The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| molecule keywords |
Caspase-3 subunit p17
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| publication title |
Cacidases: caspases can cleave after aspartate, glutamate and phosphoserine residues.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
16
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D, F, H
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.56: Caspase-3. |
| pdb deposition date | 2016-02-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FQQ B; 3P4U B; 4DCJ B; 1RHK B; 2QL7 B; 1RHU B; 2CNO B; 3EDQ B; 3GJQ B; 1RE1 B; 2HBQ B; 2CJY B; 2Y1L B; 4ZVS B; 2H5J B; 1SC1 B; 2HBZ B; 1ICE B; 2CNN B; 4ZVR B; 2H54 B; 2XYG B; 3GJT B; 4LSZ B; 2CNK B; 3RJM B; 2H4W B; 1SC4 B; 5IC4 B; 1RWO B; 2P2C B; 4DCP B; 1RHR B; 3SIP B; 4ZVT B; 2CNL B; 3R7N B; 1RWK B; 4ZVU B; 1IBC B; 2C2M B; 5IC6 B; 3KJF B; 2H48 B; 1RHQ B; 2CJX B; 4ZVO B; 1SC3 B; 1RWV B; 2H51 B; 4DCO B; 3R7B B; 3D6M B; 1I3O B; 3IBC B; 1GFW B; 3IBF B; 1PYO B; 1RWX B; 2QLF B; 3GJR B; 3EDR B; 1I51 B; 1RWP B; 2HBY B; 3D6F B; 2QL9 B; 2CDR B; 3NS7 B; 2C1E B; 2C2K B; 4ZVP B; 2XZT B; 3D6H B; 2DKO B; 1NME B; 3R5J B; 2XYP B; 1QDU B; 2Y0B B; 1RHM B; 2HBR B; 1RWN B; 1RWW B; 2QLJ B; 3R6L B; 3KJQ B; 3GJS B; 1F9E B; 3KJN B; 3R7S B; 2H5I B; 3R6G B; 5K20 B; 2QL5 B; 1RHJ B; 2XYH B; 2XZD B; 3QNW B; 1PAU B; 2C2Z B; 3P45 B; 4JB8 B; 1BMQ B; 2H4Y B; 2QLB B; 1QTN B; 1RWM B; 4ZVQ B; 2C2O B; 2H65 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VAK A; 4YS2 A; 3EGW B; 2CPD A; 2YKN B; 2CRL A; 2IC3 B; 4XK8 C; 4IYQ A; 1K8A T; 2RRN A; 3KLI A; 4ECR A; 2M8H A; 2JEG A; 4DSI A; 5DO2 A; 2M9K A; 4PZV A; 3SCJ E; 2DEI A; 4ZIW A; 4TQS A; 3TW0 A; 4FXD A; 1X4A A; 1N36 J; 3HCX A; 3ZTR A; 3EVM A; 3THP A; 2B5J B; 2MKI A; 2YWW A; 4JI3 J; 2IFX A; 2WCX A; 3PY8 A; 5K8O A; 2UUB J; 2WK4 A; 3EXC X; 2W2O P; 1VI7 A; 3M2U B; 3E01 A; 5KT5 A; 4RZR A; 2MZR A; 5ETL A; 3T5H A; 2XS7 A; 5F41 A; 2Y1J A; 1KD1 T; 1RT4 A; 2FHM A; 1RTJ B; 1ZBT A; 4WXW A; 2FY8 A; 2JVR A; 2UP1 A; 2EBE A; 2DH9 A; 2KN4 A; 1UW4 A; 5H9E J; 4LFA F; 3MUV P; 4IQX A; 4O0N A; 5B7W A; 1FCA A; 1RQ0 A; 4DUY J; 4PCQ A; 4F2R A; 2D69 A; 3CW2 C; 3RB0 A; 3MM8 A; 5AE2 A; 1BWV A; 2ABY A; 3K5L A; 3D0G E; 3VQS A; 2AKW B; 3D1H A; 3E51 A; 2DIS A; 1DAX A; 1LEO A; 4DCP B; 3EZ5 A; 3ZNJ 1; 3PDN A; 4KPC A; 2XWX A; 1YVF A; 1EET B; 3OL8 A; 1RT3 A; 1Z4U A; 3UD5 A; 3BO2 A; 4KC5 A; 1BC6 A; 5FLX U; 4CLZ A; 1JK9 B; 2FGO A; 5KFI A; 3K5N A; 2GA7 A; 3DC2 A; 3DI6 B; 2XBP A; 1BQM B; 1AYE A; 5KTQ A; 1RWX B; 3D3B J; 3Q24 A; 1X9S A; 2WVD A; 5KT7 A; 2XHC A; 1U49 A; 4C4W A; 3WQP A; 3W1Y C; 3KK1 B; 4WTO B; 2ZH4 A; 2BJ9 A; 2E9Z A; 4YY3 J; 3Q22 A; 2XYP B; 5F8G A; 1W26 A; 2G2Z A; 3EYZ A; 1SKS A; 1E6Y A; 3TVK A; 2P9C A; 3PJ9 A; 1T94 A; 1Q82 T; 4DL7 A; 2RE1 A; 3BKU A; 3IR5 B; 2QMW A; 2YQ1 A; 4M63 A; 3QGP A; 4YB7 A; 4O44 B; 5C42 B; 2PII A; 3QGI A; 4F4Z A; 1VQ9 S; 2GW8 A; 2UUC J; 2QGF B; 4USH A; 2KDO A; 5IM0 A; 4F36 A; 4QU7 A; 1M1K T; 2UUT A; 3LWL A; 1MLA A; 2E5H A; 5F3Z A; 3PKY A; 1L3S A; 4I7F B; 1MU2 B; 1CQN A; 1WHW A; 4Y28 C; 5IC4 B; 5LL6 d; 2OKQ A; 3AFG A; 3D54 A; 1HA1 A; 2BX6 A; 4FXW A; 4HHJ A; 4ZPV R; 4X66 J; 5BR8 F; 1M5P C; 4J9V A; 2AGP A; 5E3C A; 1NDP A; 4UT4 A; 4DL0 C; 1N8R T; 1NZA A; 1VBZ A; 3KHR A; 4ECU A; 1RT2 B; 5C2C A; 3AJ2 A; 2CQ1 A; 1MW7 A; 3C3L A; 1OQ3 A; 2VBW A; 1RT6 B; 1E6V B; 3SCI E; 3ZTS A; 2DRD A; 2CJA A; 2C2K B; 4U8Y A; 1FVS A; 1X4D A; 3TOQ A; 5B09 A; 2NSB A; 2ROP A; 5D0H A; 4JI2 F; 1X8D A; 4E2F B; 1SH0 A; 1IN0 A; 2DNM A; 4QYZ J; 5IT0 A; 3VZH A; 1QUV A; 3QWU A; 1X0F A; 4B3O A; 1SC6 A; 3H98 A; 4ED2 A; 2HLT A; 2JX2 A; 1RWU A; 5E3R A; 1FVQ A; 1H72 C; 3P5B P; 3SBM A; 4R8U B; 2QFJ A; 1S6U A; 3GIJ A; 3E2E A; 4EO8 A; 3NAH A; 4UF4 A; 3AQP A; 2HQG A; 1EKR A; 2LDI A; 3E3X A; 4IR1 A; 4PG6 A; 4C0O C; 1C0T A; 5J1E B; 3MED B; 2KTQ A; 4WCE Q; 4L76 A; 1BGX T; 5J2M A; 1ZS6 A; 3T1Y J; 3A8K A; 3VGV A; 4N56 A; 2PMZ D; 2EFN A; 3QSY B; 5IFM A; 2V94 A; 2VPY B; 4OYW A; 5AXL A; 2CQ4 A; 1HQE B; 2LYV A; 5DQG A; 3IS9 B; 4LRE A; 1UL3 A; 2HHQ A; 1P9Q C; 1WOS A; 5LM7 E; 2E1A A; 5ITH A; 4CO4 A; 3W60 A; 3T1A A; 4WF9 Q; 2CPH A; 5AJ3 J; 2Y8W A; 5A6P A; 3NNH A; 2GVZ A; 3LP1 B; 1QVF R; 3GP9 A; 3OPK A; 3MM6 A; 2LLZ A; 2YWE A; 2H65 B; 1RLD A; 1XR5 A; 2ZBC A; 3UDV A; 3Q89 A; 1F5A A; 4Q0B A; 2N3O A; 1NK0 A; 2ZE2 B; 3R97 A; 2J8S A; 5A8R B; 2AJ4 A; 5T7L B; 2PFF B; 2FIU A; 1NUE A; 2G0C A; 3OR2 A; 1U6B A; 4QPT A; 3C6T B; 4DQI A; 3HVT B; 1R8P A; 3MR5 A; 2OEK A; 1GXU A; 4DSK A; 3BBF A; 2BJ3 A; 1VLO A; 2MGZ A; 1TP7 A; 1HHQ A; 4OI6 A; 5B0C A; 5I42 B; 4LF6 J; 5IQQ A; 5IWA F; 4ICL B; 2F7V A; 4CP5 A; 1S59 A; 3DDN A; 4QOT A; 4M5J A; 2KVQ E; 1DLO B; 3LAK A; 4YDX A; 4DV1 J; 3AD7 C; 2MKY A; 1MNE A; 4C6A A; 3DLG A; 3QFW A; 1N48 A; 2JZ5 A; 3V2U C; 3MFI A; 1FRI A; 1X4E A; 1U02 A; 1WG5 A; 2VB6 A; 5K5M A; 3QNW B; 4DR5 J; 3OFH A; 2CUY A; 2K8G A; 5HSP A; 2L48 A; 4NEZ A; 1URR A; 2HAI A; 3I4P A; 2M8D B; 2YWK A; 2HMI A; 3HHL C; 3VHQ A; 4OI2 A; 5HQ8 A; 2WSC C; 3RZA A; 4QZV B; 1OJ4 A; 5B08 A; 2A2D A; 5KG0 A; 1UVI A; 2OI2 A; 3DOL B; 3DLB A; 1OY6 A; 4X4T A; 3TUJ C; 1UJ6 A; 1F60 B; 2CQG A; 5AE3 A; 3W66 A; 4CO5 A; 4RPF A; 3CF5 Q; 4MKB A; 3G2X A; 1OMS A; 4S0M A; 3CVK A; 4DV3 F; 5DDO C; 4QBU A; 3MAA B; 2G0I A; 2AT1 B; 2ZNY A; 5HO4 A; 1XR7 A; 2J76 E; 5ETM A; 4YN3 B; 1RWP B; 4NLY A; 3M8Q A; 3BQ0 A; 2DR6 A; 1HWL A; 5HAT A; 5K14 B; 5T41 A; 2DKO B; 4U8V A; 5D0E A; 4I69 A; 3R3T A; 2W2M P; 2L9N A; 2A10 A; 4G1P A; 1BQN A; 3GR1 A; 4EMD A; 1AFI A; 2UUW A; 5I3U A; 4TYB A; 2V2Q A; 2MKJ A; 2JWN A; 1GXT A; 5FJ4 A; 1HMV A; 2AZ1 A; 3K58 A; 3R9L A; 2E7X A; 4KO0 A; 2SXL A; 1AB8 A; 1X5O A; 1HHT P; 2WVC A; 2VG7 B; 2MKK A; 5H1S V; 3ETO A; 2JNJ A; 2DPI A; 2YNI A; 2EBG A; 1Q5Y A; 4ZVR B; 1RBO B; 4IG0 A; 3K0J A; 2ZD1 A; 1NH8 A; 2FVQ A; 3CE8 A; 2MST A; 1T9W A; 5LSR A; 1K0T A; 1NDK A; 3EVO A; 2BKO A; 1FRH A; 4IRD A; 4DL2 A; 3NS5 A; 4P2S A; 4JV1 A; 3ZFV A; 1WJ9 A; 4RWX A; 2AGQ A; 3H20 A; 2XLI A; 3TNV A; 1H0H B; 2ZZM A; 4ATN A; 1IWA A; 1WEL A; 4ZLN A; 1FJ7 A; 4K8R A; 1U1Q A; 4GKK J; 2F63 A; 3IXQ A; 1ZAW A; 3UNG C; 2J0Q D; 3DRX A; 2HND A; 1LWC A; 1RWN B; 2CVI A; 2Z4P A; 3I5A A; 1FJG J; 5CXT A; 2DIU A; 5M2R A; 4QIF A; 4J90 A; 1CLF A; 1Q86 T; 4A4J A; 2XC9 A; 3K2Y A; 3ILO A; 2XMU A; 2VQF F; 5A6W A; 1IKV A; 1RUS A; 3KFW X; 1XMO J; 2FVR A; 1BXN A; 1U4B A; 1B7Y B; 4C0H A; 2DH7 A; 4U7U D; 1RAD B; 2MSS A; 3M8S A; 3IG1 A; 5A8W B; 3MM5 B; 3KK3 A; 4OLP A; 5EWF A; 1WWH A; 2FLO A; 1YIJ S; 2ZM6 F; 4IFY A; 3FBE A; 4JBC A; 3UO0 A; 4OX9 J; 4F26 A; 1S1T A; 3ZZZ A; 1U2R A; 1FFS B; 2KZM A; 4U7C A; 3QT8 A; 1CJK B; 1U2C A; 2HZC A; 3H5S A; 1KVI A; 1REV B; 3R7S B; 2HK2 A; 2LQ9 A; 4QPX A; 3GCX P; 1WEY A; 2J9D A; 5DDP C; 4P10 A; 3M2V B; 1S1U A; 2DCU B; 4ECY A; 2W2Q P; 1DRZ A; 3IRX A; 1IJE B; 2QE5 A; 3CUL A; 3Q8R B; 2HLU A; 4MMO A; 3BF4 A; 3T6J A; 3W62 A; 2AHO B; 2HQC A; 1S12 A; 1HKA A; 3IRW P; 3GWC A; 1ZTW A; 2XYG B; 3QQC D; 4OYM A; 1RU2 A; 4DQP A; 2UUA F; 2V4Q A; 4X4V A; 5DZ6 A; 1B0P A; 4RUC A; 3D2W A; 1N34 F; 4UY8 5; 4LF9 F; 3TZX A; 4C7Q A; 2FB0 A; 5DG7 A; 1S72 S; 1HQU B; 1TK8 A; 2HHT A; 3KLI B; 8ATC B; 3GIR A; 1KWM A; 3EPG A; 3Q83 A; 4J5O A; 4FF1 A; 4QR2 A; 4LRD A; 4YB5 A; 3NBP B; 4OX7 A; 3SI8 A; 2B3T B; 2QX0 A; 4BS2 A; 3DLJ A; 3F0N A; 3PYF A; 4NA3 A; 4UY8 T; 2K3K A; 4C9D A; 3D6H B; 3BGU A; 2HVE A; 3IR7 B; 5B0G A; 2WSE C; 3KLH B; 2DGV A; 1U1M A; 2G1D A; 2VPW B; 2EFQ A; 4PYA A; 1IR2 A; 2YNF A; 3CJ2 A; 1CPZ A; 3B82 A; 4I67 A; 1KRP A; 1FEH A; 3E01 B; 2GVD B; 2WTF A; 2HBQ B; 3RBE A; 2XMT A; 2HHU A; 3GV7 B; 4OYO A; 4CO2 A; 3EE3 A; 3OTC A; 5KFG A; 3UWT A; 3R5G A; 1WC4 A; 1ICE B; 3ILI A; 2XI3 A; 4AL5 A; 4ECX A; 1EKS A; 5F0W A; 2CFX A; 4L6V 3; 3KJV B; 4I2P A; 5JVG Q; 1RT7 A; 3BPS P; 5HVG A; 6FDR A; 4ZVT B; 2HS3 A; 5K9F A; 4IUF A; 2GV1 A; 1RB0 A; 3PYE A; 5JVH Q; 2J9D E; 1RTD A; 3DRS B; 3CJK A; 2IMO A; 1T03 A; 1YJR A; 3BJY A; 1A0O B; 3GYG A; 5EX3 A; 3HSG A; 2MHN A; 1FK9 A; 1N5Q A; 2FLP A; 1VIX A; 4JI0 F; 3DMJ B; 4HYK A; 2ZH6 A; 4QWC A; 3D5M A; 2D9O A; 4UST A; 1BY9 A; 3KUE A; 1QSY A; 4K5R A; 1RBA A; 2DTJ A; 4HAC A; 3NY0 A; 2BZ2 A; 2E5J A; 3M8R A; 5EX0 A; 1NSA A; 5KFP A; 2FJA B; 5CQG A; 4HHU A; 4O3S A; 3UR3 C; 3L3C A; 2XMV A; 2COL A; 1FXD A; 3G4S S; 5GAG I; 3PFE A; 4DZD A; 3MI7 X; 4A46 A; 3MPV A; 4C3K A; 3QID A; 3BSA A; 5GAE I; 3DLE B; 3DM2 A; 3R7N B; 1Q7Y T; 1QTM A; 1SH2 A; 1WKK A; 3UN2 A; 4B3T J; 1HBM B; 3UN5 A; 2JEF A; 4RNN A; 3QO9 A; 1SQE A; 3J7A 1; 3MM7 A; 5F8J A; 2R7R A; 1JB0 C; 1JXE A; 2MEW A; 2HPU A; 4P72 A; 5BYS A; 3N5F A; 3M7V A; 1DQ8 A; 1WC1 A; 3OVS A; 2A6M A; 3NGK A; 4A48 A; 3Q8S B; 2Z2L A; 2ZH8 A; 2XZW A; 5KFN A; 1FTC A; 3KK2 B; 2BMB A; 1TVR B; 4ES2 A; 1UET A; 4RU2 A; 2MTL A; 3T19 A; 3D0I E; 4ZCM A; 5LT5 A; 3TRG A; 3CCQ S; 2KVI A; 4X65 J; 5EWE A; 3CC7 S; 3C15 A; 5HVH A; 4G1Q A; 2RDD A; 1F0X A; 1WUU A; 3FRZ A; 2EW9 A; 4RUH A; 4NZ0 A; 3AD8 C; 4I6Y A; 4X64 J; 4F3M A; 2OFH X; 1S0M A; 1RT1 A; 3RB4 A; 2A0F B; 1TL5 A; 2L3M A; 4B3O B; 2GJ2 A; 1VS3 A; 2J9C A; 3BBB A; 4ELU A; 4OQJ A; 4H4M A; 5KG5 A; 1RI7 A; 2D7S A; 3K5O A; 4ENO A; 1X4F A; 2CJX B; 1JLG B; 3HHN B; 3BV8 A; 1NKB A; 1S4F A; 4AQY J; 4QQB A; 3BGO P; 4CH7 A; 1NM2 A; 2EK1 A; 1TKT A; 1TU0 B; 1VBK A; 2RIJ A; 1U1R A; 1EJ7 L; 4KRW A; 4JI1 J; 1VOM A; 4IG3 B; 1MN7 A; 4Q5V A; 1M5H A; 4H4O A; 1FDA A; 2YY3 A; 1C0T B; 3OUY A; 1ACM B; 2ZBP A; 2C3U A; 4DZ6 A; 2E1R A; 2I0X A; 2DRA A; 1D0E A; 2DHG A; 3H42 A; 5LOQ A; 3PNI A; 5HMX A; 4DR3 F; 1PJ6 A; 4KGX B; 3MMJ A; 3W2W A; 2WAQ D; 3HZE A; 5IT4 A; 3T5L A; 4OHW A; 3C8Y A; 2ZKU A; 2ZH3 A; 2DGS A; 2KRR A; 3QGH A; 1DTT A; 1RAH B; 1ZZF A; 2EKY A; 2GVZ B; 5F3T A; 3KG0 A; 3ZZT A; 1M0S A; 1NAQ A; 3T9N A; 5DGB A; 3MEC B; 1V3Z A; 4FNH A; 5GVQ A; 3W65 A; 4B17 A; 2LVW A; 3HP6 A; 4Q0B B; 3H4B A; 4FF2 A; 3PEH A; 4CCH A; 4R5P A; 1JMT A; 1VJW A; 4KH1 B; 2BXJ A; 4C8K A; 2EG1 A; 2I5J A; 3OR2 B; 5A76 A; 4TN2 A; 4WU2 A; 2X7I A; 5DJB A; 2UXD F; 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