The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
103
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structure length |
103
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Chain Sequence |
ASGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Extended Substrate Recognition in Caspase-3 Revealed by High Resolution X-Ray Structure Analysis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CASPASE-3
|
| total genus |
18
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| structure length |
103
|
| sequence length |
103
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2006-04-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RHM B; 3R7S B; 1PYO B; 1RWP B; 3EDQ B; 2XZT B; 2DKO B; 3D6F B; 2Y1L B; 1RWK B; 3KJQ B; 2H5J B; 2XZD B; 4ZVQ B; 2HBR B; 2QL5 B; 2XYH B; 4JB8 B; 2H51 B; 1RWN B; 2QLF B; 2QL7 B; 2H65 B; 2C2K B; 2HBQ B; 3EDR B; 2HBY B; 2CJX B; 3R6L B; 3R6G B; 3R7B B; 2XYG B; 3GJR B; 5IC6 B; 1IBC B; 4ZVO B; 1SC1 B; 3D6M B; 3GJS B; 2QLB B; 2CNO B; 1ICE B; 1RHQ B; 1F9E B; 2CJY B; 1RWX B; 2FQQ B; 1RHU B; 4DCO B; 5K20 B; 2Y0B B; 2P2C B; 4ZVS B; 1I51 B; 4ZVP B; 2C2M B; 1QTN B; 3P45 B; 4ZVT B; 1GFW B; 1NME B; 1BMQ B; 1RWV B; 1RHJ B; 2H5I B; 2QLJ B; 2C1E B; 3R5J B; 2C2Z B; 3GJQ B; 1RWW B; 2CDR B; 2QL9 B; 3R7N B; 2CNN B; 1PAU B; 3P4U B; 2H48 B; 1RWM B; 3KJN B; 1QDU B; 1I3O B; 4DCJ B; 2XYP B; 2HBZ B; 2H4W B; 5IC4 B; 4DCP B; 3GJT B; 3NS7 B; 2H54 B; 4ZVR B; 3D6H B; 1SC4 B; 1RHR B; 1RWO B; 3IBF B; 3KJF B; 2H4Y B; 3SIP B; 3RJM B; 4LSZ B; 2CNL B; 4ZVU B; 3QNW B; 3IBC B; 2CNK B; 1RHK B; 2C2O B; 1RE1 B; 1SC3 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1S57 A; 3IMQ J; 4DQR A; 3VAL A; 4JUZ A; 3TA0 A; 2RDI A; 2JOQ A; 3H59 A; 2MLX A; 4RNM A; 2J0Q D; 2XTJ P; 4QIW D; 3J81 U; 3HD1 A; 4DV7 J; 3ELH A; 3EGW B; 1RT5 B; 1N4L A; 4WTY A; 2QIF A; 4LFC J; 3TAR A; 3UD4 P; 3MPU B; 4O4G B; 4CO3 A; 1HI0 P; 7AT1 B; 3OTD A; 1N5Y B; 3GMG A; 1WOO A; 2R8I A; 1H73 A; 3BDE A; 1XR7 A; 2X51 A; 1DQ8 A; 4G1P A; 2ZOF A; 2MQL A; 3PCO B; 3SSQ A; 1YJW S; 1C1B B; 1TKT A; 3FEZ A; 3M8P A; 2CQ3 A; 3MR2 A; 5HP1 A; 4DJB A; 4USW A; 5DGA A; 2DGS A; 4DLE A; 2C2D A; 5A0Y A; 3ADA C; 3CB4 A; 3NS7 B; 3IWX A; 4DV1 J; 4R8U B; 4P2S A; 3IG1 B; 3RBE A; 2GJI A; 2B5J A; 2FJV A; 4PQU B; 2DNL A; 3DM2 B; 1RTD A; 1ITP A; 2QYG A; 3KK3 B; 4MH8 A; 3FGV A; 2ZUG A; 4LSN B; 2EFO A; 3D6F B; 3C19 A; 1RWK B; 5HRO A; 4DS5 A; 2BM1 A; 5AXK A; 4I7F B; 4AXJ A; 1RWN B; 4KH1 B; 2OUG A; 3K17 A; 1H6K X; 3MM8 A; 3W8G A; 1NDL A; 2XBP A; 1F9F A; 3RRG A; 1LOU A; 4KV8 B; 4YHH J; 3G82 A; 2AGO A; 2E66 A; 3H90 A; 2ZFH A; 4DX6 A; 2E1C A; 4DX5 A; 5AXN A; 2Z2L A; 2V2V A; 5KT6 A; 4WU2 A; 2RVJ A; 3JYT B; 1AXQ A; 1YIJ S; 2BAN B; 3CUN A; 4WYL A; 3L95 X; 2V8H A; 1D8Y A; 2CJ9 A; 3HSG A; 3QGG A; 4NLU A; 1TMM A; 3IS9 B; 1UEK A; 3DOL B; 5HAT A; 2B9E A; 2HNY B; 1DQ9 A; 1WHX A; 2B8Q A; 3W5Z A; 4IOA Q; 4R0J A; 1BQN B; 2E5L J; 3QT8 A; 1H74 A; 2AQ4 A; 2AYM A; 3GZ7 A; 1MML A; 1WF0 A; 3R1L A; 1APS A; 4NLP A; 2HAI A; 3R27 A; 3FBB A; 5HMW A; 3MEC B; 1S9G A; 2PO4 A; 1KLN A; 4DF4 A; 1E6Y A; 2RF2 B; 2MHN A; 3LGM A; 4KH0 B; 4YB5 A; 4ELT A; 4Y6I A; 3RW6 A; 2OFG X; 3FVY A; 3SMZ A; 4CLZ A; 3DC2 A; 3ZXW A; 2R3V A; 2VG5 A; 1N5Q A; 3M8Y A; 1T9X A; 3V6H A; 3TJ8 A; 3W64 A; 3DYA B; 2WB4 A; 3GP9 A; 1RT2 A; 1WI6 A; 3HZE A; 4YP3 A; 2DHG A; 2VOO A; 2IBK A; 3CCT A; 2F9J A; 3MEG A; 4MFB A; 2ZH9 A; 2VQF F; 2WBR A; 3TJ9 A; 4WKR A; 5A6W A; 2DRD A; 4AFF A; 5IV3 A; 3CCE S; 2KFN A; 4WFB Q; 4UF4 A; 1B64 A; 2MKH A; 2D3U A; 2FC9 A; 5F8I A; 2WB1 D; 1FRJ A; 1MW7 A; 1RT7 A; 1HHT P; 4RNH A; 1G3O A; 2N4C A; 2JLE A; 3DLG B; 4OHW A; 1V3R A; 3UR3 C; 3AH6 A; 5A8K B; 3GIJ A; 4RL1 A; 1U1Q A; 4BLG A; 4YN3 B; 2G1D A; 4CP5 A; 4B3R F; 2BJ1 A; 2VB6 A; 4RX6 A; 3K8W A; 2OLW A; 4ECR A; 1LK5 A; 5KFW A; 1W26 A; 5A8W A; 4WK1 A; 1VFJ A; 2RHQ B; 1DZ5 A; 2HBQ B; 1OSD A; 4NEY A; 4MIW A; 2JFK A; 2BE2 B; 3DOK A; 2NPF A; 2HHH J; 1Y4Z B; 3UVJ B; 2E9T A; 2Z30 B; 1XMO F; 2LQ5 A; 3W2V B; 2HFZ A; 3FZB A; 2YWH A; 5HJX A; 4ZVT B; 5CD4 H; 3KHL A; 1IBL J; 5KFV A; 1IXK A; 4F02 A; 3KXD A; 4EBC A; 2R7X A; 2RE1 A; 4DX8 H; 1RU2 A; 1N36 J; 3PYF A; 4WXW A; 2YKN B; 5CZV A; 2G13 A; 4DU7 A; 1NHV A; 5KFB A; 1OMS A; 2YVS A; 3PRV A; 1S97 A; 5A8R B; 2WW8 A; 5FJ4 A; 2AD9 A; 5EX0 A; 3SI8 A; 3PHT A; 1HNX J; 5J2Q B; 4DV2 F; 4OLP A; 3ENV A; 2BW2 A; 3FFI B; 2G4B A; 2IYG A; 4LF8 F; 4DR4 J; 3ISN C; 3QT6 A; 5F8M A; 4DV3 J; 3MPY A; 1RAC B; 5GAE I; 2AJ1 A; 2R2R A; 3OTE A; 2IVM A; 4CT8 A; 4UOG A; 2HK2 A; 1TL7 A; 1B3T A; 3NL0 A; 3PW0 A; 4QIG A; 1ARO P; 1RAG B; 3C16 B; 2NXE A; 4Y00 A; 3V4I B; 4NXN J; 3EGZ A; 3DLE A; 3S6E A; 2MQN A; 2RT3 A; 1YI2 S; 1EAY C; 1UTA A; 2NRE A; 5GAH U; 2DB1 A; 4RNN A; 2RIJ A; 2ACY A; 2ADC A; 1K1Q A; 5KFK A; 5C24 A; 2GIF A; 3LA0 A; 5M2P A; 2BJ7 A; 4EZ9 A; 4CM0 A; 5B0F A; 2UXC J; 1REG X; 1JLC A; 2G9O A; 1SC6 A; 2MYF A; 4JI8 J; 2UXB J; 4BHQ A; 2E1M C; 2IMO A; 1NSK L; 2DEI A; 1ZAW A; 1TK5 A; 1LFW A; 5HMX A; 2OEK A; 2IYI A; 4NA2 A; 4DQQ A; 2LA4 A; 1RTH B; 1KEK A; 3CME S; 3AJ1 A; 2YWG A; 2V2Q A; 1YJN S; 1CC8 A; 3FJ2 A; 1R0A B; 2WSF C; 3A3O B; 1WC1 A; 3HJF A; 3AXK A; 3T1H J; 1HPZ B; 2FY1 A; 2CPY A; 1FRL A; 4DMZ A; 4LFB F; 4ETZ A; 2IM1 A; 1T9Y A; 5CYJ A; 2ZH8 A; 3IWL A; 2HQI A; 1REV B; 4C2M A; 2PMW A; 2XCP A; 2VON A; 3TAN A; 4DSK A; 3TVY A; 2C2M B; 2JJ4 D; 3CO0 P; 3A8K A; 2FB0 A; 4LF5 F; 4ZA1 A; 1YHQ S; 2OI2 A; 1JWW A; 4PYD A; 4LQ3 A; 4UY8 T; 3V6D A; 2IA6 A; 1TL1 A; 3R5C A; 2CQ2 A; 5H9E K; 1ZTW A; 3POT A; 4I2P A; 4K4T A; 3PJW A; 3I5A A; 1HNW F; 3W65 A; 2H1Y A; 2M70 A; 4A46 A; 3KFW X; 1Y3J A; 4PQA A; 2DGQ A; 2L9W A; 4IDK B; 2E9R X; 3THP A; 3LP1 A; 2YQ3 A; 2RU3 A; 3T5L A; 5T41 A; 1VHF A; 2XLK A; 1N0V C; 1T7P A; 4QIF A; 2DGW A; 5DDO C; 2ZBR A; 4DV0 F; 2UVR A; 2EBE A; 2HRU A; 3M2U A; 2J9C A; 1T9V A; 4DSF A; 1JLA B; 2MQ8 A; 4R25 A; 1KD1 T; 2L41 A; 4DR2 F; 1HQE B; 4HKQ A; 3UN2 A; 1U7L A; 4RWW A; 4ZVO B; 1Q7Y T; 1TKZ B; 4Y34 A; 4CLL A; 2W7P A; 4C8M A; 3CSK A; 1Q81 T; 2G2Y A; 2BRL A; 3GG0 A; 3KG0 A; 5D78 A; 5G4D A; 1RAH B; 4LT6 A; 1M5H A; 3GR1 A; 3N6N A; 1UJ4 A; 1NM2 A; 2EEY A; 3CF5 Q; 1K0V A; 2CPZ A; 3JQJ A; 2AJ4 A; 4RR5 A; 1S0M A; 1JLQ B; 2JRS A; 1HR0 J; 2QTW A; 4UOF A; 3T5H A; 1IQT A; 2NZ4 A; 4ZPT R; 4LIR A; 4KYZ A; 4Y65 A; 2XMK A; 2GAG C; 1MRO A; 2GJF A; 1TL3 A; 4X66 J; 4OYM A; 1RT3 B; 3RAX A; 3QSI A; 1WUU A; 3VQS A; 1DLO B; 4TU9 A; 1IKW A; 1VQN S; 2X7I A; 5I4M A; 1B0P A; 4LRA A; 1S1U A; 1OWX A; 4KIA A; 2Y9H A; 4JI0 F; 4OHX A; 4CH0 S; 4A8M P; 4DR5 F; 2W2Q P; 2VJV A; 4JI2 J; 4KT0 C; 1PIE A; 4D3G A; 4MK9 A; 5LOQ A; 1HBU A; 3I0R A; 1RUS A; 4DHV A; 1ZA2 B; 4NMX A; 3TEH B; 3BSA A; 2CQ0 A; 3ZZZ A; 3D1Q A; 4RU9 A; 1S76 D; 2J0W A; 5HVG A; 3DMJ A; 2HHQ A; 5KFE A; 3EGV A; 2ZH7 A; 1VIS A; 3G87 A; 5FDL B; 2D74 B; 4OV6 A; 4QWC A; 1ULR A; 1T8E A; 3ZO7 A; 1LWE A; 4PWD A; 1UFK A; 6FDR A; 2DNO A; 2Y0S D; 2GGP A; 2I2Y A; 5IXU A; 3ETM A; 1GEH A; 3RYL A; 1PBA A; 3SQG B; 4X4Q A; 1B0T A; 3LWM A; 3D68 A; 1JLB A; 1U1K A; 2W01 A; 2LA6 A; 3QT7 A; 4NI2 A; 2CNK B; 1XR6 A; 5I3U A; 1X4E A; 2WVC A; 2K3I A; 5LSO A; 3KUE A; 4ZIW A; 2D3O R; 1QVG R; 1JJ2 R; 4PAA A; 1M5P C; 3H2U B; 3I0S B; 4FXD A; 3ETO A; 2PD1 A; 4M5M A; 2V4J B; 2HVD A; 2MKI A; 1WG4 A; 1SUQ A; 1SKR A; 2B51 A; 4DQS A; 1XBW A; 4X65 F; 3TQE A; 1EKS A; 2HWT A; 5F41 A; 2VC0 A; 3DLH A; 1Q5Y A; 3K58 A; 1FX2 A; 1U0S A; 3W2W B; 3EYZ A; 4KFB B; 2QLJ B; 5DGB A; 3HT3 A; 4G1I A; 2G0J A; 2OD4 A; 3B8H A; 4RZR A; 5KG3 A; 5H1S V; 1T94 A; 2KB2 A; 2KN4 A; 3UD3 P; 3J80 U; 2R7U A; 3LW5 C; 2GO8 A; 1NK0 A; 4X4N A; 4IYQ A; 1VCT A; 3CDB A; 4RW9 B; 3OXG A; 4OI6 A; 3TUJ C; 5L39 A; 5D4N A; 2UXD F; 4U7U D; 1ROF A; 2Z8Q A; 2OTJ S; 4CM2 A; 4U96 A; 1BQM A; 5EGY A; 1KP6 A; 1F3V A; 1QE1 A; 3CNQ P; 1U1P A; 2DYA A; 4FXV A; 2HGN A; 1JIH A; 3P5T L; 1CQM A; 3K57 A; 1NDP A; 4NLR A; 3E01 A; 3I5C A; 7FDR A; 1ZTT A; 2AGP A; 4I2Q A; 4I6W A; 3HI9 A; 4HI1 A; 1HBM A; 3I32 A; 3OTO F; 2JNJ A; 4QJV A; 4W92 B; 5L9X A; 5ETS A; 3T5J A; 2C2N A; 4J9K A; 1FF2 A; 2RAQ A; 2EFN A; 2VBX A; 2HFN A; 4JI7 F; 4OYX A; 1PCA A; 3T6J A; 1RI7 A; 1RAI B; 1K1S A; 4UOC A; 1RHR B; 1SV5 A; 5IQQ A; 1RIS A; 3MR7 A; 1XMQ F; 5KT2 A; 2C22 A; 3CJQ A; 3H25 A; 3TAP A; 1NK8 A; 4B3S J; 2V34 A; 2IC3 A; 4FYD A; 1RT4 A; 1S1W B; 3TJA A; 3CJS A; 5HL7 Q; 2HHU A; 2R7Q A; 5KFI A; 3UPF A; 1D1U A; 4MK8 A; 4FNI A; 2ABY A; 1KFS A; 1YJV A; 1YJ9 S; 4G1Q B; 1LQ9 A; 2ZBP A; 4ANE A; 2U1A A; 2DPJ A; 3EVM A; 4LFA J; 1Q8B A; 5ETL A; 1CEZ A; 2YNH B; 3HSJ A; 1QAX A; 2NZC A; 2FZK B; 5E0O A; 3CPW R; 1NU4 A; 4K4U A; 1UVN A; 2WTF A; 1IKY B; 1NME B; 3DOM B; 3MGJ A; 2COL A; 2WZ1 A; 3HFV A; 4DI6 A; 1L3V A; 5CA5 A; 3CCS S; 4OZ1 A; 4F4K A; 3UCG A; 2XY6 A; 4TLR A; 5KG7 A; 2IDE A; 4NLQ A; 3CO9 A; 1L3U A; 1CUL B; 4PUO B; 5E3C A; 5B0B A; 4B3T F; 2HZC A; 1H0H B; 1KNZ A; 4FZV A; 4O44 B; 2Z58 B; 2BA9 A; 4NCB A; 4F36 A; 1P9Y A; 2HK3 A; 1FA0 A; 3Q23 A; 1P6T A; 1V5I B; 1SJF A; 2DY1 A; 3K0J A; 3R2C J; 2RH3 A; 4F0H A; 2A2D A; 3OR2 B; 1RK8 A; 3CC4 S; 2J0X A; 5HAO A; 3UR0 A; 1ZOT A; 4ZVQ B; 3LP0 A; 2K1R A; 2Y3Y A; 3BS9 A; 2ZH6 A; 4DZ6 A; 2PFD A; 4ECV A; 2F7V A; 4QR2 A; 3HK2 A; 4JI3 F; 2DR9 A; 8AT1 B; 4H4M A; 3R6G B; 1JKH B; 4IO1 A; 2PI5 A; 4USK A; 5D8H B; 1V3Z A; 4ICL A; 3G6E S; 2DH7 A; 1R6V A; 1SC1 B; 4JYA J; 1HMV A; 1T02 A; 3M05 A; 1MN7 A; 2J6T A; 5HMZ A; 5KT3 A; 2IJN A; 2MXY A; 3P45 B; 1OPI A; 5L1K A; 1NK5 A; 3US5 A; 5HK4 A; 3OL9 A; 2BAB A; 4DS4 A; 5JVH Q; 1S1T A; 4QPX A; 4URQ U; 2XSJ A; 2O5D A; 3IC1 A; 4UY8 5; 4YFU A; 4URS A; 1WAC A; 4UQG A; 3FCH A; 3M32 B; 3FUY A; 4ER8 A; 1QUV A; 4LBH A; 1RWO B; 4TYA A; 5IFM A; 2JLG A; 5F8G A; 4KHR A; 1NPR A; 3L3C A; 1F9H A; 3QLH B; 3MR6 A; 5F9N A; 2HBR B; 1IM6 A; 5F8N A; 3ONQ A; 2DBB A; 2Q79 A; 3RW7 A; 2RKI A; 3HFZ B; 3GQC A; 2MGZ B; 3TEG A; 5CCM A; 2ZZM A; 2GVZ B; 2PGC A; 2W9A A; 5THW A; 3JSM A; 4IUF A; 1FES A; 4ZN3 A; 2OPQ B; 2UV8 G; 4P2M A; 1T11 A; 2IMW P; 1QY7 A; 2GHV C; 2WOM B; 2MKC A; 2CAJ A; 2NSC A; 3QRQ A; 1C0T A; 1XMB A; 1PJ7 A; 2AW0 A; 1CLF A; 2KI2 A; 1D09 B; 3BN7 A; 4DBQ A; 2IVY A; 3KJF B; 4OI2 A; 1RJJ A; 2JVO A; 1X5T A; 2ERR A; 2EFG A; 4ZKA A; 4DR3 F; 1NB2 A; 2PEH A; 4RW7 B; 2EC0 A; 4K59 A; 2BOP A; 5L1L A; 2GJ2 A; 3EM1 A; 4WZM A; 3HHK A; 2QMW A; 1X7V A; 3U1N A; 1WC4 A; 2OML A; 2H9Z A; 2C2K B; 3TUP A; 2OSQ A; 1V5V A; 1H72 C; 3GJR B; 3Q24 A; 5IWA J; 1TK8 A; 2AWZ A; 3A4T A; 4D3H A; 2F4V F; 5J2M A; 4M5J A; 4NX9 A; 2JEG A; 2A1B A; 2PA3 A; 2GQQ A; 4ZVP B; 4N76 A; 4M5L A; 1DTT A; 1AB8 A; 1FJG F; 3OL6 A; 4IG3 B; 3I4P A; 4FPR A; 4NCA A; 3D66 A; 5J2P A; 2RS2 A; 2VFU A; 4ECY A; 1BGX T; 4KHP J; 1U2F A; 2VD3 A; 1HBO B; 1VJQ A; 1SC4 B; 4HR2 A; 2JFD A; 3V81 A; 3NGK A; 1QAY A; 2CKW A; 2WBM A; 3IBW A; 2Q43 A; 1SC3 B; 4DEZ A; 2XHC A; 4FYV B; 2CPD A; 2B6A A; 4X62 J; 4HAC A; 3G82 B; 4O23 A; 2K7J A; 3BJY A; 3DLB A; 5KFS A; 2E7W A; 4M5D B; 5E3R A; 2WK4 A; 3N6M A; 3MPW A; 2B9Y A; 4LF6 F; 4K4X A; 5GAD U; 4LF9 J; 4HHU A; 4WFY A; 4J7C A; 3VQT A; 3CMQ A; 2YY3 A; 4K4W A; 1KLM A; 3PW2 A; 1NSA A; 1QJH A; 1SBR A; 3BN4 A; 2DIT A; 1XK8 A; 3DRS A; 2DH9 A; 4CTA B; 4OX8 A; 2VKZ G; 4K50 A; 4NXM J; 2DHS A; 3C14 A; 3NOG A; 3KHH A; 3ET6 B; 2FIU A; 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