The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
103
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structure length |
103
|
Chain Sequence |
MSYKIPVHADFLIAYSTVPGFYSWRNTTRGSWFMQSLCAELAANGKRLDILTLLTFVCQRVAVDFESCTPDTPEMHQQKQIPCITTMLTRILRFSDKQLAPAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural mechanisms of DIAP1 auto-inhibition and DIAP1-mediated inhibition of drICE.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase
|
| molecule tags |
Hydrolase/ligase/hydrolase
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
20
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-06-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R7B B; 2QLB B; 3D6M B; 1BMQ B; 2H4Y B; 2CNO B; 3EDR B; 4ZVQ B; 2CNN B; 2QLJ B; 2FQQ B; 1SC1 B; 2CJY B; 3NS7 B; 1RHU B; 4ZVO B; 2QL5 B; 4DCO B; 4LSZ B; 2P2C B; 2H5I B; 2C2M B; 3R7N B; 2C1E B; 2XZT B; 1RWN B; 1RWV B; 2H51 B; 1RWK B; 3GJT B; 2DKO B; 2XYG B; 3P45 B; 2H48 B; 3RJM B; 1QDU B; 1RHM B; 1RWO B; 1RHQ B; 4DCJ B; 3IBC B; 4ZVS B; 1SC4 B; 2XYH B; 1QTN B; 1NME B; 2H65 B; 1F9E B; 5IC4 B; 2CNK B; 1RHK B; 4ZVT B; 4ZVP B; 5K20 B; 2HBY B; 1RE1 B; 2H4W B; 3GJR B; 4JB8 B; 2C2Z B; 1PYO B; 3KJN B; 1RWP B; 2QLF B; 2XYP B; 2CJX B; 2CDR B; 1RWX B; 3D6H B; 4ZVU B; 3R6G B; 2C2K B; 3KJQ B; 1ICE B; 1RHR B; 1RWM B; 3R6L B; 1PAU B; 2Y1L B; 2HBR B; 2Y0B B; 1SC3 B; 2H54 B; 1IBC B; 3SIP B; 1I51 B; 3R5J B; 2HBQ B; 2HBZ B; 3GJQ B; 2QL7 B; 4ZVR B; 3GJS B; 3IBF B; 3P4U B; 1GFW B; 2H5J B; 1RHJ B; 2XZD B; 3R7S B; 1RWW B; 1I3O B; 2QL9 B; 3KJF B; 3QNW B; 4DCP B; 3D6F B; 2CNL B; 2C2O B; 5IC6 B; 3EDQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VPY B; 4DFP A; 3SQG A; 2CQB A; 3NEK A; 2Y9H A; 5KFL A; 3DRX A; 4B17 A; 1J27 A; 2DNK A; 3LO3 A; 2CXE A; 3U1N A; 4LSN A; 1L5U A; 2Z57 B; 2FYX A; 1HQE B; 2ZEJ A; 3S7R A; 3G86 A; 1U0H B; 3RRK A; 2XMK A; 2EVZ A; 3BQ0 A; 2V94 A; 4OJ3 A; 2I38 A; 3JSY A; 2UVW A; 3Q22 A; 2A2C A; 1EX8 A; 5HMW A; 5FDL B; 1N0U A; 3CTR A; 3JSB A; 1RLC L; 3QMQ A; 1I1G A; 2N3L A; 3L7O A; 3TYT A; 1SV5 B; 3QJJ A; 1Q1K A; 3GE9 A; 2KFY A; 3KK1 B; 2FLL A; 2GIR A; 1R27 B; 4QW9 A; 3VAJ A; 1LQ9 A; 2VC1 A; 1HHQ A; 2NZ4 A; 1N32 F; 1RT1 A; 2OPP B; 2XMT A; 4FKX A; 1RT5 B; 4NLG A; 4UY8 5; 5DQG A; 3GIL A; 3NGT A; 3GR1 A; 3IO1 A; 3DLB A; 5I42 A; 3PJ9 A; 1FDB A; 3M6V A; 1IQZ A; 3DDI A; 4TYA A; 4DV3 F; 2FLO A; 4LRD A; 1QLN A; 4ZLN A; 3R5C A; 1TVR B; 4X64 F; 4ECR A; 1FJE B; 3CD5 A; 1SUQ B; 2BM1 A; 5EN1 A; 4OX6 A; 2HNZ B; 4F0H A; 3V81 A; 4ZHR A; 2QC3 A; 4PWW A; 3CJT A; 5A8R B; 4F67 A; 5LJ3 Y; 2XS5 A; 1SJ1 A; 2WOM B; 3LGN A; 2ZBR A; 4LT6 A; 3UD4 P; 4RUB A; 1WOS A; 1RKJ A; 2CNK B; 1FTC A; 3TZY A; 1NDP A; 2MGZ B; 2HHP A; 3TX8 A; 4LF4 J; 2KDO A; 2W2N P; 3ZNJ 1; 2HFZ A; 3TEG A; 3A3N B; 4NXM F; 3KHH A; 2ADB A; 2H9Z A; 1V3R A; 1BQX A; 5F3Z A; 3S01 A; 5K8P A; 3FZB A; 1PAE X; 3MHY A; 2CPI A; 3BPS P; 1OO0 B; 4RNM A; 2XCP A; 1FI4 A; 1Y3J A; 1HR0 J; 3MMA A; 2ALZ A; 3DN9 A; 2G2O A; 2K7J A; 2OTL S; 1TL4 A; 1FDN A; 3OBI A; 3UDV A; 3CCU S; 2NXN A; 2BBE A; 1DZ5 A; 5BYS A; 2YNG B; 3NS6 A; 3DI6 B; 4Y6I A; 4MFB B; 3GCX P; 1T94 A; 1R0C B; 4LFC F; 3HFZ B; 1SQF A; 4DQP A; 4OYO A; 4P75 A; 4F25 A; 2APO A; 1VLO A; 5LSL A; 1IUJ A; 4LSL B; 1LWE A; 1FKO A; 1MMN A; 4RJV A; 1H2U X; 2PGC A; 2ZVS A; 2E29 A; 2UXC J; 2HZC A; 3GYN A; 2VIH A; 3MGJ A; 1R43 A; 1RLD A; 1KVK A; 3THP A; 2OFH X; 5CXT A; 1WKJ A; 3EWG A; 4DX5 A; 3P4U B; 1TKD A; 3EXY A; 2QA2 A; 3QT8 A; 1TTH B; 1DRZ A; 3W2W B; 3CB4 A; 2ZZT A; 2BQ3 A; 2Z4P A; 3PY8 A; 1UVI A; 2VHG A; 5EUH A; 3ZNU A; 1P27 B; 5KAK A; 2CPH A; 1KOH A; 1X8D A; 3O44 A; 3KK2 B; 2XZT B; 4OHW A; 2M4M A; 2DPI A; 3GYG A; 3JS9 A; 2V8G A; 1NUE A; 4KGK A; 5KFD A; 1HQU A; 3N9U C; 2FJE B; 4DV4 J; 5DDR C; 3SQG B; 5KFB A; 3UNG C; 1W25 A; 3P6Y C; 1O6X A; 5CCL A; 2IRU A; 2X1B A; 4LSN B; 4C4W A; 4DMZ A; 1BHN A; 1ZS6 A; 2K8G A; 1S9F A; 5C7P A; 3VAH A; 3NRB A; 4UTG A; 1IKX A; 2QRR A; 4OZJ A; 2YKN B; 4WTO B; 3K2Y A; 2HBR B; 1S1X A; 1UVL A; 1U45 A; 5H9F K; 1H3D A; 1ZPW X; 1DQA A; 3R7S B; 1ULR A; 3KUE A; 2NXC A; 1IVZ A; 4PYD A; 3FUY A; 1RT6 A; 4UOG A; 2NPF A; 3N79 A; 4YR0 A; 1BMQ B; 2XCA A; 3PCO B; 5KFE A; 3EUN A; 3D3B J; 2PEH A; 2W7A A; 5GAH I; 4DUY F; 3MR2 A; 3TUZ C; 4ECW A; 3ETO A; 2R2R A; 2HFN A; 3C8Y A; 1RT1 B; 5CZX A; 2I1R A; 5BYQ A; 3I5A A; 5D4P A; 2CPE A; 2F8M A; 2VG5 A; 1WEL A; 1VC5 A; 1QDU B; 1UVJ A; 3D1H A; 3M9M B; 2I0X A; 2JH3 A; 2RRA A; 4RL1 A; 4DS5 A; 5FD1 A; 2E44 A; 3C6U A; 3OL7 A; 2KHD A; 4G6V B; 1JJ2 R; 2HBY B; 1RYS A; 4IRC A; 4KTQ A; 3CVK A; 4FKY A; 5KFH A; 4HYK A; 1S7I A; 4L74 A; 3R6G B; 1RWU A; 2JSX A; 1OQ6 A; 3JTN A; 4WYW A; 1VBK A; 4AQY F; 3I31 A; 5A6W A; 5HMY A; 4ZHR B; 3MM9 A; 5B0A A; 2L41 A; 3H2V E; 2DO0 A; 3ZZR A; 3MD3 A; 2LFV A; 4NLQ A; 4FS2 A; 4RNN A; 3RB0 A; 1O51 A; 1ZTW A; 2U2F A; 4ED4 A; 1V3S A; 3E2E A; 4L72 B; 2EK1 A; 2ZJP Q; 4RLE A; 2RH3 A; 1RTH A; 4EO6 A; 1MRO B; 3MAH A; 2Z2Y B; 3Q8R B; 4DUZ J; 3PJW A; 3J81 U; 3UWT A; 4ZJL A; 3A3P B; 1K73 T; 1U2R A; 4CLL A; 1TQL A; 2DNM A; 3DGV A; 1YZ7 A; 3OT9 A; 4LF2 A; 4DR4 F; 1T0T V; 2GNK A; 3LQV A; 2BUN A; 5ETT A; 2DR7 A; 4PG6 A; 3MMA B; 5AJ3 F; 4NRU A; 2RDD A; 2K3I A; 3FBF A; 1IR0 A; 4IFV A; 4MKV A; 1QTM A; 3FJ2 A; 5EHH A; 2MQL A; 1YVF A; 3R8Y A; 4WFZ A; 4C3K A; 4NLW A; 3T9N A; 5F9L A; 3JAM U; 2D9O A; 1C0T A; 5DDP C; 1Y9O A; 1QM9 A; 1X5O A; 3FMB A; 2KG1 A; 1KHW A; 1HYS A; 4NLX A; 4ZPV R; 4A8K A; 1S9G A; 4Q0B B; 1KNZ A; 3DKD A; 4Y65 A; 5A8K A; 1OSD A; 4L3N A; 5DQH A; 1LWE B; 1VC0 A; 4DFK A; 3CT9 A; 4WFB Q; 1S4E A; 5GAD U; 1REG X; 2F1F A; 4AXI A; 5KFQ A; 3ZZO A; 1VQ4 S; 1RAE B; 4WU2 A; 1VQ8 S; 1WC0 A; 3QSI A; 4RNH A; 2ZE2 B; 2CKW A; 1NK9 A; 1FTR A; 1AFJ A; 3BN4 A; 2A1B A; 3LH2 S; 3H2U B; 3VVU A; 3CJ4 A; 2CJK A; 2R7V A; 3D7S B; 1JXL A; 2E66 A; 5J2M A; 2DVI A; 3CJ3 A; 5C25 A; 3MD1 A; 3VHQ A; 3U7J A; 3W9I A; 1OYD A; 4N76 A; 5D3G A; 3EZU A; 2ZM6 J; 3DXB A; 3AD7 C; 4G3I A; 3ITH A; 5BR8 F; 3HSD A; 3QRP A; 3IP0 A; 2YNH A; 3O3L A; 3MCS A; 4IRK A; 4NRT A; 1NK8 A; 1NDC A; 3K5P A; 3WIV A; 4QR0 A; 1E6V A; 4G1P A; 4DU8 A; 1PAU B; 4JV0 A; 3EE3 A; 4A8F A; 4X64 J; 1F9H A; 1HNX J; 1HQU B; 3HKW A; 2B5J B; 2OI2 A; 3S6E A; 3A8K A; 4Y2M A; 3AOC A; 2CNL B; 2FHJ A; 5KFX A; 3VWS A; 4KHP F; 1PJ5 A; 2M9K A; 3I0S B; 2HWI A; 5L1J A; 4DPU A; 7FD1 A; 2I5J A; 4ZPC A; 1LW0 A; 1BLU A; 3BGF A; 3ET6 A; 1JLB A; 5CCM A; 3TR5 A; 1RSC A; 2ASD A; 5KFI A; 2DJW A; 4RW6 B; 4GKK F; 2JFD A; 3K7R A; 3NP5 A; 3HZE A; 2MHN A; 2CJA A; 3PG9 A; 3TX0 A; 3BN7 A; 2OH2 A; 2VON A; 3HK2 A; 2WSF C; 3J7A N; 4DL0 C; 2BJ1 A; 3Q24 A; 3ZFV A; 4P74 A; 2CPF A; 1VIO A; 3SV4 A; 1D9D A; 1HBM A; 3IWX A; 4QOT A; 3RRG A; 5KG2 A; 1YI2 S; 2HS3 A; 2WCX A; 2NUH A; 1P9Q C; 4I1T A; 2DIU A; 1S77 D; 4IOB A; 2R3V A; 3HHN B; 2ZNY A; 1M90 T; 1WSR A; 4O4G B; 3BBB A; 1FNX H; 3W64 A; 3WDO A; 2M88 A; 5L9X A; 1JLQ B; 1EJ7 L; 4B3T F; 2W2M P; 2VPZ B; 4I2P A; 4ZVE A; 3HP6 A; 3CDE A; 3MPU B; 5IT9 Y; 1YJT A; 4I68 A; 1IKW B; 2CJB A; 2C2E A; 1OMS A; 3W9J A; 3MM9 B; 2JVR A; 2E5H A; 4B02 A; 1HWL A; 2R9L A; 1I94 F; 5GAE I; 3DDK A; 4JI2 F; 4CIO A; 1S1W B; 4MK7 A; 3OVS A; 2DKO B; 3BSA A; 3VGS A; 3IRW P; 3OW2 R; 5ETP A; 1RHM B; 5DQI A; 3GLJ A; 3NGS A; 3NOG A; 1Q8B A; 4ZP6 A; 1RTH B; 3MPY A; 3OFE A; 3EGW B; 2XWX A; 4X84 A; 1PYO B; 2GML A; 4E8U A; 1J5E J; 3RBZ A; 3UCU P; 5D0G A; 1LFW A; 2B8P A; 3AQP A; 3OD2 A; 4K4V A; 3UDE A; 1VRU B; 2BR0 A; 4P9S A; 4I56 A; 3TUJ C; 4M5H A; 3HMJ G; 4K4X A; 3M2V A; 1KVJ A; 2Y0S D; 1S1T A; 4ED0 A; 2BKO A; 1KBR A; 1TK0 A; 3BDE A; 2PA3 A; 2YKO A; 3IN5 A; 4XAK A; 4NOH A; 2WAQ D; 5DG8 A; 2OGU A; 4ECV A; 3QIP A; 1BQM A; 4DR6 F; 1MWQ A; 3NKY A; 2LA6 A; 2QE5 A; 4YR2 A; 3UFC X; 1AUD A; 2DGU A; 1QAX A; 4CH0 S; 4M5L A; 4F50 A; 2W9A A; 2OD4 A; 1S9G B; 3HI9 A; 2QLX A; 4QWB A; 5A2Q U; 4QWE A; 3KJV A; 4ID5 A; 2KH9 A; 2V8V A; 4X62 J; 4EBC A; 3KLG B; 1R8A A; 2NYH A; 3PKM A; 3U1L A; 4DV2 J; 1RAB B; 3M9O B; 1F9E B; 3KMS A; 3MWB A; 2UVR A; 2IVM A; 3G8S A; 3A8E A; 1PSD A; 3K5N A; 3DNC A; 1MN7 A; 2R7S A; 3SSR A; 5D0R A; 1UWB A; 3TOQ A; 2HAF A; 3DU6 A; 1VQS A; 2LEC A; 5B0C A; 5E33 A; 2FVR A; 1I51 B; 3R5D A; 4DUY J; 1LV5 A; 2Y1J A; 1RAJ A; 4KRW A; 1VQM S; 4JOU A; 5C25 B; 2XMM A; 3RR8 A; 3G6X A; 1W2I A; 5D3G B; 1R8B A; 2AJQ A; 3ITH B; 4OI0 A; 5E5N A; 2CA9 A; 2YNH B; 4PAB A; 4ER8 A; 1E6V B; 4IDK A; 2OEM A; 4LBI A; 4EYI B; 1IBK F; 4R0J A; 4WE1 A; 2DRD A; 3BF4 A; 3CJ2 A; 5HQL A; 5DZ7 A; 4OHY A; 3NWR A; 2RQC A; 3ZTR A; 4AQY J; 3WC2 A; 4GVB A; 1NHK L; 3IBC B; 3WZ0 A; 1SC4 B; 2FUG 9; 4LF9 F; 4NLO A; 4ZPT R; 1NSA A; 2PI5 A; 2ZWP A; 4DX6 A; 1WC3 A; 4LIR A; 1QSL A; 1LW0 B; 3BV8 A; 2YKP A; 3ET6 B; 1R8P A; 1W7W A; 3FSI A; 4CO5 A; 2CQP A; 1FVQ A; 1VCT A; 2Y0B B; 1N5V A; 4USJ C; 2BA9 A; 1CPZ A; 2UV8 G; 2J6S A; 2CPY A; 4D3G A; 1L3V A; 3LPY A; 3FBB A; 4DR4 J; 1FRK A; 3AH6 A; 1IJF B; 4CRJ A; 2B6A B; 3GQC A; 4J9U E; 2RHQ B; 4LSZ B; 3QGG A; 3THT A; 2EKY A; 3I0R A; 4TLR A; 1GMW D; 2BAN B; 3HT0 A; 4TKT A; 2F8H A; 2HHQ A; 3DDN A; 2HHX A; 3RJM B; 2ZD1 B; 5E0O A; 1K47 A; 1F1B B; 1QY7 A; 2VDI A; 2ALY B; 4I2P B; 3J7A 1; 5HLF A; 1JLA A; 2L9W A; 1UZH A; 3ONQ A; 1ELO A; 3ELH A; 2GA7 A; 5B0D A; 3MR5 A; 1UW9 A; 4DHV A; 2RF2 A; 3DLG B; 1GX6 A; 3F73 A; 2AP6 A; 1B0T A; 3T1H J; 2LQ9 A; 4ED1 A; 4OIX A; 2VG6 B; 2FC8 A; 2KT2 A; 2DR9 A; 1QUV A; 4WYL A; 1WF2 A; 2UUC J; 4NX9 A; 3IR6 B; 2KXF A; 1TKX B; 1RT7 A; 3D6M B; 1VGY A; 3FEX B; 5J1E B; 1ZPV A; 1RAO A; 1FES A; 2QYG A; 4A8M P; 2X1A A; 4X65 J; 2Y3Y A; 4X4V A; 3IGV A; 2WVE A; 5KT3 A; 2KT3 A; 2BW2 A; 2I9S A; 2HFV A; 2B4V A; 1VK8 A; 4DZD A; 3PEJ A; 4CLT A; 3QIP B; 5ETQ A; 5DM6 Q; 3QT6 A; 1D0E A; 2OPQ B; 1FT8 A; 4RWW A; 3LAK A; 2H1Y A; 3BM7 A; 1YLX A; 3D54 A; 4I2Q B; 2BZ2 A; 4KHP J; 3HD2 A; 4OYW A; 3MEC B; 2JHE A; 5C5J A; 3ZTQ A; 2YWE A; 4RW8 B; 3KJV B; 4ID5 B; 3DRY A; 2BQU A; 1JIH A; 3M6W A; 5LMU F; 4PQU A; 1Q53 A; 3AOB A; 3UDL A; 4RUA A; 3BO3 A; 5KT4 A; 1TU0 B; 5LOQ A; 4BWM A; 4DR2 J; 3LAM A; 4ITS A; 4IO9 Q; 3IMQ J; 3LGH A; 2HRT A; 4LRB A; 3Q2S C; 3MMC B; 3QT7 A; 4ETZ A; 2VFS A; 1CQN A; 1VBZ A; 4DV6 J; 2R7R A; 5DM7 Q; 4RW9 A; 1NH8 A; 2CVI A; 2V4J A; 2W9C A; 5JXS A; 1RDR A; 3DLK A; 4PCQ A; 3T6J A; 4U7U K; 5M2P A; 4I6A A; 1MMD A; 2HK2 A; 1GTH A; 2J6T A; 1YHQ S; 5L8R C; 3OJU A; 3QPI A; 2HND A; 3M2R A; 4USH A; 4K8R A; 4DF4 A; 3C16 A; 4XDC A; 3GJR B; 3EM1 A; 1NDL A; 1DAX A; 1PIL A; 1EQ0 A; 2KB2 A; 2ZJQ Q; 3DOL A; 4WE1 B; 4B3T J; 3VV2 B; 2IMO A; 4NEY A; 1WKL A; 3TVY A; 3VQS A; 4P73 A; 3IGN A; 3TZX A; 2B4O A; 2PMZ D; 5HAN A; 2JLF A; 2CPZ A; 2XMJ A; 4WP8 A; 3UN5 A; 3BGR B; 2FJV A; 1RAG B; 1I94 J; 4CYU A; 2J0X A; 4BCA A; 4RW7 A; 2QLB B; 4DPT A; 5CYQ B; 3BEG B; 3PYF A; 1MWY A; 2DGO A; 2P9G A; 3MI7 X; 2CAJ A; 4MAK A; 4LJM A; 1EKR A; 3GMG A; 1N0V C; 4N47 A; 2C3O A; 4KFB B; 1K1S A; 2VG7 B; 3QJP A; 5ETK A; 1NKE A; 3SCI E; 4NEZ A; 3G96 A; 4U96 A; 2Z2Z A; 3SCJ E; 3HUL A; 2HHV A; 1GQE A; 5JMN A; 1S99 A; 2VFT A; 1SB6 A; 2BMB A; 2QV6 A; 3CE8 A; 2V69 A; 1GAO A; 3FEZ A; 4RR5 A; 4DR6 J; 3GPA A; 1I5O B; 3VAI A; 3I0R B; 2D74 B; 1TL5 A; 4AYB D; 3M7V A; 2UVV A; 3M9N B; 3V5R A; 2H54 B; 2OSR A; 2YH0 A; 2QL7 B; 2HHS A; 2HAI A; 2UUW A; 1K44 A; 1WHX A; 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