The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Caspase-7
|
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| total genus |
18
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XYH B; 1SC4 B; 4JB8 B; 2DKO B; 3IBC B; 1RHK B; 2HBR B; 4ZVR B; 3D6H B; 3GJS B; 3NS7 B; 1RWM B; 1IBC B; 3EDQ B; 2XYP B; 2CJY B; 2Y0B B; 4DCO B; 1QTN B; 3R5J B; 1F9E B; 4DCJ B; 2FQQ B; 1RHU B; 3P4U B; 4ZVP B; 1ICE B; 3KJF B; 3R7B B; 2CNK B; 2H5J B; 3D6F B; 4ZVQ B; 3R7S B; 3R6L B; 5IC6 B; 1RWP B; 3GJR B; 3R6G B; 1RWX B; 1RHM B; 2H54 B; 2H48 B; 2Y1L B; 2CJX B; 3KJN B; 1RE1 B; 3EDR B; 1SC3 B; 4LSZ B; 1I3O B; 3R7N B; 1I51 B; 4ZVU B; 1PYO B; 3QNW B; 2C1E B; 2H65 B; 3KJQ B; 2H4W B; 2QL7 B; 2HBQ B; 2CNL B; 1GFW B; 1RHR B; 1RWN B; 2QLB B; 2C2K B; 2H4Y B; 1RHQ B; 4ZVO B; 2HBZ B; 1PAU B; 1RWK B; 2QL9 B; 4ZVT B; 1RWO B; 2C2Z B; 2H5I B; 1NME B; 3GJT B; 3D6M B; 1SC1 B; 4DCP B; 2C2M B; 2H51 B; 5K20 B; 2QLJ B; 3GJQ B; 2XYG B; 1RWV B; 2CNN B; 3RJM B; 5IC4 B; 2XZT B; 2C2O B; 1RWW B; 2P2C B; 3SIP B; 4ZVS B; 2XZD B; 2HBY B; 3IBF B; 2CDR B; 1RHJ B; 2CNO B; 3P45 B; 1BMQ B; 1QDU B; 2QLF B; 2QL5 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IAS 9; 3HVR A; 2HS3 A; 1N54 B; 4DL7 A; 2KG0 A; 1NUE A; 1N4L A; 1HR0 J; 4ELV A; 2HW3 A; 3RB3 A; 3M8Z A; 1HQE A; 4ELT A; 4R5P A; 2DHX A; 2K2P A; 4TYA A; 4B3S J; 2ZKU A; 5DET A; 3KXD A; 2E5L J; 1T11 A; 2XHW A; 5KFC A; 5KOW A; 4I7F B; 3G8S A; 3BGU A; 4C8O A; 3M8W A; 3OFG A; 2N4C A; 3VAJ A; 5IWA F; 4RKU C; 1MWQ A; 2H5E A; 4M5G A; 1Z4U A; 4PYA A; 3GCW P; 1ZOT A; 4USM A; 2RU3 A; 5J1E B; 3TEG A; 3N6N A; 4TLQ A; 2X1F A; 3O5T B; 4X66 J; 1GNK A; 4RWW A; 3Q86 A; 2KYX A; 1T8E A; 2F65 A; 1QSY A; 1IQT A; 4HL9 A; 5IM0 A; 2FGC A; 2XLK A; 2DK2 A; 4G1I A; 5GAH I; 1RU2 A; 4DV5 J; 2CDR B; 1TL3 A; 3OL9 A; 2JSX A; 2Z2L A; 4CH0 S; 4NLG A; 2HGM A; 4O3R A; 2EEY A; 3GFX A; 4L74 A; 1P6T A; 1XMO J; 3QPI A; 2HVE A; 2I1R A; 3HP6 A; 1VQ8 S; 2V2K A; 4HEA 9; 1RA7 A; 4J9N A; 5HQM A; 5I3P A; 2QRR A; 3VVT A; 2VZ9 A; 1M5O C; 1TKZ B; 4BWJ A; 1EAY C; 4UST A; 2Y1I A; 2EFP A; 4EWT A; 3W1Y C; 2FJX A; 1ZTT A; 3W60 A; 1AYE A; 3CCU S; 4IFV B; 2X3G A; 5CXT A; 1HNZ F; 1ARO P; 4I4B A; 2P9C A; 5CD4 A; 2OEK A; 5KT5 A; 3RBX A; 4DL5 A; 3BDE A; 1NK4 A; 2B9X A; 1RHQ B; 4M63 A; 4MKA A; 1ZM4 A; 1G7C B; 4NZ7 A; 3E2E A; 3J80 U; 2W25 A; 3SCI E; 2DNH A; 2IYI A; 1HKA A; 1W7W A; 5D4L A; 2KL8 A; 3GE9 A; 1EP4 A; 1S0V A; 2MZT A; 4ZPW R; 3G6X A; 2N7C A; 4ENO A; 5A8W B; 1OO0 B; 2ZJQ Q; 3H59 A; 3M8S A; 2RSQ A; 3H5S A; 1UWB A; 1VJQ A; 1Q81 T; 1A0O B; 1MML A; 1H38 A; 4MIW A; 2DGO A; 4ICL B; 4F7V A; 4QIE A; 4F4X A; 5A2Q Y; 4X65 J; 4LF7 J; 5LXR A; 2XMM A; 3U02 A; 4OZ1 A; 2AQ4 A; 2Y9H A; 4BWM A; 4TY8 B; 3OTC A; 1RWX B; 2B6A A; 3RUB L; 4I6A A; 2BAN B; 3O8W A; 1NJZ A; 3EXC X; 2RQ4 A; 1I3O B; 5ETS A; 4OV1 A; 5B08 A; 1IBL J; 3CNQ P; 4IDK B; 3M8P B; 3MOZ A; 4DWI A; 3VGV A; 2V0N A; 1TU0 B; 2D41 A; 4ZIV A; 2HUR A; 4OHZ A; 1N5V A; 2LEB A; 4ER8 A; 3CO0 P; 2E1R A; 1VRU A; 3M6X A; 4OHX A; 1FXL A; 1NDC A; 3SMZ A; 2EW9 A; 2AZ1 A; 3QID A; 3MPW A; 4KIA A; 3ILI A; 2KI2 A; 2AEM A; 2ASY A; 3MEG B; 3CCZ A; 2OFG X; 3I9V 9; 4NA2 A; 3EGZ A; 1SC4 B; 1B99 A; 3DXS X; 1PG5 B; 3FCW A; 2IJF A; 1BY9 A; 1UW4 A; 4DFJ A; 3TQE A; 3SSR A; 1UL3 A; 1PCA A; 2FZC B; 3QIP A; 2MQL A; 5LXY A; 3C6U B; 4R25 A; 3G86 A; 1ELO A; 2XY5 A; 1PYS B; 3PR5 B; 3POT B; 3A8J A; 3GB0 A; 1YTY A; 1DUR A; 1NJW A; 4O0I A; 2PII A; 4KGV B; 2D74 B; 2WSC C; 3B6B A; 4J9P A; 3OR1 B; 3M2R B; 2PMW A; 4C8M A; 2EI5 A; 3J81 j; 2UXC F; 5KFA A; 4LRE A; 2RIL A; 5LSL A; 3GP9 A; 1RWV B; 5D0E A; 2GW8 A; 2HQD A; 1FEE A; 4R8U B; 4JV2 A; 2OPP A; 3SIP B; 4IRD A; 3IRX B; 5T41 A; 2PFF B; 4FXV A; 2XSJ A; 3SQG A; 5IT4 A; 2UUA F; 2E1A A; 2VKR A; 4A8F A; 1FJE B; 5ETP A; 4W90 B; 1DTT B; 2DIU A; 4DR3 J; 1RB0 A; 4OZ2 A; 2C3U A; 3TA0 A; 2QZ8 A; 2HQF A; 4NEZ A; 4MKY A; 3CDB A; 3NS6 A; 2ZM6 J; 2ATC B; 5B0F A; 4ECZ A; 5E3Q A; 2NS1 B; 3GV8 B; 4MIA A; 3OVB A; 2LVW A; 5G0R A; 5H9E K; 4EO6 A; 4LVN P; 1VQM S; 4PPZ A; 4AQY F; 2XLJ A; 2GA7 A; 4HYK A; 1QE1 A; 1DLO A; 1NBE B; 2IM2 A; 4P6Q A; 3IS9 B; 1HWU A; 4U95 A; 5HP1 A; 1S1T B; 4Y2I A; 1N34 F; 1RP5 A; 4ID5 A; 2ADC A; 2CA9 A; 4CDI A; 1DQA A; 2FZK B; 5HRO A; 1ZM2 A; 3AQP A; 2AKW B; 3TX0 A; 2CNO B; 2G1H A; 3UR3 C; 5J2N A; 4O4R A; 1IJE B; 3PEJ A; 4TNO A; 4RNO A; 3FBB A; 2YNF A; 4U9R A; 4AL6 A; 2P5V A; 1MMD A; 2UVW A; 2RQK A; 3PHE A; 1U09 A; 2YPY A; 2VOP A; 1EX8 A; 5IWA J; 4QU6 A; 3MED B; 3MM9 A; 4Q0B A; 4KPC A; 5AXK A; 5J2Q B; 2OPR A; 3Q8S B; 5EWE A; 5IC6 B; 1YZ7 A; 5E0O A; 4OI1 A; 4PXC A; 4F4A A; 4XTT A; 4LT6 A; 2KJW A; 3MUM P; 4UOH A; 4IOC Q; 5E7O B; 5E3C A; 1M90 T; 1H74 A; 2R8K A; 4C9D A; 4P7T A; 3CJS A; 3OVA A; 2VPY B; 2XMU A; 2KJV A; 4P2X A; 3M4X A; 1Q86 T; 1XQI A; 2GMH A; 4DDF A; 1FNM A; 2R2R A; 1OWX A; 2IDE A; 4K2J A; 2C3Y A; 4I2Q B; 2VBY A; 1WHX A; 2NXE A; 1EET A; 3D54 A; 2DNQ A; 4DCP B; 3CJ8 A; 3DNC A; 1N56 A; 4ED6 A; 1ZH5 A; 2QGF B; 3P6Y C; 4TQR A; 5KAK A; 2HZV A; 1H0H B; 2OKQ A; 1X4C A; 4GC6 A; 2UP1 A; 4S0M A; 2DGW A; 4DQQ A; 2MYF A; 4BDP A; 2VPX B; 2E5I A; 1HMV B; 3CIZ A; 1JKH A; 3AA8 A; 1D09 B; 3C14 B; 2P6T A; 4HTI A; 3OR2 B; 4AND A; 1P1T A; 4X4P A; 3NMA A; 4DV0 F; 3MCN A; 4F50 A; 4DV4 F; 4I2P B; 1U25 A; 2VH7 A; 3D4J A; 1KVK A; 4B9M A; 3ZNU A; 1BQN A; 4TU9 A; 1FE0 A; 3KJQ B; 4KGZ B; 3DDK A; 1UJ5 A; 1UWA A; 5I3U B; 3MI7 X; 2AJF E; 2B9E A; 4OZN A; 2L48 A; 2XGQ A; 3OLB A; 3TWZ A; 1VS3 A; 2HGL A; 4K4U A; 2M70 A; 4NWB A; 1S0O A; 4YB1 P; 2AJQ A; 3X1L B; 5HVG A; 2F8M A; 2OSQ A; 2P8I A; 2L3M A; 4H4K A; 1TK5 A; 2CZ9 A; 1N6Q B; 3ENA A; 1CBK A; 4YR3 A; 3BN4 A; 4QWB A; 4URG A; 3WZ0 A; 3BQ0 A; 2ZH6 A; 4OHV A; 1V5I B; 2QFJ A; 1J2V A; 1HQ2 A; 3MUV P; 4A4J A; 1S1U B; 4ZVQ B; 2BW2 A; 1YWX A; 4CLP A; 3WQP A; 1HPZ A; 2CYY A; 2ZBC A; 2GZO A; 4DEZ A; 1LWF A; 1HNV A; 3JYT B; 4M5I A; 4DSI A; 4LSZ B; 4B9L A; 2WTF A; 2IC3 B; 2F9D A; 1DFD A; 2R4F A; 2UU9 F; 1R8P A; 1WG4 A; 2H4W B; 4OX7 A; 2E7V A; 1HAR A; 4YB6 A; 1RTD B; 2ZFH A; 2RUS A; 4F26 A; 1TVR A; 1RWO B; 2ILZ A; 3KG4 A; 4OMF G; 2O01 C; 4Y2K A; 2KKH A; 3OXL A; 4HR2 A; 1M5K C; 4MFB B; 5LSO A; 2FVQ A; 2XMW A; 2CQ1 A; 4XPE A; 2LXF A; 2V8V A; 2MTL A; 1PAE X; 4FXW A; 3Q8Y A; 3LGN A; 2CIM A; 4HVZ A; 2HQ3 A; 1KKH A; 4OI0 A; 3PV8 A; 2XYP B; 1TL3 B; 1DHM A; 1WOP A; 1LWX A; 3OFH A; 2VA3 A; 3F56 A; 4Y2A A; 1BLU A; 4ZVF A; 1DQ8 A; 1NSP A; 3B4D A; 3S6E A; 1TV6 B; 2HHQ A; 2BJ1 A; 2WON A; 1FJC A; 3SCL E; 2AW0 A; 2UXC J; 1VIO A; 1R27 B; 1Q8L A; 4DF8 A; 1Y7P A; 2YQ1 A; 1URN A; 4WFZ A; 4LMZ A; 4KO0 A; 1V3R A; 4A8K A; 5FDL B; 2VIC A; 4DR1 J; 1SKW A; 2UUA J; 4LR7 A; 3LF0 A; 3G71 S; 3VAL A; 2KVI A; 3ZTS A; 3NMR A; 3ENV A; 2V68 A; 1RDR A; 2MDA A; 1XMB A; 1I1G A; 3D28 A; 1B0V A; 3EPI A; 1UKU A; 2W2N P; 2YWF A; 4FN5 A; 5D0H A; 2VQE J; 1OSD A; 3MGJ A; 2XO6 A; 2LA6 A; 1HNX F; 2BA9 A; 5HO4 A; 1YK9 A; 4AQY J; 3BB5 A; 5F8H A; 5THW A; 2I5J A; 3U27 A; 4PKD B; 3ZZU A; 1EB0 A; 2RB7 A; 4RL1 A; 4ZP7 A; 4F4K A; 4O0N A; 1UMJ A; 4YEA A; 4PCQ A; 4ECV A; 2CPD A; 3KDO A; 1UWB B; 5LOQ A; 1JX4 A; 4A8W A; 2RT3 A; 2ZH9 A; 4JP8 A; 5KOX A; 1UZH A; 5ITH A; 4FVC A; 3CTR A; 1YGY A; 2YKA A; 2H54 B; 4LRC A; 3BV8 A; 3J7Y U; 3KLE B; 3PVX A; 2CJ9 A; 4KTQ A; 4NLP A; 3CJ4 A; 1I51 B; 2BJE A; 3BPS P; 2HFS A; 2VBX A; 4ZVH A; 1UEU A; 3H2L A; 1Y00 A; 3D2W A; 3A8K A; 5ETQ A; 2QLB B; 4UW2 A; 5EHH A; 1LXN A; 1NH7 A; 2JX2 A; 1RWK B; 5IV4 A; 3DLJ A; 4U8Y A; 2IAJ B; 2V2Q A; 3I32 A; 2PA3 A; 3EM1 A; 3BSO A; 4USV A; 4P75 A; 3FBF A; 4R0J A; 4LF2 A; 4JI8 F; 4YS2 A; 3C15 A; 5L8R C; 1U4B A; 5IS2 A; 1ZZF A; 2BQ3 A; 3MM6 A; 1YJW S; 1PYT A; 2DHA A; 1R0A A; 2VON A; 3LP0 B; 2LEC A; 1G2E A; 2XQC A; 1CJU B; 5GMD A; 1SXL A; 3VGS A; 2KFN A; 1NZ8 A; 4F2R A; 5IFM A; 3UR0 A; 4QIV A; 1RZM A; 3MCS A; 4PPD A; 4FKY A; 3KK3 A; 3K57 A; 4X84 A; 5EX3 A; 2F1F A; 2DNY A; 3M2U A; 3M9M B; 1HHQ A; 2DR7 A; 1PBA A; 4YDX A; 1FKO B; 2XSF A; 1H73 A; 3D3C J; 1WC0 A; 5ETN A; 2ACM A; 4ITS A; 1EJ7 L; 3CCW A; 3R7N B; 1RBO B; 2YX4 A; 2CQ0 A; 3H0P A; 2OFH X; 1Z1Z A; 4OZ5 A; 1KTV A; 3MCO A; 3O1L A; 4DS5 A; 3KLI A; 5B0G A; 3CSK A; 2R2U A; 2ZWO A; 5GAG U; 4O44 A; 4K7Q A; 2BE7 D; 4C48 A; 4B3M J; 5DG9 A; 4FPR A; 2CFX A; 1TEL A; 3E3X A; 1T7P A; 2FGO A; 1D3W A; 1C4C A; 2MKS A; 2V9K A; 2YPZ A; 4DV4 J; 2EFO A; 3DLG A; 4N41 A; 4DN9 A; 4DQS A; 4DL3 A; 3VV2 B; 2OPP B; 1SQG A; 3D9B A; 2YNG A; 1RCX B; 1UJ6 A; 5HVF A; 4K4Z A; 1D8Z A; 1TFY A; 2J7K A; 3HK2 A; 1SC6 A; 2L08 A; 2XSJ B; 3KJF B; 3D0I E; 3FRZ A; 3OT9 A; 5MAO A; 2R3V A; 2BE9 B; 3R5C A; 3H25 A; 1R31 A; 3NNH A; 3J7Z T; 2CJX B; 2DHS A; 2Z0G A; 4LSL A; 1Y4Z B; 4U7U D; 4A8Y A; 1M1H A; 4KHP F; 1FEH A; 1RT2 A; 4ZJL A; 2U1A A; 1X9S A; 1NHV A; 2ZBI A; 1K1S A; 4FBT A; 5AXN A; 1V5V A; 3AB4 B; 3TUJ C; 4DV2 F; 1XNR F; 3PCO B; 1DLO B; 4P74 A; 2CQG A; 1YRX A; 3Q8V A; 3MEC A; 2F3J A; 5HP1 B; 4RNN A; 3GG0 A; 1FRH A; 3N0V A; 1TFW A; 2HRY A; 3SYZ A; 4ID5 B; 4BC7 A; 3VAK A; 1DQ9 A; 2YWW A; 3HJF A; 4EBD A; 1R7I A; 5HRO B; 5DZ6 A; 2BM1 A; 2UU9 J; 3I82 A; 1XC9 A; 2QYG A; 3W5X A; 2ZDP A; 1EHW A; 5E41 A; 5J2N B; 1IVZ A; 1FNO A; 4GRS A; 1ICE B; 2YNF B; 2DY9 A; 2POK A; 4DG1 A; 2BXJ A; 1UCN A; 2F9J A; 5KG5 A; 3ZNJ 1; 4J9O A; 2OPR B; 4Y65 A; 1IN0 A; 4XPC A; 5H9F K; 1TMJ A; 2M4M A; 2VD3 A; 2YWG A; 3S01 A; 1S1X A; 2QA1 A; 2HND B; 4YR2 A; 2R7W A; 2MGZ B; 3DGP A; 1VC5 A; 3SDE B; 4ZPC A; 4WBF A; 3CJT A; 1VHF A; 3TVY A; 2F4F A; 4ZP6 A; 2CJB A; 1YSJ A; 4RR5 A; 4ZN1 A; 2VFU A; 5KFP A; 1DJ0 A; 4DLE A; 4Z2X A; 2ZHO A; 4ZLP A; 2OI2 A; 2MQ8 A; 2O1P A; 4GVL A; 4JUZ A; 2ROP A; 3WX4 A; 2YNH A; 4RJV A; 3KFW X; 3QT7 A; 4QZV B; 4MKB A; 2IPO B; 9ATC B; 3CMQ A; 4LRF A; 3ENQ A; 1TKX B; 4GO5 X; 2W9B A; 1RAD B; 4AYB D; 1JKH B; 2FHK A; 3FMB A; 5IZH A; 3E01 A; 1Q5V A; 1S0M A; 3BEG B; 4NLO A; 1NKB A; 4GMK A; 4CNY A; 2VFS A; 4QQB A; 4ATN A; 1HQU B; 2BKN A; 1MRO A; 2DNN A; 4URS A; 1WOR A; 1Z2Z A; 2DGU A; 2EFN A; 1BQN B; 1HNX J; 2RDI A; 3L7P A; 1HWJ A; 3U1M A; 1S7I A; 2KRB A; 1S10 A; 1XBW A; 1QSS A; 2OJ3 A; 1WC1 A; 3JSM A; 1X8D A; 5DJB A; 2P2C B; 3CJR A; 3NL0 A; 2IBO A; 3FFI A; 2GML A; 1VC6 A; 2IA6 A; 1QUV A; 2DNL A; 3RR8 A; 2QO3 A; 1VQN S; 3A3N B; 4PRF A; 2B43 A; 1B0T A; 2W2O P; 3D6H B; 2M88 A; 1X5S A; 2BMB A; 3D1Q A; 2UUC F; 2Q6C A; 2I6W A; 2BQR A; 4K59 A; 5H9E J; 5KFL A; 3JAM Y; 1KLM A; 3D66 A; 1P8G A; 2RD5 C; 2AYB A; 1UTA A; 4NCG A; 2J7W A; 1SQE A; 4FBU A; 7FDR A; 2HIQ A; 1RAH B; 2PC6 A; 2CQC A; 5AT1 B; 5KG4 A; 1WOS A; 2J5A A; 4JI8 J; 2YKM A; 3TVZ A; 1S4E A; 2HFZ A; 1YHQ S; 4UY8 5; 3OPK A; 4P72 A; 3AOD A; 4ZVT B; 2XMT A; 4CT8 A; 1RXO B; 2CQ3 A; 3C3L A; 2HAF A; 3N5B A; 3DRY A; 2QLJ B; 3SCJ E; 2Z2Z A; 1YJT A; 2CJK A; 2UV8 G; 3ETM A; 3W3S A; 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