The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
AIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPAGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A combinatorial approach for determining protease specificities: application to interleukin-1beta converting enzyme (ICE).
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
INTERLEUKIN-1BETA CONVERTING ENZYME
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.36: Caspase-1. |
| pdb deposition date | 1997-02-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1I3O B; 3GJQ B; 2H54 B; 1RWV B; 5IC6 B; 1GFW B; 3KJF B; 3R6L B; 3R6G B; 2HBQ B; 3GJT B; 4LSZ B; 4DCO B; 2CDR B; 4DCJ B; 2H5J B; 2H51 B; 3R7N B; 4DCP B; 1RHQ B; 2CNN B; 4ZVR B; 4ZVQ B; 3EDQ B; 3D6H B; 2FQQ B; 1QDU B; 1IBC B; 2CNO B; 3QNW B; 1PAU B; 2H5I B; 1ICE B; 2XZT B; 2H4W B; 3IBC B; 2HBR B; 3R7B B; 1RHU B; 2Y0B B; 2CNL B; 2H65 B; 1RWO B; 1RHJ B; 1RHR B; 2P2C B; 4ZVT B; 3P4U B; 2H4Y B; 3NS7 B; 3GJR B; 1RWX B; 2Y1L B; 4ZVO B; 2CJY B; 3KJQ B; 3KJN B; 2C2M B; 2HBZ B; 4ZVU B; 3EDR B; 3D6F B; 2XZD B; 2XYG B; 3R5J B; 1SC4 B; 3IBF B; 2QLF B; 3D6M B; 1RHM B; 3P45 B; 4ZVS B; 1RWN B; 1PYO B; 2QL5 B; 2C2K B; 4ZVP B; 5IC4 B; 1RWW B; 2C1E B; 2QLB B; 3SIP B; 1BMQ B; 1SC3 B; 2QLJ B; 2H48 B; 2XYH B; 1RHK B; 2HBY B; 2C2O B; 1I51 B; 1RWM B; 3RJM B; 1F9E B; 2QL7 B; 2CNK B; 1RWK B; 5K20 B; 1NME B; 1QTN B; 2DKO B; 2CJX B; 1SC1 B; 3GJS B; 1RE1 B; 2XYP B; 2C2Z B; 1RWP B; 3R7S B; 4JB8 B; 2QL9 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 5J1E A; 3DFE A; 2F5G A; 2FJA B; 3CXC R; 2NSC A; 3GJT B; 2HHQ A; 3KJV B; 3SYZ A; 1O8B A; 2Z8Q A; 2ZZT A; 3OFF A; 2J8S A; 3OT9 A; 3NS5 A; 4OZ0 A; 4ZIW A; 2M8D B; 4O4G A; 1OQ6 A; 2ACM A; 4PAA A; 4F0H A; 3PR5 B; 4M5D B; 3IS9 B; 5KFL A; 3BEG B; 1CUL B; 3PO4 A; 2VQE J; 1KFS A; 2IM2 A; 1CC7 A; 1RAF B; 2MLZ A; 3D0H E; 2JL9 A; 2M9K A; 1LFW A; 1HBO B; 2YKP A; 2OSQ A; 3KUG A; 4PKD B; 1YIJ S; 3LP2 B; 4OMF G; 1DQ8 A; 2W4D A; 5D77 A; 4N5S A; 3NWG A; 4DMZ A; 3PIO Q; 1VBZ A; 2VC0 A; 2D3U A; 1H72 C; 2ZHA A; 4KH0 B; 1M5P C; 4U7U K; 2QMU B; 4PQU A; 4HHH A; 4ELV A; 1GMW A; 2ZM6 F; 4HI2 A; 1URR A; 2F65 A; 3OR1 B; 1TUG B; 2EBG A; 3HI9 A; 4HH0 A; 2WB1 D; 2J6T A; 1OSC A; 2ZUA A; 4NLU A; 3DOM A; 4O0N A; 2LYV A; 1SXL A; 2MKH A; 4QWA A; 2LXI A; 4BWJ A; 4DCP B; 1MU2 A; 1VQN S; 1RGV A; 5A8R B; 4I56 A; 2LXF A; 4LIR A; 2Y1L B; 3TEG A; 3GFZ A; 3MPV A; 4J7C A; 3OJU A; 5K14 A; 2IJN A; 3MTK A; 2EXU A; 1WG4 A; 1SC4 B; 2MQP A; 2ZKU A; 4X4T A; 3DLK B; 5F0U A; 4FS2 A; 3PY8 A; 4RUB A; 4O4R A; 1S1T B; 4M5N A; 1HL6 A; 2AGQ A; 3UCU P; 1NDK A; 3N9U C; 5HK4 A; 3MXH P; 1RQ0 A; 3CO9 A; 5KG0 A; 1WOO A; 2HKE A; 3GR0 A; 2ZE2 B; 4C8Y A; 2OMO A; 2PA3 A; 3SCK E; 3FBE A; 3UN5 A; 2AYB A; 4LF4 J; 4DSK A; 1SKU B; 1SC1 B; 2WBM A; 2K06 A; 4DR1 F; 1BQN A; 5MLC V; 2PGC A; 4ZK7 M; 3NCR A; 3CCT A; 2YQ3 A; 3DM2 B; 2DIS A; 3PW0 A; 1RTD A; 3M2U B; 3I4P A; 4JI7 J; 1O5J A; 4F2R A; 2HG4 A; 3T5H A; 1N6Q B; 3HJF A; 1IN0 A; 3KJN B; 2MJU A; 3H5X A; 1W7W A; 1VC6 A; 2AW0 A; 5GMK a; 3KK2 B; 3SBM A; 1SJ4 P; 2MZQ A; 1S1V A; 2R7W A; 2BJ3 A; 3IA0 A; 3OXL A; 4CLL A; 3OBI A; 4ED1 A; 3KDO A; 4CIO A; 1H74 A; 4C9D A; 4OX6 A; 3T3F A; 2HHT A; 1L3V A; 2DPJ A; 4P2S A; 4DX8 H; 2QA1 A; 4RUA A; 2K7J A; 4CTA B; 3QRR A; 3GTY X; 3GLJ A; 2DJW A; 2HRT A; 2DHA A; 4RBU A; 3J81 j; 3LP1 A; 5SZT A; 3IWN C; 3R1L A; 1UWB A; 4FYX B; 1HD1 A; 3E3X A; 1L3U A; 2Z57 B; 1R31 A; 3M2V B; 2JVR A; 4ELT A; 1HYS B; 2JH3 A; 3AQO A; 4DR5 J; 1BHN A; 4DFK A; 2IAJ A; 4C11 A; 1X4G A; 5T7L B; 2GO8 A; 4UUX A; 1ZAW A; 3Q89 A; 5A8K A; 1H98 A; 5B0E A; 3N01 A; 1J27 A; 4DV2 J; 1JXV A; 3F0N A; 3OTD A; 4N56 A; 1FRK A; 1NDL A; 3DDK A; 1S6P A; 1TKX A; 4Z2X A; 1M1K T; 4LFB J; 1DUR A; 2ADB A; 2CPH A; 2OI2 A; 3C15 A; 1RDR A; 3IBF B; 3T41 A; 1W26 A; 5C24 B; 4ICL B; 4BDP A; 4X66 F; 5F3Z A; 2Q1L A; 3X1L B; 3LW5 C; 2J0S D; 2EFV A; 4OYP A; 4OHV A; 2P9C A; 4E2F B; 4C2M A; 1H2T Z; 2XLI A; 2D69 A; 4M5D A; 3O2I A; 2LA4 A; 4DX5 A; 1CUL A; 1NSP A; 4GO7 X; 1S77 D; 1TFW A; 2E5G A; 3LP0 B; 2UZA A; 1C4C A; 4KGK A; 2H5E A; 3KJF B; 4CLW A; 3CCW A; 1G1X A; 4RW7 A; 5CCM A; 4DUY F; 2AEM A; 3PIP Q; 5LM7 E; 4NEY A; 3QRQ A; 3CD6 S; 4WFN Q; 1BQM A; 2PC6 A; 3IRW P; 3MM5 B; 4FXV A; 1HMV A; 2B7B B; 2ZH8 A; 1JMT A; 4UTG A; 4UT4 A; 1YJ7 A; 3FMW A; 2DR5 A; 3CJ8 A; 4K50 A; 3KG0 A; 4H54 A; 2CPI A; 3IRX B; 3THT A; 2LFV A; 2AJ1 A; 3NBP B; 4NLY A; 1ZYQ A; 3NGS A; 2D3Z A; 1CJV B; 2B3T B; 4ZP9 A; 2B0G A; 2ZJP Q; 1U6F A; 2XSF A; 2GML A; 1U0S A; 2UUC F; 3HCX A; 3MM9 B; 2CVE A; 1RWW B; 3KUH A; 2QLB B; 2F3J A; 5LSL A; 2I8E A; 4Y0F A; 4JYA J; 4IUF A; 1PBA A; 5E41 A; 5A6P A; 1S0O A; 1RA7 A; 4H4K C; 1D9D A; 4N41 A; 4WWS A; 4RNM A; 3B8H A; 1RWM B; 1RWK B; 3QO9 A; 3A3N B; 4TU9 A; 4EBD A; 2YWK A; 5F9L A; 1Y11 A; 1RE1 B; 2JFD A; 1RWP B; 2KFY A; 4OZ3 A; 1DLO B; 3BBC A; 1I3O B; 5AXN A; 3T1Y F; 1UFW A; 2ASJ A; 3CUN A; 1EX8 A; 3JXO A; 3CME S; 3OFE A; 2J6U A; 2JZ5 A; 2CNO B; 1JLG B; 2X3G A; 3A8E A; 3DLK A; 5KG6 A; 3HSJ A; 3IBC B; 2HAI A; 2C22 A; 2MZJ A; 1Q53 A; 5A8W A; 3MEK A; 1T05 A; 2OUG A; 2ZE2 A; 2HVI A; 2BX6 A; 3S1T A; 1IXK A; 5T41 A; 4PWW A; 3WC2 A; 3HP6 A; 2V4Q A; 1FRX A; 3TYT A; 4F3M A; 3LPE A; 3IM8 A; 3CC7 S; 2C3Y A; 3CJ4 A; 4FF3 A; 1L3S A; 4EEY A; 1NEE A; 3V5R A; 4UZC A; 4YS2 A; 3NL0 A; 1CPZ A; 2QLJ B; 3K5L A; 3N0V A; 3PFE A; 3AA9 A; 4DPO A; 2A6M A; 4V1A k; 3HHK A; 2CPJ A; 2QT7 A; 5C42 B; 1KLN A; 2YWE A; 1N6Q A; 2LDI A; 4IH7 A; 2P9G A; 2BZ2 A; 1TUW A; 3UNG C; 5IXU A; 4NXM J; 5ETP A; 4JI4 J; 4YHH J; 1K1Q A; 4L75 A; 1RHQ B; 1X60 A; 1IWA A; 3BR8 A; 2C2R A; 2HBR B; 1LFP A; 1TKD A; 2FJB B; 1T02 A; 1KWM A; 4I7F B; 1MRO A; 1XBW A; 1V3R A; 2B8P A; 4LF8 J; 3TA2 A; 3CDB A; 4OQJ A; 1N32 J; 1GTE A; 1NJI T; 8AT1 B; 4YB1 P; 1RAO A; 4I6Y A; 5KFF A; 1I6J A; 1M5K C; 2R4F A; 2RS2 A; 1RU1 A; 3O6Q A; 4QIG A; 3FKB A; 1WTB A; 4GKK J; 3M2V A; 4JUZ A; 1HYS A; 2LQ5 A; 3CCE S; 2A10 A; 2DXF A; 4DXL A; 1VHI A; 2JC0 A; 3I0R B; 2OO4 A; 1XC9 A; 5T7L A; 4NCA A; 4B08 A; 2Z4P A; 1X9W A; 1VQO S; 3KHR A; 1EIY B; 4C97 A; 1QTM A; 2B9E A; 4NLO A; 2EC0 A; 3SSR A; 1T94 A; 1FRH A; 3ENQ A; 2UXD F; 5JMN A; 1XNR F; 1VQY A; 2K8G A; 3HVA A; 2NZ4 A; 1LW2 A; 2V8G A; 5KFJ A; 3FK4 A; 3MR2 A; 1KQS R; 2KVQ E; 3EGN A; 3M9O B; 2EFQ A; 3WC0 A; 3RW6 A; 4OJ1 A; 4O0I A; 3G4S S; 2MST A; 4DPW A; 3V6K A; 3OSP A; 4CLS A; 4UOG A; 2F4V J; 1LNQ A; 4IOC Q; 1EB0 A; 2AZ1 A; 2DNO A; 2IM3 A; 2IDE A; 2QFJ A; 4TU8 A; 2JEG A; 2KJV A; 3SXL A; 1XNQ J; 4GC7 A; 3MHY A; 2HPU A; 1XMB A; 2RD5 C; 2GHV C; 1S1U B; 4LF6 J; 2DBB A; 1RAC B; 5HBM B; 3RUB L; 1U24 A; 3V4M A; 1REG X; 1U49 A; 1N0V C; 2MYF A; 4M94 A; 3PV8 A; 5M2P A; 4CH1 A; 3OSN A; 2G4B A; 2XYH B; 5D0R A; 1WTF A; 4NYZ A; 2MLY A; 2DGQ A; 4DG1 B; 2BJ8 A; 3MM5 A; 1Q86 T; 1UP1 A; 4OLO A; 2DEJ A; 4AL6 A; 1PO6 A; 3MAH A; 1VBX A; 2R8G A; 4F3O A; 3DLH A; 1RAJ A; 1RLC L; 3NBP A; 4WZM A; 1VDH A; 1TU0 B; 4N8N A; 1CJV A; 3GMG A; 2DNQ A; 2OP5 A; 3DDN A; 3Q8P B; 3WIV A; 1RT2 A; 2RJZ A; 1KLM B; 1TAU A; 1NO8 A; 3M6V A; 3QYY A; 5LXR A; 3GIR A; 3OXF A; 3MPW A; 3FMB A; 1K1S A; 1IJF B; 3PYF A; 5DLG A; 2MDA A; 5LL6 d; 3OL6 A; 4J9L A; 1JLB B; 1IBL J; 3JS9 A; 2CIM A; 3H20 A; 5J2Q A; 4J9R A; 1ZPW X; 1L5U A; 1Y7P A; 3BO2 A; 3J80 U; 4DPU A; 2ZZN A; 2ZH3 A; 2PI4 A; 1TV6 B; 3VVU A; 3NY0 A; 1GXU A; 3G82 B; 1RBO B; 3MCS A; 3RBD A; 5DZ7 A; 1JLG A; 2ILZ A; 4QWC A; 2BQ3 A; 2DD8 S; 4DSI A; 4IRC A; 5LOQ A; 4RW6 B; 1FNX H; 2E7V A; 3NGU A; 1KOH A; 1WHV A; 1JLF B; 3UNY A; 3GPA A; 2V0N A; 2NLW A; 3F56 A; 2W7P A; 2HSE B; 3PRV A; 2BOA A; 2AJF E; 1RT5 B; 4KO0 B; 4IH5 A; 4C0O C; 5KAK A; 2IRY A; 4LSL B; 2CQ0 A; 1HNZ F; 1D8Z A; 2WVB A; 8RUC A; 3D1O A; 4I6A A; 1CJK B; 4NE9 C; 4URS A; 2XO6 A; 5KFG A; 4DL6 A; 2AKW B; 3FSX A; 2YNH B; 5EN1 A; 3HKW A; 1KVJ A; 1F9F A; 2GW8 A; 5DJB A; 1S1X B; 1UTA A; 2EFG A; 2ZWP A; 4A47 A; 2RQ4 A; 1HI1 A; 5DRK A; 4EK2 A; 1BMQ B; 3V6H A; 4DV5 F; 4RW8 B; 2RDJ A; 4LF5 F; 3MEE B; 4QWD A; 4PEO A; 5KT4 A; 1DY3 A; 1DZ5 A; 2Q43 A; 3RBX A; 2KYZ A; 1UCN A; 2M7S A; 3V4I A; 2UUA F; 2XYP B; 3CIM A; 4OYA A; 1HNV B; 3UR3 C; 1FCA A; 2FPH X; 4F36 A; 1FNM A; 2H54 B; 3HSG A; 1FDB A; 1YJW S; 3TEH B; 4OX9 J; 2CQ4 A; 3DC2 A; 3S8S A; 2JLF A; 5D78 A; 1R6V A; 3QT6 A; 5E3C A; 1CLF A; 3CCM S; 4OFZ A; 2JLG A; 1NPR A; 2DNP A; 4BBY A; 4LQ3 A; 3IAS 9; 3KFW X; 1HA1 A; 2UVV A; 5KFV A; 2D9P A; 2ZD1 B; 1YQH A; 1S7H A; 2BM1 A; 5J2N A; 3BSA A; 2N4D A; 2W9A A; 4CO3 A; 5H9F K; 3C8Y A; 4ILR A; 4A8Q A; 2M52 A; 1IKY A; 3MM6 A; 3DU5 A; 3AY0 A; 3MD1 A; 4F67 A; 2W8K A; 1FHT A; 3HHE A; 1KDN A; 2PI5 A; 1MMD A; 1UWA A; 2E5L J; 1HKA A; 1LV5 A; 2OH2 A; 1ZA2 B; 2KHC A; 1FK9 A; 3NCQ A; 4CZC A; 3LAL A; 2LQB A; 5HN0 A; 5KFK A; 4GO5 X; 2OEM A; 2NPF A; 2ILY A; 1C0T B; 1RKJ A; 2RDD A; 5AJ3 F; 4NMX A; 4FP9 A; 2D41 A; 3N6N A; 2X1G A; 2DIV A; 4QPT A; 1U47 A; 4LJM A; 2VDI A; 3J81 U; 4UY8 5; 3C16 B; 2Z0G A; 5HBM A; 3J81 Y; 4O44 A; 2ALZ A; 3KKF A; 5KG2 A; 2CPF A; 2H4W B; 4B3M J; 4LF1 A; 1RHU B; 2Y0B B; 3OD2 A; 2HZA A; 2XSJ B; 3AOD A; 3C19 A; 2R8K A; 1SH3 A; 1U1P A; 3AFG A; 2J0Q D; 2MQN A; 4DJB A; 2YH1 A; 2V2Z A; 3K8W A; 4EBC A; 2EVZ A; 2DGW A; 2LMI A; 1NK8 A; 2VG6 B; 2V8D A; 4XO0 A; 3TAM B; 2R9L A; 3FUY A; 1NB2 A; 9RUB A; 1LWX A; 2C1E B; 3I6P A; 2MEW A; 5GME A; 1LOU A; 3FCH A; 4YEA A; 1U8W A; 2SXL A; 1U0H B; 5KFT A; 2UXB F; 4PG5 A; 5AE3 A; 3AB2 B; 2ASY A; 2FHO B; 4YB7 A; 3FCV A; 3BPD A; 1GAO A; 2EK1 A; 1HNI A; 3D5M A; 3UVJ A; 4CLP A; 5D4N A; 2CPY A; 3DRS B; 1JLB A; 1WAC A; 3TQE A; 1OPI A; 3VAM A; 2ZUG A; 2I38 A; 1NAQ A; 2QTW A; 4MIB A; 2DK2 A; 3HZE A; 2DRD A; 2BKO A; 1WI8 A; 3VZH A; 3K5N A; 4CH0 S; 3FGV A; 3HHL B; 4WBF A; 1UFL A; 1VQ8 S; 4I0W A; 4WKY A; 5KFE A; 2EFN A; 4ZPA A; 1U7L A; 3AJ2 A; 2C2E A; 5DDO C; 4HLB A; 1NK9 A; 1JLF A; 5L9X A; 1UEV A; 4MH8 A; 1GEH A; 2CPZ A; 2DH7 A; 3HSZ A; 1J5O A; 1NJY A; 2RHQ B; 2DGS A; 1HBM B; 1AW0 A; 3LH2 S; 4LSL A; 2YTC A; 3LF0 A; 2MMY A; 1FDN A; 2A18 A; 4OYB A; 1A0O B; 1TMM A; 2JC1 A; 2ABY A; 5K20 B; 1QTN B; 1CJK A; 4HHJ A; 2KXF A; 3AAW B; 1ZOT A; 2CAJ A; 2RIL A; 2FZG B; 3L7U A; 3G6V A; 1S1X A; 2VC1 A; 2K7K A; 4ECT A; 4F0M A; 2V9W A; 1T8E A; 2B6A B; 3ETO A; 3TI0 A; 2VQE F; 2NXU A; 3H2L A; 1P9Y A; 4USU A; 4ES2 A; 4NLG A; 3PYD A; 4GMK A; 4IQX A; 4C48 A; 2V34 A; 3ZTO A; 1NBE B; 2UVW A; 1KQG B; 4F04 B; 4ECX A; 2B9Y A; 1RAG B; 3FEY B; 4RW4 B; 2ZH5 A; 2UVU A; 3MZI A; 4C98 A; 5DET A; 1S0M A; 3DLJ A; 2V94 A; 3KK3 B; 1B64 A; 3MDF A; 4A8O A; 3BO3 A; 2XY6 A; 3L95 X; 2XMU A; 1HNV A; 3UD4 P; 1YJR A; 3CCU S; 4CNZ A; 2MKJ A; 3O1L A; 3R5B A; 2U1A A; 1WKK A; 2RQC A; 1LKZ A; 4NX9 A; 1F2G A; 4DSF A; 2L48 A; 4B9M A; 2AD9 A; 4Y3C A; 1X5S A; 3OLB A; 3OTO J; 2ZD1 A; 3RZA A; 5C25 A; 3U1M A; 4NEZ A; 3LGH A; 2DKO B; 2CJX B; 5F0W A; 2I5J B; 2NZC A; 4P75 A; 4DV3 J; 2ZBC A; 4QJV A; 1R8H A; 4OI4 A; 3VAK A; 2EKN A; 3DGP A; 5DQI A; 2CPX A; 2ASL A; 3K5M A; 3UDV A; 2HIQ A; 3W9H A; 2QIF A; 3CD7 A; 1CC8 A; 3WX8 A; 2NR0 A; 3TZX A; 5HMX A; 3MCM A; 2C3U A; 2ZDP A; 4ETZ A; 3EM1 A; 4J9U E; 5DQH A; 1WSV A; 3H8Y A; 4ETX A; 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