The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
CASPASE-3 SUBUNIT P17
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| publication title |
In Silico Identification and Crystal Structure Validation of Caspase-3 Inhibitors without a P1 Aspartic Acid Moiety.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2010-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ICE B; 3KJF B; 3RJM B; 2HBQ B; 3EDR B; 2QLF B; 1RWK B; 2QLB B; 4LSZ B; 3GJQ B; 4ZVR B; 5IC4 B; 2CNL B; 3R5J B; 4ZVO B; 3R6G B; 2C1E B; 1RHU B; 2H5I B; 1PYO B; 3SIP B; 3IBF B; 2P2C B; 1RHK B; 1RWM B; 1I51 B; 3QNW B; 1RWX B; 2CJY B; 2CNN B; 2DKO B; 3IBC B; 2H4W B; 4ZVS B; 2Y0B B; 1PAU B; 2HBR B; 3KJQ B; 3KJN B; 1RWN B; 2XYH B; 1SC1 B; 2C2Z B; 2CDR B; 1QDU B; 1I3O B; 2QL5 B; 1RWP B; 3D6F B; 2H48 B; 3NS7 B; 2CNK B; 1SC4 B; 2QL7 B; 1RHR B; 1RWV B; 4JB8 B; 2H4Y B; 3P4U B; 1RWW B; 2CJX B; 2H51 B; 4ZVQ B; 2CNO B; 3D6H B; 2QLJ B; 1F9E B; 3GJS B; 1GFW B; 4ZVT B; 2HBY B; 2H54 B; 1QTN B; 4ZVP B; 2FQQ B; 2XZD B; 4ZVU B; 2C2K B; 2C2M B; 1RHJ B; 2XZT B; 2C2O B; 3GJT B; 1SC3 B; 3EDQ B; 1RWO B; 3P45 B; 3R7S B; 1NME B; 4DCJ B; 5K20 B; 2HBZ B; 5IC6 B; 1BMQ B; 1RHM B; 2QL9 B; 2H5J B; 3D6M B; 4DCO B; 1RE1 B; 3R7B B; 4DCP B; 1IBC B; 2Y1L B; 2XYG B; 3GJR B; 2XYP B; 2H65 B; 3R6L B; 3R7N B; 1RHQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4H4O A; 3MMB A; 3EIC A; 5HP1 A; 4OYB A; 4RW8 A; 5EWF A; 4LRB A; 2CA9 A; 2IYI A; 3UCU P; 3CCM S; 1RT6 B; 4NLO A; 1WG4 A; 4K0K F; 2AT1 B; 4CWB A; 4F26 A; 4TNO A; 4WIQ A; 1U1L A; 3OJS A; 4AL5 A; 4N47 A; 1JKH A; 2FVQ A; 3ET6 A; 5LMN J; 3LOU A; 5KFR A; 1HNZ F; 3HHN B; 3WC0 A; 4FBU A; 1FWP A; 4HEA 9; 4RW4 A; 1EJ7 L; 1ZAV A; 4B9S A; 3PO5 A; 1FX2 A; 1TAU A; 1EB0 A; 2ZBP A; 4JI3 F; 5HVF A; 1PBU A; 3CJ4 A; 1WG5 A; 3HVA A; 2H54 B; 2KFZ A; 4O44 B; 1KHW A; 3TP2 A; 1TMJ A; 4F4X A; 3R5G A; 5IT9 U; 3GIJ A; 3JS9 A; 4OJH A; 1FVQ A; 4ZN1 A; 2OI2 A; 1LV5 A; 1R8P A; 3CJ8 A; 1FRK A; 1X5S A; 4O0N A; 3RRG A; 4Y2M A; 1F3F A; 3R27 A; 1UW4 A; 3T9Z A; 5LXY A; 2H5E A; 1C0T B; 3RAM A; 5H9F J; 3WDO A; 1YJW S; 3SMZ A; 3OPK A; 5HBM A; 4PZV A; 4LFB F; 2H5I B; 2LQJ A; 3E2E A; 3EE3 A; 5F8L A; 1YJN S; 1YBA A; 3ILJ A; 5KFC A; 2P6S A; 2HHW A; 3TZW A; 2MMY A; 3MR5 A; 3IS9 A; 2W2Q P; 4I2Q B; 1XN9 A; 4Z37 A; 2BR0 A; 2K8G A; 2WOM B; 4LF7 J; 1SH3 A; 3LP1 A; 4PAA A; 3IAM 9; 2HLT A; 4O4R A; 1ARO P; 4AD6 A; 4DFJ A; 1K1Q A; 2RNE A; 1DUR A; 2Q43 A; 2YH0 A; 3K0J A; 5GMD A; 3CMQ A; 2XG8 A; 4ZVQ B; 1V6H A; 4FKY A; 1P8G A; 5I42 A; 2OKQ A; 5C42 B; 2ZC4 A; 4LBI A; 1SI9 A; 1TFW A; 4CO2 A; 3QRR A; 3W8G A; 4JI2 J; 1GTH A; 2QLX A; 3H8Y A; 3GFX A; 2ZH4 A; 3HSJ A; 1ZPV A; 4K4U A; 1RAO A; 2W9C B; 2FPH X; 3I32 A; 4EO6 A; 3J80 U; 5KFW A; 4QQB A; 5KFX A; 2OFG X; 2RF2 B; 2ATC B; 2XLI A; 2FLL A; 1XJW B; 1U02 A; 5LMU J; 3LPE A; 1N5Q A; 2LCW A; 1B4S A; 1KLM A; 2HQF A; 5FDL B; 4KC5 A; 1IKW A; 3DLB A; 4AQY J; 3MCM A; 3PAC A; 3CME S; 3BPS P; 3KMS A; 1VQM S; 1GNK A; 4OZ1 A; 4J90 A; 1UZD A; 4H4M A; 3CJS A; 3L7U A; 2I0X A; 1UAW A; 4NA3 A; 3K17 A; 4NCG B; 1T8E A; 4TVA B; 2VIH A; 1C2P A; 2EVZ A; 2VQF J; 3K5N A; 2KM8 B; 2AP6 A; 4I69 A; 1DHM A; 3CDW A; 1LEO A; 2J76 E; 3JSR A; 2MLZ A; 1Y7P A; 1SQE A; 3H20 A; 3L4B C; 1R3N A; 2DT9 A; 3THT A; 3HXM A; 2C2M B; 2CAJ A; 3N5F A; 3K58 A; 3V6D A; 4V19 J; 3M6U A; 3BN4 A; 4ZCL A; 5HLF B; 4F0H A; 5L38 A; 4ZA1 A; 1EKR A; 1MWQ A; 1U24 A; 4ZP8 A; 3G9C A; 4MT1 A; 2NPF A; 1FRX A; 3OHA A; 1YSJ A; 2BRK A; 3WC2 A; 3SQG B; 3MPY A; 3SI8 A; 5LMU F; 2HNY B; 1QSS A; 2GGP B; 5IC4 B; 5ETK A; 3MUV P; 1YRU A; 4P72 A; 2F63 A; 3VR1 A; 1LWF A; 1HQU A; 4N7T A; 4AQY F; 2P5V A; 2HUR A; 2UXC J; 1IWA A; 2WVF A; 1ZTT A; 3CVK A; 3ZZ0 A; 4KTQ A; 1G4C A; 2OTJ S; 3BO3 A; 2YQ1 A; 1S57 A; 5KT7 A; 1U8S A; 3HVT B; 4M63 A; 3N6L A; 2VV5 A; 2VQF F; 2ZVS A; 1KNZ A; 1M5P C; 2UVV A; 4Q2M A; 1XQI A; 4JUZ A; 1FD2 A; 3DHW C; 5CXT A; 5I3Q A; 3ZXW A; 3L9Z A; 3W2V A; 2DNH A; 2MKC A; 2MKH A; 4JP8 A; 4CT8 A; 2P9E A; 2YNI B; 2F9D A; 3EWG A; 4RW9 B; 1LNQ A; 4ZLJ A; 1IBC B; 4FF2 A; 1HFE L; 5EHH A; 3W7B A; 2KO1 A; 2J6S A; 5E3R A; 1Z1Z A; 3BSN A; 1A9N B; 4NLG A; 2KN4 A; 3QMQ A; 4URG A; 3BRE A; 4KH0 B; 2I5J A; 1HNW F; 2QRR A; 1S48 A; 4LF8 F; 1JJ4 A; 5CYQ B; 3D0G E; 3M2R B; 2F7V A; 1U47 A; 1B3T A; 4ID8 A; 2V4J B; 1U26 A; 2UXC F; 5E2Q A; 3IG1 A; 4F4W A; 1PSD A; 1BUX A; 2Y0B B; 4NA2 A; 4GKJ J; 4EBE A; 2OGU A; 3MR6 A; 3RAX A; 1HBN B; 5CZX A; 1WEL A; 2VG7 A; 2H4Y B; 3TO8 A; 2CPI A; 5M2U A; 2WVE A; 5DRK A; 2HZV A; 2BE7 D; 3MEG B; 3TAM B; 1XR5 A; 1VQ5 S; 1K1S A; 4X4N A; 4O3O A; 3JSY A; 2V2Q A; 2DR5 A; 2Y9H A; 5GAD I; 3CIZ A; 4V19 X; 1ZZN A; 1X4D A; 1M0S A; 3BZQ A; 4OIX A; 2YKN A; 3QLH B; 3QIP A; 3KMQ A; 4YR0 A; 1X9W A; 3SCI E; 4F0M A; 1HBO A; 4PPZ A; 3BO2 A; 3KTQ A; 3GFY A; 2D3O 1; 2R7U A; 5AXM A; 2G1H A; 4K7Q A; 3MOZ A; 2CAD A; 3TRG A; 2B3T B; 1GH8 A; 2QZ8 A; 4WXW A; 3IXQ A; 1TP7 A; 2VOD A; 2PMW A; 3NWG A; 3QT6 A; 3R1L A; 4RU9 A; 1YJU A; 3PJ9 A; 3HHE A; 1FRL A; 1UJ4 A; 2C3Y A; 2BE2 B; 4GKJ F; 2CJK A; 4HL9 A; 5C25 A; 1Y5L B; 4PEO A; 4LMZ A; 2DNQ A; 4R8U B; 4UZC A; 4RW6 B; 3B54 A; 3N5B A; 1F9H A; 4NCB A; 4BWJ A; 3W5X A; 2B7B B; 5IQ6 A; 3D3B J; 5HL7 Q; 4MKV A; 3CGI A; 5LM7 E; 1Q53 A; 4JI4 J; 1TL7 B; 2AEJ A; 4R0J A; 3MEC B; 5B0A A; 4LRD A; 4GMK A; 1BMQ B; 1JXE A; 2M0G B; 3ISN C; 4FYX B; 4IH7 A; 3AQO A; 3OFF A; 2HMI A; 1X5O A; 4KRW A; 1QUP A; 3NGU A; 3I0S B; 1FE4 A; 2M8H A; 4DZ6 A; 2ZKU A; 1WTF A; 3CE8 A; 3HSZ A; 4J9K A; 3DRP B; 3AY0 A; 1T9V A; 2DNO A; 3BSA A; 3M05 A; 1Y0H A; 5A8R A; 3J81 Y; 1VQN S; 3TQE A; 1EET B; 4GKK J; 4M5D A; 2LDI A; 3HKZ D; 2CJA A; 1H2V Z; 4MFB B; 4DX8 H; 3NMA A; 2M9K A; 5U47 A; 3KLV A; 1X7V A; 1ZBT A; 2YNG B; 3A4T A; 3ZTS A; 2WRM A; 2VPZ B; 4F7V A; 3TX0 A; 3ZTQ A; 2CJX B; 5KFE A; 1S59 A; 4WFZ A; 3GJS B; 2F65 A; 2ZDP A; 2GHP A; 4JI4 F; 3ZZT A; 3O8W A; 2AIR B; 2N4C A; 2V4R A; 1NJI T; 1ZM3 A; 4OV1 A; 5KT2 A; 3MM9 A; 2DH7 A; 2HFU A; 4CLZ A; 3US5 A; 1U6F A; 5K9F A; 1VC6 A; 2FVC A; 4V1A k; 2RJZ A; 4UOC A; 3OXF A; 4Y28 C; 4RNN A; 5D0H A; 2WBM A; 3BF4 A; 4NL5 A; 1PC5 A; 1SJQ A; 1EQ0 A; 2ADC A; 1Q8I A; 4CLP A; 3D1O A; 2CQI A; 2NRE A; 1WC3 A; 1DY3 A; 2ZUA A; 3SCK E; 2B4O A; 1S72 S; 2YPZ A; 2KM8 C; 4GKK F; 2HFV A; 1JNZ B; 2JHE A; 2OAU A; 1SVD A; 3UW1 A; 4O44 A; 2E29 A; 1S6Q A; 2F40 A; 4LQ3 A; 3S8S A; 4LR7 A; 1U48 A; 2XUL A; 3UDV A; 1W7W A; 5H9E K; 4P74 A; 2MKY A; 3F44 A; 1MWY A; 2CRL A; 3HX9 A; 3IR5 B; 4X65 J; 4K50 A; 2Y1I A; 3CD0 A; 5E3C A; 4LF5 J; 2UU9 J; 1VQ6 S; 3CD7 A; 1C0T A; 2ERR A; 3DGP B; 5G0R A; 1IUJ A; 4IOB A; 3RYL A; 1DTT A; 4HDG A; 3N28 A; 4ZKA A; 5GAH U; 2VG5 B; 3ZZO A; 2ZJQ Q; 1EAR A; 1BQN A; 4UT4 A; 3HCX A; 3MHY A; 3DLK B; 2JDJ A; 5KFT A; 2CYY A; 3R7N B; 3ZZZ A; 4U6P A; 3M30 B; 3O6Q A; 2BJ8 A; 3V4I B; 3A3P B; 3HZE A; 1NK9 A; 1NK6 A; 2Y0S D; 4NZ0 A; 2Z56 B; 3PRV A; 4FS2 A; 3DRX A; 4WFX A; 3T19 A; 2OEM A; 2HHU A; 2CNL B; 1ZM4 A; 3W3S A; 2KJW A; 4ZPT R; 1VQK S; 4LBH A; 1CQN A; 4PXC A; 4TU7 A; 2LKZ A; 5F8M A; 5B7W A; 5F8G A; 2HVI A; 2M70 A; 4K59 A; 2QFI A; 4DSL A; 2BJ9 A; 1Y10 A; 4X65 F; 4YY3 J; 2XZW A; 2MQO A; 2W9C A; 1RAJ A; 2YNF A; 3OR2 A; 4LF5 F; 2UU9 F; 1UVM A; 1U4B A; 3M4X A; 1KOH A; 3QAE A; 2RF2 A; 4ZCI A; 1B99 A; 2PFF B; 4Q5V A; 4QOT A; 1OO0 B; 5FDL A; 4ZN3 A; 3FVY A; 2LXI A; 3ZNJ 1; 3SSR A; 4DV1 J; 2RD5 C; 2CQB A; 4ELV A; 2DBB A; 1UA1 A; 3KLI B; 3RR7 A; 2HND A; 2KXN B; 5D4N A; 5CYM B; 3VAM A; 2FZG B; 3VTI A; 3KK2 A; 1EP4 A; 3BSC A; 1X8D A; 1DFD A; 2QLF B; 2R7T A; 2ZH6 A; 4DSK A; 4DUZ J; 3BBB A; 4Y0F A; 1HYS B; 4ZLP A; 3HHL B; 1B7Y B; 2XGQ A; 5D4O A; 2BOP A; 1S4F A; 2B9X A; 3BGL A; 1Q82 T; 1G7C B; 5DG8 A; 4USU A; 3CW2 C; 2RHS B; 4YY3 F; 3V81 A; 4A8K A; 4NLU A; 3D9B A; 2X1G A; 2EW9 A; 5BJR A; 5JUM A; 3EXC X; 1U0S A; 2IVM A; 3CED A; 3MTK A; 1RU2 A; 1LFW A; 3PRD A; 2HFN A; 4KIA A; 2E5J A; 4FP9 A; 3ONQ A; 1S0O A; 2IMO A; 3MM6 B; 4UF4 A; 2F4V J; 1HHQ A; 2B4P A; 2LLZ A; 2XMK A; 2ZFH A; 2MQN A; 2EFQ A; 3UN3 A; 4DV1 F; 4L72 B; 1KTV A; 3TZZ A; 4CO3 A; 3D6M B; 2CWX A; 4MH8 A; 4OZ3 A; 2W8L A; 4OV6 A; 2J5A A; 2HK3 A; 3D0I E; 2QSW A; 3T1H F; 4C7Q A; 1WSR A; 4LQ9 A; 4DV2 F; 2C3P A; 1WC1 A; 5FLX Y; 2O66 A; 4G65 A; 1XNR J; 2GCF A; 2PA3 A; 1S7H A; 2GA7 A; 4EWT A; 3WQP A; 3P6Y C; 3HT3 A; 1UVL A; 1VBK A; 2YNI A; 1UP1 A; 3Q8Y A; 1IM6 A; 3GCW P; 4XPC A; 3HP6 A; 2MQM A; 4XDD A; 1QE1 A; 4WF9 Q; 3VGV A; 3AXK A; 2ROG A; 1T9W A; 4S0M A; 4M5N A; 1SL2 A; 2MQ8 A; 4J9N A; 5HAN A; 3T5K A; 4K4T A; 2DNL A; 3D3C J; 1VK8 A; 3TVY A; 2KT5 A; 1PBA A; 2FQQ B; 3R5B A; 2ZH9 A; 2EBG A; 3SDE A; 5CYQ A; 1HNV B; 2C2O B; 3TAQ A; 2V4J A; 3K5P A; 2XMT A; 1X0F A; 2OH2 A; 1VLY A; 5DGA A; 2HYI B; 2KRR A; 3UPF A; 4W90 B; 2CG4 A; 3R6L B; 5HMW A; 3KJF B; 2R8G A; 2BAN B; 4GO7 X; 3ZZR A; 3D68 A; 1UVI A; 2KG0 A; 3C14 A; 3HI9 A; 2XHC A; 5FII A; 3UCZ P; 3RB4 A; 4OFZ A; 4EI2 A; 4IQM A; 1S10 A; 1T9Y A; 3MEG A; 3SIP B; 4EUV A; 3GTY X; 4LR8 A; 2NZ4 A; 1SJ4 P; 2FYX A; 2AYM A; 2OPP B; 1S77 D; 4Q0B B; 1DTQ B; 2FLN A; 4TLR A; 3TZX A; 2BQR A; 3C6T B; 4DOZ A; 1CS4 A; 2KFY A; 2Q79 A; 2B6A B; 2E1P A; 1R8H A; 1VRU B; 1LWX A; 4L73 A; 3PZP A; 1WI6 A; 2HIQ A; 4OYO A; 3RBX A; 3G6Y A; 3F41 A; 1OS5 A; 4QPX A; 4DEZ A; 1JLQ B; 4CLY A; 3CJK B; 2DNZ A; 1S1W B; 4B3R J; 3VVU A; 4MK9 A; 3JQK A; 3QSY B; 1T03 A; 2NSB A; 3E01 A; 1Q5V A; 5KT5 A; 4RUC A; 4LT6 A; 4J5O A; 2PMH A; 4QR2 A; 5ETT A; 2BE2 A; 1Q81 T; 4RUH A; 3T1Y J; 1R43 A; 2DGQ A; 4ILM A; 1K44 A; 4DPY A; 1RHQ B; 4JV1 A; 3CJR A; 2MYF A; 4R8U A; 3QT8 A; 3W9J A; 3GYN A; 1FRM A; 3EPI A; 3CDB A; 1N32 J; 4HT7 A; 2JLG A; 3M32 A; 5HAT A; 1F0X A; 4DSI A; 4Q2L A; 1FRI A; 1VQS A; 2YWG A; 1RDR A; 3EZ5 A; 2XBP A; 1OQ3 A; 1N6Q A; 1RWX B; 4OI4 A; 4WZM A; 2LQ9 A; 2PI5 A; 3DMJ B; 3ISN D; 4M5M A; 2BJ1 A; 2XEX A; 3IR7 B; 3QAU A; 2Z2L A; 3GR0 A; 4WWS A; 1RIS A; 3TJ8 A; 2JH3 A; 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