The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| total genus |
17
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C1E B; 3R7B B; 4DCP B; 2H51 B; 2CNL B; 2QLF B; 1RWM B; 2Y1L B; 3R6G B; 3D6F B; 2C2Z B; 3KJQ B; 4ZVP B; 1RHQ B; 4ZVQ B; 2QL7 B; 3IBC B; 3EDR B; 2CNK B; 1RHU B; 1I51 B; 4ZVU B; 3SIP B; 3R5J B; 2P2C B; 2CJY B; 3R7S B; 1RWP B; 2HBZ B; 4DCO B; 1RWN B; 4JB8 B; 2H4Y B; 3IBF B; 1RHM B; 1QDU B; 3KJF B; 3RJM B; 4LSZ B; 2HBQ B; 1RWV B; 2H5I B; 3GJR B; 3P45 B; 3EDQ B; 2C2M B; 1RWW B; 1SC1 B; 1PAU B; 1QTN B; 4ZVT B; 2H48 B; 1RHJ B; 1RWO B; 1ICE B; 2XYP B; 1RE1 B; 5IC4 B; 2XZD B; 2QL5 B; 2H4W B; 2CNN B; 3QNW B; 1RHR B; 2XYH B; 4ZVO B; 2FQQ B; 3KJN B; 2C2O B; 2DKO B; 2QLJ B; 2XYG B; 1SC4 B; 1GFW B; 3GJT B; 5IC6 B; 3R7N B; 4ZVR B; 2H65 B; 4DCJ B; 3GJS B; 2QLB B; 1IBC B; 3NS7 B; 1RHK B; 5K20 B; 2CDR B; 3GJQ B; 2HBY B; 1F9E B; 2XZT B; 1PYO B; 2C2K B; 1BMQ B; 4ZVS B; 2QL9 B; 2CJX B; 3R6L B; 1RWX B; 2H54 B; 2HBR B; 3D6M B; 2H5J B; 1RWK B; 1I3O B; 1NME B; 3P4U B; 2CNO B; 2Y0B B; 1SC3 B; 3D6H B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JJH A; 2QEX S; 4PWW A; 4GVB B; 2CRL A; 3NGK A; 4U96 A; 2FLN A; 5K14 A; 2VPW B; 3HT3 A; 4EU0 A; 2HQG A; 3IBC B; 1JXV A; 4DV0 F; 1O6X A; 2HKE A; 4WK3 A; 7FDR A; 3OL8 A; 1CJU A; 3MR5 A; 1RJJ A; 2OEJ A; 2QV6 A; 2D1C A; 4RUA A; 3RAX A; 1VIO A; 2HWI A; 1RAC B; 3HHL A; 5KFF A; 2ZH9 A; 4M63 A; 3TX0 A; 3BO3 A; 1XMB A; 2NLW A; 2ZJQ Q; 1YIJ S; 4NLQ A; 4WU2 A; 1S1V B; 3MAA B; 1CJK B; 1RT5 A; 3QNW B; 3G96 A; 2CQP A; 2B5J A; 2ZBQ A; 1SC6 A; 2OH2 A; 1TK5 A; 3A8K A; 4EYI B; 1SQE A; 3H5S A; 1FD2 A; 4FXV A; 2IJF A; 3KG1 A; 3PIO Q; 3K5P A; 2FLL A; 4GKJ J; 2V2Q A; 2QN6 B; 1HAR A; 3TNV A; 3N9U C; 3IGN A; 4HHJ A; 4OJG A; 2GVZ B; 4FYV B; 1D09 B; 1H72 C; 5DM6 Q; 1RT7 A; 2V4J A; 4DV0 J; 4MYU A; 1WD6 A; 3FBC A; 1U26 A; 3RBE A; 1NHK L; 1IJF B; 2OEM A; 3HVT A; 3MMB A; 1BGX T; 4FBT A; 1UVN A; 1IKX B; 3W5Y A; 4X4S A; 3MZI A; 3CCZ A; 1VQP S; 5HVF A; 1L3U A; 5KFO A; 3R7S B; 1Y5N B; 1FNM A; 2HZV A; 1UPM B; 1MML A; 2LYV A; 2ZVI A; 3NLC A; 1FEE A; 3NY0 A; 3BZQ A; 3EPG A; 1FEH A; 4X4N A; 3M32 B; 4RNN A; 4UTG A; 2XYP B; 5AT1 B; 2QL5 B; 3K8W A; 3CDA A; 5DDO C; 1K9M T; 2ZH3 A; 1T11 A; 2YXL A; 4L3K A; 3TA0 A; 2R8I A; 2KRB A; 1DAX A; 3TJ8 A; 2G9O A; 1WOR A; 1HHS A; 3D28 A; 1SQF A; 2WZ1 A; 2XMW A; 3M4X A; 2HFN A; 4JI7 F; 4U7U K; 2H5J B; 4QYZ K; 3THP A; 4FYY B; 3DLJ A; 3RBZ A; 5AXN A; 2XLJ A; 3DMJ A; 1U1K A; 4G65 A; 3I6P A; 2R7U A; 3L7U A; 2JEI A; 4IRD A; 2AZ1 A; 2PGC A; 1DLO B; 3KK2 A; 1WAC A; 4ID5 A; 2HRY A; 2CXE A; 3J81 j; 2DBB A; 2AGP A; 3IFE A; 4OMF G; 1FRX A; 4DL4 A; 1L3S A; 3H8Y A; 2VG7 B; 2M5Y A; 3M8Y A; 1L3T A; 4KPC A; 4USK A; 1VJW A; 3NMR A; 2DVI A; 1BWE A; 1SVD A; 3LPY A; 2VBX A; 1SIZ A; 2OO4 A; 2JOQ A; 4LBP A; 3L9Z A; 3RB3 A; 1N36 J; 2BJ3 A; 4B02 A; 4QOT A; 1RA7 A; 2XYH B; 3DOL A; 3NGU A; 1EX8 A; 4UZC A; 1T9X A; 1H6K X; 2YNH A; 1J2V A; 3I0S A; 1S99 A; 3EGN A; 3RG6 A; 4ED8 A; 2F9J A; 1FKO A; 2YX7 A; 4DSE A; 4JI7 J; 1N5S A; 1CC8 A; 3LP2 A; 3MOZ A; 3DXS X; 5ETK A; 1S9E A; 3MM7 A; 2RNE A; 2ZBR A; 3BKF A; 2VJV A; 1C1B A; 2DO0 A; 5A8W B; 4F04 B; 4ECT A; 2HUR A; 1YJR A; 3QAT A; 2XHW A; 3PJW A; 2WON A; 3VAI A; 4B3O B; 2DB1 A; 2F40 A; 1YRU A; 3SQG B; 4DJB A; 2QSW A; 4HVZ A; 2Z58 B; 3TO8 A; 2PMH A; 4UY8 5; 4Z7Y A; 2IIH A; 2FJE B; 4QIV A; 3UD5 A; 4BHQ A; 3HUL A; 4ZPD A; 4C9D A; 1Y5I B; 1RAO A; 1T9U A; 3T5L A; 1B4S A; 1UEK A; 1C0U B; 1ULR A; 3FGV A; 4AYB D; 1UEU A; 2MQO A; 3WC0 A; 4DPX A; 4F67 A; 3CJ8 A; 2L48 A; 5GVQ A; 2Y3Y A; 5A76 A; 1VRT B; 3OL7 A; 4K0K F; 4C11 A; 1UWB A; 2MKS A; 2LDI A; 5HBM A; 4QIF A; 2HFO A; 1C4A A; 3CCM S; 3WIU A; 2L9N A; 4FF1 A; 1FX2 A; 2MGZ B; 3IXQ A; 3NEK A; 2AW0 A; 2N7C A; 4ED3 A; 3M8Q A; 1SCJ B; 3H59 A; 4HLB A; 2M88 A; 3NCP A; 2AGQ A; 1H73 A; 3M1V A; 2VC0 A; 3BO2 A; 3FBE A; 1G2E A; 2Y1J A; 1NPR A; 3C15 B; 2C2N A; 3VAK A; 1R0B G; 4JUZ A; 2L08 A; 2FTR A; 2E5I A; 1JKH B; 2RQC A; 1U1N A; 4Q2L A; 3WC2 A; 2OUG A; 3OR1 B; 5K8N A; 4PQA A; 3G71 S; 1S72 S; 3P49 B; 4URQ U; 2FGO A; 2HHX A; 2KL8 A; 4L74 A; 1HWI A; 3I55 S; 4K0K J; 2KHC A; 3UVJ A; 2Y9H A; 4B9T A; 2ZFH A; 4CT9 A; 2YX1 A; 1FCA A; 3T5K A; 3UR3 C; 1DTT B; 1U0H B; 3HHN B; 4ECS A; 1NXI A; 1SC1 B; 2JDJ A; 1RHJ B; 1X5P A; 1LW0 A; 3ZZZ A; 1HW8 A; 2HLT A; 2Y8Y A; 1X4A A; 3KK1 B; 3BYP A; 3B54 A; 2HND A; 4DR5 F; 1F9E B; 4IG0 B; 1DUR A; 3W2W B; 1S1U A; 4ZCL A; 4EBD A; 3JS9 A; 4MAK A; 1HNV B; 2AWZ A; 2DNQ A; 2VA2 A; 3AJ2 A; 4FXD A; 1UAW A; 2XWY A; 3FCV A; 4EBE A; 4RNM A; 3E3X A; 4LR9 A; 1NH8 A; 1BE4 A; 1NKE A; 2BZ2 A; 5KFG A; 1Z2L A; 1SJ1 A; 4RW8 A; 3T9Z A; 1HD0 A; 3MCO A; 2BAC A; 3B82 A; 2VBW A; 3GTY X; 3O6Q A; 1MW7 A; 1VK3 A; 2GAH C; 4LF5 F; 2UV8 G; 4A4J A; 4IG3 A; 6FDR A; 3TA1 A; 4WFX A; 5LMN F; 4NLD A; 2U2F A; 3KHL A; 4KGZ B; 3PR4 A; 3P5T L; 3SCK E; 4QIG A; 1NEE A; 1NJW A; 4DV5 F; 4ZOS A; 3UPF A; 3UWT A; 3A13 A; 3DDK A; 1GTE A; 1LWE B; 3IAM 9; 2XS7 A; 2JEF A; 4X4U A; 2VOD A; 4MKV A; 3W63 A; 2I9S A; 1SUQ A; 1UWA A; 3I5C A; 2Z2Z A; 4KSE B; 3AQO A; 1U2C A; 2XZT B; 2IC3 B; 2R8K A; 4RW9 A; 1JNR B; 2ZNY A; 4NLW A; 2VOP A; 3MEG A; 3NAI A; 1MWQ A; 2CNO B; 3KNG A; 1TAQ A; 2MZ1 A; 2HQI A; 4EBC A; 1RWM B; 1FWP A; 5B0F A; 1FI4 A; 1OPI A; 5EX3 A; 2VFU A; 3EVW A; 2V5H G; 2DGU A; 2XG8 A; 1LWF A; 2QO3 A; 3M8Z A; 3EPI A; 4LF5 J; 2ZZN A; 1JLE B; 2X1B A; 1NB7 A; 2D3O 1; 1OSC A; 4YB6 A; 1MNE A; 4NPO A; 5LMN J; 3TVK A; 2Y8W A; 5FDL A; 5D0H A; 1BXN A; 4XTT A; 2HVZ A; 2C3O A; 2RDD A; 2MQM A; 5IV3 A; 2MQP A; 1RT2 B; 2YVS A; 1V5I B; 1RWV B; 2AF6 A; 1YJ7 A; 4KB7 A; 3HSJ A; 2V68 A; 1Y3J A; 3MM6 B; 3MF5 A; 2LQB A; 3DFE A; 5M2P A; 2ZD1 A; 3NBP A; 3FFI A; 3DOM A; 1Q95 G; 3DRY A; 1HWL A; 5KG4 A; 4ID8 A; 4WE1 B; 4O3Q A; 3I87 A; 4DPW A; 4WJB A; 1ZS6 A; 1JJ2 R; 1ZM9 A; 1R6Y A; 4ILL A; 3N6M A; 1FFS B; 4CTA B; 1FXD A; 1F0X A; 2MST A; 3GIJ A; 1TR0 A; 5F8I A; 3EZU A; 3UNG C; 1IR0 A; 2IFX A; 3EXC X; 3FQL A; 1HPZ A; 4QQB A; 1RT4 A; 3JAM Y; 2M0G B; 2MDA A; 3I31 A; 4OZ2 A; 2HBQ B; 1A6L A; 4X4P A; 3BBC A; 3TJA A; 1R0A A; 1VLY A; 1N48 A; 2E1A A; 2OD6 A; 2BR0 A; 2EFN A; 3VZH A; 2EI5 A; 2HVI A; 4NYZ A; 5I4M A; 1PYT A; 1MU2 A; 1U7L A; 2G0C A; 1KTV A; 1HNX F; 5ETO A; 1VQ4 S; 2OMO A; 4H4O B; 3VWS A; 2DRA A; 3NXZ A; 2Y0B B; 4C3K A; 4NCG A; 3HSG A; 4YHH F; 1WEY A; 1IBL F; 2VFR A; 1LQ9 A; 4ECU A; 3HHD A; 2HHH F; 2IYI A; 2V50 A; 4DPT A; 5B0E A; 3OJS A; 2QA4 G; 1RAE B; 1HQE A; 2WW8 A; 4LIW A; 3I0R B; 2OFH X; 2C2R A; 4GVB A; 3E8O A; 4U9R A; 5DLG A; 2R7X A; 1Y0H A; 3U02 A; 2EG1 A; 1K1S A; 2YWK A; 1NJY A; 4TY8 B; 5F0W A; 5IZH A; 1FJE B; 2FC8 A; 5THW A; 5CCL A; 4F4X A; 2HK2 A; 4A8Y A; 2OPS B; 4N47 A; 2QX0 A; 3TVY A; 2Z57 B; 3AB4 B; 2MYF A; 2CWK A; 3CMA S; 4HTI A; 5HMX A; 2HW3 A; 1DFD A; 2I2Y A; 4YS2 A; 1HNX J; 2VG6 B; 4PR6 A; 3R5B A; 3G87 A; 1HQU B; 4HL9 A; 4KGK A; 2E5L F; 3MAA A; 1CJK A; 2N3L A; 3VAJ A; 5JMN A; 1QD1 A; 2FJD B; 4YR2 A; 2IRU A; 2CJA A; 4YHH J; 3ITH B; 1FTC A; 1IBL J; 4I64 A; 3AB2 B; 4AT1 B; 2HHH J; 5E5N A; 4USJ C; 1DZ5 A; 2BMB A; 2DGQ A; 4HI2 A; 4DX7 A; 2YKM B; 2ZH1 A; 3GIR A; 1GK8 A; 2GVZ A; 3CO0 P; 2J0X A; 3M6X A; 4DCO B; 3MCM A; 4FPI A; 4ZN1 A; 3QZ7 A; 3R2D J; 4MJK A; 1QDU B; 3R5A A; 2O3D A; 2VPX B; 4A8F A; 1S10 A; 1IKX A; 3D0G E; 4IFY B; 5J2N B; 3OR2 B; 4JI5 F; 3D1O A; 3D9B A; 2AEM A; 2KFZ A; 1LKZ A; 1UJ6 A; 4K5R A; 5B0D A; 3ZTQ A; 2E5L J; 2J76 E; 2BX6 A; 3GJT B; 1GQE A; 4DN9 A; 1PJ7 A; 4X64 F; 4FYW B; 4RU2 A; 3DKD A; 3M32 A; 2LVW A; 1FE0 A; 2IA0 A; 2RRN A; 3GFZ A; 4IH6 A; 1ZZF A; 3HMJ G; 1CC7 A; 4FZV A; 4ZMM A; 2CPJ A; 1SV5 A; 3IWL A; 4CQ1 A; 1G6B A; 3AFG A; 4KH0 B; 1EP4 B; 2B9E A; 3LOU A; 3K58 A; 1PG5 B; 2G0J A; 3CCS S; 3NCR A; 3OFE A; 3SSR A; 4DLE A; 3R3T A; 5BJR A; 1NDK A; 3T9N A; 1I5O B; 1UKU A; 3HHL D; 2VPZ B; 1T95 A; 5EHH A; 2CJK A; 4NZ0 A; 3U1N A; 1FHT A; 2VFT A; 3CCT A; 4IR9 A; 4ER8 A; 2EFP A; 3G6X A; 4N8N A; 4OIX A; 5KT3 A; 2H4Y B; 2JH3 A; 3T6J A; 4JV1 A; 1DLO A; 5H9E J; 4ED5 A; 3G8Q A; 3MDF A; 4ZJQ A; 2JLG A; 4JI5 J; 1VBX A; 5B7W A; 1MSW D; 3J7A N; 2Q1L A; 1ZA2 B; 2YNG B; 1H2V Z; 2VG7 A; 2EBG A; 2J6S A; 3DRS B; 3JAM U; 4X64 J; 5IOL A; 1RHR B; 2C2O B; 2VV5 A; 5E3A A; 2OD4 A; 3HVW A; 1PC4 A; 4IO1 A; 3HK2 A; 4ZVH A; 5KFU A; 3ZC4 A; 4NLG A; 2DIV A; 4MYT A; 4J9S A; 1Z4U A; 1PJ5 A; 3MEK A; 3M8R A; 2BW2 A; 3K5M A; 5DG9 A; 3I9V 9; 2D41 A; 2XUL A; 1FDA A; 3KTQ A; 2ZC4 A; 3QBC A; 1XMQ F; 1KC8 T; 3VR1 A; 3RBX A; 3BKU A; 2VKZ G; 4DFJ A; 4TVA B; 2KFY A; 2GV1 A; 3QO9 B; 4PG4 A; 1B7Y B; 5A8W A; 2E5H A; 1L5U A; 2ZH7 A; 4B3O A; 3S7R A; 2XGP A; 3SQG A; 3J81 U; 1RBA A; 2E9Z A; 2HHS A; 1HW9 A; 2KHD A; 1NZ8 A; 2MEW A; 2CQ0 A; 2ZDP A; 3DLE B; 3BPS P; 4QPX A; 2MJN A; 2UXD F; 4OYX A; 1C0U A; 4NI2 B; 2RUG A; 2MQN A; 2A2D A; 1X5S A; 4RUB A; 3KHR A; 1VRT A; 4O4R A; 4OYZ A; 1M5H A; 3CF5 Q; 3ONQ A; 3F73 A; 4XDC A; 4OHZ A; 3A12 A; 2MGZ A; 2ZDO A; 2JVO A; 4ZP7 A; 4N56 A; 1HKA A; 3NGD A; 1WF1 A; 3BB5 A; 2HQF A; 5F8L A; 2VC1 A; 3D4J A; 5KT4 A; 3V4I B; 3DDN A; 3FSY A; 2DGO A; 4NLY A; 3A3O B; 2A3J A; 4CLY A; 1OSD A; 3M8P B; 2ACM A; 3TUJ C; 3C15 A; 3QWP A; 3ICL A; 4WII A; 2XCA A; 2BAN B; 4ZPV R; 2DHA A; 1FFW B; 1JKH A; 2YX4 A; 3IC1 A; 4J9Q A; 2UXD J; 4FBU A; 1FA0 A; 3BKT A; 2P9E A; 4OZJ A; 1UVM A; 3OR1 A; 3QGG A; 4J9L A; 4LF6 F; 4WFA Q; 2XO7 A; 1D0E A; 2OAU A; 1VDH A; 1JLB B; 3THV A; 4PYA A; 3VAG A; 1S9G B; 1IXK A; 4F8R A; 1M0S A; 1DTT A; 1GAO A; 1HBU B; 2FHO B; 1YX2 A; 1S77 D; 3PV8 A; 2KVQ E; 2ZH6 A; 5C2C A; 2F5G A; 2EW9 A; 4O3N A; 3SYZ A; 3P4U B; 2B8P A; 2BEF A; 2UU9 F; 4U7U D; 3W2W A; 3R6G B; 2UUC F; 4B9S A; 1WC6 A; 2IMW P; 3ZTP A; 2M8D B; 1HNV A; 3CE8 A; 1HBN B; 4L73 A; 3SIP B; 1V3S A; 3WBZ A; 5D0E A; 2M52 A; 2B9W A; 4BWM A; 2B4U A; 4LF6 J; 1QSY A; 2BRK A; 4M95 A; 4E98 A; 4F3O A; 1PIE A; 2JJ4 D; 2GQC A; 2JLE A; 3B8H A; 2KJV A; 4ZP9 A; 1RTJ B; 3TW0 A; 4KR0 B; 4I7F A; 2G1H A; 2F8M A; 5I3U B; 2J0W A; 4BWJ A; 1QTM A; 3KLE B; 3PEJ A; 1KS2 A; 4EGL A; 4W4M A; 2DT9 A; 3HI9 A; 1UL3 A; 2YBV A; 2RD5 C; 2B4V A; 5J2P B; 2GIQ A; 4RNF A; 1ZYQ A; 4NLT A; 3T1H F; 3O44 A; 2UU9 J; 3GQC A; 1IVZ A; 1LWE A; 1F6T A; 2UUC J; 4DF8 A; 2IBO A; 2C1E B; 4LIR A; 2AT1 B; 2QLF B; 2IC3 A; 5L9N A; 4G1Q B; 1VBK A; 2O67 A; 1WG5 A; 4I2P B; 1YJW S; 1ZAX A; 2B6A B; 3GV7 B; 4Y2A A; 1CJV B; 4QU7 A; 4J5O A; 2MQ8 A; 1YJT A; 1YSJ A; 7AT1 B; 3ZZP A; 2LEP A; 5L9X A; 3QAU A; 5KG7 A; 3GP9 A; 1DQA A; 3ILI A; 1HQ2 A; 3KKF A; 3ISN D; 1FK9 B; 1PSD A; 5IWA F; 1RT2 A; 2CPH A; 1NHV A; 2V2K A; 1EJ7 L; 3T1H J; 3Q2S C; 3J7Y I; 3NWR A; 4CM0 A; 4RBV A; 3N0V A; 3MM6 A; 3JYT B; 4JV2 A; 3KHG A; 3V81 B; 2V67 A; 2F1F A; 2OP5 A; 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