The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Extended Substrate Recognition in Caspase-3 Revealed by High Resolution X-Ray Structure Analysis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CASPASE-3
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| total genus |
19
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2006-04-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R5J B; 1PYO B; 2FQQ B; 3GJT B; 3GJQ B; 1RHU B; 2C2M B; 1RWM B; 1I3O B; 3IBC B; 3D6M B; 1RHQ B; 3SIP B; 2Y1L B; 2QL7 B; 2H4W B; 3GJR B; 2XZD B; 2QL9 B; 4DCP B; 3R7B B; 2CDR B; 1RE1 B; 4JB8 B; 2QLB B; 4ZVR B; 1RWO B; 1RHK B; 1RWN B; 2HBQ B; 3P4U B; 1F9E B; 3GJS B; 2CNN B; 2Y0B B; 1I51 B; 2CNO B; 4ZVP B; 3D6F B; 1RHJ B; 2HBR B; 4DCO B; 1NME B; 1BMQ B; 5IC6 B; 2H65 B; 2CNL B; 1QTN B; 3KJQ B; 2XYG B; 4ZVO B; 2XYH B; 2H48 B; 1RWX B; 2H5I B; 1RHR B; 2H5J B; 2HBY B; 3KJF B; 2C2O B; 1RWK B; 1RWV B; 2DKO B; 3R7S B; 1PAU B; 2XZT B; 4ZVQ B; 3RJM B; 4ZVT B; 2CJY B; 1SC4 B; 3R6L B; 4ZVU B; 3NS7 B; 5K20 B; 3R7N B; 3IBF B; 1QDU B; 2C2K B; 3P45 B; 1SC1 B; 2P2C B; 5IC4 B; 2QL5 B; 2CNK B; 2QLF B; 4LSZ B; 2H54 B; 2H51 B; 1RWP B; 2QLJ B; 2H4Y B; 2C2Z B; 1ICE B; 3KJN B; 3D6H B; 1SC3 B; 2XYP B; 3QNW B; 2HBZ B; 3R6G B; 4ZVS B; 2CJX B; 1RHM B; 3EDQ B; 2C1E B; 4DCJ B; 1RWW B; 1IBC B; 3EDR B; 1GFW B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HVT A; 2C28 A; 1PG5 B; 3IWN C; 2N3L A; 2EXU A; 2BM1 A; 1T9V A; 4EU0 A; 4M5N A; 3CCZ A; 2DPJ A; 4X4Q A; 2HGN A; 2WAQ D; 2GGP B; 4AL6 A; 1YRX A; 4B9L A; 4QR0 A; 2MQM A; 3K89 A; 3VAI A; 2ZJP Q; 4CQ1 A; 4NZ7 A; 1X4F A; 4UUX A; 5K8N A; 1TR0 A; 3RRK A; 2XM3 A; 4OX9 F; 4K4Y A; 2Z2Z A; 4O3Q A; 1GNK A; 1Q82 T; 4OYI A; 3C46 A; 1IVZ A; 1WOR A; 1R27 B; 4DLG A; 2X1G A; 4Q5V A; 4RUH A; 4DR2 J; 3HFZ B; 3CGI A; 4Q43 A; 5D8H B; 1X0F A; 1D3W A; 1HNW F; 3D67 A; 3DRX A; 1RTJ B; 3MM6 B; 3W5X A; 4P72 A; 5EN1 A; 3IO1 A; 5KG0 A; 2W9B A; 4N7T A; 2MLX A; 1W26 A; 1FKO A; 2M8H A; 2MGZ A; 3KLH B; 4UOF A; 3D5M A; 3QRQ A; 2GAG C; 4PRF A; 2CPI A; 4DEZ A; 3ZZU A; 2CIM A; 5F3Z A; 1T9T A; 4LRA A; 2JFK A; 2WK4 A; 4DUY F; 4B9N A; 3N4W A; 4TKT A; 4JUZ A; 2DO4 A; 3DLB A; 4LF2 A; 2BZ2 A; 4HI2 A; 3RW7 A; 1Q53 A; 1CG2 A; 1Q7L B; 2MKY A; 2Q1L A; 4BWM A; 4PXD A; 4JV5 F; 2YBV A; 2DR9 A; 1FX4 A; 4IUF A; 3RB4 A; 2B9W A; 2CA9 A; 2VPZ B; 2YQ3 A; 3W9J A; 4ZVQ B; 2OMO A; 4O3R A; 3PNI A; 2YWF A; 2G0I A; 4LRC A; 2QMU B; 2LU1 A; 1KP6 A; 2MST A; 1N6Q A; 4B3S J; 2OFH X; 5ETM A; 3UCU P; 1SUQ B; 4RW6 B; 3OLA A; 2HFS A; 4P7V A; 4NPO A; 1S1U B; 4ZOS A; 4B3R F; 2ZHO A; 3MEG B; 4QWB A; 3QSI A; 3H5U A; 4OJH A; 2R2T A; 4OQJ A; 3IBC B; 2BW2 A; 3EGV A; 1RHQ B; 3ZZY A; 4AQY J; 3K8V A; 2OPQ B; 4LRE A; 1UWA A; 2KM8 B; 2V4R A; 4ZLJ A; 3JSR A; 4P10 A; 1WAC A; 4WYL A; 4EYI B; 3CCQ S; 3RTV A; 4GO5 X; 4DU8 A; 1NRK A; 1H7X A; 1WDD A; 2KFN A; 4P2F A; 2MY8 A; 2RNE A; 4OYZ A; 1YLX A; 3MOJ B; 3V6J A; 1T05 B; 3ZZ0 A; 1RTI A; 4O44 B; 5IOL A; 2BUN A; 1XK8 A; 2E29 A; 5KFP A; 5HVG A; 2HG4 A; 4I6W A; 4USU A; 2PGC A; 1N33 F; 1QVF R; 2RUS A; 3ZZR A; 3MF5 A; 2PII A; 3HJF A; 2UP1 A; 2LCW A; 1WTB A; 2DY9 A; 4CTA A; 3BPS P; 2K7K A; 1TL4 A; 3E8O A; 1F6T A; 1D0E A; 4CLZ A; 1R0A B; 4I67 A; 1FK9 B; 1SV5 B; 4NLQ A; 4DU7 A; 3JTP A; 3I0S A; 1TL3 A; 2GJI A; 1ZM3 A; 5E2Q A; 3RW6 A; 1Q7Y T; 1S5Z A; 3W65 A; 1VK8 A; 3TO8 A; 3TVY A; 3C8Y A; 2VFV A; 1O5J A; 3U27 A; 2LA4 A; 3W8P A; 3OSN A; 5ITH A; 1BMQ B; 4EO8 A; 3MAQ A; 4PYD A; 2CNL B; 4DR3 F; 1IR1 A; 2ZE2 B; 3T5J A; 2W8K A; 3FBE A; 2CVI A; 4ER8 A; 4DL5 A; 1CBK A; 4DX6 A; 2D3U A; 2MY7 A; 3CJ0 A; 2O3D A; 2P5V A; 4ED3 A; 3OD2 A; 4ZVT B; 3T1Y F; 3SBM A; 2KXH A; 5HQ8 A; 2ASJ A; 3DLK A; 4K4S A; 3Q8V A; 2GHP A; 2HNZ B; 1BE4 A; 1IXK A; 2XMV A; 4CLY A; 3A8K A; 1FRL A; 1RT2 B; 1Q0N A; 2B9Y A; 1NPP A; 3QRP A; 5C24 A; 1X4E A; 4JI4 J; 9ATC B; 5I4M A; 3QLH A; 2OD6 A; 2O66 A; 4RNH A; 5B0A A; 2HQG A; 4Y2I A; 2HFU A; 4P2S A; 2Z4P A; 3L3C A; 4RNF A; 2OPS B; 1WKJ A; 3KLE A; 4J9M A; 2VG6 A; 1GXL A; 2C3P A; 1VQP S; 4KT0 C; 4P73 A; 2KO1 A; 4FXV A; 2F4V F; 4MFB A; 3TX8 A; 2IVM A; 1K1Q A; 3ENA A; 4RJV A; 4H4O A; 3M2U B; 3MR3 A; 3EJM A; 2C42 A; 1X5T A; 3Q2T C; 3EVO A; 2EFN A; 4DI6 A; 1T03 B; 1N4L A; 4BWJ A; 2PI5 A; 3IWL A; 3N79 A; 2ZBP A; 4C8O A; 2NSC A; 3R9L A; 3W2V B; 2YH1 A; 1GEH A; 4OL8 A; 2QMX A; 1G1X A; 1XN9 A; 2MXY A; 1Z1Z A; 3C14 A; 4AL7 A; 1X7V A; 4ZIT A; 5DRK A; 5JVG Q; 1PKU A; 3ISN D; 4Y65 A; 2AJF E; 4ED6 A; 2XI2 A; 3DLE A; 2DGX A; 3AOD A; 5CYQ B; 2Z30 B; 2LEP A; 1OY8 A; 2AGP A; 1QM9 A; 2B6A B; 4WII A; 1RAJ A; 1QE1 B; 2ERR A; 4Q8F A; 1JB0 C; 1AFI A; 1B0T A; 4CO2 A; 5E5N A; 2RAQ A; 5KT4 A; 2VQF F; 5I3P A; 4NLD A; 3T6J A; 3KNG A; 2NXE A; 3KK1 A; 2K1R A; 2VBZ A; 3GTY X; 2M3D A; 2LLZ A; 2IMW P; 3TOQ A; 5KFU A; 4FXD A; 1SKR A; 2E9T A; 1UAW A; 1UA1 A; 2QYG A; 3QT8 A; 3F44 A; 3GR1 A; 4TU9 A; 4DDF A; 5KT6 A; 2CFX A; 1R8H A; 4Q7A A; 1M1H A; 3GCW P; 3UW1 A; 1U24 A; 3DRY A; 3ICL A; 2O67 A; 4J9K A; 2R7S A; 4S0M A; 4CLT A; 5DDR C; 2RUG A; 4DV0 F; 2YX7 A; 3CJ8 A; 3R5J B; 5J2M A; 1X5S A; 1XMB A; 2XHC A; 2AP6 A; 3QT7 A; 4RW7 B; 4OHW A; 1NND A; 2VC1 A; 4X4S A; 1ZET A; 2RQK A; 2AEF A; 8AT1 B; 1KFD A; 3A12 A; 3PRB A; 3TAP A; 2JC0 A; 4FXW A; 4A8O A; 2QN6 B; 1TUG B; 3GFZ A; 4UT4 A; 3LAN A; 5T14 A; 4DSF A; 3FUY A; 5JVH Q; 4OX6 A; 4LF8 J; 4JI7 F; 2EFP A; 5D4N A; 4ZVP B; 4C8L A; 1T05 A; 2NUH A; 4QU7 A; 2BBE A; 3OTD A; 3OSP A; 5DZ7 A; 3N01 A; 2R7W A; 1NHU A; 4OJ1 A; 4Q0B B; 1ZPW X; 2V8H A; 1KC8 T; 2IA0 A; 2CWX A; 2IAJ A; 2F4F A; 2P9G A; 1HI8 A; 2IC3 B; 1PJ5 A; 2KXF A; 2MQL A; 4DUT A; 1ZS6 A; 3V2U C; 4RKU C; 1QDU B; 5IC4 B; 3CD0 A; 4RZR A; 3MUM P; 5ETL A; 4FKY A; 1K1S A; 2X1A A; 4W92 B; 1NAQ A; 5DM7 Q; 1HFE L; 2HFO A; 2CKW A; 2PFF B; 4EGL A; 3IRW P; 2ZWP A; 4HDH A; 5A8W A; 5HBM B; 5LOQ A; 4DFM A; 3J7A N; 2DEI A; 4N8O A; 4RW8 B; 3OTO J; 1FO1 A; 2RH3 A; 2ZE2 A; 5CYM A; 1XR5 A; 2F9D A; 3TR5 A; 4KPY A; 3IM9 A; 2F8E X; 2YNF A; 1WG1 A; 2O5D A; 1S6O A; 1R43 A; 1TL5 A; 2ACM A; 3CUN A; 2GHV C; 2K3I A; 3NWG A; 3LQV A; 4WU3 A; 5KFY A; 2XBP A; 1F5A A; 3IS9 A; 2HWI A; 4QIF A; 4KHP F; 2R9L A; 5D77 A; 1T94 A; 1SQG A; 3KJF B; 3VQS A; 4C3M A; 2XMA A; 1CQM A; 5GVQ A; 2FZG B; 4LRF A; 1Q78 A; 2DNY A; 4PAA A; 2B5J B; 4P74 A; 1U1N A; 3JSM A; 3UN2 A; 3L7O A; 1ZYQ A; 1Y5N B; 3OW2 R; 3Q86 A; 2J7W A; 3M7V A; 5JMN A; 3B8H A; 4USH A; 4NCB A; 8ATC B; 3PKY A; 4F67 A; 4KAI A; 4JV1 A; 4USJ C; 2VF3 A; 3BGO P; 2E9Z A; 2HBZ B; 2HND B; 4UOH A; 1HD1 A; 2LVW A; 2FGO A; 3KXD A; 3Q8Q B; 2AYG A; 3TZY A; 2RB7 A; 4NMX A; 1FJG F; 3OL8 A; 2DRB A; 3KK3 B; 3CUL A; 2EK1 A; 4L73 A; 3TZW A; 2DNL A; 3OUY B; 3BGU A; 1FEE A; 5H9E J; 5HLF A; 1KQS R; 3Q8R B; 4PXC A; 4Y00 A; 3R8Y A; 2JEI A; 2YNH B; 2DGO A; 2ZH3 A; 4RW4 A; 3UWT A; 4CWB A; 2W4P A; 1RTD A; 3BV8 A; 3M2U A; 1UTA A; 5DDQ C; 2IVY A; 4QW9 A; 4A8X A; 4NLG A; 4OV1 A; 5HRO A; 3ZTQ A; 2E5I A; 3DGP B; 5JXS A; 1L3S A; 3ZXW A; 5HQL A; 4M8L A; 3BN4 A; 4DHV A; 4JBC A; 2EFO A; 1ZTW A; 4QZV B; 2JSX A; 4B3O A; 5F8G A; 4OX9 J; 4AD6 A; 4CH0 S; 2DJW A; 1SVD A; 1RWU A; 1EAR A; 3FDS A; 3MEK A; 4LQ9 A; 3MM9 A; 5AT1 B; 2AF6 A; 1KQF B; 2FJX A; 1UJ5 A; 2AYE A; 1HNW J; 1A0O B; 1WF2 A; 3N9U C; 5DO2 A; 1Q8K A; 3ZTP A; 2HHQ A; 1C2P A; 3NP5 A; 1TK0 A; 3LP0 B; 1QUP A; 2L9N A; 4G6V B; 4RBT A; 1QE1 A; 2GV1 A; 1N48 A; 4KE5 A; 1EX8 A; 4A8W A; 2D3O 1; 1WKK A; 5FII A; 1NXI A; 4IRC A; 2N4C A; 2GA7 A; 3ZTO A; 4NLT A; 4OZ5 A; 1H2T Z; 1TUV A; 2ZOF A; 1RDR A; 3DMJ A; 1NPK A; 4FF2 A; 4WF9 Q; 4HTJ A; 2B4O A; 3POT A; 4DXL A; 5D4L A; 5ETT A; 2JEF A; 5ADZ A; 1VOM A; 3L7U A; 4CYU B; 4UY8 5; 1SC6 A; 5BR8 J; 1MN9 A; 1EAY C; 4UOC A; 1KVJ A; 2BKN A; 3TAR A; 3CC2 S; 3NS6 A; 1FFW B; 1CS4 B; 4NML A; 1SC3 B; 2ZH2 A; 3P49 B; 2KHC A; 1WEL A; 1SPB P; 2OEJ A; 3K5O A; 1IBL F; 1X4G A; 5AE3 A; 1S1W B; 1J5E F; 5LJ5 Y; 4F0K A; 2W7A A; 2XWX A; 5A2Q Y; 3UR0 A; 3EMT A; 1V3S A; 4OZ0 A; 1RTZ A; 1NJZ A; 4Q0B A; 1NKE A; 3QT6 A; 5HVF A; 5E7O B; 4N47 A; 1FNM A; 4MIA A; 1BHN A; 2R7X A; 1DFD A; 5A8K B; 5BYQ A; 3QIP B; 3Q2S C; 3CJ4 A; 2AWZ A; 4QWE A; 4IG3 B; 4HT5 A; 4X84 A; 3SZ2 A; 4B9U A; 3JAM Y; 4Y2A A; 5HAO A; 2BOA A; 1QUV A; 3M9O B; 1H38 A; 1XNQ F; 1F2G A; 4BLG A; 2ATC B; 4NA1 A; 4LF5 J; 2LU2 A; 2ZZM A; 1IKV A; 5GAE I; 4UW2 A; 1J27 A; 5HBM A; 1CJT A; 4OZ3 A; 1T3O A; 1Q95 G; 4CO5 A; 4DLE A; 2RQC A; 3VAF A; 4EZ6 A; 2BYC A; 2CQC A; 2BR0 A; 2V63 A; 4P71 A; 1N33 J; 3H42 A; 1YIJ S; 2HUR A; 4RBV A; 4FF3 A; 3K2Y A; 1GMU A; 1LWF A; 3Q8P B; 3R7B B; 3R2C J; 3RU0 A; 2QGF B; 2X1B A; 1RWO B; 1UP1 A; 3TVK A; 1NH8 A; 1YRU A; 3RG6 A; 4R0E A; 3KLG B; 4ZLL A; 1AXQ A; 5B08 A; 1FD2 A; 4ECT A; 1DUR A; 4I68 A; 3BGR B; 2AX1 A; 4A8M P; 2ZD1 A; 4ECS A; 1K47 A; 3PRD A; 3VAH A; 1H3D A; 2XYG B; 2KL8 A; 3PXG a; 1U2C A; 3FCH A; 1RAG B; 2H5J B; 2BOP A; 1OY9 A; 4IR9 A; 2DNK A; 5F8H A; 4Z7C A; 3MM8 B; 4DR3 J; 5JJB A; 1SJF A; 2PT0 A; 1SBR A; 4PG7 A; 4ED5 A; 3RYL A; 3W3S A; 1HBM B; 2ZEJ A; 2BRL A; 5AXL A; 3KK3 A; 1KVI A; 4M5J A; 3NCQ A; 2P8I A; 3T1Y J; 2KVI A; 1G7C B; 1LWE B; 4I2P B; 3GPA A; 3SXL A; 2ZKT A; 2MZ1 A; 1N0V C; 4GVB B; 4PUO A; 1GX6 A; 3FZB A; 3HVW A; 4HR2 A; 2KB2 A; 1VRQ C; 1VR6 A; 3LAM A; 1C0U B; 2NS1 B; 2FJB B; 2VZ9 A; 2PN6 A; 3A3P B; 2E66 A; 3QGH A; 1ZH5 A; 3G87 A; 3M6V A; 3N6N A; 4ZPB A; 4KRW A; 4CLW A; 2HRY A; 2YWG A; 5J1N A; 4W4M A; 3SQO P; 5LSL A; 1U6B A; 1SH2 A; 2EPI A; 3IAS 9; 4C8Y A; 1N5Q A; 4C97 A; 2LQJ A; 2X7I A; 3E01 A; 2BKP A; 3JSY A; 4RNN A; 2NPI A; 4YR2 A; 2WB1 D; 3NWR A; 5F0W A; 3P45 B; 2ATL A; 5I42 A; 2MJN A; 1HW9 A; 1ITP A; 4N77 A; 1LFW A; 4URS A; 1XEZ A; 1B99 A; 2FHM A; 3DRP B; 2IYG A; 4CO4 A; 2CJX B; 2O1P A; 3EDQ B; 4RL1 A; 2E7V A; 2EKY A; 2IJN A; 3RR8 A; 1RAB B; 4MH8 A; 3J7Y U; 2EC0 A; 2VFT A; 1S6P B; 3V81 A; 4K50 A; 4HLB A; 3RRH A; 3GG0 A; 3L4B C; 5A0Y B; 4CLK A; 3CNQ P; 3TEG A; 2NQP A; 1B0P A; 2F63 A; 4LVO P; 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