The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
YKIPVEADFLFAYSTVPGYASMRNPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Reprogramming Caspase-7 Specificity by Regio-Specific Mutations and Selection Provides Alternate Solutions for Substrate Recognition.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| total genus |
17
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| structure length |
93
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| sequence length |
93
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2015-05-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IC6 B; 2QLF B; 3D6F B; 1RHU B; 1RHJ B; 2DKO B; 3GJR B; 4ZVP B; 1SC4 B; 1QTN B; 3KJQ B; 2CNL B; 2HBR B; 1RE1 B; 4ZVR B; 3R7B B; 2QLB B; 4ZVT B; 3R6L B; 3GJS B; 1RWW B; 3KJF B; 2CDR B; 3R7S B; 1RHQ B; 1PAU B; 1RWP B; 2H54 B; 2P2C B; 1RHM B; 1F9E B; 2C2O B; 3IBC B; 2H4Y B; 3D6M B; 1RWN B; 2QL9 B; 2CNO B; 2Y1L B; 1RWK B; 2C2K B; 2H65 B; 2QL7 B; 1I3O B; 1QDU B; 3R6G B; 2H5J B; 4DCP B; 3QNW B; 2XZT B; 2XZD B; 3GJT B; 1GFW B; 1NME B; 2CNK B; 4DCO B; 3EDQ B; 1SC1 B; 3SIP B; 1SC3 B; 3R5J B; 3GJQ B; 2QL5 B; 2HBZ B; 2H5I B; 4ZVU B; 2FQQ B; 5IC4 B; 4DCJ B; 2H51 B; 3P4U B; 1RHR B; 3P45 B; 2CJY B; 1ICE B; 3KJN B; 3R7N B; 1IBC B; 2XYG B; 4LSZ B; 1BMQ B; 3RJM B; 4JB8 B; 1RHK B; 4ZVS B; 2C2Z B; 2C2M B; 2H4W B; 4ZVQ B; 1RWM B; 2Y0B B; 1PYO B; 1I51 B; 2HBQ B; 1RWO B; 2QLJ B; 4ZVO B; 2C1E B; 2XYP B; 5K20 B; 3EDR B; 1RWV B; 1RWX B; 3IBF B; 2HBY B; 2XYH B; 3NS7 B; 2H48 B; 3D6H B; 2CNN B; 2CJX B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YKP A; 2MTL A; 3WQP A; 5DS7 A; 4ENO A; 4DL7 A; 4LF2 A; 3ELH A; 3UW1 A; 3MM9 B; 4IO9 Q; 2L48 A; 2UP1 A; 3UN5 A; 4OZ5 A; 2J0S D; 2C22 A; 2GVD B; 3TYT A; 2YTC A; 3QO9 B; 3CDB A; 2YPY A; 4PPZ A; 3OV7 A; 1HHT P; 3M6W A; 4ZK7 M; 5D0R A; 4OX9 F; 4ECX A; 4A8S A; 2DNK A; 3ZZU A; 1RGV A; 3PRD A; 3BBF A; 3QNW B; 2EKN A; 2VBZ A; 3FCW A; 1KP6 A; 3MPY A; 1RKJ A; 1PAE X; 4O0I A; 1NDK A; 1IBK F; 3BSN A; 1B0P A; 3H20 A; 2CQC A; 3ZZT A; 2ADB A; 2PSZ A; 4JI5 J; 3K7R A; 1RI7 A; 1VQP S; 2FJB B; 2OMO A; 1K47 A; 1HYS B; 2WVB A; 2FHJ A; 1SV5 A; 2B56 A; 2HKE A; 4NLS A; 1NU4 A; 2VOO A; 4NX9 A; 3GCW P; 1B4S A; 4YHH F; 2YVS A; 4JV1 A; 1UZD A; 2K1R B; 2HBQ B; 1KDN A; 4ER8 A; 1FKA F; 1DBD A; 3EMT A; 3KUH A; 4RO0 A; 4JI1 J; 1HNX F; 1RHU B; 4URS A; 3CCL S; 4YP3 A; 1LNQ A; 2QV6 A; 4Z2X A; 3CTR A; 4YY3 F; 4YDX A; 2YQ3 A; 3TUJ C; 1R27 B; 1T95 A; 4ZJQ A; 1S9E A; 1KWM A; 5F41 A; 3PTW A; 2X3G A; 4F4K A; 3M4X A; 1GQE A; 2R8G A; 4QYR A; 4GKK F; 3NMR A; 1IM4 A; 1R89 A; 3T9Z A; 1UAW A; 3HDS A; 3MFI A; 4NZ6 A; 1U09 A; 2XHW A; 3SSQ A; 3MOJ B; 4LRB A; 1WHW A; 3PAC A; 1NXI A; 2WZ1 A; 3QLH A; 3TP2 A; 3OUY A; 3MCN A; 3R7N B; 1C1C B; 2LXF A; 3CSK A; 4YME A; 5IWA F; 3EE3 A; 3BDE A; 1RT3 B; 2R9L A; 2QO3 A; 2V94 A; 3TAN A; 3W60 A; 2H4W B; 4F02 A; 1ZM2 A; 2C1E B; 4B08 A; 1URR A; 3H4D A; 3MPD A; 2V8V A; 4HAC B; 3W63 A; 1RK8 A; 2AGP A; 1W2B R; 4I64 A; 1JJ4 A; 2IYG A; 2CNL B; 2ZVS A; 2OEL A; 1Q7Y T; 1SJ1 A; 2ZJP Q; 1RAA B; 3NCR A; 3KNG A; 5G0R A; 9RUB A; 3GZ7 A; 2HHX A; 4IG3 A; 4OI3 A; 1V3S A; 3MI7 X; 4X65 F; 3VF0 B; 4ED7 A; 4C97 A; 1MMN A; 3I0S A; 3NS6 A; 1TMM A; 5HSP A; 4ID5 A; 2IA0 A; 5K8N A; 2W7P A; 1XEZ A; 2D9P A; 3FEZ A; 2UV8 A; 2A2D A; 5CZX A; 4C9D A; 4MIA A; 3EWG A; 4NLT A; 3U27 A; 5IC4 B; 1CQM A; 1ITP A; 2F4F A; 3QGP A; 1CQN A; 3D1H A; 4LSL B; 1VQN S; 1NPR A; 3JYT A; 2OEJ A; 3IAS 9; 3QIP A; 3KLI B; 5T41 A; 1NAQ A; 1FEH A; 1EP4 B; 3ZXW A; 2DVI A; 3CJK B; 2CQD A; 2WOM A; 2LXU A; 1T05 A; 3KK2 B; 2FGO A; 2UVU A; 3VV2 B; 4DMZ A; 2FVS A; 3VZI A; 3OR1 A; 4UW2 A; 4QYZ J; 1TUW A; 2DRB A; 4ILM A; 3Q8V A; 1FNO A; 3A8K A; 4EO8 A; 2QLB B; 1BQN B; 1RWW B; 3GIL A; 4DR3 F; 5D4L A; 2A2C A; 4CLF A; 4QQB A; 3PIP Q; 1FI4 A; 1V6H A; 3T9N A; 4CO1 A; 4CZC A; 1U1N A; 1U2F A; 1MSW D; 2ZIT A; 2QMU B; 3QJP A; 2NZC A; 4KHP J; 4RZR A; 1EET B; 1NJZ A; 4DPY A; 3TA2 A; 4MMO A; 4ZP8 A; 2D74 B; 1TKT A; 2ILZ A; 1KRP A; 2WW8 A; 1JB0 C; 4ZLL A; 2V2V A; 5GAD I; 1VIX A; 1U0S A; 4W92 B; 4WF9 Q; 3MMA A; 3FK4 A; 3R1H A; 5D78 A; 4B3T F; 4E8U A; 1VJW A; 2VDH A; 3GV8 B; 4MH8 A; 2DR9 A; 1SIZ A; 2PA8 D; 2HRY A; 4LIR A; 3V6H A; 3TAM A; 3KHG A; 1RTH B; 1T8E A; 3VAF A; 3QBC A; 2ZHB A; 2P5V A; 1MMD A; 1VOM A; 4H4O B; 4LF7 J; 2DGW A; 5HLF B; 4OZ1 A; 2KN4 A; 3C6U A; 2CFX A; 4EYI B; 1PIE A; 2MY7 A; 5FDL A; 1U24 A; 3FSI A; 1LWF A; 4H4M B; 3FBF A; 3GYG A; 1BXN A; 1CUL B; 2W8L A; 5E3R A; 5HQM A; 3VHQ A; 1RWK B; 4M95 A; 4WYL A; 4DFK A; 2W2Q P; 1WTB A; 3LGM A; 4B3R F; 2HLT A; 4JOU A; 3PYF A; 3GJT B; 1NME B; 4DL0 C; 5I3P A; 4URG A; 4OMF G; 4TLQ A; 4ZVU B; 2FQQ B; 3LQV A; 3RG6 A; 4F04 B; 5KFX A; 2NPI A; 4F25 A; 2W2O P; 2CG8 A; 4CO2 A; 1ZAW A; 1DLO A; 1IQZ A; 4L74 A; 1TTH B; 3Q2S C; 1VMB A; 1KTQ A; 3EVW A; 4HVZ A; 1U1R A; 1WEZ A; 3PYE A; 3SFG A; 4HL9 A; 4F3Q A; 4TY9 A; 2W4P A; 1AFI A; 6FDR A; 3C14 B; 2O3D A; 1UCN A; 2CPY A; 4YDD B; 4QIE A; 1T11 A; 3Q2T C; 2JLE A; 1XMO F; 2AMC B; 3QRR A; 1SBR A; 3R7S B; 2IDE A; 2FIU A; 4DR4 F; 4DLE A; 2EFP A; 2V5H G; 4KBI A; 1B3T A; 1H7W A; 4HLB A; 1U1K A; 4AYB D; 1FKO A; 4LR7 A; 1E6Y A; 1NND A; 1HR0 F; 3HK2 A; 3H59 A; 3V4I A; 3BQ1 A; 3KNA A; 3DCA A; 1SC3 B; 5AT1 B; 3NAI A; 1D9A A; 3CJ3 A; 2DGT A; 1X4D A; 2MGZ B; 4QYZ K; 1JLB A; 2CZV C; 3K17 A; 3TAR A; 1LV5 A; 1TKX B; 3SI8 A; 2E7V A; 4QWE A; 5H9F J; 4ED1 A; 5C42 A; 2QSW A; 3HVT A; 3LW5 C; 3DRS A; 1FK9 B; 2FDN A; 4DL5 A; 1CS4 B; 3DLE B; 3G82 A; 2LYV A; 4PG7 A; 4Y6I A; 4Y3C A; 3BEG B; 1ZM3 A; 3D66 A; 3RB0 A; 2DEI A; 2PMW A; 3SQO P; 4U6P A; 3PJX A; 3JTO A; 2KB2 A; 5JVG Q; 2VC0 A; 4Q0B B; 3VGS A; 2AX1 A; 3BGR A; 1P1L A; 1M5K C; 4UZB A; 2X3D A; 5CXT A; 3O2I A; 3AHP A; 1E6V B; 1W25 A; 4CYU A; 2XGP A; 5LJ5 Y; 3Q23 A; 1HNI B; 5D77 A; 1S6U A; 5BR8 J; 4MAK A; 2CQH A; 2F9D A; 4JI5 F; 4O4R A; 4OQJ A; 2ZDP A; 3RB4 A; 4M8L A; 2OD6 A; 2LU2 A; 2A1B A; 3MAH A; 3IR7 B; 2XS7 A; 1XMB A; 1U8W A; 4JI6 J; 1CBK A; 3R5D A; 4LRD A; 1ICE B; 8ATC B; 1FVS A; 3BKU A; 3IS9 A; 2GML A; 2IJF A; 1ZZN A; 4RWX A; 4JI1 F; 3E2E A; 2HGM A; 3GPA A; 1C4C A; 2BAB A; 1JLF B; 1UWB A; 1ZAV A; 3FMB A; 4EUV A; 4Q2M A; 4R5P A; 1NB2 A; 2VQF F; 3GR0 A; 4U7U K; 3KJV A; 2Y3Y A; 3ZZO A; 4KGK A; 2QIF A; 3KHH A; 3KFW X; 1WD6 A; 3OPK A; 2C42 A; 4P75 A; 5KT4 A; 1D9D A; 2DNQ A; 4J90 A; 3VAG A; 2RDI A; 3VAH A; 1X0F A; 5GMD A; 1M1G A; 1FRL A; 2E9T A; 2JEI A; 2XMJ A; 4OYB A; 4FN5 A; 5DRK A; 4ZVF A; 3OUY B; 2RS8 A; 4AND A; 2W24 A; 4U7C A; 3BJY A; 2MQN A; 3AQO A; 3HSJ A; 5BJR A; 2OTL S; 2KYZ A; 5G4D A; 1Q86 T; 4F4Z A; 4KQZ A; 4OFZ A; 3WX8 A; 4F3M A; 4NEY A; 4OZL A; 2ZZN A; 2IVF B; 4MYT A; 3H0P A; 1X4G A; 1RQ0 A; 1REG X; 2PGC A; 2RS2 A; 1C1B A; 5G0R B; 3HXM A; 3DDK A; 2K3I A; 1IN0 A; 4F4A A; 2J8S A; 3IBF B; 2KHC A; 3I0S B; 5H1S V; 1TEL A; 1UET A; 5B08 A; 4ID5 B; 2EBG A; 1WI8 A; 4UOF A; 2OGU A; 1GXT A; 2ZUG A; 1CEZ A; 5KFL A; 1B7F A; 2O01 C; 2BBE A; 2BXJ A; 1UMJ A; 3OJS A; 1WJ9 A; 5KT5 A; 4X84 A; 3OHA A; 4KFB A; 1XQI A; 3Q8S B; 2ZH2 A; 2Y1L B; 3TJA A; 4ED8 A; 3NGR A; 4A48 A; 4AL7 A; 3JTP A; 2VON A; 5KFJ A; 4B3M F; 4QIG A; 3J7Y U; 1QTM A; 3QIP B; 1L5U A; 3K5O A; 5IV3 A; 2IHR 1; 3HHD A; 3I87 A; 3KXD A; 2X1G A; 2B5J A; 5L38 A; 4RW6 A; 2WSC C; 3B82 A; 2WOM B; 1ZET A; 5CH7 B; 4OLO A; 1T05 B; 3RB3 A; 2OIH A; 3M8Q B; 3EX7 B; 4DV3 F; 4UUX A; 1U7L A; 2AYB A; 4TNO A; 1ZTT A; 2EC2 A; 1FJC A; 3E3X A; 4PG5 A; 2CQ3 A; 4PPD A; 2W2P P; 3Q8R B; 4ED0 A; 2F1F A; 3PIO Q; 2PFD A; 2L9W A; 2ZM6 F; 4LBI A; 3HFK A; 2CG4 A; 4AFF A; 1F9H A; 4DEZ A; 5CYM B; 2XNR A; 2PDA A; 1LQ9 A; 2LQJ A; 2ZBI A; 4IH5 A; 1G7C B; 2R7Q A; 4N8O A; 4KHP F; 2N4C A; 4OJ3 A; 4I7F A; 4NLO A; 3A12 A; 1FO1 A; 1HBO A; 2DGO A; 4CLU A; 4EBC A; 1UFK A; 2ZBP A; 2WB4 A; 3C15 B; 2XWY A; 3MMA B; 2I8E A; 4DQS A; 2I2Y A; 4ZDN A; 2BEF A; 3NGD A; 2DNN A; 3HSZ A; 1TK5 A; 5CYJ A; 2HHQ A; 4M5M A; 4QZV B; 1CC8 A; 3E8O A; 2W4C A; 2CYY A; 5KFR A; 2KDO A; 3RR7 A; 3TAM B; 2CJY B; 2WB1 D; 1S7I A; 3X3U A; 2K06 A; 2R7S A; 4LF7 F; 2FLP A; 3T3F A; 1N0U A; 1WWH A; 2B3T B; 3GV7 B; 4Y2M A; 1X4B A; 2P8I A; 3V81 B; 4EGL A; 3TQ1 A; 4C8O A; 2R7R A; 1DTT A; 5A8W A; 1F2H A; 4HTI A; 4FZV A; 2MJN A; 1WC4 A; 1CSJ A; 3RAX A; 1PO6 A; 4OYW A; 1EKR A; 1FWK A; 4B9M A; 4F0K A; 4X4R A; 2B9X A; 3L9Z A; 4C0H A; 2VFU A; 2GV1 A; 2AYE A; 2RU3 A; 2ATC B; 2VJV A; 2CJB A; 1F9F A; 3D1O A; 4Y0F A; 2ZWP A; 4JV5 F; 2FY8 A; 1NEE A; 4B9T A; 2UVR A; 1DLO B; 4FS1 A; 3DLH A; 3NGS A; 5DDR C; 4JP8 A; 3SCL E; 2HNZ A; 2BJ8 A; 3DMJ A; 3ZZP A; 1BQM A; 2EFG A; 2D3O 1; 3IFE A; 1B7Y B; 4X4T A; 4X66 J; 2E1M C; 3K57 A; 2AEM A; 2BRK A; 4OI1 A; 3US5 A; 4UY8 T; 2Z58 B; 1DFD A; 4HYK A; 1CPZ A; 4HEA 9; 4IH6 A; 1QVF R; 2WAQ D; 1B0V A; 2IYI A; 1JKH A; 2LMI A; 4IR9 A; 2FJD B; 4DU7 A; 2QLF B; 1N5Y B; 1FXL A; 3NNA A; 2IC3 B; 2HK3 A; 1FKO B; 4EO6 A; 4JI2 J; 2F5G A; 1UPM B; 5C24 A; 2DCU B; 3V4I B; 4NXM J; 4KV8 A; 2JZ5 A; 3BH6 B; 3EZO A; 1HMV B; 2XMU A; 3CDA A; 3NP5 A; 4O3R A; 2RH3 A; 3NS5 A; 2ZDO A; 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3CCE S; 1KQG B; 1APS A; 3GP9 A; 2KM8 B; 4O4G A; 4A8Y A; 4LF5 J; 1RWX B; 1Q16 B; 3J7Z 5; 1H2U X; 1N5S A; 2WTF A; 3U02 A; 4ZPB A; 1SJ4 P; 2FC8 A; 3PCO B; 1TFW A; 4LF9 F; 5L1L A; 1EHW A; 3MM5 A; 1P27 B; 5AE3 A; 5L9N A; 2R7T A; 5HK4 A; 4TLR A; 1WOP A; 1HWJ A; 3FCV A; 4QIW D; 1PKU A; 3H8Y A; 5GAG I; 2GNK A; 4DUZ F; 1Y5I B; 2HK2 A; 1KQK A; 4YB6 A; 1SC1 B; 4LIW A; 2JVR A; 2G2O A; 1TUV A; 4I56 A; 1RLD A; 3CJ5 A; 1VHI A; 3GSD A; 2CKW A; 2VQE J; 2VG6 B; 2DR8 A; 4KHM A; 4JI4 F; 1UPP A; 2IPO B; 4ZIT A; 1VLO A; 4OYP A; 3CCS S; 2AP6 A; 4E2F B; 1UTA A; 2V0N A; 5CQG A; 1TL7 B; 4FF1 A; 1I94 J; 4KFB B; 4DV1 F; 3FQK A; 2UUT A; 3MED A; 5BXI A; 3BPS P; 2W9C A; 4KPY A; 4GRS A; 1T3N A; 4QR0 A; 2FZG B; 3BB5 A; 3KYL A; 2XMK A; 1MWZ A; 3BQ2 A; 1TQL A; 1RT1 A; 1Y4Z B; 3OL9 A; 2X7I A; 3QGI A; 2JEF A; 1Q78 A; 3GTY X; 1HNV A; 2PD1 A; 4FPI A; 2KJV A; 1MU2 A; 5KG3 A; 3D3C J; 3DYA A; 2YH1 A; 3ISN D; 3P4U B; 1ZYQ A; 5HJX A; 5HQ8 A; 2J6S A; 1QUV A; 5KFM A; 2NXU A; 2V4R A; 2LQ8 A; 3P49 B; 2E5I A; 5JUM A; 3CJ8 A; 3UI3 A; 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