3N5LA

Crystal structure of a binding protein component of abc phosphonate transporter (pa3383) from pseudomonas aeruginosa at 1.97 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
DQPVINFGIISTESSQNLKSIWEPFLKDMSQQTGYQVKAFFAPDYAGIIQGMRFDKVDIAWYGNKAAMEAVDRAHGEIFAQTVAASGAPGYWSLLIANKDSKIDSLEDMLANAKSLTFGNGDPNSTSGYLVPGYYVFAKNNVDPVKAFKRTLNSSHEVNALAVANKQVDVATFNTEGMERLELTQPEKARQLKVIWKSPLIPGDPLVWRNNLSDEQKNKLRDFFFKYGANAEQKKVLADLQWSKFQASDDDQLLPIRQLELFKQRTDVANNANLGAEEKAAKLKALDEELAKLEKRMAEREQKTAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a binding protein component of ABC phosphonate transporter (PA3383) from Pseudomonas aeruginosa at 1.97 A resolution
rcsb
molecule keywords Binding protein component of ABC phosphonate transporter
molecule tags Transport protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 106
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12974 Phosphonate-bd ABC transporter, phosphonate, periplasmic substrate-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 3n5lA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n5lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n5lA02
3QUFA 4NTLA 2R9JA 4OEUA 2REGA 4LQ5A 4WXJA 3VE1B 1B5IA 3RPWA 1DTZA 4G8NA 5I56A 4P0IA 3B7DA 2O1LA 4FEDA 4M4GA 3TPAA 4EDPA 5AA2A 1JEVA 2ONKE 3UORA 4RPOA 1DPPA 4QSDA 5I2NB 1RYOA 2NOOA 4AQ4A 3H3GA 3DM0A 1LRZA 1P1WA 3PMXA 3TTNA 4R74A 3KN8A 4G77A 2QPQA 3A3UA 4IY6A 2B3FA 2C5IT 1LFHA 1LCFA 2O69A 3TKLB 3ILTB 4WEPA 3RT6B 2DE4A 3T9HB 1I6QA 2DE2A 5AA2D 4G68B 1BTJA 1MG1A 3PU5A 3IAZA 4FJPA 1B46A 1QULA 4NF5B 2V3UA 1URGA 2H5YA 4YB7A 3UN6A 5A5XA 4LVQA 2Z22A 1A8EA 3K01A 2H4IA 1JEUA 4X9TA 1N3XA 3RTWB 5DEXA 3FZVA 3CG1A 3M3LA 3RNNA 1N84A 4BDRA 4F1YA 4YKPA 3O6GA 4HCYA 2DWAA 4YICA 1QSDA 3KN3A 4KYEA 1MDQA 2X26A 3QSLA 4GF8A 2FYIA 1JETA 3VLUA 2I3WA 1P1NA 4MLVA 2DWHA 3L6GA 5KZTA 3OSRA 1SQYA 4JSDA 1B6HA 5H8HA 1Z7NE 3THIA 1Y3NA 2THIA 2QS3A 4KR5A 2M8CA 3IJXB 3MQ9A 3D4GA 3QIMA 5ICQA 1LAFE 4OENA 4YKKA 2F7AA 2PVUA 3RUMA 5B70A 3H6VA 4KCCA 4FATA 3VVDA 4IGRA 1JVYA 4I1DA 2NUVA 2OBGA 1MRPA 2I0BA 2DYXA 2XXIA 5J1DA 3KJTA 3PPNA 4C1UA 1LSTA 4PP0A 5KCJA 2XXPA 1B7UA 4NE4A 4JWOA 1LLSA 1AH5A 4EYYR 4RK2A 3FIRA 3MPKA 4TOZA 2F7CA 3CVGA 3KBRA 4HS7A 3N94A 4PE5B 4BDLA 1VR5A 5EHMA 4C1TA 1MQDA 4WEDA 2V3QA 3ONMA 2IA4A 1JNFA 4KD5A 3PMVA 2ONRA 4ZE8A 3OO9A 5JTYA 4E0WA 4NF6A 3M8UA 3KZGA 1F9BA 2ONSA 2F6PA 1B3EA 1FTMA 1NL5A 3OOAA 1IJ5A 1MY4A 2OWSA 4KFQA 3V89B 1PB8A 2FA7A 1Y4TA 3LSLA 1AIVA 1MM7A 3OD7A 1H44A 3M3KA 3MP6A 3VV5A 3MXZA 4OESA 5TU0A 3RLFE 1N76A 1HSEA 2X7QA 4GXAA 4TLMB 2F6GA 1B1XA 5CMMA 1D9VA 2GH9A 1MQJA 1I6AA 2ESNA 3K6XA 2XXXA 3N6TA 4ZEKA 4XKNA 2QSXA 3DP8A 4YZZA 1B52A 3IO6A 5TP9B 2RINA 2Q9TA 2XXTA 4DZ1A 4DNDA 1ZU0A 2DQVA 4ZZAA 3SETA 3MC2A 4NF8A 3GBAA 4EUOA 1SVXB 3LSFB 2CA5A 1PB9A 4LONB 1ZMGA 4ZDMA 5K2XA 3T9UA 3ODBA 3UP9A 3VFJA 4OVJA 2RCAA 1M5EA 3RN8A 2HAUA 1QUKA 1DOTA 1LAHE 3Q29A 3SKPA 1OQHA 3R26A 3QXMA 4IO3A 2UVIA 4I62A 4F3SA 3FJMA 1NMUA 4NEDA 2E0SA 3FXEB 5AE4A 4PQJA 1IXIA 1M5DA 4Q5TA 3E9XA 2PX1A 5JK4A 1B05A 4F3GA 3HO7A 4IO4A 1DTGA 1QKAA 3CRBA 1Q1KA 4MFIA 3LUYA 1IZ1A 4R2BA 2KWIB 2I3VA 1UTHB 1R9LA 4H0WA 4YKIA 3A09A 1BIYA 1OLAA 3C34A 3O28A 2CMOA 4F22A 1LAGE 1R1NA 1YAEA 3EHSA 2VD3A 4MF3A 4X48A 4U1OA 3ZS6A 4O3BA 4DCYA 5L9SA 3VLWA 3K00A 4OQOA 2UYFA 2QS4A 2Q2CA 2O84X 3S9NC 2D3IA 4R73A 2O7IA 4XIGQ 4UA8A 4DE8A 5FHNA 5IAIA 3CFLA 4MH5A 3PUXE 3V83A 1JW1A 4O3AA 5F7VA 3U93A 1SBPA 4NF4A 3OMBA 4YAHX 5KDTB 5M2VA 4LA9A 1US5A 1QW0A 1IXGA 3N5LA 2F8DA 1LB8A 3S9LC 3H7MA 1B4HA 1AL3A 1WODA 1TT1A 4ZZEA 4R72A 1MM6A 4IO6A 3QAXA 4YU0A 2P2AA 2VGQA 3C32A 1QJMA 2HCAA 1SYHA 1OMPA 4I9DA 4BDNA 1UIVA 1BLFA 3W9WA 4NF6B 2F97A 3K2DA 3N26A 4DIGA 2PT1A 5CMCA 3Q28A 3SEYA 1UQWA 1N7XA 2GFEA 4LZ7A 4JBZA 1VFEA 2Y7PA 3RTFB 1USYE 1GV8A 3HSTA 2RC7A 1R6ZA 4GOTA 3MVXA 1US4A 3FGSA 1B9JA 1RKMA 3K02A 4RA1A 3FXDB 4KHZE 5AA4A 4GL0A 4KYSA 1EZPA 4RNSA 1IXCA 3MVZA 5I57B 1USYH 3H6UA 3HV1A 2D21A 3DLNA 2G0UA 2DSFA 4H5GA 1MXVA 3MZ9A 2Q8JA 3TAJA 4JSOA 4NF8B 2I4BA 1WVJA 1B3HA 1FQAA 3FXQA 1FTKA 4GLIA 3TUSA 5ELVA 3EQ1A 4ZEIA 3FV2A 4H1XA 3KN7A 4RYAA 1SYIA 3OO7A 2O1MA 3IO4A 3PPPA 4LZ5A 1MDP1 1ZJLA 4Q30B 1SW2A 1A55A 3IORA 1S9TA 5TPAA 2NVUB 3F11A 4NWCA 3T9VA 1A99A 5H8QB 3ZSFA 5ITPA 4KYDA 3K1MA 3WAFA 4QFNA 3RY3A 2Z23A 3QK6A 2GRVA 4U4SA 2I48A 3IOVA 3IK6B 2Z8FA 1A54A 1ELJA 1URDA 4ONYA 2H9BA 3IOWA 2Y84A 1FQDA 3PUWE 2XXHA 5H8FB 1J1NA 3E13X 3CKDA 5HPQA 1H3DA 1YCJA 3FATA 2ZYKA 1XVYA 2UXAA 2QMWA 3HCQA 1O63A 2CZLA 2I58A 3IR1A 2HEUA 3SERA 3K4UA 1B3FA 3W9VA 1Y20A 5L8DA 3EN3A 1YTVA 3OO8A 2PMSA 4JWXA 1M5FA 1FQFA 4WKMA 4IO5A 2O6AA 2OK2A 3OSQA 4EQ9A 1ZBMA 4JDFA 2I4CA 1EU8A 2KWHA 3G3KA 4NMYA 4Q8RA 1NFTA 3OEKA 3M3FA 2X9XA 2F35A 2OJTA 3IOUA 3JZJA 4GXSB 2DS9A 4H8JA 3FASA 3TELA 3PPRA 3TQLA 4F2OA 1TFDA 2KLFA 2P0SA 2QS2A 1B0HA 2XX7A 3JV9A 2LAOA 3A3CA 3CFXA 4IY5A 5CBSA 3BBRA 4U4XA 3P7IA 5AA1A 1PBPA 3VXBA 1GTKA 4R75A 2R6GE 2O51A 4ISUA 1PBQA 4THIA 2PT2A 1MH3A 3PV0E 3O29A 3T22A 1N7WA 4KQPA 2RC8A 1MQHA 3Q26A 1PC3A 2Y7RA 1NNKA 1T0KA 1N0TA 2QL3A 3RGYA 4ZEFA 4PFYA 1UTBA 3G3IA 1HSLA 2I6EA 3LSXA 2XXYA 3H03A 1HSJA 4QFPA 3TTMA 1FTJA 2ABHA 2VP1A 2XHDA 3MBPA 3O66A 4GRKA 1XVXA 4RJZA 3KOTA 1EH3A 2G29A 1Y4CA 4IB2A 1B7HA 4DCXA 3CVRA 1CE2A 1B58A 4I8CA 4PFWA 2UVHA 4PFUA 5I56B 3H4ZA 3MUQA 4JWYA 5AA2B 3W15C 3GLBA 1SI0A 2OZZA 3E4RA 4EXKA 3LBSA 1H7CA 3U8QA 3MP8A 3VDFA 4R9GA 4L0RA 4AB6A 1FQCA 3TEPA 1LGBC 4J2CA 3R6UA 3EHUA 5CMBA 4OHNA 5CI5A 4C0RA 1OQGA 1LFIA 3SEXA 3MZBA 1ZIUA 1IJ6A 3EPEA 4F18A 4P0GA 3PPOA 2A5TA 5B7DA 1OVBA 1BP5A 5DVJA 2DP8A 2XTLA 4FI5A 1MPBA 3S9MC 4U21A 1PB7A 1P1QA 4KCDA 1I69A 3IL1B 1L5TA 2ZYNA 5TPAB 3V8XB 1H43A 5HBCA 4H65A 4DXUA 4PETA 5A5XB 1JVXA 1B1HA 3LSWA 4ECFA 1Y3PA 2Y7IA 4QSCA 3TCGA 1XT8A 1ZKBA 4FEBA 3BFTA 3C33A 1IIWA 1POTA 3O9PA 3K1PA 1H45A 4G2ZA 4OERA 5DEXB 4BDQA 4IO2A 5F1QA 2F36A 3OELA 2ZYMA 2QJEA 3K0VA 1MS7A 3E3KA 2ZXTA 5CC2A 1OIBA 1MY2A 4XKQA 4G68A 3TZAA 1LFGA 3OO6A 4FORA 4NF5A 3Q27A 3PMWA 4JXIA 4R9FA 4G8MA 1LCTA 3PUYE 3JYRA 3TYHA 1GGGA 5H8HB 4KI0E 2AL5A 4ZE9A 4EQ7A 3ZKKA 4G68C 4OFOA 1DSNA 1B3LA 2QRYA 3VVEA 4F3PA 2B65A 2ZNTA 1FTLA 3MWBA 4ND9A 3U94A 3CG3A 1B2HA 3GZGA 4ZECA 3C9HA 3S9EA 4ZEBA 4OETA 4HW8A 3B6WA 3O2AA 1MXXA 1M5CA 4G4PA 3TDJA 1CB6A 4U1ZA 3TTKA 1VSOA 2ZMBA 2WKYA 3FVOA 1NNTA 2B3BA 2XX8A 4GL8A 2F34A 3KEIA 1A40A 2OLBA 4BDMA 5KCJB 1LB9A 1H76A 3SEWA 5I2KA 3LR1A 2I49A 3L3PA 3IOTA 4OFLA 4NWDA 4H8IA 2XX9A 3WAEA 1Y1ZA 1NH8A 3K6UA 4FAJA 3I6VA 4OWDA 3FVNA 4N07A 2RKMA 1XHYA 2IC6A 3T96B 5JTYB 4GQOA 1B32A 4RXLA 3MPLA 4F31B 4Z0IA 1IXHA 4DDDA 1DMBA 1NH7A 3R7XA 1FQEA 2AL4A 3O97A 3S2VA 1ZTYA 1LVFA 1VFDA 2RC9A 4HTGA 1PDAA 3FJGA 1IQ7A 2DOJA 4FECA 4QF9A 3VVFA 1B5HA 4EQBA 1Z7ME 3T93B 3FJ7A 5DVFA 3KGCA 4GFRA 4DXCA 3TQWA 5I58A 3FV1A 4OEVA 4EF1A 3CR9A 2V3TA 1MXYA 2Z8DA 1MXUA 3S4UA 3TKDA 3PUZE 3QYTA 2H98A 4QFOA 4H67A 3U1OA 1SDXA 3B6QA 1MY0A 3KOSA 2A5TB 3C4MA 2E1SA 4OZ9A 3G3FA 5ICTA 2I0CA 1FTOA 1I6BA 3MVWA 1M5BA 1MQGA 1B3GA 3DELB 3I3VA 1B4ZA 5DTBA 1GVCA 4DXBA 2GHBA 1MPCA 3T66A 1B7ZA 4QFLA 2IC9A 2V25A 5I59A 3T9XB 3KG2A 1MPDA 4LQ2A 1B0LA 3ILUB 2Z8EA 2AYSA 3KSJA 2VD2A 2HZLA 4N6PA 3CSGA 2P1SA 1R9QA 5TP9A 4LP2B 1P99A 3HHFA 3FXUA 3G3HA 4UACA 1II5A 1O7TA 5CMKA 3MZ1A 5CM6A 2MBGA 3O6HA 4R2FA 1SW5A 5ISUA 1SW1A 2DXRA 3UK4A 2G93A 3H06B 4Z7EA 2Q89A 2D5WA 3UIFA 1BKAA 4ZEDA 4ELPA 1LBBA 3BKIB 1WDNA 1TXFA 2GHAA 1O64A 4YB6A 2HXWA 4YMAA 1A8FA 3FVGA 3OEMA 4JB7A 2AIXA 4XKRA 2F5XA 3SDFA 4KPTA 3H6TA 1AOVA 2F7BA 2X9WA 1UTHA 5ITOA 3KSXA 4NF4B 2V93A 4OMBA 1ZLQA 3MJNA 1KWHA 5H8SA 4RK9A 2YPNA 1POY1 1D9YA 1MH4A 2XD2A 3BFUA 1UIUA 4F1UA 5I2KB 3EHTA 3ECRA 3UA8A 1ZKEA 1JW5A 1Z0PA 3MAMA 1OVTA 4G8HA 3IB2A 1VE4A 3U72A 1XOCA 1EZOA 4F39A 2K48A 2NXOA 4ESWA 3K6VA 4H6DA 4OTEA 2X7PA 4HCWA 2REJA 4Q0CA 1TFAA 3PUVE 4U2RA 2UYEA 5KDTA 4XTCQ 1DPEA 1S7YA 1IUDA 1IEJA 2HQ0A 4U22A 4QFKA 2Q2AA 4ELOA 2O7UA 5FHOA 4E0XA 1JW4A 4POWA 3QUJA 5I58B 4YKJA 2FNCA 3VXCA 1YPNA 1FCKA 5AA4B 2DVCA 1AMFA 2H25A 3TODA 2Y7WA 3FXRA 4U23A 4X1BA 5H8NA 4OYVA 4XKPA 3CI8A 3RT8A 5JEIA 3TMGA 2IEEA 4ZS9A 1MXWA 4IGTA 3B6TA 4POXA 5IKBA 3OENA 2YJPA 5L9OA 2A5SA 3MP1A 4PFTA 3UGWA 3SEVA 1B40A 4TLLB 5FTHA 1LBCA 3IB1A 5DT6A 3SESA 2HFBA 3D4CA 3TTRA 2XXWA 5I59B 1FQBA 1QUIA 4FIMA 1N04A 3C31A 5CRYA 1RYXA 3SEUA 1MXZA 3DP4A 2DXYA 4CQIA 5HM4B 1NKXA 1NNFA 5I57A 4YMBA 3U92A 2UVGA 1P1UA 1D3KA 3TTLA 1XS5A 3PD9A 3N6UA 3H6WA 2ZYOA 3PPQA 3HN0A 1XC1A 4GIZA 1URSA 1QKBA 3KFMA 3HPIA 5I2NA 5EHSA 4H5FA 1JQFA 4OXVA 2DWIA 4K3FA 1EZ9A 2C5KT 1SD3A 2F78A 2O68A 1QVSA 2XD3A 3PGFA 2QS1A 2DE3A 5FHMA 3L6HA 4R6KA 3HHGA 2VOZA 3Q25A 2OWTA 3TFLA 4F3BA 5EYFA 1SW4A 1LAXA 3K1NA 1Y1MA 4P11A 1B51A 2QMXA 4DLDA 1D4NA 5BWJA 5K2YA 1MY1A 1Q35A 5DVIA 2HAVA 5H8QA 4BLAA 1A7LA 4TQUQ 3DP6A 2RCBA 2ALUA 2V84A 2PYYA 4QRZA 1IITA 3MW0A 4R6YA 3G7WA 1ATGA 3CSBA 3KJ7A 4IO7A 4N13A 4LATA 2Q88A 4MLQA 3IJOB 3FUZA 3G3GA 1Y9UA 4LUBA 5H8FA 2XXRA 4GD5A 3C36A 3G3JA 5AA3A 3K6WA 2R71A 3TCFA 1MY3A 2DWJA 3CIJA 4ELRA 3IX1A 4F19A 3TCHA 1Y3QA 1ANFA 2XXQA 2YLNA 4QHQA 3RQTA 4GWOA 4R6HA 1QUJA 4B6XA 2XXUA 5DYHA 5L9MA 4RPNA 4M1VA 4OFJA 1SI1A 1TWYA 2VHAA 4EXLA 3FD3A 2NWJA 5CBRA 3USDA 3LC8A 1UTBB 4AB5A 4XXUA 3I5OA 2BJJX 2ZNUA 5LOMA 3FVKA 4F1VA 2RF1A 3PD8A 3C35A 4X1DA 3EF7A 4MBPA 1B5JA 1P1OA 5FTIA 1OLCA 4ESXA 3V5AA 3OXNA 2W7YA 5H8NB 4ELQA 1N3WA 4F29A 2Y7KA 4EF2A 2DVZA 4F2QA 4YB5A 4RY1A 2UVJA 1PEBA 2X9YA 4QSEA 5I84A 2C5JA 2OCUA 4LZ8A 1MQIA 3MVYA 2ZNSA 3O6IA 4GVOA 4L17A 3VLVA 1GR2A 3IB0A 3GXAA 4O3CA 3ZKLA 4FE8A 3GBBA 2PBWA 5BUUA 1S50A 2H99A 2HZKA 2XXVA 3CFZA 3AXFA 1FW0A 2ANJA 4BDOA 1NNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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