The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R5J B; 4ZVU B; 3D6M B; 4ZVR B; 3R7S B; 2CNN B; 4LSZ B; 1PAU B; 2C1E B; 1IBC B; 2HBY B; 1PYO B; 3D6H B; 1RHR B; 2CJY B; 2QLF B; 2C2M B; 5IC4 B; 2HBR B; 3R6G B; 5IC6 B; 2XYH B; 4DCO B; 2CNL B; 2HBZ B; 1I51 B; 3KJF B; 1SC4 B; 2QL9 B; 3GJR B; 3NS7 B; 3P45 B; 4ZVP B; 1I3O B; 3D6F B; 4ZVQ B; 2XYP B; 1ICE B; 3KJN B; 1SC3 B; 1RHK B; 2XZT B; 3KJQ B; 2XZD B; 2QL5 B; 2Y1L B; 1RWO B; 2P2C B; 2H4W B; 4JB8 B; 3IBF B; 1RWM B; 1RWX B; 3R7N B; 1RHQ B; 2H51 B; 3GJT B; 2H5J B; 3R7B B; 1GFW B; 5K20 B; 1RHJ B; 4DCP B; 2QLJ B; 3RJM B; 1RWV B; 1RWW B; 4ZVO B; 1RWK B; 2H5I B; 2H4Y B; 2CDR B; 3EDR B; 2DKO B; 2CNO B; 2FQQ B; 2Y0B B; 1RHM B; 2QLB B; 2CJX B; 2CNK B; 2QL7 B; 4ZVS B; 3GJS B; 3EDQ B; 2C2O B; 1NME B; 1BMQ B; 3QNW B; 1QDU B; 2XYG B; 3R6L B; 1RWN B; 2HBQ B; 2H54 B; 2C2K B; 2H48 B; 1RHU B; 1QTN B; 4DCJ B; 3GJQ B; 4ZVT B; 1F9E B; 1SC1 B; 3IBC B; 3SIP B; 2C2Z B; 1RWP B; 2H65 B; 1RE1 B; 3P4U B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HK2 A; 1FF2 A; 1H3D A; 2IVY A; 3NGR A; 7AT1 B; 4OMF G; 2DH8 A; 1VI7 A; 3SQO P; 2MLY A; 4W90 B; 2AGO A; 4LFC F; 2VHG A; 3PIO Q; 1DY3 A; 1QUV A; 3CO9 A; 1YJN S; 4C3K A; 2C3M A; 5BYR A; 2PE8 A; 4JI4 F; 1NKC A; 1KLM A; 2JLF A; 3OTC A; 4J9P A; 2VKR A; 4Q2M A; 4ZCK A; 2EFG A; 3ENQ A; 3P5T L; 1R8H A; 2DO4 A; 4QU6 A; 3UPF A; 3D1O A; 5LT5 A; 2M8D B; 1RWK B; 2V4J A; 2ZUG A; 2I0X A; 3L09 A; 4XTT A; 4ECX A; 2NYI A; 1CSJ A; 1EB0 A; 3IBW A; 1U1O A; 3VZH A; 4RU2 A; 2APO A; 1WF0 A; 2ZHA A; 1HQE A; 3JSB A; 5IWA J; 1BUX A; 1GTE A; 1VC0 A; 2KHC A; 2UVV A; 3RR7 A; 3DDN A; 2HVD A; 1EKS A; 3HF5 A; 2IM0 A; 3EGN A; 1ZOT A; 2W7O A; 5FDL B; 3MR5 A; 4C97 A; 4X64 J; 2ZFH A; 2ZVI A; 5HJX A; 2W4P A; 4M8L A; 3TZY A; 3K5O A; 2WON B; 6FDR A; 1XJW B; 4ZVP B; 1T9U A; 2AW0 A; 4OZJ A; 3QWP A; 4DQR A; 4IH7 A; 1ZA1 B; 3OFF A; 2OD4 A; 1Y4Z B; 4ZHR B; 4UOG A; 4TU7 A; 1NPK A; 3DYA A; 2CVI A; 4P73 A; 3KK1 B; 4MK8 A; 3IRW P; 4UQG A; 4M94 A; 3TI0 A; 5T41 A; 3HMJ G; 3W2W B; 2PEH A; 3SDE A; 1O51 A; 2DIU A; 2C2O B; 2XYG B; 2IDL A; 2HVI A; 3BDE A; 1U1N A; 2C2K B; 1RT6 A; 1ZTT A; 4C3M A; 1S5Z A; 2J9C A; 3H0P A; 4OI4 A; 4CO1 A; 2KB2 A; 4AQY F; 3LO3 A; 3GV8 B; 4B9V A; 3MF5 A; 1MRO A; 1EQM A; 4CP5 A; 1W2B R; 2WOM B; 4NXN J; 5MLC V; 2NSB A; 4P7V A; 3RB4 A; 2AF6 A; 2N82 B; 4B9L A; 1Z2L A; 2O3D A; 2RQK A; 3SSQ A; 1U4B A; 5KFD A; 2DR7 A; 4OZ0 A; 3MR3 A; 2DEJ A; 1CBK A; 1FDN A; 4OI1 A; 1MMD A; 1WJ9 A; 2QSF A; 1FXD A; 2ZBC A; 3KLE B; 2FJW A; 3CJ0 A; 2DGT A; 1DLO B; 3DRP B; 5GAH I; 2B51 A; 2UP1 A; 3UE2 A; 1FVS A; 1DBD A; 4HI1 A; 2IC3 A; 4IG3 B; 1Q79 A; 4L75 A; 5KFQ A; 2J7W A; 4U67 Q; 3PYD A; 3KUH A; 4QIE A; 5G0R B; 3FKB A; 1FRJ A; 4WZQ A; 2MKS A; 4F25 A; 4HKQ A; 5I42 B; 2LP4 A; 3W8P A; 1IKV B; 4W4M A; 4OQJ A; 1DFD A; 1T9V A; 1UW9 A; 4EUV A; 4R5P A; 4MKV A; 3C2P A; 1TMM A; 3QT7 A; 2W9A A; 2VAS A; 3R5J B; 4M5L A; 1KHV A; 1I6J A; 3CC2 S; 3H25 A; 2ZOF A; 2Y8W A; 3K5M A; 2GJF A; 1T3O A; 2ZVS A; 4P7T A; 1HNZ J; 4UY8 5; 3T1H J; 2MLZ A; 4NI2 B; 2MQ8 A; 2JEI A; 3MUT P; 4K0K F; 5KFB A; 4ERD A; 1T05 B; 4F3Q A; 5J2Q B; 1NCL A; 1Q8K A; 2WZ1 A; 1HPZ A; 3D3B J; 2Z2Z A; 4N76 A; 1OWX A; 4JB8 B; 5HAN A; 4ZIW A; 2VON A; 3Q2S C; 5F8H A; 2A2C A; 1WTB A; 1ZM4 A; 2EC2 A; 3KHH A; 1U49 A; 3OR1 B; 5EHH A; 3BJY A; 2CPF A; 2CNO B; 2JLG A; 1BHN A; 3TVY A; 5JVG Q; 2UXD J; 4USW A; 4A47 A; 4LF8 J; 2VQE F; 4MIA A; 1VIX A; 4NLY A; 3KLF A; 1FE4 A; 4F8R A; 3BPD A; 2KXF A; 4AXJ A; 4R0E A; 3PZP A; 5K8O A; 1CC7 A; 3ZZU A; 1ZS6 A; 4C98 A; 3EZ5 A; 1VK8 A; 1C2P A; 1UWB A; 2O5D A; 2V2K A; 2K7J A; 5GAH U; 4YHH F; 4O44 B; 1Q82 T; 7FD1 A; 3VWS A; 2FLN A; 1H7X A; 2HNZ B; 2IBK A; 3DLH A; 2QLF B; 2CQ1 A; 2X51 A; 3BS9 A; 3IWL A; 2G1H A; 5KFJ A; 3HP6 A; 2M3D A; 3DXS X; 2W8K A; 3VAH A; 2CDQ A; 4BDP A; 3I82 A; 4EEY A; 2KI2 A; 2KG0 A; 1Q78 A; 2V4R A; 1VQP S; 1CEZ A; 3JTO A; 5ETR A; 3T3F A; 2R9L A; 4U8V A; 3AXK A; 4EFA C; 5HN0 A; 5CZX A; 3QLH A; 1OJ4 A; 4ID8 A; 1U2R A; 4F0H A; 3G86 A; 2V67 A; 3FUY A; 4ED8 A; 3FSI A; 4PYD A; 1RAB B; 4OZL A; 1NLK L; 3G82 B; 5HL7 Q; 2EG1 A; 3HXM A; 2EKY A; 1N5Q A; 4CH1 A; 2YX1 A; 4LF9 J; 2C3P A; 3DOL B; 4CT9 A; 4TU8 A; 5F9L A; 1HFE L; 2MEW A; 3QFH A; 4ED5 A; 3OL7 A; 1OY9 A; 2MYF A; 4ANE A; 4IFV B; 2GA7 A; 4M5D B; 4GC7 A; 4ILR A; 3MPV A; 3E3X A; 3D0H E; 1OIA A; 5DJB A; 1S0N A; 2DNM A; 3FRZ A; 5D4O A; 1C4C A; 5THW A; 1XTZ A; 2JLE A; 1TV6 A; 1TUW A; 3OFG A; 1LWC A; 1CC8 A; 2R42 A; 2KJV A; 4KB7 A; 4B9U A; 2AJQ A; 1EET B; 4LFA F; 3MUV P; 5HK4 A; 1EP4 A; 3OPK A; 1W26 A; 4RW7 A; 2GC8 A; 2E7X A; 2PMW A; 1D1U A; 3IAS 9; 3SQG B; 3RJM B; 1U1K A; 3FDS A; 2HRT A; 2KKH A; 5F8L A; 2RHQ B; 2LQ5 A; 3HJV A; 3U27 A; 2XLK A; 3VAK A; 4H4K C; 1C4A A; 3W63 A; 4G6V B; 4QW8 A; 5I3U A; 3C8Y A; 2LXF A; 3VAF A; 2KFN A; 3WZ0 A; 1WF1 A; 3AJ1 A; 2DO0 A; 4RO0 A; 3HHN B; 2HZC A; 3QT5 A; 1S9F A; 3CCR S; 4ILM A; 3M4X A; 4B3M F; 4ILL A; 1FER A; 1TVR B; 3D9B A; 4N41 A; 1G6B A; 3K7R A; 2HQ3 A; 3IWN C; 5L1K A; 2QV6 A; 2MZR A; 1FNX H; 4UW2 A; 3NGS A; 2KT2 A; 3GII A; 1NXI A; 2DYA A; 3M8S A; 3G6E S; 4DR2 J; 3BN7 A; 1VJW A; 4ECR A; 4C2M A; 4G3I A; 1S76 D; 1MG7 A; 3LP1 B; 3TAN A; 3H8Y A; 2N7C A; 4RL1 A; 2ZE2 A; 3MMC B; 2C2N A; 2YWG A; 3L95 X; 4PUO B; 2QE5 A; 2AX1 A; 4NML A; 2J6S A; 1C0T A; 4I2P B; 3N6M A; 3DMJ A; 2MKJ A; 3FSX A; 1VBZ A; 1KOH A; 4MJK A; 4FVC A; 4OHY A; 2FJE B; 3IXQ A; 2CQ3 A; 3R6L B; 3L3C A; 3AJ2 A; 4C8Z A; 1UZH A; 2XC9 A; 4QBU A; 1SL2 A; 1ZAV A; 3DGP A; 1UEV A; 2E5L F; 2J0S D; 3MOJ B; 2HHH J; 2E1M C; 2ZNY A; 3NS5 A; 4C6A A; 3NAH A; 5CZV A; 4OYM A; 4B3S F; 1QD1 A; 3C6T A; 3MM6 B; 1S79 A; 4X4N A; 2YQ0 A; 4DV0 J; 3JB9 k; 2C2M B; 3KG1 A; 1TEL A; 2N3O A; 4IO1 A; 3HFK A; 4BC9 A; 3IRX A; 1V5V A; 2YBV A; 2F4F A; 3BBF A; 4BWJ A; 1HNI B; 2ATC B; 4C8Y A; 3GYN A; 5AE2 A; 2VD3 A; 3TAM B; 1QAJ A; 3ZNJ 1; 3I87 A; 2D1C A; 5DS7 A; 1T0T V; 3DFE A; 4CZC A; 2YNF B; 2H51 B; 3MPY A; 3IG1 A; 1REG X; 2KYX A; 2CJQ A; 3IGV A; 3TRG A; 1NK7 A; 3J7A 1; 3ZTP A; 3ZZY A; 4KT0 C; 2B9Y A; 1WHY A; 2KZZ A; 4HHU A; 2XS5 A; 1BXN A; 7FDR A; 1I94 J; 4Q44 A; 3UNG C; 2EG2 A; 2FC8 A; 4N56 A; 1JLB B; 3V6D B; 2X3D A; 2ROG A; 2OIH A; 3LP0 B; 3VCD A; 4F36 A; 2CYY A; 4A8K A; 4GC6 A; 2NRE A; 1FEH A; 4KGM A; 4OV1 A; 3HVT B; 4QYZ J; 5KG0 A; 3QSI A; 3V6K A; 4MYU A; 3FNN A; 3R3T A; 4CNZ A; 2BR0 A; 5KFS A; 3W9I A; 1HW9 A; 2J0W A; 1S9E B; 4G1Q B; 4LFC J; 3TR5 A; 1H2V Z; 4WTY A; 4F04 B; 1X9M A; 3HSD A; 4A8W A; 4OV6 A; 4JI4 J; 3L7P A; 3VZI A; 2BUN A; 1VQ5 S; 2QZ8 A; 4CRJ A; 3UNY A; 2GQC A; 4FXV A; 1LEO A; 3IM9 A; 3FCH A; 2W7P A; 3W65 A; 2LDI A; 3MWB A; 4RNN A; 5LXR A; 4PAB A; 2CJA A; 2CJX B; 5C5J A; 1K1S A; 5J2P B; 3TJ8 A; 4W98 A; 1TK5 A; 3ZZ0 A; 1TFW A; 1VLY A; 2ZZT A; 4URS A; 5K5M A; 4NYP A; 2X7I A; 2YWK A; 5AJ3 J; 1QTN B; 4YDX A; 2PI5 A; 1CJT A; 2XB2 D; 2GX8 A; 4WXW A; 4YY3 F; 3FEY B; 2CQP A; 2XMU A; 4X65 F; 2QLX A; 4IH6 A; 3SFG A; 3P96 A; 3VTI A; 4ZCM A; 2W2O P; 1VRT B; 2J7K A; 2CQD A; 3MEC B; 3DN9 A; 3UVJ A; 2CQC A; 1UW4 A; 3GJR B; 1KRP A; 4MTP A; 3NCP A; 3FBF A; 1JJ2 R; 4OZ5 A; 2C3O A; 3CD6 S; 2EK6 A; 1DTQ B; 3QIP B; 2LYV A; 2QA2 A; 2ZH9 A; 1S49 A; 3AOC A; 1VQ4 S; 4QR0 A; 4DJB A; 5HMW A; 2EEY A; 4NA2 A; 1F6T A; 3VV2 B; 2KO1 A; 4C8O A; 2EFV A; 4N47 A; 2HQG A; 3O2I A; 1UPM B; 5M2R A; 2KFY A; 4J9M A; 2VG6 A; 5KG3 A; 2DNN A; 3J81 U; 3KLV A; 3H7H B; 2ZOG A; 2VJU A; 3QRR A; 3A3N B; 3Q86 A; 4L76 A; 3PW2 A; 3THT A; 4DQS A; 2BRL A; 1GMW D; 1PCA A; 1IUJ A; 2GIR A; 1XER A; 3B8H A; 1WC4 A; 2PFD A; 3M32 B; 4NA1 A; 5A8R A; 5H1S V; 3DRS A; 2X1B A; 4AQY J; 5HMY A; 1REV A; 1D9A A; 1FDB A; 2YNI B; 3R1L A; 5K14 B; 2DR8 A; 3M2U B; 2FD2 A; 2CQI A; 2XS7 A; 1UVL A; 3JTN A; 1RTJ B; 5HI7 A; 4YS2 A; 2OEK A; 1BWE A; 1KOO A; 2QA4 S; 2LQ8 A; 3TP2 A; 2HFS A; 3BBC A; 3MR6 A; 2BMB A; 2VZ9 A; 4P6Q A; 1KTV A; 4RBU A; 5D0H A; 1FKP A; 1X0P A; 2UUA J; 3MCO A; 1FK9 B; 3KFW X; 4B08 A; 4D3H A; 1CS4 A; 3MAQ A; 2B8P A; 1C1C B; 2IVM A; 1Z2Z A; 2GFF A; 5FII A; 4RBV A; 2W2P P; 1YJR A; 1KQK A; 4NA3 A; 3CJK A; 4LVN P; 3PFO A; 1UVM A; 3B78 A; 3EPG A; 3OFH A; 3RAM A; 4LSL B; 1FD2 A; 1OQ3 A; 1U8W A; 4KIA A; 4ZPW R; 3UFC X; 3TW0 A; 4OX8 A; 1F9E B; 3SIP B; 2AKW B; 1RTD B; 3FSY A; 4YDD B; 1D8Y A; 1PYT A; 3EM1 A; 3MCM A; 3OR2 B; 1ZET A; 5F3Z A; 5AT1 B; 3WC2 A; 3W64 A; 4J9Q A; 1IM4 A; 4X4O A; 4BLG A; 2ZH6 A; 4G1I A; 4OX6 A; 3BKU A; 2GQQ A; 2B7B B; 3AD9 C; 3HLU A; 4K0K J; 1X4A A; 4HI2 A; 1MWQ A; 3ILO A; 4K5S A; 4OYO A; 1TKZ A; 2AP6 A; 5IOL A; 2QRR A; 4BHQ A; 1KN6 A; 3PYE A; 3VQT A; 3BQ0 A; 3NRB A; 5FDL A; 2FLO A; 3BRE A; 2DNZ A; 3R7B B; 1RCO B; 1QJH A; 4NWB A; 1UVN A; 3CED A; 2HMI A; 2DGO A; 4KR0 B; 1R0A A; 2CZ4 A; 5I3Q A; 1PJ5 A; 3RBX A; 5A0Y B; 2G2Z A; 3F41 A; 1N32 F; 5F8G A; 3HHL B; 2BAB A; 4CLP A; 4DR6 F; 2DBB A; 3CJS A; 4K4Y A; 2CPY A; 3ET6 B; 4DR3 F; 2VQE J; 3HSJ A; 2JX2 A; 3VGT A; 2UXC F; 3CDA A; 1TL1 B; 2VPX B; 4EZ9 A; 2R2U A; 5EGY A; 1JXV A; 1W2I A; 1YJ7 A; 3OTD A; 1V9O A; 1WI6 A; 2CJY B; 2OD6 A; 3M8Q A; 5ETL A; 2VFT A; 8ATC B; 3V4I B; 4YHH J; 1UAW A; 2GNK A; 4LQ3 A; 4FYX B; 5DRK A; 3SSS A; 2V5H G; 1M5H A; 2XSJ A; 2KYZ A; 3MMA B; 1X4F A; 3RBZ A; 5KFV A; 1OS5 A; 2K1R A; 1F3F A; 1CJV A; 4M5I A; 1QE1 B; 1YWX A; 3M2V B; 4JOU A; 3TZX A; 1IBK J; 3E01 B; 4JI6 F; 1RWO B; 3AD7 C; 2J0Q D; 4IR9 A; 2ZBR A; 4ELV A; 2LFV A; 1SQF A; 2AZ3 A; 5KG5 A; 5IT9 Y; 2C22 A; 3NLC A; 1S12 A; 2EBG A; 4LRB A; 2OPS A; 3BZQ A; 4WE1 B; 2HND B; 4MKA A; 4N8N A; 2D3O R; 2KVQ E; 3IWX A; 1O5J A; 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