The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
164
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sequence length |
504
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structure length |
492
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Chain Sequence |
SRDRKYLARLKLPPLSKCEALRESLDLGFEGMCLEQPIGKRLFQQFLRTHEQHGPALQLWKDIEDYDTADDALRPQKAQALRAAYLEPQAQLFCSFLDAETVARARAGAGDGLFQPLLRAVLAHLGQAPFQEFLDSLYFLRFLQWKWLEAQPMGEDWFLDFRVLGRGGFGEVFACQMKATGKLYACKKLNKKRLKKRKGYQGAMVEKKILAKVHSRFIVSLAYAFETKTDLCLVMTIMNGGDIRYHIYNVDEDNPGFQEPRAIFYTAQIVSGLEHLHQRNIIYRDLKPENVLLDDDGNVRISDLGLAVELKAGQTKTKGYAGTPGFMAPELLLGEEYDFSVDYFALGVTLYEMIAARGPFRARGEKVENKELKQRVLEQAVTYPDKFSPASKDFCEALLQKDPEKRLGFRDGSCDGLRTHPLFRDISWRQLEAGMLTPPFVPDSRTVYAKNIAFEKADTEFFQEFASGTCPIPWQEEMIETGVFGDLNVWRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Identification and structure-function analysis of subfamily selective g protein-coupled receptor kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Transferase/transferase inhibitor
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source organism |
Bos taurus
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molecule keywords |
Rhodopsin kinase
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total genus |
164
|
structure length |
492
|
sequence length |
504
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ec nomenclature |
ec
2.7.11.14: Rhodopsin kinase. |
pdb deposition date | 2014-05-23 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00069 | Pkinase | Protein kinase domain |
A | PF00615 | RGS | Regulator of G protein signaling domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Transferase(Phosphotransferase); domain 1 | Transferase(Phosphotransferase) domain 1 | ||
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Phosphorylase Kinase; domain 1 | Phosphorylase Kinase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5K3Y A; 2OIC A; 3ZSG A; 3RHK A; 4GJ2 A; 4MX9 A; 4TN6 A; 3NNW A; 4ZZO A; 1JBP E; 3LKM A; 3R01 A; 3IDC A; 3EZR A; 1J7U A; 3DZO A; 5LVL A; 3I0O A; 5E7R A; 4C3F A; 3HUC A; 3OW3 A; 4CCU A; 2ZDT A; 3RHX A; 3L9L A; 4DC2 A; 4E8A A; 3P4K A; 5HX8 A; 2VAG A; 4RIX A; 3UE4 A; 3SLS A; 2B9J A; 2YM7 A; 4A07 A; 1FGI A; 1Q41 A; 3ZBF A; 4CZU A; 2OFV A; 1GJO A; 2VTI A; 5CX9 A; 4CZY B; 3OCG A; 3E63 A; 4Y46 A; 3V5J A; 3SXF A; 4L3P A; 4BR3 A; 1PYX A; 4CTB A; 2GFC A; 1BKX A; 4I1Z A; 1H01 A; 3R9H A; 3ORM A; 4YLL A; 3RP9 A; 3ORP A; 4QQC A; 4ASE A; 1YI6 A; 2R3K A; 1XWS A; 2YJR A; 2F2U A; 4F7J A; 4E5B A; 1IAH A; 5J1W A; 4ITJ A; 4XP2 A; 3R8M A; 2HZN A; 2SRC A; 1Z9X A; 5K0K A; 4DEA A; 3QF9 A; 3H0Z A; 4I4F A; 5FDX A; 3EQR A; 3SD0 A; 4FVQ A; 3U6J A; 2PUL A; 2E9O A; 3LQ3 A; 4ACC A; 2WEI A; 3HEC A; 3NDM A; 4E4N A; 4FZF B; 2O5K A; 4UXL A; 1REJ A; 1ERK A; 1CKI A; 3V5L A; 2JLD A; 5BVE A; 4PL5 A; 4KIK A; 3Q9Z A; 5IEV A; 4GVA A; 5EOL A; 2YCS A; 4DED A; 3TNQ B; 3T3U A; 1F5Q A; 2BAK A; 4JAI A; 4HGS A; 1I09 A; 4IHP A; 3U9N A; 2BTS A; 2XVD A; 2GS7 A; 3F5P A; 3HLL A; 3EL8 A; 4IDT A; 4D2R A; 3FLZ A; 2GNH A; 3H9F A; 4GOU A; 3MB6 A; 4U79 A; 3I6W A; 4W4Y A; 1ZYL A; 4FKR A; 4RA5 A; 3DKC A; 3QCQ A; 4D4Y A; 4M3Q A; 1YWR A; 3SX9 A; 4DG0 E; 2B54 A; 2QD9 A; 3QRT A; 3Q9Y A; 4ZTH A; 4RIX B; 2QHM A; 3PYY A; 4O6E A; 2VX0 A; 4BTF A; 4ZAU A; 5HCZ A; 4Y8D A; 1U5Q A; 4BYI A; 3NIZ A; 3G6H A; 4DFY A; 3TI1 A; 3SW4 A; 2XA4 A; 4QTC A; 4OT5 A; 5LMA A; 1OIY A; 2OGV A; 3B8Q A; 3C4X A; 3FAA A; 4II5 A; 3MV5 A; 2GNJ A; 3F2R A; 1M52 A; 1UVR A; 2B4S B; 3OBJ A; 1Q3D A; 2PU8 A; 2WHB A; 5KNJ A; 5ETC A; 3TNW A; 2R64 A; 4L52 A; 1PME A; 5LVM A; 4E4M A; 2X8I A; 3MY5 A; 4XG6 A; 3B2W A; 4CMU A; 5ACK A; 2WTK C; 4E6A A; 2YIY A; 2ZV9 A; 2IWI A; 3BX5 A; 4FL1 A; 3C9W A; 4C3P A; 3E3B X; 5HCY A; 5FUT A; 3D94 A; 4P7E A; 5C8M A; 4UMR A; 1GNG A; 1BL6 A; 1AGW A; 3A7I A; 4RRV A; 4FYO A; 4AZT A; 3G15 A; 3N51 A; 5BMS A; 5C01 A; 4DBN A; 3LW0 A; 2IVT A; 2IZU A; 1G5S A; 4ZSJ A; 4X2N A; 4BN1 A; 2GS6 A; 2VO7 A; 2PVM A; 3ROC A; 5DFP A; 5L2S A; 4GEO A; 1OBG A; 4LYN A; 5JQ8 A; 4TW9 A; 3ZON A; 2X6D A; 1ZXE A; 3OHT A; 2R3J A; 3D5X A; 3ZM4 A; 2Z7L A; 3HZT A; 3NAY A; 4NEU A; 4IAK A; 1JAM A; 4L44 A; 2XK9 A; 3DAK A; 4QP9 A; 4WHZ A; 4LUE A; 3CTJ A; 4Y85 A; 2FA2 A; 2GTM A; 4FV0 A; 5FTQ A; 4CRL A; 4F65 A; 4O7Z A; 3NUP A; 4KA3 A; 4E4L A; 3TV6 A; 4KAO A; 2V22 A; 2RFN A; 2UUE A; 3F3U A; 4KRD A; 4M7I A; 3VN9 A; 5JMS A; 2VX3 A; 4RMZ A; 4CLJ A; 2VTL A; 3ELJ A; 5HD4 A; 3W2P A; 5EHL A; 4R78 A; 1XQZ A; 5AV0 A; 2VNW A; 3AMB A; 4WD5 A; 3JVS A; 1NW1 A; 4BDA A; 1TVO A; 1Q8U A; 2BRO A; 3F2N A; 4L68 A; 3QQF A; 2ZDU A; 5AV2 A; 2C3L A; 1S9I A; 4AFJ A; 3FLQ A; 3KUL A; 5I3O A; 4C34 A; 1O6K A; 3KKV A; 1VYZ A; 3VO3 A; 5LMK A; 2OG8 A; 3OOM A; 1ZOH A; 2PE1 A; 5CEM A; 4J95 A; 2R5T A; 5ETI A; 4DFN A; 2GTN A; 4CV9 A; 4IB5 A; 4EH5 A; 4AE9 A; 5DBX A; 5JFX A; 4QPS A; 5JSM A; 4F6S A; 2FUM A; 2V7O A; 2C0T A; 3SOA A; 4C62 A; 3OUN B; 2BRH A; 2B52 A; 4F63 A; 4CG8 A; 2HWP A; 1OKZ A; 1OPK A; 4FTK A; 3JS2 A; 5KO1 A; 4ACM A; 1Q8Y A; 5CAS A; 1H00 A; 3AC3 A; 4KIP A; 5DRB A; 4FIF A; 2GFS A; 1UNH A; 4E26 A; 3UNK A; 2IPX A; 1OKW A; 2W06 A; 3FV8 A; 2ETM A; 4E5A X; 2C0I A; 4O7S A; 4FSR A; 4FI1 A; 5CZH A; 2W5B A; 2Z2W A; 3F5X A; 4G9R A; 4GYI A; 5CLP A; 4X2G A; 2ITW A; 4USF A; 4RWJ A; 3MY0 A; 3GB2 A; 4WNP A; 2NO3 A; 4ANS A; 4BCJ A; 2R3R A; 2BDW A; 3KK8 A; 2EXM A; 4FOB A; 4FTU A; 3RK7 A; 4AW0 A; 1P4F A; 2C3K A; 2XJ1 A; 2NRU A; 4OTH A; 2LGC A; 4MTA A; 3WIG A; 4I0R A; 4EK8 A; 5ANJ A; 3ZFY A; 4D1Z A; 1YXT A; 2FSO X; 3DZQ A; 2X2L A; 4ZIM A; 4MAO A; 4MQ1 A; 3DXQ A; 2VV9 A; 3D83 A; 5DH3 A; 3FXX A; 2WO6 A; 4FIJ A; 3AMY A; 3FYJ X; 3UIX A; 5BYY A; 2YZL A; 2C6D A; 2QOL A; 1SVE A; 1E9H A; 4EK4 A; 5AA8 A; 2E9P A; 3LXL A; 3OXZ A; 3R7G A; 3VID A; 4FEV A; 3LLT A; 4NM3 A; 4O7L A; 5EQE A; 3Q4C A; 2A72 A; 4OAU C; 4ERW A; 3BI6 A; 3UIU A; 3ZYA A; 1OUK A; 3P7A A; 4RLK A; 1PMV A; 4DEG A; 3OD6 X; 4IVD A; 2VTJ A; 1KV1 A; 1MRU A; 1H8F A; 3ACJ A; 3Q6U A; 3PWD A; 4ANM A; 5EYD A; 1VJY A; 2YIX A; 3IQ7 A; 3ORZ A; 4ENX A; 1JKK A; 4A9T A; 1G8A A; 3AC4 A; 3CLY A; 4L3J A; 2Y4P A; 4EOR A; 4F7L A; 2JBP A; 4I0T A; 4MXO A; 5EKO A; 4ANN A; 2RFD A; 4BDK A; 2HK5 A; 4L7F A; 4YSJ A; 5HG8 A; 3GOK A; 3HRC A; 4O7R A; 3MPM A; 4U42 A; 4UEU A; 4F0G A; 3LM0 A; 3E88 A; 3OWP A; 3UYS A; 4WO5 A; 3QD3 A; 5IQI A; 4DFB A; 2C1A A; 4FVR A; 2R3F A; 4BCQ A; 3SAY A; 3S2P A; 3RNY A; 2WMA A; 3WIK A; 4CRS A; 5DVR A; 3DLS A; 5GIP E; 2OSC A; 1ZV4 X; 1W83 A; 3Q4Z A; 4PL4 A; 4GFO A; 1W98 A; 2PVJ A; 3PPZ A; 5I0B A; 4MH7 A; 4ANO A; 4K2R A; 4KKG A; 3NYX A; 3UZP A; 2F7Z E; 4Z55 A; 5AFV A; 3FHI A; 3CGF A; 3C4E A; 3TZ9 A; 5JN2 A; 4YTI A; 4I93 A; 2W17 A; 3DAJ A; 2ITO A; 3Q96 A; 4IAZ A; 3TN8 A; 4C57 A; 3HDN A; 4ZY4 A; 5LOH A; 5HOA A; 1HTJ F; 2WQM A; 3AMA A; 3CY3 A; 5EM7 A; 3LFA A; 3RPS A; 2WIP A; 3T8O A; 5KMJ A; 5TR6 A; 3L8V A; 4TYE A; 3V5Q A; 2CPK E; 2F49 A; 4FST A; 4FK3 A; 3OFM A; 1XH9 A; 5K0X A; 1ZY5 A; 1CKJ A; 5J5T A; 3DBC A; 1DI9 A; 2QOK A; 4EZ7 A; 2VTS A; 4FT0 A; 4FTO A; 3D2K A; 3CEK A; 2YM4 A; 3E62 A; 3QCS A; 4JG7 A; 4I6H A; 4UMU A; 5K9I A; 1BUH A; 1XBC A; 4YR8 A; 4O86 A; 3G2F A; 1JSU A; 2JED A; 4DF3 A; 3KXH A; 5AX3 A; 1QPJ A; 3MI9 A; 3FKN A; 5IDP A; 4I41 A; 4FR4 A; 3ORN A; 1ZYD A; 5FED A; 4C61 A; 4R8Q A; 4P5Z A; 4D5K A; 2GHG A; 2XKD A; 5L6O A; 3SV0 A; 4IH8 A; 4A7C A; 2HYY A; 2WMR A; 2J5F A; 4EC8 A; 1REK A; 3PA5 A; 5D7V A; 4ORK A; 2X2M A; 2RIO A; 4UMQ A; 4EZ3 A; 5JQ5 A; 5IME A; 3CR0 A; 4GH2 A; 2QOB A; 1H28 A; 1GZ8 A; 5IMX A; 4BCH A; 4X2K A; 4I23 A; 1GIJ A; 4TRL A; 4D1S A; 4EOO A; 1BI7 A; 3G90 X; 4EKK A; 4C2W A; 2Z7Q A; 3GT8 A; 2OH4 A; 4TWC A; 4A06 A; 5I4N A; 4DE4 A; 5CAP A; 2WAJ A; 4FKG A; 2BCJ A; 1SMH A; 4KRC A; 2YDI A; 3QZG A; 3BRB A; 4IFC A; 3BLH A; 4JQE A; 3RM7 A; 5KMK A; 5AUW A; 3JY9 A; 2I59 A; 2ITY A; 3GFW A; 2VU3 A; 4IB3 A; 4FV9 A; 5IQB A; 1BL7 A; 1FVT A; 1UA2 A; 2QI8 A; 3P5K A; 3UTO A; 5EW9 A; 4CVA A; 3PG3 A; 4BCF A; 3UG1 A; 4AOT A; 2BAL A; 2QOD A; 2OIQ A; 1VR2 A; 3ALO A; 4B0G A; 3I6U A; 1H1W A; 4Z7H A; 5DI1 A; 4R1Y A; 3V8S A; 5K5X A; 3BGQ A; 3C0G A; 3HMO A; 2WU6 A; 4FKL A; 4OW8 A; 1ZYC A; 4NM5 A; 4Q5H A; 1LEW A; 2X0G A; 5DGZ A; 3RK5 A; 2UW3 A; 4O0V A; 4CFN A; 1ZMV A; 4PMT A; 4EH2 A; 2FSL X; 4H58 A; 4J8M A; 4FKO A; 3PIZ A; 3EFJ A; 2LAV A; 1W7H A; 4QTD A; 3UVQ A; 4E6Q A; 3OY3 A; 4FK6 A; 4F0F A; 3OG7 A; 2PBI A; 3AC2 A; 4BBF A; 2CGU A; 2JFM A; 3C7Q A; 2QOF A; 4XOY A; 3Q9X A; 4HZR A; 5TE0 A; 4KKH A; 4NTT A; 1JKS A; 2UW8 A; 1W82 A; 4N6Y A; 5JRS A; 3R8U A; 4NL0 A; 3OVV A; 2JKO A; 4XOZ A; 3R8P A; 5CAV A; 3FI4 A; 3PXZ A; 4M66 A; 1OZ1 A; 4IIR A; 2PZ5 A; 2PMN X; 5I9W A; 5JFV A; 5IUH A; 3CX7 B; 3FI8 A; 3JR1 A; 5A4L A; 3LFE A; 3RCJ A; 5CF8 A; 5IPJ A; 2X4F A; 4JAJ A; 3ZLX A; 5D7A A; 2QCS A; 4FNW A; 4EL9 A; 4FE2 A; 4IB0 A; 4J97 A; 1OVE A; 3DTC A; 2ZB1 A; 5ANE A; 4QP4 A; 3VHE A; 4AA4 A; 5BVF A; 2EB3 A; 2WMS A; 3C5U A; 4CSV A; 3IDB A; 2QO7 A; 4LMN A; 3WF6 A; 1ZOE A; 3EQB A; 4R3P A; 4C02 A; 3ATS A; 2PVY A; 4TNB A; 4GU6 A; 1Q8Z A; 3WZE A; 1OIQ A; 5E1S A; 4C0T A; 4D55 A; 3QQJ A; 2OO8 X; 2XNB A; 4BCP A; 2XJ2 A; 5TOZ A; 4ASX A; 2H96 A; 2XK3 A; 2YDJ A; 3M11 A; 1WFC A; 4FTQ A; 4NJD A; 3ZEP A; 2CKE A; 5CXZ A; 2G01 A; 1M2R A; 5FWK K; 1ATP E; 4AX8 A; 3LJ2 A; 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