The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Caspase-7
|
| total genus |
16
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CNN B; 2DKO B; 4ZVO B; 2H4Y B; 4ZVS B; 1RWW B; 1F9E B; 1I3O B; 4ZVU B; 2H48 B; 2H65 B; 1RHJ B; 2XZT B; 3SIP B; 4ZVP B; 3R6L B; 1RHU B; 3GJQ B; 2XYH B; 3R6G B; 5IC6 B; 2Y0B B; 2H4W B; 2HBR B; 3P4U B; 4ZVT B; 1RWK B; 3KJF B; 4ZVR B; 3EDQ B; 4DCJ B; 3R7B B; 3GJS B; 1RE1 B; 2C2O B; 1QDU B; 3D6F B; 2XYG B; 1I51 B; 3KJN B; 3D6M B; 2HBZ B; 4LSZ B; 3IBF B; 2QLJ B; 1RWV B; 2C2K B; 2P2C B; 2CJY B; 1RHQ B; 2FQQ B; 1SC4 B; 2XYP B; 3D6H B; 1RHR B; 3QNW B; 1NME B; 2CDR B; 3R7N B; 1RWO B; 1RWM B; 1PAU B; 3R7S B; 3GJR B; 3RJM B; 1QTN B; 2H5I B; 1RHM B; 2C2M B; 5K20 B; 2H5J B; 3IBC B; 3EDR B; 2H54 B; 2QL5 B; 1SC3 B; 1SC1 B; 2C2Z B; 1ICE B; 2CJX B; 1PYO B; 4JB8 B; 2CNK B; 2HBY B; 4DCO B; 1BMQ B; 1RWP B; 1RHK B; 2HBQ B; 4DCP B; 2QLB B; 3NS7 B; 1RWN B; 2H51 B; 2QLF B; 4ZVQ B; 2XZD B; 1IBC B; 3GJT B; 2C1E B; 3R5J B; 2Y1L B; 2QL7 B; 2QL9 B; 2CNL B; 2CNO B; 1GFW B; 5IC4 B; 3P45 B; 3KJQ B; 1RWX B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HNZ A; 2F5G A; 1XMQ F; 4GKK J; 5CD4 A; 2YNF A; 3ITH B; 4LF6 F; 1X4C A; 3G4S S; 3TAM B; 4PG4 A; 4JI2 F; 4NLO A; 3FQL A; 3MXH P; 2PDA A; 5FLX Y; 1N5T A; 3NRB A; 2CPY A; 1JLQ A; 2Z2Y B; 5HK4 A; 2R2T A; 3M05 A; 2DR7 A; 4DL7 A; 1U25 A; 3KHH A; 2Y9H A; 3QJJ A; 2ZBP A; 1YZ6 A; 3TUJ C; 4M95 A; 5DGA A; 5T14 A; 3CC2 S; 4USI A; 3CMQ A; 3R97 A; 3GG1 A; 1WF0 A; 5CD4 H; 4KV8 B; 1QE1 B; 4X4U A; 2IAJ A; 3Q8R B; 5E3P A; 1HBN A; 1H74 A; 1S59 A; 2M70 A; 4YB6 A; 3SZ2 A; 1K0T A; 1VQY A; 4ECZ A; 1HYS A; 2BJ1 A; 4IRD A; 4NLW A; 2GHV C; 4Y28 C; 3U27 A; 5KFP A; 4CLL A; 2QLB B; 3KDO A; 4ZVQ B; 4DF8 A; 4DV4 F; 1CS4 A; 5HMY A; 4ZK7 M; 5HP1 B; 3KLF A; 3M8Y A; 4RW6 A; 4K4V A; 4ECX A; 3B4D A; 1QUV A; 2OAU A; 3H5Y A; 1C0U A; 1FXL A; 3AB2 B; 2ZBI A; 4QIE A; 2G2O A; 3CDE A; 4P2S A; 1JWW A; 1XR6 A; 5HLF A; 1Q4R A; 2ACY A; 4CT9 A; 1JLB B; 3T6J A; 1F2H A; 5J2M B; 3PYF A; 1RTI B; 2NSC A; 1H7X A; 3OBI A; 3GCX P; 1V5I B; 2GML A; 4RNM A; 2CQ0 A; 2C2O B; 1WUU A; 2Z58 B; 2CPX A; 2XGP A; 4Q0B B; 1JKH A; 3FCW A; 1UET A; 2UVV A; 3M30 A; 2VDH A; 5IZH A; 1VQM S; 3QJL A; 2HRU A; 5DM6 Q; 2B8Q A; 1TVR A; 1FEH A; 4DPX A; 4DPT A; 1U47 A; 3IR5 B; 4X4T A; 1WI6 A; 3DLB A; 1FJ7 A; 3T1Y F; 3IAS 9; 4DQI A; 2HGL A; 4DPO A; 2NS1 B; 3V4I B; 2A2D A; 1DHM A; 3OUY A; 1UWB B; 5KFQ A; 2OFG X; 2ZZM A; 1XEZ A; 3MMC A; 1YJR A; 1U1P A; 1YLX A; 1NH8 A; 3GIL A; 1M1H A; 2A6O A; 2LQ5 A; 1HHT P; 2R7V A; 2B5J A; 3GR1 A; 1LWF A; 4DSL A; 4CTA B; 1HWK A; 3TOQ A; 2MLX A; 3V6J A; 5C24 A; 3BO2 A; 3CGI A; 4BDP A; 1BHN A; 3KNA A; 4FYD A; 3MAQ A; 3ZNJ 1; 5MAO A; 1YKW A; 1R27 B; 2HHT A; 4KRW A; 1XR5 A; 3TWZ A; 3ENQ A; 2FQQ B; 4XK8 C; 3SCK E; 2JLF A; 2O01 C; 2BOA A; 4U8Y A; 1H0H B; 4YB7 A; 1FES A; 3MED A; 4YP3 A; 2RDJ A; 2VV5 A; 3TAQ A; 3KG4 A; 4Q43 A; 2E9Z A; 1EQ0 A; 2GVD A; 1GT8 A; 4OJG A; 2HG4 A; 5AE1 A; 1KN6 A; 2CQ1 A; 2ZJQ Q; 2YKO A; 2H9Z A; 4DR1 F; 2XMJ A; 2MXY A; 1UWA A; 2YH1 A; 1MRO B; 1SJF A; 1T9U A; 3G2X A; 4OI2 A; 1Y3K A; 3OPK A; 4MKV A; 3HJF A; 1YK9 A; 1VHF A; 5CYQ B; 3HVA A; 4TY8 B; 1C4C A; 2LU1 A; 2M88 A; 4Y3C A; 1XQI A; 1R3N A; 2BJD A; 1E6V B; 1K0V A; 3HPO A; 2DNG A; 1MWQ A; 1Y7P A; 3KLV A; 2GO9 A; 4OX9 F; 3A1Y G; 3TVY A; 1KVJ A; 2DHX A; 1JIH A; 3TX0 A; 3HKZ D; 2V0N A; 3KWM A; 2FJB B; 2CUY A; 3QBC A; 4IG3 A; 3T5K A; 1U48 A; 2N82 B; 3GE9 A; 4FNH A; 4Q8E A; 1HMV B; 3TAM A; 4MK8 A; 4ZVH A; 5LSR A; 2UUA F; 2WVC A; 1BE4 A; 4M1K A; 2XS5 A; 2OEM A; 2RS8 A; 2VG5 B; 4OHY A; 1OYD A; 5IM0 B; 2VFV A; 4DPU A; 2J9C A; 3KK1 A; 2HVI A; 3HHL D; 5F8I A; 3D68 A; 1A9N B; 2Y0S D; 2P9C A; 3DFE A; 4RJV A; 4X64 F; 3CTR A; 3VAG A; 3FFI B; 3IM8 A; 3ILL A; 1AZS B; 1YRX A; 5IC6 B; 4DV1 F; 2Z4P A; 1MWY A; 3T1H J; 2VHG A; 2AYM A; 3T6B A; 1FCA A; 2J0W A; 4X62 F; 1IBM J; 3MD1 A; 1B7Y B; 4DOZ A; 3ZTQ A; 5HI7 A; 4P9S A; 1PIE A; 1RP5 A; 3M8W A; 1NJZ A; 5DDR C; 3SQG B; 3W62 A; 1KFD A; 1HPZ B; 1S9F A; 2X7I A; 5A76 A; 1JXE A; 4ZIV A; 2E1C A; 5ETR A; 3LP2 B; 3OL9 A; 3Q8V A; 3SCJ E; 2J8A A; 1RK8 A; 1SC3 B; 2CJX B; 3MHY A; 3CJ4 A; 4CLU A; 4I68 A; 1Q16 B; 2BJ3 A; 1U49 A; 4KR0 B; 1MN9 A; 3L4B C; 4Q0B A; 5FJ4 A; 1WEL A; 3RG6 A; 3UCG A; 1FNM A; 2VG6 B; 1AXQ A; 4EZ9 A; 1BUX A; 3CCQ S; 3O44 A; 3KXD A; 1S1T A; 2IM3 A; 1SKR A; 4DV0 F; 1CVJ A; 3FSY A; 5HVH A; 3NGR A; 3KJF B; 1TUG B; 1YZ7 A; 2D7S A; 1KSP A; 2BXJ A; 2DT9 A; 5AXN A; 3IBW A; 1UWB A; 2E5I A; 1VRU B; 3UE2 A; 4EO6 A; 2AJQ A; 3FDS A; 3MEC B; 2UUC F; 4J9Q A; 1CSJ A; 2MPU A; 5E41 A; 1SUQ B; 3E01 B; 5T7L B; 5GAE U; 4DU8 A; 3UQS A; 3FZB A; 1F9H A; 1WC1 A; 4N7T A; 3OJS A; 4FS1 A; 2V2K A; 2XSJ B; 4LMZ A; 1IBL J; 1JLE B; 2ZVI A; 4LBH A; 5DG7 A; 2RH3 A; 1NU4 A; 2ASY A; 4WP3 A; 2Z0G A; 1NPK A; 1S0O A; 1TFY A; 1FE0 A; 2W2M P; 3R5D A; 1ZPV A; 2ZWO A; 3M8R A; 4DLG A; 2ZBC A; 5KFR A; 4KO0 B; 4YR0 A; 3I55 S; 4GVB B; 4DSE A; 4TYA A; 2H3E B; 2PSZ A; 4OV1 A; 4LF9 J; 1UFW A; 2V4R A; 3N6L A; 2ZJR Q; 3FRY A; 2HFS A; 1S0M A; 3C14 A; 1U1L A; 1FRK A; 2AP6 A; 2FLP A; 3BR8 A; 3TJ9 A; 1WJ9 A; 1NK5 A; 3G82 A; 1IJF B; 4V1A k; 2Z56 B; 1IJE B; 2JLE A; 2P2C B; 2IM1 A; 4O23 A; 3TJ8 A; 1XC9 A; 2C3M A; 3SQO P; 3D28 A; 4R5P B; 3M2V A; 1GTE A; 3G87 A; 4HLB A; 1IKX B; 5JVH Q; 1QTN B; 3HVW A; 1DAR A; 4DR5 F; 1Q0N A; 1XMQ J; 3OV7 A; 1LW2 B; 3JSM A; 2RKI B; 1KTV A; 3FGV A; 5CYQ A; 4JI7 J; 1JJC B; 4ZMM A; 2P5V A; 2XZD B; 2MGZ B; 4ECW A; 2DHA A; 2CZV C; 2MKJ A; 3EIC A; 1E6V A; 3OVA A; 1ZA2 B; 2D3U A; 2HIY A; 4K4T A; 3BKF A; 4NRU A; 2O1P A; 2J0X A; 4I2P A; 2JC1 A; 3DOL B; 1LW0 B; 3Q0A A; 2L9D A; 4MAK A; 5GAD U; 5ETQ A; 2HQF A; 3BSO A; 3BR9 A; 2Y1J A; 1CLF A; 4F3O A; 2EFQ A; 2DVI A; 2VG5 A; 4FYY B; 2RQC A; 2ALZ A; 5IM0 A; 1SPB P; 3A4T A; 3KJN B; 2N4C A; 1FTR A; 3CCW A; 2F4V F; 3D6H B; 5KG1 A; 5A6W A; 1RHR B; 4DV4 J; 4EFA C; 1GXU A; 3V81 B; 4KGV B; 4NA3 A; 3NY0 A; 2H5J B; 1RAJ A; 3FFI A; 2DNK A; 2FHJ D; 3Q8U A; 2A2C A; 4F25 A; 2ATC B; 2ZH3 A; 3KJV B; 1UPM B; 1MMD A; 1N34 F; 4Z7C A; 2XZW A; 1IR0 A; 3QAE A; 4K4X A; 2OEJ A; 3FMB A; 2PA3 A; 3QSY B; 5THW A; 3SQG A; 2CQP A; 4AYB D; 3KHG A; 1HPZ A; 2UU9 J; 1IVZ A; 3NEK A; 2AQ4 A; 3PFE A; 4B3O B; 5J1E B; 2IJR A; 2V8D A; 1TTH B; 7FDR A; 3BSA A; 3GFX A; 2DO0 A; 3T41 A; 3EXC X; 4RW4 A; 1U4B A; 1Q8L A; 2AGO A; 3W9H A; 4CLS A; 1Q8B A; 1REV B; 3GJS B; 1F9F A; 3I87 A; 1CC7 A; 4CDI A; 4KGZ B; 1EQM A; 4MIW A; 4ED7 A; 4QWB A; 3GB0 A; 3RB3 A; 4FXV A; 2ZHO A; 4ECU A; 1PJ6 A; 3PRB A; 1RTZ A; 5D4L A; 3PO4 A; 2DXE A; 2XG8 A; 2VG6 A; 3NBP A; 4LR7 A; 4M8L A; 1NPR A; 3AY0 A; 5HL7 Q; 1K1S A; 4A4J A; 4AUK A; 3MPU B; 3AHP A; 1UW9 A; 4O3N A; 4IQX A; 1QJH A; 4HTJ A; 4ES3 A; 2OFH X; 2QL7 B; 1IR1 A; 4TXS A; 3HHL B; 1S99 A; 3IR6 B; 3ZTR A; 3A13 A; 1JNR B; 3NOC A; 3MEC A; 2XS2 A; 3Q83 A; 5LMU F; 2ZH7 A; 3HUL A; 1ZOT A; 1T8E A; 4RUA A; 1W26 A; 5F41 A; 4F02 A; 2YNI B; 1SIW B; 3CO0 P; 3HX9 A; 2ZWP A; 4IFV B; 2PO4 A; 2W4C A; 1YG0 A; 4DCJ B; 1S9E B; 2XSJ A; 2YKP A; 3DRX A; 1UVJ A; 1HNX F; 1RYR A; 2COL A; 1S48 A; 3V6K A; 2DY1 A; 4GVB A; 3M1V A; 1WDT A; 4RU9 A; 5GVQ A; 1FKP B; 2HHH F; 2OPR B; 4I6W A; 3D54 A; 4OLP A; 1C1B B; 5CCL A; 2HBQ B; 3PEH A; 3IFE A; 1BGX T; 2GJ2 A; 2DD8 S; 3DHX A; 3QGI A; 4B3R F; 2FC9 A; 4NYZ A; 3HP6 A; 3RB4 A; 1NHU A; 2DNM A; 5KOX A; 1FJG F; 1X4B A; 1OO0 B; 2OML A; 4ED4 A; 2MEW A; 1KQK A; 2RDD A; 1WG1 A; 2FTR A; 1M0S A; 3NP5 A; 4WKY A; 1LXJ A; 3QZ7 A; 4N8O A; 4WE1 B; 2QLX A; 1JXL A; 4DFP A; 4ZS6 A; 1ACM B; 4ED2 A; 2UUA J; 4M5J A; 3P6Y C; 3CC7 S; 1X4F A; 4ZCL A; 1NO8 A; 5A0Y B; 2ROE A; 3NNC A; 2DGV A; 2JH3 A; 3CD5 A; 2MGZ A; 4CH7 A; 2K8G A; 2CVE A; 2ZNY A; 4HI2 A; 5T41 A; 4XDD A; 4FPR A; 3KMQ A; 3N5B A; 2QV6 A; 4YDD B; 3TRG A; 3M2R B; 4LRA A; 1WWH A; 1BD6 A; 1GXL A; 4P52 A; 3I96 A; 4ZPC A; 5KFH A; 4YME A; 1ZTT A; 3J7Z T; 3DOL A; 2ZNZ A; 4DPY A; 2B7B B; 3JAM U; 2CPF A; 2ZE2 A; 1ELO A; 2BR0 A; 4ZPW R; 3GV5 B; 2BAN A; 4OYA A; 3ET6 A; 2QL9 B; 4X62 J; 4CLZ A; 2IYI A; 3TAR A; 4U7U K; 1U6F A; 1UW4 A; 1L3U A; 4I0W A; 2V4J B; 5KT5 A; 1X9W A; 2W01 A; 1H6K X; 3K8W A; 3HMJ G; 4NXN F; 1WF1 A; 1HWI A; 4FF3 A; 1FF2 A; 3WIU A; 2OMO A; 3C6T B; 1L5U A; 1T11 A; 1O0P A; 5C25 B; 4ZVT B; 1W25 A; 3JTP A; 5RUB A; 2G4B A; 1BC6 A; 3KJV A; 2IC3 B; 4DLE A; 3MCO A; 4MYT A; 3Q2T C; 4FPI A; 2V68 A; 1KD1 T; 4RUC A; 4C3M A; 3LP0 B; 2KB2 A; 3UR3 C; 2N3L A; 1VQO S; 4GKJ F; 3CSK A; 2E5J A; 2GGP B; 3H20 A; 2NXC A; 3UDE A; 5DG9 A; 2C2M B; 4LQ3 A; 1S0V A; 5E0O A; 1RXO B; 3MR6 A; 2KFN A; 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1FXR A; 4NOH A; 4P6Q A; 2FVS A; 4NXM F; 1Z1Z A; 2RS2 A; 1RWV B; 2HPU A; 1K73 T; 1RAH B; 2C3U A; 3C6U A; 3BPD A; 4OX7 A; 1JLC B; 4QYR A; 5CZX A; 4USK A; 1HR0 J; 1PAU B; 1EIY B; 2W9C B; 4URG A; 4QOT A; 1U1R A; 4YY3 J; 1CC8 A; 3SXL A; 3US5 A; 2RF2 B; 1N33 J; 4QWE A; 4E8U A; 2Y8W A; 2MY8 A; 2QO3 A; 1MML A; 4WE1 A; 3OR2 A; 3NCP A; 1RU1 A; 1RTJ B; 2F65 A; 3BBC A; 3S7R A; 3PJW A; 4LF5 F; 2DYA A; 3J80 U; 4NEY A; 1EAY C; 1APS A; 2N4D A; 1IR2 A; 1QAJ A; 1MG7 A; 2ZH6 A; 4IG0 B; 4DZD A; 5D4P A; 1SV5 B; 3R6L B; 1S4E A; 4CT8 A; 2F4V J; 3M2R A; 2V4Q A; 2KRB A; 2CJ9 A; 2G1D A; 3GU0 A; 4OHX A; 3GG0 A; 1F1B B; 2C2D A; 1UAW A; 2HBR B; 2HWH A; 4C9D A; 2NQP A; 4RBV A; 1NEE A; 3NKY A; 2JFD A; 4JYA J; 4QWD A; 1N34 J; 3LWM A; 3D6M B; 4URS A; 2ASJ A; 3EWG A; 2W9A A; 4WXW A; 1HD0 A; 5LSL A; 2PII A; 2CPI A; 1RWM B; 2IBK A; 2HVZ A; 3QT8 A; 2VKZ G; 2IJF A; 2PEH A; 3GWC A; 2V2V A; 3NS6 A; 2H54 B; 1WSV A; 3VGT A; 1X4G A; 1G2E A; 1TKX B; 2B6A A; 2ZBQ A; 1GMU A; 1ZM9 A; 4B9N A; 2RAQ A; 2MQN A; 3T3F A; 4C0B A; 4ETZ A; 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