The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
94
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structure length |
92
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Chain Sequence |
YTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYGSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFKDPSAIGKKQVPFASMLTKKLHFFPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of active and inhibitor-bound human Casp6
rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-6
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| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
23
|
| structure length |
92
|
| sequence length |
94
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.59: Caspase-6. |
| pdb deposition date | 2010-10-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D6F B; 1PYO B; 5IC6 B; 3IBF B; 2H5I B; 4ZVR B; 2H4W B; 2XYH B; 3KJQ B; 1QTN B; 3R7N B; 2Y1L B; 1RWV B; 2HBQ B; 2CNL B; 2H54 B; 1F9E B; 1GFW B; 1RWN B; 3QNW B; 1NME B; 4ZVT B; 2XZD B; 3IBC B; 2XYP B; 1RWX B; 2C2K B; 3KJN B; 5K20 B; 3R6L B; 1I51 B; 2P2C B; 3GJS B; 3R7S B; 1ICE B; 3EDQ B; 2H48 B; 2HBY B; 3EDR B; 2H4Y B; 1RHR B; 1RHK B; 1RHU B; 1SC4 B; 3SIP B; 2CNK B; 2QLB B; 5IC4 B; 1RHJ B; 2XZT B; 3KJF B; 2C2O B; 4LSZ B; 2C2M B; 3RJM B; 2QLJ B; 2FQQ B; 4DCP B; 2CJX B; 1RWK B; 3GJT B; 2H51 B; 2CJY B; 1I3O B; 2CNN B; 2QL9 B; 3D6M B; 4JB8 B; 2C2Z B; 4ZVU B; 2H65 B; 2C1E B; 1RHQ B; 1SC3 B; 4DCJ B; 1RWO B; 3R6G B; 1RWW B; 3GJQ B; 2HBR B; 1IBC B; 1RE1 B; 3D6H B; 1RHM B; 4ZVP B; 4DCO B; 2DKO B; 3R5J B; 3GJR B; 3R7B B; 2Y0B B; 1BMQ B; 2QL5 B; 2CDR B; 2HBZ B; 2QL7 B; 2XYG B; 3NS7 B; 3P45 B; 2QLF B; 2CNO B; 1SC1 B; 1RWM B; 4ZVQ B; 1QDU B; 1PAU B; 2H5J B; 1RWP B; 4ZVO B; 4ZVS B; 3P4U B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NSB A; 3QRP A; 2NXJ A; 1ZM4 A; 2XY7 A; 1FRL A; 2W9C A; 4KYZ A; 4HDG A; 2YWK A; 3MHY A; 3NGT A; 3D4J A; 3TX8 A; 4JI6 J; 4WF9 Q; 3E01 B; 5CYJ A; 4CO3 A; 4BWM A; 4O23 A; 3T3F A; 2XWX A; 1S6Q A; 4KE5 A; 5LMN J; 1HWU A; 4W92 B; 4TQR A; 4K0K J; 1Q8B A; 2W8K A; 2Q6B A; 5CXT A; 3TUI C; 2R7W A; 4V19 J; 2F9D A; 1T9V A; 2AGO A; 1HNX J; 1FX2 A; 2QT7 A; 2M88 A; 3D9B A; 2R8K A; 2QYC A; 4I1T A; 1TQL A; 2EFV A; 2E9T A; 2FLP A; 2G1H A; 3LOU A; 4L75 A; 2HS4 A; 3M6X A; 3NCQ A; 3OFG A; 5AE3 A; 5F3T A; 2VBY A; 3C66 A; 1RWM B; 4EMD A; 3DOM A; 4OX9 F; 3I4H X; 2VFR A; 4UQT A; 2XNR A; 1R8P A; 2G13 A; 4FKX A; 3LGH A; 4NL5 A; 4OMF G; 2DRB A; 2QMU B; 3HLU A; 4FYY B; 4TLR A; 4CH1 A; 2O5D A; 2IRY A; 2CQ1 A; 3CSK A; 3SI8 A; 4O3O A; 1ZTW A; 1SJR A; 4DL6 A; 3W60 A; 1RCO B; 2PEH A; 2V8V A; 5B7W A; 1V3Z A; 4NXM J; 5E3C A; 4DUT A; 4J9V A; 4X2B A; 4C11 B; 2IA6 A; 4CCH A; 4TU8 A; 5DQH A; 1SH2 A; 4WXO A; 5SZT A; 2DTJ A; 2LQB A; 4IH7 A; 2GHV C; 5KFK A; 2HHQ A; 5C24 B; 2NSC A; 2CVE A; 4PPD A; 2E1P A; 2E5L F; 1AUS L; 3VR1 A; 5L1I A; 2MLX A; 2WHO A; 1VDH A; 5AE1 A; 3BKU A; 4LVO P; 1GMW D; 1VQP S; 1YI2 S; 1VQ4 S; 3NS6 A; 4RW9 B; 4F50 A; 2QL5 B; 3D6T B; 3P45 B; 2DGS A; 4UOG A; 5DG8 A; 2BE7 D; 1VLO A; 1HHT P; 4LQ3 A; 2Z58 B; 3VQT A; 2ATC B; 2K8G A; 4C8Z A; 2M2B A; 5MLC V; 5E2Q A; 2HMI A; 2VQF J; 2KXN B; 1YJ7 A; 5CCL A; 5KG4 A; 4DG1 A; 2PE8 A; 4FKY A; 3X3U A; 3G4S S; 1S9G B; 2K1R B; 4KY3 A; 1DFD A; 1V5V A; 4Q2L A; 4CLP A; 1HLW A; 4NLX A; 2G1D A; 5KFM A; 2BR0 A; 2R8J A; 1IN0 A; 1SI9 A; 3CDW A; 3KUE A; 4ANE A; 1GTE A; 4N5S A; 3PX0 A; 1B64 A; 1TUW A; 2XLJ A; 1JJ2 R; 4ZVF A; 4LF7 F; 3PEH A; 1U8S A; 1IJF B; 2BAC A; 2N3O A; 4ID5 B; 2FZG B; 4Y2C A; 3SFU A; 3SIP B; 4QQB A; 2D7S A; 3V4I A; 2UXD J; 3M05 A; 3QRR A; 5T7L B; 1PIE A; 1O0P A; 4P73 A; 1X7V A; 2C2M B; 4ZIT A; 2GJ2 A; 5HN0 A; 2EG1 A; 4J9L A; 1SCJ B; 3I82 A; 4ZHR B; 3M8W A; 3JTP A; 5IM0 A; 5A8R A; 5K5M A; 1XR5 A; 3UVJ B; 5AXN A; 2ZOM A; 3AD7 C; 4X4V A; 2CG4 A; 4C98 A; 3KG0 A; 4KBI A; 3ITH A; 3MOJ B; 3LPE A; 2DGO A; 5KFP A; 3K8W A; 4KJI A; 2FHO B; 4ECS A; 4WU3 A; 2L9D A; 3PW7 A; 4UF4 A; 2FJE B; 4OJG A; 4OZN A; 2CQC A; 3M2U A; 2PII A; 2VQE F; 2WVC A; 4B3O B; 1S12 A; 2JEI A; 2AZ3 A; 3T5L A; 3J7A N; 3MAQ A; 3U7J A; 1CC7 A; 2ZWP A; 3M8Z A; 1C4A A; 2DYA A; 2AYE A; 3CWJ A; 3AXK A; 3KLG B; 4DUY J; 5J2M A; 1H6K X; 2HIQ A; 2VOP A; 1YJW S; 4K2X A; 3S1T A; 4C6A A; 3CJ8 A; 4LSN B; 1F9F A; 4YR3 A; 3VV2 B; 3NCP A; 4OX9 J; 4NA3 A; 3EVM A; 4QIV A; 2K2P A; 4X62 J; 1T9Y A; 4G1Q A; 4EU0 A; 1B0T A; 3NP5 A; 1BHN A; 5HAT A; 1SIW B; 3AB2 B; 4DF4 A; 4DZ6 A; 1JLQ A; 3PIP Q; 3CCR S; 1DTT B; 1SH3 A; 1C0U B; 3OFF A; 3G8T A; 4M5L A; 3R5J B; 1ZPW X; 3OSN A; 1REV B; 1BMQ B; 2CNO B; 4D3H A; 4RNH A; 4FDF A; 3AJ1 A; 4IRC A; 1L5U A; 4F4Z A; 2B6A B; 2HKE A; 3M30 A; 4NRU A; 4OHW A; 4RW7 A; 1IQT A; 2NZ4 A; 2RU9 A; 5KFO A; 2LQJ A; 2RDD A; 4BLG A; 2ZBI A; 2F5G A; 4EUV A; 2VJU A; 1HQE B; 3F41 A; 1QUV A; 4A8K A; 3CD7 A; 3EE3 A; 3H8Y A; 1N5T A; 2E5L J; 1K0T A; 2KFZ A; 3E3X A; 1S76 D; 4B3M J; 3IWL A; 4UUW A; 3OR1 B; 1RTI A; 5KTQ A; 2P9G A; 4KH0 B; 5KT3 A; 4JV2 A; 1CC8 A; 2WON B; 3W9H A; 5ETN A; 2R7T A; 4X4U A; 4USM A; 1MRO A; 1X4G A; 3W8P A; 1M90 T; 2C3U A; 3C6U A; 4IDK A; 4DR5 F; 2OFG X; 2L48 A; 2DNQ A; 2FVR A; 2W2P P; 2HHH J; 3RB4 A; 4JB8 B; 1BGX T; 3MEC B; 3EJM A; 2PMW A; 2MB0 B; 4WE1 B; 5H9F J; 2AT1 B; 5MAO A; 2WCX A; 1FRX A; 3W5Z A; 3VGU A; 2RH3 A; 4ECW A; 4R5P B; 1FRM A; 5D77 A; 3MPW A; 1SUQ A; 4NOH A; 2W7P A; 1X4F A; 4LBH A; 1LV5 A; 2UV8 G; 6FD1 A; 4QIE A; 4LF7 J; 3PKY A; 1H3D A; 4IQX A; 1SVD A; 5H1S V; 5CD4 H; 4PWU A; 1NSA A; 1Y11 A; 3LQV A; 3SZ2 A; 1WSV A; 3D67 A; 3MUV P; 2K06 A; 4X66 F; 2VF3 A; 2C2K B; 5F9L A; 5A8K B; 2BXJ A; 4YQW A; 5HRO B; 5A76 A; 2RHQ B; 2AJF E; 4LIR A; 4P9S A; 3N5F A; 4NWB A; 3K5N A; 2QA1 A; 3ET6 A; 4IR1 A; 4CYU B; 1WKK A; 4PZV A; 1CUL A; 4NLD A; 3ONQ A; 3DLE B; 3KLH A; 3FSI A; 4W4M A; 3DRY A; 1FCA A; 2XI2 A; 1AXQ A; 1UMJ A; 1HNV A; 2IVF B; 3OLA A; 4ES1 A; 4GVB B; 2AMC B; 1FNX H; 4WII A; 4P6Q A; 2PMZ D; 1RU1 A; 3L9Z A; 5KG2 A; 5HBM A; 1LQ9 A; 5D78 A; 1KC8 T; 1RT4 A; 3TVZ A; 3SMZ A; 4O4G A; 3GV8 B; 3MD1 A; 1FXR A; 1WOP A; 1WF1 A; 4PG8 A; 1ZM2 A; 4K4W A; 4ZPD A; 1C1B B; 2NS1 B; 2HG4 A; 1S0N A; 4ZPT R; 4LMZ A; 4A47 A; 1RP5 A; 3K58 A; 3DLB A; 4F3Q A; 1Z2Z A; 2CYY A; 4OV6 A; 2BOA A; 2DEJ A; 3GFH A; 5ETK A; 4CO0 A; 1RDR A; 2F65 A; 4O3S A; 1WI6 A; 2MKY A; 3T19 A; 3RUB L; 1RAA B; 4ECQ A; 1UP1 A; 3OPK A; 1Q95 G; 1S1U B; 2DNP A; 1ZYQ A; 4JV1 A; 3KDO A; 4HHH A; 3F73 A; 2DR5 A; 2HHU A; 2FLO A; 1F9H A; 1R89 A; 3D1Q A; 1ZTT A; 2BVZ A; 3X1L B; 2BJ3 A; 3THT A; 4TXS A; 1TL1 A; 4DR4 J; 2FD2 A; 1RT1 A; 4CH0 S; 5FLX Y; 3D28 A; 2MEW A; 3EUN A; 1N48 A; 3TI0 A; 1U6B A; 5HMW A; 4OQJ A; 4DN9 A; 2ZOF A; 4MKB A; 5AT1 B; 1TL5 A; 1S1W B; 2MKS A; 2CZV C; 1WC0 A; 1SJ1 A; 4DSL A; 2H5J B; 1RQ0 A; 1RTZ A; 3HFV A; 1JXL A; 3TEH B; 4LF9 F; 1YJ9 S; 1R43 A; 1FEE A; 2HHS A; 3FCV A; 3TJ8 A; 4CNY A; 4OHY A; 2NUH A; 5G0R A; 1M5V C; 4MYT A; 1IWG A; 4U8Y A; 1YJR A; 2LEP A; 1RLD A; 4KGV B; 4MKA A; 2EKY A; 2VG5 B; 3IS9 A; 4NRT A; 4HDH A; 4H4O A; 3T1H F; 2CQB A; 3JSM A; 4EGL A; 1VYA A; 3I4P A; 4CLZ A; 3FRZ A; 3QIP B; 2DO0 A; 2CNK B; 1N32 F; 1S1X A; 2VA3 A; 2EI5 A; 4OYP A; 5LXR A; 2VKR A; 1S9E B; 2CJX B; 4E2F B; 2OI2 A; 3IRX A; 3PZP A; 2FLN A; 4DLG A; 1NK5 A; 3I5C A; 3V6J A; 5KFH A; 3D68 A; 2IFX A; 1FI4 A; 4R0J A; 4X66 J; 3NNH A; 2VA2 A; 5I3U A; 4DV7 F; 3DLL Q; 2J0Q D; 1VQK S; 2B4O A; 3JQM A; 1FRH A; 1E6V B; 2RQC A; 1RK8 A; 4TYB A; 3I0R A; 3GQC A; 1YJN S; 2CJB A; 1FFW B; 3C14 B; 4DR6 F; 2EFP A; 3M32 B; 1Y5I B; 2X7I A; 4XTT A; 2GML A; 3EPG A; 2C2E A; 2F8H A; 1TU0 B; 2FVC A; 3FVY A; 2MZJ A; 3AOC A; 4MIB A; 4QYR A; 2JFD A; 1RU2 A; 3OW2 R; 4MK7 A; 3NBP B; 2C42 A; 2DK2 A; 4Y2K A; 1RT3 B; 3S7R A; 3BEG B; 2F8E X; 3EZ5 A; 5HMX A; 5BYR A; 4DV6 F; 1KN6 A; 1KHV A; 4RNM A; 2GCF A; 1LXJ A; 3G6Y A; 4ZVE A; 4I6A A; 1Q78 A; 3DLJ A; 1XMO F; 4C7Q A; 2KM8 C; 4FBU A; 4B17 A; 3Q8R B; 5I3Q A; 2YWW A; 3AOD A; 3OUY B; 4ELV A; 3ZZU A; 4A8M P; 3IGN A; 2JWN A; 4LF4 F; 1WOS A; 4X4Q A; 1Y4Z B; 1DHM A; 4F4W A; 3LP2 A; 4K59 A; 1BQM B; 4AXJ A; 2KVI A; 1W7W A; 1X9W A; 1IM4 A; 2QFI A; 3HT0 A; 2VOD A; 3C3L A; 1HI8 A; 2FJA B; 3C8Y A; 4ED4 A; 2FGO A; 2LP4 A; 3M8Y A; 3HFZ B; 2KG1 A; 4ED1 A; 1XIQ A; 3OXF A; 2RRA A; 2I8E A; 2LA4 A; 4I2P B; 3K89 A; 3DYA B; 2CAD A; 1N6Q B; 2B43 A; 5KFX A; 1JLG A; 2ZIT A; 2N7Y A; 4AL6 A; 2YNI A; 5J2Q A; 2FHJ A; 1J5E F; 4XK8 C; 2ASD A; 3BF4 A; 1CJT A; 7FDR A; 2LEC A; 1HD0 A; 3OTE A; 2RSQ A; 4NX9 A; 4WIQ A; 2LU1 A; 2GVZ B; 1IJE B; 1IBM F; 1U2C A; 2ZZT A; 1PJ5 A; 4ZIW A; 4ED5 A; 1WD6 A; 2KN4 A; 1NH7 A; 1LW0 A; 1U25 A; 2VFV A; 2OEL A; 3K2Y A; 5C7P A; 1JB0 C; 1TVR A; 1FDA A; 1G3O A; 3BZQ A; 1UTA A; 3MM8 B; 5BXI A; 2IYI A; 1K8A T; 4YB1 P; 1CVJ A; 2HFZ A; 2MDA A; 1LWX A; 1RTH A; 3G82 B; 1I6J A; 3MOZ A; 4XAK A; 1ARO P; 4XIU A; 1X5O A; 5E33 A; 1R8H A; 3T1H J; 2XCP A; 4EBC A; 1N5Y B; 2QLF B; 5LT5 A; 2KT5 A; 2R2R A; 4C48 A; 2VG7 B; 2KHD A; 1FRJ A; 3T6J A; 2DR6 A; 5B0D A; 2LDY A; 1N32 J; 3B4D A; 2B8P A; 2BAB A; 1S7I A; 4B9S A; 1BUX A; 2CZ4 A; 3MM5 B; 1VOM A; 5D4O A; 2YQ1 A; 3CT9 A; 3HD1 A; 4ZN1 A; 3UE2 A; 3CJ3 A; 1XR7 A; 1QSS A; 4EFA C; 1UPM B; 5A6P A; 2J8S A; 4NLR A; 1PBA A; 4JI8 F; 2DXF A; 1U2R A; 4GKJ J; 1GK8 A; 2YTC A; 1LW2 B; 3K5M A; 3KLI A; 1F5A A; 4DR6 J; 3QLH B; 3D7S B; 4U7U D; 3LAN A; 1FWL A; 4RW4 B; 4PWW A; 1H38 A; 2Y0S D; 5E5N A; 2B3T B; 1T05 B; 1CJU B; 4DV6 J; 3M1V A; 1HBN B; 3DLG A; 3TAR A; 4GC7 A; 2JEG A; 2QFJ A; 2QN6 B; 6AT1 B; 3EYZ A; 2OP5 A; 3W63 A; 4KKO B; 4O0I A; 4JYA J; 1SXL A; 2VIH A; 3HVA A; 4YR0 A; 3KJQ B; 1Q0N A; 4UY8 5; 1B7Y B; 5CAB A; 3DHX A; 4XDD A; 3IXQ A; 2YKQ A; 3ISN D; 2MKI A; 1R8C A; 3GON A; 2QX0 A; 2FLL A; 1VRU B; 1T94 A; 1RTJ A; 4AL7 A; 4C8K A; 3I9Z A; 1UWB A; 2Z56 B; 4Q8F A; 3OVA A; 1SL2 A; 2HFU A; 3IMQ J; 2F40 A; 3TJ9 A; 3NWR A; 2B5J A; 4KHM A; 2RJZ A; 1HYS B; 2LEA A; 2DR9 A; 1PAE X; 2EFO A; 1BWV A; 1B0P A; 2M7S A; 1J5E J; 3HPO A; 3TP2 A; 3CDE A; 1VR6 A; 3DRP A; 1K1Q A; 2B9Y A; 1B70 B; 2CKW A; 4CP5 A; 2EBE A; 1MNE A; 2VPW B; 4N8N A; 2FC9 A; 4ZN3 A; 1U6Z A; 1XBW A; 2R7V A; 2J9D E; 4AFF A; 4UT4 A; 2ATL A; 3E01 A; 2HZV A; 3MUT P; 3G2X A; 3QRQ A; 2ZM6 F; 3OR2 B; 4IQM A; 2DR7 A; 3L95 X; 2BW2 A; 3HHE A; 3UD5 A; 5AJ3 F; 5GAH U; 2YWE A; 2DCL A; 4I2Q B; 1NME B; 2DXE A; 7AT1 B; 4GVL A; 3HO1 A; 2OD6 A; 1VBY A; 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