2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein 70
molecule tags Chaperone
source organism Escherichia coli
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
2E8AA 2D1KA 1HKBA 2GUPA 2QWMA 5JLHA 3H0XA 4A2AA 3HTVA 3LDQA 3AAPA 3HZ6A 3J8AA 2E20A 3L6QA 2VCPA 3SMPA 4O8KA 1RDWX 2YHXA 5AQOA 5EY4A 4DQ8A 1Q18A 3SJHA 4R5JA 1NGAA 3QBWA 4WQ4A 3LL3A 3T4AG 5BN9A 4WV5A 5AQSA 4YDUA 4CZGA 1ATSA 4BRHA 3HM8A 4WQ5A 4BG9A 3FZMA 2A6AA 2ASPA 5AQNA 2FSNA 2HOEA 4JD2A 2ZWHA 4EZOA 3QDKA 2A5XA 5AQQA 3VGLA 3EL2A 2E2QA 1C0GA 4H5NA 3VENA 3A0IX 2P9SB 3CI5A 3TPQA 3WT0A 1S22A 5AZIA 3BEXA 1DKGD 3RSEA 2FSKA 4MLHA 3TU5A 4EHTA 3MCPA 2FF3B 4M7XA 1KAYA 3VETA 3B8AX 4FWKA 1ZBSA 2NLXA 4B9QA 5E26A 1NGIA 4M7YA 3L3OM 4EIAA 4JN4A 4CJ7A 4FWSA 3VF4A 3ZETA 2QXLA 1J6ZA 1HX1A 4K25A 5AQHA 3ZEUB 3ZX0A 3DQGA 4ISFA 4QS8A 4EAHD 3ZX3A 4A61A 4NO7A 4IO8A 4BGBA 1BU6O 4H0VB 4B1WB 3DWLA 5KQDA 3G25A 4EZTA 4CZKA 2GWJA 5AQXA 3W3DA 1DKXA 3FGUA 1T44A 5EOYA 2GWKA 3HBTA 3WQTA 5BPLA 3VEOA 3WEEB 4Z94A 2YJFA 1EQYA 2P9SA 3H46O 4A62A 4CBUA 4E1JA 2PAVA 3U4LA 4H5WA 3VEXA 3EKUA 4EZUA 1GLFO 4XEIA 1ZXOA 5ELZA 3MN7A 2YI1A 3MN5A 5AQUA 4JWIA 4JHDB 4AM6A 1TUYA 2EWSA 2D4WA 1QZ6A 4FOIA 3D2EA 3BUZB 1WOQA 5KPRA 1H1VA 2HMPA 3GE1A 3SMSA 4FOEA 4XH1A 3WXIA 5F1XA 3WXLA 4AM7A 4IWVA 3QFPA 4QS9A 4BC5A 2P9NA 2ZGZA 1HKCA 4BR5A 1BPRA 1NWKA 4M63C 1Q5LA 4R5KA 3DXMB 3WXJA 1GLCG 3BP8A 3ULEA 2IVPA 2QWNA 3H1QA 4WQ4C 1ATRA 4BRQA 4O5FA 3QFUA 4GNIA 1ATNA 1GLLO 3O4WA 4YDUC 3WEEA 4F00A 4BC2A 4F01A 3DOBA 3WXKA 2OP6A 2A40A 1Z6RA 3P4IA 2A42A 4IJAA 4WQ5C 2ZGYA 3R9PA 5AQRA 1JCFA 3S41A 3LDLA 1E4GT 2P9UB 5BPNA 3KVGA 2FF6A 4BC4A 5ADXA 5AQKA 5AQGA 4B1VA 3L0QA 3UE5A 4BGAA 2QWLA 4JHDA 2GELA 1YXQA 2BTFA 4Y0WA 3H1VX 2QWOA 2P9LB 4HYBA 3W0LA 1SZ2A 4BVOA 3VEZA 3OHRA 4BR9A 4B1ZA 4QS7A 5BRDA 5F0XA 4EZQA 4DHYA 3CJ1A 4BR0A 1DG4A 1CZAN 5JMVA 2YJEA 1T6CA 3O08A 3VPZA 5AQWA 2E1ZA 3DXMA 1YAGA 1V4TA 1RFQA 4EZZA 3L4IA 3VEYA 4DCHA 1IJJA 3CIPA 1NGCA 4FWPA 1XQSC 3CJAA 3FR0A 3LDNA 1NGDA 4MLEA 3VF2A 3VGKA 2P9UA 2Q0RA 3O80A 5E84A 2CGJA 3LM2A 4JWEA 1LOTB 4PKGA 4BR7A 2D0PA 2GEMA 1BUPA 2HF4A 3GOIA 2W40A 5AQMA 3EN9A 2P9LA 1GLDG 1NGBA 3R6MA 2V51B 1NBWA 2WINM 4BRPA 5FPMA 4BRCA 4MO4A 4BROA 2W41A 3C7NB 3SLCA 3MK6A 3H3OB 3VOVA 5AQFA 1QQMA 1Z05A 4CD3A 4JWDA 2FLOA 4H0OA 4L3QA 5CE3A 2P9KB 5AFUA 1D4XA 1QQOA 2Q2RA 3LM9A 2QW9A 5AQPA 3MN6A 4I6MB 5TKYA 4DB3A 3VEWA 1TYQB 3IUCA 3CJ9A 5AFUH 5EVZA 5KPZA 3T46A 1BG3A 4FPAA 4FWMA 1HPMA 4JAXA 2YHYA 4EZYA 2VWBA 4R5GA 4IXCA 4BRIA 1U2VB 4CZLA 5BR9A 1HKGA 3IDHA 3F9MA 4IZ9A 4PL7A 5AQVA 2ASOA 3A5NC 2E2OA 3KHYA 1GLJO 2E2PA 5AZJB 4H0PA 4FSVA 2IVNA 2IVOA 3GG4A 3U9ZA 5FPDA 1RGIA 5AQYA 4EFHA 3CQYA 2Q31A 2AA4A 3O1WA 3A5OC 1MDUB 1SQKA 3JXUA 7HSCA 4FL9A 3ATVA 4EZPA 3ZEUA 4H5TA 1KXPA 5LJVA 3UKUB 3FZHA 2A41A 2Q36A 5BRHA 4I6MA 3O6WA 3VF6A 2I7NA 3M1FA 1G99A 1GLBG 2F9TA 2V52B 1XUPO 4BVPA 3T49A 4BR2A 2YCHA 3N8EA 5BRFA 4CI6A 3MMVA 4E81A 5FPNA 1HLUA 1U2VA 2DPNA 4CZEA 2QWPA 5KPTA 5LJWA 3HI0A 4FO0A 1DKZA 1NGGA 3H6EA 1X3NA 5AZJA 2ASMA 1BA1A 4MO5A 3KZBA 4A2BA 3CETA 3R8EA 3ZX2A 2UYTA 1S3XA 3HSCA 2E88A 3BF3A 1BWFO 2Q0UA 3CJ7A 5AQTA 5ADXH 3DXKB 4EZNA 1OKJA 4BQLA 4K43A 3UKUA 3VESA 3U8XA 3UKRB 3QMLA 2WUSA 4ISEA 3GDQA 4BRDA 4CBXA 2NZTA 2YHWA 4FWOA 4B1UB 3EO3A 5B8HA 1R59O 3DJCA 1QQNA 2QM1A 2I7PA 3M6GA 4CZFA 5I9EB 3AY9A 4WV7A 1JCEA 3O8MA 4H6IA 3BF1A 5AQJA 4H0TB 2A3ZA 2QWQA 3QNJA 2FXUA 1DGKN 3CJCA 1IG8A 2QFFA 4BREA 4HWIA 1NGEA 5AR0A 4BRFA 2CH5A 4B1XB 1KAXA 5JLFA 2H3GX 5EX5A 2Q97A 2P9PB 1MWKA 3A8YA 3ZETB 3QB0A 3FZKA 4R5IA 3ENHA 1X9JA 2QWRA 5KQ8A 4BRMA 3DXKA 5LY3A 4CZJA 4H5RA 4NB4A 1K8KB 4EZVA 3CQXA 3H3NO 3SK3A 3U9DA 3WQUA 4EHUA 3UKRA 1MWMA 3QBXA 4JNEA 1NGFA 2P9IB 2PBDA 1NGHA 3AARA 4CD1A 3VGMA 3CERA 3IMXA 1C0FA 1GLAG 2ITMA 4BRNA 4RTFD 2AP1A 1YVNA 3DPPA 1TUUA 4FWQA 5EXWA 3AAQA 1NLVA 2CGKA 3QICA 5F2RA 2IIRA 1NM1A 1V4SA 5BN8A 3CJBA 3FLCO 1E4FT 3I8BA 4HTLA 4B1YB 3D2EB 4RCHA 2D0OA 3T48A 3MN9A 3O5BA 2P9PA 1JCGA 3GL1A 1BA0A 2F9WA 4BG8A 3T47A 1YUWA 4XH4A 2CGLA 4ISGA 5FPEA 1QZ5A 3D7EO 1DKYA 3O1BA 4J8FA 4CBWA 1NMDA 2P9NB 1GLEG 1ZC6A 3JS6A 2Q1NA 4BQZA 1K8KA 4H03B 1DEJA 4HY9A 3ULEB 1KAZA 3D2FB 3C7NA 3OHXM 1SAZA 3FFKB 2OANA 2P9IA 4CZHA 3EKSA 3M3ZA 3DPOA 4PL8A 4BRLA 2NRHA 4XH5A 2P9KA 4IJNA 4LC9B 4FWNA 3DAWA 1LCUA 2FSJA 3C0BA 1ESVA 4BC3A 4JWCA 1WUAA 3ID8A 4EZXA 4H6HA 3CHWA 1XC3A 4K42A 1BDGA 3ATUA 4KBOA 1BOTO 4FWRA 2VYPA 2E1YA 2GTDA 2KHOA 3DPQA 3I33A 1TYQA 3A5LC 1NGJA 1P8ZA 3H45C 3IFRA 2V7ZA 3LDPA 3WUHA 1MA9B 1U6ZA 2ZF5O 3MDQA 1U00A 4FPBA 4PKIA 4PKHA 5JICA 2HF3A 4C23A 2V7YA 2BPRA 5AQIA 3FZFA 3GBTA 4RWTA 4FWLA 4CZIA 3VEVA 4F9OA 3FZLA 1QHAA 3FE1A 5AQLA 3LDOA 1Y64A 3D2FA 1X3MA 5AQZA 4R5LA 4CZMA 4H5VA 2E2NA 3A5MC 3UB5A 3EZWA 2BUPA 4EZSA 2J4RA 4WYBA 4PO2A 4EZRA 4BR4A 4H0XB 1T6DA 4JD2B 4EZWA 4JNFA 4BRGA 5BREA 3VERA 4BRAA 4K41A 4H0YB 1CKRA 1BO5O 5BPMA 4GY2B 3ENOA 5AZIB 1HUXA 3RSEB 2CH6A 1HJOA 4BRKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F5TA 2GUPA 2UUCK 3J7YP 2XO7A 3RV1A 1QWNA 2X74A 2E20A 3HZ6A 3TAMA 3SMPA 1C0TA 1RDWX 2YHXA 1TKZA 3TSPA 4CJ5A 3NDKA 2O4IA 4HVJA 4OLAA 3M8SA 4LF8K 4H8SA 3LL3A 3T3FA 5KGXA 2YI9A 3V1RA 4JRQA 1RBUA 3LAMA 1LAVA 2HVHA 3KLHA 1L3UA 2D0BA 3OBWA 4JD2A 1REVA 4JK9A 2ZWHA 3QDKA 2A5XA 5AQQA 4X64K 3EL2A 4I2PA 1HNWK 2A1SA 4H5NA 4E89A 4FZOA 1JLFA 4DFKA 3G71N 2KYQA 3CI5A 3TPQA 1KV0A 3V9XA 4LY7A 3Q84A 5CHIA 5FROA 3SV3A 4MLHA 1IBKK 1U4BA 1KAYA 3VETA 4GKKK 4FLYA 2GMOA 3RMBA 4M7YA 3KOWA 3CZNA 4CJ7A 2HHWA 3MWPA 4K25A 3TAFA 4LSNA 3DQGA 3ZX3A 3OS1A 1W0HA 3DLGA 1SU6A 4IO8A 1R0AA 4H0VB 3SV4A 1C1BA 1TV6A 3OK8A 4CZKA 3V9SA 2GWJA 2NNWA 4HHTA 2IC3A 1EO1A 1BCGA 3OYAA 1BI4A 3NCIA 4U67L 2GWKA 3ULDA 4IOXA 1N34K 5BR8K 3EJUA 1SKRA 3VEOA 4CCHA 4HHFA 2YJFA 2ATBA 2Z1HA 3H46O 2B3CA 4BDPA 3CPWM 3QEIA 1P0AA 2PAVA 4H5WA 4WFNL 3I8DA 1TK8A 3VEXA 4EP4A 3DX4A 4XEIA 2HNYA 4CJKA 5AQUA 4DSJA 4FM3A 4DFJA 1K73O 1PE4A 1SUQA 1SU7A 4H4MA 3HM9A 4BACA 1VRTA 1P90A 3OYDA 3D2EA 4E7JA 1RBSA 3GE1A 4FLXA 4FOEA 3V9UA 4IWQA 3NGYA 3WXIA 4CF9A 5F1XA 1HNIA 3CMAN 3PO4A 4DV3K 2HHHK 3LLLA 2E2FA 2ZGZA 4OKEA 3CD6N 1HKCA 4HUGA 4KTZA 2KPYA 4M63C 4R5KA 2YLAA 4OKKA 4DS4A 1ATRA 1I3AA 3QFUA 5CY0A 2OP6A 1WT7A 3P4IA 5AQRA 5GAGP 3S41A 2KZZA 1QSYA 1TQSA 1B7DA 1YTAA 1T7AA 4DTJA 1OH8A 5AQKA 2HBLA 1NH5A 1K9MO 3UE5A 3P38A 4BGAA 2A7TA 4JHDA 2GELA 1YXQA 4DCNC 2BTFA 1R5EA 3RR8A 2QWOA 2P9LB 1SZ2A 5HL7L 1Q9YA 4B1ZA 4QS7A 4CGDA 4BE1A 4CJ4A 3BUPA 4QCLA 1DG4A 2YNHA 1CZAN 4MQDA 3B52X 4DTMA 2BRZA 1NE5A 4FJLA 1C0MA 1TKTA 1JZBA 3O4NA 3BZCA 3VQEA 3DXMA 1JXBA 4DR3K 1YAGA 2ITGA 4DF8A 1UWBA 1RFQA 3M8QA 4EZZA 2F1BA 1NKBA 3CFRA 1NRAA 1NGCA 4FWPA 1XQSC 3FR0A 3EZ5A 5J2NA 3K5LA 4A59A 3L4QA 3VGKA 3O80A 1GNTA 3OY9A 1LOTB 4CJRA 5JVGL 4FJ7A 2D0PA 3D0PA 2KLAA 4FM1A 3HOTA 3EN9A 3QETA 1CZBA 4UAFE 4JI2K 4BRPA 5FPMA 4ZTFA 2RAKA 4DTNA 2ATQA 3SLCA 2ALWA 1N32K 1TK5A 3NVKA 4H0OA 4L3QA 2P9KB 4KHSA 1L3TA 1RTIA 1I6FA 1HYZA 5AQPA 3MN6A 5EU7A 3I2WA 1KCFA 5TKYA 4CJLA 5C5BB 3HAHA 3IUCA 4D8JA 1RT1A 3U3YA 2YHYA 3UIQA 3F9KA 2MI7A 3LALA 3J80O 4CZLA 4AEIA 2SN3A 3D45A 1LV5A 4PL7A 5AQVA 3KHYA 4IDHA 1GLJO 1WDZA 4DR2K 2X3XA 4GVEA 2UUBK 5AQYA 4GV3A 3M8RA 1VHXA 4BY9C 2PY5A 1HQEA 4C8LA 2W42A 1SQKA 3ATVA 1MU2A 4EZPA 5D3GA 1N33K 1KXPA 4LF4K 4CHPA 3AO5A 3S3NA 1VSMA 1WBBA 1SEGA 3FZHA 4RW6A 1J5OA 4JKDA 2I7NA 1G99A 3OYLA 3WNFA 1TQVA 4BVPA 4AZ5A 4Q0BA 4BR2A 4O4GA 3AVFA 4LF5K 1OH7A 1SU8A 4CI6A 4NXNK 4DUZK 5C15A 3M3WA 4E81A 4QOZB 4AB0A 3E9PA 1EWRA 4JI6K 3HI0A 5CR4A 2Q13A 4FO0A 1DKZA 4JKCA 1S72N 1X9MA 1BA1A 2KSKA 2RN2A 4A2BA 1NK6A 2O8FA 3IS9A 2OTJN 1VQ5N 4AZGA 5KRTA 2UYTA 3F7WA 1BWFO 3CJ7A 1RT4A 3LWLA 1VRUA 3LMFA 4EZNA 1OZZA 4AHCA 3VESA 1W9HA 1R34A 1O7DC 4FZSA 2KJAA 3QMLA 3MXJA 3EJPA 4ISEA 5C42A 3OYGA 3JYTA 1TAUA 4F3TA 3EO3A 4UAEF 4XJXA 1HRHA 1VSDA 5I42A 3DJCA 1ZYVA 3ACOA 1CLQA 3BVVA 1XHXA 3SPYA 2HSTA 1TL3A 1TKXA 4H0TB 4MQ3A 1X04A 1ZBFA 2FXUA 2OPRA 2G8IA 3B51X 3NE6A 2BE2A 4B3TK 1I4DA 4W5RA 4BRFA 3T7ZA 1D5AA 1EXQA 3OJSA 4CGJA 3E7RL 2B5JA 4B9SA 3QB0A 3SUOA 4OPAA 3FZKA 1X9WA 4LFCK 4CK3A 3DDGA 4O44A 5LY3A 3CCEN 1UOCA 4NB4A 1K8KB 3AVHA 3H3NO 3BVWA 4IM0A 3DX3A 2HMIA 4EHUA 1MWMA 3AVJA 1NJYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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