2DA 1QUAA 3A4UA 4I35A 4C9ZA 1AVBA 1CA9A 1OS9A 1UZYA 4HL0A 1R54A 1JXNA 1JH1A 2ZGQA 2VW1A 1MMQA 3HDAP 2ZHLA 5GZGA 1N3PA 1QOTA 3AFKA 2ERQA 1O4ZA 4GQLA 2P3JA 1URXA 1G05A 1IS6A 830CA 2DVGA 5H9QA 2DWRA 4R9DA 4FPCA 2ZHKA 1JN2P 1IABA 3KQRA 1W6QA 4FPJA 4Q26A 3AIGA 1ROSA 5I2ZA 4Q2FA 2YROA 3HN1A 3WDXA 2GMPA 4JPAA 1LULA 4LBQB 2UURA 2GNMA 1GANA 1MZ6A 2XG3A 4XOGA 5JMYA 2AENA 1H9WA 2D6LX 2W12A 2ZGOA 4PCRA 3M2MA 1BKCE 1MR5A 1DBNA 3IPVA 1G9KA 1GBGA 4GR8A 1UMZA 3EDGA 1PWPA 5CB7A 2EF6A 5I43A 2Z42A 4CTEA 4EFSA 3PVEA 3SITA 1D0HA 4XBNA 3LK8A 3USNA 3TB0A 1AXZA 1V6NA 2A71A 2F1YA 5F5QA 3I7GA 2ZGNA 1SLIA 4F83A 4DPNA 4L19A 3R4UA 2DW0A 2A8HA 4R9CA 4A3WA 4GR0A 2SRTA 1LECA 1OKQA 2ENRA 1BSWA 2PHTA 3AZZA 5T5PA 4DD8A 5IUQA 2OUHA 1WD3A 2YXSA 4NO4A 1A8DA 5FREA 5DXDA 1EAKA 1V6KA 4ON1A 1TEIA 1OS2A 3FLPA 3RS6A 1XQNA 1I76A 2DUQA 4D69A 2E51A 1Z0HA 2Q5TA 2D44A 3HSVA 2WO8A 4AVTA 2OVXA 5H9RA 1I1EA 3BODA 1PZ9A 1WW6A 2E7QA 2OXUA 1QMJA 1D0AA 1QF3A 1G8WA 2ZGTA 1R1IA 1AKLA 1MS9A 2GNTA 3M3EA 3ATGA 3RTSA 1FAYA 1CVNA 2OW0A 4LBQA 3B69A 3CNAA 1GSLA 3BA0A 2WKKA 3SH5A 4Q1RA 5DZGA 3AZYA 3WDUA 2WNEA 3KECA 1K2FA 4J4MA 4XTMA 5KXCA 1DLLA 1HY7A 1WD4A 2V73A 1ENSA 1BZSA 1FV2A 2A3YA 2PHRA 1GLHA 3ZSKA 5CNAA 1DZQA 2ES3A 4BLJA 2A6ZA 1EUBA 2ZGUA 1R1HA 1BKZA 1MS5A 1ZP5A 4XMIA 3WNXA 3PJQA 1YIFA 3SLIA 3ZUKA 1RMZA 3KWVC 1IAAA 1BYHA 1LOCA 1R1JA 4Y22A 2FV5A 1GKCA 3AZXA 4L8QA 4XBHA 1GO7P 1DYPA 4XZPA 1G9BA 2O3EA 4YZ1A 2C9AA 4GR3A 3UVCA 5GLZA 1S0CA 4ITCA 1G49A 5EYXA 4YFZA 4DF9A 4H84A 1PWUA 3DWBA 1SLTA 2P2KA 2ZZJA 3WG3A 2AH2A 4JRAA 1MS8A 2GDFA 3OHOA 1BUVM 1DIWA 4MYEA 5DG2A 1PWQA 2AIGP 2ERPA 1CQ9A 4Z8MA 4XJAA 4XDQA 2EROA 2W0DA 2EXIA 3RSJA 4FQ4A 1XFUA 4PBPA 3ASIA 1SLNA 3N7KA 1WBLA 3JUUA 5GZDA 1JYIA 2WT2A 3O5SA 4Y1UA 1C57A 2NMNA 1Y0VA 4I7CA 3N7JA 3T2TA 1YQYA 2OY4A 1IACA 1ULDA 2D7FA 2QPJA 4Y26A 1EB6A 1R1ZA 3I4IA 4H82A 2B7YA 5T5OA 1LOBA 4H1QA 4GWNA 2MZEA 3HB2P 1KUIA 1LOAA 1YOUA 4H2EA 1IADA 2J83A 5B5OA 3U1RA 1GZCA 5JOZA 2GN7A 2ZMNA 2ZAAA 3AYCA 3EDIA 3AJZA 2AN6A 3BOPA 2D3RA 1AF0A 1ZVXA 3VI1A 3AYEA 1ASTA 4Y20B 2F1ZA 3AP7A 1RM8A 3NV1A 1UTZA 3ILRA 1D7XA 2ZGPA 3F17A 1RINA 1AXYA 1USNA 1WLCA 3OPZA 1J1TA 3LE9A 4YZ5A 3AZVA 1SCRA 4FPHA 3EDHA 2RJQA 1CZZA 4YGEA 1EPWA 3WCSA 3WCRA 4UW6A 3WV1A 2I2SA 5KXDA 4YLZA 5GLTA 2DVBA 4HANA 2JKBA 4PKUA 1SBFA 5H9SA 4C1XA 2ZACA 3ENRA 1DQ4A 2CTVA 3P1VA 3WDYA 5T54A 1AX0A 2CKIA 1LENA 1OFSA 3H0OA 3IVBA 2USNA 3LJTA 4M4EA 2A3XA 2JNPA 1SLBA 1ULEA 1UZZA 3EWJA 2R0HA 4FPFA 3DSLA 3SH4A 4AGGA 1K7QA 2YV8A 1C1FA 1FYUA 3ZYRA 1W6PB 5EYYA 4YW2A 1XUCA 5JOWA 1KITA 2X3AA 2PHUA 3WOGA 3EHXA 4CA1A 1FLSA 3N7MA 1AF9A 1RIRA 1WW7A 1UKGA 2A5ZA 1KDMA 2I47A 2GMMA 5I12A 1IS4A 2GALA 4L6TA 3B9CA 4K21A 4DRRA 2JSDA 1VALA 1LOGA 5GLWA 4LBMA 2W15A 1HQLA 3HQIA 3Q2GA 3AP4A 1MZ5A 1N1VA 2JIHA 3WV2A 2JECA 966CA 2N8RA 5HCAA 1YYNA 3LSEA 4AXQA 1YRZA 1LB6A 3HDBA 4YFWA 1D8FA 2ZHNA 4Y20A 5HCFA 3G42A 1C8TA 4FQZA 4FOVA 1CONA 1GYKA 1B8YA 4K20A 3AYUA 1S1AA 3I8TA 1LHVA 4GF1A 1UL9A 1OMJA 1GE5A 3A0NA 1JK3A 4XBLA 4WZFA 4BM8A 3F18A 1MMPA 5CBLA 3DUIA 1JW6A 5EXOA 4YZ4A 2VXRA 3O0XA 3OHLA 2OW9A 4XBQA 2P3KA 1HKDA 1BQPA 1SCSA 1XUDA 3AZWA 5CXAA 3FLRA 2DVDA 3K7LA 4M3CB 3POWA 2R0FA 1BXHA 3ZVSA 1Q8QA 2C5DA 1HDKA 2VW2A 1XFXA 5T50A 4JJQA 1KUGA 3DNGA 1SACA 1CR7A 2BQPA 4ILWD 2ARBA 2PELA 1KZZA 1WBFA 2ZABA 1U0AA 3PVOA 4DV8A 1DFQA 3ZJBA 1CA4A 4YZ2A 3IN9A 1NLSA 4H49A 3D5OA 3DPFA 1AXKA 4M00A 1LHWA 3WV3A 4DPEA 1BIWA 1LOFC 1MMRA 3O64A 3N2UA 3D6EA 2ZGSA 5DUXA 1QJIA 3KMEA 4R3VA 4XYXA 1JKYA 1V6OA 2DW2A 2E7TA 3N2VA 1C3IA 4BMBA 5CAZA 2DU0A 4XM6A 4AIGA 2VUAA 1DMTA 1SU3A 4WK7A 3ZXHA 1V6JA 2AUYA 1UEAA 1UMSA 1ULGA 4U36A 1WLDA 3OBRA 3PMEA 1C1LA 5D1TA 3HR9A 2D3PA 1W6MB 1SRPA 4Q8LA 3IMNA 3FUOA 3B92A 4JCKA 3B00A 4ZXKA 4HX3A 3PVNA 4LBQD 5IK8A 3WZ1A 2PHWA 4ZR5A 1PWWA 3M3QA 1KJLA 3ZXFA 1GV9A 2DYCA 1LEDA 3W58A 1MACA 1Q8VA 3AP6A 1CJPA 1K7GA 1IAGA 4AYUA 4K1YA 4YSIA 3VKMA 5I3MA 1KUFA 5D3CA 2WO9A 2PHXA 4I7DA 5JDBA 2JT6A 1YP1A 4IJOA 2EXKA 1QOOA 1CPMA 4M3CA 1Y8JA 4BMEA 1PZ7A 1L6JA 3GNEA 3HY9A 2JT5A 3R4SA 1D5JA 4FPLA 5IT6A 1ULCA 2FOJA 1NXD1 3RRDA 3AP9A 3MW3A 1CZYA 4YM1A 1A3KA 4FP2A 1AJKA 4CZSA 3DL1A 1KJRA 4GKYA 1ZS0A 4Y1XA 3MPPG 2XS3A 2SLIA 1MS3A 4AGVA 3F15A 3ZYPA 1Q3AA 3HBUP 2H0BA 4GA9A 1CGEA 3M3OA 4WZVA 4GXLA 4XJWA 3L2YA 1GNHA 1QJJA 3HY7A 4FPKA 5HCBA 1QOSA 3LMCA 2TCLA 1LOEA 4XJ8A 4FU4A 1G9FA 2WT1A 1D8MA 4AYKA 3MQRA 4I7BA 2CY6A 2V4BA 1JBCA 1V6IA 3N3HA 1LODA 1FATA 4RA0A 3LSDA 2VW0A 4TYSA 2KRJA 3HQMA 1BKCA 3WUCA 2R1BA 4ISQA 5I4OA 2PJTA 2DDFA 3N36A 3OYWB 4YW1A 2P34A 1W6MA 3V0AB 1ZXCA 1LESA 2JE7A 1FLKA 5DZEA 3OGGA 3VKLA 4K1ZA 3TS4A 3ELMA 4WVVA 2ZGKA 5GJ6A 1HFCA 1LHUA 4LBLA 1QNWA 3SHIA 1SLCA 3RG0A 4TZDA 1DQ2A 1IS5A 2CWSA 1ENRA 1YI7A 4FPOB 1GE7A 1FNYA 1BZWA 4YW5A 1I3HA 3TAYA 2DVFA 1KUKA 3L0VA 3B8ZA 1S0EA 2ZMKA 4YM2A 2FHRA 1LTEA 1B3DA 4PKVA 1B09A 4DRVA 5H9PA 2ZMLA 1I1IP 1VAVA 3JU9A 4HMAA 1GXDA 1XFVA 1RITA 3G5CA 2DV9A 5IK7A 3LQBA 5BYNA 1JHNA 1HQWA 4H30A 4JQGA 1FBLA 1QIBA 2W68A 1G7YA 4IN9A 2NZ9A 1CXVA 5H9MA 3RMXA 2GN3A 1N3QA 3SISA 1I73A 1UN1A 2A6VA 4FPEA 4BOWA 3AYAA 4YW3A 1W6NB 1YY6A 1ZXVA 2CYFA 3EHYA 3O0VA 4YG3A 4DFSA 2ERFA 4CTHA 3GALA 1LCLA 4I30A 2XS4A 3WHTA 3UJQA 4AGRA 3LUNA 3IVQA 5T5JA 5AVAA 1XURA 1F31A 3LIRA 5GZFA 3ZXJA 5KXEA 3B01A 1ULFA 4XJ9A 1UPSA 3ZVXA 2HU6A 3VKNA 2YMZA 3WUDA 1YO8A 2JJ6A 3POYA 2D6KA 3BTAA 4XILA 1D00A 2K2GA 1JAPA 4A7BA 5LABA 4UW5A 2EALA 3HMYA 1IAEA 1ZA4A 1WNIA 2GNDA 2CWMA 4GJHA 2YZ4A 3N7LA 2DTYA 4AVSA 1V6LA 1JOJA 3OYWA 1ATLA 2OY2A 1JIWP 3NX7A 4I03A 4Y24A 1HOVA 3V0AA 1SBDA 2F1XA 4FOWA 4DQAA 1FX5A 1ZM1A 1LB4A 3WDTA 1GO8P 4XTPA 2EIGA 2DTWA 1W0PA 3SH3A 3UJOA 4YGCA 2NP0A 4PQ9A 1CGLA 1IKPA 1AX1A 2YB9A 1CGFA 4XM8A 5T55A 3L0TA 2DUOA 1CK7A 3KEJA 3IVVA 1AJOA 1ONAA 5I0LA 2DVAA 2MZHA 1D2SA 2E53A 3WDVA 4PBOA 2WOAA 4NOTA 4UW4A 1KQRA 3KHIA 1S0FA 2CR2A 1DYKA 4XXPA 4FXQA 2AREA 4P9YA 1OM7A 4DS0A 4JA1A 1SFYA 1Q8SA 2F1WA 3KMCA 2NN8A 5GZEA 1JJ9A 5D2BA 5JVVA 4ISRA 3EDZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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