4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Meprin A subunit beta
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
3B00A 3SNMA 1FX5A 4R9AA 1C1LA 3LMCA 1DQ4A 1VAVA 2ZGUA 3NV3A 2D44A 4Y1ZA 1K7GA 1D5JA 1AXKA 1HV5A 1XQNA 3AP9A 4UW3A 1RITA 1LTEA 2AR6A 4ZKTB 4YG6A 2YB9A 4XJAA 1SLMA 1PWPA 1HY7A 1LB4A 1ZMSA 2EF6A 3OYWB 4LBQA 5T5LA 2O36A 5DXDA 1V6NA 5IK8A 1HTDA 2ZA9A 3WZ1A 2OUJA 3MW2A 4JRAA 1ULGA 5LK5A 3AZYA 2PHUA 4YFZA 3LIKA 1OS2A 1JYCA 2MLSA 1F9KA 2YXSA 2L0RA 1RM8A 1GKDA 3V0BB 3AXDA 2CY6A 2OXUA 5BOYA 3VKMA 4Q8LA 4YZ1A 4O1VA 5KXCA 2P37A 3Q9OA 1AVBA 1S1AA 2DU0A 2JKBA 2SLIA 3POSA 3V64A 1N1TA 3AP4A 2K2GA 3LJZA 1V6JA 4CTEA 2E6VA 1AYKA 2WT1A 3WG3A 1CVNA 1MZ5A 2F1ZA 2XS4A 1LOCA 4H76A 1DYPA 3SITA 1SACA 2J0TA 3N7KA 2YZ4A 1KRIA 1YQYA 4FU4A 3I7IA 1CZYA 4BPZA 1BM6A 2JE7A 3OPZA 2CR2A 2DYCA 4IUWA 4NOTA 3OJBA 3UK9A 4GF1A 1D8MA 4ASMB 5H9QA 5CBLA 4QKZA 3EHXA 2GALA 4C1XA 5DG1A 4XJ9A 1IAEA 2UWBA 4FOQA 1N3QA 4AGRA 1QICA 1CIWA 4Y1YA 2A5ZA 3WVJA 1PWWA 3FFZA 1RIRA 4TYSA 4XE9A 5T54A 3HYGA 5GZGA 3NV1A 3T1LA 3LGPA 3USUB 1SRPA 2ES3A 3WCRA 2MLRA 4ISQA 1C7KA 4ITCA 1SBFA 2R0HA 3RG0A 4XM7A 3HSVA 1CGLA 1N3OA 1Q56A 3IVVA 2DURA 5GLWA 3LSEA 1JAOA 5GALA 1H30A 2D1NA 3SH5A 2E7QA 2PHRA 1LOAA 1LOBA 1W6OB 4Q8KA 1LJ7A 3LQBA 2V4BA 1QOOA 1BKCI 1H9WA 3E8RA 2O3EA 1D01A 1DMTA 1XFUA 5H9RA 966CA 1G9FA 2UWAA 2FV5A 1BKZA 1UL9A 4YG0A 3ZXKA 5DUXA 4M3CE 1KITA 4AGGA 1DQ1A 1R54A 3TB0A 2CWMA 1DQ0A 4FVVA 1XUCA 1CN1A 3VTGA 3ILNA 4H30A 1LCLA 3ZXHA 2WT0A 1EAKA 1SLIA 5SV8A 3RTSA 1MZ6A 1CA9A 2OW0A 3LK8A 3Q2HA 4YZ3A 2PELA 5EWSA 3H0OA 1WD4A 2VH9A 1BXHA 2POJA 2W13A 4DFSA 5DZEA 1ZM1A 4FPFA 5DZGA 1LESA 1L0AA 5E88A 1IACA 1VLNA 3L0VA 1Q3AA 3IN9A 1HDKA 3C2UA 5L79A 4XOGA 4U36A 2YY1A 4PBPA 3TT4A 2BQPA 2JT6A 1DTHA 3VKFC 4NO4A 5KXBA 4GWNA 4ON1A 1LU2A 4R3VA 5JMYA 1XFWA 1Q8OA 1GYKA 4YM3A 1XURA 4XMAA 3PMEA 2SRTA 4Q1PA 3ZYRA 4DRRA 1WW5A 5DG2A 1QJJA 1X50A 3AK0A 1LOFC 2E53A 5T5PA 2E3XA 5JOXA 3U1RA 5GLTA 1UPSA 1GANA 1CESA 2ZBJA 1HLCA 3B92A 1AZDA 2EAKA 2VW0A 5T50A 3A0NA 1I76A 4JQGA 3LSDA 4H1QA 2UU8A 1WW4A 1FBLA 1QKQA 4DPNA 1USNA 2AYHA 4GHUA 1JKYA 2ZMKA 2OW9A 1XFVA 2NMOA 4J4MA 3PVNA 4Y1VA 2JECA 1JIWP 3LKAA 4G9LA 1Z78A 1ULDA 1WBLA 1YRZA 1ND1A 1C3IA 2K9CA 1V6LA 1LGCA 4GQLA 1D0JA 4XXAA 1HQLA 2YROA 3IKWA 1R1JA 1Y8JA 2CLTA 3FUQA 4PKTA 3M2MA 1UX6A 3HQHA 3WOGA 1O4YA 4XBNA 4XJUA 4U2AA 2OVZA 3HY9A 1KDKA 1S0CA 5HCAA 2J83A 3INAA 3N2VA 1DQ2A 2EXJA 3M1HA 4M00A 4R9CA 4AGVA 2CTVA 3WG4A 1I1IP 1V6KA 4BMEA 1R55A 1DBNA 2MZIA 4Y22B 3AYEA 3P24A 2ZGTA 4YM2A 2RHPA 4RA0A 4H55A 4TZDA 3WDYA 1GZ9A 4G0DA 1QJIA 2DWRA 4W65A 4Y1XA 1Q8SA 3USNA 1BQOA 1JANA 1HFSA 2DVAA 3FBYA 1FYUA 2FOOA 1N1YA 1Y93A 3AZVA 4K20A 4JPAA 5JOZA 4PKSA 4YGBA 4L63A 1DGLA 1D00A 3HY7A 2MZHA 3POWA 4XIKA 3VKOA 4BQ1A 3LQ0A 2DDFA 1JIZA 1SLLA 3HN1A 2P3KA 2X7MA 2Z2DA 1GZWB 4Y22A 1MMQA 4YW1A 4WF6A 1MMRA 3KMCA 3KMEA 3FLTA 1HOVA 5T55A 1LOFA 2R1DA 1GNZA 1DYKA 3WDWA 3F19A 4FOYA 1VALA 4XJZA 2ERFA 1SLTA 2ARBA 2E2DA 2A75A 1MS1A 2W39A 1KAPP 1DQ5A 1KQRA 4AWDA 1SLAA 2A6XA 4SLIA 1IKPA 3DPEA 2VW1A 1S0DA 1S0EA 5H9PA 4LBQB 1QIBA 4YW5A 2R0FA 4LBJA 4XM8A 1WLWA 1ZA4A 2SBAA 4YGEA 1URXA 4XM6A 3P1VA 1F5FA 4AVSA 1CJPA 4AUOA 1G9AA 2USNA 3SHIA 2OVXA 1MVQA 4P9WA 4AVVA 3RQ0A 2D3PA 4I35A 1LULA 1D0HA 2W12A 2ENRA 3WV2A 2WO8A 1DZQA 3BA0A 4KG9A 2GN7A 2ZACA 2X3CA 1D2SA 2H0BA 4YFWA 5I12A 4PCRA 1SLNA 3MEPA 5CNAA 1IAGA 3WDUA 5KXDA 1UZYA 4Y24A 4GR8A 5I0LA 2A25A 3ZSLA 4I03A 5EYYA 5DUVA 2GNDA 2ERPA 3BTAA 4YW2A 1YOUA 4H84A 1ONAA 4LBNA 1KUKA 2DV9A 5GZDA 4LBLA 2N8RA 3LUMA 1AXZA 4XJWA 1Y0VA 1ZXCA 3O0VA 3WHTA 4M3CA 3RSJA 2D6PA 1QOTA 4YM0A 1Z3JA 3UL2A 3PVEA 5JOWA 3K7NA 5I2ZA 1LB5A 1V00A 4WZFA 3LILA 5GZFA 4ATEA 1CQRA 5BYNA 4JA1A 1FM1A 1R1HA 5E1TA 2PHXA 1G8WA 3FLPA 4MYEA 2W14A 3OY8B 1SATA 1LENA 1GV9A 3OGGA 4GA9A 3R05A 4FPCA 4LBQD 3R4SA 2AYKA 1SU3A 1CGFA 3HB2P 5L7FA 1GO8P 2ZZJA 2E51A 1PWUA 2DW2A 3HQLA 4H3XA 4A7BA 1JN2P 1AX0A 4ISRA 2AH2A 3DUIA 4GUYA 2W52A 5F5QA 1SMPA 4GR3A 1CA4A 3TAYA 3ZJBA 1UMSA 1CAQA 3CNAA 3AZXA 3LJTA 2XB6C 3APBA 5I43A 2MZEA 4AVTA 4XBLA 3DWBA 1WLDA 1AJOA 1SFYA 1UEAA 3OY8A 5DZFA 3OBRA 1VIWB 3AXEA 3OHLA 3HR9A 1QDOA 4C1WA 4P9YA 3AP7A 1BUVM 2ZGKA 3KHIA 3WDTA 2A6VA 1G12A 2D43A 1BZWA 3KECA 3MQRA 4FPKA 3SH3A 4P9XA 2Q5TA 4IJOA 4ATFA 1XFZA 1SCRA 5D1UA 3N35A 3LJGA 2EALA 3WV3A 5GZEA 3UJQA 3ASIA 5CUHA 1G9BA 4FP2A 4FVLA 5CA6A 1F3VB 3D6EA 3ZXLA 1W6MA 2Y6CA 3M3OA 4L8QA 2OW4A 3HQIA 1IOAA 1O4ZA 4FOWA 5IUQA 4FXYP 2PJTA 2DVBA 4AYKA 1DLLA 3VUOA 3O2XA 1SLBA 4JC1A 1S4BP 3EDIA 1MS3A 4WV8A 3ZVXA 1LOEA 5T5OA 1IS5A 4GKYA 1JUIA 2GMPA 4RL7A 4L19A 2DVFA 4WZVA 4YZ2A 2Y6DA 1A78A 3F16A 2R1BA 4JP4A 1WW6A 4BLIA 3NX7A 4EFSA 3I4IA 4A3WA 1W6NA 3AP6A 4JJQA 1ULFA 2A6WA 4PKRA 4PKWA 2VXRA 4FPOB 2UWCA 2OY2A 1MR5A 3NV4A 4XMIA 3BIWE 2OI0A 2ARXA 2ZHLA 1Y7BA 4BMBA 1QIAA 1GE5A 3RMYA 1G9DA 3BOPA 1HKDA 3DL1A 4P14A 2JJ6A 4Q27A 1UTZA 4Y1UA 3IPVA 1AF0A 4XDQA 4YGCA 4DD8A 4FPHA 3BODA 2EXIA 3QCWA 1JJ9A 5L73A 4I7CA 5GLVA 1V6MA 3EDHA 2X3BA 3NWKA 1BUDA 4UW5A 4FPEA 2OXZA 4YZ5A 5D1SA 5IK5A 3LE9A 2GNTA 3D5OA 5F9TA 4DF9A 2VY0A 3AJZA 4XBHA 1ATLA 4FQ4A 4M3CF 1OM6A 1W6PA 1G4KA 1D7XA 4PKVA 2JIHA 4HMAA 1LHNA 4PBOA 3EWJA 1QOSA 1ULEA 1WUVA 3O64A 1V6OA 2EIGA 5I3MA 3B01A 1UKGA 3CKIA 1JAQA 1CPNA 3ZSKA 3HDBA 3O12A 4ZXKA 3M3QA 5EYXA 2X3AA 2RJQA 3LEAA 2EXHA 2CYFA 4K8UA 3V0AA 4R9DA 1Q8VA 1XFXA 2AGSA 1ENRA 3A0KA 1N1VA 5GM0A 2WQZC 1S0FA 1HFCA 1BSWA 1YIFA 2P3JA 2YMZA 4Y20A 1DHKB 1C57A 3I8TA 1O0QA 3VV1A 1RF3A 1N3PA 5EXOA 3WV6A 1AX1A 4HANA 3B9CA 2WNEA 3LUNA 2GMEA 1L6JA 1B09A 1NXD1 2R49A 1EPWA 2B7YA 1H9PA 1OMJA 2D6NA 3PJQA 2C9AA 1C4RA 5CXAA 1KUGA 2WSVA 1GLHA 4XBQA 1SLCA 4Y26A 4DS0A 4CRQA 2KM2A 3WDVA 3ENRA 456CA 2HYKA 1W6QB 1MS5A 3WV1A 2VU9A 2ZGLA 3POYA 4YW4A 4K1ZA 1A85A 1KZZA 1S0IA 3T2TA 1C1FA 1QF3A 2OW1A 2D6LX 2G4IA 1V6IA 1JAPA 5CAZA 1S0JA 2OVUA 1KJLA 5LABA 5BPAA 1GE6A 2D6KA 2JD4A 1MMBA 3A4UA 1AF9A 3RMXA 3RTTA 4WKEA 5GJ6A 2NN8A 2DU1A 4YM1A 1YY6A 3AJYA 3HBVP 3FLRA 2P2KA 4GJHA 4LBMA 2NMNA 4XCTA 1RINA 4FPGA 2WSUA 3DSLA 2P3IA 5T52A 1W6QA 3ZXFA 5AVAA 1O0TA 2ZGRA 2F1XA 1IABA 2ZHKA 1WLCA 1IS4A 2ZGMA 2ZGQA 5B5PA 2P34A 1ZS0A 1ASTA 4DPEA 2E7TA 5DUWA 2ZGOA 4XILA 2NZ9A 4CTHA 1GICA 1GKBA 4AIGA 2WOAA 2F1YA 3KEKA 3WUDA 4X3GA 3ZSMA 3V65A 3EDZA 3TS4A 1FNYA 1ZXVA 1MS8A 4M3CB 1R1IA 1LHVA 2FV9A 4LBOA 3WLUA 5JMCA 4F83A 4YLZA 3I7GA 4BM8A 2PHTA 5HCBA 1YXWA 3GNEA 2DW0A 2JSDA 1KUIA 1ZP5A 3IM0A 3NV2A 3TVCA 3VI1A 4BOWA 1IADA 1CONA 2PHWA 3GALA 3ZXJA 3IVBA 1SBDA 3HMYA 4UW4A 1UAIA 2JT5A 2OXWA 1YCMA 3B8ZA 4GXLA 1YP1A 4KBBA 4DQAA 5H8XA 2V5YA 1K7IA 4GWMA 4PQ9A 1IS3A 1Z0HA 1K2FA 4GALA 3N3HA 4I30A 1QSCA 4UW6A 1FLKA 1GKCA 2W08A 3OHOA 2A70A 2I47A 2DVDA 3ELMA 1MMPA 4XTMA 1CIZA 1GBGA 1I73A 2GNBA 1LGBA 1G86A 1MACA 1CGEA 5FREA 1D8FA 1BKCE 5I4OA 2AUYA 4XHBA 1WD3A 2D6MA 2DUPA 1IAAA 2LTNA 3KWVC 3VKLA 2OUHA 2D3SA 3AYKA 3OYWA 2A6YA 3ILRA 1MS0A 2ZGPA 1SBEA 2D1OA 4GKXA 5GLZA 1OS9A 3ZUKA 3MPPG 3LIRA 3G42A 2TEPA 1LEDA 1UMTA 2GKWA 5CB7A 1G9KA 1OFSA 1YO8A 1LGNA 2ZMNA 2ERQA 2V73A 3JU9A 5GLUA 1JW6A 3SH4A 1PWQA 4FP3A 3QLQA 3V0BA 4FPLA 4OZXA 3RS6A 3W58A 1CQ9A 3N36A 1G05A 3G5CA 3DPFA 2NM1A 2FMDA 2ZKNA 4YW3A 5HCFA 1W6MB 1APNA 2WT2A 2KRJA 4XIOA 4M4EA 1TEIA 2OW2A 1QDCA 4AXQA 1NLSA 2EXKA 1FATA 1BJQA 3AZZA 4WVVA 1AX2A 1OM8A 1ULCA 3ZVSA 3KQRA 1LODA 4XXPA 4Q26A 3HQMA 2QPJA 1QU0A 830CA 3MW4A 2HU6A 5E8AA 1XUDA 1KBCA 1N47A 2WO9A 2LALA 4PKUA 1YYNA 3SLIA 4Z8BA 2A3XA 1LOGA 5B5OA 1EB6A 3AZWA 3K7LA 3KRYA 2GN3A 1FNZA 2WKKA 3ATGA 1DFQA 1JOJA 2TCLA 1W6NB 2ZHMA 1WW7A 1S0GA 1JYIA 4WVWA 4Q2FA 4XJ8A 3ZYPA 1BZSA 2WJSA 1AKLA 1LU1A 4FPJA 4CA1A 3GBOA 3F1AA 5DUUA 3F18A 4Z8MA 3DNGA 5JVVA 3SISA 2OY4A 1KJRA 2EROA 2CL2A 1PWVA 1LECA 2ZGNA 1OKQA 2A8HA 3Q2GA 1WNIA 1FLLA 4FPYA 1BYHA 1MNCA 2D3RA 4YG3A 3IPVB 2VW2A 5H9SA 3USUA 3WCSA 1WBFA 1B3DA 2YV8A 3M3EA 1Q8QA 4I7BA 5JDBA 1OO9A 1Q8PA 4YZ4A 5CZMA 1FLSA 3HBUP 4DV8A 1ZVXA 1W6OA 3N7MA 4GR0A 2ZHNA 4BLJA 1GE7A 1FV3A 3WDXA 4XYXA 5D2BA 4XTPA 5KXEA 1G9CA 3TSKA 5IK4A 2XG3A 2DTYA 2OZRA 5T5JA 5IK7A 1BIWA 4ILWD 2JDZA 1W6PB 1W0OA 1ROSA 3AIGA 3F15A 1N1SA 4Q1RA 2A3YA 2DVGA 2NP0A 1UZZA 3B69A 1H71P 3FUOA 1I3HA 4H49A 4H2EA 2DUQA 3EHYA 1OM7A 1MS9A 4AYUA 3L2YA 2W15A 2XS3A 1LHOA 4K1YA 3WUCA 1ENQA 1XFYA 4JIJA 1OQ1A 3V0AB 1ENSA 2I2SA 2DW1A 2ZMLA 1PZ7A 1SCSA 1FAYA 2C5DA 3AYCA 1CXVA 2AIGP 2NYYA 3DGTA 1YZEA 4D69A 3N7LA 1DQ6A 4Y20B 2FOPA 5FRAA 4DRVA 1QNYA 3IMNA 2CWSA 3ZXEA 4HL0A 1IKQA 4WK7A 1S0BA 5D3CA 2AENA 4M01A 3AP5A 1QMJA 1KDMA 1JBCA 3AX4A 3F17A 3KM5A 4WKIA 4XZPA 3HU6A 2W0DA 1QUAA 1FV2A 2GNMA 2A7AA 3L0TA 2GMMA 3AFKA 1PZ8A 1I1EA 5D7WA 4IN9A 2RJPA 2W68A 3VKNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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