The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
AIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPAGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A combinatorial approach for determining protease specificities: application to interleukin-1beta converting enzyme (ICE).
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
INTERLEUKIN-1BETA CONVERTING ENZYME
|
| total genus |
15
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.36: Caspase-1. |
| pdb deposition date | 1997-02-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EDQ B; 2DKO B; 2CDR B; 5IC6 B; 1RHU B; 2CNN B; 1GFW B; 2Y1L B; 2H4Y B; 2CJY B; 1BMQ B; 3P45 B; 3R7N B; 3QNW B; 2H51 B; 4ZVO B; 1IBC B; 2P2C B; 2H65 B; 3EDR B; 3D6M B; 2CJX B; 1RHR B; 1RE1 B; 3D6H B; 1NME B; 3R6G B; 1RWX B; 4DCO B; 1QDU B; 4LSZ B; 2C2Z B; 2CNK B; 2XYG B; 3D6F B; 2C2O B; 2QLF B; 4DCP B; 1RWN B; 2H54 B; 3R7S B; 2CNO B; 2QLB B; 1PAU B; 2Y0B B; 1SC1 B; 3R7B B; 5K20 B; 3KJQ B; 2QLJ B; 1RHJ B; 1SC4 B; 3IBF B; 2QL5 B; 3R5J B; 1RHK B; 5IC4 B; 3SIP B; 1PYO B; 2C1E B; 2H4W B; 3GJS B; 3GJR B; 2CNL B; 3KJF B; 2HBY B; 1RWK B; 1I51 B; 4ZVU B; 2FQQ B; 4JB8 B; 1RHM B; 1SC3 B; 1I3O B; 1F9E B; 2QL7 B; 3GJT B; 2XZT B; 3IBC B; 2H48 B; 1ICE B; 3P4U B; 2H5J B; 4ZVR B; 1RWW B; 1RWM B; 2XYP B; 1QTN B; 2C2M B; 3KJN B; 4ZVS B; 2HBR B; 4DCJ B; 2HBZ B; 2HBQ B; 2XYH B; 3RJM B; 2XZD B; 4ZVP B; 2QL9 B; 3GJQ B; 2H5I B; 2C2K B; 3R6L B; 1RWP B; 1RWO B; 1RHQ B; 1RWV B; 3NS7 B; 4ZVQ B; 4ZVT B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1N5Y B; 4NLP A; 1CJU B; 3BSO A; 1LWX A; 4ECS A; 2VG6 B; 2CPD A; 4PWW A; 1RT6 A; 1HBN B; 3CNQ P; 1VBX A; 3NOC A; 1KFD A; 4O4G A; 2AEM A; 5A76 A; 1T9V A; 5L1K A; 4BLG A; 4C11 A; 1VQ7 S; 3M1V B; 4P74 A; 3DOL B; 3FQK A; 3C15 A; 3FRY A; 4DX5 A; 4BDP A; 1UTA A; 2M0G B; 2AP6 A; 1YRU A; 3B4M A; 3LWL A; 2PFF B; 1WKK A; 3EMT A; 2VPX B; 5GMK a; 2CYY A; 4F25 A; 3WIV A; 2PII A; 2E5H A; 5D3G A; 1NZ8 A; 2WOM A; 1WOO A; 4WE1 B; 4KGX B; 3GJQ B; 2GAH C; 3EM1 A; 2FLP A; 4OZ5 A; 4NLV A; 2QC3 A; 2DCU B; 3KLF A; 4LRB A; 5IS2 A; 2GHP A; 2Z30 B; 3H40 A; 2RKI A; 1CS4 A; 3Q2S C; 4LF6 F; 3RUB L; 3QNW B; 5I3P A; 3W8G A; 1URR A; 4U96 A; 2BE9 B; 3S6E A; 4ELU A; 2HHX A; 1X4F A; 3W66 A; 2BVZ A; 3DGP B; 2MKI A; 2AYE A; 3SQO P; 3JQJ A; 3VCD A; 2ILY A; 1WG5 A; 1U2F A; 1N6Q A; 2A3J A; 2KH9 A; 1RTI B; 1PYT A; 2UXD F; 3TX0 A; 1RBO B; 1HD1 A; 1NSK L; 2XTJ P; 3FFI A; 1FXR A; 3R5J B; 4WYL A; 1S9G B; 3KNA A; 3BGO P; 1M5K C; 4X4O A; 4DX8 H; 3Q89 A; 1UA1 A; 4LF1 A; 2ZIT A; 4FS2 A; 2QL7 B; 3R3T A; 3PHT A; 1WC5 A; 3FVY A; 4RW9 B; 2UU9 J; 3JSM B; 2EEY A; 4DJB A; 1IWG A; 4A8W A; 3IR5 B; 1EP4 B; 4ANC A; 3TI0 A; 2PC6 A; 1V3R A; 5F0W A; 4YHH F; 1SI9 A; 5KG7 A; 3LAK A; 3V4I B; 3CMQ A; 2C3M A; 3OL7 A; 2HGM A; 4K4T A; 1KDN A; 4IG3 B; 4XPE A; 5CA5 A; 5KFP A; 2YWK A; 3IN5 A; 2OTJ S; 4N41 A; 3NCP A; 4B3S F; 3GYN A; 2BV3 A; 1Q0N A; 1FE4 A; 2QLF B; 2CPX A; 5J2P B; 2AQ4 A; 3K59 A; 4K50 A; 3TQ1 A; 2QLJ B; 2HGL A; 1S76 D; 2E1M C; 3F0N A; 2PMZ D; 1FFG B; 1NO8 A; 1D9A A; 1OY9 A; 1Q82 T; 4K59 A; 2YKA A; 5JXS A; 2XY7 A; 3QPI A; 2P9C A; 4WXO A; 4RUC A; 1YX2 A; 3MUR P; 5A0Y A; 4LF4 J; 2C2M B; 3SDE B; 3I32 A; 2OO4 A; 4EUV A; 2HLT A; 1S5Z A; 4J9Q A; 2RD5 C; 2FJW A; 3ILJ A; 2P8I A; 2ATL A; 4G1Q B; 3OTO J; 1S6O A; 2HHP A; 2DKO B; 2YTC A; 5JVG Q; 2GW8 A; 1IM4 A; 3WC2 A; 2R7V A; 2XNQ A; 3FEX B; 2VD3 A; 3VAF A; 2OPP A; 1RA7 A; 3MMC A; 1SBR A; 2MKC A; 3FNN A; 1LW0 B; 2HHV A; 1PJ6 A; 3AH6 A; 2YH1 A; 1VC0 A; 2ATC B; 1WTB A; 2BKP A; 2BKN A; 2KZM A; 3D7S B; 3DOM B; 4OX9 J; 2W01 A; 2VIC A; 2OSQ A; 3T6B A; 3FCH A; 1L3K A; 4AFF A; 1WUU A; 4RU2 A; 1ZA1 B; 3SQG A; 3DHX A; 1FXD A; 4AQY J; 1GXU A; 5DLG A; 1HPZ B; 2OD4 A; 5D4L A; 1KP6 A; 4J37 A; 2A0F B; 2XCP A; 3MED A; 3OSP A; 3NY0 A; 3CE8 A; 4IR9 A; 4ZVR B; 2J6T A; 3GR1 A; 2XMW A; 4ITS A; 3PR5 B; 1QSS A; 5SZT A; 2DNO A; 4ECW A; 2IA6 A; 3NGD A; 3OR1 B; 1X4E A; 2XWY A; 2GVZ A; 1RT4 B; 4B9L A; 2C22 A; 2VKR A; 1O6X A; 2LU1 A; 3W3S A; 2WTF A; 1Y5N B; 4ECU A; 2F4F A; 1GMU A; 2DPJ A; 5GAH I; 2BRL A; 4LIW A; 3KLI B; 2CPE A; 2QFJ A; 3MM7 B; 2VON A; 1Y4Z B; 3CSK A; 3QT6 A; 4TN2 A; 4Y6I A; 3PV8 A; 1X9M A; 2P9E A; 2MQ8 A; 3JQK A; 4DQI A; 1LWC B; 3FDS A; 5E2Q A; 3BM7 A; 3D9B A; 3ITH B; 3GE9 A; 2O3D A; 4KY3 A; 3HZE A; 1S97 A; 2FVC A; 3E2E A; 3F44 A; 4OI1 A; 1RWU A; 1S6Q A; 2HEK A; 3VAH A; 3EXY A; 3RZA A; 4FVC A; 4PQU B; 2YNF A; 1VRU B; 4P7V A; 2BJE A; 2FJV A; 1VGY A; 2AV5 A; 2JFD A; 1TAU A; 4UQG A; 1LFP A; 3C2P A; 5C2G A; 2J0X A; 1N5T A; 1HNV B; 3R97 A; 2KU7 A; 1RTZ A; 2W7O A; 3ZTO A; 4ES1 A; 3HHN B; 3PYF A; 2G0J A; 2V9W A; 2OGU A; 5HAT A; 3R7N B; 1QTM A; 1HWK A; 2Z2Z A; 5HJY A; 4HHH A; 1RAD B; 3FBC A; 2HIQ A; 2MEW A; 1E6V A; 3QFH A; 4G65 A; 1D9F A; 4YB7 A; 5HL7 Q; 4ZCK A; 4RW8 B; 3CPW R; 1JKH B; 3BR8 A; 1VQN S; 1NKE A; 3IS9 A; 5IOL A; 1HBM A; 3QSY B; 4CO0 A; 1M5P C; 3SSQ A; 5C7P A; 1VJQ A; 4H4M B; 3D3C J; 1S9E A; 1M90 T; 3OFF A; 3GIR A; 4QQB A; 2AJ2 A; 2NPF A; 3NRB A; 2E5L J; 3OTE A; 3W63 A; 3DGV A; 2ZH1 A; 3NNH A; 1D3W A; 1JJC B; 4CH1 A; 2YNI A; 4U8V A; 1HNZ J; 5IT4 A; 2FB0 A; 3MAQ A; 1L3S A; 2XQC A; 1N0U A; 2FY8 A; 1NSP A; 1C0U A; 3HI9 A; 7FD1 A; 2FVS A; 4ILL A; 2XMT A; 4ECZ A; 4RWX A; 2GJI A; 4BS2 A; 2P2C B; 4I2Q A; 1NDL A; 1BUX A; 1VRT B; 2WZ1 A; 3KG1 A; 4TQR A; 2F63 A; 2YKO A; 4K4S A; 2XSJ A; 5CQG A; 4C8N A; 5J2Q A; 1O5J A; 2CNO B; 1MWY A; 2OPS A; 2MZR A; 1IVZ A; 3IFE A; 2FPH X; 5ETL A; 4X4N A; 1X60 A; 4L3N A; 5M2P A; 4FF3 A; 3V6H A; 4DR1 J; 4MYU A; 2AT1 B; 1XTZ A; 2I5J A; 2WVB A; 3FEY B; 1S79 A; 2KVI A; 4ZJO A; 4GRS A; 4B3R J; 3CDU A; 1JLE B; 3FGV A; 3V6J A; 3FMB A; 1ZM2 A; 5K14 A; 4ZPV R; 5HLF B; 3TUI C; 3SV3 A; 3HHL D; 1SH3 A; 1UP1 A; 2J0Q D; 1TKT B; 2BJD A; 2G2Z A; 1KOO A; 2GHW A; 2V94 A; 2MZJ A; 2R9L A; 4QWD A; 2HFS A; 4F36 A; 4TYA A; 2HNY B; 1S49 A; 2FHM A; 2E1P A; 1TK0 A; 4IOC Q; 1FER A; 4B3M F; 1RT7 A; 2NCK L; 3N79 A; 4PZV A; 5IM0 A; 1XQI A; 1N5Q A; 1AA1 B; 3LTO A; 1S1W A; 2CPH A; 4QU6 A; 5HP1 B; 5KFN A; 2XYG B; 3A8K A; 4M95 A; 4PWD B; 4QIW D; 1EB0 A; 1GMW D; 2Y0B B; 3W1Y C; 3MM8 B; 5IZH A; 4AXJ A; 2IY5 B; 2GCF A; 3TAP A; 2Q43 A; 1RAH B; 5KFQ A; 3OR2 B; 1YLX A; 5C24 B; 3VAI A; 4QCL A; 2I0X A; 1ULR A; 1X9W A; 1FXL A; 3NKY A; 1TFY A; 4U7U K; 1U48 A; 2VU5 A; 2RUG A; 2DTJ A; 1HBU A; 3G8Q A; 4NI2 B; 3FEZ A; 1CVJ A; 4GKJ J; 3TVK A; 3A12 A; 5FII A; 3C15 B; 4Q7A A; 4I7F A; 3OSN A; 3OQ2 A; 4QR1 A; 1RCX B; 2F8H A; 2AJQ A; 3W9H A; 3HX9 A; 4UF4 A; 2IRU A; 4KKO A; 3DM2 B; 1U24 A; 1QLN A; 3AXM A; 4LJM A; 5F3Z A; 4P2F A; 3KK2 A; 3MUM P; 2HVZ A; 3T1H F; 4IUF A; 1DTT A; 5KG0 A; 5FLX U; 3WC0 A; 1TKD A; 4YY3 F; 3EYZ A; 1RT2 A; 4MIB A; 5C42 B; 5EWE A; 3DU5 A; 1R8C A; 1LWE A; 1RU1 A; 1KN6 A; 3KNG A; 3VTI A; 2Z0G A; 4O3S A; 3POT B; 2QYG A; 4DV1 F; 4URS A; 2RKI B; 2YWH A; 4W4M A; 3QJJ A; 1F9H A; 4LF5 J; 4LF2 A; 4JI2 J; 2GQC A; 3HPO A; 2UVU A; 1UWB A; 3I87 A; 4ATN A; 1IN0 A; 2B4U A; 1PCA A; 2NSB A; 1FX4 A; 2QO3 A; 2MQN A; 1DY3 A; 3CO0 P; 2DRD A; 2HBQ B; 4CRJ A; 3ONQ A; 3EZO A; 3BBB A; 4X4R A; 3M8P B; 2M9K A; 3QT7 A; 3J7A 1; 3M32 A; 1HQU A; 3I5B A; 3M4X A; 2CPF A; 2NUH A; 4JI3 F; 2CIM A; 3E8O A; 3MMA A; 2W4C A; 4ECR A; 2GIF A; 4X62 J; 1XNQ F; 1V6H A; 4WXW A; 2GV1 A; 2DO4 A; 2G2O A; 2J9E A; 4P6Q A; 4NZ0 A; 3FBF A; 1H72 C; 2E7X A; 2EBE A; 4ERD A; 4OX7 A; 3SZ2 A; 5LXY A; 1VCT A; 6AT1 B; 1S6P B; 5KT6 A; 3PXG a; 3KLV A; 1JWW A; 2R7U A; 1SIW B; 1FF2 A; 3AOB A; 4OZN A; 4MT1 A; 1Q53 A; 2CQ4 A; 3K5N A; 2HGN A; 4DUT A; 2GC8 A; 5I42 B; 3M30 B; 4OYX A; 4DF8 A; 3G6E S; 1BLU A; 4MK9 A; 4IFY B; 1SKU B; 1RWK B; 1O0P A; 3ZZO A; 3TAN A; 2XB2 D; 2XZT B; 3CCT A; 3IBC B; 4DSK A; 3I56 S; 1TL3 B; 1KOH A; 4ZP7 A; 2AX1 A; 1BQX A; 3OTB A; 4U95 A; 5DG7 A; 4YS2 A; 2FVQ A; 4C0B A; 1RWO B; 2AKW B; 4C98 A; 1JMT A; 1KQG B; 4ANE A; 4EBD A; 1UFK A; 2Y0S D; 4JI0 J; 4Y65 A; 2C2E A; 3DMJ A; 1GK8 A; 1P27 B; 5JUM A; 2DY9 A; 1VBY A; 1S1V B; 1Q79 A; 1TKZ A; 2NYI A; 3EIC A; 1HR0 J; 2AJ4 A; 3PO4 A; 2LXF A; 2VBX A; 3BGL A; 1VQP S; 2OHD A; 4JV5 F; 5KFR A; 1YJ7 A; 4CO4 A; 2CJB A; 1TL7 A; 5B7W A; 2IPO B; 1WSR A; 1EX8 A; 3Q0A A; 1EIY B; 2DHH A; 1XMB A; 4DS4 A; 1XJW B; 3S01 A; 3GJS B; 2KXF A; 1UZH A; 2KJW A; 1T05 A; 3QJL A; 2CQ3 A; 3QQC D; 4Y00 A; 1FTC A; 2XO6 A; 4G6V B; 3IBW A; 3RU0 A; 1FNO A; 3RW7 A; 1S0O A; 5GAD I; 1T95 A; 3D66 A; 3CXC R; 3R9L A; 1REV B; 2H5E A; 3TZX A; 2C2R A; 1Q8B A; 4KYZ A; 3KUG A; 2WSC C; 1FRX A; 2G9O A; 3VAG A; 4X4S A; 4OIX A; 2DNL A; 1M1G A; 2ZUG A; 4HI1 A; 2KYX A; 2XEX A; 3K2Y A; 2WVD A; 4OZJ A; 4LSZ B; 4YHH J; 3GCW P; 4A8M P; 2ALZ A; 4QW9 A; 1HKA A; 5KFY A; 2IVY A; 2OD6 A; 2I1R A; 2CJQ A; 1LK5 A; 2V34 A; 4NLG A; 3BH7 B; 4Q0B A; 2MKH A; 2WHO A; 3BBF A; 1HD0 A; 1TAQ A; 2M8H A; 1LFW A; 1C1B B; 4CLK A; 2YBV A; 2M88 A; 2Y8W A; 1HL6 A; 1ZS6 A; 3PIO Q; 4F02 A; 4GMK A; 2KG1 A; 1VRQ C; 3F73 A; 2UP1 A; 1YBU A; 4EGL A; 1RP5 A; 3QT8 A; 2PEH A; 2AU0 A; 2DGQ A; 3V2U C; 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2UXB F; 2DH9 A; 2AX0 A; 1U0H A; 3CCJ S; 3DRS A; 2RUS A; 4NXN F; 1TMJ A; 2BW2 A; 1F2G A; 5CHC B; 4LQ3 A; 1S48 A; 3JQM A; 2YKQ A; 1W2B R; 1U8S A; 3D5M A; 2D3Z A; 3KMS A; 3VGS A; 3HO1 A; 4DMZ A; 4MKA A; 4ED0 A; 4TQS A; 2YKP A; 2VUG A; 2V4J B; 4ECX A; 2OIH A; 2HKE A; 4LR8 A; 1RAG B; 2HQC A; 1RB0 A; 2ZH2 A; 3JTP A; 4DPW A; 4RKU C; 2F65 A; 3GV7 B; 2XGP A; 3EGN A; 4J9K A; 5AE2 A; 4DV0 J; 2K2P A; 2JX2 A; 2W2N P; 3SYZ A; 4PR6 A; 2QMW A; 1LW2 B; 2FJB B; 5A8W A; 1B4S A; 1QVF R; 1YHQ S; 4DR5 J; 5IC6 B; 4PG5 A; 4UOG A; 3HZG A; 1UEU A; 4KV8 B; 1LWF B; 1BQM A; 1QJH A; 1RGV A; 4M94 A; 3GLJ A; 5KAK A; 3BYP A; 4F0M A; 1DAX A; 1HHT P; 4LF8 F; 4JI8 J; 2PMW A; 4YUD A; 2RDJ A; 2AJF E; 2ZEJ A; 4PAA A; 4DQP A; 1X4C A; 2XBP A; 2JRS A; 4JYA F; 3PX4 A; 1YZ6 A; 3EGW B; 4KO0 B; 5CD4 A; 3MCM A; 3QAU A; 1UPP A; 4DUY F; 1UWA A; 3K0J A; 2WON A; 4QU7 A; 4KGZ B; 1HMV A; 3LP2 B; 3M2U A; 3AQO A; 2ZD1 A; 1MWQ A; 3Q8S B; 1UFL A; 3MM9 A; 5IM0 B; 2V0N A; 4JI1 J; 3CJ0 A; 1QAJ A; 4E2F B; 1N36 F; 2KHC A; 3I0S A; 3NAI A; 3UCZ P; 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