The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
115
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structure length |
115
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Chain Sequence |
KEDTIEIAGFHAHVYFDAASRDVAARVREGLGARFEVQLGRWFDKPIGPHPKGMYQVAFLPNQFDKVVPWLMLNREGLDILVHPETGDAVSDHAVYSLWLGAALALNIEFLRQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of putative dioxygenase (ZP_00109509.1) from Nostoc punctiforme PCC 73102 at 1.46 A resolution
rcsb |
| source organism |
Nostoc punctiforme
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| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
putative dioxygenase
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| total genus |
28
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| structure length |
115
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| sequence length |
115
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | DOPA-like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NYH A; 2PEB A; 2P8I A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OZ2 A; 1U1N A; 3IWL A; 1MU2 B; 4KKO A; 1N88 A; 2ZD1 B; 3ENW A; 2YNF A; 2FC9 A; 2QG9 B; 1X8D A; 3VGS A; 3ITH B; 2OPP B; 2E5G A; 4KPC A; 1X0F A; 4DQR A; 1HIY A; 1NJI T; 2Y8W A; 2HFZ A; 1RHU B; 1QAX A; 4WYL A; 2OHD A; 1LOU A; 2QL5 B; 3D1H A; 1CS4 B; 3QGH A; 2HAI A; 3QPI A; 1HHT P; 2XS5 A; 4I2Q B; 1UEV A; 4RNH A; 1VQP S; 4NE9 C; 3D0I E; 1U1M A; 1TV6 B; 2FJW A; 2X3D A; 4LR9 A; 5C24 A; 3SZ2 A; 3HFV A; 3QWU A; 1UZD A; 5DGB A; 1G6B A; 4Y2I A; 3RRK A; 1X5T A; 4ECT A; 3LGH A; 1U26 A; 5B0B A; 2XTJ P; 1XEZ A; 4Z2X A; 5I42 A; 4AQY J; 1U48 A; 1OYE A; 2V2V A; 4W98 A; 3BQ1 A; 4JI6 J; 3I5A A; 3DNC A; 3E51 A; 3CCL S; 3HX9 A; 2UVR A; 4ERD A; 3AD8 C; 3PFO A; 1VIS A; 4LRD A; 2HND A; 2V5H G; 5DLG A; 1RAC B; 1ZA1 B; 3QMQ A; 1RA6 A; 3KKF A; 4CZC A; 3VV2 B; 1SL2 A; 3M7V A; 4R5P B; 5KFN A; 3F0N A; 2HLU A; 4OLP A; 4JI1 F; 5C5J A; 3QGG A; 4DS5 A; 1GX6 A; 4GC6 A; 1A0O B; 3WX8 A; 3P8B B; 5T7L A; 5L1J A; 3T5J A; 4AND A; 1YJN S; 1RT6 B; 1UA1 A; 1A7G E; 4DL0 C; 2XHW A; 3LQV A; 3DLK A; 2UU9 J; 3VHQ A; 5KFS A; 1HBO A; 2B5J B; 2CUY A; 1NLK L; 2JWN A; 3EM1 A; 3HCX A; 1PIE A; 1GX5 A; 5DG7 A; 1QTM A; 2B6A A; 2XM3 A; 3I55 S; 4L73 A; 4PZV A; 1IM6 A; 4DQI A; 3D28 A; 3UQS A; 4FYW B; 1ROF A; 3K57 A; 2KDO A; 3NEK A; 4LBH A; 1C4A A; 4LVO P; 4RR5 A; 2YNF B; 5A0Y A; 3VAI A; 4DV1 J; 2Y0B B; 1EX8 A; 1ZPW X; 2EBG A; 1XMO F; 4K0K J; 4NLS A; 3TJ8 A; 4B08 A; 4Q5V A; 2DR5 A; 2QV6 A; 2R8J A; 5D78 A; 3T19 A; 5D0G A; 1GFW B; 2RNE A; 1F60 B; 1WI6 A; 4CH7 A; 4ZPD A; 1XBW A; 2FHM A; 3V81 A; 1X9W A; 4Q8F A; 1CG2 A; 2DYA A; 3KOA A; 1RT7 A; 1V9O A; 2YQ0 A; 1CJU B; 3OBI A; 4U8V A; 2DGT A; 5CH7 B; 4ZN3 A; 4X4Q A; 3UCU P; 2JSX A; 1KQS R; 9RUB A; 1VBY A; 5B0E A; 3H25 A; 1NK6 A; 2FJV A; 2IYI A; 2NXC A; 1YKW A; 3OR1 A; 4EEY A; 1XR7 A; 1YLX A; 4HT7 A; 4CH1 A; 3H5S A; 4Y00 A; 1H3D A; 2DHG A; 2RDI A; 2VC1 A; 3AOD A; 5F8J A; 3SFG A; 4X65 F; 2DNG A; 3CME S; 1RWN B; 1HI8 A; 1HNX J; 4KH1 B; 2XYG B; 4CI0 B; 1S1T B; 2GGP A; 4CRJ A; 5C25 B; 1X9S A; 4J9S A; 1Q81 T; 3NKY A; 3C6T B; 1S6Q A; 4C98 A; 4WFX A; 2BE9 B; 2IAJ A; 3BGR A; 4JUZ A; 3PVX A; 2LEC A; 4J9Q A; 1S6Q B; 3G6X A; 1UVJ A; 5KFB A; 2M70 A; 1W7W A; 4A47 A; 2R2S A; 1ARO P; 1R8H A; 3DRS B; 3DMJ A; 4MK7 A; 1HNZ J; 1S1T A; 2V34 A; 1LNQ A; 1HR0 J; 3SFU A; 3FCV A; 1CJV B; 3JS9 A; 3PYG A; 2PMZ D; 3SQG B; 3Q8S B; 3BH7 B; 1FK9 B; 4L3N A; 1QAJ A; 4KHP J; 1SC3 B; 1CBK A; 1X4H A; 2BAB A; 3AB2 B; 1RAI B; 3HZG A; 4H4O B; 1C1C B; 4DUT A; 3RBD A; 2LEP A; 3FQL A; 4ZLL A; 1MN7 A; 3W2W A; 2FLN A; 1RCX B; 5A2Q U; 2FHJ A; 4Q43 A; 3HK2 A; 3GFX A; 3OXG A; 2Y1L B; 2ZE2 A; 1VJW A; 4L76 A; 3TA1 A; 4QPX A; 1T3O A; 2R8G A; 4PAA A; 1KR4 A; 1Z2Z A; 2WCX A; 4CLP A; 3V81 B; 2E9R X; 3KNA A; 4ZPT R; 2J7W A; 7FDR A; 4OMF G; 3NS5 A; 5FDL B; 5BYR A; 3SDE A; 3W60 A; 4NLV A; 4LF8 J; 3NRB A; 4BBY A; 2B4O A; 3TX8 A; 1PBA A; 2JLF A; 4PQA A; 3OQ2 A; 2X7I A; 5GAH I; 1IBK F; 2ZDP A; 5A8K A; 2EFO A; 1FX4 A; 1QUP A; 4HT5 A; 3H4D A; 3ILJ A; 3DDI A; 4HH0 A; 1KOH A; 4Q45 A; 1FD8 A; 1Q7L B; 3O2I A; 1HNI B; 3HHD A; 4N8N A; 5E3R A; 4F0M A; 2Z2Y B; 2SXL A; 4Y34 A; 3W5Z A; 3T3F A; 2OD4 A; 2IPO B; 2WRM A; 2CQG A; 1QAI A; 3IBW A; 3V6H A; 3C66 A; 2WVE A; 4KGZ B; 1G3O A; 4B9S A; 1VQS A; 3NL0 A; 1WC1 A; 4O0N A; 3DC2 A; 5T7L B; 4X66 J; 3ZNJ 1; 4JI7 F; 3GIL A; 3B6B A; 1NB7 A; 3L4B C; 2BAN B; 1JLE A; 1L3U A; 1FRX A; 5E3Q A; 5C2C A; 2J6U A; 3D4J A; 5J2M B; 5L9X A; 3TEH B; 5AE1 A; 2HSE B; 1IJF B; 3MEE A; 3PHT A; 2FJE B; 2HHW A; 3DOL B; 2EFG A; 2B4V A; 2ZVI A; 5HQ8 A; 4GKJ F; 4LSN B; 2MKC A; 3IN5 A; 4P2X A; 4WP8 A; 4PPD A; 4F0H A; 4OV6 A; 3UPF A; 2E1P A; 5JMN A; 1LKZ A; 1PO6 A; 3QRP A; 1VR6 A; 2B7B B; 2GVD A; 1K73 T; 2F8M A; 4DPW A; 3D6F B; 1B70 B; 4CIO A; 3ETO A; 5DQI A; 2L48 A; 4YR2 A; 3HHL C; 3KLF B; 1XMQ J; 1R89 A; 1KBR A; 5D0E A; 5AE2 A; 2DNR A; 2WOM A; 2KG1 A; 3CO9 A; 2VFV A; 1UEU A; 5J2Q A; 2B51 A; 1CSJ A; 1XNQ J; 2J0X A; 5ETO A; 2K2P A; 1RI7 A; 4H4M A; 3UFC X; 3D6T B; 2KN4 A; 2LCW A; 2Q3P A; 3JTP A; 4NWB A; 5EWG A; 2FHK A; 3PJX A; 1VRT A; 4F4K A; 3DI6 B; 4BHQ A; 5HP1 B; 5LSL A; 2NCK L; 3V6J A; 3EVM A; 4J9L A; 5DLF A; 1FES A; 3H5X A; 2EKY A; 1U2C A; 3UW1 A; 4F36 A; 2QA2 A; 2F1F A; 3G8Q A; 4QWC A; 2M5Y A; 5LMU F; 1MU2 A; 1RLC L; 5K8N A; 2FZK B; 4CH0 S; 5KFI A; 3WBZ A; 2ALZ A; 1JWW A; 2QGF B; 2VV5 A; 5HLF B; 1QTN B; 2MHE A; 2PT0 A; 3VAF A; 3EZ5 A; 2HNZ B; 2F3J A; 1BY9 A; 3QIP B; 1UJ4 A; 4FP9 A; 2HWT A; 4MIA A; 4R25 A; 3JSB A; 4A8S A; 2FJB B; 3BGO P; 3RBZ A; 5B0C A; 5IV4 A; 2AX1 A; 2R42 A; 2EI5 A; 3OTD A; 4LF9 J; 1N33 F; 2V63 A; 1UVK A; 5IQ6 A; 1UJ6 A; 4PXB A; 2H51 B; 2GMH A; 4DPO A; 2ZJQ Q; 3CJ0 A; 2HFU A; 1LWE B; 4FPR A; 2ASJ A; 3VGT A; 2V2K A; 1HI0 P; 3GFY A; 4B9M A; 3M30 A; 8ATC B; 1EET A; 1TL1 A; 3VR1 A; 3J81 j; 3KG0 A; 4PRF A; 2N7C A; 5DQG A; 1VC0 A; 3CMA S; 4W90 B; 1HNZ F; 2GHV C; 2QLB B; 3I0R B; 4F3Q A; 4C8K A; 2G4B A; 1FXL A; 1S9G A; 3JXO A; 2FJD B; 1LWC A; 4F2R A; 2ASL A; 1QUV A; 2HMI B; 2EPI A; 3WDO A; 4B3R J; 2OPR B; 2HQ3 A; 1KRP A; 3M8S A; 1N52 B; 2EVZ A; 5EN1 A; 4FVM A; 4UTG A; 4P52 A; 2M3D A; 1FNO A; 2ZOM A; 4YME A; 3AXK A; 4EUV A; 1LQ9 A; 3UD4 P; 3QT6 A; 3JYT B; 3D67 A; 4NLR A; 3HFK A; 4G1Q A; 2V8V A; 1N5T A; 1N4L A; 3ZTR A; 4DF4 A; 3BGF A; 3DRR B; 3D6H B; 4DOZ A; 4FF1 A; 3CUL A; 2V68 A; 4XDC A; 2E1A A; 3SCJ E; 3IRW P; 2KFN A; 5IT0 A; 2AGQ A; 3R5D A; 5J2Q B; 2H5I B; 2CA9 A; 3UWT A; 5EWF A; 5LJ5 Y; 5HJX A; 1YTY A; 2VBW A; 2FVC A; 5CZV A; 4IG0 A; 3LPY A; 1XTZ A; 2HVZ A; 4K5R A; 1LW0 A; 1UWB B; 1WTF A; 2FZG B; 4K2J A; 1GEH A; 1Z2L A; 4WF9 Q; 3CC4 S; 1BWE A; 3GR1 A; 5IZH A; 1U6F A; 1YJT A; 3M2V A; 4R0E A; 3UN2 A; 1T94 A; 4JOU A; 4Q0B A; 3V2U C; 1DQ9 A; 3PRV A; 2O1P A; 2ZBC A; 4LFC F; 2HRU A; 2DR9 A; 4Y2A A; 1U0H B; 3D54 A; 4ALZ A; 4DPX A; 1OPZ A; 1RWM B; 2HQC A; 4LQ9 A; 2A6M A; 4KYZ A; 1JXE A; 1TUW A; 4B9L A; 3R2D J; 2W4C A; 3AOC A; 2WOM B; 2P8I A; 1J2V A; 1OMS A; 1YBU A; 5F8M A; 1UKU A; 1Q8I A; 2KYZ A; 1O6X A; 2V0N A; 5IM0 A; 2AGP A; 2AMC B; 3R7B B; 4WFA Q; 4OYX A; 2CPE A; 5EX3 A; 2HHV A; 2MQM A; 3UN5 A; 3ENQ A; 4CO5 A; 2IBK A; 4ANC A; 4U9R A; 1JQG A; 1YIT S; 2XB2 D; 4LRA A; 4D3H A; 4KHR A; 4CLF A; 4K4S A; 5F3T A; 1T03 A; 5ETK A; 5HAT A; 1S99 A; 2OI2 A; 3IAM 9; 4DU8 A; 3OPK A; 3HSJ A; 1NDC A; 2MJU A; 1X5S A; 5LXR A; 1DQ8 A; 3M6U A; 3MM6 B; 1BHN A; 1M5H A; 1SC6 A; 2GO9 A; 2HGM A; 3H90 A; 3N5F A; 5J2M A; 2DRB A; 2NR0 A; 3MFH A; 3TUZ C; 3R8Y A; 3MEG B; 4ZLN A; 1LXJ A; 1RAF B; 3HVW A; 5FLX Y; 5EDW A; 1NK0 A; 1N0U A; 3ISN D; 1LEO A; 5I3U B; 1WHV A; 3K8W A; 2BQ3 A; 3GIR A; 3N79 A; 5DS7 A; 1C1B A; 1UA0 A; 3NCQ A; 4BCA A; 3TAP A; 3AY0 A; 1KVJ A; 1DAX A; 2MST A; 3PEH A; 3I87 A; 3EZO A; 4USM A; 3SCI E; 1SKW A; 2E7W A; 1HNI A; 4N8O A; 4JI2 J; 2LA6 A; 3NWG A; 2HHQ A; 3BPS P; 2BE2 A; 2MKJ A; 1IR2 A; 4WKY A; 3AQP A; 3QJL A; 2W4P A; 1RAO A; 2CFX A; 4KE5 A; 4PCQ A; 5D4L A; 2I2Y A; 4QCL A; 3NXZ A; 3NBP B; 4DCP B; 4A46 A; 1HWJ A; 3L7P A; 4RW4 B; 4F4Z A; 4USI A; 3N6N A; 5EX0 A; 3AHP A; 3THV A; 1NZ8 A; 3O5T B; 4AL7 A; 3DMJ B; 4I64 A; 2BJE A; 5GAE U; 1U1Q A; 1D8Y A; 2G9O A; 3ILO A; 2H65 B; 5ETS A; 4B3T J; 3BB5 A; 4NCG B; 3V4I A; 1KWM A; 1VC5 A; 1PC4 A; 1UJ5 A; 3N6M A; 4H4O A; 1RT5 B; 4MAK A; 1Q8B A; 2DHA A; 4TY9 A; 3TA2 A; 3H4B A; 1C2P A; 3GSI A; 2CQ1 A; 3MOJ B; 4RBU A; 1DJ0 A; 3QJP A; 1P9Q C; 4IUF A; 4L3K A; 1HBU A; 5HBM A; 3HHL A; 3KK2 A; 4C7Q A; 3ISZ A; 4Q7A A; 4EYI B; 1VHI A; 1MLA A; 3KG1 A; 2Q6B A; 1NK5 A; 1PYO B; 2E5L J; 2XZW A; 3RAX A; 1ZET A; 1DTQ A; 4NEZ A; 2FPH X; 2GVZ A; 4M5L A; 2A0F B; 2LP4 A; 2LXI A; 4DR7 J; 2DIS A; 1RHK B; 2VG6 B; 4O44 A; 3CJK B; 1LWC B; 2D9P A; 2GS8 A; 3HVT A; 2JDJ A; 2VOD A; 4LVN P; 2CWK A; 4DFP A; 4U6P A; 1BQM B; 3RTV A; 4QIF A; 2BBE A; 3VZI A; 3PW0 A; 3FKB A; 1R0A B; 3UNG C; 4WTY A; 3M8Q B; 1RWU A; 3NS7 B; 4ELU A; 1H2V Z; 4GVB B; 2D41 A; 4H4K C; 4UOF A; 3IFE A; 1N6Q A; 2DPJ A; 3IG1 A; 2EKN A; 2P2C B; 3KYL A; 5J1N A; 3VAL A; 1UVL A; 2CJQ A; 1RQ0 A; 4ED5 A; 3Q86 A; 4I67 A; 4M5M A; 4B3M F; 2HG4 A; 4UZC A; 5L46 A; 1TKT A; 5HVF A; 1G1X A; 4ENO A; 1Q78 A; 3WC0 A; 4L72 B; 5EGY A; 2ROE A; 2VHG A; 3UDV A; 3DRP A; 4NA1 A; 4C97 A; 5KAK A; 3FUY A; 1RT2 B; 2HVD A; 2V2Z A; 3BRE A; 1OY6 A; 2FUG 9; 3J81 U; 1FE4 A; 1FRI A; 3QGP A; 4M5J A; 4WU3 A; 2KFZ A; 4OJG A; 2HWH A; 5AXM A; 2GQC A; 2EFN A; 2W2O P; 4ER8 A; 2QL9 B; 2O3D A; 4ECR A; 2K1R B; 4IRD A; 4NRT A; 4ES2 A; 5HVH A; 1RTJ A; 4QIW D; 5A2Q Y; 1H73 A; 2YNG A; 2HND B; 5GMD A; 3W8G A; 3QAE A; 3M32 B; 4X66 F; 3VCD A; 1RK8 A; 2QMW A; 4U96 A; 1SIZ A; 5A8W B; 2NXU A; 2Z2Z A; 2YKP A; 3VQT A; 4NLU A; 1ZH5 A; 2POK A; 3I5B A; 4NAS A; 3R27 A; 1T9W A; 4FNI A; 2FHJ D; 4NLX A; 1NAQ A; 3N4W A; 4QBU A; 5CZX A; 2DTJ A; 3RUB L; 4CNY A; 1KEK A; 2HFN A; 4PAB A; 2DEJ A; 4V1A k; 5KFO A; 3EYZ A; 3HT0 A; 4DR5 F; 2E1M C; 4LUB A; 4ZVU B; 4NZ7 A; 1R0B G; 4RX6 A; 5HQM A; 2ASD A; 4DS4 A; 1S6P A; 3A12 A; 3PNI A; 2M4M A; 4KY3 A; 1MG7 A; 4A8O A; 1T9Y A; 1RTJ B; 2L9W A; 3IG1 B; 2AW0 A; 1N5Y A; 2GIF A; 3MAH A; 3MTK A; 3U1M A; 3R6G B; 4PXD A; 3DLL Q; 3AJ2 A; 2ZD1 A; 4DQS A; 1JLE B; 2YKQ A; 4DF8 A; 2XMK A; 3FJ2 A; 2ZZM A; 1EKS A; 4LF6 J; 4IOA Q; 3SXL A; 1D9F A; 4IDK A; 2KVQ E; 1QE1 B; 2VOO A; 2MJN A; 3IBC B; 4TVA B; 2XYH B; 1HQU A; 5A76 A; 2DPI A; 4DL5 A; 4DR2 J; 5DQH A; 3TO8 A; 2CQ0 A; 2YBV A; 4HKQ A; 1ZS6 A; 3EGV A; 4TU9 A; 2LKZ A; 1MWQ A; 1TKT B; 3O3L A; 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