The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
LKKTSSSGLYKVQIGAFKVKANADSLASNAEAKGFDSIVLLKDGLYKVQIGAFSSKDNADTLAARAKNAGFDAIVILES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the Peptidoglycan Binding Domain of Bacillus subtilis Cell Wall Lytic Enzyme CwlC: Characterization of the Sporulation-Related Repeats by NMR(,)
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Bacillus subtilis
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| molecule keywords |
Sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
|
| total genus |
16
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| structure length |
79
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| sequence length |
79
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| ec nomenclature |
ec
3.5.1.28: N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase. |
| pdb deposition date | 2005-05-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05036 | SPOR | Sporulation related domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Sporulation related repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X60 A; 1UTA A; 2LFV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BQU A; 4F4K A; 1YQH A; 3IP0 A; 4J37 A; 4ZJQ A; 1FFW B; 6FD1 A; 2HSE B; 3AA8 A; 3RUB L; 1OJ4 A; 4I6A A; 3DOK A; 4TY9 A; 1HYS B; 2BEF A; 1RCO B; 2ZZT A; 4C3K A; 1URN A; 3SYZ A; 1DY3 A; 1F3V A; 1N8R T; 3NGK A; 3D6M B; 3I32 A; 4K50 A; 5DG8 A; 2XWY A; 4HHU A; 1PBA A; 5J1P A; 4DG1 B; 2E9Z A; 3CUL A; 3W2V A; 3CJ5 A; 2E5J A; 1Y10 A; 1FD2 A; 3M05 A; 1Q8B A; 3A8E A; 5IM0 A; 1A0O B; 2UUW A; 1F5B A; 1RT4 B; 4WXW A; 1NKC A; 1ZTT A; 1S6U A; 2CAJ A; 2LLZ A; 1S99 A; 2W4C A; 1FVQ A; 2FJA B; 4DF8 A; 3ZZ0 A; 2IRY A; 1RWM B; 3CPW R; 4LFA J; 2BE2 A; 2QA4 S; 2OPQ A; 3CCT A; 2KM8 B; 2F40 A; 2CA9 A; 3TWZ A; 4LIW A; 5DLG A; 4QR0 A; 3IBF B; 3TQ1 A; 2R9L A; 2G1H A; 5M2U A; 1YLX A; 3TVY A; 4CLY A; 5KT6 A; 5AE1 A; 3UDE A; 3G96 A; 2X3G A; 1Q86 T; 3C16 B; 5SZT A; 3TUP A; 2RF2 B; 4A8S A; 2ATC B; 4ED3 A; 1OPZ A; 4DV0 F; 4C9D A; 2PI5 A; 5JVG Q; 4F4Y A; 1IR2 A; 5D15 A; 2YH1 A; 1XNR J; 4B9S A; 5HI7 A; 3M6W A; 2RSQ A; 2M4M A; 4USV A; 2XQC A; 2VA2 A; 3I5A A; 5E7O B; 4KH0 B; 1UWB B; 4FXD A; 1H2V Z; 1IBM J; 1SC6 A; 3NG8 A; 3CIZ A; 4QWA A; 3MED B; 1EQ0 A; 2KG0 A; 3PDN A; 5F8G A; 5JXS A; 1IR1 A; 1T9U A; 3RR7 A; 5HK4 A; 1JJ4 A; 1QLN A; 1B99 A; 1KD1 T; 3L7P A; 1VJW A; 1VRT B; 5EX3 A; 1WHV A; 2LU2 A; 4NWB A; 3OFE A; 3K57 A; 5F3T A; 3MM5 A; 1OY9 A; 4DR3 J; 4HTJ A; 3IR5 B; 2VPW B; 2ZEJ A; 1SV5 B; 4KHR A; 1TL3 A; 4EGL A; 4I69 A; 3DDN A; 3OHB A; 4UTG A; 2YVS A; 3MEC B; 2CPE A; 2AT1 B; 2FPH X; 3K17 A; 1RWK B; 4MKY A; 3KLE A; 5LM7 E; 3K5O A; 3FMW A; 2ZOG A; 2OH2 A; 2E7V A; 2B4P A; 4B9N A; 3MUR P; 5KT5 A; 4YB7 A; 1X4E A; 3CD0 A; 3Q22 A; 2H5E A; 2G13 A; 1EX8 A; 2VOO A; 3T1Y F; 4OI4 A; 4DV3 J; 2BXJ A; 5LJ5 Y; 2MST A; 1BC6 A; 1PIE A; 2RKI A; 3BQ2 A; 4ZVG A; 3R5B A; 1X5O A; 5E3C A; 1BQM A; 1RT2 A; 5HRO A; 2FYX A; 3L9Z A; 1NEE A; 2MKH A; 3C6U A; 5IV4 A; 2BR0 A; 3M2V A; 3FBF A; 1HIY A; 1ULR A; 1WI6 A; 3IFE A; 1GT8 A; 1VQP S; 3NCP A; 2XHC A; 2B3T B; 4PKD B; 4KY3 A; 4NA1 A; 1DAR A; 4DX6 A; 2HYI B; 3JAM Y; 4ZVU B; 2CG8 A; 1GXT A; 2G1D A; 2VG7 A; 4B9V A; 2DNG A; 2MGZ A; 4EFA C; 3DLG A; 1V5I B; 3PXG a; 6FDR A; 1WC3 A; 1REV A; 2OTL S; 2KXF A; 2VH7 A; 3QAE A; 2QSW A; 3B4M A; 3QJL A; 3C6T B; 1IKY B; 3CJ3 A; 1RK8 A; 3NMR A; 4FBU A; 1KS2 A; 3W65 A; 3DGP B; 2CQ1 A; 3E51 A; 3FSX A; 4LF1 A; 1P6T A; 3RB0 A; 3MCM A; 5D0H A; 3J7Y U; 5DRK A; 3DDI A; 2IM1 A; 4MT1 A; 1IVZ A; 1IWA A; 5HAO A; 2GAH C; 3JSM B; 1U6B A; 4I7F B; 1C1C A; 4OI1 A; 2WW4 A; 1HWI A; 2V4Q A; 3T6J A; 3BPS P; 2AJQ A; 4P73 A; 1XNQ F; 2BMB A; 3MMJ A; 5A8W B; 3JTP A; 4DV6 F; 4LFB F; 4WU3 A; 3KXD A; 3HT3 A; 1ROF A; 3HM9 A; 1U1L A; 1ZTW A; 5KFO A; 2D69 A; 4ZLN A; 4DQQ A; 3DU6 A; 2JVR A; 2CPF A; 1IXK A; 2H5I B; 2DR6 A; 1IKW B; 3W5X A; 4QU6 A; 3KOA A; 2YNF A; 1SJF A; 1S1U B; 1T02 A; 1CJV B; 4C8Z A; 2W01 A; 2CZV C; 1M1K T; 3EMT A; 1KDN A; 1WG4 A; 2KT2 A; 1RTZ A; 3AOC A; 1OSD A; 4DR6 F; 5D78 A; 3VVU A; 2LQ5 A; 2QV6 A; 3QWP A; 4Y34 A; 2Y3Y A; 3UW1 A; 5E41 A; 4JBC A; 1P27 B; 3MR6 A; 4RW9 A; 1EZZ B; 3D3C J; 2VIH A; 5GAG U; 1U2C A; 3NAH A; 3UWT A; 3HDS A; 3QQC D; 1VOM A; 1UET A; 3Q8P B; 2Z57 B; 1CJK A; 2GHW A; 4KR0 B; 2V9K A; 3GIM A; 1WOR A; 3LPY A; 2VU5 A; 2DPJ A; 1QSY A; 1BD6 A; 3ZNJ 1; 4B9U A; 2Q3P A; 3J7A 1; 4UQG A; 3B54 A; 3UDC A; 2FLL A; 4TU8 A; 4MMO A; 5LL6 d; 2WRM A; 2BKP A; 5CAB A; 3CE8 A; 4ILM A; 4JI0 J; 1TKX A; 4P72 A; 1NPR A; 5ETN A; 2QO3 A; 2CVE A; 3VCD A; 2YKN A; 3RBD A; 2KFN A; 2LCW A; 3GB0 A; 3GV5 B; 2KO1 A; 1SKW A; 3ZZP A; 2DNQ A; 1VQ5 S; 2ZHB A; 2P8I A; 5GAD I; 4QYR A; 3J81 j; 1GMV A; 2J7K A; 4C0B A; 3TAM A; 2EWH A; 2HFZ A; 1NK0 A; 3CCM S; 1R3N A; 1ICE B; 2QMX A; 2K3K A; 4Y2A A; 3CDA A; 3K89 A; 1REG X; 2HGN A; 4JI7 J; 3OW2 R; 1G6B A; 1DUR A; 2B7C B; 3JXO A; 2C2R A; 2E1P A; 4PUO B; 3BQ1 A; 5J2Q A; 3KJV B; 2MKJ A; 1IJF B; 2R7R A; 5J1E A; 4MKV A; 3T6B A; 3RGI A; 2K1R A; 1EKR A; 3H2U B; 3MR5 A; 3GLJ A; 4ZN1 A; 5AXM A; 3MF5 A; 4P2S A; 4ELV A; 4ECQ A; 4NCB A; 5CZX A; 1TL1 A; 3GYX B; 2HS3 A; 4FF3 A; 2E44 A; 1RJJ A; 4KHP J; 3D6H B; 3MI7 X; 1ZM9 A; 1Y0H A; 3BV8 A; 4QWC A; 3H98 A; 2E29 A; 5K14 B; 2WZ1 A; 4GC6 A; 4ENO A; 5D4L A; 3PO5 A; 2ZNZ A; 3Q89 A; 3EGN A; 2E66 A; 3KLI B; 4NCG A; 5BYS A; 5HBM A; 4JUZ A; 1QUV A; 1R89 A; 3JSR A; 1RT5 A; 3FEX B; 1UPM B; 3AT1 B; 2EFG A; 2I2Y A; 3P4U B; 1D3W A; 2HQF A; 3FJ2 A; 3OVA A; 1WTB A; 4KGV B; 1NBE B; 2FIU A; 4Q5V A; 1LXJ A; 4ECS A; 3QJJ A; 2NRE A; 1YG0 A; 4V19 X; 1VK3 A; 1FRH A; 3N9U C; 3CJR A; 4PXE A; 4OZ5 A; 2FZG B; 4GMK A; 2KG1 A; 5E3P A; 1BE4 A; 5JJB A; 1WEY A; 3R8Y A; 2HHP A; 4PQA A; 1FEH A; 4TNO A; 1D1U A; 3KMQ A; 4QWD A; 4IG0 B; 3SV4 A; 3FQK A; 3ENA A; 3M8Y A; 5A0Y A; 4PEO A; 1OPI A; 1AFJ A; 4KJI A; 3A8I A; 1XMQ F; 2CPZ A; 2EC2 A; 3HHL D; 2C2Z B; 3NWR A; 2H3E B; 4P2M A; 4PG5 A; 1NRK A; 4ZVO B; 1U4B A; 1S72 S; 1BWE A; 3PG9 A; 1FJG F; 2UXD F; 3BSC A; 3UCU P; 2FLP A; 4CQ1 A; 5GAE I; 1MN7 A; 1AZS A; 4TY8 A; 3GSD A; 3FFI A; 4C8O A; 1Q78 A; 3U27 A; 3VZI A; 1MSW D; 4AE5 A; 1GQE A; 1HQ2 A; 3POT A; 4M5L A; 3EYZ A; 3JYT A; 2VB6 A; 4GC7 A; 3Q23 A; 1FF2 A; 4X65 F; 3ILL A; 2UV8 G; 4O4R A; 2R7S A; 1N36 F; 1TV6 A; 1NCL A; 3KLF B; 3KLH A; 2ALZ A; 3VV2 B; 2HFO A; 2V63 A; 4CTA A; 3UVJ A; 2QA1 A; 2OSR A; 3BO3 A; 3BGR A; 3OFG A; 4E2F B; 2BA9 A; 2YQ3 A; 2JLE A; 5B0E A; 3IN5 A; 1RA7 A; 1QD1 A; 3LO3 A; 2DR9 A; 4X66 F; 3UN5 A; 5DG9 A; 4IUF A; 1VBX A; 4WTY A; 3PKY A; 4YHH F; 2J8S A; 3HHL A; 1RAA B; 1FXL A; 4CP5 A; 4XDD A; 4ID5 A; 3HUL A; 4AT1 B; 3MXH P; 2HS0 A; 3AD8 C; 3R7S B; 2CJ9 A; 2F1F A; 3MM6 A; 2VUG A; 3GPA A; 4RX6 A; 4OX6 A; 1Y4Z B; 3P49 B; 2A1B A; 1TL5 A; 1OYD A; 2ZE2 A; 1I94 F; 2UP1 A; 2DGX A; 3V6D B; 4HHJ A; 3QZ8 A; 4FKX A; 1HHT P; 1X4D A; 4BHQ A; 2HGL A; 4ZPD A; 1XER A; 2X1G A; 2QC3 A; 4JYA F; 3IBW A; 5B08 A; 1JJC B; 3BN7 A; 1UWA A; 2ILY A; 2UUA F; 5BR8 J; 1RHM B; 1S4F A; 2LDY A; 1FWK A; 3CCL S; 3KUH A; 1WKL A; 3IR7 B; 4DQR A; 1X8D A; 1GX6 A; 1JWW A; 1MG7 A; 4L75 A; 4NPO A; 4ZLJ A; 1JXL A; 5E33 A; 2HND A; 4CO2 A; 2YH0 A; 3MWB A; 2HHS A; 1GMW D; 1VLY A; 1S9E B; 4HH1 A; 1UA1 A; 2C2E A; 1FES A; 2L48 A; 1F3F A; 1P1L A; 3M1V A; 4B3M J; 4RNO A; 2E9R X; 3UN2 A; 2UZA A; 1CPZ A; 2Y8W A; 4PXB A; 3KK3 B; 4C8M A; 1OYE A; 3JTN A; 4EUV A; 4ILR A; 2W4D A; 5I3U A; 3NXZ A; 1F9E B; 5C24 A; 4WFN Q; 2JEF A; 4L72 B; 4KSE B; 3KG4 A; 3V6H A; 4KPC A; 4L74 A; 1YI2 S; 3DOK B; 4DV1 J; 3WIV A; 1LW2 A; 2E9T A; 4O3Q A; 2BX6 A; 4Z37 A; 1OS5 A; 1D9D A; 3SMZ A; 3F56 A; 1X9S A; 4RUH A; 3W2V B; 2AEM A; 3D1Q A; 2MQ8 A; 3ZFV A; 3H8Y A; 5IM0 B; 5L1J A; 1N5Y A; 4K4S A; 4O0I A; 5B09 A; 3VAF A; 4O44 B; 3J80 Y; 1JX4 A; 3RAQ A; 1NDC A; 2A3J A; 4DL4 A; 4P7T A; 3MPU B; 5EHH A; 4YY3 F; 1J5E F; 2QA2 A; 2MQN A; 5ETO A; 4WP8 A; 3WQP A; 1U2F A; 1F6T A; 2BE2 B; 3DN9 A; 1F5C A; 2AF6 A; 2OPQ B; 1WC4 A; 2AJF E; 3D6F B; 3VTI A; 3TA0 A; 4XAK A; 2QFJ A; 3D4J A; 3V4I A; 2GCF A; 1CSJ A; 4QIV A; 2IMW P; 3V2U C; 1S49 A; 4NLP A; 2LMI A; 2NUU G; 3EM1 A; 1X4B A; 1RWO B; 3M8R A; 1N0U A; 3MPV A; 2YWF A; 4CDI A; 5DLF A; 2EVZ A; 3D0I E; 3K8V A; 3KG0 A; 1BQN A; 4P10 A; 2WVD A; 2P5V A; 3OR2 A; 1BXN A; 1WOO A; 5HMY A; 4HHH A; 5HJY A; 4OV6 A; 2I1R A; 1X0F A; 4M8L A; 1LKZ A; 2QE5 A; 2XC9 A; 2YPY A; 1AT1 B; 3HVW A; 4I2Q A; 2RQM A; 4DN0 A; 3KKF A; 2ZJR Q; 1TAQ A; 4B02 A; 4EZ9 A; 2QT7 A; 3H5U A; 2H54 B; 1IBK F; 3MM5 B; 1QSL A; 2G0C A; 4U7C A; 2E5L J; 4PZV A; 2XG8 A; 3MM7 A; 1TL3 B; 2EBE A; 2X1F A; 1Q1K A; 2IAJ A; 5IV3 A; 3I4H X; 4IO9 Q; 3FBC A; 2D74 B; 1GTH A; 2BJ3 A; 4FBT A; 2RJZ A; 4YR0 A; 4F26 A; 1XJW B; 4X4P A; 4ZVF A; 1VBK A; 4QW8 A; 2DXF A; 3KLE B; 2ZH9 A; 1EKS A; 1KON A; 4I4B A; 5KG3 A; 3T1A A; 2J0X A; 1B70 B; 1RAE B; 5LXR A; 4J9U E; 3N6L A; 3J7A N; 3SEO A; 4HI2 A; 2W4P A; 2ZOF A; 3KNA A; 2R7W A; 4OZ2 A; 4DFJ A; 1JQG A; 4N76 A; 1D9A A; 1N33 F; 2D3U A; 2AJ4 A; 2H9Z A; 4Q8F A; 5ETT A; 1WKJ A; 1FNM A; 2HQ3 A; 5CH7 B; 1K0V A; 3T41 A; 3ZZZ A; 3CCU S; 1S0M A; 3A13 A; 2RKI B; 4IFY A; 4DCO B; 5IFM A; 1QVF R; 1BHN A; 1BQM B; 2CDR B; 2RS8 A; 3NCQ A; 4P7V A; 1RT2 B; 5HRO B; 4OJG A; 4BDP A; 1RA6 A; 3C6U B; 1R8P A; 3M2V B; 2X3D A; 1HWL A; 1FKO A; 2AW0 A; 4RW7 A; 3RAX A; 1JLA A; 2WW8 A; 4DMZ A; 1YIJ S; 1IN0 A; 4WFX A; 1RGV A; 4L3N A; 2WSF C; 3R7B B; 5C42 B; 2Y0S D; 3RBE A; 4X64 J; 3SCL E; 2VG7 B; 2CQH A; 3ONQ A; 2ASY A; 2MGZ B; 2WVC A; 2RS2 A; 3DLG B; 4CWB A; 1ZA2 B; 2OD6 A; 1REV B; 1RBL A; 3K58 A; 4JV2 A; 1X5S A; 3KHL A; 4NLG A; 1N4L A; 4R0J A; 4QR1 A; 2HHU A; 4DV4 F; 2QN6 B; 2CQ3 A; 8RUC A; 1HNX F; 5ETV A; 5KFA A; 1T94 A; 2BUN A; 1SH3 A; 3IXQ A; 4DPT A; 2FZK B; 3M4X A; 4K2J A; 3BYP A; 4LF2 A; 1GXL A; 3A3N B; 3SSR A; 3BPD A; 3R3T A; 4G1Q A; 1U45 A; 3HFK A; 4JI8 F; 2M3D A; 1HBO A; 4JI4 F; 4ZDN A; 2E7W A; 4YDD B; 4DSF A; 3E3X A; 4BCA A; 3ZZT A; 3SCI E; 1R31 A; 3T5K A; 1C1C B; 3D68 A; 3I56 S; 1RYS A; 2Z2M A; 4M5D A; 3AD7 C; 1QAY A; 3D1H A; 4PAB A; 3I9Z A; 2N82 B; 3OUY A; 1HWJ A; 1P1T A; 1Y3K A; 3IR6 B; 1OMS A; 2GNK A; 3D66 A; 4AL6 A; 4PPD A; 4DF4 A; 2FJD B; 5FII A; 4ALZ A; 3NMA A; 3MMA A; 1CEZ A; 2VPY B; 1FNO A; 1QTN B; 2Y0B B; 1KLM A; 3H40 A; 1K1S A; 2YNF B; 2ZBC A; 1WWH A; 4ELU A; 1VBY A; 2PEB A; 3C8Y A; 2OEJ A; 4C8Y A; 3UE2 A; 4NYP A; 1LK7 A; 4I56 A; 2F7V A; 1SUQ A; 2PD1 A; 1NHV A; 2ROG A; 2DNZ A; 4ANE A; 2MZQ A; 4KFB A; 2F3J A; 4Y28 C; 5IWA J; 4IRK A; 4CH1 A; 2DIS A; 3MMB A; 4X4O A; 1M1H A; 1ITP A; 3DGV A; 5EDW A; 4RW9 B; 1RBO B; 2VZ9 A; 2E5I A; 1KSP A; 2RU3 A; 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