The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
In Silico Identification and Crystal Structure Validation of Caspase-3 Inhibitors without a P1 Aspartic Acid Moiety.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
CASPASE-3 SUBUNIT P17
|
| total genus |
18
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2010-11-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EDQ B; 4ZVO B; 1SC3 B; 1RHK B; 3D6F B; 4ZVR B; 2DKO B; 2QLB B; 2H65 B; 3R6L B; 1RWP B; 3GJS B; 4DCO B; 3GJQ B; 2QL7 B; 2H5I B; 2C2Z B; 2QLF B; 2Y0B B; 3R5J B; 4ZVP B; 2P2C B; 4ZVU B; 2H48 B; 2HBR B; 1RWK B; 1RWV B; 2FQQ B; 3EDR B; 2HBQ B; 2CNL B; 1SC4 B; 2C2K B; 3KJQ B; 3R7N B; 3GJT B; 2CJY B; 1QDU B; 1PYO B; 3R7S B; 2XYG B; 2XYH B; 2QL5 B; 1F9E B; 3IBF B; 2HBZ B; 2XZT B; 1I3O B; 3GJR B; 2CJX B; 1RWX B; 3D6H B; 1SC1 B; 1IBC B; 3P45 B; 4DCJ B; 3P4U B; 1QTN B; 1RE1 B; 2XYP B; 2H5J B; 2H51 B; 2HBY B; 3SIP B; 3IBC B; 3R6G B; 3KJN B; 2C2M B; 2QLJ B; 3QNW B; 2CNN B; 2XZD B; 1RHU B; 2C2O B; 1RHQ B; 3D6M B; 2QL9 B; 3KJF B; 1RWO B; 1RHR B; 2H4Y B; 1RHJ B; 2Y1L B; 2C1E B; 4LSZ B; 1RWN B; 2CDR B; 2CNK B; 1PAU B; 4ZVQ B; 3RJM B; 5IC6 B; 5IC4 B; 1I51 B; 1RWW B; 2CNO B; 3R7B B; 1BMQ B; 4ZVT B; 2H4W B; 1RWM B; 4JB8 B; 4DCP B; 1ICE B; 1RHM B; 1GFW B; 4ZVS B; 2H54 B; 5K20 B; 1NME B; 3NS7 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RU2 A; 3NL0 A; 3OXL A; 1WI6 A; 3EDQ B; 3T1Y J; 1EIY B; 1FT8 A; 3GJQ B; 2U1A A; 4ECW A; 2NXC A; 5AXK A; 2K3K A; 4WXO A; 1VC0 A; 1HNI B; 3MCS A; 3BSO A; 2ZOG A; 3IR6 B; 1XMO F; 2XI3 A; 1UVJ A; 1QUP A; 2XYH B; 2EFV A; 1KTV A; 4O44 B; 3PEH A; 1GNK A; 1TK5 A; 3M2V A; 3KDN A; 3SXL A; 3V6K A; 2AYG A; 3P5T L; 5HVF A; 3U1N A; 3J7Z 5; 2UUB J; 1N56 A; 1G7C B; 2HHU A; 1FHT A; 2I9S A; 4NLU A; 1RWO B; 1LOU A; 2HHQ A; 3FVY A; 3ZFV A; 5KFW A; 2C1E B; 3I6P A; 3PW2 A; 2HFV A; 4B3T F; 2QTW A; 4U9R A; 4DV3 J; 4J9Q A; 3JYT A; 5KG2 A; 5HRO B; 3SDE B; 3VGU A; 1BWE A; 2MHE A; 1URR A; 2QV6 A; 4C97 A; 1VRU A; 3TX8 A; 4RUA A; 4O0N A; 5LXR A; 3PEJ A; 3TAN A; 5GAH U; 2OLW A; 3ZTR A; 4OX7 A; 3UCG A; 1Y00 A; 4I2Q B; 3W8G A; 3IM9 A; 3VQS A; 1P1L A; 1VQS A; 3F44 A; 2JHE A; 3EVM A; 3ISN D; 4ZCL A; 1RYS A; 4OYM A; 3GII A; 4AFF A; 3UVJ B; 1S0N A; 3QGP A; 2ATL A; 4ZP7 A; 3TVK A; 4ED0 A; 4H4M A; 2V8G A; 1E6V B; 1H73 A; 2NCK L; 7AT1 B; 1XWL A; 2JC1 A; 2K2P A; 1YK9 A; 2RML A; 2Y9H A; 2L48 A; 1S7I A; 4BWJ A; 4LSN A; 4RJV A; 1UAW A; 4DX6 A; 1VK8 A; 5HAN A; 1LXJ A; 4NMX A; 1N5S A; 1YVF A; 4YB1 P; 2AYM A; 2X3D A; 3JSY A; 4ZLN A; 3MFI A; 2JX2 A; 3M2U A; 1NB7 A; 4KGV B; 3N6L A; 3BJY A; 4WJB A; 1HBO B; 1SPB P; 5IQQ A; 1U0S A; 4F8R A; 2HFZ A; 3OR2 A; 3U27 A; 4ZPT R; 3JSM A; 3VAF A; 4H4O A; 3OJU A; 1VIX A; 3RU0 A; 4K5R A; 3G2X A; 2RH3 A; 3I0R B; 2BM1 A; 1VRU B; 2CA9 A; 2VJV A; 2VC0 A; 4QR1 A; 2RDJ A; 3QSY B; 2IPO B; 4WP9 A; 2IM0 A; 2A6M A; 2DHG A; 2Q1L A; 2CPD A; 3TZX A; 3PO4 A; 2PSZ A; 3AD8 C; 3PX6 A; 4IO1 A; 2UXD F; 1UFW A; 4K4Y A; 1UFL A; 3SQO P; 5HI7 A; 4MKV A; 1B0V A; 1VQ7 S; 2CPI A; 4ZIV A; 3MM7 B; 4HHU A; 4IRK A; 3C19 A; 3KJV B; 2V8D A; 2BJ9 A; 1FJG F; 4NLX A; 3DU6 A; 2VDI A; 2JH3 A; 4DR7 J; 3NCR A; 5J2N B; 4HLB A; 5HBM A; 1FXR A; 3Q89 A; 3US5 A; 3C14 B; 2MQM A; 4Y2I A; 1U8W A; 1U1P A; 2VBZ A; 4TXS A; 3TX0 A; 3OR2 B; 2MLY A; 3JSM B; 2LXU A; 5LSR A; 4PXE A; 3H4D A; 4WFX A; 1PJ5 A; 5B0E A; 3OR1 B; 4P72 A; 3RYL A; 1NK6 A; 4H54 A; 5U47 A; 3PVX A; 2FQQ B; 1UJ5 A; 3HT0 A; 3HDS A; 4HR2 A; 1TFY A; 1JLQ B; 1MRO A; 1T05 A; 3J7A 1; 2BE2 A; 4A46 A; 4AUK A; 2K8G A; 1TAQ A; 2CJY B; 2DIU A; 3DLK B; 2GGP A; 4DR5 J; 3DLB A; 5L1J A; 1KVI A; 2DEI A; 3JTO A; 4CH1 A; 2HS0 A; 3KK2 B; 4YDD B; 1X5T A; 2HKE A; 4FF2 A; 3LAN A; 2I5J A; 1FDD A; 3KDO A; 4G65 A; 4IOB A; 2KJV A; 1SIZ A; 1D1U A; 2QLJ B; 3W63 A; 2C28 A; 2X1A A; 4OZ0 A; 4DL5 A; 3R5D A; 1YGY A; 2XTJ P; 5LL6 d; 4ES2 A; 1W26 A; 3M8Z A; 2RF2 B; 3GTY X; 1RB0 A; 3CCL S; 1BQN B; 2UZA A; 2CZV C; 2DEJ A; 4OLO A; 3QJJ A; 4HTJ A; 3OFG A; 4OI1 A; 4CO0 A; 2YBV A; 3CCZ A; 3CUL A; 4WKY A; 2G2Z A; 2FJW A; 2UVU A; 4J9L A; 1S6U A; 2WSE C; 2JFK A; 1SIW B; 1BHN A; 3C6T A; 3NBP B; 1EKS A; 4PEO A; 2VFV A; 1D0E A; 3VF0 B; 2GZO A; 1T9V A; 1U8S A; 2F7V A; 4P75 A; 3DGV A; 2HHT A; 3OTE A; 5ETQ A; 1S97 A; 4ECZ A; 5EDW A; 3MM5 B; 3F73 A; 2UP1 A; 1QLN A; 1FJE B; 2F5G A; 4QWE A; 4ECV A; 1U1O A; 2BE2 B; 4P10 A; 3LQV A; 1HBM A; 4G1Q A; 4OJ3 A; 2GGP B; 4CLS A; 2G1H A; 4X65 F; 4KR0 B; 5F8I A; 4I2P A; 2OEJ A; 1HQU A; 3MAH A; 2Z2Z A; 1F9H A; 5KFE A; 5DGA A; 2J6T A; 1MG7 A; 2O3D A; 5T7L B; 4L3K A; 3HZE A; 3HFZ B; 5HVH A; 3T1Y F; 1RTJ A; 1YLX A; 3MMJ A; 2CNK B; 2EI5 A; 2OUG A; 5KFY A; 4B3S J; 3Q2S C; 2BR0 A; 2BRL A; 2B56 A; 5KT6 A; 5ADZ A; 3IXQ A; 4DV1 J; 4B3M J; 2IVY A; 4DN0 A; 1GK8 A; 2KDO A; 3QPI A; 5KT2 A; 1S0V A; 1OJ4 A; 4M5L A; 6FDR A; 2CIM A; 5KFZ A; 2ASD A; 4CM2 A; 3UNG C; 4IUF A; 2DR5 A; 3C6T B; 4FBT A; 2KYZ A; 2PFF B; 3FZ2 A; 3BDE A; 3BB5 A; 2N82 B; 4ICL A; 3C66 A; 4GVL A; 5KFX A; 3M9N B; 1RA7 A; 2XMT A; 1ITP A; 4M5G A; 2ZKT A; 5KG1 A; 4F4Z A; 2RU9 A; 5EUH A; 2QMU B; 4OZ3 A; 1A9N B; 1HBM B; 3BO3 A; 4G1Q B; 1BC6 A; 2MEW A; 1A0O B; 3GG1 A; 1TEL A; 2RKI B; 1F5B A; 1WC0 A; 1QAI A; 3FEX B; 4I2P B; 2GHV C; 3OVS A; 1N54 B; 1FRX A; 1HQU B; 3TQE A; 2OEM A; 1GTE A; 3M32 B; 3WBZ A; 2W8L A; 4EMD A; 2WZ1 A; 4OL8 A; 4CO5 A; 2ZJR Q; 4P2F A; 4Q45 A; 1REG X; 1RTJ B; 3KLH B; 2EBG A; 3CJ2 A; 3KFW X; 5K8N A; 5CAB A; 3NS7 B; 4BDP A; 1HQ2 A; 2EG2 A; 2CPH A; 4BLG A; 4UT4 A; 1EQ0 A; 1VR6 A; 3A13 A; 3H59 A; 3P5B P; 5A8K B; 2DY9 A; 5E0O A; 3O6Q A; 4DR6 J; 4N76 A; 3VAH A; 3MMC A; 1IKV B; 3ZNJ 1; 3PNI A; 3KK1 A; 3I5C A; 3KUG A; 2MZ1 A; 3IN5 A; 4W90 B; 2ZVS A; 4GMK A; 5F8L A; 2YKN A; 4ICL B; 1KKH A; 1CC8 A; 1FRH A; 3NGR A; 1AXQ A; 1RK8 A; 2IYG A; 1HQE A; 4RLE A; 1R0A A; 2H5J B; 1VBK A; 4USW A; 1SI9 A; 4MJK A; 2EG1 A; 2MZR A; 1G6B A; 2J9D E; 1HNW F; 4M5M A; 3CD5 A; 1S6Q B; 2Y8Y A; 2B3T B; 4QYZ K; 4ANE A; 3IS9 A; 4PAA A; 1T3O A; 1S0M A; 3HX9 A; 2AV5 A; 4DV2 J; 2V5H G; 1KON A; 4M5H A; 3ENV A; 4Q44 A; 1VQL S; 2KT5 A; 2XNQ A; 3MM9 A; 4IYQ A; 4JBC A; 1RT4 A; 1WF0 A; 1JLB A; 1JLA B; 4LSL B; 5LMU J; 4O4R A; 2H48 B; 1SKU B; 3BV8 A; 1CC7 A; 2W2O P; 3CED A; 4RZR A; 4A8O A; 3KJQ B; 4N8N A; 1RAG B; 3UN5 A; 3LP0 A; 3KK1 B; 5KFC A; 1FDN A; 2VG6 A; 2YKM B; 3UDE A; 3MM6 A; 1QM9 A; 4DR7 F; 2QX0 A; 2YH0 A; 3LTO A; 3DRP A; 3EPG A; 1NM2 A; 3OL9 A; 1HQE B; 4WE1 A; 3NEK A; 1WOO A; 3M8Q A; 3MR7 A; 1ZH5 A; 3RAQ A; 1ROF A; 2B8P A; 5F41 A; 1AUS L; 1RAC B; 3K5P A; 4URG A; 2DR9 A; 1GX5 A; 3KXD A; 4O23 A; 3GQC A; 3V6D A; 4CO4 A; 3Q22 A; 4C8L A; 1XMB A; 3MTJ A; 5L39 A; 4HEA 9; 1UPP A; 2Z0G A; 4OV6 A; 4ZVQ B; 5IC4 B; 3W65 A; 4WU2 A; 2C3O A; 3CC4 S; 3IS9 B; 1RT5 B; 1J5E J; 4AXI A; 2BAC A; 1LV5 A; 1WHV A; 4YOE A; 2QMW A; 1HPZ A; 1IM6 A; 1MSW D; 1JK9 B; 2IYI A; 1HNV A; 4C3M A; 3MM9 B; 4I4B A; 2W01 A; 1W7W A; 4CLT A; 1B0T A; 2VB6 A; 1RT4 B; 5FDL B; 4Z7C A; 3NGS A; 1CJV A; 1NK0 A; 5KG4 A; 4ILL A; 5CH7 B; 2W9C B; 4FZV A; 2ADB A; 4DI6 A; 2YWF A; 4FKX A; 3LGN A; 3QYY A; 1FTR A; 4RU2 A; 4YR3 A; 3RB0 A; 1FFS B; 2W24 A; 4XDC A; 1RJJ A; 3LP0 B; 1Q8I A; 2XWX A; 1NO8 A; 2VG6 B; 3M9M B; 4DMZ A; 3CTR A; 4EZ6 A; 8RUC A; 2C2R A; 4G3I A; 4K4W A; 1O5J A; 2V2K A; 4MMO A; 4NCB A; 1S1T A; 3S1T A; 2R8H A; 2GV1 A; 4TNO A; 5KFU A; 1VOM A; 1S9G A; 1NRK A; 1R6Y A; 1SKW A; 2EBE A; 3NAI A; 2H5E A; 4ECY A; 2FUG 9; 3ZZR A; 3VAK A; 4RWX A; 1KLN A; 4K4S A; 2CDR B; 1NEE A; 4WZM A; 2RHS B; 5ETM A; 4RNN A; 5EN1 A; 2ALY B; 3UWT A; 4DR1 J; 1ZAV A; 1U0H A; 3R5B A; 3UDC A; 3VQT A; 3TVZ A; 1RTZ A; 2BBE A; 2A3J A; 3E3X A; 4ZVO B; 1M90 T; 2M4M A; 4K4V A; 4YR0 A; 4ECR A; 2KKH A; 2BKP A; 4PUO A; 3N6M A; 3TUJ C; 1BWV A; 3GFX A; 1R8H A; 3HXM A; 4OI3 A; 1SBR A; 5H9F J; 5EWG A; 4ZLJ A; 2G9O A; 1YJU A; 1CJV B; 1CG2 A; 3ETM A; 1GX6 A; 1G3O A; 5CQG A; 3CWJ A; 3V5R A; 4RBT A; 1PAE X; 2DNN A; 3IRW P; 1JLE B; 1N88 A; 4P7V A; 4ED1 A; 3VAJ A; 5K8M A; 1TUW A; 5KAK A; 1X5P A; 1S1T B; 4LRE A; 1GH8 A; 4HH1 A; 1S1W A; 1XR5 A; 2VA3 A; 2MKY A; 9RUB A; 4B3M F; 2IM1 A; 3CT9 A; 1FCA A; 4U96 A; 4PXD A; 3NNC A; 5KFT A; 4FYV B; 5IC6 B; 2AJ2 A; 2JL9 A; 2R7S A; 1HBU B; 2XMK A; 4DU7 A; 3EUN A; 1X4F A; 2XY5 A; 2OH2 A; 2H3E B; 2ZM6 J; 1MLA A; 1DZ5 A; 2LA4 A; 1RT3 A; 3IC1 A; 2NUU G; 2VQE F; 2GFF A; 1U0H B; 3DLE A; 3BRE A; 1FRK A; 4C11 B; 4DUY F; 1APS A; 7FDR A; 2LQ5 A; 3D3B J; 4ZVH A; 2BAB A; 4WYL A; 5KFI A; 1FWL A; 4KO0 A; 4ZVU B; 1JLF B; 2VF3 A; 2C3M A; 1PYT A; 4PUO B; 1RT6 A; 1SQF A; 4U7C A; 3VVU A; 4EYH B; 3DI6 B; 4ELU A; 3VAM A; 1GMW D; 2LEB A; 3IBF B; 2IHR 1; 3I5A A; 4YFU A; 4J9R A; 3G6Y A; 1SL1 A; 3H8Y A; 1RGV A; 1EP4 A; 1N32 J; 2LEP A; 4V19 J; 4CLP A; 4ZCM A; 1WC6 A; 4UW2 A; 3DC2 A; 2D3U A; 5B0G A; 4LF7 J; 5IM0 A; 2W9A A; 2ZVI A; 3RB6 A; 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4EI2 A; 3FK4 A; 2IC3 B; 2AF6 A; 2E5J A; 5CYQ A; 1T9Y A; 1NSP A; 2WRM A; 5KFO A; 2ASJ A; 2CQH A; 2HND B; 3TP2 A; 2IAJ B; 4U67 Q; 1N5Y B; 4RNH A; 1I3O B; 2GVZ B; 5D4P A; 4DQI A; 1LWF A; 4EEY A; 2OPP B; 3HKZ D; 1NPK A; 1NCL A; 4YQW A; 1WHW A; 4X66 J; 1KLM B; 1TK8 A; 3GWC A; 2D7S A; 2VG5 B; 2XMJ A; 2ADC A; 4PPD A; 1VQ8 S; 3MMB A; 5DRK A; 4O4G A; 1I94 J; 4OX8 A; 2CVI A; 2WSC C; 3TAR A; 3K58 A; 3CJQ A; 3MCO A; 1N6Q A; 1X4B A; 4LIR A; 1IBM J; 3O1L A; 4Q5V A; 5EGY A; 4AL5 A; 3HP6 A; 1R43 A; 4DG1 B; 2CPY A; 1UA1 A; 3AOB A; 2HVD A; 4ZHR B; 5K14 A; 1GFW B; 1VGY A; 5KFL A; 4MYT A; 4QJV A; 2POK A; 2RQ4 A; 5HQL A; 2P6T A; 1T7P A; 5HSP A; 1H7X A; 3MEE A; 4KTQ A; 4RUC A; 1LW0 A; 2OSR A; 3EDR B; 3BGO P; 2KXH A; 1SXL A; 3GB0 A; 2NLW A; 2OEK A; 4DL0 C; 4CP5 A; 4OLP A; 2GVD A; 2YWK A; 1GMU A; 5A6W A; 4JI0 J; 1WDD A; 1REV B; 2LDI A; 4ZMM A; 2UXC J; 4X4R A; 1UWB B; 3NRB A; 4TYA A; 4H4K A; 3GE9 A; 3HJF A; 3W7B A; 4DR1 F; 1F3V A; 2CQD A; 2MQL A; 1V9O A; 3RBX A; 4EBD A; 4QW9 A; 1N8R T; 3QO9 A; 3MMB B; 4O4G B; 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