The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
103
|
structure length |
103
|
Chain Sequence |
MSYKIPVHADFLIAYSTVPGFYSWRNTTRGSWFMQSLCAELAANGKRLDILTLLTFVCQRVAVDFESCTPDTPEMHQQKQIPCITTMLTRILRFSDKQLAPAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural mechanisms of DIAP1 auto-inhibition and DIAP1-mediated inhibition of drICE.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase/ligase/hydrolase
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| molecule keywords |
Caspase
|
| total genus |
20
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| structure length |
103
|
| sequence length |
103
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-06-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QDU B; 1PAU B; 2C2M B; 3KJN B; 1RWM B; 2CJY B; 2HBR B; 1BMQ B; 2CDR B; 2XYP B; 3QNW B; 4ZVS B; 3GJS B; 2QL5 B; 2C1E B; 3EDR B; 2DKO B; 3GJQ B; 1RHK B; 1RHU B; 3D6F B; 4ZVO B; 2C2O B; 2H65 B; 2C2K B; 1RWK B; 4LSZ B; 1GFW B; 1RHQ B; 1RWO B; 2QL9 B; 5IC4 B; 4DCO B; 2CNL B; 2CNO B; 1SC3 B; 1QTN B; 1I3O B; 2HBQ B; 2HBZ B; 4DCP B; 3R5J B; 1PYO B; 4DCJ B; 2CJX B; 1I51 B; 1RWN B; 3R7B B; 1RWW B; 2CNK B; 2H48 B; 3R6L B; 1ICE B; 4ZVQ B; 2XYH B; 2H51 B; 1SC1 B; 4ZVT B; 3GJT B; 3D6H B; 3IBF B; 4ZVU B; 3NS7 B; 2QLF B; 2H4W B; 1SC4 B; 4ZVP B; 1RWP B; 4JB8 B; 2QLJ B; 3R7S B; 5K20 B; 5IC6 B; 3GJR B; 2Y1L B; 2XZT B; 1RHR B; 3SIP B; 1RWX B; 2P2C B; 1NME B; 3IBC B; 3R6G B; 2XZD B; 3RJM B; 4ZVR B; 3R7N B; 3KJF B; 1IBC B; 3P4U B; 3P45 B; 2FQQ B; 3EDQ B; 2QL7 B; 2H5J B; 2Y0B B; 1RHJ B; 1RHM B; 2HBY B; 1RE1 B; 2H5I B; 2QLB B; 3KJQ B; 3D6M B; 2CNN B; 2XYG B; 1F9E B; 1RWV B; 2H4Y B; 2C2Z B; 2H54 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ELH A; 1Q5V A; 3OTC A; 3QLH B; 2AEM A; 2LU1 A; 4ZIV A; 3KLI B; 4ZVS B; 3P5B P; 4CLL A; 3D3B J; 3G4S S; 2AMC B; 4U9R A; 2V69 A; 2BJ3 A; 3UDL A; 1P8G A; 4YHH J; 1RT2 A; 3CCR S; 4DR2 J; 3I0R B; 2C3U A; 4F4Z A; 4FVC A; 1D9A A; 4PPD A; 5KFC A; 4DUZ F; 5E33 A; 3HF5 A; 1NK4 A; 3MEG B; 1JXV A; 4TNO A; 2UUA J; 5CH7 B; 3HSJ A; 4ILL A; 1NZA A; 2F63 A; 4A8Y A; 1FJE B; 4DV0 J; 2EC0 A; 2ZH7 A; 5B09 A; 3Q8V A; 4LJM A; 2D74 B; 1YHQ S; 4I2Q A; 2HWT A; 2XMA A; 1O5J A; 3DLG A; 3BKU A; 3EVO A; 1RWM B; 1U1L A; 3EXC X; 4G1Q A; 2BE2 B; 3V2U C; 4V19 J; 1S0V A; 4FVM A; 1IKY A; 4NYO A; 2ZM6 J; 4R8U A; 2ILZ A; 3EUN A; 2FZC B; 2K1R B; 1T05 A; 1UVI A; 2RB7 A; 2ZBC A; 4WE1 A; 3H2U B; 4ZK7 M; 2FGO A; 4NCG A; 2MKC A; 3WBZ A; 1RXO B; 1P9Y A; 5DGB A; 1WUU A; 3M4X A; 2NPF A; 2FTR A; 2MY7 A; 1TK0 A; 1CC8 A; 4UZC A; 1KQS R; 3THV A; 4HT5 A; 3L7P A; 2HHV A; 3GG1 A; 2HAI A; 1LWE B; 3VHQ A; 3OTO F; 3TW0 A; 4QZV B; 4LBP A; 4CLY A; 3KDO A; 2OTJ S; 3OLA A; 2RU9 A; 5LT5 A; 3ITH A; 3SDE B; 1VS3 A; 2FB0 A; 2DR8 A; 1UZH A; 4TQR A; 3AY0 A; 2I9S A; 1P1L A; 2IM2 A; 2OPQ A; 1Q82 T; 2XBP A; 4ZPW R; 1NK7 A; 1K73 T; 3BDP A; 5F41 A; 5LJ5 Y; 2DIU A; 4BLG A; 4A47 A; 3MCS A; 1SPB P; 4JI6 F; 5J2Q B; 3R3T A; 3KLG A; 2CA9 A; 1WF2 A; 1CJU B; 3QPI A; 2E9T A; 4OHX A; 3I4P A; 2FJW A; 1JXL A; 3QZ8 A; 4DPT A; 3NOG A; 2J8A A; 3DRR B; 4WFB Q; 1QJH A; 4FYD A; 4MH8 A; 1V3R A; 1M90 T; 3IRX B; 4DF8 A; 3K58 A; 3GWC A; 1CEZ A; 2F8H A; 4WU2 A; 3OVB A; 2YBV A; 4USI A; 1T9T A; 2OUG A; 1S76 D; 1S6P B; 2D3Z A; 3GJR B; 4XPE A; 3DI6 A; 2DBB A; 2YWF A; 2QO3 A; 4LRA A; 4GKK J; 1R43 A; 1JIH A; 2CPF A; 2Z4P A; 3ZTS A; 2EK6 A; 4DUY F; 3W7B A; 4NE9 C; 2AV5 A; 3LP1 A; 1PYS B; 3KK1 A; 4BBY A; 1TL5 A; 2JEI A; 1R3N A; 2M88 A; 4ZP6 A; 1FDA A; 1RTI A; 3ILL A; 1AB8 A; 1KVJ A; 1ZH5 A; 5AXM A; 2CDR B; 2RKI B; 4PQU B; 2W9B A; 1S59 A; 1G6B A; 4UTG A; 1B3T A; 3TAN A; 4KHM A; 3TUI C; 1FFS B; 1W26 A; 3VZI A; 1VRT A; 4U7U D; 2WB4 A; 1QVF R; 3VAI A; 2L9N A; 3VAH A; 1FRL A; 2M3D A; 5KFX A; 2VFT A; 1JXE A; 3HX9 A; 1VQ4 S; 3PFO A; 3U1N A; 2EXU A; 1YBA A; 4ECS A; 2CQD A; 2WOM B; 5A0Y A; 2LEB A; 2YX7 A; 1SXL A; 1HWJ A; 3NMA A; 2B7C B; 1QE1 B; 2E66 A; 4O3Q A; 5L1I A; 2VUG A; 1HNV A; 5CAA A; 5DG7 A; 4DSL A; 4H4M A; 3T5K A; 4I2P A; 2RQC A; 3NEK A; 2VBW A; 3N5B A; 2ZH6 A; 5HL7 Q; 4K4U A; 1V3S A; 2V4Q A; 1M5H A; 4RUC A; 3DGP A; 3SYZ A; 5EWF A; 2FQQ B; 4F2R A; 2CPX A; 2QGF B; 2MKY A; 2WRM A; 4RBU A; 2W2O P; 3OV7 A; 1NRK A; 4OYP A; 2BBE A; 4OZ2 A; 1VQ6 S; 1N5V A; 4O4G B; 2JFK A; 2UP1 A; 3CJ8 A; 4JYA J; 2LLZ A; 3Q8U A; 2V68 A; 1WG5 A; 4PRF A; 5AJ3 F; 3W62 A; 1WJ9 A; 1VQ7 S; 1UP1 A; 2RF2 A; 3PNI A; 4OZ3 A; 1N0U A; 4CO5 A; 1LNQ A; 4NLV A; 3J81 Y; 1JLA A; 3M2U A; 1VLY A; 4ZVQ B; 4P75 A; 4F4A A; 1YKW A; 5EX0 A; 1R8H A; 1Z2Z A; 1IKV B; 5IXU A; 2KXN B; 2KH9 A; 1FD2 A; 2HRY A; 3GII A; 4XPC A; 1VI7 A; 5F8M A; 3N01 A; 5D0G A; 4HR2 A; 4ZVR B; 1YQH A; 2KG1 A; 3WIV A; 2LDI A; 3N79 A; 1NJX A; 2XNQ A; 3D6T B; 4C8Z A; 3ZNJ 1; 4IG3 B; 4A8W A; 2MLY A; 2AD9 A; 3QGG A; 3R5G A; 1S12 A; 5IM0 A; 2I5J B; 5KG5 A; 1KVK A; 2DJW A; 3P6Y C; 4YQW A; 5KG4 A; 3DRX A; 1IKX A; 3AA9 A; 3GFH A; 3M1V A; 3D6F B; 3M8Q B; 3EPG A; 3P8B B; 2E1R A; 3FBF A; 3RGI A; 3GTY X; 4YB6 A; 5LJ3 Y; 3PW4 A; 4DQI A; 3NCR A; 3BQ2 A; 3D1O A; 3HVT B; 3D2W A; 1VIO A; 4I64 A; 5D77 A; 2OPR A; 2GHW A; 1WTB A; 4LVN P; 4BS2 A; 1JK9 B; 4KAI A; 1RCX B; 2GO9 A; 4CLF A; 1DHM A; 2ZKU A; 1R0A B; 2MHN A; 2DT9 A; 1UPM B; 1REV A; 3FCW A; 3UVJ A; 2W8L A; 2JLE A; 1FK9 B; 1H2V Z; 2AYG A; 4EYH B; 2OD6 A; 2GML A; 1OQ3 A; 3KLH A; 5B0E A; 4E98 A; 2G0I A; 1TU0 B; 4J7C A; 3BEG B; 1HR0 F; 4KGV B; 3HO1 A; 5KG1 A; 4DR4 F; 5J1P A; 2RVJ A; 5DLF A; 2VC1 A; 1D8Y A; 3NS6 A; 3DN9 A; 1FCA A; 3CCT A; 2MZR A; 3C14 B; 3H4D A; 1JLB B; 2ALY B; 3M6U A; 4L75 A; 3R5A A; 5C25 B; 2O1P A; 2LVW A; 4RUH A; 3L4B C; 4YDX A; 2C2O B; 2QX0 A; 2HFN A; 4WFN Q; 2CZV C; 2BKN A; 2BJD A; 5ETM A; 1NJZ A; 4RU2 A; 5KFZ A; 5FLX U; 3U02 A; 5KFQ A; 1Y5L B; 2F7V A; 1RTD A; 2RHS B; 3R5J B; 1PYO B; 4Q8E A; 3BPD A; 3VGS A; 3A8K A; 1AUS L; 3K5P A; 1NND A; 1NK6 A; 1QSY A; 2NPI A; 5HVG A; 2ZBI A; 3OL8 A; 3RBX A; 1KKH A; 3NNH A; 5CYJ A; 2JX2 A; 4ZVP B; 4O3S A; 1U02 A; 4DR5 F; 1FKO B; 1IBL J; 1RWX B; 1Q86 T; 5HMX A; 4PWD B; 2PA8 D; 1HBM A; 5LXY A; 2VBY A; 5EHH A; 1VGY A; 2LYV A; 2Y3Y A; 4LF4 F; 3RRG A; 2HVD A; 1KFD A; 2FVR A; 3TUP A; 1DY3 A; 3M8Y A; 3CJK A; 2R9L A; 2IVF B; 1NDK A; 4O44 B; 4GO5 X; 1U6Z A; 4ZOS A; 1ZET A; 2ZC4 A; 1S49 A; 2V4J B; 3PX6 A; 4KTQ A; 3MR7 A; 2LXI A; 1HNW J; 2YX1 A; 2EVZ A; 4Z37 A; 1EB0 A; 3IR5 B; 1N4L A; 3W5X A; 2C3O A; 2XY7 A; 3MED A; 2HQC A; 5HJY A; 2FDN A; 3OSP A; 4OI4 A; 2D41 A; 1QAJ A; 2KU7 A; 2AW0 A; 3EZ5 A; 4JV5 J; 5L46 A; 1O0P A; 3NGU A; 3VAL A; 1GMW D; 1NJI T; 1UAW A; 1SC1 B; 2GIF A; 1WKK A; 2YKA A; 5A6W A; 4ZP7 A; 4QIF A; 4Z2X A; 1NBE B; 2DIT A; 2JZ5 A; 1WD6 A; 4EI2 A; 4C0B A; 5F9N A; 1HWU A; 4DR6 J; 5KFE A; 1KDN A; 1KS2 A; 2R7W A; 4P52 A; 1FRK A; 4CYU B; 2OH2 A; 2JEJ A; 2XSF A; 2RU3 A; 3EDQ B; 3G96 A; 4JI8 J; 4CLK A; 3NLC A; 3QAT A; 4LIW A; 2V2K A; 5HP1 B; 4Y2K A; 4DL2 A; 3JXO A; 2HK3 A; 4FPR A; 1IKW A; 3DLJ A; 1PAU B; 5DQH A; 3MFH A; 5SZT A; 3JSR A; 3B4M A; 3AOD A; 4AL7 A; 1XMO J; 4EFA C; 4GVB B; 1EIY B; 4WF9 Q; 5G0R B; 3BYR A; 3HT3 A; 2NRE A; 1FNM A; 2JH3 A; 2CKW A; 1RB0 A; 1GFW B; 4WBF A; 3AH6 A; 1FRJ A; 3DYA A; 2V94 A; 5E7O B; 2AZ1 A; 1SJQ A; 1KLN A; 2KFZ A; 3UI3 A; 1R27 B; 3SQG B; 3R5B A; 2CQH A; 2M5Y A; 1VQS A; 2CWX A; 1VQ9 S; 1JLF B; 2L9W A; 2RE1 A; 1HYS A; 4M5G A; 4OLP A; 2N3O A; 3QJP A; 1U1P A; 2YNF B; 3BGL A; 1DJ0 A; 3UQS A; 2FLP A; 4OLO A; 1FRH A; 3G8S A; 2HGM A; 4YB1 P; 3PDN A; 3UCZ P; 4J9U E; 4K5S A; 3Q8Q B; 4LR8 A; 3DGV A; 4DL5 A; 3W9I A; 5EWE A; 2LFV A; 4KGX B; 1IN0 A; 3GFY A; 2YNI A; 2VFR A; 4L74 A; 4UQG A; 2ZOF A; 2VL1 A; 1JMT A; 5DZ6 A; 4TU9 A; 2PO4 A; 2HHH J; 1IQT A; 2KO1 A; 4TYA A; 1J5O A; 3OR2 B; 1AFI A; 3P49 B; 3LTO A; 1M5P C; 5KG3 A; 3TRG A; 3CUL A; 5KFW A; 5C7P A; 1XNR F; 2C3M A; 1GTE A; 1N6Q A; 3NGS A; 4LRE A; 1RHQ B; 3OUY A; 4OI3 A; 1U25 A; 3G8Q A; 4J37 A; 4FXD A; 5CYM B; 4QPX A; 2VPX B; 4B9L A; 2V67 A; 3NGR A; 2E5L J; 3TAM A; 4ZVF A; 3GIK A; 1YJT A; 4J9O A; 2YKM B; 1X5O A; 3D0I E; 3GMG A; 1CJT B; 2DD8 S; 4NXM F; 2W4D A; 4AD6 A; 5D0H A; 5D4O A; 3EZU A; 3LPY A; 4P2M A; 1ARO P; 4DV4 J; 1NLK L; 2H5E A; 4OFZ A; 3RB0 A; 3NBP B; 1UEV A; 2K2P A; 1NKC A; 1RAG B; 3MEE A; 1GAO A; 3N6N A; 5JMN A; 1R31 A; 3AT1 B; 2LEC A; 4C48 A; 4P73 A; 4IRC A; 1D09 B; 4U8Y A; 4X4V A; 2FLO A; 1X60 A; 3LW5 C; 4F25 A; 5SUH A; 1RAH B; 4LF8 F; 2H1Y A; 3VAF A; 4X66 F; 3MZI A; 3IA0 A; 2LA4 A; 3OTE A; 3GV7 B; 1C4A A; 2GAH C; 4Q0B B; 2BE9 B; 2R2S A; 1S9G B; 2MB0 B; 4DV7 J; 2AJ4 A; 1R6Y A; 3R5D A; 2DKO B; 1SH0 A; 1X9W A; 3ULH A; 1UTA A; 4ANC A; 3MCN A; 3MMC B; 4HI1 A; 1XMQ J; 2CJB A; 2A10 A; 2DNG A; 1S79 A; 1EQ0 A; 1D9F A; 1LEO A; 1UFW A; 1MWY A; 8AT1 B; 1ELO A; 2ZBP A; 4QIE A; 3T9N A; 4J9L A; 1N36 F; 1FFW B; 2XI3 A; 3HK2 A; 4ZCM A; 2IHR 1; 3TAQ A; 3KNA A; 2MY8 A; 2E9R X; 3LAK A; 2WW8 A; 1X5P A; 2XZT B; 3JS9 A; 1SIZ A; 2NZ4 A; 3EZO A; 2P5V A; 4M63 A; 3CGI A; 1S99 A; 2B9E A; 4ZPA A; 2JHE A; 4YEA A; 1HFE L; 3JAM U; 3D54 A; 4UZB A; 1M1K T; 4R0E A; 1TK8 A; 3JAM Y; 1H6K X; 4N77 A; 4A46 A; 3LO3 A; 1VQO S; 4RWW A; 2DIV A; 3MR3 A; 2GQC A; 4MAK A; 3DLL Q; 5DQG A; 4HLB A; 5J2M A; 1EQM A; 2L9D A; 2V50 A; 3UNG C; 3R8Y A; 4UOG A; 1HHT P; 2F9J A; 4WK3 A; 4AXJ A; 4NPO A; 2AGO A; 4CO0 A; 3M6V A; 2CJX B; 4DPO A; 1YJ9 S; 3ZTR A; 1KOO A; 1I5O B; 2DEJ A; 1U1O A; 2H51 B; 5KG6 A; 4X4O A; 2B9W A; 3N28 A; 2ADC A; 1TP7 A; 3AQP A; 3E51 A; 1IXK A; 2IY5 B; 1TUV A; 1A9N B; 2E1A A; 4TQS A; 4K4W A; 2J9C A; 4KGM A; 5L1K A; 2CZ9 A; 5HJX A; 4BWJ A; 3S6E A; 4M5N A; 3GB0 A; 1S7H A; 1N32 F; 4M5J A; 4C98 A; 2N4C A; 3P45 B; 5KT6 A; 2FJB B; 3CW2 C; 1X0P A; 5LSR A; 3ZFV A; 1RDR A; 3A8E A; 3J7Z 5; 5BYR A; 3I96 A; 2AKW B; 4QJV A; 2BKO A; 1LW2 B; 3BKF A; 4I6W A; 4MMO A; 3ADA C; 2J8S A; 1HMV A; 4PCQ A; 3VWS A; 3CDU A; 1S9E A; 3UD3 P; 3BSA A; 2EG2 A; 4DCO B; 4DX6 A; 1X5S A; 7AT1 B; 4ZJQ A; 4CO3 A; 1AYE A; 5C42 B; 4MK8 A; 4OJ1 A; 1AZS A; 3RB6 A; 4K4X A; 1Q81 T; 2F5G A; 3CJT A; 2VA3 A; 3ETM A; 2HS3 A; 4DUZ J; 3K7R A; 1R89 A; 4AUK A; 3C2P A; 5DS7 A; 1KOH A; 3DOK A; 4UOC A; 3HXM A; 3JB9 k; 2EFG A; 3CD0 A; 4I2Q B; 4AXI A; 4UQT A; 4C3M A; 3SI8 A; 4G1Q B; 5F0U A; 4JI3 F; 3FBE A; 3GV5 B; 1FNX H; 3DLE A; 4R8U B; 4ELU A; 4X4S A; 4YB5 A; 5ETS A; 3A12 A; 4RBT A; 1U4B A; 2RH3 A; 1T05 B; 2HND A; 1KRP A; 2ROG A; 4X84 A; 4ECU A; 1TKZ A; 1VHI A; 1FEE A; 3OFG A; 1XR6 A; 4WFA Q; 1KBR A; 1TEL A; 4QQB A; 3OLB A; 5KFG A; 4FZV A; 2U2F A; 1C1C A; 3GE9 A; 1BD6 A; 2VOD A; 3UN3 A; 4M94 A; 5A8R A; 1HW9 A; 1NAQ A; 5ETT A; 1HW8 A; 4DV6 F; 4IH5 A; 3IR7 B; 2XO6 A; 3CCL S; 5BJR A; 4KIA A; 3FRZ A; 2ZHO A; 4B02 A; 3ITH B; 5HLF A; 2D9O A; 3NGT A; 3CCQ S; 5FDL A; 3ETO A; 4QR1 A; 3H0P A; 3BGR A; 2BM0 A; 3N6M A; 1RT5 A; 3J7Z T; 3BBF A; 2OPQ B; 1F3V A; 3OTO J; 4ZPV R; 4J9K A; 2G1H A; 3V81 B; 1ZPW X; 3OHB A; 2DH9 A; 3MM6 A; 1DTT A; 2MZT A; 1QDU B; 5D4L A; 1Y10 A; 2J0W A; 2X7I A; 2PMH A; 2FJX A; 4FXW A; 1TR0 A; 4ID8 A; 1SI9 A; 3TA2 A; 2L41 A; 2GC8 A; 1RQ0 A; 1RLC L; 2ASY A; 5RUB A; 2Y1I A; 4JI6 J; 1N5S A; 1QUP A; 2KG0 A; 1IM6 A; 3ZTQ A; 2HVI A; 4QBU A; 2O5D A; 4NA1 A; 2MZS A; 3DI6 B; 3Q86 A; 2MGZ A; 2HK2 A; 1YJ7 A; 3A3O B; 2OPS A; 1Y5N B; 3GR0 A; 1VHF A; 4S0M A; 2Y8Y A; 2GIQ A; 1F2H A; 4RW7 A; 3DMJ A; 5BXI A; 3H40 A; 3LP1 B; 4GKJ F; 4LF7 F; 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