The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Combined inhibition of caspase 3 and caspase 7 by two highly selective DARPins slows down cellular demise.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7 subunit p20
|
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
18
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| structure length |
94
|
| sequence length |
94
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2013-07-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SC4 B; 2CNN B; 2C1E B; 4DCP B; 2C2K B; 3D6H B; 3IBF B; 1RWW B; 1RWM B; 1RE1 B; 2H5I B; 2C2M B; 2CNK B; 5IC6 B; 2Y0B B; 2C2Z B; 1RWK B; 2P2C B; 2QLJ B; 2QL9 B; 1RWO B; 3D6M B; 2XYG B; 2H48 B; 1QDU B; 3EDQ B; 3GJR B; 2QL7 B; 2QL5 B; 3EDR B; 1RHK B; 1SC1 B; 1I3O B; 3NS7 B; 1RHJ B; 1ICE B; 3GJQ B; 4ZVQ B; 3D6F B; 4ZVP B; 1RWV B; 1QTN B; 3QNW B; 3IBC B; 1PAU B; 3P45 B; 3GJT B; 4DCO B; 1RHQ B; 1RHM B; 2H4Y B; 1GFW B; 3SIP B; 2H5J B; 1IBC B; 4ZVS B; 4JB8 B; 1NME B; 3R6L B; 3R5J B; 2XYH B; 2DKO B; 2H65 B; 2H4W B; 2CNO B; 1SC3 B; 4DCJ B; 4ZVR B; 1RWP B; 1RWX B; 3RJM B; 5K20 B; 2CJX B; 2XZD B; 5IC4 B; 3KJF B; 1I51 B; 1RHU B; 3KJQ B; 2HBY B; 3R7N B; 2XZT B; 4ZVO B; 2Y1L B; 3P4U B; 2HBQ B; 3KJN B; 1F9E B; 2QLB B; 1BMQ B; 2HBZ B; 4ZVT B; 2CNL B; 1PYO B; 1RWN B; 2C2O B; 3R6G B; 2H54 B; 3GJS B; 2H51 B; 1RHR B; 2QLF B; 3R7S B; 2CJY B; 2CDR B; 2HBR B; 4LSZ B; 4ZVU B; 3R7B B; 2XYP B; 2FQQ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OPP A; 4RL1 A; 3CCQ S; 1QJH A; 3UW1 A; 4M8L A; 3V4M A; 1AB8 A; 1SC6 A; 2DY9 A; 2Y3Y A; 4DOZ A; 2SXL A; 2KL8 A; 4JV2 A; 2Z2Z A; 1F9H A; 2UXD F; 2X1A A; 2EKN A; 1T05 B; 2ZH9 A; 5M2R A; 3W9J A; 4P7T A; 1SC1 B; 2IRX A; 2MLX A; 2IAJ B; 1FE4 A; 4NZ0 A; 3IRX A; 4TQR A; 4H4O A; 2V9W A; 1JJ2 R; 4DG1 B; 3PJ9 A; 3AAW B; 3FBE A; 4EBE A; 2PT0 A; 2CXE A; 4BS2 A; 2DR7 A; 1SKW A; 4PWD B; 2YWF A; 3N6L A; 1S1X B; 3AD9 C; 1TL1 B; 1MRO B; 3NG8 A; 2DBB A; 2E7X A; 2CJQ A; 4LF4 J; 4CRJ A; 4OZ0 A; 4I6Y A; 2W7P A; 1N6Q A; 1RTI A; 2HBZ B; 5DGB A; 2AMC B; 5CZX A; 2B6A B; 3UDE A; 3MUM P; 3T3F A; 4P71 A; 3R8Y A; 2QSF A; 1PC5 A; 3JTP A; 4KKO B; 1HD0 A; 3R5A A; 3TQE A; 1HD1 A; 2XQC A; 2CNK B; 1FRH A; 3M8P A; 3PG9 A; 2YH1 A; 1U49 A; 3Q8R B; 3CMA S; 1YIJ S; 1KVI A; 5F8M A; 1PAE X; 4DR5 F; 2RF2 B; 1FXL A; 4DMZ A; 2RQK A; 3N5B A; 1RAJ A; 3DFE A; 4MK9 A; 1KLN A; 1GAO A; 4HLB A; 2XLJ A; 2DHX A; 2K2P A; 2B7C B; 2RKI B; 2MEW A; 2UXD J; 3V6D A; 2MYF A; 3LP2 B; 3HZG A; 1D9D A; 1SXL A; 4LBP A; 5DDP C; 3DLE A; 2IYI A; 1JLF B; 2ZFH A; 3FEX B; 2OUG A; 1IBL F; 3GP9 A; 1L3T A; 1X7V A; 2VDI A; 2DNQ A; 1ARO P; 1IJE B; 4DUY J; 2ZNZ A; 4NEY A; 1PSD A; 2XMV A; 4HHJ A; 1SL1 A; 2MJU A; 1OJ4 A; 3MI7 X; 2V4J B; 1SH0 A; 4HHU A; 3G8T A; 1Y3K A; 5F0U A; 4C3L A; 3J7Z T; 1VC6 A; 2RSQ A; 2R2T A; 3BSO A; 1C0U B; 2C1E B; 2DGW A; 1TAU A; 1FD2 A; 5E5N A; 4OJG A; 4I56 A; 1UA0 A; 3HF5 A; 3BGL A; 4MKY A; 2KT2 A; 3VCD A; 1RWK B; 3KXD A; 3TAP A; 4E0D A; 1T9W A; 3Q83 A; 2IMO A; 4MKA A; 3G96 A; 1U1L A; 1UW4 A; 1AZS A; 4NLO A; 1VIX A; 5L1J A; 1HNW F; 4A48 A; 1K1S A; 2V34 A; 3MCM A; 1GFW B; 2XSF A; 4CLF A; 3R5J B; 2YNG A; 1VHF A; 1REV A; 1Y3J A; 2CPF A; 2V68 A; 3PRB A; 1RYS A; 3EM1 A; 1FI4 A; 2CQI A; 1RWP B; 4OYW A; 1ZAW A; 2ACY A; 4A8Q A; 2F40 A; 1SJF A; 2IIH A; 1HWL A; 1JLG A; 4BBY A; 4JI3 J; 1VS3 A; 5FLX Y; 4NLY A; 4WP9 A; 2E7V A; 3IR7 B; 3PYF A; 5IZH A; 3N0V A; 4U9R A; 5CYQ B; 5HL7 Q; 2MLY A; 1N34 F; 3TAN A; 3DRR A; 5KTQ A; 1IBL J; 4PWW A; 2HS0 A; 4NA3 A; 2CKW A; 5CYJ A; 3GFZ A; 3OXL A; 3CB4 A; 2RRN A; 3QBC A; 4ANE A; 2OTL S; 1GTE A; 3AQP A; 2GO8 A; 4DR4 F; 1HI1 A; 5H9F K; 4U96 A; 1AA1 B; 1JLE B; 1TKX A; 5JXS A; 3CJ3 A; 2IBO A; 3JQJ A; 1C1B B; 2Y1R I; 4KBI A; 3BB5 A; 1K0T A; 2G0J A; 2E1R A; 4CLU A; 3HPO A; 3S1T A; 4MJK A; 2MHE A; 1O0P A; 1V5V A; 3S01 A; 2V2V A; 4O3O A; 4X62 J; 1QSY A; 1FTR A; 4K4Y A; 4WII A; 1HNW J; 3AXK A; 2MXY A; 4NYO A; 4M5D A; 1HBM A; 1HMV A; 2DHS A; 2GO9 A; 3U1N A; 5CD4 A; 2DVI A; 2RDJ A; 3QAE A; 2HBY B; 2BXJ A; 2GQC A; 2VQE F; 2PA3 A; 1S4E A; 4JI0 F; 3KLH B; 4U8V A; 2L9D A; 3OL6 A; 1S1V B; 4F4X A; 1WHX A; 2CQ1 A; 3NGU A; 1WD6 A; 5HSP A; 5EX3 A; 1X4F A; 4ECW A; 1FRK A; 5F8G A; 3CIM A; 3MEC A; 4DL7 A; 2BJ7 A; 1FRJ A; 3HHL C; 2IM1 A; 5DLG A; 2FDN A; 3BYR A; 1LWE B; 3PYD A; 1N34 J; 4DR7 F; 3FQL A; 3LAM A; 3WZ0 A; 2VZ9 A; 4IFV B; 5G0R A; 1EAR A; 3KTQ A; 4NZ7 A; 3IN5 A; 3QT5 A; 4FKY A; 2B43 A; 3ADA C; 2H4Y B; 1M5S A; 2M8D B; 4F8R A; 1RBL A; 4FKX A; 3H59 A; 4LQ3 A; 1OYE A; 4CM2 A; 3R5B A; 1KOH A; 3PEJ A; 4WFZ A; 4FYW B; 5KFC A; 4K4X A; 2ZUG A; 2DB1 A; 5D15 A; 2AD9 A; 4J9S A; 4OZ5 A; 3UCU P; 1GNK A; 2LXF A; 2BM1 A; 5D3G B; 1Y5I B; 4CTA A; 3KYL A; 1F9E B; 1JXE A; 4LT6 A; 3OL8 A; 1BQX A; 4ZVT B; 4D3H A; 3LP0 A; 2BV3 A; 3BSC A; 2KG0 A; 3AA9 A; 4HDG A; 3CCU S; 3BN7 A; 2LMI A; 1FDD A; 1FVS A; 3GR1 A; 4DV7 F; 3PAC A; 4N76 A; 2UVV A; 4OI3 A; 1GK8 A; 2A3J A; 4NLG A; 5B7W A; 4JI0 J; 2AYG A; 1TVR A; 3BSN A; 5DQH A; 3NGR A; 3IM8 A; 1FER A; 1HBO A; 2DO0 A; 2GMJ A; 3ZZT A; 4KGM A; 4C48 A; 2AIR B; 2YWK A; 1MMD A; 4DCO B; 2IRY A; 1WG4 A; 2GVZ A; 3MCO A; 3DOM B; 4PQU A; 4Y28 C; 5T7L B; 5D0G A; 5MAO A; 4ECR A; 2G4B A; 1LKZ A; 1X5S A; 1X0P A; 2I5J B; 4ZCM A; 5M2U A; 5JJB A; 2AYB A; 3OVB A; 4L75 A; 3MCS A; 2FZK B; 1TFY A; 1VC0 A; 1OQ6 A; 4OV6 A; 1EQ0 A; 4NLX A; 2DGU A; 4BWM A; 2XMT A; 2DGX A; 4EU0 A; 1S79 A; 4NML A; 3OLA A; 3IA0 A; 1QAY A; 4IOB A; 2G0C A; 4WKY A; 1Q81 T; 2DY1 A; 5C25 B; 4NE9 C; 3M2R A; 5KAK A; 2JDJ A; 5C42 A; 3M8Z A; 3L09 A; 2F4F A; 2IY5 B; 5E41 A; 2NYI A; 2J6T A; 2ZM6 F; 5DQG A; 3DMJ B; 3CJ0 A; 3PX6 A; 1U1K A; 4NX9 A; 3JAM Y; 2KHD A; 3QFW A; 1KQK A; 4YEA A; 3I0R A; 4CO2 A; 3V6J A; 3NS7 B; 1T7P A; 2R3V A; 4I2P A; 2J0W A; 4XK8 C; 5F8N A; 4ZLL A; 1DUR A; 3HK2 A; 3QRQ A; 1RTZ A; 3PRD A; 4WFB Q; 3HDS A; 1DQ8 A; 4A47 A; 5ADZ A; 2IM3 A; 3NCR A; 1F9F A; 3J81 U; 1UA1 A; 2KT3 A; 2LP4 A; 2G13 A; 2MLZ A; 3C3L A; 4WXO A; 4LSL A; 2EFG A; 1FK9 A; 2XZD B; 3KUH A; 2YWW A; 4OZN A; 3RYL A; 1NSK L; 3FQK A; 3TW0 A; 2VFT A; 3H5U A; 2HS3 A; 2XEX A; 3BDP A; 5F8J A; 1BXN A; 2W8K A; 1APS A; 3FCW A; 4GMK A; 1Z1Z A; 2ZE2 A; 2E1C A; 2OPR A; 1XNR F; 2CQG A; 1KQS R; 1EAY C; 5J2Q A; 3OXG A; 4TYB A; 2WOM A; 4AXI A; 2C2N A; 2HQ3 A; 3MPW A; 3U27 A; 2BKP A; 4FYX B; 4GKJ F; 2B3T B; 3JS9 A; 3BBF A; 4LQ9 A; 3M32 A; 4CLP A; 1RT2 B; 4RW7 B; 5HRO A; 1NM2 A; 4OFZ A; 4ICL A; 4ERD A; 2EG1 A; 2R7Q A; 5L1K A; 2V8P A; 3W8G A; 5LMN F; 5BYQ A; 5BR8 F; 1HKA A; 2QYG A; 3ZTS A; 3DCA A; 4QYR A; 3UD4 P; 4AE5 A; 2ZM6 J; 3AOA A; 1D09 B; 3W60 A; 3DDN A; 4GVB A; 2H65 B; 3KWM A; 3I9Z A; 2LQB A; 4ZCI A; 1Q0N A; 4A8O A; 4Y2A A; 1ZS6 A; 3VGU A; 1AFI A; 4J37 A; 2XB2 D; 3T9Z A; 2CA9 A; 4XDC A; 5EN1 A; 3TAM B; 1TUG B; 4PUO B; 1T0T V; 2K1R A; 4ER8 A; 2PC6 A; 3GWC A; 4LR7 A; 4K4U A; 4F3M A; 4YDD B; 5LSR A; 2V8D A; 4IG3 B; 4IDK B; 4WZM A; 3THV A; 2D7S A; 2JFD A; 3IAM 9; 4B3M F; 4K7Q A; 1A6L A; 4QIW D; 3M9N B; 3EXC X; 4JI6 F; 1UET A; 3NGS A; 2MKJ A; 1XQI A; 2D69 A; 2CNN B; 4OJ3 A; 2CPJ A; 3T5J A; 1FJ7 A; 1U1N A; 2W01 A; 5LM7 E; 4QIG A; 1T94 A; 1B64 A; 4IG0 A; 2AJF E; 4KPY A; 4JYA F; 1Q82 T; 2BRL A; 4HI2 A; 3DYA A; 2IJF A; 5CD4 H; 4N56 A; 2LEP A; 1RWV B; 4FF2 A; 4CO3 A; 2KYZ A; 5E3R A; 3PW0 A; 4GKJ J; 3WC0 A; 4CH0 S; 3QLH B; 2HQI A; 3KOA A; 1NME B; 1KC8 T; 1N5S A; 4CQ1 A; 4CLZ A; 4HTJ A; 1I94 F; 5FII A; 1HWK A; 2P9E A; 1XR7 A; 4B9T A; 2IA0 A; 4RU2 A; 5BR8 J; 2KVQ E; 1CVJ A; 5BJR A; 3RW7 A; 2RHQ B; 2VOP A; 1R6V A; 4Q8E A; 2NUH A; 3DU5 A; 2DNR A; 1U02 A; 5J2P A; 1SUQ A; 1SV5 B; 3SQO P; 4MIB A; 5C24 B; 2RIL A; 2V8H A; 4FYD A; 1FRI A; 2VD3 A; 1LK5 A; 4R5P B; 3KK1 A; 3KK3 B; 4Y0F A; 4FDF A; 2Z2M A; 4I7F A; 1SQG A; 1VQ7 S; 3QO9 A; 4B3M J; 1TKZ A; 5JUM A; 3MMB A; 1LEO A; 2CQC A; 1S12 A; 4AND A; 5CYM B; 4QU6 A; 1RJJ A; 5AXM A; 1QTN B; 4KRW A; 3RTV A; 5L46 A; 1KRP A; 5DG7 A; 5A8K B; 4DPT A; 2HK3 A; 3HSZ A; 2XYH B; 5ETV A; 4JYA J; 1NPR A; 1IKX A; 5HJX A; 4ZLJ A; 2R7W A; 3U7J A; 4LFC F; 2FJD B; 2XCP A; 3MM8 B; 1LW0 A; 2IDL A; 3TUP A; 1KKH A; 4OHY A; 1G6B A; 2Y1L B; 2NXU A; 2QX0 A; 4ZN3 A; 4X65 J; 2YKM B; 2LQ9 A; 2CPH A; 3VZI A; 1I94 J; 2M70 A; 2HRT A; 5JVH Q; 3V6K A; 1NSA A; 4H4K C; 4KV8 A; 1FCA A; 2HHS A; 4I69 A; 2GMH A; 2C2E A; 3NBP B; 3FZB A; 1PGZ A; 1N8R T; 4DFM A; 4RUA A; 2R8I A; 1RI7 A; 2NPI A; 4JI4 F; 4ED5 A; 4M5L A; 1A9N B; 1CJK B; 4P72 A; 3KMS A; 4J5O A; 4J9R A; 4LF6 F; 3CDW A; 5J2M B; 2GC8 A; 1YZ7 A; 4YHH J; 1YQH A; 3EDR B; 1KFD A; 3MMC A; 2E5J A; 4NL5 A; 3VR1 A; 3MEG A; 2B9X A; 6AT1 B; 2K7J A; 4DJB A; 4RW9 B; 2VIC A; 4QZV B; 1PBA A; 5EWG A; 2FJA B; 1JXL A; 2JHE A; 3SV4 A; 2UUC F; 1S1W A; 4H54 A; 4F4W A; 1HQE B; 3OFH A; 2FHJ A; 3H42 A; 5A6W A; 3CO9 A; 2ZJR Q; 4O44 B; 2KN4 A; 3OTB A; 5B0F A; 4CO1 A; 2WVF A; 2Z4P A; 1VQ6 S; 4FN5 A; 2K8G A; 4N77 A; 4A4J A; 4Z7C A; 1NK7 A; 1RBA A; 2PN6 A; 3PO5 A; 4LFC J; 3I32 A; 3R3T A; 4NXN F; 1S99 A; 5ETK A; 3AOD A; 3HHE A; 1D8Z A; 1L3V A; 1CS4 A; 4OV1 A; 5E0O A; 3OJU A; 1P27 B; 3I55 S; 1QY7 A; 1WSR A; 4O3Q A; 2WW8 A; 3B6B A; 3KNA A; 3AD7 C; 2B8Q A; 2UXC F; 2ALY B; 1JJ4 A; 3D0H E; 2BJ8 A; 4JI4 J; 4PAA A; 3MR3 A; 4LF6 J; 3GII A; 1UWB B; 4PWU A; 2D3O 1; 2R2S A; 4ENO A; 1S1T B; 4LF2 A; 4CIO A; 3NY0 A; 2VDH A; 2IPO B; 5K8P A; 4X4Q A; 4QQB A; 2LVW A; 1DQA A; 3DKD A; 3C14 B; 1HQ2 A; 4WFY A; 6FD1 A; 4RWX A; 1C1C B; 4DLG A; 4F2R A; 2Q66 A; 4MKV A; 3AA8 A; 2UUC J; 3SCK E; 4QW9 A; 4BCA A; 4M63 A; 1RAF B; 5AE2 A; 2BKN A; 4Z37 A; 1H7W A; 4C8Y A; 1X9M A; 4ED6 A; 3TJ9 A; 2AGO A; 3ELH A; 1YJW S; 3MED A; 1PJ6 A; 2FC9 A; 2MQP A; 2LFV A; 2F8E X; 2FVP A; 1S9F A; 1N32 F; 3GJR B; 4M5G A; 2RQM A; 1ZET A; 1UJ5 A; 4HAC A; 1JKH B; 2KB2 A; 2OI2 A; 4H4M B; 1DTQ B; 1RHM B; 3W2W A; 2MKY A; 1GXU A; 4RW4 B; 3VAK A; 3EE3 A; 1J2V A; 4PAB A; 3VVT A; 2UUB J; 2ZD1 A; 4I2Q A; 5JVG Q; 4OLO A; 1FXR A; 2UXC J; 5ETT A; 5GAG U; 1F3F A; 3SQG A; 2XI2 A; 2Q1L A; 4CNY A; 2JL9 A; 4V19 J; 3H5X A; 1QM9 A; 4HL9 A; 3NAH A; 1HYS A; 3C2P A; 3UVJ B; 2RAQ A; 3FC9 A; 3DHX A; 5HVG A; 4FPR A; 1S48 A; 1H7X A; 2N4D A; 3EWG A; 2V8G A; 2OEK A; 2NUU G; 4QWC A; 4IR9 A; 5CCL A; 4QWA A; 4X4R A; 3RAX A; 4B3R F; 3MM7 A; 4H4K A; 3NS6 A; 2HMI A; 4FYY B; 2MQO A; 4DN9 A; 4FXD A; 3ISZ A; 1E6Y B; 2D9P A; 4RW6 A; 3X1L B; 4M5N A; 1KHV A; 2MQQ A; 3AOB A; 1HBN B; 3MFI A; 5DDO C; 2NSC A; 3D54 A; 4DPU A; 1HAR A; 4OYM A; 1NSP A; 1R8B A; 1N32 J; 2HLT A; 1SC3 B; 4ZVR B; 2VAS A; 3SSR A; 2V2Z A; 1NSQ A; 1ACM B; 3CCL S; 1HA1 A; 3M6W A; 2B8P A; 1RA6 A; 1E6V A; 3D67 A; 2XZT B; 2A6M A; 1NRK A; 1WC3 A; 2KVI A; 2YQ1 A; 2RNE A; 3HVT B; 2CAJ A; 2OHD A; 3P5B P; 3QAU A; 1FFG B; 3PFE A; 5KFZ A; 4P9S A; 4IRC A; 3AFG A; 4ZLN A; 3VZH A; 3K5L A; 3CO0 P; 4DHV A; 2QRR A; 2BMB A; 3QIP A; 4IYQ A; 3L9Z A; 5LJ5 Y; 4ELU A; 4B9N A; 2AF6 A; 4LSN A; 3LTO A; 1YKW A; 2QLJ B; 2QL9 B; 2UVU A; 1MWY A; 1N6Q B; 4M5J A; 2CIM A; 4KGV B; 1RTI B; 5KFH A; 1U6B A; 4KGK A; 2W8L A; 4CLT A; 2PSZ A; 3EVM A; 4TU8 A; 2MSS A; 4ECT A; 2HAF A; 3OLB A; 2NXE A; 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