The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
AIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPAGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A combinatorial approach for determining protease specificities: application to interleukin-1beta converting enzyme (ICE).
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
INTERLEUKIN-1BETA CONVERTING ENZYME
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.36: Caspase-1. |
| pdb deposition date | 1997-02-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RWK B; 5IC4 B; 1RWO B; 2HBY B; 2CJY B; 1RWV B; 1SC3 B; 3R5J B; 3IBF B; 2HBR B; 1BMQ B; 3GJT B; 2CNO B; 3R7B B; 2CDR B; 1RHU B; 3SIP B; 3GJQ B; 3GJR B; 2C1E B; 5K20 B; 2H4W B; 3R7S B; 3EDQ B; 3R6L B; 2CNK B; 4ZVT B; 1RHR B; 4ZVP B; 3KJN B; 3QNW B; 2H54 B; 3EDR B; 1RHJ B; 3IBC B; 3RJM B; 1SC4 B; 2XZT B; 3D6F B; 1RHK B; 1GFW B; 2CNL B; 2QL5 B; 4DCO B; 2QLJ B; 1PAU B; 1NME B; 2C2K B; 1RWN B; 3NS7 B; 2H48 B; 2HBZ B; 2H51 B; 3P45 B; 1I51 B; 2CJX B; 2C2O B; 2HBQ B; 2QLB B; 1IBC B; 5IC6 B; 2H5J B; 3GJS B; 2CNN B; 3R6G B; 1QTN B; 2QL7 B; 1RE1 B; 3KJQ B; 4DCP B; 2XYH B; 3D6H B; 3KJF B; 2Y1L B; 4JB8 B; 1ICE B; 1RWM B; 1I3O B; 1QDU B; 1PYO B; 4LSZ B; 2FQQ B; 2QLF B; 3P4U B; 1RWW B; 2C2Z B; 4ZVQ B; 2QL9 B; 4ZVS B; 2XZD B; 2XYG B; 2H65 B; 1SC1 B; 2XYP B; 1RWX B; 4DCJ B; 2P2C B; 3R7N B; 2C2M B; 1F9E B; 2Y0B B; 2H5I B; 4ZVU B; 1RHM B; 1RWP B; 1RHQ B; 2H4Y B; 2DKO B; 4ZVO B; 4ZVR B; 3D6M B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UEK A; 2WSE C; 2CPI A; 3MEK A; 4QZV B; 3DM2 B; 3LOU A; 3RYL A; 4PQU B; 2B9E A; 3GV8 B; 4NXN F; 1HKA A; 2OPR B; 3DMJ B; 1M5O C; 4N47 A; 5T41 A; 1M1H A; 2VBW A; 2C3P A; 3LAK A; 4NLV A; 5K5M A; 4L72 B; 2QSF A; 4NCG B; 4PUO A; 2VHG A; 4ED8 A; 4P71 A; 1IBL F; 3HO1 A; 4M5I A; 3KLG A; 2KYZ A; 3CME S; 2XS5 A; 3ZXW A; 1H74 A; 4URQ U; 2HIQ A; 2MKS A; 2KFY A; 2EWH A; 1NRK A; 3BBB A; 4U6P A; 3A4T A; 2HGM A; 3GFH A; 3JSM B; 3CNQ P; 4WYW A; 3KG0 A; 4IRK A; 2LYV A; 3CIZ A; 3FEY B; 1BHN A; 5JMN A; 3K59 A; 1SC1 B; 4QR0 A; 1KN6 A; 1RYR A; 1FRH A; 3MF5 A; 4ECQ A; 2J7U A; 5DS7 A; 3KK3 B; 2DY9 A; 3TUZ C; 1ELO A; 4HT7 A; 2JFD A; 2F9J A; 2HHS A; 1WKJ A; 3M1V B; 1UFL A; 3F73 A; 4CLW A; 2MZR A; 4Z37 A; 2L9N A; 3IBF B; 5KFA A; 1PGZ A; 3IO1 A; 2CNO B; 5I3P A; 2V69 A; 3T6B A; 4UW2 A; 1XEZ A; 3WC0 A; 2DEJ A; 3R6L B; 2X3D A; 2O67 A; 2N3L A; 1IJE B; 2HHU A; 2G1H A; 2DRD A; 5KT5 A; 5HMZ A; 2RB7 A; 2ZVS A; 1H3D A; 1KHV A; 3VVT A; 4ECV A; 1FJC A; 1O51 A; 1L3K A; 4DHV A; 2I0X A; 1H73 A; 1HNZ J; 3FBB A; 1NDC A; 1Y3J A; 5LXR A; 3CVK A; 4TU8 A; 4ILR A; 4M5M A; 2DIT A; 1N5Q A; 3CD5 A; 2DIV A; 4ETZ A; 5KFK A; 3VV2 B; 1MU2 A; 2HQG A; 1HBO B; 3KJF B; 2GVZ B; 1MN7 A; 5SUH A; 2DK2 A; 4M94 A; 2CIM A; 2ZFH A; 2A2D A; 1C4C A; 1RB0 A; 2DIS A; 4H54 A; 4NOH A; 2XUL A; 2YY3 A; 3TUP A; 3PKY A; 4QYZ J; 1TL7 A; 4R0E A; 2OHD A; 3MTJ A; 3G86 A; 2MHN A; 3HHE A; 5H1S V; 3BYR A; 1GX6 A; 2WON A; 3BM7 A; 3TUI C; 3TAR A; 1Q8K A; 4CP5 A; 1CVJ A; 1KBR A; 5CD4 A; 2WAQ D; 4DV2 F; 4DR6 J; 3SEO A; 2V6A A; 1IBK J; 2FHM A; 3BGR A; 4KFB A; 3MR6 A; 2F40 A; 2ALZ A; 3BSA A; 1TL1 B; 1VQ8 S; 3VR1 A; 2UXD J; 1VQL S; 3UWT A; 3TA2 A; 4LFC J; 1FNX H; 1R8C A; 3GYN A; 3MEE B; 2UXB J; 5KFT A; 2GX8 A; 3E2E A; 1VQ5 S; 1T8E A; 4GVL A; 4CYU A; 4UQT A; 1R0A B; 4ZP9 A; 3F44 A; 1IM6 A; 4YDX A; 1PC5 A; 1RWN B; 1KS2 A; 2A6M A; 3C6U A; 1WEL A; 3UDV A; 4OI1 A; 3CGI A; 2JC1 A; 4N8N A; 4DR5 J; 1UPP A; 1RAD B; 4C8Y A; 3FQL A; 2G0I A; 4FYW B; 3MOZ A; 1SJQ A; 4JI7 J; 3J7A 1; 3PCO B; 2CPZ A; 1L3S A; 1F6T A; 2GHP A; 2WOM B; 4E8U A; 1OY6 A; 3JXO A; 1M5S A; 2KT2 A; 2F4F A; 3Q8R B; 4M5K A; 4KTQ A; 3CJR A; 4GO7 X; 2XO6 A; 4LFB J; 2ZUA A; 5HQM A; 7AT1 B; 3BO4 A; 3R8Y A; 4O3R A; 1T9V A; 4P2F A; 4P52 A; 4P2S A; 3M8P B; 4FXW A; 2DH9 A; 3UE2 A; 1GT8 A; 4MIW A; 1H98 A; 4ZDN A; 1UKU A; 4Y2K A; 2EFO A; 4JI1 F; 4AL7 A; 4PYD A; 3AD7 C; 3DOL B; 2PI5 A; 3LAM A; 2BUN A; 2AHO B; 1JNZ B; 4Q5V A; 1NK7 A; 3ZZO A; 2CQC A; 2UV8 A; 1X31 C; 1PIL A; 3ADA C; 5DDP C; 5A76 A; 3V6H A; 1RT4 A; 4C7Q A; 4OX6 A; 2MQQ A; 3IC1 A; 4DS4 A; 5EX3 A; 2FVS A; 3NS5 A; 3HPO A; 4OX9 F; 3V81 B; 1N0V C; 2FIU A; 5GAD I; 1RJJ A; 2R7X A; 1KVI A; 4ZPW R; 4CM0 A; 3JSB A; 2J8S A; 4Y34 A; 4Q2M A; 4ECU A; 4J9V A; 2ATL A; 2C2Z B; 1NND A; 5D77 A; 1IR0 A; 4RO0 A; 2WVB A; 3R7N B; 1IWA A; 2OP5 A; 5LL6 d; 3Q86 A; 1SCJ B; 2XMV A; 3G9C A; 3KUH A; 2NZC A; 1NDP A; 2ZKT A; 4DX5 A; 2OLW A; 1XER A; 4WTY A; 3DDK A; 2VC1 A; 4P75 A; 1TVR B; 1Q79 A; 4DQP A; 1FDN A; 5A0Y A; 1GMW A; 3PY8 A; 4CT9 A; 3EDQ B; 2J76 E; 1K1S A; 2CNK B; 3IRX B; 2VDH A; 4KGK A; 5GME A; 3ZNJ 1; 2OML A; 2K06 A; 4C6A A; 3PO4 A; 1T95 A; 1CG2 A; 5KT4 A; 3I55 S; 3GR0 A; 4F50 A; 2ZWO A; 1JLA A; 2ZD1 B; 4W4M A; 3QJL A; 2D7S A; 3K2Y A; 4I6W A; 3BEG B; 3IGV A; 5KT2 A; 2NYI A; 2MDA A; 1MWZ A; 4UOC A; 5IT9 Y; 2QA4 G; 1OWX A; 1BXN A; 2CQ2 A; 4FYD A; 5HP1 A; 1GXL A; 5L1L A; 2EG2 A; 3JYT B; 4P2X A; 2ZZN A; 2G2Z A; 4JI5 F; 3ENA A; 5CZV A; 4TKT A; 2R8I A; 1R0B G; 2EKN A; 3VAF A; 5GAD U; 1N6Q A; 1HNX F; 3LO3 A; 1K44 A; 4J91 A; 3C16 A; 3IN5 A; 5BR8 J; 4I7F A; 3FFI B; 1T03 A; 3NCQ A; 1VMB A; 2BA9 A; 3OUY A; 2KFZ A; 3AA9 A; 3GYG A; 3C14 B; 3NMA A; 4UOG A; 1S1T A; 2GFF A; 2KXF A; 3CMA S; 1GFW B; 1X0F A; 3K5P A; 3VAL A; 2IDE A; 2XG8 A; 2ZE2 A; 2C2D A; 1XIQ A; 3POT A; 4LF1 A; 4ZS6 A; 1QUV A; 4A8K A; 1UVI A; 1K73 T; 1AW0 A; 2D9O A; 1IR2 A; 3W5X A; 4F4A A; 1YBT A; 2D3U A; 2IFX A; 2XSF A; 1A7G E; 5F9L A; 1VRU A; 3ZZP A; 3I0S B; 1ZYQ A; 4ELV A; 4OIX A; 1IKX B; 2NXU A; 3NGS A; 5DZ6 A; 3VCD A; 1UEV A; 4DL3 A; 3TX0 A; 3OD2 A; 4HHH A; 3CCM S; 3KLE A; 2AYG A; 3DI6 A; 4LSL B; 4DWI A; 5KFM A; 3CD0 A; 1LWF A; 3T1A A; 4C4W A; 2ZC3 A; 5J2M B; 3PR5 B; 3DOK B; 1REG X; 1Y5N B; 2RRB A; 2GGP A; 3AXM A; 3KG4 A; 1J2V A; 3KHR A; 4HH1 A; 3O3L A; 3UFC X; 3BZQ A; 3BSO A; 2D41 A; 1IKW B; 4ID5 B; 4Q43 A; 1Q7L B; 2VG6 B; 2F4V F; 2H54 B; 3W9H A; 4WE1 B; 3K7R A; 2AYE A; 4KV8 B; 5BYR A; 4PEO A; 5KTQ A; 4DN9 A; 2C2R A; 3K5O A; 4HKQ A; 3NS7 B; 4BCA A; 2H51 B; 4ZPB A; 5I4M A; 2HYI B; 2B4V A; 5FD1 A; 3SDE A; 1YG0 A; 2CQI A; 5KT7 A; 1EAY C; 2BE7 D; 2AZ3 A; 3QZ7 A; 2C3Y A; 3HKZ D; 4A48 A; 2E1M C; 3PFE A; 1T02 A; 3WZ0 A; 2XO7 A; 2M88 A; 1XNR J; 4DLE A; 3BQ2 A; 2KT5 A; 4RL1 A; 4YEA A; 1R8H A; 2J7K A; 2ZVI A; 3UDE A; 2BM1 A; 4ZCL A; 3KLF A; 1P27 B; 1NK8 A; 3PAC A; 1SL2 A; 1J5O A; 3EXC X; 1JKH B; 3F0N A; 3D2W A; 5J2N A; 4ES2 A; 4JI3 F; 1W25 A; 4CO0 A; 4AUK A; 3DGV A; 3TQE A; 1YLX A; 2V8H A; 1HNW F; 1VJQ A; 2LEA A; 3U27 A; 4ZIV A; 4FF3 A; 3NS6 A; 4FP9 A; 5AXN A; 4J9N A; 3PW7 A; 2R8K A; 1SI9 A; 2HVZ A; 3P5B P; 4UZC A; 2RSQ A; 1TR0 A; 2ZH5 A; 1D1U A; 1RP5 A; 2BJD A; 3R27 A; 5E5N A; 4FYV B; 2F7V A; 3JQJ A; 1U1Q A; 4NWB A; 3FDS A; 3HI9 A; 1F5C A; 1C0T B; 2YNH A; 4C3M A; 1XNQ F; 3QT7 A; 3HSG A; 3TJ9 A; 3HF5 A; 5FLX Y; 2ZDP A; 2D74 B; 3DN9 A; 4DPO A; 2CQD A; 1V3R A; 2HVH A; 2XMM A; 3J7Y I; 4KIA A; 4L74 A; 2FLP A; 5BYQ A; 2DHG A; 3MFH A; 3GMG A; 3HVW A; 1RAA B; 1N4L A; 2ZH2 A; 2WRM A; 3GIM A; 2ALY B; 1SL1 A; 3L7P A; 1HMV B; 2FD2 A; 1HNV B; 3B78 A; 2DCU B; 3VQS A; 1WEX A; 5LSO A; 3MR3 A; 2IRY A; 3QFH A; 3CF5 Q; 5F8J A; 2GAH C; 2GQ2 A; 3OTC A; 4A8O A; 3MWB A; 3D1O A; 2HRT A; 2AGP A; 1TAQ A; 2IJF A; 2GC8 A; 1RI7 A; 2OO4 A; 1WC6 A; 2LFV A; 4NXN J; 2RQM A; 1B4S A; 2FLL A; 2RS2 A; 4OYB A; 4X4S A; 1AZS A; 3VVU A; 3AD8 C; 3MAA A; 1P1L A; 2CPD A; 4OI4 A; 4X4R A; 2MZQ A; 4OZN A; 4A8S A; 1RT1 B; 1IBL J; 2V9W A; 3JTO A; 4LSN B; 4LF2 A; 2BKP A; 3FSI A; 3K57 A; 3C6T B; 3THV A; 4R0J A; 4DL6 A; 5E3C A; 2DRA A; 4RNF A; 1VQ7 S; 3CCQ S; 2V8P A; 3W2W B; 3I96 A; 3FZB A; 1T7P A; 2JC0 A; 1MG7 A; 2P9C A; 2QZ8 A; 2YWF A; 3VGV A; 1WC0 A; 3CDB A; 4OYW A; 3SSS A; 1RDR A; 2MEW A; 4H4M A; 1XR7 A; 1SBR A; 4HTJ A; 2MKJ A; 4QBU A; 3OLA A; 4R25 A; 4ICL A; 4OFZ A; 4X2B A; 3J7Y U; 1HHQ A; 2NZ4 A; 2DR8 A; 3OBI A; 3R5J B; 5A8K B; 2EK1 A; 2WB1 D; 2RNE A; 3GV5 B; 3KMQ A; 4B3O B; 4RNM A; 2JEJ A; 1Q7Y T; 1U24 A; 3MR5 A; 4KHP F; 1VQO S; 1B3T A; 4IOC Q; 5ETM A; 4ZVP B; 2QLW A; 2Q43 A; 4RW4 A; 4QU7 A; 4HEA 9; 4IO1 A; 3TQ1 A; 2GQC A; 4RW8 B; 2QT7 A; 2ZWP A; 4DCP B; 1CJT A; 3CD6 S; 4P6Q A; 3CPW R; 1FKP B; 4KO0 A; 3DYA A; 3LH2 S; 3TVK A; 4ZPA A; 3HD2 A; 1YDL A; 2HWT A; 2GO9 A; 3PHT A; 1FKO A; 1JX4 A; 4ED6 A; 1ZAW A; 3GON A; 1JLB A; 5HMX A; 1YBU A; 4K50 A; 1NZ8 A; 3AAW B; 1SJ4 P; 4TQR A; 4RNN A; 3W9J A; 2H5I B; 4TVA B; 1FRK A; 1IXK A; 1CUL A; 4WXO A; 2Q6C A; 4M5D B; 3H4B A; 2EC0 A; 3M32 B; 3IBW A; 4DV2 J; 2VG5 A; 3M2R A; 3MEG A; 4M5J A; 1NB7 A; 2G9O A; 4PWD A; 4TU9 A; 3N79 A; 1U45 A; 1W7W A; 3I0R B; 1S5Z A; 5A2Q U; 3LAN A; 4F25 A; 3QSY B; 1DLO B; 3T5H A; 2VDI A; 2J0X A; 3VAI A; 3P49 B; 1TKZ A; 2V94 A; 3M2V A; 1F3F A; 2B43 A; 3HT0 A; 1Q95 G; 2COL A; 4C8O A; 3S7R A; 1LFW A; 2LXI A; 4C8K A; 2NYH A; 5IC6 B; 4RWX A; 1HQE A; 3GIJ A; 4FVM A; 4ZJO A; 2DRB A; 1LWE B; 1ZZF A; 1NH8 A; 4P72 A; 2CQ0 A; 1Q5V A; 4OI2 A; 3UD5 A; 2YNF B; 1HWJ A; 3RGI A; 2HND B; 3NY0 A; 5MAO A; 2VG7 B; 2LKZ A; 4G6V B; 3AOB A; 2XYG B; 1QE1 A; 2DBB A; 4NLP A; 2E5G A; 1S57 A; 3NP5 A; 4N41 A; 4MKB A; 2FPH X; 2EXU A; 1DTT B; 1KVJ A; 3R2D J; 1M1G A; 2QGF B; 4LRA A; 4C98 A; 2RDD A; 3PRV A; 2MXY A; 3RB4 A; 3BSC A; 4WKY A; 2EG1 A; 1IQT A; 4JI1 J; 4EBC A; 4DSI A; 3HHL B; 2R7O A; 5D0E A; 3SBM A; 1DTQ A; 4RW6 A; 3TAM B; 4ZVT B; 3CUL A; 4DFK A; 1TAU A; 2A10 A; 2J5A A; 4PXD A; 4DG1 A; 4EI2 A; 1NUE A; 3NOG A; 3VZH A; 2CPE A; 3J80 Y; 2B7B B; 3EWG A; 3ET6 A; 4QIE A; 4OX9 J; 3MPU B; 1HLW A; 1UCN A; 3KK2 B; 1ZTT A; 2POK A; 1W2B R; 3UO0 A; 1UZH A; 4CH1 A; 2ZHA A; 8ATC B; 1JLC A; 2O1P A; 5A8R B; 5IOL A; 1FER A; 4U7U K; 2JRS A; 3NWR A; 3O8W A; 3LW5 C; 1XWL A; 3L3C A; 2FJD B; 1K1Q A; 5F0U A; 2DHX A; 2MQL A; 2L41 A; 3KHL A; 1VBY A; 2BRL A; 1BQN B; 3MEC B; 2EBE A; 3MUT P; 3HD1 A; 1S6O A; 3FRZ A; 3BR8 A; 1YSJ A; 2XMW A; 1EQM A; 4ECZ A; 2CJY B; 3K8V A; 1QSY A; 2NXE A; 5KG0 A; 4CO1 A; 3KMS A; 2YKN B; 3TWZ A; 2YPY A; 5E2Q A; 1Q81 T; 2B6A A; 1R6V A; 5B0A A; 3M30 A; 2LMI A; 2W01 A; 5DG9 A; 3ICL A; 3WIU A; 2EFP A; 3T9N A; 4AT1 B; 2RIJ A; 5GAE I; 1SC4 B; 1TUG B; 5I42 B; 2QMU B; 2K2P A; 2ZBP A; 3U1M A; 1ZM3 A; 4DPU A; 5KG1 A; 1AFI A; 3ZFV A; 1MWY A; 2JEG A; 4NLT A; 2NUH A; 4G1Q A; 3DLH A; 2KN4 A; 2GQQ A; 4B02 A; 3J7Z 5; 3TEG A; 4CI0 B; 3C46 A; 4FS2 A; 2OPS B; 3H5S A; 1HR0 F; 4I6Y A; 5SZT A; 3N5B A; 5J1N A; 1O6X A; 2VV5 A; 4IR9 A; 2CZV C; 3FBC A; 2FGO A; 3MAH A; 1VIX A; 2GIR A; 2VFS A; 2B9W A; 2HHP A; 3UI3 A; 1QJH A; 4H4O A; 3PYD A; 3PYF A; 2IVF B; 4RNO A; 2B5J A; 1A9N B; 5T7L B; 3NNC A; 4JI5 J; 4ZVR B; 3RAQ A; 1HNX J; 3IWL A; 2XY7 A; 1TV6 B; 4KBI A; 5DDR C; 1KEK A; 2KRR A; 1RLC L; 1HI0 P; 4NCB A; 2XS2 A; 2AMC B; 1RAO A; 1X9M A; 1X9S A; 3A3P B; 1TU0 B; 3RW7 A; 1WF0 A; 3MUV P; 5IWA F; 5K8N A; 4OZJ A; 2P5V A; 2HBQ B; 3AHP A; 5JUM A; 1P6T A; 1XMB A; 2FZC B; 1SJ3 P; 5C5J A; 3GII A; 1P8G A; 2YKM A; 4G3I A; 3AOA A; 3HMJ G; 2DR7 A; 2H1Y A; 4JUZ A; 1T9X A; 2AYB A; 5B0E A; 5GAE U; 4IFY A; 2OEM A; 4OZ2 A; 2YWH A; 3ZTR A; 2UU9 F; 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