2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Escherichia coli
molecule keywords Heat shock protein 70
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
5AQGA 2WUSA 3ID8A 4PKGA 4H6HA 2P9KB 4H0YB 3ZX2A 4EZRA 1KXPA 4JNFA 4R5KA 4WV5A 4XH4A 2D1KA 3J8AA 3L0QA 5B8HA 2IVNA 3A5NC 4BREA 1YAGA 1ZC6A 3EKSA 1NGAA 3QICA 3HTVA 4BVPA 2Q31A 1T6CA 3C0BA 3WQTA 4HTLA 1J6ZA 3SJHA 4BRIA 3I8BA 3LDNA 2P9UB 4FPBA 3CQYA 5AQLA 1JCFA 1HLUA 4H6IA 1C0GA 2ASMA 3GG4A 3AAQA 5ADXA 1RDWX 1GLLO 5BPLA 1HUXA 2FSNA 2E2PA 1P8ZA 4EZQA 3CERA 1E4GT 3GOIA 1XUPO 3DAWA 4BGAA 3VEOA 2GWKA 5BREA 4CZFA 4XH1A 4JNEA 3VPZA 4BVOA 4EIAA 3VF6A 4QS9A 1BOTO 4E1JA 3R9PA 3HI0A 3BEXA 4C23A 3DPPA 4DCHA 1NMDA 3D2EB 2VCPA 1DKZA 1EQYA 3QDKA 1WOQA 4FWLA 1DKXA 1X3NA 2ZF5O 3A5LC 3MN6A 3O80A 2YI1A 1Q5LA 3AY9A 1QZ5A 2CH5A 4CBUA 5BRHA 5E26A 1Q18A 3CJBA 2D4WA 1QHAA 4L3QA 2DPNA 3CJ7A 3ENHA 2P9SA 1ZXOA 1JCEA 1D4XA 3HM8A 2P9LA 2WINM 3EZWA 3WXIA 1KAXA 5ADXH 2AA4A 2V52B 5F0XA 4NO7A 3U4LA 3ZX0A 4CJ7A 1HX1A 2GUPA 3MN7A 4EFHA 4CZKA 4WYBA 1LOTB 2D0OA 2BPRA 4JWDA 3VOVA 4A2AA 3SK3A 3VEYA 1TUUA 4FO0A 3C7NA 1MWKA 4RCHA 4CZGA 3D2FA 3W3DA 5JICA 3DPQA 4EHUA 4I6MB 1BA0A 2E1YA 3QBWA 2YHXA 4QS8A 3WEEA 4O5FA 1U2VB 2YJEA 3BF3A 3LL3A 4PKHA 4DQ8A 3QMLA 4BC5A 5FPMA 3U9DA 1IG8A 4BRNA 1GLBG 4CZLA 3KHYA 1K8KA 4JD2B 3FFKB 3ATVA 1XQSC 2W40A 5AQQA 1NWKA 1NGIA 3LDOA 2W41A 3MN5A 2E2QA 5AQYA 2D0PA 5EVZA 3A8YA 2HF4A 2VWBA 4GY2B 4CZJA 4ISFA 2E1ZA 1HKGA 2GEMA 5KPZA 3UKUA 1GLAG 4BC2A 3S41A 4B1VA 4EZUA 2BTFA 3VF2A 3UE5A 3LM9A 3UKUB 2J4RA 2PBDA 3ENOA 2QWOA 3T49A 2GWJA 4M63C 4H0XB 3WT0A 3RSEB 3DPOA 1MA9B 3VEZA 1MDUB 5AQNA 1U6ZA 3MN9A 4A61A 4QS7A 4FWSA 3T46A 1XC3A 1OKJA 1E4FT 1WUAA 2P9NB 3H3OB 1NGGA 1V4SA 2AP1A 3BUZB 3VF4A 3ZEUA 1BUPA 4PL8A 3VGLA 3OHXM 5KPTA 3JXUA 3O1WA 5AQTA 5FPDA 4LC9B 5AZJA 3H1QA 4IJAA 3EKUA 1JCGA 1ATRA 5AQMA 3QFPA 4FWOA 4B1XB 4BQZA 4FWNA 1ATNA 4JWEA 2ZGYA 5AQZA 3FLCO 1KAZA 4FWMA 1GLFO 4FWKA 3CHWA 1BDGA 4BRLA 2P9IA 1GLEG 4ISGA 3VESA 3HZ6A 3MDQA 3IUCA 3U8XA 2QWPA 2A40A 1NGDA 4B9QA 3FZHA 3KVGA 1X3MA 2P9IB 3VERA 4K41A 4BRHA 3MCPA 3FZMA 3GL1A 3DXMA 1YXQA 4F01A 2YJFA 3WXKA 3FE1A 5BN8A 1QQMA 2Q1NA 4EHTA 3QNJA 1V4TA 1S22A 4FOEA 4H0VB 5BRFA 1CKRA 2I7PA 3QFUA 4HY9A 3CIPA 4B1WB 3AARA 3HSCA 3KZBA 4PKIA 4B1YB 5EXWA 4CD1A 4H5NA 3FR0A 3A5MC 4WV7A 3CJ1A 3H46O 3VGMA 4EZTA 3GE1A 1DEJA 4K42A 5EX5A 4IJNA 1G99A 2FSJA 1SAZA 2P9SB 4R5JA 2P9LB 3DXKA 2IIRA 3HBTA 4K43A 4AM7A 4F9OA 5LJVA 3B8AX 4DB3A 3WXJA 1C0FA 3WXLA 3UB5A 4BROA 3DXKB 2E88A 2V7ZA 3O4WA 5BRDA 4BC3A 5JLHA 4H0OA 3UKRA 4NB4A 4MLEA 3F9MA 4MO4A 4BRFA 5EOYA 4BRKA 3O08A 4BR0A 3C7NB 3D2FB 1HPMA 5KQ8A 2YCHA 2ZGZA 3ZX3A 3WEEB 1RGIA 1DG4A 2QWQA 4WQ5A 2QXLA 2OP6A 4BC4A 2Q36A 4FWPA 3LM2A 1QZ6A 3DWLA 3EO3A 5F1XA 1K8KB 1TUYA 3H1VX 4FWRA 2A6AA 1GLJO 1QQOA 4AM6A 1BO5O 5AQRA 3BF1A 2FLOA 5EY4A 5FPEA 5BR9A 2IVPA 3VENA 2CGKA 4J8FA 2F9WA 1KAYA 5AQJA 5LY3A 3IDHA 1BPRA 2I7NA 1NGJA 3CI5A 4CZMA 5FPNA 1NM1A 2GELA 4JN4A 3N8EA 2BUPA 1TYQA 3ULEA 4JAXA 2CGLA 1T44A 1NGBA 5AZIA 3GBTA 3T48A 3FZKA 2QM1A 2IVOA 1Y64A 2EWSA 1Z05A 3DJCA 4H0TB 2P9PA 3TPQA 5AQXA 3IFRA 4EZOA 2E8AA 3ATUA 2E2OA 2HF3A 4FOIA 3WUHA 3P4IA 4XEIA 3VEWA 4BRDA 4BR5A 3LDLA 2Q0RA 4H5WA 1NGEA 2V51B 4JHDA 1NGCA 2YHYA 1MWMA 4GNIA 4RTFD 5AQIA 4B1UB 5E84A 4EZSA 3EL2A 2FXUA 4EZNA 5TKYA 4FSVA 4BRQA 3ZEUB 4IXCA 5BPNA 2A5XA 4WQ5C 4BR2A 3FGUA 4H5VA 3L3OM 2FF3B 4R5LA 1HKCA 3EN9A 4H03B 3CJCA 2H3GX 2P9KA 3BP8A 5AZJB 2QWRA 4MLHA 4HYBA 3M3ZA 2CH6A 3D7EO 1ZBSA 4ISEA 2A42A 4CZHA 2OANA 3LDPA 3MMVA 3WQUA 5ELZA 1YUWA 3W0LA 3T4AG 4A2BA 2P9UA 4Y0WA 5JMVA 4EZWA 3T47A 5AQHA 1DKYA 2NLXA 3ZETA 4CD3A 5AQWA 2Q97A 1GLDG 1LCUA 5CE3A 3ZETB 4HWIA 4B1ZA 2ASPA 5JLFA 3L6QA 4R5IA 3SLCA 3VETA 1H1VA 1BU6O 2QWMA 3VEVA 3DXMB 2YHWA 4K25A 4BRGA 4PL7A 4BR4A 5LJWA 1ESVA 1Z6RA 4BR7A 3H45C 3FZLA 2F9TA 2VYPA 1SZ2A 4BQLA 5AR0A 4BG9A 4BRCA 4YDUA 1DGKN 4Z94A 4BRPA 1U00A 3M6GA 3O1BA 4F00A 3H3NO 2ZWHA 3GDQA 1RFQA 3U9ZA 4BG8A 3D2EA 5BN9A 2Q2RA 4O8KA 1DKGD 3SMPA 3MK6A 4EZXA 3O8MA 2PAVA 3R8EA 2NZTA 2E2NA 4CBXA 1CZAN 2V7YA 4BR9A 3IMXA 3L4IA 1BA1A 5KQDA 1NGFA 4BGBA 3FZFA 4A62A 3A0IX 2FF6A 5AFUA 4RWTA 4H5RA 5KPRA 2UYTA 5AQUA 3M1FA 5AQKA 2Q0UA 1NGHA 7HSCA 3UKRB 3TU5A 1S3XA 5AQSA 4CZEA 4M7XA 3LDQA 2ITMA 2KHOA 3CQXA 4EZZA 2CGJA 2E20A 3JS6A 4JWCA 4WQ4A 3QBXA 3VEXA 4EZYA 1YVNA 2FSKA 3OHRA 3O6WA 3H6EA 4M7YA 4FPAA 3CJAA 1HJOA 4I6MA 1T6DA 4EZPA 4CI6A 1U2VA 3A5OC 3O5BA 3R6MA 4IZ9A 1BG3A 1NBWA 4YDUC 1NLVA 4CBWA 5I9EB 3DQGA 4E81A 5F2RA 1HKBA 4JD2A 3CETA 4XH5A 2HOEA 2HMPA 3I33A 4H0PA 4IO8A 4BRAA 3CJ9A 5AFUH 1TYQB 3ULEB 4FL9A 2NRHA 2QWLA 2GTDA 3G25A 1X9JA 5AZIB 1IJJA 5AQPA 4H5TA 4EZVA 1BWFO 1SQKA 3QB0A 2P9PB 4R5GA 1QQNA 3DOBA 2ASOA 4JWIA 3AAPA 2A41A 4JHDB 3RSEA 5BPMA 4BRMA 2QWNA 1GLCG 4EAHD 1ATSA 4FWQA 5AQVA 4KBOA 3H0XA 4WQ4C 2QFFA 4DHYA 4MO5A 2A3ZA 1R59O 3VGKA 4CZIA 2P9NA 2QW9A 4IWVA 5AQOA 4PO2A 3SMSA 5AQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WLJA 4E1NA 5AQGA 4PKGA 4JKHA 4AHTA 3ZX2A 4RW6A 4R5KA 1T8EA 1L3TA 3L0QA 1RDBA 1M1KO 3DYAA 3QINA 3UITA 1LW0A 2OW6A 5B8HA 1LW2A 3THVA 1U49A 2BANA 1YAGA 2KBKA 1ZC6A 3HTVA 1YVUA 3AVKA 3SJHA 4AHSA 2G2KA 5EU7A 3I8BA 3LDNA 5M1QA 3T1YK 3C6AA 2FICA 5ADXA 3J7ZO 4CE9A 3JSMA 3LWLA 4KAZA 1HUXA 3OYEA 1VSFA 3TAFA 3EJSA 3B51X 2RAIA 1E4GT 3HAIA 3VEOA 3H08A 3D52A 4JNEA 4DTPA 1YHQN 1KRPA 4EIAA 4C8OA 2HBLA 4GKKK 3EJPA 3HI0A 1CXUA 1D5AA 3D2EB 2VCPA 5M1NA 1DKZA 4IG3A 4IOAL 2N3KA 1Y2OA 1DKXA 3A5LC 1SU6A 3O80A 3B6PA 5BRHA 2YI1A 3AA4A 4XJXA 3D51A 2Z1HA 1Q18A 2RKIA 1QHAA 4L3QA 3BDPA 2O8EB 3CJ7A 3V9ZA 4IWOA 2P9LA 3EZWA 5ADXH 4KB0A 1BI4A 1NK9A 3AVLA 1GPSA 5KI6A 1FK9A 1VSEA 3MN7A 1J9AA 1P0AA 4NQIA 4WYBA 1KD1O 3LPTA 1RTHA 3WNGA 3CCSN 4N41A 4FJ8A 1LOTB 3GI7A 5JVGL 3SAHA 1QWUA 1G15A 5D3GA 3P38A 3LP1A 3KKSA 2O8DA 1VSJA 4CZGA 1PTXA 4M3TA 5JICA 3OYIA 3M5RA 5M1KA 3CD6N 1BA0A 2KJAA 2N66A 1FKPA 1S5JA 2E1YA 3MAQA 3WEEA 4C8KA 3SUOA 1U2VB 2YJEA 3BF3A 4PKHA 1ILYA 4JK8A 1U4BA 1BCMA 4DQPA 3DRPA 4CEDA 3U9DA 4FXDA 1GLBG 4CZLA 3KHYA 1QSSA 2HW3A 4JD2B 5KGWA 4DR3K 1XQSC 4PUOA 3ZSYA 2W40A 3ZSOA 1KV0A 4DCNC 3MN5A 3E66A 2E2QA 3VQQA 1MU2A 4IKFA 3K2PA 2HF4A 5HRNA 2E2FA 4AZ7A 2GA9D 2P1JA 3E01A 4OKKA 3TAGA 1PS3A 1EWQA 3AA2A 4AZ5A 4JI4K 3QESA 1NK5A 3KDRA 4CF1A 3VF2A 4HHTA 4FVUA 2J4RA 4JI5K 2FBVA 2GWJA 5J1EA 4H0XB 4H4OA 2Q3SA 2QA4N 3VEZA 1BIUA 3OTOK 3CFOA 1ZYVA 2QKBA 1LWCA 1TV6A 3ID6A 2OPQA 5M1PA 2P9NB 3IRXA 1NGGA 1WSHA 1R34A 1YF5L 3FFIA 1BUPA 4Q0BA 1EETA 4FJIA 3OHXM 3O3FA 4M3XA 4FZOA 1HWWA 5IT9O 5DK5A 3SBTA 4AHVA 4FLWA 3H1QA 3EKUA 3VQ5A 1OMYA 1WAJA 4UY8O 4B1XB 4FLYA 3SNNA 4FWNA 4CGDA 4F4KA 4JI3K 2JLEA 2ZGYA 1RT6A 3HO1A 4FZSA 4O0JA 4DF4A 1VQKN 4FWMA 2O4GA 3CCUN 1GLFO 2P9IA 1GLEG 1HNIA 3KK1A 3VESA 4E72A 3HP9A 1QSLA 3U8XA 3FZHA 3KVGA 4B9QA 1X3MA 4NYNA 2KFNA 4K41A 5HP1A 2VQFK 4CGFA 4IWQA 4GW6A 2UUAK 3DXMA 3HOTA 5C5BB 5BN8A 3CCEN 5KBPA 4LSLA 3QNJA 1JLCA 4FZYA 2KLAA 4LFAK 4FOEA 3M8RA 2HNYA 4M0MA 4K8ZA 2FBYA 1RTJA 3RR7A 2HMIA 4PKIA 4C8NA 3Q0KA 5EXWA 4KHUA 3VGMA 4JLHA 3U6FA 4FK4A 1DEJA 4K42A 4IJNA 2FSJA 1OVYA 2ELBA 2E4LA 1VRUA 3DXKA 3HBTA 4AM7A 5LMNK 4FLUA 3THYA 1A5XA 3BUPA 5HROA 2NCZA 1BL3A 3UB5A 4OLBA 5BRDA 5GIPA 4CIGA 4PHTX 4JRQA 4NB4A 4MLEA 4MO4A 4BRFA 3AO5A 3O08A 4ZHRA 3C7NB 1REVA 5M1FA 4DUYK 3AVHA 1IKYA 3HL8A 4IDKA 5DM6L 2YCHA 2XHBA 3TSQA 4HTUA 2FBXA 4B3SK 4H4MA 1DG4A 2QWQA 3SCXA 1NK8A 4WQ5A 1ASVA 2QXLA 3VQ7A 4BC4A 3TAQA 4FWPA 3SQ1A 4IDHA 3DWLA 3HAJA 1PE4A 1JZAA 1K8KB 1TUYA 4C8MA 3C95A 4DR4K 1VQ8N 4AM6A 3S3MA 1TKXA 2PZSA 1EWRA 5BR9A 2IVPA 4DSJA 1O7DC 3V81A 1KAYA 5AQJA 5LY3A 3IDHA 1BPRA 1GPTA 2I7NA 1IKVA 4DSIA 3J81O 4KO0A 2DFFA 2VWKA 3IS9A 4BEBA 2BUPA 3QEIA 2YNIA 3PO5A 4BE0A 1TAUA 4DF8A 3T48A 3FZKA 4FLTA 3AGRA 1N34K 4FJXA 2EWSA 1Z05A 4H0TB 2NUBA 1ZBLA 4CGHA 4RG8A 3TSPA 2IOCA 3ATUA 4AEIA 1JLQA 1ZWWA 3VEWA 3M3WA 3C65A 4DV1K 4H5WA 3NF6A 3QNIA 5FLEX 1NGCA 5H1SQ 1MWMA 2IC3A 4DV0K 5AQIA 4KHWA 1B3CA 2NY9X 4EZSA 3KIOA 3EL2A 4AZGA 5TKYA 3T3FA 3HVTA 4BRQA 1CLQA 1HPZA 4WQ5C 3EJQA 3FGUA 3P83D 3LANA 4B9NA 2FF3B 3EN9A 4R5LA 2RT6A 2P9KA 5AZJB 1T7EA 3ZYYX 3NHGA 1HQEA 4KHYA 3CQ8A 4AKVA 4ISEA 3QNOA 3C94A 4CZHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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