The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
103
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structure length |
103
|
Chain Sequence |
MSYKIPVHADFLIAYSTVPGFYSWRNTTRGSWFMQSLCAELAANGKRLDILTLLTFVCQRVAVDFESCTPDTPEMHQQKQIPCITTMLTRILRFSDKQLAPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/ligase/hydrolase
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
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| publication title |
Structural mechanisms of DIAP1 auto-inhibition and DIAP1-mediated inhibition of drICE.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase
|
| total genus |
20
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-06-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PYO B; 4ZVO B; 1RWV B; 2QL9 B; 2C2M B; 2H5J B; 3QNW B; 2H4W B; 5IC6 B; 3GJQ B; 1GFW B; 2CNN B; 1RWM B; 2H5I B; 2CDR B; 2QLB B; 4ZVR B; 1RWN B; 2XYP B; 1SC4 B; 1NME B; 2H51 B; 2CNK B; 3R7N B; 1QTN B; 5IC4 B; 1I51 B; 4ZVS B; 1RHM B; 1RWO B; 2C2Z B; 1QDU B; 3R6G B; 2CJY B; 3P45 B; 1SC3 B; 3SIP B; 2QL5 B; 1RHJ B; 3P4U B; 2HBQ B; 2H48 B; 4ZVQ B; 3R6L B; 2Y1L B; 3EDR B; 4JB8 B; 2CNL B; 3EDQ B; 3D6F B; 2XYH B; 3KJN B; 1RWP B; 3GJT B; 2CJX B; 3NS7 B; 1BMQ B; 3RJM B; 4DCJ B; 3R5J B; 4ZVP B; 1PAU B; 4ZVT B; 1RHK B; 2Y0B B; 5K20 B; 4DCO B; 2C1E B; 2CNO B; 2C2O B; 2P2C B; 3GJS B; 4ZVU B; 2H54 B; 1IBC B; 1RHU B; 3KJF B; 2QLJ B; 2FQQ B; 4DCP B; 4LSZ B; 1RHR B; 2DKO B; 3GJR B; 2HBZ B; 2HBY B; 2HBR B; 3IBC B; 3IBF B; 1RWW B; 1RWX B; 1RWK B; 3D6H B; 2XYG B; 2QL7 B; 3R7B B; 3KJQ B; 1I3O B; 2H4Y B; 3R7S B; 2XZD B; 1F9E B; 2QLF B; 1RHQ B; 1RE1 B; 1ICE B; 3D6M B; 2XZT B; 1SC1 B; 2C2K B; 2H65 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2K2P A; 1LQ9 A; 1HNV A; 3KJV A; 2Y1I A; 1VIO A; 3PEH A; 4X4S A; 1OMS A; 2IAJ A; 3GWC A; 1HBM A; 4EWT A; 4DR3 F; 3M30 A; 4DV0 J; 2KKH A; 1NDL A; 1M1H A; 1UL3 A; 1RT4 A; 2OPQ B; 7AT1 B; 4F0H A; 2WHO A; 3IM8 A; 4RO0 A; 2G0J A; 2MDA A; 4V1A k; 3ZZR A; 2ZJR Q; 4LVN P; 3R6G B; 3MMA A; 1YI2 S; 4ZKA A; 1DZ5 A; 3UVJ B; 2W2N P; 4GC6 A; 3QZ7 A; 1QAJ A; 2Y1R I; 1C2P A; 3G6Y A; 1DY3 A; 3VVT A; 4MIA A; 2OSQ A; 1LOU A; 2HHV A; 1JIH A; 4L6V 3; 2B3T B; 1XEZ A; 2DR9 A; 2GNK A; 2JEJ A; 1GMW D; 5CYQ A; 2ZJP Q; 4WBF A; 1FNM A; 1WI8 A; 4WCE Q; 2BR0 A; 4RL1 A; 2CIM A; 2Z58 B; 3GII A; 1OYD A; 2DNY A; 1Q53 A; 3R7B B; 1JJ2 R; 2OPS B; 3W2W B; 3IO1 A; 1GTE A; 1CVJ A; 1XNR J; 4JI8 F; 4H54 A; 2ZHA A; 2UZA A; 3LP0 A; 3TAR A; 2D3Z A; 3KUG A; 3FQL A; 1YJN S; 4ZLL A; 4X66 J; 1XR6 A; 1N5Q A; 2R7X A; 4HHU A; 3CCS S; 1UP1 A; 3UVJ A; 4OX7 A; 4PRF A; 1QVF R; 3MCN A; 2PI5 A; 5ETL A; 2LP4 A; 3KNA A; 4EU0 A; 4DR1 J; 4PXE A; 2C28 A; 2Y8Y A; 3EDQ B; 4F26 A; 1IKX B; 4NOH A; 2GJ2 A; 2OD6 A; 5AXK A; 4Q2M A; 3FJ2 A; 3KMS A; 3M2V B; 1FFS B; 2KHD A; 3QPI A; 2D3O 1; 2V6A A; 5HQL A; 4UOF A; 1L3S A; 3BQ2 A; 1G4C A; 2GQQ A; 4DV5 J; 1VBZ A; 5B0A A; 2OPS A; 2MQM A; 2C2R A; 3IWL A; 4X4T A; 3I5A A; 3MMC B; 1E6V B; 2RML A; 1WEL A; 2D41 A; 2HQD A; 3CME S; 2XG8 A; 4I6A A; 3BF4 A; 1CJV B; 1SC1 B; 4BHQ A; 3OLA A; 2GVZ B; 5C42 B; 1NDP A; 2QL9 B; 1JLE B; 1H7W A; 5D78 A; 4YUD A; 1JJH A; 1UZD A; 4R25 A; 3OUY B; 1N0V C; 1WEZ A; 5HK4 A; 1R0C B; 2E9T A; 1IR0 A; 2CG4 A; 4YDX A; 3ILO A; 3TEG A; 3ENA A; 1QUV A; 2K1R A; 2IBK A; 5KG3 A; 1VQN S; 3JSB A; 4YOE A; 4YB7 A; 2OPP B; 3HHE A; 1QE1 B; 1JJ4 A; 2B8Q A; 5KFZ A; 3C16 A; 4QJV A; 4XPC A; 1QJH A; 1RBA A; 4NLV A; 4DV2 J; 1RT2 A; 3WIV A; 3UN2 A; 1B0T A; 3DRR A; 4RU2 A; 2Z2L A; 5E41 A; 1NO8 A; 1JLC A; 1D8Y A; 3M8Q A; 3MMC A; 1E6V A; 5KFP A; 4PEO A; 2XYG B; 2ZOG A; 1R8C A; 1F2G A; 4KAI A; 1N5V A; 2HFS A; 3CJ5 A; 3VGU A; 2J76 E; 2NUH A; 2KHC A; 5C42 A; 4DPU A; 2F9J A; 2VB6 A; 2QMW A; 2ZNZ A; 4KFB B; 5U47 A; 1RTH A; 2FVR A; 1FI4 A; 1DFD A; 2JC0 A; 4ZCI A; 1EQM A; 1RWM B; 4G6V B; 3S7R A; 1ITP A; 1UFK A; 2QMU B; 3VF0 B; 3V6D B; 4C6A A; 2YKO A; 4BCA A; 3KLH B; 3JYT A; 1KR4 A; 1HPZ B; 2MGZ B; 3PW5 A; 4IRC A; 2HEK A; 1BQN B; 4ANE A; 1T3N A; 4DQS A; 4NZ6 A; 2YNG B; 1V3S A; 4KHM A; 3RGI A; 3LAL A; 2EC2 A; 4YB5 A; 1HHT P; 1RTD A; 1A9N B; 2V8P A; 4U67 Q; 4UZB A; 5J2N A; 4DR5 F; 2AWZ A; 4F4Y A; 1RHK B; 3VQT A; 2QV6 A; 1IBM F; 3OTO F; 3L7U A; 1K73 T; 3GSI A; 5DZ7 A; 2DO4 A; 2P9C A; 4NLW A; 2D3U A; 3JSY A; 3K17 A; 4DSE A; 2V0N A; 1C0T B; 2X1G A; 3AFG A; 1N5Y A; 1X4C A; 1YKW A; 3SDE B; 1KFD A; 4LUB A; 3DXS X; 3AJ1 A; 2DH7 A; 2IVM A; 4NCG B; 4CNZ A; 2GVD B; 4IQX A; 5BXI A; 2KYZ A; 4MKA A; 3I82 A; 2I9S A; 2WVE A; 1YJ7 A; 3V6D A; 5ETQ A; 1Z2Z A; 3IGV A; 1BQN A; 2YNG A; 1FNO A; 1HQU B; 2MKJ A; 5E3Q A; 3GCX P; 4NPO A; 4I6Y A; 1WF1 A; 1HNX F; 3KNG A; 4ZPA A; 3SIP B; 2CQH A; 1SKR A; 2LQ5 A; 5HQ8 A; 3KTQ A; 3AB4 B; 1NH7 A; 4C8Y A; 1BE4 A; 3GJT B; 5J1E A; 2U1A A; 4ZN1 A; 3OR2 B; 2IJF A; 1DTQ B; 3BDE A; 5KFJ A; 2I5J B; 2LU1 A; 1C0T A; 4DL6 A; 1K0T A; 3WX4 A; 3GV7 B; 2G2Y A; 5BYR A; 5KFA A; 3T1H J; 2DNO A; 3T9Z A; 4ES1 A; 2VG6 A; 1HR0 F; 3N6M A; 2JWN A; 4K4Y A; 1S9E B; 3GLJ A; 3QID A; 4NCB A; 4U7C A; 1FRH A; 3QGP A; 4OLO A; 3SSS A; 4ZIV A; 3HUL A; 2CWK A; 5HVF A; 4WXW A; 1Q8I A; 4ITS A; 4V19 J; 3MM5 A; 2MST A; 5D3G B; 4PR6 A; 4GVB B; 1UET A; 1RJJ A; 2HZV A; 4Y2A A; 2XSJ B; 1YBA A; 4NEZ A; 3LP2 A; 2ZC3 A; 1Y9O A; 3A12 A; 1WG4 A; 3E51 A; 4A8Q A; 2XC9 A; 5C2C A; 3R6L B; 3H90 A; 2RDJ A; 3KK3 B; 4ZP6 A; 1TU0 B; 4IG0 B; 5B0E A; 4AQY J; 3KUE A; 3FEY B; 3OR2 A; 4MYT A; 1D3W A; 2I5J A; 2DNQ A; 4KJI A; 2YWW A; 3N6N A; 3PRD A; 3HHD A; 1Q8K A; 1L3K A; 5IV3 A; 9ATC B; 1CJK A; 2NSC A; 3TJ8 A; 4LBI A; 5DGB A; 4I4B A; 1WHX A; 5EX0 A; 2E1M C; 3NS5 A; 1JLG A; 1S9E A; 4A46 A; 3ZZZ A; 2LEC A; 1WOP A; 2PA8 D; 5F8N A; 2IC3 B; 4C0H A; 4HI1 A; 2CG8 A; 1RTJ B; 3OL6 A; 1FDN A; 2MZT A; 3RG6 A; 1KQF B; 4A47 A; 1RAB B; 4RW6 A; 4P72 A; 4X4O A; 1AT1 B; 4NLG A; 4QOT A; 4BWM A; 2ZOM A; 5E3C A; 2XSJ A; 5E33 A; 3PZP A; 5H9F J; 5HMZ A; 2ZIT A; 1CUL B; 2VOP A; 3PR5 B; 2XUL A; 1YRT A; 4NI2 B; 2EFV A; 3O44 A; 4CO1 A; 2MY8 A; 2Z2Z A; 3I4P A; 1QSY A; 5M2U A; 2FJA B; 2W24 A; 4U7U D; 4IG0 A; 2DNM A; 2QA2 A; 3M1V B; 3WC2 A; 2A2C A; 1T9V A; 1XWL A; 2HHX A; 1RT3 B; 3SI8 A; 1FDA A; 2GAH C; 4B17 A; 1PAU B; 3K7R A; 2UUB J; 4M8L A; 4A8K A; 4DR4 F; 1IBC B; 2XNR A; 2IA0 A; 2VG7 B; 1J5O B; 4DG1 B; 3IAM 9; 4FZV A; 2OJ3 A; 3OTC A; 3Q2T C; 2QA1 A; 3OTB A; 2IC3 A; 1RTJ A; 2QLF B; 3CDE A; 4WFA Q; 3U27 A; 3OHB A; 1PBA A; 5EDW A; 4M5H A; 1S79 A; 2MZQ A; 1NRK A; 3FMW A; 2JOQ A; 4PXC A; 5LMN F; 2LLZ A; 1Y10 A; 2J7K A; 4F8R A; 2XWY A; 4PQU B; 4USI A; 3CCW A; 1IKY B; 4C2M A; 4ZPD A; 4Q45 A; 1CUL A; 4CH1 A; 1NHK L; 1UPM B; 3AOD A; 4K7Q A; 4Y65 A; 4JI2 J; 3DU5 A; 4J9O A; 1DRZ A; 2J8S A; 3WX8 A; 4C8O A; 1S1U B; 1GMU A; 4NL5 A; 1TV6 B; 1RT3 A; 4RW7 B; 2Y1L B; 2PGC A; 1B70 B; 4ED0 A; 1M0S A; 3AA9 A; 3DC2 A; 3Q8S B; 2ZD1 B; 4Z37 A; 2NCK L; 1NDC A; 2RJZ A; 3VGT A; 1UW9 A; 4TLQ A; 1I6J A; 1X4H A; 3BQ1 A; 2VG7 A; 2BUN A; 2DBB A; 2GJF A; 4DG1 A; 5LJ5 Y; 4ZN3 A; 3MGJ A; 2YKP A; 2ZH4 A; 4OYB A; 3GIJ A; 2HAF A; 1URN A; 3BH6 B; 2GAG C; 3SCJ E; 2R7O A; 4ED6 A; 4M63 A; 1R0A A; 1SKW A; 1J5E J; 3KJQ B; 3D7S B; 3AOC A; 5T7L A; 3CCE S; 3M6U A; 4OZ0 A; 2XCP A; 2H65 B; 1OQ6 A; 2DNG A; 5BJR A; 2KRB A; 4GMK A; 7FDR A; 2HLT A; 3EZ5 A; 4DUT A; 3Q86 A; 4F3Q A; 1SIW B; 4WJB A; 4PQU A; 1X0F A; 3VCD A; 3PHE A; 3U7J A; 3ZTO A; 5EWF A; 1VK8 A; 1RAJ A; 1U2F A; 2Z57 B; 2ZBC A; 2H51 B; 2R7Q A; 4IOA Q; 2W4P A; 1S1U A; 3RBX A; 2Q6C A; 3IS9 A; 1TV6 A; 4P73 A; 4TY8 B; 5A0Y B; 2CPE A; 2ZD1 A; 3FEZ A; 4B3O A; 4F3O A; 3G2X A; 5CCM A; 3AXM A; 1QAI A; 2UU9 F; 1HHS A; 1VYA A; 2AJ4 A; 2VFV A; 2DR5 A; 1R7I A; 3TEH B; 2WSE C; 2CPD A; 5AJ3 F; 4LF8 J; 4JI7 J; 2ACM A; 4I6W A; 1FJ7 A; 1A6L A; 2LA6 A; 4NRT A; 2ZKT A; 3TO8 A; 1EJ7 L; 2AEJ A; 2BE9 B; 3J81 U; 1XC9 A; 2V9W A; 5E5N A; 5GAG I; 3K5M A; 2IMW P; 4GKJ J; 2GJI A; 5D15 A; 3M9M B; 2OKQ A; 3DOL A; 3NMR A; 4I2Q B; 2KB2 A; 2LEA A; 4H4M B; 4TY8 A; 5A0Y A; 3QBC A; 2NXU A; 1XBW A; 4OHW A; 3KOA A; 3IN5 A; 3BO4 A; 1TK5 A; 1XQI A; 5DS7 A; 4OMF G; 4JV5 F; 4J7C A; 3QO9 B; 1GH8 A; 4BC9 A; 1K44 A; 5KG5 A; 4WFZ A; 1B4S A; 2M8D B; 1N4L A; 4K4Z A; 1FHT A; 3QT7 A; 5BYS A; 2FQQ B; 2MZJ A; 2B51 A; 2HS3 A; 3QRQ A; 1P8G A; 4C3M A; 4QPT A; 1UEK A; 1HL6 A; 3T1A A; 2FIU A; 2LCW A; 3GG0 A; 2HW3 A; 2OD4 A; 3VAM A; 4A8O A; 4IOC Q; 1Y5L B; 2XHW A; 2J9D A; 3DKD A; 1AYE A; 2GGP B; 4ETZ A; 2W9C A; 2D9P A; 4B9T A; 2QYG A; 2A2D A; 1M1G A; 3EXY A; 4H4M A; 1VRT A; 2QLX A; 1HQ2 A; 3PHT A; 2IYG A; 2C2Z B; 1B99 A; 1W2I A; 1FKO B; 3AJ2 A; 3PW7 A; 3JB9 k; 3TYT A; 3M8P B; 2ZZN A; 3LWL A; 3DRS B; 1XNQ F; 3NBP B; 2CJQ A; 4A8F A; 2A1B A; 2X3G A; 1K8A T; 2YY3 A; 2B4V A; 1KS2 A; 5LSO A; 3GCW P; 5AXM A; 1K1S A; 5KFS A; 3MOZ A; 1T9U A; 3LAN A; 2AU0 A; 4D3H A; 3TAM B; 4RPF A; 2HNY B; 2E5H A; 3R8Y A; 5EUH A; 2AZ1 A; 1JNZ B; 4DQR A; 4QZV B; 1F2H A; 5ETP A; 3DDK A; 1D09 B; 2O67 A; 3IBW A; 2GGP A; 3KLV A; 2DPJ A; 2ZH6 A; 3DYA A; 5GME A; 3KKF A; 3RR8 A; 2F5G A; 2AX1 A; 1VRU B; 3VR1 A; 4FNI A; 4OFZ A; 3DN9 A; 2HMI B; 3MI7 X; 4NLQ A; 1EP4 B; 1U1L A; 1U0S A; 3BN7 A; 1TZ0 A; 2VG5 B; 3C6T A; 1MRO A; 4J91 A; 1RAD B; 3BBB A; 1OQ3 A; 3RB3 A; 2XB2 D; 3A8I A; 2EXU A; 4DN0 A; 2DIU A; 2MHN A; 2HVH A; 2FY1 A; 3NBP A; 1UKU A; 5DDQ C; 3DDI A; 2B0G A; 3CDA A; 1FWP A; 4LQ3 A; 3CJ0 A; 5KFB A; 3RYL A; 1TUV A; 2D3O R; 1BY9 A; 4LF5 F; 2L41 A; 4WK3 A; 2KYX A; 1FVS A; 2GX8 A; 1MLA A; 4PWW A; 4NCA A; 5ETK A; 4ECR A; 3I55 S; 1SV5 B; 3LWM A; 1IN0 A; 3JXO A; 2XLK A; 3VAK A; 1FKA F; 4PWD B; 1WOO A; 1X4G A; 2ABY A; 3TVZ A; 3K5O A; 4YHH J; 4C8K A; 1V5V A; 3U1L A; 2VIC A; 3QFW A; 4FPI A; 1RT5 B; 2R8I A; 1EP4 A; 5C25 B; 3D3C J; 2QLB B; 2VFT A; 4NML A; 4KC5 A; 3M32 A; 1UFL A; 2J7U A; 2HWI A; 3N28 A; 1VLO A; 1EAY C; 3ZNJ 1; 4LJM A; 2NXN A; 3UDV A; 2CVE A; 2BJE A; 3I0S B; 2QL5 B; 3M9O B; 4DR1 F; 3HDS A; 2ROG A; 3T5J A; 1DLO B; 2YBV A; 1URR A; 4URS A; 1UVJ A; 3LA0 A; 4USV A; 3HHL B; 3SZ2 A; 2QN6 B; 1S6O A; 2P9G A; 2CNO B; 3BH7 B; 3T19 A; 2MJN A; 4MH8 A; 4QYZ J; 4TKT A; 2MKH A; 4ERD A; 5L39 A; 1T9T A; 2FC8 A; 1TKZ A; 3D1H A; 4X62 F; 2JEF A; 3QWU A; 4PWD A; 4K0K F; 3PYE A; 1PJ5 A; 2DIV A; 2G0I A; 5B0G A; 1RHM B; 1R8H A; 1YVF A; 1F5C A; 3M8S A; 3MXH P; 5IV4 A; 4MMO A; 5B09 A; 4O3R A; 3KK2 B; 1H6K X; 3GFH A; 3JTO A; 5C25 A; 4C48 A; 4UOC A; 4ETX A; 4B3T J; 3WIU A; 4OZ2 A; 4WII A; 1IM4 A; 3TP2 A; 3EM1 A; 1NME B; 1EHW A; 3LH2 S; 1MW7 A; 2ADB A; 2Z56 B; 1AB8 A; 4LRB A; 3RR7 A; 3GIK A; 4MT1 A; 4MAK A; 2WBM A; 1S0V A; 2QFI A; 4HEA 9; 2I8E A; 1SUQ A; 1DLO A; 4DPY A; 1H72 C; 2IBO A; 4WYW A; 2Y3Y A; 3J7Y U; 3V81 A; 1IR2 A; 3HHL A; 4URG A; 4F2R A; 2GFF A; 1OY9 A; 4J9Q A; 2NYH A; 2VDH A; 4FNH A; 3EE3 A; 3NS7 B; 2FGO A; 4FS2 A; 3FSY A; 5LM7 E; 8RUC A; 3AT1 B; 3SCK E; 4OYW A; 3H25 A; 4PXB A; 2WK4 A; 1JLF A; 1EQ0 A; 3VAI A; 1ZOT A; 1WOR A; 4E2F B; 3K89 A; 1J2V A; 4JI4 F; 3PRB A; 3AOB A; 3FVY A; 2VJV A; 4Q5V A; 4QWB A; 4LF9 J; 3NGS A; 3KK2 A; 2I2Y A; 2OO4 A; 2HQG A; 3NCR A; 4J9R A; 1YGY A; 1N54 B; 2HG4 A; 4AND A; 1RLD A; 4DSL A; 4FYD A; 2Z30 B; 4WP9 A; 5KFF A; 1FX2 A; 2MXY A; 4N41 A; 3FBB A; 2VPY B; 2ALY B; 1BWV A; 3D54 A; 1FTC A; 4QQB A; 2V8H A; 1U0H B; 1VLY A; 5GAD I; 1W26 A; 4NXN J; 2B7B B; 1N33 J; 2BA9 A; 3KDN A; 1DQ8 A; 3GFZ A; 5L1L A; 1IBL J; 4DX5 A; 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