The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| total genus |
18
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y0B B; 2QLB B; 1RWV B; 2CNO B; 2HBR B; 1RHU B; 1I51 B; 2H4Y B; 2H5I B; 3GJQ B; 2HBY B; 1SC3 B; 2CNL B; 4ZVU B; 2QLF B; 2CJX B; 2P2C B; 3IBC B; 1I3O B; 1F9E B; 3GJR B; 4ZVR B; 3KJN B; 3SIP B; 2QLJ B; 3D6F B; 1SC1 B; 1RWM B; 2H51 B; 3D6M B; 3NS7 B; 1GFW B; 2DKO B; 3R7S B; 2CNN B; 4DCP B; 2FQQ B; 4DCO B; 2H65 B; 1RWP B; 2QL5 B; 3R6L B; 2QL9 B; 3KJQ B; 3R7N B; 5IC6 B; 3P4U B; 2H54 B; 1QDU B; 1RHQ B; 1RWO B; 1RHK B; 1IBC B; 1RE1 B; 1RHJ B; 3EDR B; 2C2M B; 2CJY B; 2C2O B; 4ZVQ B; 3R7B B; 3R5J B; 2XYP B; 2Y1L B; 1RWK B; 3RJM B; 1SC4 B; 1RHM B; 2QL7 B; 2XZD B; 3GJT B; 3EDQ B; 3D6H B; 4LSZ B; 3IBF B; 2C2K B; 3P45 B; 1NME B; 1RWN B; 2H5J B; 1RWX B; 3KJF B; 1BMQ B; 2H4W B; 1PAU B; 4ZVS B; 4ZVT B; 2C1E B; 4ZVP B; 2CNK B; 2H48 B; 2HBQ B; 4JB8 B; 1PYO B; 4ZVO B; 1ICE B; 1RHR B; 1RWW B; 4DCJ B; 1QTN B; 3QNW B; 2XYG B; 2XZT B; 5K20 B; 2C2Z B; 2HBZ B; 2CDR B; 5IC4 B; 2XYH B; 3GJS B; 3R6G B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BC6 A; 4O3Q A; 1MN9 A; 5L8R C; 1YZ6 A; 1NSQ A; 2RKI B; 2V68 A; 1S49 A; 1OSD A; 1QAY A; 2QLF B; 1EKS A; 4TN2 A; 3HD1 A; 2YWF A; 2PT0 A; 4J9O A; 1NHK L; 2MGZ A; 3AXK A; 1Y3K A; 2WVD A; 1IKY B; 4DX8 H; 4S0M A; 2X7I A; 4JI4 F; 3OR1 A; 3GII A; 2FY8 A; 4B3S J; 2LLZ A; 1LFW A; 3UVJ A; 2NUH A; 1U0H A; 3B78 A; 1HW8 A; 2VZ9 A; 3NY0 A; 3IR5 B; 3MDF A; 3HPO A; 2VOO A; 4K5S A; 3N9U C; 1KWM A; 1YTY A; 1N5T A; 1T94 A; 1M1K T; 3A8E A; 2MY7 A; 2MZQ A; 2B6A B; 3HO1 A; 3LO3 A; 4C8N A; 4A48 A; 3AB4 B; 5FLX U; 2V34 A; 2R9L A; 2J8A A; 1N32 F; 2UUA J; 2CPZ A; 4LBH A; 1VHF A; 1AUD A; 3M32 B; 4LT6 A; 3T5H A; 2CAD A; 3GJS B; 1NKB A; 2RF2 A; 3ET6 B; 1S9G B; 1TZ0 A; 2ZH1 A; 5KFP A; 5A6W A; 5GAH U; 1JLQ B; 4PUO A; 1BQM A; 2WB4 A; 8AT1 B; 2HHV A; 3CJS A; 3T1Y J; 1IR1 A; 4CLF A; 3NNH A; 1KLM A; 3HP6 A; 1RWM B; 1SKS A; 1OYD A; 4J9M A; 4JV5 J; 4F4Z A; 3Q86 A; 3U02 A; 1FXR A; 2RQK A; 4WIQ A; 3K57 A; 4DF8 A; 2I1R A; 2I2Y A; 1F5C A; 4J37 A; 1YX2 A; 2UVR A; 1LK7 A; 3L4B C; 4J9K A; 3DOK B; 4GKJ F; 3E01 B; 4I0W A; 2RIJ A; 1OS5 A; 2Z8Q A; 1KBR A; 1SC6 A; 4WFA Q; 4EWT A; 2XUL A; 2VBY A; 4AYB D; 2JC0 A; 3DLK A; 4J91 A; 2QFI A; 1N34 F; 1CG2 A; 4YUD A; 2V63 A; 2EEY A; 5L38 A; 5K9F A; 2IDE A; 2NYH A; 3HXM A; 4NE9 C; 4AUK A; 2R7Q A; 3H5U A; 3JB9 k; 2N4D A; 1FFG B; 4KQZ A; 2C3P A; 1PYT A; 2HHH F; 2CQD A; 3CJ0 A; 2W2O P; 4RNO A; 3CO9 A; 2RRA A; 4QR1 A; 2P8I A; 3NS7 B; 1RT2 A; 1TVR A; 2AZ1 A; 1QSL A; 1H2T Z; 3DMJ B; 1NJZ A; 4ECV A; 1NXI A; 3IRW P; 3ZNJ 1; 1S10 A; 3G6V A; 1QE1 A; 3K2Y A; 1H7X A; 2OPR B; 4X62 J; 2JLF A; 1BE4 A; 3UN5 A; 1T03 B; 3FRZ A; 4B3R J; 4KTQ A; 4K4W A; 3VZH A; 1LEO A; 3K58 A; 4DPW A; 5HQM A; 1VQO S; 3TUP A; 4F3M A; 2BA9 A; 2CFX A; 3O1L A; 2YKN A; 4JI2 J; 4C97 A; 3VAF A; 5A6P A; 2B5J A; 4O0I A; 5K20 B; 2VKR A; 1TL3 A; 4JYA F; 2ZKU A; 4J9V A; 1HL6 A; 3DU5 A; 3R2D J; 4OYP A; 2ZD1 B; 4RW4 A; 4ENO A; 1HI8 A; 4PG6 A; 3MEE A; 4N7T A; 3MEG A; 2GQ2 A; 3PEH A; 3CC4 S; 3A8K A; 2Z58 B; 1W2I A; 2BAN B; 1WDT A; 1IR2 A; 3HCX A; 4P73 A; 2LEP A; 3M1V B; 5JUM A; 3D1O A; 2OPS B; 2IYG A; 3Q2S C; 5J1P A; 3TNV A; 2D1C A; 4IUF A; 2RDJ A; 4YQW A; 2XY6 A; 4BC7 A; 4KYZ A; 4R8U B; 5LMN F; 3CDA A; 3ONQ A; 2QYG A; 1QM9 A; 2C2O B; 3NEK A; 3QRR A; 3KOA A; 1VLY A; 3CDW A; 3HHL B; 4WK3 A; 2MQN A; 1B0P A; 5JMN A; 3FJ2 A; 3QAU A; 4WP3 A; 2P9C A; 3T9N A; 4U96 A; 3K5O A; 1BWE A; 3KLE B; 3KLF B; 2OH2 A; 5IZH A; 4RW8 A; 2MQ8 A; 2ASD A; 3W8P A; 2XM3 A; 3PR5 B; 4QIF A; 3THT A; 2DY1 A; 4WTY A; 2J5A A; 2NZC A; 1U7L A; 5AXN A; 1XMO F; 4KY3 A; 4WE1 A; 4EZ6 A; 3VQT A; 4OQJ A; 1TR0 A; 3UN3 A; 5DQI A; 1VRT A; 1Y3J A; 4K4X A; 4ITS A; 2H4Y B; 1VI7 A; 3PRV A; 4QWE A; 2LKZ A; 4MJK A; 4LSL B; 3C6U B; 2LEC A; 4PEO A; 4PXD A; 3D2W A; 2MSS A; 3IGN A; 4LF7 J; 3HVA A; 2IA6 A; 2EG1 A; 4X65 F; 4F8R A; 1VBK A; 3PYF A; 3D3C J; 2F1F A; 1HKA A; 2XMV A; 4DV5 J; 3FGV A; 4WYW A; 5HMX A; 1R0A B; 1ELO A; 1K0T A; 1JLG A; 1GXT A; 2OTJ S; 3POT B; 1WTB A; 4LRE A; 1N5Y A; 1XMQ F; 4NXN F; 5D4L A; 1AZS A; 1FO1 A; 1CJK B; 3SV3 A; 4WFZ A; 4NA3 A; 3C19 A; 4P2M A; 3UI3 A; 2HK3 A; 2HNY A; 1RWN B; 1U45 A; 2CIM A; 3OT9 A; 2ZIT A; 1D9D A; 1TU0 B; 2E1M C; 4KSE B; 5C5J A; 4MIA A; 4X4O A; 3TZY A; 2FJD B; 1NK6 A; 4FNH A; 1WEZ A; 1YKW A; 3EE3 A; 4XAK A; 1KNZ A; 5I42 B; 2N7Y A; 3MR3 A; 3QJJ A; 3L7U A; 4I2P A; 5DLG A; 2BRL A; 4RBU A; 2WRM A; 4L74 A; 4TQS A; 1AA1 B; 3G9C A; 1F9H A; 3WZ0 A; 2P2C B; 3GV7 B; 1CVJ A; 2BKP A; 1E6V B; 4XDC A; 3HFV A; 4I6A A; 2KHC A; 3NMR A; 1ZAV A; 1PCA A; 3DLB A; 3CB4 A; 1D8Z A; 1HLW A; 4PG8 A; 3W2V A; 3H5S A; 1I94 F; 2YH0 A; 3MR6 A; 3T1H J; 1XTZ A; 3P8B B; 1FJG J; 1FEH A; 1Q5Y A; 4C3K A; 3G6X A; 4DV4 F; 4C7Q A; 1AB8 A; 1XR5 A; 2V8H A; 1HI1 A; 3AA9 A; 1FTC A; 4EU0 A; 1X7V A; 4LBI A; 1SJQ A; 5E5N A; 5L9N A; 2FDN A; 5BR8 J; 4ILL A; 5DLF A; 1JXV A; 3KLV A; 1V3S A; 1UJ5 A; 3DKD A; 4LSN B; 1S1V B; 1R7I A; 2HQD A; 4JI0 J; 2IY5 B; 4CRJ A; 5E3P A; 2LFV A; 1NDK A; 4PWD A; 3BGR B; 2XMA A; 3U1L A; 3HHK A; 1I6J A; 4X64 J; 2V2K A; 4CLK A; 2DYA A; 3TR5 A; 5JVG Q; 1T9W A; 2JVR A; 1FXL A; 2EXU A; 5AXM A; 5LL6 d; 5B0D A; 3CCQ S; 4F4W A; 2YNH B; 2KFY A; 2GHW A; 1N5V A; 1NEE A; 1Q8L A; 1TTH B; 5A8R B; 2BDP A; 1X4C A; 3BRE A; 1OY6 A; 1ZS6 A; 4HHH A; 3BZQ A; 3CJK B; 3JAM Y; 1Y0H A; 2BJ9 A; 3DNC A; 1S1U B; 2KL8 A; 2XZD B; 1Z4U A; 3MPU B; 1XN9 A; 2KKH A; 4DX7 A; 2IBK A; 3PW0 A; 3RB0 A; 4DS4 A; 5BYR A; 4QZV B; 2YNF B; 2EKN A; 4KFB B; 3V4M A; 2HEK A; 1E6Y A; 3C6T B; 4R25 A; 3PKY A; 3M05 A; 4AQY F; 3PW7 A; 3GQC A; 3K89 A; 2IDL A; 1TKZ A; 4BDP A; 3C16 A; 2GAH C; 3V4I A; 3U1N A; 4HI1 A; 2IIH A; 4XDD A; 3DLE A; 3W8G A; 5ETK A; 1XNQ F; 2ZBI A; 2AGP A; 3U1M A; 5C42 B; 1VQK S; 5E2Q A; 1W7W A; 2KFZ A; 3CCV S; 4LRF A; 4GO7 X; 2EG2 A; 9ATC B; 4TYA A; 5FJ4 A; 4YHH J; 2G2O A; 2M52 A; 1DTT A; 2OP5 A; 4EFA C; 2FHJ A; 1FK9 A; 2KRR A; 3DN9 A; 5HO4 A; 4P74 A; 4TU8 A; 5HMY A; 2CJY B; 3DI6 B; 4PYD A; 5EWE A; 4URS A; 2ZH4 A; 1OMS A; 2UXD J; 4CLL A; 1RHM B; 1NBE B; 2GMJ A; 3GMG A; 3VQS A; 4N41 A; 2HHP A; 1N33 F; 4DV2 J; 2IAJ A; 4MYT A; 3MD1 A; 3EZ5 A; 2IC3 A; 2IVY A; 1TMM A; 2QX0 A; 1SQG A; 3PTW A; 2E5H A; 4KPY A; 4DV6 F; 4QWC A; 3NGT A; 3MAQ A; 3I32 A; 1VK8 A; 1HWK A; 3KLH A; 4I2Q B; 1EHW A; 5L39 A; 3GIJ A; 2DH8 A; 2J0X A; 2PMW A; 4LQ9 A; 2Y1J A; 4LIW A; 4USJ C; 2OI2 A; 1EQ0 A; 2JRS A; 2GW8 A; 4X66 F; 3CCM S; 2F63 A; 3CMA S; 2GMH A; 1RTI A; 3LGM A; 4CH0 S; 1WSR A; 4NZ0 A; 3FBB A; 2F3J A; 4DQQ A; 1OJ4 A; 1FX4 A; 3M2V B; 3NMA A; 1WHX A; 1CJT B; 1HNV A; 4ZVE A; 4J9U E; 4XPC A; 1PGZ A; 3RRG A; 1UEU A; 2W9B B; 2CJA A; 1C0U B; 3ZXW A; 1VQ9 S; 1T9U A; 4CO4 A; 1L3T A; 1REV A; 5D3G B; 3H4D A; 3RTV A; 3HK2 A; 1RDR A; 3KYL A; 1Q5V A; 5D8H B; 1S48 A; 5DG9 A; 1GT8 A; 1M1H A; 2W8K A; 2K8G A; 2E1A A; 1WC1 A; 1V6H A; 2KHD A; 2LMI A; 2JFK A; 3ICL A; 1UWA A; 2W01 A; 2KJW A; 3C66 A; 4E0D A; 1JJ2 R; 2LU2 A; 4KV8 B; 1Q7L B; 1XMQ J; 4ZPT R; 2YX7 A; 1DHM A; 1RTH A; 4KB7 A; 2I5J A; 4ECW A; 2EFN A; 4Q8F A; 2ZM6 J; 1TL7 B; 2OJ3 A; 4DR1 J; 3FUY A; 4KHM A; 1S6P A; 1UFL A; 3KJN B; 5E3C A; 4A8X A; 1RI7 A; 2G9O A; 4O0N A; 1GAO A; 2PMH A; 4Z7Y A; 2PEH A; 3QT8 A; 4ILR A; 3DRS B; 4OYW A; 2KT5 A; 4DSL A; 2AEF A; 4CQ1 A; 2ATL A; 1XC9 A; 4PCQ A; 2BBE A; 3W2W B; 4ZIW A; 3IR6 B; 3MD3 A; 2MQL A; 3DLH A; 4O4G B; 2JH3 A; 1J2V A; 3J7Z T; 3CJR A; 1LK5 A; 5CD4 H; 1TKT A; 2CQG A; 1ZM2 A; 4LF8 J; 2WVB A; 3A1Y G; 4IDK A; 4TKT A; 1VQ7 S; 3T9Z A; 3EGW B; 2N3L A; 5HAN A; 3HHL C; 5GAE U; 1H74 A; 1BUX A; 2Q66 A; 5I4M A; 3BPS P; 1RWX B; 1RT3 A; 5FDL B; 4EI2 A; 2NR0 A; 1RCO B; 4DDF A; 3UDL A; 2UXC J; 5HBM A; 3G71 S; 1G7C B; 2J6T A; 3MED B; 3T1A A; 3V81 B; 2OIH A; 4Q2M A; 2YBV A; 4FF4 A; 4OLP A; 3CDU A; 4X4U A; 2ILY A; 4DCJ B; 3FEX B; 3TEG A; 2APO A; 1WAC A; 1A0O B; 2WVE A; 3T6J A; 4WKY A; 4NXM J; 4C2M A; 2GVD A; 2E66 A; 5C7P A; 4DL0 C; 1IWG A; 4FXW A; 5D4O A; 1UL3 A; 2H3E B; 4JI3 J; 1BHN A; 3ILL A; 4Y6I A; 3A12 A; 3EGV A; 3GYN A; 3ENV A; 1S72 S; 1IR0 A; 2X1G A; 1HPZ A; 3THP A; 3LPE A; 2J7U A; 3I0S B; 3ZZU A; 1S6U A; 1QDU B; 3RW6 A; 1SV5 A; 3SSR A; 1HHS A; 1JNZ B; 1FRK A; 5KG2 A; 5K8N A; 2PE8 A; 3D54 A; 1VBY A; 2JNJ A; 2IA0 A; 5LSL A; 2VA3 A; 2CQC A; 4RPF A; 2PGC A; 4I68 A; 1D9A A; 2DR8 A; 2HUR A; 4F4K A; 1RT5 A; 4DOZ A; 3QT6 A; 1Q86 T; 4E98 A; 1Z1Z A; 2YXL A; 4B3O A; 4DV3 F; 1RK8 A; 2XCA A; 5J2N B; 3I5C A; 2HZC A; 3GFH A; 2FVC A; 1VRU B; 4YME A; 4FYX B; 3H5Y A; 2RRN A; 4N77 A; 2DHH A; 3BEG B; 1S76 D; 4P2S A; 3F44 A; 3H7H B; 3R27 A; 2W7P A; 1T05 B; 4DFM A; 3GP9 A; 1S1T A; 3KNG A; 3JQM A; 1YDL A; 1UA0 A; 4LF9 J; 1IKX B; 4AQY J; 2KXN B; 5C24 A; 5D6G A; 1UZH A; 3NCP A; 2FVP A; 3I56 S; 5CHC B; 2B9Y A; 2C28 A; 2E1P A; 1WF0 A; 1S7I A; 4DG1 B; 1GNK A; 1SQF A; 4DQR A; 1PO6 A; 3TAR A; 1P9Y A; 4OJG A; 4OHZ A; 3M8W A; 1OY9 A; 2HQ3 A; 4HT7 A; 2KG1 A; 3SCL E; 2POK A; 1WNE A; 3K8W A; 1XR6 A; 3CJ3 A; 2E7X A; 4FNI A; 2JL9 A; 4OI4 A; 1S0O A; 4CLZ A; 3MMJ A; 2Y8Y A; 3LP1 A; 1PJ6 A; 3H98 A; 2RRB A; 1R8B A; 3GV8 B; 3PHT A; 2DIT A; 1SH2 A; 4JI8 F; 1RT1 B; 4DV1 F; 1JNR B; 2XYH B; 2DRB A; 2KT3 A; 3V6D A; 4FF1 A; 1N33 J; 3W65 A; 1ZZF A; 4LVN P; 1HNX F; 1FNO A; 3OL8 A; 3HKW A; 3M8S A; 5THW A; 1B0T A; 3PYG A; 2XWY A; 1CLF A; 3G82 B; 1C1B B; 4KRW A; 1HBO A; 2E5I A; 1Q16 B; 3ZZT A; 5IWA F; 2JEF A; 3UCU P; 2CZ4 A; 3QIP A; 1JMT A; 3I82 A; 1U1K A; 3GCW P; 4UF4 A; 2A6O A; 2J7K A; 4NL5 A; 4OIX A; 5JVH Q; 3G8Q A; 5DQH A; 4YP3 A; 1CJU A; 4OYA A; 1UW9 A; 4DUZ J; 1FRM A; 3OSN A; 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