The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
88
|
structure length |
88
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Chain Sequence |
TRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The three-dimensional structure of caspase-8: an initiator enzyme in apoptosis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CASPASE-8 ALPHA-CHAIN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
|
| chains with identical sequence |
D, F, H, J, L
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.61: Caspase-8. |
| pdb deposition date | 1999-07-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DCP B; 1ICE B; 2HBQ B; 3KJN B; 1RHJ B; 1RHQ B; 2C2O B; 2QLJ B; 1RWM B; 2XZD B; 2XYH B; 2C2M B; 1SC3 B; 1RWK B; 2Y1L B; 5IC4 B; 1I3O B; 1RHR B; 2C2Z B; 1RHK B; 4LSZ B; 2QLB B; 3GJS B; 2H4Y B; 2HBZ B; 4DCJ B; 3NS7 B; 4ZVS B; 3EDQ B; 4ZVQ B; 1RWX B; 3D6F B; 2CNL B; 3SIP B; 2H48 B; 1NME B; 1RWO B; 1F9E B; 3R7N B; 4ZVR B; 3QNW B; 3EDR B; 3D6H B; 3KJF B; 1SC1 B; 3GJT B; 3IBF B; 1GFW B; 2H5I B; 3GJR B; 4DCO B; 2H5J B; 3RJM B; 2QL9 B; 4ZVT B; 3R7B B; 4ZVO B; 2CNN B; 2QL7 B; 2CJY B; 1RHU B; 1IBC B; 1RHM B; 2CDR B; 4JB8 B; 5K20 B; 2H51 B; 2Y0B B; 2QLF B; 2XYG B; 1QTN B; 3R5J B; 4ZVU B; 1PAU B; 2CJX B; 3IBC B; 2DKO B; 2P2C B; 2H65 B; 3R7S B; 3D6M B; 2XYP B; 2CNK B; 1SC4 B; 1RWV B; 1PYO B; 2H54 B; 3P4U B; 2HBR B; 2FQQ B; 1I51 B; 4ZVP B; 3KJQ B; 2HBY B; 3GJQ B; 2XZT B; 1RE1 B; 2CNO B; 1RWN B; 3P45 B; 1RWP B; 1QDU B; 2H4W B; 5IC6 B; 3R6L B; 2C1E B; 2C2K B; 3R6G B; 2QL5 B; 1RWW B; 1BMQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LAL A; 4ELV A; 1TL1 B; 2LEA A; 2HFS A; 3HJV A; 2E5L F; 2MKK A; 3UO0 A; 3RG6 A; 3QMQ A; 2OD4 A; 5G0R B; 2IHR 1; 4WYL A; 3SQG A; 2BE9 B; 3LH2 S; 1XTZ A; 4DPY A; 2XZW A; 3Q8Y A; 2L41 A; 3GZ7 A; 1PJ6 A; 1XR7 A; 2RDD A; 2GQC A; 5KOX A; 4MYT A; 1R8P A; 2LU1 A; 3M30 A; 5AXL A; 3JSM B; 3MEG B; 1MRO B; 5CZX A; 3AFG A; 2DPI A; 3QRQ A; 2FZC B; 1Q7L B; 2CQP A; 2Z4P A; 2JX2 A; 4LUB A; 2VIC A; 2VA3 A; 2CNK B; 1M90 T; 2RRN A; 2IAJ A; 1X4C A; 2BKN A; 2MLX A; 3ETO A; 4W92 B; 1WNE A; 2FTR A; 1HQU B; 3C46 A; 1XK8 A; 3KUH A; 4OLP A; 1U1P A; 4IFV A; 7FDR A; 3CGI A; 3OJU A; 4USK A; 3RBE A; 4NYP A; 4WK1 A; 3TI0 A; 1Y0H A; 2DIS A; 4EUV A; 5J1E A; 1U24 A; 3MM7 B; 4B3S J; 2YX4 A; 2KM8 C; 2DNP A; 1XMQ F; 3MAA B; 2UU9 J; 2MKJ A; 3C66 A; 3SBM A; 1ZZN A; 2CQ3 A; 3EDR B; 1FE0 A; 4RNN A; 5M2U A; 2RU9 A; 4LIW A; 1R43 A; 3GPA A; 2IJR A; 4HH0 A; 2QA4 S; 4JI6 F; 4U7U K; 3FBC A; 3LPY A; 2ZHB A; 2ASY A; 2FUG 9; 1HNI B; 5IT9 Y; 4QYR A; 2H65 B; 1Q16 B; 4I2Q A; 2B4U A; 4YR3 A; 3O5T B; 4YB1 P; 2DGX A; 3Q24 A; 2ROP A; 2OPP A; 3KKF A; 4P71 A; 4YB6 A; 1CQN A; 3NS6 A; 3C19 A; 3TAQ A; 3KHL A; 4C0O C; 2DNH A; 2BMB A; 2C3M A; 3OUY A; 4NLP A; 3RR8 A; 2CPI A; 2XMJ A; 1RHQ B; 1D8Y A; 5CYQ B; 1UZD A; 4R8U B; 3I5A A; 3BKF A; 2CDQ A; 3POT A; 5IQQ A; 3HK2 A; 2G2Y A; 2RAQ A; 1FEE A; 1Q8K A; 4KTQ A; 4Q2M A; 1N36 J; 2BAN A; 4IR9 A; 4B3R F; 1GFW B; 1P1L A; 4FNI A; 2WSC C; 1ZAW A; 2KB2 A; 1UJ4 A; 4NYO A; 1RAD B; 2CJY B; 3M9N B; 1W2B R; 3NCR A; 2R8G A; 4F36 A; 5CYM B; 1M5V C; 2CQB A; 3BQ0 A; 4JI2 F; 3MED A; 5ETL A; 4KFB B; 4N56 A; 5KAK A; 3KJV B; 2FC9 A; 4NLQ A; 1H7X A; 2EEY A; 3BZQ A; 4FYW B; 1YBA A; 2IBO A; 3CJQ A; 2CWX A; 3CUN A; 4F67 A; 2W7O A; 3CDE A; 1UA0 A; 2VG5 A; 1RU1 A; 3KLE B; 4DV6 F; 3WX4 A; 1N33 F; 4PCQ A; 2ZJQ Q; 2RQK A; 3W61 A; 2MGZ B; 4X66 F; 3T1H F; 2OPR A; 3CUL A; 4G1I A; 3MMJ A; 3CSK A; 2YPZ A; 4RZR A; 4HDG A; 1J5E J; 4CO4 A; 3C2P A; 1OPI A; 4HLB A; 2ILZ A; 1RQ0 A; 3K89 A; 3HZG A; 3K8V A; 1WTB A; 2ZH5 A; 4KH1 B; 2YNI B; 2HRU A; 4F4Z A; 3V4I A; 1U1M A; 2G1D A; 3Q2T C; 2VQE J; 2Y1R I; 3T1Y J; 2JEJ A; 4PEO A; 1BLU A; 3UQS A; 1IJF B; 5GAE I; 4PG7 A; 1ZM3 A; 4MMO A; 2COL A; 3UWT A; 1JXL A; 1OQ6 A; 3GCX P; 2KTQ A; 3RGI A; 1BQN B; 4UTG A; 1X9S A; 1CJV B; 4DR3 F; 5F3Z A; 3FCW A; 3IS9 A; 3NCP A; 3MMB A; 1WJ9 A; 1X0F A; 1FK9 A; 2HHS A; 3K58 A; 4I7F A; 4IRK A; 4OI4 A; 3ZTR A; 2LFV A; 1SL2 A; 4UUX A; 2ROG A; 1T11 A; 3PAC A; 3Q83 A; 5GAD U; 1JLB A; 5BR8 F; 2D74 B; 2YKM B; 4NL5 A; 2AMC B; 4ECV A; 2IC3 A; 1JLA B; 2ZE2 A; 3KUG A; 2QLB B; 4ALZ A; 2YNH A; 1TMM A; 2HFO A; 2YWF A; 2DK2 A; 4QOT A; 4DR2 F; 2Z2Z A; 1U6F A; 5L1I A; 4DI6 A; 1X4F A; 4MIB A; 2Q43 A; 1RYR A; 3VAK A; 2E1A A; 5L9X A; 3MM8 A; 4DV3 J; 5DQG A; 2LMI A; 2B56 A; 1D3W A; 1U45 A; 1R7I A; 2V8P A; 4YDD B; 4K0K F; 4OZ3 A; 2UVW A; 1SL0 A; 2RJZ A; 1LFW A; 3OTD A; 2UUB J; 3VAG A; 5T7L A; 3ZZP A; 1FJC A; 4DV0 J; 4M95 A; 3TQE A; 2V6A A; 5EWE A; 3J7A 1; 3M6W A; 1GX6 A; 1XNR J; 2F8M A; 2YKN A; 3R9L A; 3MDF A; 1ICE B; 4RW7 A; 1KQK A; 5A76 A; 2W2O P; 3TAM B; 3JQK A; 5HQM A; 4DWI A; 3NS7 B; 3TP2 A; 5IQ6 A; 3MCO A; 1JKH A; 5KFX A; 4ZVR B; 2D7S A; 3THP A; 2BDP A; 4JI1 F; 3GSD A; 1L3S A; 5F8J A; 4JI0 F; 3U02 A; 4W98 A; 1U8S A; 3IR6 B; 3VCD A; 2ZZT A; 2N7Y A; 4DMZ A; 3MR5 A; 4RR5 A; 3G8Q A; 2ZH2 A; 5SUH A; 1RAA B; 4K4Z A; 2FHJ D; 2WON B; 1ZAV A; 4IKA A; 1APS A; 1S9E A; 3CMA S; 4I64 A; 1NUE A; 1NDP A; 4F25 A; 3WZ0 A; 3HFK A; 4ZPB A; 2L9W A; 5HN0 A; 2HK2 A; 2VG6 A; 2MQ8 A; 3AB4 B; 3DRS A; 4C0H A; 4DUT A; 3HMJ G; 3Q86 A; 2DPJ A; 3TQ1 A; 5EX0 A; 2OFH X; 3MMA B; 5G4D A; 4X4O A; 2C22 A; 4I0W A; 4RBU A; 3GR0 A; 3H5X A; 2QE5 A; 3IWX A; 2W9B A; 1R31 A; 2FB0 A; 3TAN A; 3MM6 A; 2QIF A; 2X3G A; 2E9T A; 3WIU A; 1SUQ A; 5D4L A; 5RUB A; 3KG1 A; 3AD8 C; 3QIP A; 2DXD A; 4L73 A; 5E41 A; 1TL7 A; 2VC0 A; 1FFS B; 3FMB A; 3JS9 A; 3NOC A; 3TVK A; 3RW7 A; 4C8Z A; 3I32 A; 4R25 A; 2AGQ A; 5HI7 A; 2FJE B; 4IQX A; 4GVL A; 4IG0 B; 3TA1 A; 3BH7 B; 2RQC A; 3UI3 A; 1FRX A; 3BSO A; 2KYX A; 2G13 A; 1Q4R A; 1SPB P; 4X65 J; 1S1W A; 1HQE B; 2GZO A; 4J5O A; 4WP3 A; 3EGN A; 2QX0 A; 4CLP A; 5B0D A; 3GV8 B; 3O3L A; 1VQS A; 1TMJ A; 2MHN A; 4MKB A; 4FBU A; 1IR2 A; 4WYW A; 1TL1 A; 3V5R A; 1BY9 A; 1VOM A; 4UZC A; 2FVS A; 4C8L A; 3IRW P; 2IA6 A; 5G0R A; 1IVZ A; 1BWV A; 4P2X A; 4BLG A; 1HR0 J; 1N5T A; 3MR7 A; 1ZYQ A; 4Q45 A; 1R8B A; 1FE4 A; 5JJB A; 4DSJ A; 1ZM2 A; 4OI6 A; 5LXY A; 3R5B A; 2DR6 A; 4Y34 A; 2IY5 B; 3JSM A; 2VB6 A; 3MEG A; 1MRO A; 3BN4 A; 4I2P B; 4MKA A; 4RLE A; 2DNO A; 4QR0 A; 2WB4 A; 3CJ4 A; 3R1L A; 3G71 S; 5KT2 A; 2YNG B; 1TEL A; 1DRZ A; 5IFM A; 2E7W A; 3HVW A; 2F8H A; 4YY3 J; 4WXO A; 1ITP A; 2QA2 A; 4YDX A; 2HLT A; 4ELU A; 3ET6 B; 2HBR B; 4ZVP B; 1KNZ A; 5F8N A; 2GAH C; 4F02 A; 1HWL A; 4K4X A; 3AOC A; 4B3O B; 1P8G A; 3MPV A; 2H9Z A; 2HQ3 A; 3RR7 A; 2M4M A; 3ILO A; 1L3K A; 4C48 A; 3KLI B; 2RIJ A; 3M9O B; 2Q6B A; 1QJH A; 3T5J A; 5B0F A; 1FXL A; 3IN5 A; 3O1L A; 3MM7 A; 1BD6 A; 1RKI A; 3MAA A; 5GAG I; 4DR4 J; 1N32 J; 4LR9 A; 3H4B A; 1F9E B; 3KMS A; 2MHE A; 2OUG A; 1X9W A; 1HYS B; 4ILM A; 1FD8 A; 1GK8 A; 2MQQ A; 1T95 A; 4NMX A; 3IBF B; 3PHT A; 1CJU B; 2FYX A; 3H2L A; 5KOW A; 4FXV A; 2Z2M A; 1CS4 B; 4DPW A; 4ZP6 A; 2J8S A; 2HW3 A; 2GIF A; 4CT9 A; 4NEZ A; 3KLG B; 3X3U A; 4G65 A; 2X1F A; 2CYY A; 2LKZ A; 2LYV A; 4PG4 A; 4ILR A; 4EZ9 A; 2ZBC A; 2R7O A; 4ECT A; 1X0P A; 1NHU A; 1YBU A; 4AQY J; 1PYO B; 2ZUA A; 2V9W A; 4LRD A; 4K4S A; 3BR9 A; 2B7C B; 2V5H G; 1XN9 A; 1HHT P; 1NH7 A; 3I0S B; 3D4J A; 1TK5 A; 1F3V A; 2FGO A; 3EX7 B; 5CYQ A; 4URG A; 2W2Q P; 4R8U A; 3GMG A; 4H54 A; 4Y3C A; 3RBD A; 3FQL A; 1EHW A; 3PW0 A; 3AXK A; 2JZ5 A; 4Z2X A; 4GO5 X; 3B82 A; 2CPX A; 2HSE B; 2GS8 A; 2I9S A; 5KFO A; 3RZA A; 4ZVQ B; 3W62 A; 2XI3 A; 3JTN A; 1NME B; 1T9V A; 1LNQ A; 2XM3 A; 2WK4 A; 3QQC D; 5CYM A; 1CC8 A; 1ZBT A; 3W9H A; 4IRC A; 2V2K A; 3TZX A; 5IT0 A; 1WWH A; 4KFB A; 3KJV A; 1S7I A; 1LEO A; 1YHQ S; 4PUO A; 1PAU B; 3F0N A; 1DLO B; 3R7S B; 1AFI A; 2HZC A; 3JSY A; 1N6Q B; 2L48 A; 2BW2 A; 3KLE A; 1P9Y A; 2UZA A; 2XZT B; 4JV0 A; 2MGZ A; 4KHP J; 5CD4 A; 4DUY J; 1IBK F; 4EO8 A; 4DV7 J; 1S7H A; 1FWP A; 3D1O A; 3V6D B; 3BKU A; 1WKJ A; 3KK3 B; 2V50 A; 5HSP A; 3PKY A; 1FNO A; 1NDC A; 1YJU A; 5HBM B; 1EQ0 A; 1GTH A; 5D4P A; 3Q22 A; 3GJS B; 2YNI A; 1HWJ A; 4GVB B; 3VTI A; 4Y0F A; 2ZDO A; 4RNF A; 3H2U B; 2ZD1 B; 3GIJ A; 3B54 A; 6FD1 A; 2NZC A; 4RPF A; 3RJM B; 2QL9 B; 2EC2 A; 5L9N A; 1KBR A; 4JI7 J; 2K1R B; 1XBW A; 5KFT A; 4ECR A; 2PMH A; 4S0M A; 3QJP A; 2M5Y A; 2ZJR Q; 3MHY A; 1X7V A; 2CPF A; 1BQN A; 3PRB A; 5F8I A; 3K5L A; 1CJV A; 3O2I A; 2K06 A; 5BYQ A; 1GX5 A; 3N28 A; 4J9S A; 3ETM A; 2LEB A; 3BDP A; 4AL5 A; 3FGV A; 2HGN A; 4P73 A; 5AE3 A; 1TK0 A; 3W8G A; 3NL0 A; 3HVT B; 3MM9 B; 2NUH A; 1H7W A; 4ECU A; 1JLA A; 2MZR A; 3ZTP A; 4OLO A; 1S48 A; 1X9M A; 1WDD A; 4NXN F; 3H98 A; 3HHL D; 1FJE B; 2D3Z A; 4TU9 A; 3RRK A; 1Q8I A; 1FDD A; 3J81 j; 5E3Q A; 3FFI B; 4YME A; 3O44 A; 2B4O A; 4DDF A; 2EBG A; 1BQM B; 3OVA A; 1KKH A; 1T9W A; 2EFO A; 4OMF G; 4X64 F; 1MWQ A; 1YJR A; 2UXC J; 2BOA A; 1QSS A; 3KUE A; 4C3M A; 3GIK A; 3G6E S; 1VK8 A; 1QAY A; 3RRH A; 3OV7 A; 3JB9 k; 4LT6 A; 4KGZ B; 4ZHR B; 2VFR A; 3OFF A; 4M94 A; 4NA2 A; 2GHW A; 3M05 A; 4DFJ A; 4J37 A; 2MZS A; 2VBW A; 4ITS A; 1MML A; 1YLX A; 5GMD A; 1RUS A; 2JDJ A; 1PIE A; 3AOD A; 1FRJ A; 3P3D A; 4RU2 A; 5AE2 A; 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2DR5 A; 4JBC A; 3DDK A; 2HVH A; 2WTF A; 4ICL B; 4LR7 A; 1HQE A; 3FDS A; 1R8A A; 1WUU A; 1X4E A; 2QSF A; 4KPC A; 4RBT A; 3E3X A; 3DLJ A; 2AWZ A; 1N4L A; 3ZTS A; 1F5B A; 2VG7 B; 3VAF A; 3QGI A; 5IXU A; 4CLY A; 3K5M A; 2JJ4 D; 2XQC A; 3HI9 A; 4DCP B; 1N8R T; 2IIH A; 3FEX B; 3TA2 A; 1S99 A; 2KRB A; 3RB4 A; 4X2B A; 3QGH A; 3A12 A; 2QA4 G; 2G0C A; 2ABY A; 3ZZU A; 5GAH I; 1ZAX A; 1TK8 A; 2K3I A; 2DEI A; 2IYI A; 2B5J B; 3BF4 A; 3H5U A; 1M5H A; 4I2P A; 1K8A T; 2DHG A; 1XMQ J; 3DC2 A; 2VU5 A; 4ANC A; 4F0M A; 2KFZ A; 3V6K A; 5D6G A; 4ID5 B; 4NRT A; 2KT2 A; 1PC5 A; 2YNG A; 3UN5 A; 5ETM A; 1FER A; 2ZH1 A; 1RTZ A; 1JLG B; 4B3T F; 4RW4 A; 5HRO B; 4Y2C A; 5T14 A; 2OP5 A; 1HWK A; 2JNJ A; 3ET6 A; 4KE5 A; 2AYB A; 2VPW B; 4B3O A; 3PRD A; 2FQQ B; 1TV6 B; 4OZ5 A; 1YJV A; 3IWL A; 1UVN A; 1RAF B; 3EZO A; 4Y2I A; 1RWU A; 4OV6 A; 2GCF A; 3MEC B; 2HNY B; 1BE4 A; 3OXG A; 2WBR A; 2J6S A; 4N8N A; 1U25 A; 4IH6 A; 4YEA A; 4J9U E; 3CJT A; 2C2M B; 3VF0 B; 1M1G A; 2VKR A; 4PR6 A; 3VGT A; 3C16 B; 4YQW A; 3MFH A; 3UD3 P; 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