4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Meprin A subunit beta
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
2A75A 3USNA 3F15A 4YZ4A 2MZHA 2QPJA 1I3HA 1RIRA 1EPWA 2DUPA 3B8ZA 3HSVA 1Q8VA 2R1DA 1SLNA 2CR2A 1GO8P 3F17A 2A71A 3OJBA 3AFKA 5H9RA 3WG3A 3NV3A 1QDCA 1OKQA 3N2VA 4HL0A 3OPZA 3OY8A 3I7GA 4BLIA 4XDQA 2OUJA 5EXOA 2AENA 2WT1A 2ZHKA 2ZHLA 1QNWA 1DYPA 2PHXA 2N8RA 2UWAA 2R0FA 4GQLA 2ZA9A 2YXSA 3WVJA 3N7KA 4IUWA 5KXDA 2F1WA 4ZR5A 5I3MA 4IN9A 4ZKTB 1B8YA 1WBLA 2EF6A 2WJSA 1CONA 2XS3A 2DVGA 4YGCA 1CQ9A 3O12A 3Q2HA 1AXZA 3KM5A 1JJ9A 1QU0A 4YG0A 5JMCA 4Z8MA 1LULA 4CTEA 1R1ZA 2PHWA 4WZFA 4FPKA 1O4ZA 1QOTA 1D8FA 4WF6A 2XXNA 1C3IA 2A3YA 5GZFA 3AZWA 3OY8B 3CKIA 2DW0A 2OW4A 5GLVA 1HY7A 2X7MA 3KWVC 1JHNA 1FLLA 4JC1A 1IS3A 2A8HA 4LBQB 4YFZA 1ZP5A 5GZCA 2W13A 1ENSA 2ZGTA 1RITA 5DZFA 3WUDA 2E3XA 2WLQA 4XJAA 4Y1XA 5KXEA 2P3IA 2VXRA 1F3VB 1VAMA 5T54A 3D5OA 5H9PA 4XJUA 2JT5A 3O64A 1PZ8A 1DQ2A 3U1RA 3AXDA 3IM0A 3PVOA 2GDFA 1AJOA 1WW4A 1K7QA 4FOQA 2K9CA 3KRYA 1SFYA 1PWPA 4XXPA 1D8MA 5LABA 1GZWB 3MW3A 2X3CA 1LHVA 3F19A 1IAAA 4LBOA 4BPZA 3V96B 1GZCA 1LENA 4Y1YA 3IVBA 1S0DA 2R1BA 3B2ZA 1LODA 1AJKA 1JN2P 1LHWA 2DVAA 3DWBA 1G8WA 3WLUA 2GMMA 1BYHA 1O0QA 2Y6DA 2ZGNA 2AREA 2W68A 3K7NA 1UAIA 3B00A 2EAKA 2B7YA 1CGEA 3F1AA 2XS4A 2D6OX 3ZSJA 2EALA 3RG0A 2DTYA 4I03A 3MW2A 1H9WA 1DQ4A 4C1WA 1SATA 1ZVXA 1K2FA 4U36A 2E7QA 1W6QA 3LGPA 1ASTA 3LQ0A 3BIWE 5FREA 1L6JA 4L63A 1HTDA 3OHOA 1ULFA 2A6VA 830CA 2A70A 3INAA 4Q8LA 1CAQA 1FV3A 2GMPA 1YXWA 1C1LA 4MYEA 1Q3AA 1LOGA 2H0BA 4D69A 2UWBA 4YZ3A 2R0HA 3MW4A 3AYKA 1V6LA 5JDBA 1ND1A 3QLQA 1I1EA 4FOVA 1RF3A 1WW5A 1HOVA 1WLCA 4WKEA 3APBA 2X3AA 2PHUA 2OW0A 1CZZA 3FLRA 3VV1A 2YZ4A 3Q2GA 5KXCA 2R16A 1UZYA 1GICA 5I4OA 3NWKA 5D1TA 3FLPA 3WV2A 1Y93A 1PZ9A 1W6QB 1X50A 2D3SA 2W08A 1D7XA 2HYKA 4GR0A 4PKQA 3ILNA 1Q8QA 3RSJA 3D6EA 4AGRA 2DTWA 1KJRA 1MS9A 4IJOA 4M3CA 2OUHA 3EHYA 1Z0HA 3B3QE 2ZBJA 5SV8A 4PBPA 2W52A 1KUHA 3EDHA 2NYYA 5E1TA 4M4EA 3A0NA 4XHBA 4ZXKA 2W0DA 3O0VA 1PWVA 2POJA 1MMPA 1H9PA 4BMBA 2JECA 3M3EA 1MS3A 4R9BA 2OY2A 4P14A 4LBQD 3EWJA 4GWNA 2EXIA 3POWA 3G5CA 1W6MB 1YZEA 3Q9OA 3VKNA 3HBUP 4CA1A 1XFZA 3PJQA 3SH5A 2D7FA 2D1OA 1LOFC 2CYFA 1R55A 4GA9A 4UW4A 1WBFA 1YOUA 1D0HA 2P37A 1QMJA 1XFXA 2AYHA 1OS9A 4H2EA 3N2UA 4H1QA 4M3CB 3I4IA 4UW3A 5GALA 3ZXKA 1IS5A 4XXAA 1Z3JA 1PWQA 4WKIA 1KDMA 1LESA 2A6YA 1SLMA 1KUFA 1JAQA 3K7LA 4YSIA 2ZAAA 1ROSA 2MZIA 1V00A 1YCMA 4XHXA 3AYAA 1WD4A 2FOOA 5GZEA 1URXA 3HQMA 1QGLA 2GN3A 4FOWA 1QF3A 1CGFA 1LU1A 2UU8A 1JYCA 3M3QA 4AWDA 2A6WA 3WG1A 1G7YA 3ZVSA 3LJGA 3HN1A 3UL2A 2C9AA 4DPNA 3B69A 2YIGA 3SISA 1BM6A 2A7AA 3ZSKA 3WDVA 1W6OB 1ULDA 3AK0A 2C5DA 1Y8JA 4XBLA 5T5PA 1ZS0A 3P24A 1R54A 5CBLA 2DWRA 1MZ6A 3R4UA 2ZGMA 3V0AA 3TB0A 4XM6A 3B9CA 3JUUA 3EDIA 2MZEA 1LOAA 3ENRA 2OW1A 2SRTA 2D44A 4FU4A 1ULGA 1V6MA 3WV6A 3DNGA 4PQ9A 2DU0A 1OM6A 4M00A 3AZVA 2PHTA 1A85A 1LGBA 1WW6A 1H30A 1WNIA 3ZPYA 4H49A 1Z78A 1DIWA 3VKOA 1CR7A 4R9AA 3LUNA 1F5FA 1SACA 1QUAA 2DW1A 2TCLA 2DVBA 5EWSA 5CA6A 3FUQA 1QOOA 5B5OA 1UZZA 1HFSA 1DZQA 2FOJA 4H55A 4GWMA 2Q5TA 4A3WA 1USNA 1GLHA 1OM7A 3ZXLA 1AF0A 3V0AB 2ZGSA 5DZEA 4XMIA 1KUIA 3L2YA 4R3VA 2RJQA 3OBTA 1OMJA 4YW1A 1WLWA 1K7IA 1SCSA 2OXUA 2D3RA 1QICA 4WZVA 2ZACA 3RS6A 2Y6CA 4K20A 1AYKA 2G4IA 3WCSA 3AYEA 3T1LA 2FOPA 4I7DA 4DQAA 3KMEA 1K7GA 1SLCA 1UEAA 1AF9A 1S0BA 2E7TA 4L19A 1IAGA 1C57A 2VW0A 3HDBA 3M3OA 1HQLA 4LBMA 1GE7A 4YM2A 4GR8A 1A78A 3IMNA 2E6VA 3UJQA 2JT6A 3ZUKA 1KQRA 4FPFA 1LGNA 2ZGQA 1SCRA 1LB4A 3GNEA 4HANA 1BXHA 5BOTA 5T5JA 2CLTA 4ATEA 3M2MA 3RMXA 3LE9A 2R49A 1BQQM 1ENRA 1GXDA 4J4MA 4FXYP 3R05A 5JOWA 2WT2A 4YW4A 2GNTA 3L0VA 4G0DA 4XM7A 3LIRA 2NN8A 1RM8A 4EFSA 1D01A 1BSWA 1G4KA 1HDKA 3LQBA 1XQNA 4WV8A 1Y0VA 1V6KA 4Y1UA 1EAKA 1SLBA 3M1HA 1L0AA 3F18A 3LUMA 2D43A 1HLCA 1D2SA 1GNZA 2CKIA 4ISQA 4DRRA 3AP7A 1JH1A 2BQPA 1BKCI 5JMYA 1GE5A 3LILA 5JOYA 4X3GA 2A6ZA 4FPOB 2L0RA 3ZSLA 4PKUA 2ZZJA 3AYUA 3N7MA 5DXDA 2W12A 5T5LA 1J7NA 1DTHA 4XJZA 4UW6A 3F16A 2D1NA 4FPLA 1G9BA 5D7WA 3HQHA 1SBFA 2F1YA 5CB7A 3RTSA 5IUQA 3BODA 5E8AA 3FBYA 1MMQA 2WQZC 4IQPA 4P9XA 4KG9A 1BIWA 1CA9A 4PKRA 1S0IA 4AIGA 5JLVA 2WKKA 3N3HA 1W0PA 2ENRA 1LEMA 1G49A 3HBVP 1SBDA 4PF5A 4RL7A 1N47A 4FVLA 3HDAP 3POSA 3RRDA 1MVEA 4WK7A 4DFSA 4YGBA 5D3CA 2VU9A 2W15A 5H9SA 1JAOA 2CWSA 2MLSA 1XFWA 4H84A 2FMDA 1CVNA 1DGLA 1F9KA 4CRQA 4XMAA 2V73A 2ZKNA 4YW5A 2OXWA 4CZSA 2DDYA 3MPPG 1S0EA 2NMOA 1ATLA 1LB5A 1UPSA 3KHIA 1I76A 1GANA 4AVSA 5BPAA 4BQ1A 3UK9A 1MMBA 1VALA 1Q8SA 1CIZA 1GKDA 4Y24A 2HU6A 2KRJA 3KEJA 1MNCA 3VUOA 3WDUA 5D2BA 1JANA 4Y20A 2ZMLA 4XZPA 1ZM1A 1JK3A 3ZYRA 2EIGA 3WCRA 1FV2A 5BOYA 1N3OA 1C7KA 4I30A 4XTPA 4YZ2A 1BJQA 2OVUA 1MS8A 2E2DA 4XBNA 4ILWD 4BOWA 5BYNA 1G86A 4K1YA 2WO8A 2DVFA 4JA1A 4Y1VA 1ENQA 4XBQA 2KM2A 5F9TA 2ZHNA 4FPJA 3AXEA 4AYUA 4F83A 2P34A 1WW7A 2OZRA 1PWUA 1D00A 2OVZA 3UJOA 1G05A 4K1ZA 4RA0A 3I7IA 4OZXA 4Y20B 4HX3A 3H0OA 3HYGA 1WD3A 2PELA 2CTVA 3DPEA 4XJWA 1KAPP 2XG3A 1QIAA 3CNAA 4P9YA 2X3BA 2AR6A 1N3QA 3AZZA 5EYYA 1YIFA 2ARXA 4YFWA 2W14A 5B5PA 4WVWA 1GZ9A 1PWWA 1JOJA 3AYDA 3V65A 5E89A 3HR9A 3FLTA 1R1IA 4I35A 5GLZA 4YZ1A 5GLTA 3KEKA 1MS1A 5I2ZA 3TT4A 3VKMA 1NXD1 3KECA 1LEDA 2WO9A 5D1SA 1DLLA 4LBKA 1MVQA 3A4UA 3HU6A 3VKLA 4DS0A 4H82A 2E51A 1QJIA 3LSDA 3JU9A 1IAEA 3BTAA 4XILA 3USUA 2OI0A 5CXAA 3ZVXA 3PVEA 3ZYPA 3IPVA 1D5JA 1O0TA 4CTHA 5D1UA 1AZDA 4PKVA 3ZXHA 5GZDA 2DYCA 1VIWB 2CWMA 3N7JA 4YM0A 1JUIA 1LOBA 2Z42A 1JKYA 3VKFC 1R1JA 4Y22A 5DUWA 4Q1RA 1OM8A 4I7CA 3LEAA 3SITA 2VUAA 1W0OA 3LJZA 3N7LA 2YB9A 2D6NA 4DD8A 4GF1A 4R9DA 1H71P 2SLIA 2CL2A 2AN6A 2OVXA 1LHOA 2EXHA 1YRZA 1LHNA 2ZGRA 4L6TA 1QOSA 4TZDA 4XBHA 4L8QA 1Q56A 3O0WA 4FPEA 5H8XA 5T55A 2AUYA 1SU3A 4JIJA 3WDYA 3EHXA 4P9WA 1EB6A 1G9KA 3USUB 2Z2DA 1BZSA 4ITCA 3WDWA 1KJLA 1LOFA 1GBGA 1CJPA 2JDZA 1FAYA 3OHLA 1GO7P 3QCWA 4UW5A 1O4YA 4GALA 1S1AA 1SLIA 2F1XA 1BQOA 1I1IP 3HY9A 5L79A 3W58A 3NV2A 3TS4A 4DV8A 5I12A 5CUHA 1S0GA 2A6XA 4Z8BA 1N1VA 1S0CA 1N1SA 2OXZA 3ZSMA 1KBCA 3IN9A 1S0JA 2JJ6A 3WG2A 1YQYA 1KUGA 4AVTA 2ZGOA 4FPYA 4GUYA 4H3XA 2AH2A 3OYWA 3EDGA 2YY1A 3R4SA 1TEIA 4YLZA 3O2XA 2JSDA 3LJTA 3GALA 3MQSC 5IK7A 4A7BA 1DQ1A 1V6JA 1ZA4A 4Q1LA 4DRVA 4FQ4A 3LK8A 3N35A 1ONAA 3OGGA 1JXNA 1GKCA 1CQRA 3O0XA 1ZMSA 1BZWA 1CZYA 3AJZA 1UMTA 1LGCA 1UN1A 1LOCA 4YGEA 1GV9A 1UL9A 1I73A 1NLSA 5EYXA 2ZMNA 3WV1A 1KZZA 1DQ5A 3V64A 2ZGUA 1ZTQA 1XFYA 3OBRA 1JIWP 5DG1A 2F1ZA 1G9DA 4FPHA 1GYKA 3OYWB 4Y26A 1LTEA 3WOGA 1UKGA 5GLUA 1HKDA 4YZ5A 4GXLA 5KXBA 2DVDA 1FNZA 1QSCA 2GMEA 1V6IA 3ILRA 4GKXA 1IS6A 3PVNA 4BLJA 4YGDA 2ARBA 2ZABA 1BUDA 3HQLA 3MQRA 5CNAA 1UMZA 2GKWA 4XJ9A 3DL1A 4Q27A 3V0BA 3T1MA 4YG3A 2VW1A 5DZGA 4G9LA 2DDFA 2YROA 4PKSA 1G9FA 3UVCA 4LBQA 2NMNA 2O36A 2OY4A 1SBEA 1EUBA 1Q8OA 1A8DA 1MS0A 1VAVA 2DU1A 1DBNA 4AUOA 3LIKA 5CZMA 4Y1ZA 4XYXA 1DYKA 1DHKB 2VW2A 4XTMA 1HV5A 4FOYA 2JD4A 3AJYA 3W59A 2A25A 4H30A 2VY0A 3MEPA 1YYNA 3HQIA 1SLAA 5GJ6A 1FLKA 1LB6A 3AZXA 4YW2A 4W65A 4HMAA 2NM1A 5H9MA 2GNDA 2ZGLA 4U2AA 4K8UA 5IK8A 2VH9A 4YG6A 1GZWA 1AKLA 3V0BB 3ZJBA 1Y7BA 4R9CA 5JOZA 3TAYA 4GJHA 1AVBA 1CESA 4AGGA 2J83A 5IT6A 3WV3A 1S4BP 1YO8A 4DF9A 1CXVA 2UWCA 1IOAA 1JYIA 2DUOA 1YY6A 4M01A 3PMEA 1GE6A 2K2GA 1AX1A 5L7FA 4FPGA 2ES3A 2O3EA 3IVVA 3HMYA 2AIGP 4PCRA 5LK5A 1C1FA 2ZHMA 3AP4A 4SLIA 1MS4A 2I47A 1S0FA 1KDKA 1LJ7A 3D4KA 4QKZA 5I0LA 4AVVA 3BA0A 2D6KA 3HY7A 3KQRA 3VI1A 4WVVA 1MS5A 4ASMB 1C4RA 4DPEA 4ATFA 2D6LX 1APNA 1ULCA 4LBLA 1N1YA 5T52A 2EROA 4FP3A 2E53A 1OO9A 4FVVA 1DFQA 2V4BA 966CA 3ILFA 2AGSA 1RINA 1BKZA 1LOEA 2RJPA 3AP6A 1ZXCA 3RTTA 2AYKA 4BMEA 1AX2A 4XM8A 2WSUA 4O1VA 1OQ1A 1B09A 2DURA 2ERPA 4I7BA 2FV9A 2A3WA 1ULEA 3SHIA 4PKWA 3RQ0A 1XFUA 2A5ZA 2P2KA 2JE9A 1AXYA 3P1VA 3AP9A 4Q1PA 2GNBA 3WZ1A 1J1TA 3TSKA 2GNMA 1CIWA 4PBOA 3WDXA 4TYSA 1XFVA 1QJJA 1W6PA 2NZ9A 5DG2A 3C2UA 1UMSA 5DUUA 1IS4A 4JJQA 4BM8A 2WSVA 1QIBA 3WHTA 4H76A 4K21A 5HCFA 4Q26A 1PZ7A 2GALA 456CA 1V6NA 2CY6A 3NV4A 1DMTA 2OW9A 3ZXEA 1LCLA 1U0AA 4M3CE 5GLWA 1QKQA 1XUDA 1QDOA 1W6MA 1DQ0A 2J0TA 5DUVA 4FPCA 1UTZA 1SMPA 3DSLA 2USNA 5I43A 2PHRA 5FRAA 4YM3A 2PJTA 5GZGA 3AX4A 1N3PA 4FXQA 1LECA 1W6PB 4C1XA 3G42A 2PHFA 1CPMA 1JW6A 1A3KA 1FX5A 4LBJA 3WNXA 1D0JA 1ZXVA 1FM1A 2MLRA 5IK5A 5JVVA 1SLTA 1BKCE 3NX7A 3AIGA 3E8RA 2EXJA 1XUCA 2RHPA 3IVQA 3O5SA 1IKQA 3NV1A 4GR3A 5F5QA 1W6NA 3FFZA 4AXQA 1FATA 3T2TA 5T50A 5DUXA 5E88A 3GBOA 1AX0A 3SH3A 4ISRA 2D3PA 1KITA 5HCBA 2LALA 4AYKA 4XCTA 1HQWA 3M3CA 2JIHA 2EXKA 3AZYA 3U4XA 1KRIA 1BKCA 1W6OA 1LU2A 1BQPA 1GSLA 3DUIA 5H9QA 3DPFA 4XJ8A 1XURA 1HFCA 1WCSA 1Q8PA 1OFSA 4JRAA 5T5OA 1GNHA 3LKAA 2YV8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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