The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
|
sequence length |
92
|
structure length |
92
|
Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cacidases: caspases can cleave after aspartate, glutamate and phosphoserine residues.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-3 subunit p17
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
16
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D, F, H
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2016-02-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RWN B; 2CDR B; 2XZT B; 5IC4 B; 3R5J B; 4ZVS B; 1PAU B; 3GJS B; 2HBY B; 2Y1L B; 2H65 B; 2H54 B; 2QLJ B; 3R7N B; 2H48 B; 4ZVO B; 2H5J B; 2H51 B; 4ZVT B; 1RWM B; 2DKO B; 2Y0B B; 1RWK B; 3KJF B; 1BMQ B; 1RHR B; 2HBQ B; 2XYH B; 2XYG B; 2XZD B; 2P2C B; 1GFW B; 1ICE B; 1SC4 B; 1SC1 B; 2CNK B; 2CJX B; 1I51 B; 2C2K B; 3KJQ B; 4ZVU B; 1PYO B; 3IBF B; 2C2Z B; 2C1E B; 2QL5 B; 3RJM B; 3KJN B; 4ZVP B; 4DCJ B; 1RWP B; 3R6L B; 3R7B B; 5IC6 B; 2HBZ B; 3D6M B; 1RHJ B; 1RHU B; 4DCP B; 2CNL B; 2C2M B; 1RHK B; 3R7S B; 3P45 B; 1F9E B; 2H4Y B; 2CJY B; 1I3O B; 3IBC B; 2QLB B; 1QDU B; 2C2O B; 2FQQ B; 5K20 B; 4ZVR B; 3D6H B; 2CNN B; 1NME B; 3EDQ B; 3P4U B; 4LSZ B; 1RHM B; 3D6F B; 2XYP B; 1RWO B; 3GJQ B; 1RWV B; 2QL7 B; 2CNO B; 1RWW B; 3GJT B; 3EDR B; 2H4W B; 3QNW B; 3SIP B; 3NS7 B; 3R6G B; 3GJR B; 2H5I B; 4ZVQ B; 1SC3 B; 1IBC B; 2QLF B; 4DCO B; 1RHQ B; 2QL9 B; 4JB8 B; 1QTN B; 1RE1 B; 1RWX B; 2HBR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1J5E J; 2W25 A; 5FJ4 A; 2HUR A; 3D0G E; 3PAC A; 8AT1 B; 5HMX A; 3PO4 A; 1GXT A; 3LOU A; 2P5V A; 5KAK A; 4C3L A; 4LFA J; 1TL3 A; 4NLS A; 1B7F A; 4ZN1 A; 3KJF B; 1FJE B; 1GMW A; 2HHV A; 1U1R A; 1HWI A; 5KFN A; 3R5C A; 5KFT A; 4JYA F; 1HBN A; 2DNN A; 4RBU A; 1RB0 A; 4KBI A; 4ZVF A; 4A46 A; 2A1B A; 3CTR A; 2ZBP A; 2VQE F; 3DLH A; 4WU3 A; 2WOM A; 2Z4P A; 5K8P A; 1WSR A; 3ZXW A; 4DL0 C; 1KLM A; 2DO4 A; 4N76 A; 3DHX A; 2UP1 A; 4BWJ A; 4JV5 F; 2HPU A; 3NWR A; 2BE2 A; 3CCR S; 4O44 A; 4O3O A; 1OPZ A; 1BLU A; 2Y1I A; 1KFS A; 3CCM S; 1YWX A; 4NZ7 A; 2MY8 A; 5K8N A; 5KT2 A; 4WFA Q; 3EGN A; 1NK6 A; 2DR6 A; 1JLA A; 1PIL A; 4LRA A; 1DUR A; 4NZ6 A; 1R8B A; 5G0R A; 1RHQ B; 3V6K A; 1WDD A; 3BN7 A; 1RWN B; 4F0M A; 1PYS B; 2Q79 A; 2KRR A; 3PW2 A; 1SJF A; 2YKA A; 2E5H A; 4OYW A; 4ES2 A; 5LJ5 Y; 5L1L A; 2IM2 A; 4OJ3 A; 3CCS S; 4LIR A; 3QO9 A; 4K0K F; 3BGR B; 3M8Z A; 4R5P B; 1T9V A; 3NP5 A; 3BZQ A; 2LXI A; 1MLA A; 3NAH A; 1HHT P; 1RU2 A; 4LQ9 A; 5GAD I; 4KGV B; 2R42 A; 4N77 A; 4QWD A; 1N52 B; 4OHW A; 1SKW A; 3DXS X; 5EWF A; 1UWB B; 1S9G B; 3OL8 A; 2K06 A; 5J2P A; 1Z1Z A; 4IYQ A; 2DHG A; 1GK8 A; 1I3O B; 5F8J A; 3KDO A; 2A2C A; 3B6B A; 4KC5 A; 4OYO A; 3CGI A; 2W01 A; 1JB0 C; 2P6T A; 4X4Q A; 1YRX A; 5D4O A; 3P4U B; 1NH7 A; 3CDE A; 3HSG A; 1N0V C; 3Q86 A; 4CT9 A; 3A13 A; 2NPF A; 1N48 A; 1GTE A; 1KOH A; 4B3R F; 3D67 A; 4WBF A; 4XO0 A; 1FJC A; 2D74 B; 1N0U A; 4DL4 A; 4ZHR B; 2B9Y A; 1S1W B; 1IBC B; 3OR1 A; 4DPW A; 4F4X A; 1YBA A; 2A10 A; 1S6Q B; 2J8S A; 2ROE A; 3HT0 A; 2WVC A; 5ETN A; 3VGS A; 4MIW A; 1YRU A; 3H5Y A; 4J9P A; 2MKH A; 5HP1 B; 4GKK J; 2MQO A; 1N8R T; 1VQK S; 2B9W A; 3BYR A; 3KUE A; 4C48 A; 2UVV A; 3VAH A; 3MMB B; 4ZP9 A; 2OPS B; 2ZM6 J; 1S1T B; 4NLQ A; 3I82 A; 5LT5 A; 1N56 A; 3V2U C; 3A1Y G; 9RUB A; 3RJM B; 4IFY A; 5KFR A; 4DUY J; 4DU8 A; 5IXU A; 4FS1 A; 5C25 B; 2OIH A; 1VMB A; 5E0O A; 2GVD B; 2H4Y B; 4CO0 A; 1RYR A; 1KD1 T; 2WCX A; 1SIW B; 4DR1 F; 1XMO J; 5L46 A; 2RRB A; 2HWH A; 1RHM B; 2CZ9 A; 2KJW A; 1DQA A; 2E29 A; 1YHQ S; 4RL1 A; 1SCJ B; 2ZH6 A; 3CXC R; 3LP0 A; 3ZZU A; 3P6Y C; 2F9J A; 4U9R A; 4TYB A; 1BQN B; 3T9Z A; 3U1N A; 1W2B R; 1X5S A; 2MB0 B; 1DY3 A; 1YLX A; 2KL8 A; 4CM0 A; 1P27 B; 5F8I A; 4ELT A; 4JI2 F; 1RDR A; 4IG3 B; 2DHS A; 1AW0 A; 4RNF A; 3NRB A; 4O4G B; 1Q95 G; 4I7F B; 4XIU A; 2A3J A; 1Y5N B; 1N36 F; 1QD1 A; 2CPJ A; 1HWU A; 2FJA B; 1S9E B; 4RWX A; 3BKF A; 3D1H A; 3QWU A; 1VQ9 S; 1MRO A; 3D6M B; 5M2P A; 2AWZ A; 1NO8 A; 2IMW P; 1HYS B; 3ZZY A; 1WHY A; 1RGV A; 4GMK A; 4M5G A; 3T6J A; 2DNL A; 2MKK A; 1NJX A; 5HO4 A; 3G6E S; 4B08 A; 2UVR A; 1MN7 A; 1VC5 A; 2V69 A; 3MTJ A; 4URG A; 3H5S A; 5L1K A; 1BWE A; 2PA3 A; 2XUL A; 1YJT A; 3MFH A; 4DXL A; 1NKC A; 3WX8 A; 2OPR B; 1GTH A; 2V68 A; 1EP4 A; 1TL1 B; 1XWL A; 1AB8 A; 1FCA A; 3M9M B; 1RT5 A; 3JSY A; 1HQE A; 1NK4 A; 3TVZ A; 3M8Q A; 2N7C A; 2PFD A; 3IFE A; 2P9E A; 3CJ0 A; 5F41 A; 5KG4 A; 3Q2T C; 3KG0 A; 2VC1 A; 2KJV A; 5KFU A; 3UVJ B; 5A8W B; 1XJW B; 3DN9 A; 2XMU A; 4J91 A; 1F3V A; 4WFX A; 4DG1 B; 5L9N A; 2I38 A; 4DX8 H; 3GV8 B; 4DMZ A; 4Q43 A; 1XN9 A; 3Q8P B; 3DGV A; 1VQM S; 2APO A; 3W9I A; 1HIY A; 4X4P A; 2WB1 D; 4P7T A; 5BYQ A; 4ZLP A; 4LVN P; 2HVZ A; 2ZBC A; 4P9S A; 3SDE A; 4NLT A; 1HBU A; 1JLG A; 5D15 A; 1UVM A; 4WP8 A; 1B64 A; 3TWZ A; 2ZD1 A; 4CLF A; 4J37 A; 4U95 A; 4DPU A; 2V8P A; 1LFW A; 3HZE A; 3MEG A; 1RAF B; 3NS7 B; 2DR9 A; 1SQF A; 3RR8 A; 3HCX A; 2VG6 A; 2HND B; 2CJA A; 4NRU A; 1Q81 T; 2IRY A; 3M9O B; 1QAY A; 1S6P A; 2W8K A; 1JLC B; 4PQU B; 3VZI A; 2OPQ B; 3GSD A; 2X3D A; 3M6W A; 2WW4 A; 4LF8 J; 2HHS A; 2O3D A; 3DI6 B; 3FK4 A; 2BDP A; 2XHC A; 4URQ U; 2BAB A; 2W9A A; 4AL5 A; 2UUT A; 4Z7Y A; 3ENQ A; 1TL7 A; 3R9L A; 1J2V A; 1VRQ C; 3I4H X; 1HI0 P; 3CMA S; 3BSN A; 5JXS A; 4MKA A; 4WZM A; 3BO4 A; 3SQO P; 3AFG A; 3CT9 A; 1RHJ B; 4K4T A; 2R2T A; 1S1V A; 1F5B A; 1TAQ A; 5FLX Y; 2R7X A; 2W2Q P; 2DT9 A; 5GAE I; 1WOO A; 1M1H A; 1WNE A; 3N4W A; 1YZ7 A; 3OVB A; 4DV7 F; 1YJ9 S; 2VOO A; 2AQ4 A; 3ET6 B; 5FDL A; 4FXV A; 1XC9 A; 2J0W A; 3Q24 A; 5F9N A; 2AEM A; 2JZ5 A; 3NNH A; 1UEK A; 1CBK A; 2JLG A; 2J7W A; 3B8H A; 3NGD A; 2QSW A; 3MAH A; 2MKJ A; 2D7S A; 4DFK A; 3GPA A; 1RAH B; 2XC9 A; 3R3T A; 4UOH A; 3BV8 A; 3W2V A; 1TK5 A; 3QRR A; 2R9L A; 4IG0 B; 4UQT A; 2MZQ A; 3KJQ B; 3OHA A; 5CQG A; 3HVT A; 1MMN A; 3CDU A; 2EBE A; 4QIE A; 3DOM B; 1YIJ S; 4OLO A; 1NKE A; 4TU9 A; 2RIL A; 3ITH B; 2ZVI A; 4USV A; 1VQP S; 4ZLL A; 2HQF A; 5J1E A; 3JSM A; 3W2W B; 2DIT A; 2J9D A; 2UU9 F; 3IM9 A; 1BQM A; 2B4V A; 2XZW A; 3H0P A; 2GGP A; 5B0E A; 5F8H A; 3GJT B; 4DSE A; 3W61 A; 4DR5 F; 2HS3 A; 1HW9 A; 1AZS A; 3TZY A; 4X84 A; 2VDI A; 3JS9 A; 3IA0 A; 4A8O A; 2XSF A; 3TAN A; 2NSC A; 4USU A; 3AXM A; 4U8Y A; 1S0O A; 3MDF A; 3KUH A; 3VQS A; 3G6X A; 4OHY A; 2UUW A; 1UET A; 3CE8 A; 2VA3 A; 2C3Y A; 3C15 A; 3EZO A; 3EGZ A; 4HHJ A; 3HP6 A; 2DCL A; 2VKZ G; 3NMA A; 5B0D A; 3BO2 A; 1JLB B; 1PO6 A; 1UPM B; 2PN6 A; 1DQ8 A; 2UVU A; 3DDI A; 3J7Z T; 1XMQ J; 1UMJ A; 3K8V A; 5B08 A; 3KLH A; 3V81 B; 2FZG B; 2QL5 B; 4UW2 A; 4A8K A; 5HAO A; 4RNM A; 3HM9 A; 4CLP A; 2DVI A; 2XY6 A; 4J9M A; 1JJ2 R; 2R7R A; 1S6O A; 1VRU B; 2QLB B; 3SV3 A; 5LJ3 Y; 4MK9 A; 3DGP A; 4AFF A; 3FJ2 A; 1HHQ A; 4RW8 A; 2GNK A; 2DIU A; 4MMO A; 4O3R A; 3T6B A; 3J80 U; 3OPK A; 1L3T A; 4ZJO A; 4YY3 F; 1JLC A; 1R7I A; 3MED A; 1E6Y B; 1HMV A; 2GQQ A; 1XNQ J; 1BD6 A; 2OPP A; 3FCH A; 2E5L J; 2YQ3 A; 3MCO A; 2GV1 A; 1VQ5 S; 2VA2 A; 4N47 A; 3MMA B; 3BJY A; 3FBE A; 1N6Q B; 2B5J A; 2V8H A; 1BQX A; 3CCE S; 4ZPC A; 3M2R B; 2HNY B; 4E0D A; 1CC7 A; 3Q8Y A; 3SEO A; 4URS A; 3G4S S; 2YY3 A; 4FPI A; 1NDL A; 2IM3 A; 5L38 A; 4FKY A; 1ZYQ A; 2XTJ P; 3I9Z A; 2WZ1 A; 3W5X A; 4CO5 A; 3MTK A; 1M90 T; 1HNV A; 2B9E A; 2KT2 A; 2FLL A; 1IKY A; 1B0V A; 4CO4 A; 1UVN A; 4NLX A; 3DLG B; 3CSK A; 2B6A A; 3SYZ A; 5GAG U; 1WF0 A; 3DC2 A; 1F1B B; 3QAE A; 5DM6 Q; 3CIM A; 1IBM J; 2V67 A; 2QO3 A; 5HAT A; 1TK8 A; 2QL7 B; 4L3K A; 3GIM A; 4FYY B; 3PW5 A; 2ASY A; 4JI4 J; 4OJH A; 3PFO A; 2OAU A; 2J0S D; 2AEF A; 1T95 A; 3L3C A; 3T1Y F; 5F9L A; 3TNV A; 3QID A; 4ZIV A; 1V9O A; 2OI2 A; 3J7Y U; 2ZWO A; 3BR8 A; 2QX0 A; 4WWS A; 1CQM A; 2VH7 A; 3TA0 A; 5EGY A; 4MTP A; 1MMD A; 5DG7 A; 3KMS A; 3Q8U A; 4Y0F A; 1JKH A; 3QFW A; 2HVD A; 4OJ1 A; 4FYD A; 1OWX A; 1DZ5 A; 3WC0 A; 3RRH A; 1PKU A; 2EEY A; 3BSC A; 1J5E F; 4TKT A; 2FJD B; 4NWB A; 1S1U A; 1NM2 A; 5BXI A; 1LXN A; 3KFW X; 1RT4 B; 2XSJ B; 2SXL A; 5D4L A; 4LFA F; 1Y5L B; 4DQP A; 2NCK L; 1M5H A; 2RRN A; 4FYW B; 3OHB A; 4X4T A; 3LF0 A; 5ETO A; 3UNG C; 1Y11 A; 1M1K T; 3J7Z 5; 3TAQ A; 2XY7 A; 5H9F J; 3SV4 A; 5MLC V; 2YX1 A; 5K14 A; 2QMU B; 3H42 A; 2FYX A; 2MTL A; 1Z2L A; 4P2M A; 3OUY A; 2OHD A; 4KGX B; 2ZUG A; 3KXD A; 1SKU B; 3DLJ A; 4HL9 A; 1UVK A; 1JXV A; 4TY8 A; 2RJZ A; 1RAC B; 1RT6 A; 1RT7 B; 3MM9 B; 2E1P A; 2HFV A; 4ZVO B; 2RKI B; 5B0C A; 2JLF A; 3EMT A; 3BRE A; 3UDC A; 2RAQ A; 1TZ0 A; 2GIR A; 2X51 A; 4AQY J; 2G2O A; 3C6T B; 2XYG B; 3PCO B; 1GT8 A; 3GE9 A; 3KJV A; 3P5T L; 3EVM A; 5DS7 A; 4U7U K; 2IYG A; 2Q1L A; 4PG6 A; 3PEH A; 4DPY A; 1NHU A; 1VJQ A; 1DQ9 A; 2W1B A; 3MM7 B; 5B0B A; 3LO3 A; 2DBB A; 5HVG A; 2BXJ A; 1ARO P; 4OMF G; 2HRT A; 5LM7 E; 1XR6 A; 1LV5 A; 5C24 A; 2XNQ A; 2YNI A; 3RBX A; 5ETV A; 5E7O B; 4YS2 A; 3R6G B; 4YHH J; 2R4F A; 3RU0 A; 4M5H A; 2RU9 A; 2XCA A; 1R3N A; 5J1P A; 4BHQ A; 5B0G A; 2Y9H A; 2IM0 A; 1S57 A; 2HNZ B; 3PW7 A; 2GO9 A; 1FKO B; 4FDF A; 3KLE A; 1FRJ A; 1CJV B; 1JNZ B; 3IGV A; 4IDK B; 1LWC A; 3EVW A; 3LP2 B; 4DI6 A; 1D8Z A; 5KG6 A; 5ITH A; 5IZH A; 1SC1 B; 3W66 A; 3NGS A; 2DGT A; 5AT1 B; 3CJK A; 4M5N A; 1RAO A; 3QIP B; 4QYZ K; 1NDC A; 1SL0 A; 1UZH A; 3G82 A; 1VK8 A; 2W4D A; 1GX6 A; 2FJX A; 4BWM A; 2JVR A; 4GKJ J; 1HPZ B; 3GYX B; 3K57 A; 1KR4 A; 5MAO A; 4GKK F; 2HHT A; 4LRC A; 4QIW D; 1QDU B; 1KQS R; 2ZM6 F; 2CNN B; 4PG4 A; 3CVK A; 2HMI A; 2IA0 A; 3OSN A; 3PTW A; 2CQB A; 1SUQ B; 3BBB A; 5KFX A; 3HHL A; 4OLP A; 4CM2 A; 5CYJ A; 4F3Q A; 2I8E A; 3I5A A; 4P2X A; 1CPZ A; 4NXM J; 2RF2 A; 4HH0 A; 1FD8 A; 1S79 A; 3DLK B; 5A8R A; 2ZH5 A; 3SSQ A; 3JXO A; 4ZCI A; 2XG8 A; 1RXO B; 3IS9 A; 1EIY B; 1S1X A; 3EUN A; 1GXU A; 1S0V A; 3PO5 A; 5C2G A; 1WOP A; 1UW4 A; 4PPZ A; 3CJR A; 3NG8 A; 1VQO S; 2NUU G; 4E2F B; 4K8R A; 4Y6I A; 5CAB A; 4CLS A; 3SSR A; 1VIX A; 3PY8 A; 2VJU A; 2GVZ B; 4OHV A; 2FLP A; 3ILI A; 4L3N A; 3BGF A; 2ROP A; 3FEY B; 3M7V A; 3U1M A; 3I31 A; 4LBH A; 3DOL B; 5JVH Q; 3M30 A; 1WF2 A; 3ZNJ 1; 2V34 A; 4NYO A; 2M88 A; 4OYI A; 2ATC B; 3T1H F; 1VDH A; 4F4Y A; 2LU2 A; 1RWO B; 2CNO B; 2KRB A; 3AOD A; 3L9Z A; 1TUV A; 3JQM A; 4CLU A; 1FWK A; 4WE1 A; 2UXD J; 2HHQ A; 2AGQ A; 1RT7 A; 2Y3Y A; 5E3C A; 4OI3 A; 3MZI A; 1WC0 A; 4RW7 B; 2VFR A; 3UFC X; 3PZP A; 4H4K A; 2GJI A; 3G8S A; 3C6T A; 4NLG A; 2JSX A; 1R0B G; 2ZH1 A; 3HZG A; 3B54 A; 2I5J B; 2VFU A; 5D6G A; 3K8W A; 4HEA 9; 4C8K A; 2MGZ A; 2Y0B B; 2U2F A; 1X4G A; 2NYI A; 1ZPW X; 2ALY B; 2XZD B; 3AB4 B; 2BAN A; 3KK2 B; 2DRA A; 3QLH B; 3ZNU A; 5HLF A; 1SI9 A; 1FX4 A; 4J9R A; 5JJB A; 1R8A A; 4PYD A; 1XMB A; 1SC6 A; 4IFV A; 5SZT A; 1UJ5 A; 3C6U B; 2CPX A; 1G3O A; 5DDP C; 2HK2 A; 2K7K A; 3T19 A; 3FSX A; 3DLE B; 1U4B A; 3N6L A; 3DRS B; 2EK6 A; 4M1K A; 3DRY A; 2KVI A; 1RAI B; 3IAM 9; 3RYL A; 4LF4 J; 3M2V A; 4C11 A; 4JV0 A; 1S49 A; 2LP4 A; 1RBL A; 3NCQ A; 3VCD A; 4P74 A; 4RJV A; 1FRL A; 3VAJ A; 1IR0 A; 2F9D A; 2FB0 A; 2V8G A; 1T9U A; 3DM2 A; 4KFB A; 1XNR J; 3HKZ D; 1CC8 A; 3AB2 B; 1T02 A; 1TKT A; 2E7V A; 5EUH A; 3UQS A; 3LPY A; 3QIP A; 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