The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
91
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structure length |
91
|
Chain Sequence |
KIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The three-dimensional structure of apopain/CPP32, a key mediator of apoptosis.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
APOPAIN
|
| total genus |
17
|
| structure length |
91
|
| sequence length |
91
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 1996-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2H4Y B; 2H51 B; 4LSZ B; 2QL5 B; 5IC6 B; 1BMQ B; 2HBY B; 2Y1L B; 1SC3 B; 1RWW B; 4ZVU B; 2CNL B; 1RWO B; 4ZVT B; 3EDQ B; 5IC4 B; 2HBR B; 2XYP B; 3NS7 B; 2QL7 B; 1SC1 B; 1NME B; 3KJN B; 1ICE B; 3GJQ B; 2HBQ B; 2CNN B; 2CJX B; 2CDR B; 3R7B B; 3P4U B; 1PAU B; 1RE1 B; 1RWN B; 3KJQ B; 3R6G B; 1F9E B; 3R7N B; 1RWP B; 1SC4 B; 3D6H B; 4ZVR B; 1PYO B; 2H48 B; 1GFW B; 1RHJ B; 3R7S B; 1RWX B; 2H65 B; 2P2C B; 4JB8 B; 3R5J B; 2XZT B; 3GJT B; 4DCJ B; 2C1E B; 4ZVS B; 1RHQ B; 2DKO B; 2H5J B; 3QNW B; 2C2M B; 4ZVO B; 1RHM B; 2CNK B; 3RJM B; 4DCO B; 2XZD B; 2HBZ B; 3D6M B; 2FQQ B; 5K20 B; 1RWV B; 4ZVP B; 1RHK B; 4DCP B; 2QLB B; 3KJF B; 2H54 B; 2QLJ B; 2CNO B; 2QL9 B; 3P45 B; 2H4W B; 1RWK B; 1I3O B; 3R6L B; 3GJS B; 1RWM B; 2C2K B; 2C2Z B; 2Y0B B; 3D6F B; 4ZVQ B; 1IBC B; 3IBC B; 2CJY B; 1QDU B; 2QLF B; 1I51 B; 1RHR B; 1QTN B; 3IBF B; 3GJR B; 1RHU B; 3SIP B; 2H5I B; 2XYH B; 2C2O B; 3EDR B; 2XYG B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQP S; 4K8R A; 3NGK A; 3V81 A; 4CNY A; 4RKU C; 4MIW A; 3CDB A; 2IRU A; 3RB3 A; 4NLP A; 1VIS A; 4LF7 F; 1HBM A; 2WVC A; 1NKE A; 1W2B R; 3D9B A; 4E8U A; 1T05 B; 2CNN B; 2CJX B; 1J5E F; 4DL3 A; 4DHV A; 2F8M A; 2JRS A; 3B82 A; 5ADZ A; 5GMK a; 3K8V A; 4NA3 A; 2R7S A; 1H3D A; 2PA3 A; 4PG5 A; 1M0S A; 5EWE A; 3D6T B; 2FVS A; 5M2U A; 1HHT P; 3HDS A; 1N32 J; 3QSI A; 4LRA A; 1VQ4 S; 4IH7 A; 3GII A; 4K7Q A; 4YOE A; 5LM7 E; 4O44 B; 2J9D A; 4DCP B; 2HHV A; 4LFC J; 1JLG B; 4NLT A; 1MRO B; 1JLQ A; 4R5P A; 3CD6 S; 4B3O A; 3SCJ E; 3IR5 B; 3D28 A; 4Y2M A; 2AD9 A; 3UPF A; 2CQH A; 2I5J A; 4PXC A; 1S12 A; 2VPX B; 1AUS L; 3LQV A; 4B3S J; 3HLU A; 1CC8 A; 3I6P A; 4O3Q A; 2DH7 A; 2QG9 B; 2B9Y A; 1QAX A; 5C24 B; 5A8W A; 1RWO B; 2N4C A; 1S9G A; 3PHE A; 1RXO B; 4R8U B; 3CT9 A; 3HZG A; 4OYP A; 3IRX A; 1WC6 A; 4CDI A; 3ONQ A; 4FYV B; 1UW4 A; 3U1L A; 3OTO J; 1XQI A; 3FSY A; 3TEH B; 1X60 A; 2ACY A; 4PYA A; 2UXD J; 1FE4 A; 1UZH A; 2ZBC A; 3HT3 A; 2CZV C; 1RTI A; 2CNK B; 2V4J A; 4JI1 J; 1U0S A; 1UVK A; 1CSJ A; 3LPE A; 4ED8 A; 3E2E A; 1RT5 A; 3M6V A; 3BKF A; 1HNI B; 3DFE A; 1RSC A; 4CLK A; 5A8R A; 2K7K A; 4CLZ A; 1X9M A; 1S0M A; 4I2Q B; 4U9R A; 4DJB A; 1KP6 A; 2B7B B; 3FMB A; 4HH0 A; 3W5Y A; 1FCA A; 2M9K A; 4L74 A; 2UVV A; 1UVN A; 4L6V 3; 3MWB A; 1UWB A; 1AXQ A; 1QDU B; 1WDD A; 1S1X B; 3IWL A; 1DUR A; 5D3G B; 2B43 A; 2OPR B; 1GX5 A; 3HHD A; 2B4V A; 3OL7 A; 2CQI A; 3LA0 A; 1YTY A; 4LSZ B; 1S49 A; 4PPD A; 3QWU A; 3OL6 A; 2QIF A; 4KFB B; 3H4B A; 1S7H A; 3EDQ B; 1CJV B; 1A7G E; 4NXM F; 1F9H A; 4YEA A; 4UOH A; 3ILL A; 2OPS B; 4L3K A; 2XLI A; 2G0C A; 2DGQ A; 1MMD A; 4ZVH A; 3L7O A; 3DDN A; 3SV4 A; 1PG5 B; 1PJ6 A; 1GMV A; 3BQ2 A; 2W9A A; 2NSC A; 2F8H A; 1FDA A; 4G6V B; 4P7V A; 2EWH A; 3C2P A; 3RR7 A; 2VL1 A; 4EZ9 A; 2Z56 B; 4CCH A; 2HYI B; 5K14 A; 1WG5 A; 4Q5V A; 4IFY B; 4JI0 F; 1KFS A; 2DKO B; 3QJL A; 2AGO A; 2W1B A; 1E6V A; 4FS2 A; 1BGX T; 4IDK A; 1RTH B; 1Q78 A; 5J2P B; 2BQ3 A; 2VOD A; 3M2U A; 4KAI A; 3LW5 C; 4FDF A; 1N33 F; 4CP5 A; 2ZKU A; 2ZNZ A; 2UUW A; 5BR8 J; 1FRL A; 1JKH B; 2WHO A; 4WPA A; 4CIO A; 3ZFV A; 1XWL A; 2MKI A; 9ATC B; 5ETL A; 3IFE A; 3L9Z A; 2CPE A; 2E29 A; 1XR7 A; 1REV B; 4QYZ K; 4N56 A; 2YNH B; 3MMC B; 3Q89 A; 3AXK A; 3NL0 A; 4ZPT R; 2FD2 A; 4TYA A; 4DZ6 A; 1VK3 A; 4B9M A; 2HHP A; 4MK9 A; 4LIW A; 2ZKT A; 3RB6 A; 4P7T A; 3HXM A; 2Y1J A; 3ZZT A; 2CQD A; 2OJ3 A; 2ZH1 A; 2QX0 A; 3EX7 B; 2PT0 A; 1S99 A; 3TZZ A; 1R6V A; 3KK2 B; 5H9E J; 1RT4 B; 4B3T J; 1KLM B; 1H72 C; 3WZ0 A; 2R8H A; 2O66 A; 2P6S A; 4U6P A; 3EGN A; 2CIM A; 2QTW A; 5DG9 A; 1PBU A; 4K0K J; 2JEF A; 1U6B A; 1FNX H; 1Q7L B; 1AZS A; 1SQE A; 3D6M B; 4F2R A; 4NMX A; 2KDO A; 1G1X A; 3MPW A; 4NCG B; 2UVR A; 5ETV A; 3MEE A; 2C3P A; 1J2V A; 1MML A; 3CD7 A; 4NOH A; 3CME S; 1V5V A; 1RCO B; 2CAD A; 1B99 A; 2DCL A; 4LF7 J; 1FWP A; 1RLD A; 3H2V E; 1J5E J; 1RHU B; 4MIA A; 2WVB A; 3HJF A; 2NZC A; 4NAS A; 1NK0 A; 1YBT A; 3T9N A; 3OR2 B; 1VR6 A; 1N34 F; 3U02 A; 2GS8 A; 2JJ4 D; 2HHS A; 3IP0 A; 4HTI A; 4CH1 A; 2E1A A; 4DSJ A; 4AL7 A; 4C0H A; 3K0J A; 2WVF A; 2QMU B; 3PJX A; 2V9W A; 5CCM A; 1LW2 A; 2HFN A; 4X65 J; 2HS0 A; 4LF5 J; 1HNX F; 3VAJ A; 4DL6 A; 2W4C A; 3NGD A; 4P71 A; 3DRP A; 3ISZ A; 4EYI B; 1NJW A; 3DMJ B; 3K7R A; 1DLO A; 2GQC A; 2V94 A; 2DR7 A; 1NSA A; 2W9C B; 1W25 A; 1S1T A; 3EVW A; 4ERD A; 2GV1 A; 3A13 A; 3BN4 A; 3QO9 A; 2ZUG A; 3GTY X; 3I4H X; 1FA0 A; 3V6K A; 3M9M B; 1T9W A; 1X4H A; 1RZM A; 4KPC A; 1S4F A; 2B3T B; 5BXI A; 3N28 A; 2ZD1 B; 3UN2 A; 5F0U A; 5HVF A; 4IOA Q; 2A0F B; 2Z30 B; 3CCT A; 4DV5 J; 4W98 A; 2XWY A; 3ADA C; 5IT4 A; 5C2C A; 1IWG A; 3GG1 A; 4JUZ A; 2MLX A; 4HDG A; 3QT5 A; 2HHU A; 3QLH B; 4XPE A; 4PCQ A; 2IM1 A; 3OQ2 A; 4RW6 B; 3E8O A; 2RRB A; 5IM0 B; 2ZDO A; 1WOS A; 2GO9 A; 4E0D A; 1JLF A; 4ZVF A; 4J91 A; 2YWE A; 1H38 A; 1T94 A; 4NML A; 5LOQ A; 3TZY A; 3SFG A; 3FNN A; 1JB0 C; 1WUU A; 2B9W A; 1G7C B; 2MMY A; 2EPI A; 2LU2 A; 3GSI A; 2CNO B; 1RT1 A; 2YNG A; 3TUZ C; 4WK1 A; 3M6X A; 5KFX A; 3LAM A; 1S48 A; 2IBO A; 3FBF A; 1CJK A; 4NXM J; 4TLQ A; 3PRV A; 3T5L A; 1AB8 A; 2POK A; 1GQE A; 1YZ7 A; 3SEO A; 3UDC A; 4EFA C; 3HVR A; 1YJN S; 3IS9 A; 1SCJ B; 3CXC R; 3BPD A; 5FDL B; 2FB0 A; 1U26 A; 1NK7 A; 4WJB A; 4JI0 J; 1NH7 A; 3T3F A; 2Z58 B; 3GCW P; 2OML A; 4V19 J; 3R7B B; 1HW8 A; 4ES3 A; 1RT3 B; 2CPH A; 3M2V B; 1S1U A; 1YIJ S; 2P8I A; 2PA8 D; 1GXU A; 1FDD A; 3QZ7 A; 4DOZ A; 3X3U A; 1XNR F; 2C3M A; 4FNI A; 4XTT A; 1NJX A; 4AUK A; 3PCO B; 1CLF A; 1XMQ F; 1HI1 A; 3PKM A; 2HQG A; 3RG6 A; 2KKH A; 5DGA A; 1VRU B; 2DNG A; 2BW7 A; 3ENV A; 4LR7 A; 1U1P A; 3G6Y A; 4DG1 A; 4M95 A; 4RUA A; 2UVW A; 1JXE A; 5HO4 A; 2A10 A; 4G1P A; 1IBM F; 4LSN B; 3C6T B; 1VQS A; 2V69 A; 2HRT A; 3TA1 A; 2RU3 A; 5LSR A; 3V81 B; 1Y5N B; 1PBA A; 2DVI A; 1HBM B; 3BO4 A; 4TYB A; 2DJW A; 2VG7 A; 4KHR A; 2VG5 B; 3SQO P; 4DQQ A; 1ZA2 B; 3RBD A; 2GFF A; 1BXN A; 5F8I A; 3K59 A; 1HIY A; 3W2V A; 2HBR B; 3NG8 A; 4PKD B; 3JSM A; 1N56 A; 1N5V A; 3K57 A; 5DGB A; 3CCR S; 4YR0 A; 4PR6 A; 3FBE A; 2VD3 A; 2RT3 A; 2EI5 A; 8ATC B; 3D1Q A; 2XMV A; 1ELO A; 1YJR A; 2Y1I A; 2EVZ A; 1U8W A; 2QYC A; 2MDA A; 2GHP A; 4J9M A; 3MMB B; 2PMZ D; 2V9K A; 2Q66 A; 4KE5 A; 4M5J A; 1FJG J; 1JLQ B; 1L3T A; 4B3O B; 3QMQ A; 2G2Y A; 2BKP A; 5D0G A; 5DDO C; 2KXN B; 1KVJ A; 2I5J B; 3VF0 B; 3HSG A; 5EX0 A; 1X9W A; 4OYB A; 3BR8 A; 4LQ3 A; 3H2U B; 4P74 A; 4ATN A; 3Q8R B; 4ELT A; 4LUB A; 9RUB A; 4DEZ A; 1N34 J; 5FLX Y; 1U1M A; 1RU2 A; 4HVZ A; 5EUH A; 1SBR A; 5L46 A; 2DNL A; 5A8W B; 2OTJ S; 3AXM A; 2XYG B; 2H4Y B; 2HZV A; 3FDS A; 1RIS A; 4IO9 Q; 1YBA A; 1EKR A; 2KTQ A; 1ZBT A; 2D1C A; 3QJP A; 4USM A; 2L9N A; 2AT1 B; 3IMQ J; 2CWX A; 2AQ4 A; 5D8H B; 2YKA A; 4D3H A; 2OAU A; 1HNX J; 2H48 B; 4DV4 F; 3R7S B; 2V4J B; 1R8H A; 3P6Y C; 4K50 A; 3IAM 9; 5A8R B; 1MN7 A; 4MAK A; 4TXS A; 4Q45 A; 4UT4 A; 2ILZ A; 4USU A; 1SJR A; 3MGJ A; 3FKB A; 1KBR A; 1UWB B; 4PUO A; 3HD1 A; 1EP4 A; 1K1Q A; 2DIV A; 1JXV A; 4B9T A; 5L1L A; 4MKB A; 1FX4 A; 4CLW A; 3N6L A; 5J2Q A; 4CLL A; 2ATL A; 1U4B A; 2CPI A; 2CPY A; 3TUP A; 3DNC A; 5CYM A; 5GAG U; 2B56 A; 1B70 B; 1JWW A; 4PRF A; 5CYQ A; 1B4S A; 3MPY A; 3T1Y J; 3F0N A; 4PPZ A; 1C1B A; 4TU9 A; 3G6E S; 2BJE A; 1K47 A; 2AU0 A; 2GMH A; 5K14 B; 4L75 A; 4DR3 J; 5G0R A; 5I42 A; 5KG1 A; 1OYE A; 2JZ5 A; 1E6V B; 3R5J B; 3M8S A; 2LEP A; 3ELH A; 2RE1 A; 1FJE B; 2CQ1 A; 2GHV C; 1VQM S; 3AOD A; 3OVB A; 2HUR A; 5CZV A; 2UV8 A; 2J9C A; 3QIP B; 4FBT A; 1WF1 A; 4IH6 A; 1IKW B; 2LCW A; 2UUB J; 1YK9 A; 4ZCK A; 5ETK A; 1VQ6 S; 4ED7 A; 1DQ9 A; 4IQM A; 2PFD A; 1I51 B; 5IV3 A; 5EHH A; 4H4K A; 5CCL A; 4Y65 A; 4JV5 F; 2Z2M A; 2MTL A; 3FRZ A; 2QZ8 A; 3NGU A; 4P73 A; 3OBI A; 3ZTQ A; 2LXF A; 1TL3 A; 4HH1 A; 1XNR J; 2LLZ A; 4JI8 F; 4DSI A; 2HRY A; 2MYF A; 3ENA A; 1XMQ J; 2B5J A; 4C3L A; 2QA4 S; 1EET B; 2KM8 C; 3NWR A; 3AA8 A; 2KB2 A; 2C3O A; 1D8Y A; 1RK8 A; 3I0R A; 1IBM J; 4MK8 A; 3LUY A; 2KJV A; 3D66 A; 3KUG A; 1BY9 A; 2LFV A; 1X4D A; 1FRI A; 3UWT A; 3SMZ A; 2J6T A; 1S79 A; 3CB4 A; 1FK9 A; 4GO5 X; 2F1F A; 1OQ6 A; 4JI7 J; 2CQP A; 1VLO A; 3T5H A; 2F3J A; 2RQC A; 4B9V A; 2VB6 A; 4DWI A; 3CUL A; 2BKN A; 1HYS A; 1X5P A; 2RHQ B; 1C0T A; 1XC9 A; 1FTR A; 4NLR A; 5GVQ A; 2CPJ A; 2OPP A; 1P1L A; 3AB2 B; 4DQP A; 2VZ9 A; 3SYZ A; 1JNR B; 6FDR A; 4TQR A; 4X4U A; 4K5S A; 1TAU A; 3D1O A; 4UUX A; 4R0E A; 2CDR B; 2DY9 A; 3I5A A; 4DL2 A; 3VAH A; 3HSJ A; 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2ZH9 A; 2EK6 A; 2MB0 B; 4BS2 A; 1RTJ B; 3MAQ A; 2E5I A; 1U48 A; 4CI0 B; 2JVR A; 2LYV A; 5ETO A; 5HLF A; 3JTP A; 2RDI A; 1SC1 B; 3KLF A; 1YRX A; 4WK3 A; 3C14 B; 2GCF A; 4LFB F; 4U8Y A; 1TKD A; 5K5M A; 4QOT A; 3ZZ0 A; 1S6P A; 2N4D A; 2KHC A; 1LK5 A; 4WE1 A; 1VYA A; 2JFD A; 3G82 A; 2DNY A; 4Y2C A; 3DN9 A; 3VZH A; 1KQK A; 1U6Z A; 2IVY A; 4RLE A; 5LJ5 Y; 1FVQ A; 1NSK L; 4F26 A; 2DGU A; 3N5B A; 4WFN Q; 4MKA A; 5D0H A; 4ED2 A; 4DV7 J; 2IHR 1; 4ZPD A; 4JI8 J; 2MZ1 A; 2A1B A; 2RML A; 2YNI A; 2RQM A; 4LF9 F; 3BGR B; 3K5M A; 4PQA A; 3W2V B; 1RI7 A; 2A2D A; 5FJ4 A; 3KLE A; 3JSM B; 5KFF A; 1FKP A; 4RUB A; 2AJQ A; 4ZN1 A; 2RF2 B; 4DL7 A; 4J9Q A; 1TKX B; 3ISN D; 3D67 A; 1UFL A; 2B8P A; 3OR1 A; 1KHW A; 4ZCI A; 1BQM B; 2ZM6 F; 1X4G A; 4A47 A; 4IG3 A; 4M5D A; 2MJN A; 3PEH A; 3D2W A; 1S59 A; 1ZZN A; 4DUZ J; 1T95 A; 5AT1 B; 5L38 A; 4WYL A; 1TVR A; 3L09 A; 3HMJ G; 3CIM A; 1VBK A; 3KXD A; 5K20 B; 4NZ7 A; 3LPY A; 2VFS A; 1KEK A; 1WDT A; 5EN1 A; 4B3M F; 4IR9 A; 1NAQ A; 4FKX A; 4RNN A; 4KH1 B; 4ZKA A; 4LJM A; 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