The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
198
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structure length |
198
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Chain Sequence |
PVPAKRYDNVTILFSGIVGFNAFCSKHASGEGAMKIVNLLNDLYTRFDTLTDSRKNPFVYKVETVGDKYMTVSGLPEPCIHHARSICHLALDMMEIAGQVQVDGESVQITIGIHTGEVVTGVIGQRMPRYCLFGNTVNLTSRTETTGEKGKINVSEYTYRCLMSPENSDPQFHLEHRGPVSMKGKKEPMQVWFLSRKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Interfacial residues promote an optimal alignment of the catalytic center in human soluble guanylate cyclase: heterodimerization is required but not sufficient for activity.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Lyase
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source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3
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total genus |
55
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structure length |
198
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sequence length |
198
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ec nomenclature |
ec
4.6.1.2: Guanylate cyclase. |
pdb deposition date | 2013-11-05 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
B | PF00211 | Guanylate_cyc | Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Nucleotide cyclase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FX2 A; 3G82 A; 4CLY A; 1U0H A; 4CLL A; 1CJV B; 1WC3 A; 1WC6 A; 2GVZ B; 4OYZ A; 1CJV A; 2GVZ A; 1Y10 A; 4WPA A; 1YBU A; 1YBT A; 1WC1 A; 1WC4 A; 1CJK B; 5IV3 A; 4NI2 B; 1CJK A; 4P2F A; 1U0H B; 4OYX A; 4NI2 A; 1AB8 A; 4CM0 A; 4OYO A; 2GVD B; 4OZ3 A; 4OYW A; 5D0R A; 2GVD A; 1CUL B; 4CLW A; 1CUL A; 2W01 A; 1CJU B; 2WZ1 A; 1CJU A; 5D0E A; 1CS4 A; 4OYP A; 4OYI A; 4CLS A; 5D15 A; 2QV6 A; 4P2M A; 3ET6 A; 3R5G A; 4CLF A; 1WC5 A; 1CJT B; 5IV4 A; 5D0G A; 1YK9 A; 4CLU A; 1CJT A; 4UST A; 1CS4 B; 1FX4 A; 5D0H A; 4OYM A; 4USW A; 4OZ2 A; 4WP8 A; 1TL7 B; 1Y11 A; 2BW7 A; 3MR7 A; 4P2X A; 3UVJ B; 4USU A; 3ET6 B; 4WP3 A; 1TL7 A; 3UVJ A; 4USV A; 4CLK A; 3C14 B; 3C16 B; 4WP9 A; 3MAA B; 3C14 A; 3C16 A; 1AZS B; 3MAA A; 4CLT A; 4CM2 A; 1AZS A; 3C15 B; 4CLP A; 1WC0 A; 3G82 B; 4OYA A; 4OYB A; 4CLZ A; 3C15 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V6J A; 1GAO A; 3G82 A; 3ZC4 A; 3DGV A; 3PW7 A; 4N5S A; 3GZ7 A; 2JVO A; 3G8Q A; 4W98 A; 2I1R A; 1MWQ A; 4V19 J; 1FT8 A; 2YTC A; 3TO8 A; 4FNI A; 1WAC A; 4LF4 F; 1HI0 P; 4HHU A; 3GII A; 2HS0 A; 1Q8L A; 4FS2 A; 4I1T A; 2HW3 A; 3D0G E; 1NHV A; 5FDL A; 2B0G A; 1BMQ B; 1T3O A; 4LF7 J; 4WFZ A; 3RG6 A; 4J9N A; 4DN0 A; 1LXN A; 5KFZ A; 2EK6 A; 3OFG A; 1YJW S; 3V4I A; 1WDT A; 1ZPV A; 1REV A; 2CNK B; 2DO4 A; 1KQS R; 3O6Q A; 4QQB A; 2VBW A; 2H5E A; 4DV5 J; 1R8B A; 2B8P A; 4KKO B; 3D66 A; 1KWM A; 3ISN D; 1ZBT A; 3SCJ E; 3AD8 C; 5DM6 Q; 1F5A A; 4ZLJ A; 2IMW P; 3JS9 A; 4V1A k; 4FF3 A; 1CC7 A; 2GO8 A; 1VQP S; 5LSO A; 2ALZ A; 4LSL A; 4KR0 B; 4EU0 A; 1ZA2 B; 1FRL A; 2DRA A; 2WSE C; 3BBF A; 3EXC X; 1HBO B; 4LF6 J; 1N34 F; 3DLB A; 5HMW A; 4LIR A; 2DGQ A; 1HWK A; 2VQE J; 3S8S A; 4CM0 A; 3CMQ A; 4DL6 A; 2RML A; 4PZV A; 9RUB A; 1N4L A; 3NNH A; 4RBV A; 2VOD A; 2MQ8 A; 1TL4 A; 1MU2 A; 1EHW A; 3K58 A; 3K8W A; 3ZTS A; 4L3K A; 4C8Y A; 2VDH A; 1FK9 B; 3GJR B; 3AD7 C; 3ZTR A; 3KLH A; 1JK9 B; 1X4C A; 4DMZ A; 3QRP A; 1XNQ F; 1RT4 A; 1VS3 A; 3VGS A; 4ZN1 A; 2H5J B; 2ZIT A; 4LF8 F; 2UUC F; 4CO5 A; 3QFW A; 5K14 B; 2BOP A; 3IRX A; 4USW A; 4JI2 F; 1M5O C; 4WBF A; 3DDN A; 3OXL A; 4AD6 A; 5HJY A; 2CPI A; 2NXN A; 1NJZ A; 1UEU A; 2W2N P; 5HQL A; 4F4W A; 2ZUG A; 1B4S A; 1XWL A; 2GV1 A; 4N77 A; 3GCX P; 2BAN A; 2CPE A; 2FVS A; 4N76 A; 3QGH A; 3QYY A; 2HHX A; 1R27 B; 3FBC A; 5DG8 A; 1UEV A; 5B0D A; 3FEZ A; 3PX4 A; 1YSJ A; 3UD5 A; 1QE1 A; 4TNO A; 2DR9 A; 4DR3 J; 4ECW A; 2VUG A; 3QLH B; 4RUH A; 3J7A N; 2R3V A; 5KOW A; 3P3D A; 3THT A; 3JSY A; 4GKJ F; 2R7W A; 4GO7 X; 4QU7 A; 1LXJ A; 1ZAV A; 3D7S B; 1A9N B; 1JNZ B; 1GXT A; 5CYQ B; 3RRG A; 4K50 A; 5J2Q A; 2XMM A; 3TA1 A; 4DU8 A; 3RB4 A; 3GV8 B; 1XEZ A; 4CLU A; 2VG7 A; 4IH5 A; 3N5B A; 3AH6 A; 1WG5 A; 2V34 A; 1KQF B; 4YS2 A; 3KLV A; 2DY1 A; 3AB2 B; 2IBK A; 4CLK A; 1N32 J; 3C16 B; 1IWG A; 1FJG F; 4NEZ A; 1HBO A; 3N4W A; 4DR6 J; 3H59 A; 5MAO A; 4NRU A; 5B0C A; 5FJ4 A; 5J2N A; 4F26 A; 4P74 A; 4PUO A; 1OMS A; 5J1N A; 4Q7A A; 3JXO A; 2UU9 F; 5DQG A; 4A8Q A; 2GCF A; 1JLC B; 3KLI B; 2LCW A; 2AIR B; 1DJ0 A; 4DQP A; 5CYM B; 1R43 A; 5HQM A; 5L1J A; 2RRA A; 2KRR A; 3LGM A; 2HWT A; 2WVC A; 3MOJ B; 4CCH A; 2V67 A; 1WKL A; 4J90 A; 4CI0 B; 2F4V J; 1HNX J; 5LOQ A; 2QRR A; 2CPX A; 3M6X A; 1CUL A; 4RW6 B; 1LKZ A; 4PYD A; 2KRB A; 1JXV A; 1XMQ J; 3LP2 B; 2NQP A; 1SXL A; 3F73 A; 2QV6 A; 3KHL A; 3B8H A; 1N5T A; 4YP3 A; 4B3T J; 1IR0 A; 4FN5 A; 3GWC A; 1U47 A; 5ETP A; 1MWY A; 5KG5 A; 2XSF A; 2GHV C; 1ZM9 A; 4ANC A; 2JEJ A; 2B7B B; 2V69 A; 4ZPB A; 3IO1 A; 4EZ6 A; 2DH7 A; 4ED1 A; 4P71 A; 3DLL Q; 3LUY A; 3N6N A; 2LKZ A; 2IJF A; 1DHM A; 3HZE A; 3PO5 A; 2NLW A; 5KFT A; 1NSK L; 1TKZ B; 4QWA A; 4YHH J; 1KQG B; 2DGV A; 5BYS A; 2NSC A; 1FRJ A; 3BGL A; 2HAI A; 3KJV A; 5KT5 A; 5L46 A; 4Z7C A; 3FCW A; 2B5J B; 2AGP A; 3W8P A; 2BDP A; 3RAQ A; 3PIP Q; 2UUB J; 2BA9 A; 4Q43 A; 5D8H B; 3OJU A; 2AGO A; 5CYQ A; 1RLC L; 5ETM A; 1SBR A; 3L95 X; 1T02 A; 5I3U B; 3UR0 A; 2BMB A; 4HL9 A; 1YVF A; 1YIJ S; 4CWB A; 1Q5Y A; 1JIH A; 3IXQ A; 5GAH I; 3PJX A; 4X64 J; 2RHS B; 1EET A; 1UZH A; 1URN A; 4DSJ A; 4PXC A; 3GIR A; 3U7J A; 1Q78 A; 4QPT A; 1VJW A; 4HAC B; 2HVH A; 4L72 B; 1YWX A; 1SC1 B; 4EBE A; 2EWH A; 3M2V A; 5I3Q A; 2QGF B; 1A7G E; 4DZ6 A; 1CQM A; 3AA9 A; 2K8G A; 4HTI A; 2HK2 A; 3MCM A; 1NJY A; 1UPM B; 4LQ9 A; 4HDG A; 1D3W A; 2L08 A; 3TAM B; 4RW7 A; 1D1U A; 3OLB A; 2VG5 A; 1B7F A; 2CUY A; 4OHX A; 3EZ5 A; 2MB0 B; 1AFJ A; 4ELV A; 4C4W A; 4CH1 A; 3MPU B; 4ZDN A; 1S6Q A; 3WC0 A; 5T41 A; 3TJ8 A; 1WD6 A; 1ZZF A; 2OPS B; 4LRA A; 4DHV A; 2KT3 A; 5K5M A; 3BKT A; 4LUB A; 1FD8 A; 1VYA A; 2GMH A; 3GIJ A; 1HWI A; 1S9E B; 1UL3 A; 1TL1 A; 1IQZ A; 2G13 A; 1X9S A; 3ISN C; 2JHE A; 2AZ3 A; 2B51 A; 2BQ3 A; 3DDI A; 5KFA A; 1RWM B; 2HKE A; 3LPY A; 3CIZ A; 2DIS A; 3FBE A; 3HVW A; 2K7K A; 1MN9 A; 1RA7 A; 2BW2 A; 4YB1 P; 1U1Q A; 4KH1 B; 1NJI T; 3Q24 A; 1B64 A; 2WVE A; 3MF5 A; 5A0Y B; 4KGK A; 1N8R T; 4CLT A; 1NZA A; 3EDR B; 2R7U A; 2ZE2 B; 1T03 B; 1S4F A; 3NAH A; 2VPX B; 5F3Z A; 4MKB A; 2RE1 A; 3CWJ A; 2CFX A; 3EX7 B; 3CCR S; 3PZP A; 3LH2 S; 4X84 A; 1LW0 A; 1S1T A; 3T1A A; 1S97 A; 4I6W A; 2YNF A; 4NCB A; 3H20 A; 2OH2 A; 2R2U A; 3SV3 A; 2GGP A; 3RBE A; 2C22 A; 3DU5 A; 3TAP A; 1YZ6 A; 2WW4 A; 4USK A; 2MQM A; 1FA0 A; 2QG9 B; 4RX6 A; 3DLK B; 4DR2 J; 2W4D A; 3T5K A; 2HND A; 2XYH B; 3C6U B; 3MM6 B; 4EBC A; 1U49 A; 2DR6 A; 3BQ0 A; 2KI2 A; 2YQ3 A; 1IXK A; 4OLO A; 4RJV A; 4C3K A; 1NK4 A; 1IR2 A; 2EFV A; 3LP0 A; 1HL6 A; 4E0D A; 3CO9 A; 1FTC A; 1AW0 A; 5IXU A; 4M63 A; 3CD7 A; 4KSE B; 4EFA C; 2MZ1 A; 4AFF A; 3BV8 A; 3HM9 A; 4NCA A; 4M94 A; 2OPS A; 4LFC F; 1VK8 A; 3TZZ A; 3DI6 B; 5SUH A; 4ZHR B; 4JI0 F; 2QYC A; 1TFW A; 1S9E A; 3P96 A; 2ZH5 A; 3R7N B; 4QYZ J; 4U8V A; 1QTM A; 4BBY A; 3GON A; 3R5C A; 2YNH A; 2VBX A; 4G1Q B; 1N56 A; 2JRS A; 5B08 A; 2LU2 A; 4NL5 A; 2PT0 A; 3NCQ A; 3CJ4 A; 3D0H E; 5KFF A; 4UT4 A; 3ZO7 A; 4YR0 A; 4OI3 A; 5H9E J; 4RLE A; 2WCX A; 1RT6 A; 2CVI A; 4DUT A; 4A47 A; 3MED A; 5IM0 B; 2A6M A; 3HF5 A; 2DGX A; 1BD6 A; 7AT1 B; 5A0Y A; 1YK9 A; 1KTQ A; 3DLG B; 4IR9 A; 2XLI A; 4ECQ A; 2X7I A; 2HHT A; 3Q83 A; 3OL8 A; 4UY8 5; 3UVJ A; 3M4X A; 5HVH A; 1RP5 A; 4WZM A; 4WYL A; 3I56 S; 4FP9 A; 2WB4 A; 3CO0 P; 2FJD B; 3QFH A; 3LW5 C; 2FVC A; 5E7O B; 2K1R B; 2JX2 A; 1FX2 A; 1LWF B; 4G6V B; 4MTP A; 1ZTT A; 1WC1 A; 3A13 A; 2V0N A; 3EVM A; 3Q89 A; 3H25 A; 3T5L A; 2MKI A; 1ZTW A; 4DV7 J; 2VA2 A; 3GJT B; 2J6S A; 4IRC A; 2YVS A; 4J9K A; 2KT5 A; 3I0S B; 2HVE A; 2NYI A; 2EKY A; 1VJQ A; 2PFF B; 1F5C A; 3BDE A; 2ROG A; 1ZM3 A; 2QLW A; 2WHO A; 3CNQ P; 5AXL A; 2NUH A; 4JI1 F; 3FNN A; 1KNZ A; 4AXI A; 2FHK A; 2X1F A; 3GP9 A; 1RTI A; 1TUG B; 4KPC A; 2HK3 A; 3PJW A; 1M1K T; 4HH0 A; 1VCT A; 4NCG A; 1TZ0 A; 2XY7 A; 2JSX A; 2LMI A; 3ZFV A; 4F4K A; 3M05 A; 4NXM J; 3RRK A; 4KY3 A; 2QLJ B; 4RWX A; 2FLP A; 4HR2 A; 1M5H A; 1S4E A; 2YKO A; 2J0S D; 4USU A; 5KG6 A; 1MLA A; 2JLG A; 4YQW A; 3RB0 A; 4C3M A; 1K0V A; 2CQG A; 3POT B; 3S7R A; 5F8G A; 2NR0 A; 3MR5 A; 4UQT A; 3OSP A; 2CNO B; 2E5L J; 3DYA B; 5T7L B; 4YN3 B; 1JLG A; 3VF0 B; 2H1Y A; 2QLF B; 5E3Q A; 1W25 A; 4FDF A; 2Z2Y B; 2XG8 A; 5JJB A; 2RS2 A; 2LVW A; 3PVX A; 4U95 A; 3FK4 A; 1J5E J; 5CYJ A; 3NRB A; 4QR1 A; 2AQ4 A; 2AU0 A; 5HP1 A; 2J5A A; 3GYN A; 1TQL A; 2RSQ A; 2DXE A; 5CAA A; 2CQC A; 2W9B B; 1X7V A; 2HFN A; 1SKU B; 3TAN A; 2ZD1 B; 3H5S A; 2ZJP Q; 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5KFJ A; 2AYE A; 2KZM A; 3MMC B; 3KLG B; 4KTQ A; 3PXG a; 5M2P A; 2UVR A; 3H5X A; 4FF1 A; 3NCP A; 1N48 A; 1PBU A; 1R6Y A; 3CCQ S; 1FHT A; 2PFD A; 2UXC F; 2CIM A; 4LF5 J; 2FJB B; 4CLW A; 3J7Z 5; 1F5B A; 3IAM 9; 4DV2 J; 4OJ3 A; 2B4O A; 1SVD A; 3HJV A; 4GVL A; 1S1V A; 3UFC X; 4WXW A; 1VQO S; 4QWE A; 2RIJ A; 2QFI A; 2Z2M A; 2XYG B; 5JXS A; 3R8Y A; 4R8U B; 1HKA A; 1ZPW X; 3I4P A; 1D9A A; 4Q2L A; 4G1I A; 3OR1 A; 2VZ9 A; 3BQ1 A; 3HT3 A; 4HHH A; 3CCZ A; 3DLH A; 5A6P A; 2LEP A; 4UQG A; 1X5S A; 2ZBI A; 2W9A A; 2NPF A; 3KFW X; 2HVD A; 1OS5 A; 2RHQ B; 3TVZ A; 2ZH3 A; 5L1I A; 3G87 A; 3KG0 A; 4QWC A; 2V50 A; 4KC5 A; 4RKU C; 3HKZ D; 1OY6 A; 1CJV A; 4Y2M A; 2VH7 A; 1B99 A; 1SJQ A; 2B43 A; 3HUL A; 3AFG A; 2EXU A; 3A8I A; 4YY3 F; 4FS1 A; 3SSR A; 1JLF A; 1PIL A; 2DR7 A; 4G65 A; 3CT9 A; 2R8G A; 3PFE A; 3WBZ A; 5AT1 B; 4ID5 A; 1S99 A; 2R7Q A; 2LP4 A; 4B3S J; 2EW9 A; 2VFT A; 1VFJ A; 3M8Y A; 1QVG R; 4ANE A; 4MMO A; 2ZNZ A; 4ID8 A; 3HVT B; 2JH3 A; 2KYZ A; 3OHB A; 2O01 C; 5AE2 A; 1HBN B; 3QO9 B; 3M2U B; 5IV4 A; 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