The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
92
|
structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3IBC B; 3GJR B; 4JB8 B; 1RHR B; 3D6M B; 2H5J B; 2H4Y B; 1RHK B; 3D6H B; 4DCJ B; 1GFW B; 3KJQ B; 1RHQ B; 2DKO B; 1SC4 B; 1RWN B; 4ZVS B; 2H4W B; 2QL5 B; 3R7N B; 2CDR B; 3GJT B; 2XYP B; 4DCO B; 3R6L B; 4LSZ B; 1RWK B; 1RE1 B; 1PAU B; 1RHM B; 1RWM B; 2H51 B; 5K20 B; 2HBY B; 3GJS B; 1IBC B; 2XZD B; 2HBZ B; 1RHJ B; 2CNO B; 5IC6 B; 2C2O B; 2HBR B; 4ZVR B; 2QLJ B; 3GJQ B; 3RJM B; 1SC1 B; 4ZVO B; 1RWW B; 2XYH B; 4DCP B; 2FQQ B; 3NS7 B; 1RWV B; 1RWP B; 3EDR B; 4ZVU B; 3D6F B; 2H5I B; 2CJY B; 1F9E B; 1QTN B; 4ZVT B; 2CNL B; 1BMQ B; 2QLF B; 2H54 B; 2QLB B; 5IC4 B; 1ICE B; 3R5J B; 3R7S B; 3IBF B; 2HBQ B; 2QL7 B; 1RHU B; 2H65 B; 3R7B B; 1NME B; 2XYG B; 1RWX B; 3KJF B; 3SIP B; 2CNN B; 2Y1L B; 2Y0B B; 2XZT B; 1I51 B; 2C2M B; 3KJN B; 4ZVP B; 2C2K B; 3P4U B; 1I3O B; 1RWO B; 4ZVQ B; 2QL9 B; 3P45 B; 3QNW B; 3R6G B; 2H48 B; 2P2C B; 1PYO B; 2CJX B; 2CNK B; 1QDU B; 2C1E B; 1SC3 B; 3EDQ B; 2C2Z B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NGS A; 2B7B B; 3UCZ P; 1N5V A; 3KUE A; 3KJQ B; 1UW4 A; 2GO9 A; 4ZLL A; 4LRD A; 2OSQ A; 1JK9 B; 3GJT B; 2I9S A; 2UXD J; 3HHD A; 1FO1 A; 3A3P B; 1WOP A; 4QW9 A; 4ILL A; 2DD8 S; 4NLU A; 4B3O A; 1ZBT A; 2XCP A; 3I0S A; 4DDF A; 5KG0 A; 4OYP A; 1KWM A; 3EXY A; 3K8W A; 1AB8 A; 3G86 A; 4G1Q A; 3GFZ A; 2RQM A; 3J7Z 5; 5B0E A; 4J91 A; 2HSE B; 4HT7 A; 5FD1 A; 4P10 A; 1X4H A; 1G4C A; 4AL7 A; 1S1U B; 2ZH3 A; 4UOC A; 1J2V A; 2KXF A; 2VOP A; 1X4B A; 4OJ1 A; 2ZH1 A; 4LRE A; 1WJ9 A; 2JC0 A; 2RSQ A; 4LFB J; 3CJ5 A; 4FNH A; 2APO A; 3PW4 A; 1TFW A; 5T7L A; 5C24 B; 3QWP A; 1Q8K A; 5ETM A; 1PYS B; 2MLX A; 2XHW A; 2WRM A; 3WX8 A; 1AA1 B; 5GAD I; 3SIP B; 3TAM A; 3NP5 A; 1YHQ S; 3UN3 A; 1WEX A; 1IWA A; 1LOU A; 2K06 A; 4N41 A; 2YNH A; 1LW2 B; 4DV7 J; 3P96 A; 4HDG A; 1T3N A; 2RKI A; 2KHD A; 3NLC A; 3HSJ A; 3AHP A; 2N7C A; 2JOQ A; 2FJD B; 5THW A; 4DV6 F; 1MNE A; 4P71 A; 3OTC A; 3QJL A; 1VRU A; 4MTP A; 2W7A A; 3K0J A; 3KLG B; 3V6J A; 1Y3J A; 4LQ9 A; 1URR A; 2VA3 A; 3IRX B; 4BLG A; 1AFJ A; 4BBY A; 2EWH A; 3KK3 A; 2QRR A; 1ACM B; 1FTC A; 4F4Y A; 1JLC A; 1S10 A; 1EP4 A; 1NJI T; 5HLF B; 1JXV A; 2IJN A; 2W1B A; 3HMJ G; 4C6A A; 1X31 C; 1IKX B; 1WSR A; 5A8W B; 2W9A A; 3V6D A; 3P6Y C; 3IWL A; 2J6U A; 2OEL A; 1FKP A; 5CD4 H; 3UDC A; 4X66 F; 1Y5L B; 1FJC A; 1YJR A; 3QO9 B; 3ICL A; 5SZT A; 3CNQ P; 2IBK A; 1CUL B; 1PC5 A; 1WWH A; 1XC9 A; 2MKS A; 1OWX A; 1YBU A; 2KXN B; 5LSO A; 4NA2 A; 5LSL A; 1Y3K A; 5A6W A; 5H9F J; 1U6B A; 2LQ5 A; 3C16 B; 3G87 A; 2J7W A; 1WI8 A; 3KK2 A; 4NML A; 4QU6 A; 1S9G A; 3MPV A; 4X4U A; 3KWM A; 4MK7 A; 1PJ7 A; 2VQF F; 4K4W A; 5J1E A; 2CWK A; 5CYJ A; 2CPX A; 1S72 S; 1RAB B; 2M9K A; 1N36 F; 2NXU A; 2ILY A; 1RWV B; 2JEG A; 4LF4 F; 2XEX A; 4IR9 A; 2MXY A; 1DTQ B; 2XG8 A; 4NOH A; 3BKT A; 5B7W A; 3L7O A; 5D3G A; 3QQC D; 1T8E A; 3JYT A; 4B9V A; 2XS2 A; 1DHM A; 3FSY A; 1V5V A; 3IXQ A; 3JXO A; 3IGN A; 2MQQ A; 3DLH A; 2EBG A; 4CLU A; 4TQR A; 4RL1 A; 2ZZM A; 3LH2 S; 3BSO A; 3CDW A; 4USI A; 2CNN B; 2WON A; 1HW9 A; 1FKO B; 1O6X A; 1Q5V A; 5EX0 A; 3TVK A; 3OVB A; 4URS A; 1VQN S; 1CSJ A; 2DNL A; 4UST A; 2ZOG A; 5KFL A; 3GFY A; 3NEK A; 4ZK7 M; 4MT1 A; 4YHH J; 3TX0 A; 1N52 B; 1PIE A; 4F04 B; 3K5L A; 1GK8 A; 4NXM F; 1RHK B; 5DDP C; 2W2M P; 3P8B B; 1FT8 A; 4LSN B; 3SV4 A; 3DCA A; 2LEC A; 3IGV A; 2P9G A; 1KHV A; 4KFB B; 2A2D A; 1GMU A; 5IZH A; 2VV5 A; 2AJ4 A; 3R5G A; 2WHO A; 3M2R A; 2H51 B; 1K1Q A; 2MZR A; 5D4N A; 2N3O A; 2W4P A; 2GVD B; 1L3V A; 5KFH A; 1S9F A; 3DI6 B; 1KLM A; 3C14 B; 1ZPW X; 2FHM A; 2ZHA A; 2YTC A; 2B4U A; 4E0D A; 3AT1 B; 4PG6 A; 1N8R T; 2GIR A; 1IR0 A; 2ROE A; 1JMT A; 5FDL B; 2LA4 A; 2QN6 B; 3GB0 A; 3VAK A; 4C48 A; 1DLO B; 2GVZ A; 4NYO A; 1RU2 A; 3GE9 A; 5B0F A; 3MPW A; 2DVI A; 1FJG J; 5IXU A; 1UWA A; 2KVI A; 2WVC A; 1VRT A; 4S0M A; 4X84 A; 1YK9 A; 4PG7 A; 3F0N A; 5KFF A; 3MF5 A; 3HLU A; 2IAJ A; 4DQQ A; 3W66 A; 2XUL A; 1KBR A; 1HR0 F; 5H1S V; 1RTZ A; 2FGC A; 4NX9 A; 3DHW C; 2AKW B; 6AT1 B; 2I5J B; 4NLX A; 4F0H A; 4CTA A; 2CQD A; 3EZ5 A; 3JQK A; 4XIU A; 3K5O A; 4MKV A; 4ED7 A; 2EK1 A; 4RW9 A; 3CB4 A; 2E5L F; 2PN6 A; 1WHV A; 4NLP A; 2K2P A; 2HIY A; 4JUZ A; 3EVM A; 2NZC A; 2Z8Q A; 4Q44 A; 4ID8 A; 1VQ6 S; 3MUR P; 1YZ6 A; 3JSB A; 4ED4 A; 3UW1 A; 2R2S A; 1UEV A; 2JLG A; 2IJF A; 4ER8 A; 2KTQ A; 4OZN A; 2P5V A; 2C2M B; 1S99 A; 1F5B A; 1OY8 A; 2QA2 A; 3RAM A; 2DR6 A; 3ZTS A; 2GJI A; 3S01 A; 2YWG A; 3MM5 A; 2P9C A; 4RW7 B; 4WF9 Q; 5LSR A; 3V4M A; 3RZA A; 4DV1 J; 2DXE A; 3H42 A; 3GIJ A; 3HHL A; 3D6T B; 4EGL A; 5KFE A; 4F67 A; 3D6H B; 4LF6 J; 4M95 A; 5AXM A; 2LA6 A; 2KYX A; 3MPD A; 3QIP A; 4LR7 A; 3JAM Y; 3GG1 A; 1RK8 A; 4MIB A; 2YKO A; 1U2R A; 2X3G A; 2YKM B; 5B0G A; 4JP8 A; 2RQK A; 3MM8 A; 4KH1 B; 3ZNU A; 1R89 A; 2E44 A; 4NCG A; 1P1L A; 2DBB A; 4KKO B; 1C0T B; 4OZL A; 4YB6 A; 1A7G E; 2OPR B; 4B3M F; 4AQY J; 3KLE B; 2CQI A; 4HVZ A; 4M5D B; 1E6Y B; 5G0R A; 5CXT A; 5F41 A; 1YDL A; 4JI1 F; 3DOM A; 4OQJ A; 2VOD A; 5KFI A; 1YJN S; 1RWX B; 1X0F A; 5I3Q A; 3CMQ A; 4PYA A; 3CC4 S; 2VH7 A; 3BV8 A; 4HI1 A; 4QYR A; 3K17 A; 4G1I A; 3S1T A; 3OR1 B; 4X4P A; 3SV3 A; 1MG7 A; 2E1P A; 4PRF A; 3R27 A; 4CNY A; 2CJX B; 4R5P A; 1SC3 B; 4IH5 A; 5A0Y B; 3A8K A; 1R8P A; 3OR2 B; 3OV7 A; 3PV8 A; 1FES A; 2H5J B; 3FK4 A; 5F0W A; 3CVK A; 2NUU G; 1HBU A; 2FJW A; 1EET A; 1NK4 A; 1G7C B; 5F3Z A; 1Y9O A; 1QUV A; 4NA1 A; 2W4C A; 1H73 A; 2J5A A; 3KG1 A; 4F36 A; 4HTJ A; 5DQI A; 4IO9 Q; 5CYQ B; 5IWA F; 2Y9H A; 4CI0 B; 3W2W A; 4UF4 A; 5GAD U; 4CLZ A; 1TKX A; 2PI4 A; 2D69 A; 1DAX A; 3OHA A; 3NBP B; 2F4F A; 3D6F B; 1HMV B; 3EGZ A; 4A8O A; 2VDH A; 2VB6 A; 2CQP A; 3H90 A; 4BDP A; 1CJT A; 2DGO A; 2GAH C; 4JI3 J; 3FBC A; 5F8N A; 2MZS A; 4MH8 A; 3FEY B; 4EBE A; 1N56 A; 1NDC A; 2HQG A; 2CQ1 A; 2DNM A; 1HD1 A; 4YDD B; 3WX4 A; 2RB7 A; 1NAQ A; 2DGQ A; 5K8O A; 4C11 A; 2U1A A; 2MKK A; 2VQE J; 3D5M A; 2BJ3 A; 3E2E A; 2HS3 A; 1W2I A; 2ZFH A; 4WII A; 2OML A; 2BJE A; 1SH3 A; 1VC5 A; 4U7C A; 4ECV A; 3NGT A; 5E7O B; 4HR2 A; 4F4K A; 3MR5 A; 1ROF A; 3R7N B; 4ZJO A; 3DGP A; 4DQS A; 3ENQ A; 2IVF B; 2E1C A; 3E01 B; 1ZAW A; 2QZ8 A; 2RAQ A; 3H25 A; 3PCO B; 4TY8 B; 1WC1 A; 1FTR A; 3CCT A; 3DLK B; 4Y2A A; 4ZPB A; 4DV5 F; 4RNH A; 4OYB A; 3FCV A; 5L1I A; 2G9O A; 5IOL A; 2ASJ A; 1FRX A; 4ZP6 A; 2UUW A; 5EWE A; 3EJM A; 5AT1 B; 2ASL A; 2OIH A; 5J2N B; 3M8Q B; 3A4T A; 1KLN A; 4DS5 A; 4TQS A; 2ZWP A; 2QJ3 A; 2QSW A; 2DTJ A; 1D9F A; 4YB7 A; 5DG8 A; 4ATN A; 3VZH A; 4CO1 A; 3CC2 S; 1TMM A; 1C1B A; 3ET6 A; 3AB2 B; 4FS2 A; 1A6L A; 1MW7 A; 1M90 T; 1NDL A; 3MHY A; 1HD0 A; 3UFC X; 1DJ0 A; 3B82 A; 4DEZ A; 4R25 A; 4IR1 A; 1IM6 A; 4IG0 B; 3SFG A; 2FJA B; 3TJA A; 1ELO A; 2LP4 A; 1UJ5 A; 4ZVS B; 4DL3 A; 2OD4 A; 4FYD A; 3OL9 A; 5E3P A; 1AZS B; 2MST A; 2A3J A; 4QWE A; 3Q8Y A; 1HBN B; 3NGR A; 2CQ3 A; 1R3N A; 3CJ2 A; 5DDQ C; 4CYU B; 1UVI A; 4FP9 A; 1IVZ A; 3HT3 A; 4C4W A; 3DLE B; 3H5Y A; 5CHC B; 5CYM B; 2QA1 A; 2YBV A; 4ZVT B; 4XDC A; 2BAN A; 5D0E A; 1BWE A; 4Y2C A; 2CJQ A; 3OT9 A; 1S59 A; 1WC0 A; 4F0M A; 4LFA F; 2P8I A; 3QRP A; 2YQ0 A; 2PSZ A; 3FSI A; 3N6M A; 5BJR A; 1L3T A; 5F9N A; 2HFV A; 4AFF A; 3K57 A; 1CQN A; 2DPI A; 2Q6B A; 4OYI A; 1CJU A; 1CLF A; 3FNN A; 1FDD A; 1HNW F; 4K4X A; 2PDA A; 4V19 J; 2PMW A; 1ZM9 A; 4JI8 F; 4QIF A; 2CRL A; 4H54 A; 1VQL S; 4K59 A; 1XN9 A; 2XY7 A; 4JBC A; 3BDP A; 1GAO A; 2GX8 A; 5KFW A; 2GJ2 A; 4JI7 F; 3A3O B; 3VGS A; 2XGP A; 2FGO A; 2YNF A; 4O4G A; 4CLF A; 1W2B R; 2B8Q A; 3OTB A; 4F50 A; 2GAG C; 2XTJ P; 4DCP B; 1HBM A; 1B7F A; 3VVT A; 4NZ0 A; 1KOO A; 4HTI A; 3KLF B; 4QIE A; 4WPA A; 5DO2 A; 3R5D A; 2FPH X; 1UA0 A; 5FJ4 A; 3BGO P; 2MQM A; 2XMJ A; 1HFE L; 3HSG A; 4QPT A; 5ETQ A; 4F4X A; 3BBF A; 3CCE S; 1FNM A; 2WVD A; 5B0C A; 4RW4 A; 4WJB A; 4ED3 A; 3TZW A; 3JSY A; 4YB1 P; 1MWZ A; 2ZBI A; 5KFJ A; 3T19 A; 3N79 A; 1SJF A; 2MQ8 A; 2VPX B; 1TL3 A; 1WHW A; 3SSQ A; 2V8P A; 3GII A; 2DHH A; 3CCL S; 4IKA A; 2VPW B; 1DFD A; 3FFI B; 1TUW A; 3C6U A; 2EC2 A; 2VC1 A; 3QZ8 A; 2Z2Z A; 3H98 A; 3PHE A; 3MFH A; 1ZM4 A; 4FYV B; 1AUS L; 3W9J A; 5B0D A; 4CM0 A; 1URN A; 5GME A; 3SQG B; 4DX5 A; 3GPA A; 4KGX B; 1UAW A; 2ZZT A; 3POT A; 2RHQ B; 3CPW R; 3MMC A; 3NY0 A; 1YJV A; 4J90 A; 5HMZ A; 2YX4 A; 2G2O A; 2VFR A; 4DOZ A; 3BQ1 A; 2HQ3 A; 4DL7 A; 1LNQ A; 2CIM A; 1UEU A; 1I3O B; 1JLF B; 3FJ2 A; 2OH2 A; 1WUU A; 2FJV A; 1WG5 A; 2WBM A; 4FBU A; 3BO2 A; 4RR5 A; 3IS9 B; 5AE1 A; 3GV8 B; 4C8K A; 2KZM A; 1S48 A; 3DNC A; 3HJV A; 1T9U A; 5A8K A; 3JQJ A; 5D78 A; 2XLI A; 2CQ2 A; 4L3N A; 1LWC B; 3A8J A; 2Z2Y B; 1AW0 A; 4OX9 J; 1H2V Z; 1KN6 A; 2K7J A; 1VQ5 S; 4FXD A; 1FDN A; 3RR8 A; 1O0P A; 1WOS A; 2O01 C; 2XMT A; 4URG A; 4DR2 J; 4NXN F; 2FVP A; 3LQV A; 4ZVO B; 5AE3 A; 4N76 A; 4ZP7 A; 4ANC A; 3EVO A; 4HT5 A; 4YQW A; 2KT3 A; 2VFS A; 3OTD A; 1J5E F; 3QJP A; 1HQE B; 3LP1 A; 4U9R A; 4QR1 A; 3NAI A; 1BQX A; 3CJ8 A; 1FXL A; 3FBF A; 5CAB A; 2Z57 B; 2YKN B; 5MAO A; 2LCW A; 4J9O A; 2J9D A; 3M05 A; 4WBF A; 4BC7 A; 1O8B A; 4A8F A; 4DUZ J; 1Y5N B; 5DLG A; 2BZ2 A; 3IA0 A; 5K8N A; 3BH7 B; 1R31 A; 1HAR A; 3CT9 A; 1G2E A; 2AWZ A; 2HGL A; 3OFE A; 2C1E B; 3JS9 A; 1NEE A; 3PTW A; 1U4B A; 4M5I A; 2DRD A; 1X4A A; 1GXL A; 4ED5 A; 4GKJ J; 1MWY A; 5GAG I; 5HJY A; 2MY7 A; 4J9L A; 2BJ7 A; 2JHE A; 5DLF A; 2DNY A; 3ZTQ A; 4JI4 F; 3KUH A; 4USU A; 2W4D A; 4FXV A; 4QR0 A; 4ZVF A; 1RT6 A; 3G6E S; 2Y3Y A; 2QMW A; 4ILM A; 3R5A A; 1UCN A; 4DMZ A; 2FIU A; 1S6P B; 2HRU A; 2CVE A; 3GYN A; 2B3T B; 1I94 F; 2GA7 A; 2XY5 A; 4ERD A; 4ZDN A; 4ILR A; 4YOE A; 5F9L A; 2KDO A; 3IC1 A; 2AD9 A; 4DN0 A; 4ZPD A; 2BR0 A; 3QZ7 A; 4E2F B; 5F8J A; 3R7S B; 2ZM6 F; 2HBQ B; 3T1A A; 5C42 B; 5KT2 A; 2CZ9 A; 2E7X A; 4UZB A; 3EPG A; 2WSE C; 3W5Y A; 3RTV A; 1X5O A; 3Q86 A; 1REG X; 3O5T B; 3FQL A; 1GMW D; 2HFU A; 4FNI A; 2YKA A; 1VJW A; 2G4B A; 2Q66 A; 1SV5 B; 1NHV A; 1IBL J; 3V6K A; 3UDL A; 2JC1 A; 2DT9 A; 5HVF A; 2O66 A; 3TX8 A; 5AXK A; 1TR0 A; 2XI3 A; 2C2R A; 1NBE B; 1IJE B; 3DRX A; 3DRY A; 3SZ2 A; 4TYB A; 5K14 B; 3CTR A; 4DR4 F; 3SDE B; 3QFW A; 1K47 A; 3EGV A; 3H2L A; 4YEA A; 3D1H A; 3MCS A; 4JV0 A; 2RDD A; 2XMV A; 5KFC A; 1BY9 A; 1KQS R; 2CPE A; 1C1C A; 3MZI A; 1S0N A; 2MQP A; 3WZ0 A; 4TY9 A; 1NSK L; 3O1L A; 2NXJ A; 4PXE A; 1H2T Z; 5I42 A; 1F3F A; 1WEZ A; 1S7H A; 4NI2 B; 2DXF A; 5C2C A; 4O3P A; 1M0S A; 4TN2 A; 2HHS A; 4AL6 A; 2XB2 D; 4A46 A; 4DV6 J; 2OPQ B; 4K7Q A; 2DGV A; 2I1R A; 4DSL A; 2UV8 G; 4M8L A; 2ASY A; 2XSJ A; 4I7F B; 1VLY A; 1FEE A; 3C6T B; 3CDE A; 5GMD A; 4RW6 B; 4HEA 9; 3W2V A; 2HHV A; 3EGN A; 3NG8 A; 4DX6 A; 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