The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational similarity in the activation of caspase-3 and -7 revealed by the unliganded and inhibited structures of caspase-7.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| molecule tags |
Hydrolase, apoptosis
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
15
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2009-07-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1I51 B; 5K20 B; 3SIP B; 2CJY B; 2QLJ B; 2CJX B; 3KJN B; 3R7B B; 1IBC B; 2HBR B; 2Y1L B; 3RJM B; 2C2M B; 2Y0B B; 4DCO B; 1RHJ B; 1RHK B; 4ZVS B; 2QLF B; 4ZVU B; 4DCP B; 5IC6 B; 2CNL B; 1F9E B; 2XZD B; 2CNK B; 1I3O B; 1SC4 B; 2H51 B; 3D6H B; 3EDR B; 2C2Z B; 3R6L B; 1GFW B; 1RWO B; 3GJT B; 3R6G B; 1RWV B; 1PAU B; 4DCJ B; 4LSZ B; 2C1E B; 3NS7 B; 2DKO B; 2XYH B; 1RWP B; 3IBC B; 2HBQ B; 1PYO B; 1BMQ B; 1RWM B; 3KJF B; 3GJR B; 2P2C B; 2XYG B; 3R5J B; 1SC1 B; 4JB8 B; 1NME B; 1SC3 B; 3EDQ B; 4ZVP B; 2H48 B; 1RHU B; 2H65 B; 3P4U B; 1RWX B; 2QLB B; 2XZT B; 2C2K B; 1RWK B; 3GJS B; 2CNN B; 3GJQ B; 2HBZ B; 3IBF B; 3QNW B; 2CNO B; 2H5I B; 3D6F B; 2FQQ B; 1QDU B; 3D6M B; 2C2O B; 5IC4 B; 1RE1 B; 1RWW B; 1RHQ B; 3R7S B; 4ZVT B; 1RHR B; 2H4W B; 4ZVQ B; 2CDR B; 1ICE B; 3R7N B; 1RWN B; 2QL7 B; 1RHM B; 2XYP B; 1QTN B; 3KJQ B; 2QL5 B; 3P45 B; 2H4Y B; 2H5J B; 2H54 B; 4ZVO B; 2QL9 B; 4ZVR B; 2HBY B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2UUB J; 1YJN S; 2DXE A; 2OPP B; 2MZJ A; 1QLN A; 1L5U A; 2HK2 A; 1RCX B; 1NKB A; 1X0F A; 2YXL A; 1VK8 A; 4Q45 A; 3TR5 A; 3KG4 A; 2J5A A; 8RUC A; 5B08 A; 1NBE B; 2JJ4 D; 1VJW A; 3R6L B; 4PUO B; 3BGF A; 1RWV B; 3DDK A; 3L4B C; 3MEG A; 1LW2 B; 1RT6 A; 2AV5 A; 3C16 B; 4S0M A; 2KN4 A; 1VCT A; 3I5A A; 2CQC A; 5A8K B; 3PR5 B; 5D0E A; 4NXM F; 3O8W A; 3UDL A; 1JLG A; 1GEH A; 1EQM A; 4I69 A; 3OW2 R; 4CO4 A; 4YOE A; 1FXL A; 3NOC A; 5G4D A; 4U95 A; 4PQA A; 3FBE A; 1NB7 A; 5CA5 A; 5H9F K; 3K58 A; 4TLQ A; 4P7V A; 1NK9 A; 5HO4 A; 3AT1 B; 5B0A A; 3DYA B; 2UXC F; 3H4D A; 4TVA B; 3W63 A; 1VQN S; 2M8H A; 1E6V A; 4L73 A; 4ES2 A; 2ABY A; 4O0I A; 3D9B A; 2BJ3 A; 5A2Q U; 3V4M A; 5A0Y A; 4OZ5 A; 2PII A; 1J27 A; 2RIJ A; 1VRQ C; 3H90 A; 4G1I A; 2VFR A; 3TVK A; 1RT3 A; 2BRL A; 4G1Q B; 1FJE B; 4RW8 B; 4GKJ F; 3LGM A; 3RUB L; 1JLE B; 2IYI A; 4OZJ A; 2PI5 A; 2HRY A; 4DV0 F; 3DI6 A; 2OJ3 A; 1U47 A; 5CZV A; 1VDH A; 1TUG B; 4P7T A; 2QFI A; 2RT3 A; 1Z4U A; 2F1F A; 1S9E B; 4LF7 F; 3SSR A; 1IN0 A; 2QA2 A; 1NME B; 1NRK A; 5JXS A; 3VQT A; 4DPU A; 2C2N A; 4DSK A; 1U2F A; 3MAA A; 1NH7 A; 2PA3 A; 4XIU A; 4RX6 A; 3TUI C; 1ZAW A; 3MF5 A; 1JLQ B; 2LU2 A; 3M8P B; 1KHV A; 1WG1 A; 3F73 A; 1R8C A; 3RAM A; 3E3X A; 3MWB A; 3JSM B; 3H4B A; 2VC1 A; 2LDY A; 1DTQ B; 2WOM A; 2IM1 A; 2B8P A; 3D5M A; 2MKI A; 4EBC A; 3PIP Q; 1RA7 A; 1VQS A; 2QN6 B; 4ICL B; 1IM6 A; 2VG6 B; 2XSF A; 2B4O A; 3MED B; 3PX0 A; 3TQE A; 4X84 A; 2FY8 A; 2UXB F; 1U1P A; 1XBW A; 2KH9 A; 3HVA A; 1FKO B; 3M2U A; 3VCD A; 4H4O B; 4IO1 A; 3K5P A; 2K7K A; 4J9P A; 3EGN A; 1HI1 A; 3K5L A; 3D66 A; 3CJ3 A; 1ZAX A; 3PCO B; 3SFU A; 2DR8 A; 2H5E A; 2HVD A; 1Y0H A; 1S57 A; 1MWQ A; 5HAO A; 1WD6 A; 1WSR A; 4X65 F; 4LQ9 A; 4RJV A; 2DCU B; 5SZT A; 3IG1 B; 5DGA A; 5IT9 U; 1E6Y B; 4ANC A; 4UY8 T; 5A8W A; 4R25 A; 1RT4 B; 3W61 A; 1MRO B; 2CNN B; 3LUY A; 2F3J A; 3FSY A; 2KT5 A; 1MNE A; 3W2W B; 3N6L A; 2MST A; 2R2S A; 3T5L A; 3RGI A; 4LF4 F; 4FF4 A; 2YNF B; 3DRP A; 1M1G A; 4B9V A; 1N6Q A; 3CXC R; 1FCA A; 2B5J A; 3UDV A; 1EP4 A; 4FVC A; 3GG1 A; 4H54 A; 1M5V C; 2KFN A; 1EZZ B; 3LP1 A; 8AT1 B; 4YDX A; 1FEE A; 4MIB A; 3CDW A; 1VHF A; 5KFF A; 2BBE A; 3OFE A; 4DCO B; 1H2T Z; 1LWE B; 4G1P A; 5BYQ A; 3HUL A; 2VB6 A; 1GQE A; 2V8H A; 4A8F A; 3HX9 A; 2KVQ E; 2OFH X; 1CUL A; 2UUW A; 3BGL A; 2M7S A; 1NSQ A; 4OX9 F; 3TO8 A; 2E9T A; 3S8S A; 3I9V 9; 2A6O A; 1F0X A; 2V2Q A; 3BBB A; 2ZJR Q; 4Y2M A; 5EX3 A; 3JQM A; 2ZH8 A; 1O8B A; 3EX7 B; 1YDL A; 2VV5 A; 2DNZ A; 1Q8I A; 2KHD A; 1YHQ S; 2HZV A; 2MQM A; 4J9L A; 2Q43 A; 2A1B A; 3QAU A; 1S9G B; 2ZD1 A; 3M2R B; 2E9R X; 2UVU A; 5EX0 A; 1WF2 A; 3BR9 A; 3E8O A; 3J7Y U; 4KV8 A; 3AQP A; 2J8S A; 2MY8 A; 2QL9 B; 2ZBI A; 2VKZ G; 1N48 A; 1KQS R; 1MWY A; 2FGC A; 4NI2 B; 3OTD A; 5ETO A; 5F8L A; 3AXK A; 2B9E A; 4Y2K A; 4OYP A; 2YKO A; 5KFG A; 4P72 A; 2DXD A; 4WFZ A; 4PUO A; 1FVQ A; 2UXC J; 1LW2 A; 4IDK A; 3C16 A; 4WZQ A; 3C8Y A; 4RW4 B; 4ATN A; 1QE1 B; 4TU8 A; 4LRF A; 3K57 A; 2HBQ B; 2W4D A; 1I94 J; 1BQX A; 2AYM A; 2XYG B; 3M8Y A; 4MIW A; 1NB2 A; 1ULR A; 5KG1 A; 2ACY A; 1GXL A; 3KLI B; 3UW1 A; 2CNO B; 3GFH A; 3NMR A; 1HWJ A; 3DYA A; 5H9F J; 3RAQ A; 2MLY A; 3LOU A; 4K7Q A; 2VDH A; 4LF7 J; 1HW8 A; 2L9D A; 1AW0 A; 3G8T A; 5KFR A; 1KBR A; 2V8G A; 1FRX A; 2H5J B; 1HQU B; 4AT1 B; 1TK0 A; 2HBY B; 3LH2 S; 5K20 B; 5L1L A; 2F8E X; 2RDI A; 3GSD A; 3N9U C; 2WVB A; 4G1Q A; 3C3L A; 1TUV A; 2PSZ A; 2CQD A; 1JLE A; 2CKW A; 1SC4 B; 1KNZ A; 2JC1 A; 2GJF A; 5F3T A; 1LOU A; 2GVZ B; 4FYY B; 1S9E A; 3T1H F; 2DNL A; 4RWW A; 3GQC A; 3AJ1 A; 3ELH A; 5CD4 H; 4JI6 F; 3RAX A; 2G0J A; 2IVY A; 2HGM A; 3M8P A; 3BO4 A; 1SIZ A; 1Q7L B; 1CC8 A; 4OI4 A; 3CUL A; 4IG0 B; 3EM1 A; 2VQF F; 2IVM A; 1DTQ A; 3G6E S; 2WON B; 2EFV A; 2DH9 A; 1NK5 A; 4ZN1 A; 3K59 A; 3IWL A; 2VG6 A; 3MED A; 4ZLJ A; 4E0D A; 3EVW A; 1Y00 A; 4WXW A; 2VFV A; 4F4K A; 3NBP B; 2MQN A; 4J9N A; 1C0T B; 1V5I B; 5B0C A; 2DPI A; 1OPI A; 5I3U B; 2MGZ B; 2F4V F; 2R8I A; 5J2Q B; 2W7O A; 4LF4 J; 2G2Z A; 2BJD A; 4C6A A; 2E1C A; 2RRB A; 1DFD A; 5JUM A; 3C15 B; 4DG1 B; 5AJ3 F; 3DXB A; 2R7W A; 1FJ7 A; 4JV0 A; 4PPD A; 3C19 A; 1TV6 B; 2NXJ A; 1E6Y A; 1VLY A; 5F0W A; 4DQS A; 1MRO A; 3VGT A; 2BM1 A; 4QR0 A; 3HO1 A; 3W2W A; 5KG0 A; 4PG5 A; 3AJ2 A; 1XNR F; 4QIW D; 2YNF A; 2IYG A; 1YJT A; 2MB0 B; 1S6O A; 5AE3 A; 3PXG a; 1HBN B; 4I7F B; 1RKJ A; 3DLJ A; 4OX9 J; 3MTK A; 1TZ0 A; 2RUG A; 3KMQ A; 4QWB A; 2DRB A; 4O3O A; 2AIR B; 5GAE I; 2GIR A; 1HNI B; 3DRX A; 1NHV A; 4KHP F; 3BKU A; 2V0N A; 1ZZF A; 3A12 A; 2CJA A; 3R2D J; 1KKH A; 3DU5 A; 4M5J A; 3OL8 A; 2FZC B; 2AGQ A; 2RHS B; 1URR A; 4DUZ F; 2GV1 A; 1GAO A; 3GR0 A; 3HMJ G; 3MPW A; 4PCQ A; 1X9M A; 1V3R A; 1XMQ F; 2HS3 A; 1TKX B; 2KJV A; 1TK5 A; 1EET B; 3ZZO A; 4NL5 A; 2FYX A; 2HQC A; 2KYX A; 4WFY A; 1VOM A; 4RNH A; 4P2X A; 1QM9 A; 2BE9 B; 3M2R A; 1R0A B; 1O6X A; 2E1P A; 1FWP A; 3FJ2 A; 1M5H A; 1WG4 A; 2D1C A; 3BS9 A; 5DJB A; 1G3O A; 2QO3 A; 1CJT B; 1SQE A; 3K5M A; 5E3Q A; 4DBQ A; 4LUB A; 4FNH A; 2B9Y A; 3CJT A; 3HJV A; 3OSP A; 2YWH A; 1B4S A; 4WKR A; 1IKW B; 3OTO J; 2QLJ B; 3K17 A; 3CME S; 3LA0 A; 4C97 A; 1VQ6 S; 1C4C A; 1JKH B; 2MYF A; 1JIH A; 5IC6 B; 4RW6 B; 3PO5 A; 5E0O A; 1FRI A; 2MJN A; 4W4M A; 3HXM A; 2E5I A; 2DH8 A; 1WHX A; 3GJT B; 3ICL A; 4X4N A; 2AGP A; 1OYD A; 3BQ1 A; 1FE4 A; 2W7A A; 1KFD A; 3NY0 A; 2VF3 A; 2HHP A; 3KLI A; 3QSI A; 1KHW A; 2EK6 A; 2QTW A; 2FJW A; 4OL8 A; 3FMW A; 4QIG A; 4EBD A; 1N32 F; 5KG2 A; 2UZA A; 4Q7A A; 4OJG A; 5IOL A; 2AYB A; 3LWL A; 2QMU B; 3BPS P; 3MXH P; 1RHQ B; 3T1H J; 4UOF A; 2LA4 A; 3RW6 A; 3FUY A; 1HNX F; 2FLN A; 2VPY B; 3CB4 A; 2RU9 A; 4K4Y A; 1HQU A; 3PKM A; 3PJX A; 3O5T B; 4OI0 A; 2OTJ S; 4WWS A; 4ED2 A; 3X1L B; 2MHN A; 3BR8 A; 1QTM A; 3EE3 A; 2RRA A; 2YNG B; 1AUD A; 1S12 A; 1R27 B; 3ZO7 A; 3MHY A; 4CT9 A; 2YPZ A; 3MD1 A; 3IGN A; 1NZ8 A; 5KFN A; 4DLG A; 1AA1 B; 1SCJ B; 1D1U A; 2JDJ A; 4CZC A; 1OPZ A; 5HAT A; 2GVZ A; 2V2Z A; 5DZ7 A; 3BKT A; 3QGH A; 2K1R B; 4WKY A; 4DR4 F; 4EZ9 A; 4EYH B; 4JYA J; 2XYH B; 3KDN A; 4YHH F; 3HHK A; 3KG0 A; 2ILY A; 5JVG Q; 2E5H A; 4JB8 B; 4N76 A; 2MQP A; 2DNY A; 3TUZ C; 2L3M A; 5B0G A; 5IV4 A; 4IG0 A; 2HYI B; 3R5G A; 4DDF A; 4DOZ A; 2R2R A; 1YRT A; 1PAE X; 1FTC A; 5AJ3 J; 1HNW J; 5D4P A; 1MN7 A; 4ZLN A; 3MMC B; 4IUF A; 1N5Y B; 2C3P A; 2ADB A; 2XO6 A; 3NWR A; 2BA9 A; 2GA7 A; 1XMO J; 4N77 A; 4DR7 F; 2MKJ A; 5F8M A; 5K14 B; 3NBP A; 5HAN A; 3GSI A; 1TR0 A; 3GIK A; 2ZH3 A; 1C0T A; 1NAQ A; 2MGZ A; 1K1Q A; 4USH A; 1X0P A; 4BHQ A; 2HS0 A; 2OHD A; 2LKZ A; 4X2B A; 5D0R A; 2FHJ A; 2RHQ B; 3KFW X; 3C15 A; 1H72 C; 2W4P A; 3PYF A; 1RT1 B; 4KIA A; 3ZXW A; 1WC0 A; 3IRX B; 1Q8K A; 5E33 A; 5KFE A; 3UCG A; 1IBM J; 1TV6 A; 4A48 A; 2OEJ A; 4CT8 A; 1LW0 B; 3HT0 A; 3BDP A; 1T9V A; 5E2Q A; 5ETP A; 4NA2 A; 2BOP A; 4WCE Q; 3M8Q B; 1S76 D; 5FLX Y; 2C2K B; 4D3H A; 4H4K C; 2ZOM A; 2LEP A; 3I0R A; 5KFM A; 2EG1 A; 1X5S A; 2CPZ A; 4I7F A; 5HSP A; 1WI8 A; 4IQM A; 1B64 A; 4YB7 A; 2ZBC A; 2DR6 A; 4Y2A A; 1LK7 A; 1FNO A; 1R8B A; 3K8V A; 3BSA A; 3Q83 A; 1HNI A; 3PKY A; 1P9Q C; 4EFA C; 1RU1 A; 2CWK A; 3ZNJ 1; 4P2M A; 5LSL A; 1BQN B; 4U96 A; 2VQE F; 4ZP8 A; 1NPR A; 2YTC A; 3PRD A; 4C2M A; 1RWO B; 3MUT P; 1I1G A; 2PC6 A; 1OIA A; 3AA8 A; 1TKX A; 3V81 B; 1CQN A; 1EET A; 2V67 A; 1LFW A; 3M30 A; 1DTT A; 1QSY A; 2EBE A; 4W90 B; 1R0A A; 1NSA A; 2HG4 A; 3H0P A; 2PGC A; 4ED5 A; 2DGW A; 3L7P A; 2HAF A; 3SCL E; 4Y6I A; 2I0X A; 1CJT A; 4C8K A; 1HR0 F; 2E5L F; 2DO4 A; 2GMJ A; 2CAJ A; 4I67 A; 4NX9 A; 2OSR A; 3V4I B; 4DX7 A; 1IKW A; 1VBX A; 8ATC B; 3V6K A; 4DSI A; 2O1P A; 2OSQ A; 4ER8 A; 4DR2 F; 2CYY A; 5K8O A; 4OYA A; 2PMZ D; 1OMS A; 2D3O 1; 4C0B A; 1JKH A; 1Y5N B; 1G4C A; 5IQQ A; 4M5M A; 1U0H B; 4RW6 A; 3NGU A; 4UF4 A; 4WP8 A; 3J7A N; 4Z37 A; 1N8R T; 1BE4 A; 4RZR A; 1QAI A; 3D2W A; 1JJH A; 3TP2 A; 5KT6 A; 2XNQ A; 2DIT A; 5I3Q A; 3IC1 A; 2A10 A; 4DCJ B; 3TZY A; 1GX5 A; 2Z2Z A; 3WC0 A; 2WHO A; 2VG5 B; 4JI4 J; 2AEM A; 2IA0 A; 4WK3 A; 5CQG A; 5KFD A; 5KFX A; 2FZK B; 2XC9 A; 4LF6 J; 5EWE A; 5LM7 E; 3T5J A; 2V8D A; 1S49 A; 1S4F A; 4WTY A; 5CYQ B; 1UP1 A; 2Q6B A; 1T7P A; 1S1U B; 3CDU A; 5DM6 Q; 1VBZ A; 2DIS A; 3H5Y A; 2QJ3 A; 1UAW A; 2CZV C; 1UW9 A; 1RWN B; 1SI9 A; 5J2N B; 2YNG A; 1RUS A; 1UZD A; 1KS2 A; 3H2U B; 3CC2 S; 5EGY A; 2E5J A; 4R5P B; 2Z2Y B; 4JV5 F; 3T3F A; 2O5D A; 4IRC A; 4OX6 A; 4HR2 A; 1UPP A; 3W5X A; 4MYU A; 2ZKU A; 4NLT A; 1XR6 A; 2HIQ A; 4GO7 X; 1DRZ A; 4F3Q A; 4DR7 J; 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