The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Conformational similarity in the activation of caspase-3 and -7 revealed by the unliganded and inhibited structures of caspase-7.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| total genus |
18
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2009-07-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GJQ B; 1RHK B; 3IBF B; 3GJS B; 2CNL B; 1NME B; 4ZVP B; 2Y0B B; 1RWX B; 2H48 B; 1F9E B; 4DCJ B; 2CNO B; 2CNK B; 2H4Y B; 2QL5 B; 5IC6 B; 2XYH B; 2HBR B; 1SC3 B; 2QLB B; 3GJR B; 3R6L B; 3IBC B; 2QLJ B; 2XYP B; 1RHQ B; 1SC1 B; 2HBQ B; 2H54 B; 1RWV B; 3P4U B; 1RE1 B; 5K20 B; 2C2M B; 2DKO B; 2QL7 B; 1ICE B; 3R7S B; 4ZVR B; 3KJF B; 5IC4 B; 3EDQ B; 2Y1L B; 2QL9 B; 1I51 B; 2XZT B; 3KJQ B; 1SC4 B; 2P2C B; 2XZD B; 3D6M B; 3SIP B; 2H4W B; 2C2O B; 2FQQ B; 3RJM B; 1RHR B; 3R5J B; 2CNN B; 4ZVU B; 4DCP B; 2C1E B; 2HBY B; 2CJY B; 4ZVS B; 1IBC B; 1QTN B; 1RWM B; 2QLF B; 1RWO B; 1PAU B; 2H5J B; 2XYG B; 3R6G B; 1BMQ B; 1RHU B; 3P45 B; 3GJT B; 4ZVQ B; 1GFW B; 2H51 B; 1PYO B; 2H65 B; 3EDR B; 3R7N B; 2HBZ B; 1RWP B; 4DCO B; 2CJX B; 4ZVO B; 3NS7 B; 4LSZ B; 1RWK B; 1QDU B; 3QNW B; 3R7B B; 2C2Z B; 2C2K B; 3KJN B; 3D6H B; 1RHM B; 2H5I B; 4ZVT B; 1I3O B; 4JB8 B; 1RWW B; 3D6F B; 1RHJ B; 1RWN B; 2CDR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EPI A; 4KGK A; 4LT6 A; 4I0W A; 2HND A; 2N7Y A; 2ZOF A; 2FB0 A; 3PJX A; 2NYI A; 4YB6 A; 4PG8 A; 2UUC F; 1MWQ A; 4C8N A; 2GZO A; 3JSY A; 2PMZ D; 2AX0 A; 4Y2M A; 2WHO A; 2PA8 D; 5HLF B; 4NML A; 1Q16 B; 3BV8 A; 5A0Y A; 3BH7 B; 1VRQ C; 1KLM B; 3AA8 A; 3BR8 A; 3UO0 A; 3CJQ A; 2VPY B; 3TZW A; 1S9F A; 3EIC A; 2E7W A; 3K8W A; 2HWT A; 4KO0 B; 1RT7 A; 2QMX A; 4ECR A; 3TNV A; 1FRX A; 4DPU A; 2YY3 A; 1Q79 A; 5B09 A; 1UW4 A; 4P72 A; 2DRA A; 2MHN A; 3P3D A; 4IH7 A; 4FYX B; 4CIO A; 2V6A A; 3MD3 A; 4NLR A; 1RAG B; 1EET A; 1N8R T; 1SJR A; 4ED7 A; 5KFR A; 3CWJ A; 4KTQ A; 1ZM9 A; 4ZVE A; 2HQF A; 4QU6 A; 2K06 A; 3RGI A; 4DV6 F; 2DY1 A; 3ILL A; 1H0H B; 1I3O B; 3PDN A; 5HQM A; 4Q0B A; 2ZDO A; 2DTJ A; 3NAH A; 1T11 A; 2YNI A; 2GVD A; 3Q83 A; 5KFP A; 3BGL A; 3QWP A; 4DPT A; 3OD2 A; 3HK2 A; 1TKX A; 2C22 A; 2BOA A; 3UR3 C; 1Q7L B; 2BRL A; 2AQ4 A; 4WTO B; 1FWL A; 1S72 S; 3OL7 A; 4IDK B; 5IT0 A; 2OD6 A; 2PT0 A; 3J81 Y; 3OLB A; 4KQZ A; 4N7T A; 1TMM A; 2D7S A; 2J9D E; 1LOU A; 1MSW D; 1GT8 A; 4NCA A; 1NK9 A; 3W8G A; 3NAI A; 3QID A; 3T41 A; 3GQC A; 2CZV C; 3GV7 B; 3QQC D; 2O1P A; 1SH3 A; 2EFV A; 1WHW A; 3DU6 A; 1Q7Y T; 2ZBR A; 4OIX A; 2B56 A; 4X62 F; 1U8W A; 2QN6 B; 3QO9 B; 4LRE A; 2FZG B; 3HF5 A; 3BQ0 A; 1RTH B; 4ZLN A; 3CD0 A; 3Q89 A; 1D0E A; 3H20 A; 1J5E J; 1WNE A; 5J2P B; 1YI2 S; 4DR6 J; 3DXS X; 3IWL A; 4S0M A; 3T1H J; 3MM7 A; 2C3P A; 1WWH A; 3LF0 A; 3B82 A; 5DDQ C; 3MTJ A; 3QAE A; 2DNO A; 1IR2 A; 3SBM A; 2R7X A; 1NHU A; 2IDL A; 3NBP A; 5D6G A; 1TL3 A; 1ZBT A; 4X4O A; 2GQ2 A; 4DOZ A; 3W9J A; 4QIF A; 3KJV A; 2VG6 A; 1IXK A; 2K3K A; 1SUQ A; 4OYP A; 3V6D A; 1EX8 A; 3M30 A; 3ZTR A; 5C2G A; 3MMJ A; 4WP9 A; 1Y3K A; 4QPX A; 5LXR A; 4OHV A; 3MM6 B; 1S0O A; 2CPJ A; 1BQM B; 1N5Y B; 4X65 J; 4KE5 A; 3ZZO A; 1S6P B; 1G3O A; 2QE5 A; 1HQU A; 1E6V B; 3BPS P; 1T3N A; 3UNY A; 3V4I A; 4B9U A; 4DR2 F; 3K58 A; 2OPP B; 4FPI A; 4YR2 A; 1HHQ A; 4TYA A; 2BYC A; 2I0X A; 1FDN A; 2DNM A; 5DGA A; 1N5S A; 3QNW B; 4NCG B; 3WBZ A; 3HT3 A; 1HPZ A; 3ILJ A; 4WFX A; 4ED8 A; 3Q8V A; 5DJB A; 3Q86 A; 2DRB A; 2K1R A; 2IAJ A; 2ADB A; 5LT5 A; 3BGF A; 2FLO A; 2ZE2 B; 1B4S A; 4QWD A; 4F4X A; 1NCL A; 4C3K A; 1X4G A; 1R8P A; 3FFI B; 3DCA A; 5C5J A; 1ZTW A; 4C4W A; 1UAW A; 3U1L A; 2ZZT A; 1IJF B; 1IR1 A; 3HVT A; 2W4C A; 3IR6 B; 5RUB A; 4C98 A; 2AJ0 A; 6AT1 B; 4WTY A; 4B02 A; 4AFF A; 1JLG A; 1FVQ A; 2RRB A; 4DV3 F; 4YB5 A; 5FLX Y; 3M2U A; 3DYA B; 5AE1 A; 4C7Q A; 1YJW S; 1D3W A; 3NEK A; 1N88 A; 3EZ5 A; 1TV6 A; 3D4J A; 4IOA Q; 4X4R A; 1PYS B; 3M8S A; 1RT4 B; 3F0N A; 2HBZ B; 4OI6 A; 1R8H A; 3A12 A; 1K9M T; 1TVR B; 2M9K A; 4DG1 B; 3MR5 A; 2DYA A; 2RSQ A; 1FRK A; 5KFU A; 1GTE A; 4DSE A; 2QO3 A; 1NSA A; 1R0A B; 1I94 J; 4NA2 A; 2LMI A; 1KHW A; 1IWG A; 4Y3C A; 2IYG A; 4ANE A; 3CW2 C; 2MDA A; 4HH1 A; 5IS2 A; 4PXD A; 2P5V A; 3NL0 A; 1X0F A; 4ZPA A; 3QT6 A; 1IR0 A; 2GCF A; 3DRP A; 2HKE A; 3IS9 A; 4DLE A; 4BWJ A; 2QLX A; 2RU3 A; 2B7C B; 1V9O A; 1BWE A; 5F8N A; 2YKP A; 3KNA A; 4A8S A; 2CNN B; 2WOM B; 2HNY B; 4YDD B; 3KG1 A; 2JEI A; 3NS6 A; 5ITH A; 4C8Y A; 4O4G B; 2Z2M A; 1NJY A; 2D41 A; 2OEJ A; 3MPW A; 4RJV A; 4YY3 F; 3W61 A; 2W7O A; 2E5G A; 3CJ8 A; 2DIS A; 1XNR J; 3PYD A; 5J1N A; 2AJ1 A; 5E0O A; 5E3A A; 5HAN A; 1HI1 A; 4CLW A; 1XNQ J; 1OMS A; 1T9U A; 4MK7 A; 2Z4P A; 1LW2 B; 2R2U A; 1R43 A; 2IJN A; 3HJF A; 4JV5 F; 4ES3 A; 4F2S A; 2IA0 A; 3VAK A; 1F9E B; 3DLB A; 4JI6 F; 2IHR 1; 1S99 A; 3BBB A; 3AD9 C; 5GAH U; 2Y1J A; 3PVX A; 1WHX A; 2DH7 A; 4EYH B; 3MEC B; 1DTQ B; 4P74 A; 4O0N A; 2OPQ B; 4PUO A; 3I0S B; 2E5L J; 4FXD A; 2JNJ A; 3PRV A; 2GHV C; 1KBR A; 3MR6 A; 3CJK A; 1DZ5 A; 2D69 A; 1JLA A; 5C24 A; 4HDG A; 1IWA A; 4HTJ A; 4Y0F A; 2W4D A; 1JNZ B; 1ZTT A; 4K4X A; 1SPB P; 3GSD A; 3UDV A; 4C2M A; 1Y0H A; 2FGO A; 3DRS B; 1ZM4 A; 4EBD A; 2WVC A; 4ITS A; 1KNZ A; 2GVZ A; 5D0E A; 4M8L A; 4NA3 A; 4WE1 A; 1WTF A; 4U6P A; 4URS A; 4OYW A; 2W9C A; 4IR1 A; 1EB0 A; 5E41 A; 1F9H A; 4DL2 A; 2WCX A; 3WZ0 A; 3T9Z A; 2V67 A; 2KYX A; 1XTZ A; 1DTT A; 3L09 A; 2UUA J; 1X9S A; 1V3Z A; 2NR0 A; 1KQS R; 2VOO A; 3DMJ B; 1BY9 A; 2XLI A; 4HL9 A; 5DDO C; 3CCL S; 1RCO B; 4CO1 A; 4URG A; 2W25 A; 3I55 S; 3TX8 A; 3KUE A; 5KG0 A; 5KTQ A; 4X4S A; 1RT3 A; 1X4D A; 1NHV A; 5E33 A; 4PWU A; 1PKU A; 3KJF B; 2G0C A; 4N47 A; 2APO A; 2IBO A; 1YRT A; 2YNG B; 4RW6 B; 5CZV A; 4ALZ A; 2Q1L A; 1U1K A; 1NB2 A; 5IOL A; 2BQU A; 2VPX B; 3IRX B; 3SCJ E; 4WXW A; 1S6Q B; 1HWL A; 2IM1 A; 2WON B; 2M3D A; 5DDP C; 2VFU A; 2PII A; 4AE5 A; 2E5H A; 2BAB A; 2HVD A; 1VQ6 S; 1ZAV A; 3CD5 A; 4TN2 A; 2FGC A; 1JKH B; 4P73 A; 1PAE X; 2IBK A; 1O5J A; 3DI6 A; 2E66 A; 2Y1R I; 4O23 A; 4LQ9 A; 4LVO P; 1HL6 A; 4UY8 T; 4ZHR B; 5D8H B; 2KO1 A; 1D09 B; 3NCQ A; 4RW8 A; 4ZCM A; 1S7H A; 2QT7 A; 3DLE A; 2N7C A; 3OR2 B; 2VBY A; 3AXM A; 5K8P A; 3PHE A; 2QLB B; 5E3C A; 4RNM A; 4ZP8 A; 4CO5 A; 2LVW A; 2XNR A; 2LQB A; 1YHQ S; 4RBV A; 1YJU A; 1LFW A; 4C97 A; 2VDH A; 2YPZ A; 2BUN A; 2E1R A; 2LU2 A; 2VF3 A; 5A8K A; 3CJT A; 1P1T A; 3TAP A; 2RML A; 3H40 A; 5T41 A; 2JZ5 A; 1T95 A; 1HFE L; 3HSG A; 2CQ1 A; 4EK2 A; 1TFW A; 2JJ4 D; 1DQA A; 1EKR A; 3CDU A; 2IY5 B; 2FC9 A; 3BJY A; 5E3Q A; 3O8W A; 3RAM A; 3OXG A; 3GIL A; 1NKC A; 3LP0 B; 4JI4 F; 3G8S A; 4NXM J; 3EZU A; 4KR0 B; 2WK4 A; 2Y9H A; 3BGR A; 2D74 B; 2W2O P; 3D28 A; 1UVM A; 4AT1 B; 1HHT P; 3QGI A; 2ZBP A; 1Q8I A; 2DGU A; 2N4C A; 3OVS A; 2UUB J; 3AH6 A; 1KON A; 2GW8 A; 2Z58 B; 3SQG B; 3VAI A; 1REV A; 4QYR A; 3ZC4 A; 1H72 C; 3EVO A; 3KK1 B; 1RT1 B; 2CRL A; 3KMS A; 2VH7 A; 4DQS A; 3BBF A; 2DCU B; 4TY8 B; 2NQP A; 3CCU S; 5B0B A; 2NUH A; 2HND B; 2FHM A; 3VGV A; 1SJ4 P; 4ZK7 M; 1KVI A; 4IO1 A; 3T5L A; 3BYP A; 4EEY A; 4KC5 A; 1S10 A; 3J7Y I; 1N32 J; 1NJZ A; 2VOP A; 2OEK A; 1H98 A; 1R8C A; 3HP6 A; 1UA1 A; 4PQA A; 2LU1 A; 5H9E J; 3QRQ A; 1NDL A; 4LF9 J; 2LYV A; 4DL6 A; 1SJ3 P; 4CYU B; 2DJW A; 2RS2 A; 4IFV A; 2DR5 A; 2LDI A; 4LFC J; 1FK9 B; 1HWJ A; 3BR9 A; 2WZ1 A; 3I6P A; 3FVY A; 1IBK F; 2ZZM A; 1MMN A; 2DNR A; 2KTQ A; 1YBT A; 3PZP A; 3TW0 A; 3W64 A; 4O3S A; 3MTK A; 2F9J A; 2UXC F; 2IM3 A; 4Z37 A; 2P9C A; 1NK8 A; 4YP3 A; 2XYH B; 4P2F A; 3QZ8 A; 1H7W A; 3PEJ A; 1VGY A; 3RRH A; 3HHL B; 4OQJ A; 4RW7 B; 4IQM A; 5KFT A; 1S9G B; 3N4W A; 4GVL A; 4CLL A; 3TA1 A; 1IN0 A; 3G6X A; 1NRK A; 3MMA A; 1RAF B; 3SSR A; 1CJU B; 5CCM A; 2ZZN A; 4C0O C; 1S1T B; 1KTV A; 1QTM A; 4L3N A; 3H2U B; 2YNI B; 4DV4 F; 4G6V B; 4H4O A; 1NK4 A; 4PWD A; 1Q5V A; 1U1R A; 4X4U A; 3AD7 C; 1RZM A; 3SCL E; 4KIA A; 1IBL J; 2EC0 A; 3G2X A; 2R8K A; 2ZJR Q; 1RTI B; 2ZEJ A; 3NNH A; 3I31 A; 4K0K F; 2R8I A; 4ER8 A; 1YJN S; 3QFW A; 4A47 A; 4WZM A; 3RUB L; 3LAL A; 4IH6 A; 3MI7 X; 3Q22 A; 2AMC B; 2NXC A; 2W01 A; 2N4D A; 2YX7 A; 2QC3 A; 2D1C A; 2C2R A; 2V2V A; 2DR7 A; 3UD5 A; 3ITH A; 1Y3J A; 2HS4 A; 3JQM A; 1PC4 A; 2BKN A; 4CNZ A; 1S77 D; 2JFD A; 5BYR A; 4B3T J; 1X4F A; 1K0T A; 4BC7 A; 5KFW A; 4DV0 J; 3EVM A; 2CPZ A; 5KFZ A; 3D2W A; 3V6J A; 2ZH9 A; 2YX1 A; 4M63 A; 2A6O A; 1RBL A; 2DHA A; 2RQC A; 2DD8 S; 1GX5 A; 1WC5 A; 3RRK A; 3MUT P; 4KV8 B; 4DV7 J; 1YKW A; 2MYF A; 4CLY A; 1TL3 B; 3RZA A; 2XO6 A; 5B0D A; 2XY6 A; 2DXD A; 3CCQ S; 3KJV B; 1SCJ B; 4X4P A; 2VG6 B; 4ECW A; 2GA7 A; 4TLQ A; 2B4O A; 3D0H E; 4ZIV A; 1WUU A; 2R9L A; 3V6D B; 1N5Q A; 3M30 B; 4XK8 C; 4DU7 A; 3Q0A A; 3C6U A; 2F4F A; 1B64 A; 4M1K A; 2EFP A; 4GKK F; 5D4L A; 3W5Y A; 2DNL A; 5IWA J; 2PMH A; 2HQC A; 5HMX A; 3IBF B; 3POT B; 1HQU B; 4W92 B; 4NPO A; 3CCS S; 1RUS A; 1WG1 A; 2DHX A; 4F0H A; 4Y2K A; 1M5S A; 4RNO A; 3CMQ A; 1AB8 A; 3O5T B; 3K17 A; 1FJG F; 4OI1 A; 4DSK A; 1X4E A; 3CCZ A; 4MFB B; 2OFG X; 5IT9 Y; 4HTI A; 1YG0 A; 3QJJ A; 2V5H G; 1RTD A; 4NRT A; 4NI2 A; 1HNV B; 1HPZ B; 3S7R A; 5ETV A; 1MG7 A; 3MM5 A; 2FY8 A; 4KPC A; 2J6S A; 1J2V A; 4BCA A; 1KN6 A; 1JXV A; 2K1R B; 5ETO A; 5KFS A; 1LKZ A; 2A6M A; 1URN A; 4AQY J; 1S79 A; 3GR1 A; 4V19 X; 3IMQ J; 4B9V A; 4MH8 A; 1OSC A; 4HT7 A; 3ETM A; 4B3R F; 2OMO A; 1FEH A; 3V6H A; 1HD1 A; 1RGV A; 3UFC X; 4ZKA A; 4M5J A; 2U2F A; 4LF6 F; 3T1A A; 3TZY A; 2CQ3 A; 4FPR A; 2HFZ A; 3KJN B; 3RU0 A; 2HSE B; 4JI8 J; 2NYH A; 3M2U B; 4DWI A; 4FYY B; 4ZVH A; 3D6F B; 2IM2 A; 5B0C A; 1NB7 A; 1K0V A; 5D77 A; 1K73 T; 3PY8 A; 4ZA1 A; 2QL5 B; 2HBR B; 1B3T A; 2K2P A; 1U2F A; 1U2C A; 1Q86 T; 3DKD A; 1LWF A; 5GME A; 1Y10 A; 3DLL Q; 1Q5Y A; 2E1C A; 1DQ8 A; 1Q8L A; 1MMD A; 3E2E A; 3CJ4 A; 1T9W A; 1PJ6 A; 2X1F A; 3T1Y J; 2X1G A; 3HKZ D; 1OS5 A; 3G4S S; 2MQL A; 2V2K A; 4OZ1 A; 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