The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
115
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structure length |
115
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Chain Sequence |
KEDTIEIAGFHAHVYFDAASRDVAARVREGLGARFEVQLGRWFDKPIGPHPKGMYQVAFLPNQFDKVVPWLMLNREGLDILVHPETGDAVSDHAVYSLWLGAALALNIEFLRQLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of putative dioxygenase (ZP_00109509.1) from Nostoc punctiforme PCC 73102 at 1.46 A resolution
rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Nostoc punctiforme
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| molecule keywords |
putative dioxygenase
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| total genus |
28
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| structure length |
115
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| sequence length |
115
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | DOPA-like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P8I A; 2NYH A; 2PEB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M1H A; 1PC5 A; 1B7Y B; 1CEZ A; 3QWP A; 3M8W A; 1MU2 A; 4BBY A; 3UDL A; 2HVI A; 3G71 S; 1UFW A; 3C15 A; 3TX8 A; 2BEF A; 2UXD J; 3R6L B; 4DSJ A; 1YJN S; 3T3F A; 3HVT B; 3KK1 B; 4NCG A; 5I42 B; 5KFY A; 1KNZ A; 1WG5 A; 5KT6 A; 3IM9 A; 2W7P A; 1HWU A; 1TK0 A; 1Z2Z A; 1H38 A; 4IUF A; 1UAW A; 2GCF A; 1KQF B; 2RDJ A; 2XC9 A; 2DO4 A; 1IUJ A; 2XWX A; 4ZN3 A; 3CUN A; 2VPZ B; 3C66 A; 9RUB A; 2AT1 B; 3H2L A; 4IFV B; 1ZAW A; 4DR4 F; 1VOM A; 2XMM A; 5IOL A; 3BH6 B; 2RML A; 2VPY B; 1Y00 A; 2KXN B; 3CC7 S; 5KT5 A; 4OZJ A; 4NLD A; 3MCS A; 3HHD A; 4ZPT R; 2XGP A; 2BM1 A; 4NYO A; 3GYN A; 4F3Q A; 3BR9 A; 4IDK A; 3TUP A; 2VQF J; 1FD2 A; 4AYB D; 2BOP A; 4O3N A; 4USW A; 1HD0 A; 3GIM A; 3EPI A; 2DIT A; 2F65 A; 5D4P A; 3GR0 A; 2RS2 A; 5I3Q A; 2AJ4 A; 3CIZ A; 2WON B; 2WVF A; 4KPY A; 4ZKA A; 2G13 A; 4NX9 A; 3EZ5 A; 2YX7 A; 5B0G A; 3RRH A; 2BJ9 A; 3QT6 A; 1SXL A; 4LSL B; 2WOM A; 4FNH A; 4OZ2 A; 3VGS A; 4G1Q B; 3K5L A; 2GC8 A; 1S9G A; 4RJV A; 3MMA B; 3OV7 A; 2ZE2 B; 1MLA A; 4RLE A; 2AGP A; 2H4Y B; 1U2F A; 4B9S A; 2IHR 1; 2FC8 A; 1K9M T; 5D6G A; 3PX4 A; 2B8Q A; 1RAO A; 3SQG B; 4OZ3 A; 4M5M A; 1X4C A; 4Y0F A; 3RAM A; 2QV6 A; 2R9L A; 1VBX A; 4EWT A; 3GZ7 A; 3CO0 P; 4FXD A; 2FQQ B; 2ILZ A; 1BQN B; 1VBK A; 3WDO A; 5D77 A; 3Q8R B; 3IAM 9; 1M5O C; 4NXM F; 3RBZ A; 3BQ2 A; 4ZCM A; 1JLA A; 2YWK A; 5DZ6 A; 4QW8 A; 1RTH A; 1GX6 A; 2XNQ A; 3KHR A; 4ECW A; 4ID5 B; 2HYI B; 1Y0H A; 2H4W B; 5BR8 F; 3T9Z A; 3CSK A; 3TAQ A; 4PG6 A; 1EX8 A; 1X4E A; 4I64 A; 3DM2 A; 1D9F A; 1QAY A; 3CDW A; 3BGR B; 4OZL A; 2OFG X; 4CRJ A; 2GHW A; 5LSR A; 3TAN A; 4WP8 A; 4V19 X; 4R8U B; 1NK4 A; 1Q16 B; 3M30 A; 4OYZ A; 4A8W A; 3DYA A; 3I5B A; 1VHF A; 4KB7 A; 1QLN A; 4OYM A; 5EDW A; 5GAG U; 4I1T A; 1N56 A; 4YB1 P; 3NWG A; 5DDQ C; 2BJE A; 3GIJ A; 4FPI A; 3J7Y U; 1PYS B; 2AYG A; 1F60 B; 1SH0 A; 1YJ7 A; 2M9K A; 2AW0 A; 2YWH A; 1MWQ A; 1BLU A; 3MGJ A; 3FJ2 A; 4OX9 J; 5KFU A; 1S0M A; 3GCW P; 3I82 A; 3PCO B; 2R4F A; 4ZP6 A; 8ATC B; 4QWB A; 3GV8 B; 1NAQ A; 5IQQ A; 4RW6 B; 3V6H A; 1GK8 A; 3KNG A; 2C3O A; 3D54 A; 4ZN1 A; 1RA7 A; 2ASL A; 5CCL A; 5J2N B; 2B9Y A; 1M1G A; 3UNG C; 5HSP A; 2M70 A; 5GAE U; 4DX5 A; 2IA0 A; 5T41 A; 2EFV A; 1IBM J; 2GIR A; 4ZJL A; 1L5U A; 4EFA C; 2H48 B; 1RXO B; 1B70 B; 3W66 A; 3GG1 A; 2ILY A; 2C2E A; 1RWU A; 1N33 J; 2EEY A; 5F3Z A; 5BYQ A; 4O4R A; 2IM1 A; 5CA5 A; 3PX6 A; 2RHQ B; 2CPX A; 1KSP A; 4G6V B; 4MTP A; 2B8P A; 3M8Q B; 2YH1 A; 2Y9H A; 4DR2 F; 1UZH A; 3O1L A; 1BQX A; 4LR7 A; 1XNQ F; 3V81 B; 4KH0 B; 3WX4 A; 2YX4 A; 1FJG F; 3J81 U; 2QLJ B; 4G1I A; 4F50 A; 3R3T A; 3BV8 A; 2JH3 A; 4U8V A; 2J76 E; 1JB0 C; 3PRB A; 3ENA A; 2QA4 S; 2GQC A; 3QRP A; 4KC5 A; 4OYX A; 2E66 A; 4N8O A; 2IVY A; 3H4D A; 2A2C A; 1TR0 A; 4KHM A; 1UZD A; 5A0Y B; 2L48 A; 5C25 A; 2IPO B; 2BA9 A; 4ZVP B; 1S1T A; 5HRO B; 4JI1 J; 1KHV A; 1DTQ A; 3PG9 A; 5HL7 Q; 5LMN F; 5C7P A; 4NOH A; 1VQS A; 3F41 A; 5KFC A; 4JV5 J; 4DFP A; 3QT5 A; 2OAU A; 2B7C B; 1SJ3 P; 3W7B A; 4R5P B; 3P49 B; 5E3A A; 3TR5 A; 3G6Y A; 3JSM B; 4W92 B; 4B3S F; 2IAJ B; 3G6X A; 2J8A A; 3VV2 B; 1D8Z A; 4CWB A; 2UXB F; 1N5S A; 3FEY B; 4DV5 F; 2W2O P; 2ZZM A; 1SKR A; 3OFH A; 1ACM B; 3OUY A; 3KHG A; 4WK1 A; 1RU2 A; 1K1Q A; 1IN0 A; 4UOF A; 2CQ2 A; 3CJS A; 2RRN A; 1PJ6 A; 2BJ3 A; 4F0H A; 1JIH A; 3IWX A; 2LKZ A; 2HWH A; 2H9Z A; 4DR4 J; 3BKF A; 1TL4 A; 3EZU A; 2XYG B; 1P9Q C; 5L1L A; 2OPR A; 4JUZ A; 2MKH A; 2MQP A; 1WDD A; 1RAA B; 3PV8 A; 4HVZ A; 1U1R A; 3KDN A; 1S6Q A; 5SUH A; 1FXD A; 3V4M A; 3TAM B; 5EGY A; 3PR5 B; 1QDU B; 3KWM A; 3MED A; 2QRR A; 3BSO A; 1JLE A; 1TU0 B; 4DPY A; 4OYB A; 1T03 B; 3PYF A; 5GVQ A; 4O44 B; 2MEW A; 4HI1 A; 4KV8 B; 4DPO A; 3LOU A; 4C6A A; 2ZH9 A; 2QLW A; 2D3Z A; 4KY3 A; 4CLT A; 3Q24 A; 2ZVS A; 5CAB A; 3IM8 A; 1WEY A; 4C11 A; 4DCJ B; 4NI2 B; 5B09 A; 3IP0 A; 4K4S A; 1ZS6 A; 1QSS A; 2ALZ A; 3AJD A; 1NKC A; 3QZ8 A; 2F8M A; 3BEG B; 3OFE A; 3T5L A; 1RWX B; 3LAK A; 1BQM B; 3ZZU A; 5SZT A; 4X62 F; 4OX7 A; 4RW4 A; 2C2O B; 2W7A A; 5AXK A; 1SUQ A; 2ZJQ Q; 4UY8 T; 1HFE L; 2DGO A; 4YDD B; 5IWA F; 2FY8 A; 2M3D A; 5AXN A; 1FA0 A; 3LP1 B; 1U7L A; 3IR6 B; 1ZYQ A; 4FKY A; 3AXK A; 1VQY A; 3DRX A; 2MQM A; 5C2C A; 3CJK A; 2WVB A; 5KFR A; 3G87 A; 3V6D B; 2AJ0 A; 3NS7 B; 2XEX A; 4M1K A; 1YJV A; 1CPZ A; 5KT3 A; 3BR8 A; 2VC0 A; 4M95 A; 1RT5 B; 4PUO B; 5THW A; 3S01 A; 5BR8 J; 5LJ5 Y; 4DOZ A; 1Q79 A; 4TKT A; 3GCX P; 2FHO B; 1SH2 A; 1S0O A; 3JQJ A; 2ZHB A; 4NZ6 A; 2Q6C A; 4RNH A; 4CI0 B; 3MR5 A; 3DLE A; 2G2Y A; 4OHW A; 3D9B A; 3LPY A; 3KJV B; 3CJ4 A; 1NSA A; 5EX3 A; 4DL3 A; 1RCX B; 1O51 A; 3L9Z A; 3IXQ A; 4LIW A; 2YH0 A; 1VK8 A; 4GRS A; 4EU0 A; 3HSD A; 2BUN A; 3PR4 A; 1IKV A; 3VR1 A; 1RKJ A; 3CDE A; 1C0U B; 2ZZN A; 1VLY A; 1D3W A; 3U7J A; 3DOK B; 4KT0 C; 3IBF B; 2KZM A; 4C8Y A; 3JS9 A; 2MQO A; 2R7T A; 2MZS A; 3MMB A; 4OX8 A; 2NR0 A; 1S10 A; 2BE9 B; 3FZ2 A; 2OPP A; 4FKX A; 2HK2 A; 4GO7 X; 3SV4 A; 2BV3 A; 1YJR A; 4CNZ A; 4I68 A; 2XY6 A; 4K4V A; 4YDX A; 1RWW B; 4JI4 F; 3UO0 A; 1WEL A; 2I9S A; 5EWE A; 5J2Q B; 1FNX H; 4ZVO B; 3JYT B; 3TOQ A; 3EXC X; 1LOU A; 3UN3 A; 4NLP A; 3W9J A; 4LT6 A; 1ZH5 A; 2ABY A; 2HHS A; 2HHQ A; 3HKZ D; 5L46 A; 4DUZ F; 1XER A; 3MF5 A; 2GAH C; 1NU4 A; 5DRK A; 3CW2 C; 5LL6 d; 4YY3 F; 3VZI A; 3UWT A; 2ZBQ A; 2AJ2 A; 2X7I A; 3FQK A; 2EI5 A; 3VAJ A; 3I5C A; 3MM5 B; 3RB4 A; 1X5S A; 3GLJ A; 3FQL A; 2FY1 A; 4RW9 A; 1H7W A; 2DH7 A; 4CDI A; 3H90 A; 4OMF G; 1KOH A; 3E2E A; 1JJH A; 2L3M A; 1GTH A; 3A8K A; 4OYI A; 3EDQ B; 1Q1K A; 1FRI A; 1B7F A; 2CNK B; 3J7A N; 1TAU A; 4DR2 J; 3G86 A; 1AB8 A; 4WTY A; 3T5J A; 2DGU A; 3M2V A; 1XNQ J; 1FJG J; 4LRA A; 2G4B A; 2V9W A; 4Y65 A; 2C3U A; 3AB4 B; 2XO6 A; 2RQC A; 3CXC R; 3G96 A; 1C0T B; 1X5P A; 1OSD A; 2UV8 G; 2RT3 A; 4M94 A; 5KG0 A; 2KFY A; 3MDF A; 5GME A; 2KU7 A; 2G0J A; 5AJ3 J; 1JXV A; 3M2R B; 2EVZ A; 3KLE B; 1HBO A; 5L1J A; 2WAQ D; 2ZOG A; 2YKN B; 3VAI A; 1H73 A; 4HL9 A; 4FVM A; 2XMU A; 2KT2 A; 4PYA A; 1HBM A; 5LMN J; 2WVD A; 3KDO A; 4CNY A; 4EBD A; 3EIC A; 3C6U A; 3J80 U; 4P2S A; 4KGZ B; 5LJ3 Y; 4ED2 A; 1TFY A; 1NJI T; 1SJQ A; 3SMZ A; 1YQH A; 3UCZ P; 2WHO A; 4ELV A; 2RQ4 A; 2ZHO A; 3CB4 A; 1S7H A; 3P6Y C; 1KTQ A; 2UV8 A; 2UXB J; 2XQC A; 3Q8U A; 4BS2 A; 4I7F B; 4DSF A; 1UEU A; 2HBY B; 3MZI A; 1TKT B; 4CLZ A; 1QM9 A; 1P8G A; 3NGS A; 4MIW A; 4DR6 F; 4H4O B; 4DV0 F; 1XIQ A; 4LFC F; 5JUM A; 1N54 B; 3DRR B; 4FYD A; 3Q23 A; 4ZVH A; 3SDE B; 3ZNU A; 2R7S A; 2AU0 A; 2IMW P; 4FS1 A; 4JI0 J; 2BAN B; 1OYD A; 1YX2 A; 1SJR A; 4L73 A; 1Y3K A; 1FRL A; 1M90 T; 2V2K A; 2KI2 A; 5KG3 A; 2QG9 B; 1SI9 A; 2KFN A; 2HUR A; 3KOA A; 2CPD A; 2CDQ A; 2Y1I A; 1NHU A; 3KXD A; 4DQP A; 2QZ8 A; 4DQI A; 2CQB A; 1VIO A; 1WG1 A; 3OHA A; 2J8S A; 1JXE A; 5CYM B; 4U6P A; 3BS9 A; 2KYX A; 3NBP B; 4CLK A; 2AEF A; 2RQK A; 1T94 A; 2ZH5 A; 5HAN A; 2MTL A; 3F44 A; 4JI8 F; 4YFU A; 1R3N A; 1NK8 A; 1T02 A; 3OHB A; 4M63 A; 3R27 A; 2UZA A; 2J0Q D; 2CQ1 A; 3NLC A; 2FLL A; 2V9K A; 3I4H X; 2XG8 A; 3F73 A; 2ZVI A; 1V9O A; 3Q86 A; 5K5M A; 1N5Q A; 3NAI A; 2PA3 A; 1H72 C; 5F9N A; 2UVV A; 1PGZ A; 1S1V B; 3KG0 A; 1N36 J; 3AA8 A; 1U0H B; 4RUA A; 1KDN A; 2CYY A; 4X62 J; 1NBE B; 3NNC A; 1S6P A; 2V2Q A; 1DUR A; 1WHV A; 3N79 A; 1VDH A; 5IT9 U; 1YRX A; 1IJF B; 1ZAV A; 4UY8 5; 4TYB A; 2NUH A; 4I69 A; 1WKK A; 1R0B G; 3SSR A; 4NYZ A; 4IOA Q; 5IWA J; 2F7V A; 5T7L A; 1IR1 A; 1M5K C; 4B3R J; 4DCO B; 2YNI B; 2HQG A; 3BDE A; 3FFI A; 4DFJ A; 4TLQ A; 1HBN B; 1EP4 B; 4IYQ A; 1YZ7 A; 2LVW A; 2L9N A; 2HNZ B; 2VD3 A; 2DGT A; 4PAA A; 2LEC A; 1B0T A; 3MEE B; 4M8L A; 1ZM9 A; 1X8D A; 2AJF E; 3ENV A; 2JLF A; 2V34 A; 4ER8 A; 4P10 A; 4JBC A; 5ITH A; 8RUC A; 1IQZ A; 5AT1 B; 1C4C A; 3T1H J; 3RBX A; 3R5J B; 3EX7 B; 1LW2 A; 2DGQ A; 3WZ0 A; 1R7I A; 2SXL A; 4IH6 A; 4USI A; 4DV6 J; 3QRR A; 3VCD A; 3L3C A; 5M2R A; 3CWJ A; 1S9E B; 5IT9 Y; 3UVJ A; 2R42 A; 4DFM A; 1SBR A; 3OQ2 A; 3IRX B; 3B54 A; 1UMJ A; 1FVS A; 1I1G A; 2E1R A; 3R5C A; 2F8H A; 3MCO A; 3WC2 A; 4J9M A; 1VQP S; 4UOG A; 1RHU B; 4DS4 A; 4F0M A; 4KFB A; 3RB6 A; 3GJT B; 2ZH8 A; 2NYI A; 1X9W A; 3HCX A; 1LWX A; 4PZV A; 2AYB A; 1JKH A; 2RRB A; 4B9M A; 3N9U C; 4H4K A; 1KQG B; 3ZO7 A; 4TY8 B; 1VMB A; 4PWU A; 3E01 A; 5K14 A; 3I96 A; 3ITH A; 1HA1 A; 1LK7 A; 3CCV S; 4JI4 J; 4ECS A; 2KZZ A; 1T3N A; 3M8P B; 2GHV C; 2P9C A; 2E9R X; 2DHA A; 4XK8 C; 1L3S A; 5ADZ A; 3V4I A; 2VFV A; 2L9W A; 3DOL B; 2AKW B; 3LTO A; 5FDL B; 4F2S A; 3WX8 A; 4YY3 J; 2QGF B; 5DO2 A; 1RBL A; 4UF4 A; 5A76 A; 4QQB A; 2BMB A; 2AEM A; 2F3J A; 1TL3 B; 1I5O B; 3M9M B; 1MSW D; 4NL5 A; 4OHZ A; 5I4M A; 5JJB A; 1FDA A; 3MAQ A; 2G9O A; 4AT1 B; 2FGC A; 1U25 A; 3VF0 B; 4M5D A; 1JLC B; 4I2Q A; 3ZZZ A; 3H98 A; 3JQM A; 1RKI A; 5BYR A; 4PKD B; 1RUS A; 1IBK F; 1U1Q A; 3IR7 B; 4A48 A; 2RRA A; 4IR9 A; 5LOQ A; 3NCQ A; 5IFM A; 4KH1 B; 1NO8 A; 4C0O C; 1AA1 B; 4LR9 A; 3CD5 A; 4WK3 A; 2UUA F; 5HJY A; 2K3K A; 3QIP B; 1WWH A; 2BAC A; 2NSB A; 2AIR B; 1X0P A; 2HK3 A; 5DG7 A; 4ZJO A; 1C2P A; 1FRK A; 5GAG I; 1JJC B; 4DR5 J; 4ZVE A; 2FIU A; 1APS A; 2CDR B; 1UVK A; 2D7S A; 1T9T A; 2E5G A; 2LCW A; 2X1A A; 1SIW B; 3Q22 A; 4PPD A; 3HVT A; 3KK1 A; 5HMX A; 3EVW A; 3CIM A; 5K8M A; 3KMQ A; 2P8I A; 1HQE B; 5U47 A; 4N41 A; 4DR6 J; 2J9D E; 1VCT A; 2CQC A; 3ZTQ A; 4NWB A; 3MWB A; 2OEM A; 3H25 A; 4MYU A; 5A6P A; 1RWK B; 1LK5 A; 4GKJ F; 3SFU A; 3AOA A; 5ETL A; 1WHX A; 1XTZ A; 2OHD A; 3DHX A; 1YJT A; 2YNH B; 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