The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
94
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structure length |
94
|
Chain Sequence |
CHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/protein binding
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| molecule keywords |
CASPASE-3
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| publication title |
Caspase-3 in Complex with Darpin-3.4_I78S
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
17
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| structure length |
94
|
| sequence length |
94
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2010-11-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D6F B; 1RE1 B; 1PYO B; 2CNO B; 3GJR B; 3KJQ B; 2XZD B; 2P2C B; 2H65 B; 2CJX B; 4ZVR B; 1I3O B; 3EDQ B; 1RWO B; 3KJF B; 2C2O B; 4ZVP B; 3D6M B; 1QTN B; 1RHK B; 1ICE B; 1RWN B; 1SC3 B; 2DKO B; 1RHM B; 1GFW B; 2HBY B; 2QL7 B; 2C2M B; 2H48 B; 1RHJ B; 3R7B B; 1NME B; 1BMQ B; 2CJY B; 4DCJ B; 3R7N B; 1RHU B; 3R5J B; 2QLJ B; 2QL9 B; 2XYP B; 4ZVT B; 3P4U B; 2XZT B; 1RWK B; 2C2K B; 3GJT B; 1QDU B; 2XYH B; 2QLF B; 3NS7 B; 1RHR B; 5IC6 B; 3GJS B; 3KJN B; 1SC4 B; 2H5J B; 2CNL B; 2H51 B; 2CNN B; 2H54 B; 1RHQ B; 2C2Z B; 3P45 B; 1RWV B; 3IBC B; 1RWP B; 4DCO B; 1IBC B; 3D6H B; 4ZVU B; 2H5I B; 4ZVQ B; 1SC1 B; 4JB8 B; 4ZVS B; 1PAU B; 2FQQ B; 3GJQ B; 3R7S B; 3QNW B; 2C1E B; 4ZVO B; 3SIP B; 1RWW B; 5K20 B; 3R6L B; 2CDR B; 3RJM B; 5IC4 B; 2Y1L B; 3R6G B; 2QLB B; 1RWX B; 4DCP B; 2XYG B; 2HBR B; 3EDR B; 2HBQ B; 1F9E B; 1RWM B; 2CNK B; 2H4W B; 2H4Y B; 2HBZ B; 2QL5 B; 4LSZ B; 1I51 B; 3IBF B; 2Y0B B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YRX A; 2HWH A; 1S59 A; 2MQM A; 2NLW A; 3V6J A; 4AYB D; 2PI5 A; 2V5H G; 3OLB A; 5KG2 A; 1WG4 A; 2XMK A; 1QTN B; 2ZDP A; 4HEA 9; 5L8R C; 2XWX A; 4NXM F; 7FD1 A; 4BBY A; 1REV B; 4X4U A; 3QT8 A; 2MMY A; 3GB0 A; 1XIQ A; 4YOE A; 5D4N A; 5FD1 A; 1OIA A; 3IGV A; 4KGK A; 1VRU B; 2XZT B; 2FUG 9; 3NS6 A; 3K59 A; 4W4M A; 1QDU B; 1BUX A; 4K4Y A; 4D3G A; 2BX6 A; 4CM2 A; 4DLG A; 1UZD A; 1HBN A; 3SXL A; 4NLD A; 1DLO A; 3JSR A; 4G3I A; 4ZLL A; 2HQF A; 1YJT A; 1RTI A; 5KAK A; 3IBW A; 3Q23 A; 2RML A; 3GYX B; 3ILO A; 1HI1 A; 1N36 J; 4AND A; 5AE2 A; 1UPP A; 1S79 A; 3H2L A; 2KKH A; 4DHV A; 1D9F A; 1BQM A; 2D7S A; 4LR8 A; 4H54 A; 1RBL A; 4DG1 B; 2ZZN A; 1RT4 B; 3IAM 9; 4F67 A; 2J9D E; 2V8P A; 3NMR A; 1S48 A; 1DTQ A; 2J0Q D; 2RU9 A; 4DV3 F; 4PXC A; 1U02 A; 1H3D A; 4LVN P; 3CCM S; 4NA1 A; 4C0B A; 4X62 F; 4K4Z A; 3ENV A; 4C48 A; 1NJX A; 1TKT B; 5A2Q Y; 3NS5 A; 1OY8 A; 5FLX U; 2CDQ A; 2GMH A; 4YHH F; 4DMZ A; 2HHW A; 5HBM B; 2YKN A; 1F9F A; 3NP5 A; 2HLT A; 5KG3 A; 5F9N A; 2Y8W A; 1LWF B; 2QLF B; 4YP3 A; 3CE8 A; 3CJ4 A; 3PRD A; 2WOM B; 5I3Q A; 2IPO B; 3DCA A; 2HUR A; 2WK4 A; 4O3Q A; 4K4V A; 2FHO B; 1Q78 A; 1S49 A; 3BO3 A; 3EZ5 A; 4JB8 B; 4DN9 A; 5LXY A; 3DLG A; 5HMY A; 4F4W A; 2J7U A; 3CXC R; 5E3Q A; 3J7A N; 4M5G A; 3IRX B; 2KDO A; 2QEX S; 3QPI A; 2RDJ A; 3PTW A; 1NBE B; 1N88 A; 4NLW A; 4LF7 J; 1CJT A; 1FEH A; 1R31 A; 4OI2 A; 1WEX A; 2N4D A; 1FKO A; 4P2F A; 1RU2 A; 1X60 A; 3TAP A; 3SCJ E; 1YGY A; 4WTO B; 1RT3 A; 1U1Q A; 2LKZ A; 2R7Q A; 5CD4 A; 2EFP A; 4DPT A; 3ZTP A; 2EC0 A; 3VGS A; 1FDB A; 1KTV A; 4C8N A; 3GQC A; 2B9E A; 3ZZP A; 2KFZ A; 3FCV A; 2JLE A; 1TFW A; 3RB6 A; 2KT2 A; 1LFP A; 4Q2M A; 1IBM F; 2RRN A; 5KT6 A; 3NS7 B; 5HLF B; 4HHU A; 3ELH A; 2W7P A; 3ISN C; 2DR8 A; 3KWM A; 1VBY A; 4TU9 A; 4IG0 A; 4QQB A; 2XGP A; 5L1I A; 2CUY A; 1HQU A; 4IUF A; 3ZTO A; 3BPD A; 1XR7 A; 2VIC A; 3GYN A; 2RS2 A; 1X9W A; 1NK6 A; 3TEH B; 3VAG A; 2CZ9 A; 2GAH C; 1BWE A; 2JDJ A; 1SUQ A; 3IM8 A; 3MM6 A; 3OL6 A; 1UFL A; 3CJT A; 3BQ0 A; 4RW7 B; 5L1J A; 2BVZ A; 3KUE A; 4X4V A; 5FII A; 1YJ7 A; 3W60 A; 5F8I A; 1C0T A; 2GNK A; 3TAN A; 1GK8 A; 1MML A; 5DQH A; 2R7V A; 4AQY J; 3AB4 B; 2OFH X; 2LLZ A; 1HQE A; 2E1A A; 5LL6 d; 3TUJ C; 3Q2T C; 1N4L A; 3D6T B; 4DUT A; 4IOA Q; 4EI2 A; 4UUX A; 1ZET A; 3KDN A; 1S77 D; 4NOH A; 2DHX A; 1IBK J; 2HGN A; 2E5L F; 2Q79 A; 2XG8 A; 3GV7 B; 1NHV A; 3GIM A; 5L9X A; 3H40 A; 4AXI A; 3BR9 A; 1FJG J; 1HR0 J; 2QLB B; 3M6U A; 3DKD A; 3G2X A; 5ITH A; 1RWM B; 1X5O A; 5HI7 A; 2CZ4 A; 3J7A 1; 4WF9 Q; 2QYG A; 1X4G A; 1PIE A; 3HT0 A; 4JI3 J; 2QG9 B; 3MCM A; 8AT1 B; 2LYV A; 1VQ7 S; 3QRP A; 3TA2 A; 4URG A; 4M8L A; 3KG0 A; 4DL7 A; 3KLG B; 4R5P A; 1A0O B; 1RT2 A; 1DTT B; 2BJ9 A; 4GRS A; 5J2N B; 3D28 A; 1ZBT A; 1UEV A; 5HVG A; 2DRD A; 1NDK A; 3A8I A; 2CPY A; 1X4E A; 5A8W A; 2K2P A; 1UCN A; 4DV5 F; 2UZA A; 2QSF A; 1U4B A; 4IDK A; 1YJ9 S; 4NI2 A; 4A8F A; 1E6V A; 3DLE A; 2W25 A; 4URQ U; 4C3L A; 3DLK A; 2F4V F; 3PDN A; 3NRB A; 4DS5 A; 4LT6 A; 1U2C A; 4LRA A; 1RWW B; 3W65 A; 1U2R A; 3DFE A; 5MLC V; 1KOO A; 4P10 A; 4Q45 A; 3TUP A; 3BH7 B; 4ILM A; 3D0H E; 3G4S S; 4I67 A; 2FVP A; 3B78 A; 3PKY A; 2OPP A; 2W9B B; 3TP2 A; 2B4V A; 3PKM A; 3AQP A; 1EHW A; 5ETK A; 3L4B C; 3GIK A; 2MZJ A; 4RW6 A; 3N79 A; 4WWS A; 5D3G B; 2ZE2 A; 4DEZ A; 3PR4 A; 1FJC A; 3MPU B; 4KC5 A; 1RHK B; 4X2B A; 5EX0 A; 5DGA A; 3PO5 A; 2ZNZ A; 1GEH A; 4OX8 A; 4I69 A; 4QZV B; 4WBF A; 3HHL A; 4DX7 A; 4F3O A; 1U8S A; 3W61 A; 3CED A; 1S1V A; 2IM3 A; 2JVR A; 3VGU A; 1SKU B; 1IKV A; 3IR7 B; 2HHX A; 4UY8 T; 4NPO A; 3JTO A; 2G9O A; 3IWX A; 2HHH F; 1JLG B; 4RX6 A; 2XMT A; 2V0N A; 3K8V A; 3D5M A; 5B08 A; 3IR6 B; 1PJ7 A; 3FSI A; 4PYD A; 1GTE A; 1S0M A; 2UXC F; 2F9J A; 2V6A A; 2CPH A; 5KFQ A; 3CVK A; 1REG X; 4OZ2 A; 3IS9 B; 1VFJ A; 1MWQ A; 4KAI A; 4IH5 A; 1CJK B; 2B5J B; 3QJL A; 2N3O A; 1VC0 A; 1YRT A; 4BC9 A; 2APO A; 3WC2 A; 2OPQ A; 4ZVR B; 3MD3 A; 4K2X A; 1C1C B; 1EQ0 A; 3I0S B; 4USI A; 1WWH A; 3UDC A; 4ECY A; 2KYX A; 4DV0 F; 3OW2 R; 2W1B A; 4C8L A; 1GXL A; 1NSP A; 1MLA A; 2BAB A; 1M1G A; 4P6Q A; 1S7I A; 4DSE A; 3T41 A; 2DNN A; 3MEE A; 1ACM B; 3RW6 A; 1F2G A; 3DLL Q; 3Q0A A; 1UVK A; 5GME A; 2Q1L A; 4JV1 A; 1WOS A; 3KOA A; 4OHZ A; 2GMJ A; 8ATC B; 3MMC A; 1HBN B; 3FVY A; 1UVJ A; 1DLO B; 3UD4 P; 5HVH A; 1NZA A; 1O0P A; 2VG5 A; 1PYS B; 2WVB A; 4EGL A; 1RTI B; 4BC7 A; 3GFY A; 4ZHR B; 7AT1 B; 5F3Z A; 1TAQ A; 4KHR A; 1SKW A; 1EKS A; 4MYU A; 2YBV A; 2JC0 A; 5M2P A; 4M5L A; 3PW7 A; 2BJD A; 1BQM B; 1RXO B; 1Q16 B; 2HBZ B; 5AJ3 F; 2NUU G; 2LP4 A; 4K8R A; 4RW8 A; 3DYA A; 4MAK A; 4IOB A; 1CG2 A; 4PKD B; 4CLF A; 5G0R A; 3S01 A; 2MJU A; 4OHV A; 3W2V A; 4B9U A; 4N77 A; 3I9Z A; 3D3C J; 4A8Q A; 4DUY F; 5D0G A; 2R7O A; 4HVZ A; 2FPH X; 2O01 C; 4B3S J; 4ER8 A; 2YKN B; 2UV8 A; 5EWF A; 1DHM A; 4P52 A; 2DY9 A; 2LCW A; 1MN7 A; 2OAU A; 4FXW A; 3EUN A; 2PO4 A; 5LMU F; 2B8P A; 2J0W A; 2F1F A; 2VFT A; 1TR0 A; 3H59 A; 3R6L B; 1E6Y B; 3DLG B; 3DRY A; 2GC8 A; 1Q4R A; 4NLS A; 3P3D A; 1RLC L; 1H98 A; 2VPX B; 5T41 A; 2JH3 A; 4I7F A; 1RAO A; 1RT6 A; 4JV0 A; 2Q6C A; 1CJT B; 3O1L A; 1FKO B; 4O4G B; 1ZAX A; 4OLP A; 2C22 A; 3GCW P; 5KFN A; 2ZEJ A; 2AJ0 A; 1LK5 A; 2EEY A; 3MMA A; 2D3U A; 3MFI A; 2X1B A; 3MPW A; 2OH2 A; 5SZT A; 3KK2 A; 3DI6 B; 4A8W A; 2VG6 B; 2KB2 A; 1I5O B; 1Q5Y A; 5IC6 B; 1MU2 A; 1SC4 B; 2CNL B; 5I3P A; 4IG3 A; 1AB8 A; 4OYO A; 1UFK A; 5A8R A; 1HNZ F; 1RWV B; 5JVG Q; 2GX8 A; 2C3P A; 2K3I A; 3EIC A; 2P6S A; 1NDL A; 3FGV A; 1FRI A; 2JC1 A; 3A13 A; 5GAG U; 2MSS A; 4ZPW R; 3WBZ A; 4R0J A; 1T8E A; 1OY9 A; 1TL1 A; 1HQU B; 2Y8Y A; 4USV A; 3J80 U; 3HFZ B; 1RKI A; 5KFK A; 2CJK A; 3PHE A; 2DGW A; 3LGH A; 3MOZ A; 3ZTS A; 1MN9 A; 1SUQ B; 2IVM A; 3EZO A; 4DSF A; 3AA9 A; 3K5P A; 4S0M A; 2FGO A; 2AGP A; 2DD8 S; 1WD6 A; 1UJ4 A; 1V3S A; 2G13 A; 1C0T B; 3C2P A; 1RCX B; 3VQT A; 5B0E A; 1VIX A; 3Q8S B; 3FMW A; 3TX0 A; 2C3M A; 1H7W A; 1AZS A; 3JAM Y; 3I4H X; 4IQX A; 2UUA F; 3IBC B; 3D6H B; 3QRR A; 4O3P A; 3CF5 Q; 1T9V A; 3GJQ B; 1YJR A; 3BRE A; 1VQ8 S; 4C8K A; 2BRK A; 3R97 A; 4JYA J; 4K5R A; 4UT4 A; 2F4F A; 3UPF A; 4K5S A; 4N5S A; 2IA0 A; 3CIM A; 3D0I E; 1TKX A; 3C19 A; 3ZC4 A; 6FDR A; 1F9H A; 2VBW A; 2DGO A; 5A2Q U; 2DNY A; 4KH1 B; 4P2X A; 3RW7 A; 1LWC A; 2EG1 A; 5C7P A; 2W9C A; 3IBF B; 1OO0 B; 3OHB A; 3MDF A; 3D2W A; 1IWG A; 4FYV B; 3PYG A; 2HHT A; 2BXJ A; 2DXE A; 1KRP A; 1KN6 A; 2F9D A; 3BDE A; 5AXK A; 1ARO P; 3OTC A; 3GIR A; 2BE2 A; 1SH3 A; 3WIU A; 4NZ6 A; 5EN1 A; 2MY7 A; 2NZ4 A; 2UUT A; 2QLJ B; 1RTJ A; 1RT2 B; 1Q7Y T; 4LFA F; 4ED7 A; 3SDE A; 1S1W A; 4DV7 J; 2BW2 A; 2HYI B; 1SL0 A; 2FJD B; 3JQJ A; 2AIR B; 4CRJ A; 2XQC A; 5A8W B; 1HYS A; 4N8O A; 3PG9 A; 1VI7 A; 1Y3J A; 4IDK B; 2CQP A; 4PG8 A; 4B9S A; 1RAB B; 4YB6 A; 3QJJ A; 4EFA C; 5KT5 A; 1JXL A; 1E6V B; 3DLE B; 1JLB A; 3DLK B; 1FWK A; 4DOZ A; 4I6A A; 3DGV A; 3RU0 A; 3ZTR A; 4M5N A; 4AQY F; 1AXQ A; 1W7W A; 5ETO A; 2MLY A; 2H1Y A; 1A9N B; 2NZC A; 3LPE A; 2OPP B; 2GIF A; 1X5P A; 3FFI A; 1D8Y A; 5KG5 A; 4ZK7 M; 1RWU A; 4BLG A; 4QIV A; 4EMD A; 4DR2 F; 1YBU A; 4CQ1 A; 4RW6 B; 3QZ7 A; 1C2P A; 2H9Z A; 3EPG A; 3MPD A; 3O3L A; 4DR6 J; 4MK8 A; 4DCJ B; 2X1A A; 3EGW B; 4U9R A; 3ICL A; 2A6O A; 3P4U B; 1CEZ A; 2ZOM A; 2ZVI A; 1DAX A; 4OI6 A; 2PMZ D; 3J7Y U; 2JX2 A; 1JLE B; 3HHL B; 1LXJ A; 4N8N A; 3MUR P; 2XNQ A; 2OO4 A; 3IRW P; 2NXE A; 3HI9 A; 2KFY A; 1S1V B; 3OFE A; 5IT9 U; 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4CNY A; 4PCQ A; 1S57 A; 1EZZ B; 3OQ2 A; 3AJ2 A; 2GO8 A; 2YNI A; 1DQA A; 2HQC A; 4J9O A; 3CD0 A; 1WEZ A; 5G4D A; 4ZP8 A; 1NSK L; 2ASY A; 3DYA B; 2XLK A; 1OPZ A; 2PMH A; 2PI4 A; 5G0R B; 2YWK A; 3BKF A; 1WKK A; 2ZH3 A; 3OXL A; 3M9N B; 4C8O A; 1N54 B; 2MQN A; 2XI2 A; 3FRZ A; 4YDD B; 3PW0 A; 3QFH A; 2JWN A; 3FEY B; 3BBF A; 4K4U A; 3QJP A; 3A1Y G; 1FJE B; 3MTK A; 3H4D A; 2HEK A; 3CD5 A; 2XO7 A; 1O6X A; 2D3Z A; 2COL A; 3H4B A; 4ED1 A; 3PJ9 A; 3KTQ A; 3VGV A; 1S0V A; 2VAS A; 2L48 A; 4KPC A; 4TU7 A; 3HVT A; 3VAM A; 3FBF A; 2EFV A; 2G2Y A; 2WHO A; 1PYO B; 2HSE B; 3HSD A; 3PFO A; 4J9P A; 2LA6 A; 3QO9 A; 1RUS A; 2DJW A; 3MXH P; 4I7F B; 1U1M A; 1RT6 B; 1V3Z A; 1XNR J; 4M5M A; 2NS1 B; 3AH6 A; 1RHJ B; 3UCG A; 4ZJL A; 4AL5 A; 4P2S A; 3F44 A; 2ZH6 A; 2HVE A; 2XSF A; 4F4X A; 4J5O A; 2AWZ A; 2DIU A; 4KGZ B; 4LR9 A; 2HQG A; 1CQN A; 3MMA B; 3EGV A; 4I64 A; 1VLY A; 3WC0 A; 2KG0 A; 1KQG B; 4DR3 F; 4BDP A; 3KK2 B; 5HMW A; 5E7O B; 1BLU A; 1J5O A; 2MQP A; 5H9E J; 4AUK A; 1MU2 B; 1ROF A; 4ZPV R; 4IG3 B; 3B54 A; 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