2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein 70
molecule tags Chaperone
source organism Escherichia coli
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
3GDQA 3KZBA 2P9UB 4BRGA 3VOVA 3EZWA 3KHYA 4R5KA 4BR7A 3DJCA 1WOQA 3ENHA 1BO5O 1KAXA 4JAXA 4CBUA 3KVGA 3WUHA 3T47A 3AARA 3P4IA 4EZRA 1ESVA 1Z6RA 5CE3A 2V7ZA 2VWBA 4BG9A 3MN5A 4FWNA 2P9PB 2YI1A 1NM1A 4XH1A 3EKUA 4IZ9A 2VCPA 1X3NA 2GWKA 3H6EA 4BRHA 3VGMA 5F2RA 1CZAN 3CQXA 1KXPA 4H6IA 1YVNA 5BRHA 5BPMA 1QZ6A 3O6WA 3D2FA 2FF3B 2QM1A 4FWMA 4KBOA 5TKYA 2F9TA 3CJBA 5BRDA 2Q1NA 1D4XA 2VYPA 3FZLA 4R5GA 5AQGA 5EOYA 3AAPA 3HZ6A 3SK3A 4EZVA 2QWRA 5EX5A 2YJEA 2W40A 1QZ5A 3VESA 2P9IB 4WV5A 1RDWX 4JWCA 4EZTA 3DXKA 3EKSA 5LJWA 5BN8A 3O80A 5JLFA 3VEVA 3VF4A 5AQIA 3ATUA 4BR0A 2CGKA 5JICA 1HPMA 4CZEA 1R59O 3MN9A 3DOBA 1DGKN 2IVOA 3AAQA 2V52B 1NGDA 1BOTO 5FPMA 5AQHA 3LDPA 1RFQA 3QB0A 2P9IA 3U8XA 3M3ZA 3BF1A 3FE1A 1BA0A 4NB4A 1GLDG 4IJAA 3WQTA 4H0YB 4PKGA 3QNJA 3D7EO 1GLCG 3VGLA 3UKRB 3VGKA 4AM7A 2D1KA 3CJ9A 4J8FA 3IFRA 3UE5A 3DWLA 4H0TB 4EZQA 1U2VA 3ZX0A 4BGAA 3H1VX 4O8KA 2E2OA 3C7NB 2D0PA 3N8EA 3WQUA 4AM6A 5AQLA 2E2NA 1ZC6A 2P9SB 3CIPA 2P9NB 4GY2B 2PBDA 3VEOA 1GLEG 3HI0A 1XC3A 5FPNA 1NGBA 4H0XB 1MA9B 3CETA 3H3NO 4CZHA 1HLUA 1SQKA 3C0BA 4K25A 3W3DA 4BC5A 4FWQA 1V4TA 4FPBA 2QW9A 5AQUA 4M7YA 4EHUA 2E8AA 2IVPA 4YDUA 2HOEA 3LDQA 4L3QA 1T44A 2D4WA 2P9NA 2PAVA 3O4WA 3R6MA 4BG8A 4CZMA 4HYBA 2A3ZA 4B1YB 2QWOA 1U6ZA 1QQMA 4EFHA 2YHWA 3MMVA 1X3MA 1BDGA 4WYBA 2FLOA 3SLCA 5F0XA 4H5WA 1SZ2A 3IUCA 2F9WA 5B8HA 4BC2A 2CH5A 5AR0A 3FLCO 3QICA 3FR0A 3ATVA 5F1XA 1OKJA 4K43A 4H0OA 1T6DA 1GLAG 3HTVA 4B1WB 3LDOA 3WT0A 5BREA 2Q36A 1DKYA 1Y64A 3ZX3A 3VEYA 2ZGYA 4RTFD 1ATRA 3DPOA 4EZXA 3D2FB 3HM8A 2QWLA 1GLJO 4YDUC 4A2BA 4BRMA 1NGFA 4QS8A 4EZNA 3FZMA 4EZOA 1NGGA 3GL1A 4Z94A 3DQGA 3LDNA 2J4RA 4I6MA 2ASOA 2GELA 3QFUA 3O08A 3DXKB 4NO7A 3EO3A 1DEJA 3UKUB 2BPRA 4FWLA 1NGAA 4F00A 1E4GT 4BRAA 4PO2A 3I33A 3HSCA 3IMXA 3O5BA 5FPEA 4A2AA 1QQNA 4H5TA 1V4SA 3H0XA 3ZETB 2GUPA 1C0GA 4BRCA 5KPZA 2E1YA 4BRKA 3VF2A 2A6AA 4MO4A 2YJFA 4JWIA 5AQYA 2CH6A 3SMSA 2FSKA 3ZEUB 1NBWA 2HMPA 1JCEA 4M7XA 3UKUA 2NZTA 2FSJA 1BG3A 5AZIB 4BR5A 1Z05A 4FOIA 1LOTB 1DKZA 2H3GX 1SAZA 3GG4A 4DCHA 1U2VB 3BUZB 4BVOA 4B1VA 4CBWA 3VERA 3ZETA 4FL9A 3D2EB 1LCUA 2QFFA 4FWRA 5AQFA 5AQQA 1ATNA 1Q5LA 4E1JA 3LL3A 3VETA 1XQSC 2A40A 3H3OB 4PKIA 2DPNA 2HF3A 3GE1A 3CJ7A 3QFPA 3ZEUA 2A5XA 5LJVA 3HBTA 4FPAA 1X9JA 1NGHA 4H0VB 4H03B 1GLBG 5AFUA 4PL7A 3QBXA 5AZIA 4DHYA 3OHXM 1H1VA 2Q97A 1S22A 4JD2B 5BN9A 3WXKA 2GTDA 4CZIA 1NLVA 2E2QA 3ENOA 4IXCA 2WINM 3D2EA 1RGIA 3FFKB 5EXWA 1MDUB 1G99A 3IDHA 4CI6A 2QWMA 2P9LB 1EQYA 4B1ZA 3ID8A 4H5RA 4CZFA 3VENA 5AQXA 4H5NA 3R8EA 4BRFA 3VEZA 3FGUA 4BROA 5AQMA 4JWEA 2ZGZA 3MN6A 4JD2A 3MCPA 1K8KB 4EHTA 4EZSA 4BREA 3O1BA 3BEXA 1BWFO 2GEMA 4A62A 4CJ7A 2ASPA 1P8ZA 3A8YA 5ADXA 5AQJA 1NWKA 5FPDA 1GLFO 3LDLA 2HF4A 4HTLA 3T4AG 1BU6O 3SJHA 5EVZA 2P9LA 1QQOA 1YXQA 3VEXA 3VEWA 5I9EB 2E1ZA 3WXLA 4FWKA 4JN4A 4WQ4A 4R5IA 4BR4A 3CERA 2V7YA 4WQ5A 2P9KB 3EL2A 3LM2A 4RWTA 1C0FA 3CJ1A 4JNEA 3S41A 1K8KA 1E4FT 1QHAA 2OANA 2AP1A 5LY3A 2ZF5O 4CBXA 4BRIA 4I6MB 4F9OA 5AZJA 3DAWA 4ISEA 3ULEA 4BC3A 1HKGA 5JLHA 4C23A 1MWKA 1ATSA 2YHXA 4CZLA 4K41A 2YHYA 3B8AX 2V51B 4GNIA 3CQYA 4B1XB 3CJCA 3U4LA 4HWIA 2Q0UA 5JMVA 4JHDB 1JCFA 3DPPA 3GBTA 4CZJA 2CGLA 1S3XA 3FZKA 3H45C 2W41A 2P9KA 3QDKA 1YAGA 3BF3A 5KPRA 2E20A 3BP8A 3I8BA 5KQDA 3A5OC 4WQ4C 2BUPA 1DG4A 3F9MA 4MLHA 3JXUA 4WQ5C 3DXMA 3QBWA 1J6ZA 2QWQA 4FWSA 3O8MA 1T6CA 4EZUA 3FZFA 4CD1A 1GLLO 3RSEB 1CKRA 2IVNA 4CZGA 1HKCA 4JHDA 3L3OM 1DKGD 3JS6A 4MO5A 4WV7A 3UB5A 2FF6A 5AQOA 4MLEA 4LC9B 1KAYA 5KQ8A 5KPTA 4IWVA 4BRDA 2IIRA 4BQLA 3H46O 1NGEA 1XUPO 4BRPA 5AQSA 2P9UA 1NMDA 3FZHA 4XH4A 2CGJA 4HY9A 4H0PA 5ELZA 3CI5A 3U9ZA 4A61A 2ASMA 3OHRA 4FO0A 3RSEA 4IO8A 5BPLA 1IJJA 2EWSA 3EN9A 1NGJA 1MWMA 4BRNA 2NRHA 3ZX2A 2OP6A 2P9PA 1DKXA 2QWPA 4F01A 3T48A 1HX1A 2Q0RA 4BQZA 3TU5A 2Q2RA 4EZZA 4FSVA 5BR9A 1JCGA 4JNFA 4R5LA 4XEIA 3U9DA 4Y0WA 3WXIA 1HUXA 5AQNA 2AA4A 2YCHA 3WEEB 3CJAA 2FSNA 3M1FA 1TUYA 2GWJA 4H6HA 4BC4A 1BUPA 4DQ8A 3DPQA 3T49A 4XH5A 3CHWA 5BPNA 2I7PA 1TYQB 2WUSA 3W0LA 3AY9A 5E26A 3WXJA 4EZYA 1WUAA 2FXUA 4E81A 4O5FA 3L6QA 4RCHA 2Q31A 5E84A 1BPRA 4FOEA 1HJOA 4EIAA 4EAHD 5AFUH 2A41A 3M6GA 1YUWA 3MK6A 4EZPA 3WEEA 5AZJB 5AQWA 3ULEB 2NLXA 4CZKA 1KAZA 2E2PA 5AQTA 4QS9A 4BRQA 5AQVA 2D0OA 3T46A 3O1WA 4CD3A 1TYQA 4K42A 7HSCA 1ZXOA 4BGBA 1BA1A 2ZWHA 3MDQA 1IG8A 3UKRA 4DB3A 3MN7A 4QS7A 2UYTA 2QWNA 5BRFA 3J8AA 5AQPA 5AQRA 2I7NA 2QXLA 3C7NA 5EY4A 4PKHA 3QMLA 5AQKA 4IJNA 4BR9A 1NGCA 3VPZA 4M63C 3DXMB 1TUUA 1U00A 2P9SA 3G25A 3L0QA 2A42A 3LM9A 3GOIA 1NGIA 5ADXH 4ISGA 3TPQA 4FWOA 3L4IA 4R5JA 1Q18A 4EZWA 4PL8A 4ISFA 1ZBSA 3SMPA 3A5LC 3A0IX 4B1UB 2KHOA 3R9PA 4BR2A 3A5MC 4BVPA 3VF6A 1HKBA 5AQZA 3H1QA 4B9QA 4JWDA 4H5VA 2ITMA 4FWPA 4BRLA 3A5NC 2BTFA 2E88A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UOCA 3KZBA 1NJWA 2P9UB 1Q8IA 3VOVA 2V0OA 3EZWA 4R5KA 4JAXA 1REVA 1S6PA 3WUHA 4AHVA 3LZJA 3P4IA 3BVUA 4EZRA 1MR4A 1Z6RA 2PY5A 4BG9A 1XHZA 3QEPA 3D4ZA 3NHGA 1WMTA 2F8TA 1NM1A 2BGGA 4XH1A 2Z1GA 1X03A 3EKUA 1VNAA 4IZ9A 2C08A 1X3NA 3IKMA 4JKGB 1QVFM 4UY8O 4I7FA 3CQXA 4FM1A 1YVNA 1TVRA 3O6WA 4LF5K 4KBOA 2FBTA 1UA0A 2F9TA 1WLJA 4JI3K 1W9MA 1LW0A 4R5GA 1WWNA 5AQGA 3K9KA 3Q0KA 3AVNA 4JKDA 2FYVA 2DFEA 4IM0A 3O80A 1E1DA 1C1BA 1ZBFA 4KB0A 3VQ6A 3KC6A 3DX2A 1XNQK 4JKGA 3ZT2A 4M3UA 1PS3A 4NLCA 4M3ZA 2UUCK 4DV2K 4CZEA 3MN9A 2F7PA 4I2PA 4JI5K 3NGZA 1JLFA 1TQWA 4CEZA 2IVOA 1B9FA 5JENA 1WT7A 1JQKA 1NGDA 4KYPA 2V52B 2X78A 1JKHA 5CZ2A 3HOSA 3LZIA 2UU9K 3I55N 4CQKA 1WSEA 2AJQA 2SN3A 4NB4A 1BA0A 3WQTA 4H0YB 5CY4A 1J53A 1WNSA 1CN2A 3UKRB 4WFBL 2D1KA 1SUQA 2X3WA 4EZQA 3CC2N 4C8MA 2E2OA 3THVA 3KP1A 4G9ZA 3N8EA 2XY6A 2E2NA 1XNRK 4PA1A 3HM9A 2YL5A 2RKIA 1SKSA 2PBDA 1LQQA 3G6EN 4LF4K 5FLXO 3GKUA 1JKZA 1N4NA 4CEDA 2BE2A 4M42A 4O5BA 3CFRA 2LXYA 3W3DA 1VK0A 1L3SA 4FPBA 3QIOA 3E1YA 4KTWA 4DTXA 4EHUA 2P1JA 3D6RA 2YIOA 4HE7A 3L2UA 2X5CA 1HR0K 4RW8A 4FK4A 4L3QA 2D4WA 4ID5A 4CZMA 2QEXN 1IO2A 3SUOA 3KK2A 2YEOA 4M41A 1NOYA 1QQMA 1QQCA 1X3MA 3UITA 2JWLA 4WYBA 1IKYA 3SLCA 4H5WA 4ILJA 2YI9A 4DSLA 1VQ6N 3ASMA 3ZSOA 1DT9A 4WFNL 1TQVA 2YHBA 4LD0A 3WT0A 3OS1A 5J1EA 3ZX3A 3HAIA 4CESA 5C5BB 3CQ8A 4IOCL 1YITN 3P39A 3TWHA 1O13A 3DPOA 4OPKA 1BIUA 3MECA 1HNWK 1BCMA 1NKBA 2NNWA 3FZMA 1S1VA 1RTJA 3DQGA 4DU3A 2HNDA 4ELVA 4M3XA 4CF2A 1RILA 4F00A 1E4GT 1RDAA 3N4PA 4PO2A 2YKNA 4NCBA 5C5BA 3AGRA 2VG5A 3OYLA 4CJVA 1IH7A 4F3OA 3O5BA 4WPCA 4OGCA 4ICLA 1NK9A 3HP6A 3DX3A 1T7EA 1J9AA 1GNLA 1C55A 5EU7A 1EO1A 3HAHA 2CH6A 4IFVA 4F2SA 3SNNA 1BG3A 3IG1A 3VQ8A 1NK0A 2XO7A 2NY8X 4DCHA 2O8DB 3AVAA 3MXJA 4K8XA 3KOXA 4FL9A 2LM0A 1LCUA 2D1LA 5AQFA 4FWRA 1RT2A 1Q5LA 3H3OB 1I3AA 4BWMA 2F7QA 3CZNA 3ZSXA 2RAIA 3HBTA 1U49A 2IGIA 2OTLN 4PL7A 2WTUA 3DLLL 3OHXM 4LY7A 4N47A 1S22A 5DMRA 5M1FA 4CK1A 1SN1A 4BE0A 4CZIA 2FBYA 5FIGA 2E2QA 2WFBA 1B92A 3ENOA 1WDZA 3CMEN 1VQ4N 3SQ2A 3FFIA 1C0MA 3VQQA 2C1IA 5H1SQ 4FVMA 1K6YA 4CI6A 3ZT3A 4DUZK 4H5RA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3GDQ A;  3KZB A;  2P9U B;  4ILI A;  4BRG A;  3VOV A;  1Q7Y O;  3L4Q A;  3EZW A;  3KHY A;  4R5K A;  3A98 A;  4BR7 A;  2HST A;  3DJC A;  1WOQ A;  2MN5 A;  1BO5 O;  1KAX A;  3ENH A;  4JAX A;  4JEP A;  3KVG A;  4CBU A;  3OBY A;  3WUH A;  3T47 A;  3AAR A;  3P4I A;  4EZR A;  1ESV A;  1Z6R A;  5CE3 A;  2V7Z A;  2VWB A;  4BG9 A;  3MN5 A;  1JJ2 M;  3I04 A;  4FWN A;  2P9P B;  2YI1 A;  1NM1 A;  4XH1 A;  3EKU A;  4IZ9 A;  1YF5 L;  2VCP A;  1X3N A;  3CCV N;  3AGK A;  2GWK A;  3IKM A;  3CPE A;  1UPX A;  3H6E A;  4BRH A;  1YHQ N;  4JKG B;  3VGM A;  1QVF M;  5F2R A;  1CZA N;  3CQX A;  1KXP A;  4UY8 O;  4H6I A;  1YVN A;  5BRH A;  5HOO A;  5BPM A;  1QZ6 A;  5TKW A;  3O6W A;  3D2F A;  4BY9 C;  2FF3 B;  2QM1 A;  4FWM A;  4IOX A;  4KBO A;  5TKY A;  2F9T A;  3R3L A;  2RE2 A;  3CJB A;  1QVG M;  5BRD A;  1W9M A;  1D4X A;  2Q1N A;  2VYP A;  3TSP A;  3FZL A;  4R5G A;  5AQG A;  5EOY A;  3AAP A;  3HZ6 A;  3SK3 A;  3K9K A;  4EZV A;  2QWR A;  4GV6 A;  5EX5 A;  2YJE A;  2W40 A;  1QZ5 A;  3VES A;  2OBM A;  3CW4 A;  2P9I B; 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