The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Extended Substrate Recognition in Caspase-3 Revealed by High Resolution X-Ray Structure Analysis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CASPASE-3
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| total genus |
19
|
| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2006-04-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CJX B; 2C2K B; 1GFW B; 4LSZ B; 4DCJ B; 2H5I B; 5IC4 B; 3QNW B; 2CNN B; 1RHR B; 1RWK B; 2C1E B; 3EDR B; 1I51 B; 2H54 B; 5K20 B; 3D6F B; 1RE1 B; 2FQQ B; 2CNO B; 2XZD B; 3GJS B; 1NME B; 2Y0B B; 1F9E B; 4ZVP B; 3RJM B; 2QLB B; 1RWM B; 3EDQ B; 3D6M B; 2XYP B; 1SC4 B; 1RWP B; 1RWV B; 3D6H B; 2H48 B; 1QDU B; 2H4Y B; 3R6G B; 1RWX B; 2QL9 B; 2DKO B; 3IBC B; 1RHK B; 5IC6 B; 3GJQ B; 3KJN B; 2P2C B; 1RHQ B; 2CNL B; 1PAU B; 1RHU B; 3KJF B; 1IBC B; 1SC3 B; 2H65 B; 2HBQ B; 2XYG B; 2C2M B; 2QL7 B; 2H51 B; 2XYH B; 3P4U B; 3R5J B; 2CDR B; 1I3O B; 2H4W B; 4ZVU B; 4DCP B; 2CNK B; 2HBY B; 2QL5 B; 4JB8 B; 3R7S B; 3NS7 B; 3R7B B; 4ZVR B; 1BMQ B; 2C2O B; 1ICE B; 2XZT B; 1PYO B; 2QLJ B; 1RWW B; 2HBR B; 2C2Z B; 2QLF B; 1RHM B; 3R7N B; 1SC1 B; 2Y1L B; 1RWO B; 4ZVT B; 4DCO B; 3SIP B; 2H5J B; 4ZVS B; 3GJT B; 1QTN B; 1RWN B; 2CJY B; 4ZVQ B; 1RHJ B; 3R6L B; 4ZVO B; 2HBZ B; 3GJR B; 3P45 B; 3IBF B; 3KJQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UDC A; 1A6L A; 2YH0 A; 4GKJ J; 2Y8W A; 2ZH3 A; 4X4U A; 4B3R J; 2HZA A; 3U7J A; 5L1I A; 4U96 A; 1UVJ A; 1F9E B; 4CT9 A; 4C8Z A; 3KWM A; 4U7U K; 3HT0 A; 3PX6 A; 2ZH1 A; 4E0D A; 4PPD A; 2R8H A; 1VQ6 S; 1FTR A; 5LMN F; 4ZVE A; 1WHW A; 4KB7 A; 1H7W A; 1S1T A; 5IQ6 A; 3D54 A; 4O0N A; 3M32 B; 3NAH A; 2XHC A; 3M2U B; 3R97 A; 1KRP A; 4IFV A; 5AT1 B; 1FO1 A; 4KJI A; 4OZ2 A; 3MPU B; 1YWX A; 1UVM A; 4K59 A; 4DV3 F; 4RUH A; 2KYZ A; 3TJA A; 4P73 A; 2VG7 A; 8RUC A; 5FII A; 3RW7 A; 5LSL A; 2DHX A; 4PWU A; 1P6T A; 4NZ7 A; 1S77 D; 1OPZ A; 4F67 A; 2KT3 A; 4ANE A; 2LEB A; 1VLY A; 1S6U A; 3VGS A; 1AA1 B; 3PO5 A; 2R7O A; 1LW2 B; 4HVZ A; 2LMI A; 3HK2 A; 1PBA A; 1TR0 A; 3AT1 B; 3O2I A; 2RS2 A; 3IN5 A; 1NBE B; 5AJ3 F; 5BJR A; 2HS4 A; 5KG3 A; 1S9E A; 4K4S A; 1N0U A; 1RA6 A; 4QW8 A; 4ZMM A; 1AB8 A; 2LU2 A; 4ELT A; 3MOZ A; 3TJ9 A; 4DJB A; 4BLG A; 4TQS A; 4LQ9 A; 1RAA B; 3BSC A; 2YKN A; 2AYE A; 1RKJ A; 3B8H A; 4B3S J; 3VCD A; 3PRB A; 4USW A; 4K5S A; 2L9N A; 4KAI A; 2HG4 A; 4JI7 J; 1N33 J; 4DFP A; 2ASY A; 3QJJ A; 3RB3 A; 1WF0 A; 3LGH A; 4PWD B; 1MU2 A; 4B9S A; 4LSN A; 4DV7 J; 4OX9 F; 1ZZF A; 3VVT A; 3KK1 A; 3QLH B; 5J2Q A; 2B7C B; 4I1T A; 1Z2Z A; 4PZV A; 3H8Y A; 4ETX A; 4WXO A; 5IZH A; 1KC8 T; 2ASD A; 1T9T A; 4O23 A; 3UDL A; 3QRR A; 2RF2 B; 3U1L A; 3PYD A; 4AYB D; 3B4M A; 2YKP A; 3H5S A; 2OSR A; 3KDO A; 2CNN B; 5HAT A; 3NMA A; 3KJV B; 5CD4 A; 5E3C A; 1KLM A; 2KJW A; 3BKU A; 4RR5 A; 4ECY A; 4Y34 A; 5F8I A; 2P8I A; 4ID8 A; 1YJR A; 5KFQ A; 3EXC X; 4XDC A; 2DNG A; 2CPI A; 4I6A A; 4OZ3 A; 2G0J A; 2HQ3 A; 2J9D A; 5AXN A; 2DIS A; 2NZC A; 3QT7 A; 3BRE A; 1KOO A; 2HHH F; 1RT1 A; 4RU2 A; 2ZH4 A; 5KFL A; 2JFD A; 4WTY A; 4NRT A; 2JOQ A; 3CDU A; 1QY7 A; 3SQO P; 3CCE S; 5J1N A; 5K8O A; 2VG6 B; 2XC9 A; 3ITH B; 3PEJ A; 2ZNY A; 4EU0 A; 2NR0 A; 2D74 B; 2KM8 C; 2Y1L B; 4MK7 A; 1FK9 B; 1HI1 A; 1HBN A; 1K8A T; 4M5K A; 1S7I A; 2CJQ A; 1X9W A; 3DRY A; 4ILM A; 2EK6 A; 1ARO P; 1S57 A; 1K1Q A; 2VOO A; 2FHJ A; 4IOA Q; 4HEA 9; 3CUN A; 4LF9 F; 5T7L B; 1TMM A; 4LFA J; 3QRP A; 2WSE C; 3H90 A; 2MXY A; 2AJ0 A; 1RWU A; 1ZM2 A; 2QN6 B; 4IR9 A; 2YXL A; 3OXG A; 2DNR A; 4ES3 A; 1DUR A; 3GQC A; 1TK0 A; 3KK3 A; 1YSJ A; 1U1O A; 3JXO A; 4OYB A; 4FKX A; 1FDN A; 2C3O A; 3MM7 B; 2M0G B; 2HVD A; 1CLF A; 3VAM A; 1LW0 B; 1FKO B; 2ZH9 A; 4JI6 F; 3JAM U; 4F2S A; 1RK8 A; 3GIL A; 2QV6 A; 3P8B B; 2QSF A; 4D3G A; 4LRF A; 1UA1 A; 1N34 F; 4EYI B; 1QD1 A; 2V5H G; 4OFZ A; 1MNE A; 1RBA A; 2PE8 A; 2UXB F; 4ALZ A; 3DLK A; 3RUB L; 4OHV A; 1DTT B; 4L74 A; 2WBM A; 4ED6 A; 1DQ9 A; 2BYC A; 4C9D A; 5HVF A; 4M5H A; 3TAM B; 5RUB A; 4FXW A; 4A46 A; 2AGO A; 5D8H B; 5HP1 A; 3F0N A; 4QIV A; 1YBT A; 3NWR A; 2BMB A; 2CQB A; 2RDD A; 2PMZ D; 2FHM A; 1EET A; 5E41 A; 1HQE B; 3IC1 A; 4JI1 F; 1KBR A; 4WII A; 2CRL A; 4XTT A; 1SV5 A; 3CGI A; 1FDD A; 3JSM B; 2C2R A; 4FXV A; 2LEC A; 2BA9 A; 2JWN A; 2P5V A; 3HHK A; 2YX4 A; 2CPZ A; 2XMT A; 3K5O A; 4E2F B; 3IG1 A; 2CPY A; 1HR0 J; 3OFG A; 1VYA A; 3FDS A; 2GHP A; 3C6U A; 4NZ0 A; 4H4K C; 2GX8 A; 1F9F A; 4H4K A; 3HMJ G; 4QCL A; 2XSJ B; 1CJT A; 1Q0N A; 4ZJQ A; 4USV A; 4BCA A; 1D9D A; 2O01 C; 4IOB A; 3EJM A; 2GQ2 A; 2MKS A; 1VOM A; 4JI2 J; 3EX7 B; 3OSN A; 4OYW A; 2MGZ B; 5KT6 A; 1MG7 A; 1MMD A; 3J7A 1; 1TKT A; 3SMZ A; 4TU7 A; 1LQ9 A; 4QZV B; 4OYP A; 2LXU A; 5LMU F; 3V6H A; 2Q43 A; 5KFE A; 2YKQ A; 2GW8 A; 4LF4 J; 2VKZ G; 2R3V A; 3BN7 A; 1SJ4 P; 1SB6 A; 2FGO A; 1DFD A; 1Y5L B; 4YS2 A; 3KUH A; 1RTJ B; 4I6W A; 2Z58 B; 3MEC A; 4CYU B; 3CCT A; 4LT6 A; 4YY3 F; 3Q89 A; 3CJ8 A; 1U1R A; 1FRK A; 1WOO A; 2RHS B; 5ETT A; 3PYE A; 1KQF B; 5DQG A; 5KFV A; 1WTF A; 2HFO A; 1Q4R A; 2IPO B; 3HKW A; 3MAA A; 1RTH B; 4PUO A; 1BMQ B; 3P6Y C; 4AUK A; 1FE0 A; 5CYQ A; 1NPP A; 5A8W A; 2BV3 A; 4DHV A; 2RRN A; 2DCU B; 1SI9 A; 5LT5 A; 1VQK S; 4OHW A; 4ATN A; 2W2Q P; 4KFB B; 2X3G A; 3D5M A; 1S4E A; 1GTE A; 3CCQ S; 4DG1 B; 3LWM A; 3D6T B; 3L95 X; 1JJC B; 2XTJ P; 3JTN A; 4CQ1 A; 3PHT A; 7FDR A; 3PDN A; 2ZDO A; 3MPD A; 5KT4 A; 2NSC A; 3CE8 A; 3M2R A; 1IBK J; 2OEK A; 2IRU A; 3QT6 A; 3SBM A; 4EZ9 A; 4N8O A; 5ETK A; 4ES2 A; 2CQ2 A; 3KJF B; 3GP9 A; 1PCA A; 2AIR B; 4Z37 A; 3A8E A; 1N48 A; 4EMD A; 1F5B A; 3BGR B; 3R5A A; 3QFH A; 4O4R A; 3M7V A; 1N8R T; 4DCP B; 1IKW B; 3MMA A; 5D4O A; 5KFN A; 3FFI B; 2M7S A; 1QE1 B; 1MSW D; 2IM0 A; 5KFS A; 2K1R B; 2ZM6 F; 3FBF A; 4NLS A; 3NGT A; 3DRP B; 3T5H A; 3AOA A; 2QMW A; 4GO7 X; 3LP2 B; 4UUW A; 2OO4 A; 3D7S B; 3MFH A; 3P96 A; 3AOC A; 3GLJ A; 3IBF B; 2FVR A; 1SL1 A; 3UR0 A; 1S9F A; 3KLI A; 3AJ1 A; 1QAI A; 4I2Q A; 1QTM A; 1RGV A; 1VJQ A; 2N3L A; 1NJW A; 2RKI B; 1B64 A; 3KDN A; 1ZAX A; 1RT6 B; 1X4H A; 4RL1 A; 2LCW A; 4NA3 A; 2CPF A; 2ZH5 A; 1N5V A; 5HVH A; 3BPD A; 3HDS A; 5HMX A; 3GR1 A; 1ZOT A; 1WC6 A; 4A8W A; 2UXC F; 1WI6 A; 4KH0 B; 3PFO A; 1KNZ A; 2X1A A; 2OD4 A; 3BGL A; 2VV5 A; 4ANC A; 1B3T A; 3IRW P; 2VIC A; 4J9O A; 1RP5 A; 1B0T A; 2WVF A; 5DM6 Q; 3QFW A; 4OZL A; 1WI8 A; 2AJF E; 3R7N B; 3BJY A; 2XLI A; 3HVT B; 3K0J A; 2KVI A; 4K4W A; 5E2Q A; 2XO6 A; 2EFG A; 3CIM A; 1T11 A; 1Q95 G; 5ITH A; 1RTD B; 2LQJ A; 4DR1 J; 2JL9 A; 1YJN S; 1SVD A; 3MDF A; 2EFP A; 2K2P A; 5J1E B; 3IRX A; 5E0O A; 3UI3 A; 3OUY B; 2HQG A; 1G3O A; 2NXJ A; 4DLE A; 5CZV A; 3J7Z T; 3T1A A; 4EZ6 A; 2F9D A; 1UP1 A; 3TEH B; 2ADB A; 3H0P A; 3CJK B; 5L1K A; 4IR1 A; 1IR0 A; 3C6T A; 3WQP A; 2H1Y A; 4JUZ A; 1Q8B A; 1TQL A; 3QBC A; 2HAF A; 5H9F J; 4CO5 A; 4DL3 A; 3ADA C; 1N5Q A; 3QID A; 1NRK A; 4NA1 A; 1X0F A; 1DTQ B; 1IBM F; 1G7C B; 2H5E A; 3PW4 A; 2HVE A; 1HNW F; 2V2K A; 4DL2 A; 2FLO A; 3HSD A; 3NEK A; 1L3U A; 2BEF A; 2I9S A; 2IM3 A; 1SC6 A; 2G2Y A; 3HJV A; 3OL6 A; 1TV6 B; 3M30 A; 3L7P A; 1GFW B; 2PEB A; 2XS5 A; 3PXG a; 3M32 A; 3M2U A; 2F65 A; 4JV5 F; 1XC9 A; 4K7Q A; 1X60 A; 2BJD A; 4MYU A; 1DJ0 A; 1KWM A; 4KKO B; 3N9U C; 3PEH A; 4RW6 A; 2FVC A; 4ZCL A; 2QG9 B; 3P5T L; 3OLA A; 4K4X A; 2ZBP A; 3GJQ B; 1UPP A; 3K59 A; 1SL0 A; 1PG5 B; 3MEE B; 1RHQ B; 1PAU B; 2QJ3 A; 2LQB A; 2HVI A; 2A6M A; 5DLG A; 1QUV A; 2XMK A; 2LXI A; 2HHU A; 2HIQ A; 2R8J A; 2MKK A; 2KFN A; 1NK4 A; 3E2E A; 1QLN A; 2PC6 A; 1NB7 A; 1FEE A; 4JI4 J; 3AQP A; 3M1V A; 4Y2M A; 2DGW A; 2BOP A; 4JI5 F; 2HS3 A; 5HLF A; 2GVD A; 3T19 A; 5C2G A; 4J90 A; 4M95 A; 5JXS A; 2VJU A; 2IMO A; 2CFX A; 3TZY A; 4C0O C; 2D9P A; 2R7R A; 3HFV A; 3W5Y A; 3BO4 A; 3VQT A; 4Q45 A; 5H1S V; 3MR7 A; 3M9N B; 1TKD A; 4PWD A; 3D6M B; 4CDI A; 1OYE A; 3TRG A; 4RNO A; 1QVF R; 3GG1 A; 3GIM A; 5J2P A; 1J5O B; 4NXN J; 1S79 A; 2W2N P; 2VA2 A; 4M5D A; 3KHL A; 1Q7L B; 1NEE A; 3O3L A; 1R8C A; 4DV2 J; 3CCR S; 4GKJ F; 4CCH A; 2V4J A; 3C16 A; 1S1V A; 4M5L A; 1WKL A; 1R31 A; 2E5L J; 2R4F A; 3I9V 9; 4B3R F; 2BE9 B; 2V4R A; 1U4B A; 5B0C A; 4Q2L A; 3WC0 A; 2JDJ A; 2JLE A; 1NCL A; 5DG8 A; 3HSJ A; 2PO4 A; 2MQQ A; 2JLF A; 5A0Y B; 2MEW A; 1B99 A; 1ICE B; 4OIX A; 1SIZ A; 2GNK A; 5DO2 A; 3DC2 A; 3O6Q A; 4F0M A; 2WVE A; 1B0V A; 2KO1 A; 4IH6 A; 2ADC A; 3MAH A; 3T6J A; 3POT B; 1TKZ B; 1MRO A; 3N6N A; 1TZ0 A; 4QWB A; 1HIY A; 4ZVP B; 2DPI A; 2JC1 A; 2HPU A; 3DDN A; 1HHQ A; 2J0Q D; 2F40 A; 2G2Z A; 5B0A A; 2BJ8 A; 4B9N A; 5MLC V; 2MMY A; 3Q8V A; 3W2V A; 5K14 B; 5HBM B; 1SKR A; 4GKK F; 3QWU A; 2ZIT A; 3LGM A; 4RZR A; 2SXL A; 5ETO A; 2DGQ A; 2C2M B; 4A8K A; 4DSF A; 1FXD A; 2XHW A; 2A6O A; 2Z8Q A; 7FD1 A; 1GXT A; 1RT2 A; 2BJ3 A; 2V2Q A; 3KLH A; 3ET6 B; 3FNN A; 3R7S B; 1YHQ S; 2DNK A; 2DEJ A; 4EBD A; 3SQG B; 4O3O A; 2ROE A; 1U8S A; 3A8K A; 4I7F A; 3I4H X; 4B3S F; 2YQ0 A; 1OY9 A; 4AND A; 2CWK A; 4OLP A; 1KS2 A; 4KPC A; 4ZCI A; 1Q8K A; 4JI7 F; 1HPZ A; 3HZE A; 1FNO A; 3MR3 A; 2BOA A; 3MCO A; 3DLL Q; 3PVX A; 5A76 A; 4NCA A; 1RHR B; 2C1E B; 4DV7 F; 3KLV A; 1VMB A; 4YN3 B; 4L75 A; 3TUI C; 2BBE A; 4WFZ A; 1S10 A; 2D1C A; 1LV5 A; 4XO0 A; 4BDP A; 3KHG A; 3EDQ B; 3FJ2 A; 2XYP B; 4Y0F A; 3TAP A; 4USI A; 3CUL A; 3DRR B; 3DOL B; 4PQA A; 4K50 A; 1U24 A; 2PFF B; 5GAE U; 5BYR A; 1Y7P A; 5AE2 A; 4C8K A; 3PTW A; 1LK5 A; 1VS3 A; 1CC7 A; 3M8Q B; 1E6Y A; 3EYZ A; 3BR8 A; 2IM2 A; 1RAF B; 3SV4 A; 3W8G A; 1OY8 A; 3M2V A; 4WXW A; 4OI1 A; 3EPG A; 2VHG A; 1DQ8 A; 1ZM9 A; 4NE9 C; 1HQE A; 5IV3 A; 1VI7 A; 4WP9 A; 1HI8 A; 3L09 A; 3W9I A; 1EAY C; 2H5J B; 4USJ C; 4Q8F A; 3CDB A; 4GC6 A; 5B08 A; 3W5Z A; 5JVG Q; 2CQ3 A; 1ROF A; 3LP1 B; 4AXJ A; 1RAH B; 1NKE A; 2K3K A; 2D3O R; 5IOL A; 2VON A; 5E3P A; 3RR7 A; 2AHO B; 3X1L B; 3AY0 A; 2VBX A; 1RWM B; 2J5A A; 2JRS A; 3CJ5 A; 1S97 A; 5LOQ A; 1NSA A; 4U8Y A; 1V9O A; 2Y1I A; 1QVG R; 4Z7C A; 3G71 S; 2EW9 A; 1FKP B; 2YNI B; 3RR8 A; 1UCN A; 2ZWO A; 3UVJ B; 1OS5 A; 4DV5 J; 5D3G A; 2CDR B; 1IJE B; 1FXL A; 4XPC A; 4LFA F; 5F8L A; 2KHD A; 2W7P A; 4O3N A; 5DDP C; 4CH1 A; 4KGV B; 1KR4 A; 3PR5 B; 4A48 A; 2D41 A; 3CED A; 1F6T A; 4X65 J; 1HD0 A; 3G6E S; 1TL3 B; 2DH7 A; 2MJN A; 2FHJ D; 2EC2 A; 4X4P A; 1MLA A; 3BBB A; 3BM7 A; 1IR2 A; 1RUS A; 5ETP A; 3GSI A; 4Q5V A; 5SZT A; 3RB0 A; 1X4F A; 4X4S A; 2GCF A; 2DJW A; 4C4W A; 1R8P A; 2B9X A; 3CME S; 4DEZ A; 2CNO B; 2QC3 A; 1RTH A; 1T9W A; 2HQI A; 2FJD B; 2NLW A; 1SJF A; 2XI3 A; 4DQS A; 1RA7 A; 1R6Y A; 2IAJ A; 2UVR A; 4J5O A; 4TLQ A; 2UVW A; 1VGY A; 3OT9 A; 2HFU A; 4X4O A; 5KG0 A; 3AXK A; 1R0B G; 5CYJ A; 2QL7 B; 2W1B A; 1R0A B; 2H3E B; 3HD2 A; 2I8E A; 4IRC A; 2A1B A; 2CQ4 A; 1EB0 A; 3UQS A; 1FFG B; 1NHK L; 2G9O A; 2JEG A; 3BGO P; 4F2R A; 1BD6 A; 3QPI A; 5EN1 A; 2GGP B; 1UWB A; 3BQ2 A; 4EBE A; 2HND A; 5DDO C; 1C1C B; 1HR0 F; 1EKR A; 2X1F A; 4WKR A; 4UOF A; 2YNG B; 5CD4 H; 3R9L A; 4X62 J; 3EXY A; 4DN9 A; 1V6H A; 2AMC B; 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