The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
251
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sequence length |
692
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structure length |
692
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Chain Sequence |
NPIHDRTSDYHKYLKVKQGDSDLFKLTVSDKRYIWYNPDPKERDSYECGEIVSETSDSFTFKTVDGQDRQVKKDDANQRNPIKFDGVEDMSELSYLNEPAVFHNLRVRYNQDLIYTYSGLFLVAVNPFKRIPIYTQEMVDIFKGRRRNEVAPHIFAISDVAYRSMLDDRQNQSLLITGESGAGKTENTKKVIQYLASVAGRNQANGSGVLEQQILQANPILEAFGNAKTTRNNNSSRFGKFIEIQFNSAGFISGASIQSYLLEKSRVVFQSETERNYHIFYQLLAGATAEEKKALHLAGPESFNYLNQSGCVDIKGVSDSEEFKITRQAMDIVGFSQEEQMSIFKIIAGILHLGNIKFEKGAGEGAVLKDKTALNAASTVFGVNPSVLEKALMEPRILAGRDLVAQHLNVEKSSSSRDALVKALYGRLFLWLVKKINNVLCQERKAYFIGVLDISGFEIFKVNSFEQLCINYTNEKLQQFFNHHMFKLEQEEYLKEKINWTFIDFGLDSQATIDLIDGRQPPGILALLDEQSVFPNATDNTLITKLHSHFSKKNAKYEEPRFSKTEFGVTHYAGQVMYEIQDWLEKNKDPLQQDLELCFKDSSDNVVTKLFNDPNIASRAKKGANFITVAAQYKEQLASLMATLETTNPHFVRCIIPNNKQLPAKLEDKVVLDQLRCNGVLEGIRITRKGFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
The Mechanism of Pentabromopseudilin Inhibition of Myosin Motor Activity.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Contractile protein
|
molecule keywords |
MYOSIN-2 HEAVY CHAIN
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total genus |
251
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structure length |
692
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sequence length |
692
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2008-03-25 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00063 | Myosin_head | Myosin head (motor domain) |
A | PF02736 | Myosin_N | Myosin N-terminal SH3-like domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Myosin S1 fragment, N-terminal |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1D0X A; 2V26 A; 4DBQ A; 2JJ9 A; 1FMV A; 1FMW A; 1D0Z A; 4ANJ A; 4PK4 A; 4E7S A; 1LVK A; 4DBR A; 1MNE A; 1B7T A; 2MYS A; 1BR4 A; 4PJM A; 1MMN A; 1G8X A; 4PFP A; 1D1B A; 2X9H A; 4PJN A; 2X51 A; 1D1A A; 4E7Z A; 1MMG A; 1BR1 A; 1D0Y A; 1VOM A; 2VAS A; 1MND A; 1MMD A; 2VB6 A; 4PFO A; 1BR2 A; 3MJX A; 1MMA A; 1D1C A; 1KK7 A; 4PJJ A; 1LKX A; 3MKD A; 4PJL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HSE B; 3G71 Q; 2R6G F; 1G5V A; 3OPC A; 4HFB A; 3OKQ A; 3EUH A; 1UFF A; 1WHK A; 2JMC A; 2QQR A; 2ROL A; 3EGD A; 4RUG A; 3URG A; 3LH0 A; 4X64 T; 3V7C A; 3EGU A; 3M0P A; 2MWO A; 2VKJ A; 3GOX A; 1ZEE A; 3TKL B; 4C92 D; 3CCU T; 4LD6 A; 2J06 A; 3AE2 A; 1W4S A; 3RYF E; 1XWM A; 3LFM A; 1ZX6 A; 5LJ5 g; 4G2A A; 5LGU B; 1BI2 A; 1LJO A; 3ZBD A; 1VQ7 A; 3CPW P; 2VXF A; 3X20 B; 5GAN 8; 1KFZ A; 2KLQ A; 2LSJ A; 3CBM A; 4JI4 T; 2M9U A; 3OBW A; 1LCK A; 1HTJ F; 1Q82 C; 2HQE A; 4BUG A; 3CPZ A; 3EAM A; 3RC8 A; 1ZV4 X; 2V8I A; 3OYG A; 1JRI A; 3EGX B; 2CZ7 B; 2CM0 A; 1RAD B; 1IXD A; 3FZK B; 1QVF S; 4B3M T; 1D0Y A; 1RAE B; 1UGV A; 2ECZ A; 2LVM A; 3PUZ F; 2RPA A; 3QZ9 B; 2OLT A; 3PDY A; 3V8K A; 1SF9 A; 2RJF A; 5A0D A; 2IAK A; 2MAW A; 1YJN T; 1Q81 U; 3NFC A; 2KI7 A; 3OYF A; 3ZL7 C; 4P09 A; 4EOZ B; 4WF2 A; 4ZS2 A; 4EPC A; 3L09 A; 3TLU A; 4DBR A; 3OS2 A; 1IRE B; 3JCM g; 2JW4 A; 2KAF A; 2VQE T; 3C50 A; 1W9R A; 2DTO A; 3LBX A; 1CHU A; 2J6O A; 3T9N A; 2YDL A; 1P92 A; 4GY5 A; 4HFE A; 1M2V B; 4WZX A; 1FIO A; 5GON E; 2KIN B; 4OF1 A; 5DJQ C; 1T98 A; 3CC2 T; 3FIF A; 1FXX A; 4QXC B; 3R6N A; 1YD8 G; 3PU3 A; 2DER A; 5HAX A; 3RUX A; 5LYJ E; 3QO3 A; 1YJW A; 5IYZ E; 1UHF A; 1D3B B; 2Q9Q A; 5HEO A; 2NUT B; 1W09 A; 4R55 A; 3C98 B; 4V1A v; 5AQU B; 5FW9 A; 1X2Q A; 2M16 A; 1NJI U; 1OWA A; 3ZSS A; 1UB4 A; 2BVL A; 3O1H A; 2GK9 A; 1DJ7 B; 2DBM A; 3M0S A; 4DQ2 A; 5HKC A; 2LKH A; 4WBO A; 3JB9 H; 4OHF A; 3IEE A; 4RCC A; 3RH3 A; 3G4S T; 3A8M B; 5LOV E; 3CCS Q; 2OI3 A; 5L4E A; 2YHT A; 2EYY A; 4ZI3 C; 3L2R A; 1WXB A; 2QEX A; 3RC3 A; 4N0A A; 2RN8 A; 4RKU E; 4GK0 E; 4F17 A; 2OTL A; 2DL7 A; 3MCA B; 4QVD A; 3ZC0 A; 3UT1 A; 1B7T A; 4Z8X A; 4EZH A; 4A63 B; 4CI3 B; 5DLO A; 1TOV A; 2CKK A; 1RLQ C; 2NWB A; 3AE7 A; 5FU6 B; 3QXE B; 5FRO A; 4QQG A; 2XQY A; 2W0Z A; 3HKE E; 3OBV E; 2KRO A; 4R56 A; 3OTO T; 3UF4 A; 2A3D A; 5C6S A; 2HQH A; 3FC3 A; 1Q7Y C; 2Y4Y A; 2M02 A; 1VQM A; 5LG4 A; 5LJ5 h; 4XZC A; 1W2B P; 3AAA B; 4JV5 T; 4RTY A; 4PJO F; 3LSV A; 3A8O B; 1GXI E; 3I35 A; 1YWO A; 1M90 U; 5EZY E; 2NYS A; 1QP2 A; 4D8K A; 2LQK A; 3I56 T; 1AWW A; 5LA6 E; 1NEK A; 4M75 B; 1QKW A; 1PKS A; 3PMT A; 2XTL A; 3KVA A; 2JQK A; 1KC8 R; 1W0B A; 2CHO A; 2XM2 A; 4ZHQ E; 3CCR A; 3CCV T; 5JR9 C; 2V1Q A; 1AEY A; 5LJ3 g; 5L8R E; 2XAG B; 4JI1 T; 3GF5 A; 4M7A B; 1KNP A; 3H0F A; 4HCK A; 3Q5E A; 3RHW A; 1X6G A; 1Q95 G; 4YJ2 E; 4XTW A; 3SFD A; 3H3M A; 3JV3 A; 1YKE B; 1HX8 A; 3CC2 Q; 2JZ2 A; 4QW2 A; 1SG5 A; 5LBM A; 1KHC A; 1S35 A; 2L5Q A; 3O1I A; 3ZCJ A; 1FYN A; 3PJA A; 4ZI2 D; 1AD5 A; 3ZST A; 4HWC A; 1RAA B; 3NMZ C; 3UWN A; 3OSS C; 3VS3 A; 4A4F A; 3JCM h; 2HMA A; 3ZYM A; 2A28 A; 3M59 A; 5AQS B; 1T3S A; 5AQQ B; 1JXO A; 1IGQ A; 2CEA A; 4ILB A; 3JCM V; 2YKS A; 4C0F A; 4IL9 A; 3UU4 A; 1OI1 A; 3Q2M A; 5HEJ A; 1IHW A; 3ONL C; 3TQ7 P; 5FXW A; 3X25 B; 3P4W A; 1MIY A; 2JQQ A; 4I50 E; 4IT4 A; 3HKB E; 2N1G A; 2ZPH B; 2KDS A; 2KZ7 B; 3N5B B; 1K73 C; 4M7D D; 3UU8 A; 5BR8 T; 1CKB A; 4C91 A; 4DA4 A; 3OYX A; 4NL2 A; 2WDV A; 4WBN E; 4E7I A; 1J1J A; 4HA8 A; 4LXC A; 4B9W A; 4ILC A; 3I55 A; 2A9U A; 3SWN C; 1VQ7 T; 1OED B; 1MV3 A; 1TWB A; 2Y6X A; 4AIU A; 5KMG P; 1Y07 A; 2M0O A; 4M77 B; 2FJB A; 5ABH A; 2FRW A; 1VQ5 Q; 3TLS A; 1RL2 A; 2DL8 A; 4MFR A; 2H89 A; 3HHT B; 3LGL A; 3N9M A; 2LHN A; 4QXB B; 5IHY A; 2E12 A; 2BG9 A; 2LM2 A; 4MHC A; 2HAX A; 5FP3 A; 3RES A; 3OA6 A; 4JRP A; 1SHF A; 1IBK T; 4TX5 A; 5JDN A; 3OJA A; 3RF1 A; 2VVS A; 1YQ3 A; 5JRC A; 3UUM A; 3RRW A; 1I5O B; 4CI1 B; 2A37 A; 4I55 E; 2JTF A; 4JJN K; 3CX8 B; 1SUM B; 2KWI B; 3FBL A; 4HFH A; 1QP3 A; 4LMJ A; 2G6F X; 2RI3 A; 3L2W A; 1IRX A; 2BZY A; 1B07 A; 5GAN d; 3MHX A; 3MXZ A; 1BIA A; 4KGZ B; 3N9N A; 1UG1 A; 3P7I A; 4DR5 T; 4YSY A; 4TZ4 C; 1MND A; 3GA8 A; 2I6H A; 1GQE A; 2VK9 A; 2L0A A; 2A72 A; 2YWW A; 3BQK A; 4YY3 T; 1IJ5 A; 4M1P A; 5HWX A; 3GWH A; 1N6A A; 3H37 A; 4JJD A; 4J2C A; 2C0O A; 5CB4 E; 4EED A; 5L3C B; 1KF6 A; 3M0U A; 2QI2 A; 4AQF A; 2M1H A; 2CYZ B; 2A08 A; 2UXB T; 2G3R A; 4PK6 A; 2DFU A; 2MK5 A; 4TWH A; 3H6Z A; 4FW2 A; 3RKY A; 4H9Q C; 1V29 B; 2Q9Q C; 1ZLM A; 4C92 B; 2LP5 A; 1WHJ A; 1O75 A; 2DL5 A; 2EHO D; 3CME Q; 2VWF A; 3V5S A; 1M9S A; 2LX7 A; 2DPP B; 2LJ1 A; 2X67 A; 3VYH B; 4E47 A; 2XQ8 A; 4JI7 T; 2V8J A; 3RNJ A; 5IN1 A; 5LJ3 h; 2H7V C; 3ZEH A; 4AKH A; 3QNU A; 1VA7 A; 3CCL T; 1YJW T; 2D0T A; 3AEF A; 2DYB A; 2K6D A; 2EQK A; 4KH0 B; 2R5A A; 1S94 A; 2EKO A; 4H9S E; 4DV7 T; 4FW1 A; 4MZP A; 1M1K U; 2M6B A; 4ZN3 A; 3RKO A; 1UX4 A; 5FY1 A; 2ZAE A; 4E7L A; 2XQ5 A; 5BMV E; 3P8D A; 3I0O A; 4N0A C; 1UUE A; 3QII A; 3RYI E; 2GFU A; 4J5Y A; 2CZ6 B; 1QQJ A; 4N4I A; 1MMN A; 3M0T A; 2W66 A; 4OB3 B; 4EMK B; 5I21 A; 5AQP B; 4EYY R; 2EJ9 A; 2J1D G; 2QEX T; 3AXJ A; 3FLG A; 5GAN 6; 2AKL A; 2LC4 A; 1BR1 A; 3O4X E; 4K11 A; 3E2U A; 1JJ2 A; 5GMK m; 2BZ8 A; 2OTL T; 2AXD S; 5CGM A; 1IO6 A; 2WU5 A; 4JRK A; 3CC4 Q; 2KK4 A; 5I2M A; 4FYV B; 1WJS A; 4O4L E; 4M75 G; 2L9Q A; 2WS3 A; 2CXF A; 4JI8 T; 2FHD A; 2KNB B; 2XDB A; 3M5A A; 3LK3 B; 4KBM B; 3JB9 J; 4C0G A; 4E7J A; 4M7A G; 2Y90 A; 3I5S A; 2FZG B; 1VQM T; 4UVA B; 4ZS3 A; 4DV6 T; 3J81 E; 1VQL Q; 2HBW A; 5E0O A; 1QVG A; 1MMD A; 3CX7 B; 1G2B A; 2EKH A; 2QXF A; 4OMP A; 2B86 A; 4MBQ A; 2H3J A; 3Q5W A; 3HR0 A; 1HSQ A; 1G3T A; 1MGQ A; 2HEQ A; 3MP8 A; 2FRY A; 5KYY A; 3UFE A; 1J5E T; 4NUU A; 4OB0 B; 1IBM T; 2BS3 A; 3CCR T; 5J39 A; 2OTJ Q; 5JRE A; 5JVD E; 2DXB A; 2ZZD A; 1K9M U; 4FM4 B; 4JLI A; 3C0C A; 3TU4 K; 4DMV A; 3AEE A; 2P0K A; 1IZN B; 1M3B A; 3UT5 E; 3CD6 T; 2DVE A; 3K1S A; 4Q5W A; 2JTE A; 5FYM A; 3J7Y q; 2HH7 A; 2XKO C; 1MHN A; 4L0R A; 4PFZ A; 3VS7 A; 4YHJ A; 2KRN A; 2DMO A; 2DKG A; 1W1F A; 2QDL A; 1KC8 C; 4DID B; 2KWH A; 3LW5 E; 1N5Z A; 3SEM A; 4C8Q B; 2GNC A; 4Z91 A; 2K5L A; 1MNE A; 1NM7 A; 2E9X B; 3G7Z A; 4Z88 A; 1N8R U; 2CZ0 B; 3MZK B; 5EG2 A; 1BI0 A; 5GAM e; 2LKG A; 5LL6 S; 5L2L A; 4L6V 5; 1W70 A; 2NUP B; 2JS2 A; 1YCS B; 4QKN A; 5HXH A; 3TSZ A; 4IHJ E; 1KIK A; 1WGS A; 2L8D A; 3E19 A; 4UVB B; 3AE5 A; 1TS9 A; 2QA7 A; 3N2K E; 5CQY A; 2PVO B; 3OS5 A; 2WDQ A; 2AZS A; 1YI2 Q; 2HZY A; 2GF7 A; 3QB5 K; 1VQ6 Q; 4IST A; 4YTM A; 5KX5 E; 4DBH A; 3I55 T; 5IXF A; 3GNF B; 2I2L A; 3CCM A; 2BG9 C; 2K48 A; 3N2O A; 3PU8 A; 1PG5 B; 4FI5 A; 2HQX A; 3SWH A; 2DVJ A; 3UQ4 A; 2DL3 A; 2PQW A; 1OEB A; 5LMU T; 1U4Q A; 5HXS A; 4MML A; 2YRC A; 3P8B B; 1YJ9 Q; 3B5M A; 1AVZ C; 1PD1 A; 4OMM A; 3M3Z B; 3EFO A; 1BR2 A; 3NHN A; 4AFS C; 5AQJ B; 5F5W A; 2X68 A; 4Q25 A; 2NP9 A; 3OW2 S; 5AQM B; 4ZGE B; 3EFS A; 2V5D A; 3Q9D A; 1WXT A; 1AHJ B; 3R6O A; 5J26 A; 3M55 A; 2LZ6 B; 1R0C B; 1ZBX A; 2Y4X A; 1UTI A; 4LF7 T; 2FPE A; 4HEA A; 2HD0 A; 2MPK A; 2KY9 A; 5C0M A; 4J7F A; 4AQF C; 4AQY T; 3FZL B; 3KV4 A; 4PK5 A; 5IHN A; 3CMA A; 3N5L A; 1VQK Q; 1OQK A; 1M2O A; 3QUI A; 5KCO A; 3AE3 A; 4TUY E; 2PU9 B; 1G83 A; 2SPC A; 4DMW A; 1QWE A; 2AHJ B; 2JT4 A; 4GLM A; 2CWY A; 4A4G A; 3CBO A; 3CXC A; 4JDS A; 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