The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
ARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
X-ray structure of the mature ectodomain of phogrin.
pubmed doi rcsb |
molecule keywords |
Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2
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molecule tags |
Hydrolase
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source organism |
Homo sapiens
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total genus |
21
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structure length |
88
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sequence length |
88
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ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
pdb deposition date | 2012-11-01 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF11548 | Receptor_IA-2 | Protein-tyrosine phosphatase receptor IA-2 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Alpha-Beta Plaits |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NG8 A; 3N4W A; 2QT7 A; 4HTJ A; 3N01 A; 4HTI A; 3NP5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DCL A; 3FBC A; 3HM9 A; 5T14 A; 4PG5 A; 4IYQ A; 3BJY A; 1HFE L; 3FMB A; 2PII A; 3AJD A; 3OLA A; 1AB8 A; 1LNQ A; 3GJS B; 1REV B; 4CM0 A; 3IGV A; 3IS9 A; 2BQ3 A; 2R2S A; 3I4P A; 3MGJ A; 1PSD A; 2CNL B; 5GMK a; 2J7U A; 2QE5 A; 4YR0 A; 2HG4 A; 1YIJ S; 3SI8 A; 2E66 A; 1U6B A; 1C0T B; 3D54 A; 4H4K C; 5THW A; 4F8R A; 2DRA A; 1SV5 B; 4U67 Q; 3SQG A; 3DCA A; 1TTH B; 4ZPW R; 4S0M A; 2R3V A; 1C1B B; 4RX6 A; 4HHJ A; 3OTO F; 2PD1 A; 3T1Y J; 2HIQ A; 3KK1 A; 5CYJ A; 1HHT P; 3CJ8 A; 2BJD A; 2WRM A; 3M1V A; 4ECR A; 2ZDP A; 1U0H B; 2M5Y A; 5IS2 A; 2MQM A; 5HMZ A; 4UZB A; 5IOL A; 1KQS R; 2E7W A; 1UA0 A; 2IAJ B; 1X4B A; 4IG0 A; 1Q5Y A; 3QAU A; 3KFW X; 2KZM A; 1N5Y A; 1JXL A; 3M2V A; 2LYV A; 1FE0 A; 3M9M B; 2Q3P A; 2XMK A; 3FNN A; 5KFB A; 4K4S A; 5GAD I; 1UEU A; 4GRS A; 1SIZ A; 1WUU A; 3QIP B; 2QSF A; 3CCT A; 3DRY A; 2YPZ A; 3NGU A; 1S0O A; 4C97 A; 3ZC4 A; 3CDE A; 2XCP A; 5EX0 A; 1TKX B; 5I3U B; 4Q2M A; 4USK A; 1E6Y B; 1S6O A; 4B9T A; 2JHE A; 2E44 A; 2HKE A; 2R2T A; 2CJQ A; 3LP0 A; 3D6M B; 4ZLJ A; 4Q5V A; 1YJ7 A; 4X4R A; 4OZN A; 4GO7 X; 1UZD A; 3TO8 A; 4DN9 A; 2IM3 A; 4A8K A; 2HND B; 3M6W A; 1K1Q A; 3GFX A; 1VCT A; 1QAI A; 4NWB A; 4RL1 A; 1TL7 B; 4B9U A; 3SMZ A; 2IDL A; 4NXM F; 3ZZZ A; 1X4F A; 2NR0 A; 4BLG A; 3MM9 B; 3ITH A; 3QYY A; 5KG3 A; 4QYZ K; 4TLR A; 2UVU A; 5DGA A; 3GZ7 A; 4Y00 A; 3G6V A; 2A1B A; 1HQ2 A; 4PWD B; 4Y0F A; 4UUW A; 2FHK A; 3I82 A; 1S76 D; 3LO3 A; 4AYB D; 2CPH A; 2GML A; 1IKX A; 4DV3 F; 2BW2 A; 2C1E B; 2X1A A; 2MY8 A; 4O0N A; 5F8N A; 2DB1 A; 2XYH B; 1T7P A; 1NME B; 1FRK A; 2BQU A; 4ZVT B; 2X1F A; 2Y8W A; 2GQ2 A; 4TNO A; 3UDC A; 1R31 A; 2QG9 B; 1N56 A; 2V2Z A; 1VRU B; 3PW4 A; 1H2T Z; 3ISZ A; 3SSQ A; 5M2U A; 2QLB B; 3CJS A; 3MM5 B; 1BQN A; 4NZ0 A; 3MM6 A; 4P52 A; 1TR0 A; 4ECZ A; 3I55 S; 1NJY A; 1CBK A; 1HMV A; 1NUE A; 4DX8 H; 2MPU A; 2EFO A; 2W2P P; 4Y2I A; 3V6H A; 5IWA F; 4I0W A; 1K73 T; 1JLG A; 1J5O A; 3IG1 A; 2DGW A; 4DPT A; 4ID8 A; 2CDR B; 1NJI T; 1AW0 A; 4O0I A; 4V19 J; 4JV0 A; 1S97 A; 5A8K B; 5J2M A; 3SSR A; 1NZA A; 2F65 A; 1BMQ B; 1U1M A; 4LMZ A; 2F9J A; 1N4L A; 4I1T A; 3D9B A; 2GVZ A; 4FF1 A; 5D0H A; 1U1N A; 4MYU A; 2AGP A; 4NCG B; 1R89 A; 1SJ3 P; 1XWL A; 2HGL A; 1BQX A; 3OXG A; 1TUG B; 3CCW A; 2HBZ B; 2D3O R; 2M8D B; 4KHR A; 2J8A A; 1VYA A; 1NHU A; 4L6V 3; 5KFW A; 3RR8 A; 1QM9 A; 4A8X A; 2G1D A; 1JLF A; 1PKU A; 3C6U A; 3A3O B; 4PXC A; 3DLK B; 3FQL A; 2BMB A; 1Q16 B; 4OI2 A; 1B4S A; 3MDF A; 1RLD A; 3ISN D; 1XN9 A; 2PO4 A; 1GXT A; 2ZOG A; 3KLE A; 3J80 U; 4NLO A; 3RB3 A; 5ADZ A; 3I0S B; 2FY8 A; 2U1A A; 2XGP A; 4B17 A; 3EWG A; 5KT7 A; 5C2C A; 3MTJ A; 2YKQ A; 3K0J A; 4HH0 A; 2OFH X; 4C2M A; 5DJB A; 2V8G A; 2LXF A; 5K9F A; 2RAQ A; 3SBM A; 4B3M J; 1Y11 A; 1N5S A; 1TUV A; 3VQT A; 1S1U B; 3CJT A; 2WHO A; 4FXV A; 1WC6 A; 3AA8 A; 5EWG A; 5L1K A; 2VFV A; 2GC8 A; 4A4J A; 3NBP B; 3N5F A; 2CQ2 A; 4L74 A; 2MKI A; 2IM0 A; 3UR3 C; 1R8H A; 1X5P A; 3I32 A; 4WU3 A; 1OWX A; 3V6D B; 1NDK A; 3M2R B; 3IRX B; 1QSS A; 3T1A A; 1BGX T; 2ZZN A; 3BEG B; 1YBU A; 2UVW A; 4NCA A; 4FYD A; 3M30 A; 3O2I A; 3P8B B; 3Q8P B; 3H90 A; 4ZP8 A; 3J80 Y; 1H38 A; 4K4Z A; 3N6L A; 4NLU A; 3A1Y G; 1RT2 B; 3WX4 A; 4JBC A; 3WDO A; 3HI9 A; 5J2N A; 1T3N A; 1U48 A; 3ISN C; 5BR8 F; 3B4M A; 2KJV A; 4PXB A; 2YKA A; 1TFY A; 3V4I B; 2HZA A; 1CJT B; 3P6Y C; 2BJ3 A; 2D7S A; 2RQK A; 3W8G A; 2DD8 S; 2FZK B; 4DG1 B; 3FZB A; 2CQ3 A; 2K06 A; 3H4B A; 2CQH A; 3CD7 A; 3ZTS A; 4PQU B; 3OHA A; 3RB0 A; 1SL0 A; 3X1L B; 4FVM A; 3MPU B; 2VOP A; 2B0G A; 2KTQ A; 1WC4 A; 1RWK B; 2D9O A; 2OPP A; 2D3Z A; 4YHH J; 2DPI A; 3TX8 A; 1IXK A; 3M2U A; 3UFC X; 2J7W A; 5CH7 B; 3KNG A; 3SIP B; 3CTR A; 2MKC A; 4IR1 A; 2CQ0 A; 2VHG A; 3ELH A; 4U6P A; 2FY1 A; 2DGX A; 3O5T B; 1WTB A; 3SFU A; 2BJ9 A; 4WTO B; 3HT3 A; 1H7W A; 3MMA A; 2BM0 A; 5ETP A; 3VZI A; 3MMB B; 5KFO A; 4WU2 A; 5H9E K; 2VF3 A; 1LKZ A; 1RT3 A; 4AL6 A; 2G0C A; 2E9Z A; 4ENO A; 3KLH B; 3ONQ A; 2GAH C; 1VBZ A; 1K1S A; 3GV8 B; 1AYE A; 4ED0 A; 2FJX A; 5B0E A; 2UZA A; 2G9O A; 3DDK A; 4RW7 B; 1RT7 A; 2BE2 B; 1KQF B; 2EFV A; 3ZO7 A; 5KT4 A; 2XHW A; 2P9G A; 2P9C A; 2B5J A; 3MCN A; 1SJF A; 2RKI A; 3UR0 A; 1CC8 A; 5L38 A; 4J9O A; 1LW2 B; 2ROG A; 1TAQ A; 1UKU A; 1S57 A; 1RYR A; 3BSA A; 4JI3 J; 3PFE A; 1F2H A; 1Y9O A; 3NOC A; 2YNI B; 2Y0B B; 2G4B A; 2ZBQ A; 4RLE A; 1HBM A; 2RQC A; 3M32 A; 1HNV B; 1LK7 A; 2DVI A; 2E1A A; 1MLA A; 2L9W A; 3N28 A; 4N47 A; 3DXS X; 1XMB A; 2C42 A; 4MFB A; 3R27 A; 4CRJ A; 3V4M A; 4CLT A; 3ETO A; 4ZHR B; 3R1H A; 4QWA A; 3H42 A; 2GGP A; 3BGR A; 1XNQ J; 5E3P A; 1TMJ A; 4WFZ A; 1RU2 A; 3GIL A; 4M5D A; 1UVN A; 1PYO B; 4G3I A; 1SBR A; 2CPI A; 4ZPA A; 5KFF A; 2AKW B; 4OHW A; 1KNZ A; 4A46 A; 4DL6 A; 3OFE A; 2UUA F; 1NH7 A; 2CJ9 A; 5GMD A; 1Z2Z A; 2CPF A; 2D41 A; 1IKW A; 2VDH A; 1RAB B; 3BB5 A; 1RGV A; 2RNE A; 4QYR A; 2OFG X; 3HD1 A; 2KT5 A; 4LF2 A; 4FVC A; 1TK8 A; 1FDA A; 2YNF A; 3CJ2 A; 5KOX A; 1Z2L A; 2HVE A; 4ZP7 A; 4LRE A; 2HHU A; 1QSL A; 5G0R B; 2OAU A; 4BHQ A; 4M5M A; 1GMU A; 4B3S F; 2VAS A; 4M5L A; 3THV A; 2D69 A; 1H7X A; 1N0V C; 2IA0 A; 3X3U A; 1FKP B; 1CJK A; 1HW9 A; 1NLK L; 3MR5 A; 1SUQ B; 1KLN A; 4DLG A; 4AQY J; 2RML A; 3D7S B; 3CCJ S; 1NK8 A; 4N41 A; 1N5V A; 3SZ2 A; 1E6V B; 2ASY A; 4USW A; 4UF4 A; 2C3P A; 1MMD A; 4PAB A; 3R1L A; 2BAN B; 3G6E S; 3K17 A; 1IR1 A; 3OUY A; 2BJ8 A; 1DFD A; 1VLO A; 3VWS A; 4NOH A; 1X60 A; 3KLF B; 1OS5 A; 3OJS A; 2BKP A; 3TUP A; 1KOO A; 4JYA J; 4EO8 A; 4DHV A; 2D74 B; 4XPC A; 4PG6 A; 2RDD A; 1U02 A; 4DL2 A; 2I38 A; 3HFZ B; 3MEE A; 4F0K A; 1YI2 S; 4ID5 B; 2W4P A; 3HHL A; 4IRC A; 2BQR A; 3E8O A; 4TYB A; 2J5A A; 3I9V 9; 3M6U A; 1WD6 A; 1FRI A; 3TJ8 A; 2XZW A; 2DNG A; 3PX6 A; 5IC4 B; 3IC1 A; 4I68 A; 3J7Z T; 1M5S A; 1UTA A; 3H7H B; 5C25 A; 2IVM A; 4P72 A; 3TEG A; 3IR5 B; 3UN2 A; 2X1B A; 4DUT A; 2MJN A; 4A8W A; 1A9N B; 1CJU B; 4R5P B; 2DNR A; 3TX0 A; 1KP6 A; 4H4M B; 4IDK A; 2GFF A; 4RW9 A; 4DU7 A; 4DPW A; 1I6J A; 4EZ6 A; 2XI3 A; 3QRR A; 1HHS A; 3C15 A; 1YJW S; 2HS4 A; 3R5G A; 1CUL A; 1XK8 A; 3CSK A; 4N8N A; 3BPS P; 3KNA A; 4HTJ A; 3G9C A; 2LA4 A; 2VUG A; 2ROP A; 3BV8 A; 4K8R A; 1KR4 A; 3TAR A; 3PJW A; 1DJ0 A; 2ZH6 A; 4JI4 J; 4HTI A; 4TKT A; 1FVS A; 3QRQ A; 2OPQ B; 4RW6 B; 3GWC A; 1MWZ A; 3LPY A; 1MU2 A; 5KFE A; 1GX6 A; 5FD1 A; 4O4G A; 4NRT A; 3GR1 A; 4ZA1 A; 2VIC A; 3SV3 A; 4NLY A; 3K58 A; 2DO0 A; 1SH2 A; 5DZ6 A; 1WG4 A; 3KK2 A; 5ETS A; 4IR9 A; 1TQL A; 1RAE B; 5JVG Q; 2BOA A; 4ZN1 A; 3NCP A; 1EHW A; 1N32 F; 3W9I A; 4ED1 A; 4G1I A; 3TAQ A; 4K59 A; 5AXN A; 1N52 B; 2XSJ B; 1DQ8 A; 1YZ7 A; 5IQQ A; 3M9N B; 4PZV A; 3QT7 A; 1XQI A; 2HFS A; 2X51 A; 2XYG B; 1IJF B; 1EAR A; 3LW5 C; 2F4F A; 1S6P A; 3KHG A; 1TVR A; 4LR9 A; 4ZPD A; 1NM2 A; 4F04 B; 3FBB A; 3RGI A; 1WC0 A; 4RUH A; 3VZH A; 1L5U A; 1LWE B; 1GH8 A; 4J9K A; 5DQG A; 1Q86 T; 3NMA A; 5CAA A; 4KTQ A; 4CLF A; 4K4V A; 3PAC A; 2HNY B; 3TOQ A; 1NK6 A; 4M94 A; 3JYT B; 1JLC A; 5KG4 A; 2BV3 A; 4F0M A; 2CRL A; 4IFY B; 2DIU A; 2J9D E; 3KMS A; 1R0A A; 5KT5 A; 4HI2 A; 2Q6B A; 3EZU A; 4OHV A; 4DV5 J; 2XUL A; 4DL5 A; 3CGI A; 1U1K A; 3KG0 A; 1NRK A; 4NLT A; 1C4C A; 3M6V A; 4UQT A; 5F8G A; 1BXN A; 3Q2T C; 5CXT A; 4C8L A; 1CC7 A; 4DI6 A; 2IMO A; 2C3U A; 5CAB A; 1R6Y A; 2QX0 A; 1HBN B; 3RAX A; 5IM0 B; 4HAC B; 1SQG A; 2E29 A; 1XMO F; 2BDP A; 3DRP B; 3JB9 k; 2XI2 A; 5B08 A; 1T11 A; 3V2U C; 3KLG B; 5DM6 Q; 2N3L A; 3DLL Q; 1RWN B; 2G2Z A; 2IIH A; 3PJ9 A; 4KE5 A; 1AZS A; 1QD1 A; 4J9S A; 1C1C A; 3E3X A; 1SKR A; 4OIX A; 3E01 B; 3L95 X; 2VG6 A; 2HBY B; 2KB2 A; 2C2D A; 1S9F A; 4ECV A; 1T95 A; 3I0R B; 4I6A A; 4KH1 B; 5K5M A; 4Y6I A; 4O23 A; 2OGU A; 3MM8 A; 5CD4 A; 4OZ1 A; 3TAM A; 3T1H J; 3G82 A; 3QNW B; 1LXJ A; 4Y65 A; 1FES A; 4JV1 A; 5BXI A; 2J76 E; 4FYY B; 5IV4 A; 1VMB A; 4R0J A; 1M5P C; 1K47 A; 3HUL A; 1S12 A; 1EQM A; 2E7V A; 1UVM A; 1IKV B; 2R42 A; 4KFB B; 1DZ5 A; 4ED7 A; 1Q53 A; 4DV7 J; 2FGO A; 3CF5 Q; 2PSZ A; 2XMV A; 3V81 B; 1HI0 P; 4CO3 A; 2NPF A; 1S99 A; 1YK9 A; 2ALY B; 4KHM A; 2AGQ A; 5DS7 A; 2V50 A; 3L3C A; 4B3R J; 3QO9 B; 4BWM A; 3G6Y A; 1LQ9 A; 4FNH A; 3BYR A; 3H59 A; 3IR6 B; 5JMN A; 2A2D A; 4OJH A; 7FDR A; 2Z2M A; 1RAO A; 2FHJ D; 3TVY A; 3H5Y A; 4V19 X; 2OI2 A; 3AHP A; 4DOZ A; 4QR2 A; 1A0O B; 2Y8Y A; 3FFI B; 4O44 A; 3OL9 A; 3M8Z A; 4ZIV A; 3MAQ A; 3G86 A; 3JTN A; 3MF5 A; 4NXM J; 4X64 J; 2DR6 A; 3MUT P; 2RQ4 A; 1WG5 A; 1ZOT A; 2YKO A; 3NGR A; 3ULH A; 4LF9 F; 2RF2 A; 5DGB A; 1RTI A; 3N9U C; 3RG6 A; 3RB4 A; 3PEJ A; 1WC3 A; 5T7L B; 1TZ0 A; 4IQX A; 1KEK A; 4FXD A; 5KFV A; 3UD4 P; 4DUY F; 2J9E A; 4X4Q A; 1U45 A; 4ZPT R; 4ZLN A; 1YGY A; 3HVT A; 3VVT A; 2B7C B; 4DR7 F; 3WQP A; 1RHM B; 2VQF F; 4K4U A; 3CCL S; 4HLB A; 1S6Q A; 4AT1 B; 4X4T A; 3KHH A; 1W2B R; 3PHE A; 1FJG F; 2ZDO A; 4OHZ A; 4A8S A; 4WPA A; 3GFH A; 4DJB A; 2IA6 A; 1TV6 A; 2NXU A; 4E98 A; 1SL2 A; 3N01 A; 3FRY A; 1TEL A; 3C14 B; 3B78 A; 1NND A; 3I31 A; 1WNE A; 4G1Q A; 4KGX B; 2M70 A; 2MLY A; 1FNM A; 3DRX A; 2W2M P; 2MST A; 2RU3 A; 3HSZ A; 4URQ U; 5D0E A; 4CLW A; 5L1L A; 3GTY X; 5CQG A; 6FDR A; 3EPI A; 2VB6 A; 2YWW A; 4YY3 F; 2GX8 A; 2CG4 A; 2R8K A; 2EFP A; 2HRU A; 4J9M A; 3GG1 A; 3R8Y A; 4NA2 A; 4C11 A; 4UOF A; 5LXR A; 4JI2 F; 5I42 A; 1S9G B; 3BZQ A; 4ZVH A; 5E5N A; 3HXM A; 2L48 A; 3DDN A; 1R8C A; 4KJI A; 5GAE I; 4DCO B; 4CLZ A; 2VFU A; 1YHQ S; 3H2L A; 2HRT A; 2BXJ A; 3RTV A; 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