The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
91
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structure length |
91
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Chain Sequence |
KIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Reducing the Peptidyl Features of Caspase-3 Inhibitors: A Structural Analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-3
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| total genus |
14
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| structure length |
91
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| sequence length |
91
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| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2003-11-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBR B; 1PYO B; 2C2K B; 3GJR B; 1RWN B; 3KJQ B; 3D6M B; 1RWM B; 3IBF B; 1IBC B; 4DCJ B; 1RWV B; 3P4U B; 1ICE B; 2QLF B; 3R7N B; 1I51 B; 2H5I B; 3RJM B; 5K20 B; 1RHJ B; 1RWP B; 2XZD B; 3GJS B; 4JB8 B; 1GFW B; 2Y1L B; 4ZVR B; 2HBY B; 3P45 B; 1RHM B; 2HBQ B; 4DCP B; 2QLB B; 3EDQ B; 2CNO B; 4DCO B; 2Y0B B; 2H4Y B; 1RHK B; 3R6L B; 1SC3 B; 1NME B; 2QL5 B; 2XZT B; 1RWO B; 1BMQ B; 2XYG B; 2CJY B; 2H4W B; 3R6G B; 4ZVU B; 2FQQ B; 3SIP B; 1RWK B; 1RWX B; 2H5J B; 2QLJ B; 1RHU B; 4ZVS B; 1QTN B; 3R7B B; 1RHQ B; 1F9E B; 2XYP B; 3R7S B; 2CNK B; 1RHR B; 1I3O B; 2C2M B; 4LSZ B; 4ZVP B; 3EDR B; 5IC6 B; 2CDR B; 4ZVT B; 2H51 B; 2H48 B; 3QNW B; 2P2C B; 3D6F B; 2QL7 B; 2C1E B; 2H54 B; 2H65 B; 1QDU B; 3R5J B; 4ZVO B; 1PAU B; 2DKO B; 2C2O B; 1SC1 B; 2XYH B; 3KJN B; 2CJX B; 2HBZ B; 3NS7 B; 1SC4 B; 1RE1 B; 2C2Z B; 4ZVQ B; 1RWW B; 2CNL B; 5IC4 B; 3GJT B; 3IBC B; 3KJF B; 2QL9 B; 3D6H B; 2CNN B; 3GJQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ETO A; 4F02 A; 4IFY B; 5KOW A; 3UVJ A; 2CQB A; 1Q79 A; 4J9R A; 1YJT A; 4K4U A; 3V6J A; 1U2F A; 3B8H A; 1DLO A; 2I9S A; 1WG1 A; 2DD8 S; 2RAQ A; 2EK6 A; 1S9E A; 3NKY A; 2VKZ G; 3KLF A; 2WK4 A; 2HHX A; 3THV A; 3VHQ A; 4ZVS B; 4EI2 A; 1S1U B; 1BQM B; 3DU5 A; 1U47 A; 4X65 J; 2DNO A; 2KU7 A; 4YR2 A; 4B9S A; 1Y3J A; 2QEX S; 3W9H A; 4B9U A; 3H2V E; 2Y0S D; 3IO1 A; 2OH2 A; 4D3H A; 1NBE B; 2DNH A; 3U1M A; 3NP5 A; 4B9V A; 1TK5 A; 5J2Q A; 4YUD A; 1AB8 A; 1R7I A; 3DCA A; 2XLI A; 4C48 A; 3U02 A; 3BRE A; 4ZMM A; 4RNN A; 1VRQ C; 4U6P A; 2BM0 A; 5LXR A; 3QGH A; 1VIO A; 2NYH A; 4KRW A; 4JI8 F; 1IVZ A; 2JVR A; 3N5B A; 4N41 A; 3TAP A; 1XJW B; 1T3N A; 3JYT B; 1N34 F; 1QTM A; 3A4T A; 3T5L A; 2UV8 G; 2RDI A; 1P27 B; 5L38 A; 3MD1 A; 5T14 A; 4URG A; 3DFE A; 3F44 A; 5KTQ A; 5KFR A; 1FK9 B; 1D1U A; 5KFM A; 3PYF A; 3BSN A; 2CWX A; 2FLN A; 3K57 A; 1TMJ A; 1W25 A; 4CYU A; 3SEO A; 2HG4 A; 3LAN A; 4KQZ A; 1UVL A; 4AL6 A; 4UZC A; 2W2P P; 2HIY A; 1HD1 A; 4KR0 B; 4P74 A; 3A8I A; 4Y34 A; 2D7S A; 5B7W A; 5AXM A; 3DHW C; 2M5Y A; 4FXD A; 2MEW A; 2IMO A; 3HHN B; 2XHW A; 3W2W B; 3DLE A; 3V6K A; 3KJN B; 3M2U A; 4RZR A; 1FXD A; 3MAA A; 1LWC A; 2ZBP A; 5ETT A; 2XMU A; 1MRO A; 3QQC D; 3GJQ B; 2E1P A; 1H6K X; 2BQ3 A; 3H8Y A; 1MG7 A; 1N52 B; 4F0M A; 5J1N A; 2ZBC A; 5A8R A; 2FC8 A; 5HJX A; 4ZCM A; 4FF2 A; 2UXB F; 2Q79 A; 1HIY A; 1CJU B; 3ADA C; 2LA4 A; 3VVU A; 1ZOT A; 2HBQ B; 4DCP B; 2CG4 A; 2XMT A; 2DVI A; 5LMU F; 2R2T A; 3CO0 P; 1E6Y B; 2YTC A; 1SL2 A; 2ASJ A; 1PAE X; 1XER A; 2B5J A; 5AE3 A; 3R7B B; 2CJ9 A; 4LFA J; 3DDN A; 3PKY A; 1BHN A; 5D6G A; 5T41 A; 4PXE A; 4ALZ A; 3CCJ S; 3MPW A; 4DS5 A; 3RYL A; 2ZM6 F; 4RNH A; 3CCQ S; 2DYA A; 4ES2 A; 5KG7 A; 3L7U A; 1VQO S; 2N3O A; 1YI2 S; 3CED A; 3DRR B; 5GAG I; 2CPI A; 4GKK F; 3TJ9 A; 2HK3 A; 1IBL J; 2K06 A; 2A2C A; 3OV7 A; 4DZ6 A; 3W8P A; 1PIL A; 2AYG A; 2YKN B; 2WB4 A; 4RW4 B; 1HNI B; 5T7L B; 1UFK A; 1KQK A; 4K4T A; 1UCN A; 2V9W A; 1UEU A; 2WRM A; 2ZD1 B; 3OTB A; 5HQ8 A; 1MN7 A; 2F9J A; 1C1C B; 4HLB A; 3KNG A; 3K5N A; 4R0J A; 3AOC A; 4K5S A; 3BN7 A; 1X0F A; 1W2I A; 3EVO A; 4P10 A; 3CJT A; 4MIB A; 1JLQ A; 1SCJ B; 4DV5 F; 1JJC B; 1XMQ J; 3D1O A; 2YWW A; 1XWL A; 1KTV A; 3TVZ A; 2YNI B; 3KK3 A; 1NLK L; 4J9N A; 4OYM A; 1FO1 A; 4ZPB A; 1RT7 A; 5KFE A; 1L5U A; 3DOM B; 1C1B B; 2R7W A; 3TI0 A; 3BDE A; 5DZ6 A; 3KLI B; 5GAG U; 1IKV B; 2J9D A; 2DKO B; 5A8W B; 4TYA A; 1AYE A; 2Z2M A; 1T03 B; 1XC9 A; 3KHR A; 1Y5I B; 1HQU A; 2MYF A; 1CJK A; 1FJE B; 2CNL B; 1W7W A; 2VDH A; 2PT0 A; 5HMW A; 2HBR B; 3PYD A; 1KQS R; 2OML A; 1R0B G; 5LSR A; 4RW7 A; 2VFR A; 1ROF A; 3CVK A; 2G0J A; 3EMT A; 5LSO A; 1L3T A; 4QW9 A; 1H74 A; 4LSL B; 2F65 A; 1A6L A; 1N5Y A; 1CC7 A; 1O8B A; 3LGM A; 4MTP A; 1TV6 B; 4ZVR B; 4CO0 A; 3UD4 P; 1JLC A; 4BDP A; 3PW2 A; 2RB7 A; 2LQ9 A; 1VQ9 S; 3TJ8 A; 3KFW X; 2CJK A; 1H0H B; 2IA0 A; 2VHG A; 1ZPV A; 4C0H A; 3TO8 A; 5DQG A; 5LM7 E; 3MR3 A; 2C3O A; 1NZ8 A; 2G2Y A; 2KVI A; 4PZV A; 2EW9 A; 4X64 F; 3M2R B; 3ZZZ A; 5B0F A; 4O3N A; 1XTZ A; 3D3C J; 2IPO B; 3MEC A; 4B3M F; 2NPF A; 2JHE A; 3OPK A; 4H4K C; 1S9F A; 4NCG B; 4PWW A; 1T05 B; 2C2N A; 2FGC A; 3KHL A; 5L9X A; 3G82 A; 1EB0 A; 3DDK A; 2M2B A; 3I96 A; 2ROE A; 3SSQ A; 4WTO B; 1R8P A; 3E2E A; 3W9I A; 4AQY F; 1V3R A; 1Z2Z A; 1RKI A; 5F3T A; 1AW0 A; 3NRB A; 3M30 B; 4DX5 A; 2MQN A; 3CJK B; 5CHC B; 3QAU A; 1MU2 A; 4QW8 A; 2ASL A; 3C19 A; 5HN0 A; 2PFF B; 4OHV A; 2A3J A; 1ACM B; 2ZZM A; 3GCW P; 2BXJ A; 3KK2 A; 4HEA 9; 4EFA C; 2JRS A; 3Q8S B; 4WXW A; 1B0V A; 1Q8K A; 2LEC A; 2KRR A; 3NBP A; 3VAJ A; 5L39 A; 3J81 Y; 3VAH A; 2RU9 A; 4L3K A; 4DX6 A; 3C2P A; 4IG3 B; 2C2M B; 4IG0 A; 4DQI A; 2PMW A; 2BW2 A; 3ENV A; 3OJU A; 4B9M A; 5CAA A; 2VH7 A; 1QDU B; 4MKV A; 4I64 A; 4ECX A; 4F36 A; 5ETL A; 5KFF A; 2P9G A; 1SIW B; 1NJZ A; 1HHQ A; 4PQU B; 2GC8 A; 4ZPC A; 3RBE A; 2O01 C; 1SJR A; 3NCQ A; 4M5H A; 3I0S B; 2V2V A; 2N7Y A; 3D6H B; 2HWI A; 5IWA F; 1NEE A; 4NA1 A; 4RX6 A; 5G0R B; 4J7C A; 4JV1 A; 1RWN B; 5DO2 A; 3DOL B; 4O0N A; 4CLY A; 1I51 B; 4N7T A; 2ATL A; 1RYR A; 3LP1 A; 2DY9 A; 2EKY A; 1RP5 A; 1WTF A; 2F3J A; 5KFO A; 3BH6 B; 3NOG A; 3SV3 A; 3R5G A; 1UZH A; 3DLL Q; 4LVO P; 1T94 A; 2MJU A; 3DLJ A; 1HNX F; 4F3M A; 3K5P A; 2AYE A; 4I2Q B; 2CQ4 A; 5HMX A; 3QGI A; 1X9S A; 1EQ0 A; 1T9W A; 2H4W B; 1HNV B; 2BW7 A; 3R1L A; 4KFB A; 4M5N A; 2V69 A; 3FQL A; 1UEK A; 1N36 F; 4DSI A; 3G8S A; 1IQZ A; 3GYN A; 1A9N B; 5EN1 A; 4OI0 A; 2HHS A; 2RQK A; 1VBZ A; 1DTT A; 3HHL C; 1HQE A; 1AFI A; 2HAI A; 1VRU A; 4NLQ A; 4DX7 A; 2OLW A; 4DL7 A; 4AE5 A; 5I3U B; 1I94 F; 1UPP A; 2V67 A; 3KMQ A; 3GB0 A; 3GV5 B; 1X9W A; 3LF0 A; 5IZH A; 2KL8 A; 1SV5 B; 2ZH5 A; 5AE1 A; 4OHZ A; 4B3T F; 3I56 S; 3K58 A; 1UPM B; 4OYO A; 1CQM A; 3B6B A; 4NAS A; 4BC9 A; 1C0T B; 1D8Z A; 2CZ4 A; 1D0E A; 3M9M B; 4X4Q A; 4FBU A; 4M5I A; 3DRY A; 5E5N A; 3PX4 A; 2W4P A; 1MNE A; 1TVR B; 2HQC A; 3HFK A; 3LWL A; 3K5M A; 3MPU B; 7AT1 B; 3K5O A; 2X51 A; 1SC6 A; 4FYD A; 3TP2 A; 3OR1 B; 1P1L A; 1TL3 B; 4OZ3 A; 2ASD A; 1YZ7 A; 1C4A A; 4DL5 A; 3H2U B; 1FFW B; 3VAG A; 2AV5 A; 4OX9 J; 4A8O A; 4DUT A; 1DTQ A; 3HD2 A; 2V2Q A; 5IS2 A; 3W1Y C; 4U96 A; 1FX4 A; 5CA5 A; 4JI6 J; 3HUL A; 3MD3 A; 4U95 A; 2UUA F; 2R3V A; 4K0K J; 4ZVO B; 3W9J A; 4X62 J; 3P3D A; 4USJ C; 3DI6 A; 3HJF A; 2DGO A; 2DIV A; 3CB4 A; 4J9L A; 1PJ7 A; 5DLG A; 4OYB A; 3BYR A; 4L73 A; 4LF9 F; 1DHM A; 1F5B A; 2DCL A; 3KNA A; 3GIK A; 1U25 A; 3N6L A; 2VG6 B; 1N33 J; 4I2P B; 4W92 B; 5CXT A; 5B0G A; 2JEI A; 3T9N A; 2RRN A; 2N3L A; 3A3P B; 5HRO B; 3US5 A; 4A8W A; 1RUS A; 2HZC A; 5LOQ A; 2UVW A; 4NXM J; 3POT B; 4USU A; 2FTR A; 2YWF A; 3FKB A; 4DV1 F; 2MZ1 A; 3H5X A; 9ATC B; 2DGV A; 2PMZ D; 3MM6 A; 1Q16 B; 2QTW A; 1RYS A; 2ZE2 B; 1GT8 A; 1FI4 A; 1S48 A; 2DIS A; 5FJ4 A; 4OZ0 A; 4KGV B; 3KJV B; 2AYB A; 2VIC A; 1I3O B; 3M7V A; 1U8W A; 1ZAV A; 2FJA B; 3Q2S C; 1VC0 A; 2EI5 A; 1HNW F; 5A6P A; 1X4E A; 2ZJP Q; 1EX8 A; 2EWH A; 2GV1 A; 4OJH A; 2C2O B; 2PFD A; 1X5P A; 3G86 A; 1ZH5 A; 1Q8B A; 3BH7 B; 3GJT B; 1UVI A; 1JX4 A; 4CRJ A; 4O4R A; 3BKT A; 1FRL A; 1B7F A; 3PAC A; 2HFZ A; 1NSQ A; 4DFM A; 3GII A; 2EEY A; 1YZ6 A; 3QRR A; 1UFL A; 4DUY F; 1Z1Z A; 3P4U B; 3SMZ A; 5KFK A; 3AOD A; 4ANC A; 1WC5 A; 4U7U K; 3LPY A; 4HAC B; 4IKA A; 4CLT A; 1KSP A; 3EGZ A; 1NK6 A; 3AAW B; 3BSC A; 1WTB A; 3M6W A; 3PYE A; 1VBY A; 2VC0 A; 5D4O A; 1RWU A; 3FNN A; 1BLU A; 1REV B; 4CO3 A; 1R8C A; 2WVE A; 2GO8 A; 5J2Q B; 3W5Y A; 3AA8 A; 4G1Q A; 3D66 A; 3CCL S; 3C3L A; 1WC6 A; 5KFJ A; 1FX2 A; 4N47 A; 2FGO A; 2XGQ A; 2X1A A; 1CC8 A; 2GQ2 A; 4F4K A; 2ZJQ Q; 2AJQ A; 3AH6 A; 4DR3 J; 4MMO A; 2C22 A; 3PEH A; 5U47 A; 1FJ7 A; 3D6M B; 4Q0B A; 2PEB A; 5D78 A; 3DM2 B; 2PN6 A; 4CYU B; 2GVD A; 4JV2 A; 3GP9 A; 4DLG A; 3V4M A; 4B3O A; 4DV3 J; 2V2Z A; 1U24 A; 3KK1 B; 2M70 A; 2R7O A; 3L09 A; 3K5L A; 3ZNJ 1; 1S4E A; 3UCU P; 2SXL A; 1F3F A; 3ISZ A; 1VQ4 S; 3SFG A; 2CJA A; 4K2J A; 4LF7 F; 3DLE B; 3M2V A; 5C24 A; 1IXK A; 2OFH X; 2ILY A; 2B7B B; 4IR9 A; 2R2R A; 2DEI A; 4IOA Q; 1RI7 A; 3MAA B; 1LWC B; 4LRD A; 2FJV A; 1X4G A; 3GWC A; 2IRY A; 1RLC L; 1R89 A; 2H1Y A; 1HBU A; 1IBM F; 3AB2 B; 3GON A; 5A8R B; 2CJB A; 2E5H A; 4OHW A; 2MXY A; 2ZH9 A; 4LF4 J; 5EUH A; 2XBP A; 2YXL A; 4P6Q A; 3JSY A; 5AXN A; 1EAY C; 1B4S A; 3KLE A; 1UL3 A; 4Y28 C; 5HVF A; 2JEF A; 4OX7 A; 3MMB B; 2KXN B; 1F6T A; 2MKY A; 4DMZ A; 1EQM A; 3FEY B; 1KS2 A; 3RJM B; 1KLM B; 3KLG A; 3V4I A; 3ZZP A; 4PG7 A; 1P8G A; 2JC1 A; 2KZM A; 1X4H A; 3MUM P; 4AT1 B; 2JJ4 D; 5C2C A; 5B0C A; 2G9O A; 4L6V 3; 2BJE A; 2CQI A; 3UR3 C; 2OIH A; 2VV5 A; 3CIZ A; 1LV5 A; 3R2D J; 4ANE A; 4CLF A; 3H4B A; 2O67 A; 2YQ0 A; 1K0T A; 2WBR A; 4EO6 A; 2UUC J; 3A1Y G; 1SIZ A; 2J8S A; 1X5S A; 4LR7 A; 3EVM A; 3KLH A; 2IA6 A; 4Y2M A; 3O2I A; 2Z56 B; 1S1X A; 2R8H A; 1Q5V A; 1UWA A; 5LJ5 Y; 4OHY A; 1SJQ A; 2BVZ A; 3NGR A; 4WFN Q; 4DV7 J; 2DRB A; 3IGV A; 1S5Z A; 3K89 A; 4WFX A; 4Z37 A; 1S49 A; 4ZLN A; 1QUV A; 2RT3 A; 1B70 B; 1EKS A; 5BYQ A; 1C0U A; 1S6O A; 1JWW A; 2NYI A; 2ZC4 A; 1IKY A; 3UD5 A; 3KK3 B; 4QJV A; 4ED2 A; 3PRD A; 4FYX B; 1NND A; 2B51 A; 2D69 A; 2VON A; 4I1T A; 2W4D A; 3HHD A; 1ZZF A; 4LF6 J; 3OJS A; 4X4V A; 1FT8 A; 5HP1 A; 2ZNY A; 1S0N A; 1VQ5 S; 4DOZ A; 1Y9O A; 3GPA A; 3KG1 A; 2R8J A; 2ZH1 A; 3TYT A; 4DR7 J; 3LAK A; 3W66 A; 4UQT A; 4J9V A; 1HQU B; 4OI1 A; 1U45 A; 1MWZ A; 1QAY A; 1F0X A; 2MZS A; 1DFD A; 2Y9H A; 3CCE S; 4FS1 A; 2H51 B; 4OJ3 A; 2ZOF A; 1Y00 A; 3WX8 A; 1IR0 A; 1TQL A; 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