4DXCA

Crystal structure of the engineered mbp tem-1 fusion protein rg13, c2 space group
Total Genus 202
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
202
sequence length
637
structure length
624
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
molecule tags Sugar binding protein, hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 202
structure length 624
sequence length 637
ec nomenclature ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF13354 Beta-lactamase2 Beta-lactamase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA01
3.40.710.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Beta-lactamase DD-peptidase/beta-lactamase superfamily 4dxcA03
4F2QA 3UNWA 3MZBA 4ZEBA 2G29A 4JLFA 1Y9UA 3FUZA 2ZC4B 3ZCZA 5ICTA 1ES3A 2GHAA 2KLFA 5DEXA 4N13A 4P11A 4ZJ3A 3SEXA 4OMBA 5CHMA 1Q35A 2D3IA 3FD3A 3PV0E 1LAXA 4ESWA 2JC7A 3CJMA 3QK6A 1EH3A 3TEPA 1YLWA 2CMOA 3WAFA 2QL3A 1AH5A 3A3DA 3FV2A 3CRBA 4R2FA 4Q8RA 3IF6A 3JZJA 1POTA 3KN7A 3U1OA 4GB7A 3E13X 1IYSA 3FYZA 1M5BA 3UE3A 3LY4A 3ITAA 4QSCA 2QS2A 1OMPA 3O88A 1OVBA 3KOSA 2W7YA 4PQJA 5AA4B 3LC8A 2GHBA 1AIVA 3G2YA 3HLFA 2REGA 1BSGA 2V93A 3QAXA 3RGYA 3Q7VA 1BKAA 1YAEA 2Q9TA 4OONA 3LBSA 1K57C 1P1OA 3FXQA 5EUAA 2XK1A 4H8RA 5A5XB 4WXJA 1A99A 3OO8A 5FHNA 1KGGA 4KZ5A 4DDYA 1P99A 1H43A 1PZPA 2F34A 2A3UA 3IAZA 1DPEA 3W9WA 3W8KA 3PUYE 5FDHA 1HTZA 4WZ5A 1T0KA 4OETA 4H1XA 2XXXA 4TOZA 2I3WA 4E3LA 2WAFA 2XLNA 4LA9A 1GHMA 2WKYA 4R6YA 1B7ZA 4M4GA 4BENA 3GRJA 3IOWA 2Y2OA 2ZC3B 1ZC2A 2QSXA 3CG1A 1DY6A 3NDGA 2ZYNA 4JBFA 2QMWA 4QU3A 4GD8A 4IEDA 5CGXA 3VP1A 2QPNA 2Q9MA 3SESA 1JWPA 3OSRA 3KGCA 4I62A 3ZKLA 1XGJA 4X9TA 4OOYA 3PPRA 4HTGA 3K4UA 1HSJA 3KJTA 4PETA 5H8HB 4GL8A 3A3UA 4G8NA 5CHJA 3NBLA 3MZDA 1WVJA 2H98A 3H06B 4EBLA 3THIA 2RC8A 4UA6A 3KJ7A 3DWZA 1L5TA 4ID4A 2DOJA 1OVTA 2UVIA 2PBWA 5FQMA 3FIRA 3KG2A 3MUQA 3OMBA 4B4ZA 1IYOA 3RT6B 3HV1A 3T22A 3IH9A 3IO6A 2GFEA 3GZGA 2RKMA 1ZKJA 2F78A 3C34A 3PUZE 3G3KA 2AYSA 5TGFA 4OQIA 2VD2A 3T9VA 3Q81A 1NNTA 3JYIA 4YINA 3D4CA 5ELVA 1MPCA 1FQFA 3IOVA 3IF6C 1B52A 1K56A 4X6TA 2RL3A 4O7DA 4RYEA 5I57A 2DYXA 3SOIA 4UACA 3AGFA 3IOTA 3HBRA 2AIXA 3B7DA 5KZHA 3ZVTA 2ONKE 5KZTA 5AE4A 3QYTA 2OV5A 4ONYA 2HP6A 1OQGA 2VD3A 2GDNA 4DF6A 3HHFA 4WBGA 4U1OA 2G93A 3FKWA 2A5SA 4UAAA 5F7VA 2J9PA 1O64A 1TFAA 3T9HB 4G8MA 3LSFB 4HCYA 3PGFA 4GQOA 4OQ0A 3CMZA 5I59B 1HD8A 2X02A 1QULA 2ZQ9A 3MP6A 4PFTA 2G2UA 1IZ1A 1MPLA 1WODA 1KE3A 2XXRA 4KZ8A 1BLPA 5DT6A 4ZZAA 4BDLA 1JTGA 3HN0A 1QUIA 4U21A 2PX1A 2PVUA 1JWVA 2Y2QA 4KQPA 1SDEA 1QJMA 1S9TA 1BTJA 3OENA 4XKNA 1BP5A 5KCJB 5H8NB 2WK0A 5AA4A 1B0HA 4GDBA 3MAMA 1K55A 2DVCA 5CEDA 1JTDA 4OXVA 2VHAA 4YFMA 2H5SA 4BD0A 3B6QA 3M3FA 3FJGA 5I84A 2OK2A 5GLBA 5A5XA 2DWJA 1E3UD 3N94A 3TKDA 1IEMA 4KZ7A 4WMCD 1KVMA 2QJEA 1ATGA 1KWHA 4Y0TA 4JXGA 1PI5A 2H10A 1ANFA 3IXHA 1LAHE 3VDFA 2CC1A 4E6WA 4JSDA 2NXOA 2Z8FA 1YLYA 1MY8A 4GN2A 1LAFE 3ONMA 3TPAA 1Q1KA 1B51A 4H5GA 4RA1A 2DSFA 1TDGA 4ZTKA 1FCOA 2IA4A 3K02A 4KZ3A 5EHSA 4FE8A 1BLFA 3MVWA 4F19A 4GNUA 1BT5A 3UDIA 4R75A 2FFFB 4AB5A 3MZFA 5A92A 4JWOA 1HZOA 1N9BA 5FQKA 2ONSA 4DE0A 3LSXA 3T9XB 4GXSB 3U8QA 1BLHA 3TTKA 1SYIA 2JBFA 4DKIA 2XXPA 1ZG4A 5H8HA 2X7QA 4OFOA 3N8RA 3MJNA 4THIA 3E2KA 2XEPA 4LV2A 4DE2A 2ONRA 1A8EA 2FYIA 3VFJA 3KN8A 2Y84A 4ZDMA 3PUVE 5JTYB 3W15C 2V84A 1QW0A 1PIOA 1ES2A 3IWQA 3S1YA 1NH8A 1W8QA 3V8XB 5JYOA 4JSOA 3FVOA 1QKAA 2ZNUA 2D5WA 2BG1A 3BYDA 3LSWA 2H99A 1MM7A 3WS1A 4O3AA 4JB7A 3DLNA 4OHNA 3OO7A 3O28A 4WM9A 4OERA 4U4XA 4ZEIA 3IT9A 3UP9A 2P1SA 3MBPA 1ZG6A 1JEUA 3Q7ZA 1NH7A 5TPAB 1Y1MA 1B3GA 1OLCA 3CFXA 3MVYA 3RXWA 4RPOA 5L8DA 5BUUA 2XXHA 2QZ6A 3C7VA 3FASA 4NF8B 1MQJA 4BDMA 1G68A 4POWA 2H0TA 4N6PA 4R73A 5EVIB 3Q29A 1B40A 1XS5A 3W4OA 5ISUA 3JV9A 5BWJA 3Q82A 3CSBA 4EF2A 1E25A 3VFFA 3BFTA 3OELA 5I59A 1M6KA 1URGA 5FQJA 4DCXA 4QJGA 2HXWA 4OH0A 2YLNA 4IO6A 2LAOA 2EXAA 4EF1A 4RJZA 3NY4A 1TDLA 3MKEA 1B5IA 3WAEA 4XKPA 3C33A 4D2OA 1GGGA 3V5MA 4GD5A 5FI6A 3KEIA 1XA7A 2R6GE 3Q26A 4NWDA 3BFDA 3CSGA 4OWDA 2H0YA 1TVFA 4GF8A 5H8NA 4H65A 1B1HA 1AXBA 3HVFA 4H5FA 3VP2A 5FA7A 4KPTA 5H8QB 2Y7WA 3RTFB 3SEUA 1LCFA 3ZNYA 3O2AA 2IWDA 4Q5TA 2HP9A 3PU5A 4PM8A 2M8CA 1FCKA 1KVLA 3GMWA 4X53A 3OPLA 5DF7A 3FGSA 3KSJA 3SETA 1MWTA 2DVZA 4JXIA 4EQ9A 1MY3A 2NUVA 4KCCA 1NZUA 4BD1A 3SS4A 2Y2JA 2E8IA 3K2DA 4ZEKA 3DP4A 4U0XA 3SH8A 1PB7A 3G3IA 3ILTB 4OLDA 5E2EA 4QFLA 2HEUA 3QUFA 2Y2LA 1JETA 1FR6A 4LV1A 4QHQA 3N26A 3MXRA 4IO7A 4KG5A 1K54A 3FV1A 4DE8A 4LATA 3UK4A 3ZHHA 2OJTA 4YB7A 1I6BA 2PYYA 2HZLA 1PI4A 3HLDA 3SDFA 3FVNA 5M19A 1BLCA 5TP9A 2DWHA 2VGJA 5J1DA 3WRZA 3K01A 4N92A 4OKPA 5DTSA 2Z8EA 1MXUA 1QVSA 3QUJA 1URDA 4IO5A 2C6WB 3UE1A 4OESA 1Z7ME 3LCEA 4AB6A 3HLGA 4EBNA 4F3BA 3N6IA 3M6HA 3PAEA 3MFDA 2ZMAA 4CPKA 5CTMA 5JK4A 5F1FA 5JTYA 1PEBA 2Y7KA 3L6GA 2HPBA 1IYPA 4MNRA 1OQHA 1XOCA 1IEJA 4QRZA 3TODA 3IWOA 1L0FA 5AA1A 5HBCA 3IXBA 5AA2D 1PBPA 2Y7IA 1OIBA 2QS4A 4OPYA 4Z0IA 1DJBA 5DF9A 5HW3A 1N7WA 4EQBA 1KE4A 1ELJA 5HFOA 1R6ZA 4EWFA 1SD3A 3BFEA 4KYEA 1N04A 5TPAA 1SW5A 3TG9A 1NNKA 1SDNA 4BJPA 3BFFA 2DE3A 1LFIA 1MY2A 4Q0CA 4LZ8A 4R23A 3T9UA 3USDA 3A09A 1B7UA 4NF8A 4HS7A 3T66A 5EHMA 5EVIA 1ZKBA 4RY1A 3HUOA 1M40A 4FH2A 4OFLA 2DE4A 3FXRA 3CG5A 4NF4A 5F1QA 3H3GA 5E2GA 5FTIA 1ERMA 3OC2A 1N7XA 1XX2A 4IY5A 1Y3PA 4IVKA 2V3TA 5M1AA 2WKEA 1TXFA 3UN6A 3WRTA 1N76A 1KDWA 4S2IA 2E0SA 1XXMA 1PWDA 4QFKA 2V2FF 4LZ5A 3G3FA 3MZEA 4UA8A 3PPNA 2RCBA 3B6WA 4XKRA 3Q07A 3OEKA 3MXSA 4YB5A 1K54C 3IORA 1N84A 1LL9A 2NVUB 2ZLYA 5E2HA 4HEFA 3K0VA 3CZDA 4L0LA 5HAIA 3G31A 1DJAA 3E9XA 3V83A 4XIGQ 2WADA 1OLAA 4R3BA 3BRMA 4DE1A 2O7UA 4QFPA 4OLGA 2O1MA 1UTBB 2FNCA 3IF5A 4I1DA 5FAQA 1FQBA 3V3RA 3IJOB 1RGZA 2ZC6B 3FZVA 1SI1A 2H25A 1RCJA 4ZBEA 1IIWA 1DOTA 2WKHA 3OCNA 3AGEA 3WS4A 4IO3A 3ZVWA 1K25A 1MDQA 2I4BA 5FQIA 3EF7A 3TTNA 4ZE9A 3LY3A 3PAGA 4BDNA 2XD2A 4C1UA 1Y3NA 4E3OA 1Y4TA 3VOZA 5H8FA 5CBRA 2Y2GA 3EPEA 3UPNA 2Y91A 3ZNTA 3UORA 1DJCA 2QPQA 5I2KB 1WYCA 2QS3A 2I6EA 2JE5A 3O86A 4FIMA 3MZ1A 2DRWA 2EFUA 1FSWA 3RTWB 2OWSA 1ALQA 3G3JA 1UIUA 1UTHB 3H6TA 3IX1A 4Z9QA 4F1VA 3MVXA 4BLMA 1CI9A 3AGDA 4DE3A 1EZ9A 4UA7A 4EQ7A 2NWJA 1MXXA 4FEDA 1EZOA 4C6YA 4NWCA 4ZJ1A 4NK3A 1FQEA 5EVIC 4EBPA 1YT4A 4P0MA 3GTCA 2Y2MA 1B46A 1Q2PA 2P74A 4KZBA 1MWRA 5A93A 3N6UA 2Z23A 3KN3A 1CB6A 3G35A 1VR5A 4XKQA 3PUWE 3ZG7B 3RN8A 1MY1A 1MWSA 5I56A 1G6AA 4NE4A 4QSDA 4C1TA 3TMGA 1S7YA 4HESA 3VVFA 3OCLA 1SCWA 1I69A 3VLVA 2Y2PA 1SKFA 2WZXA 4NF5B 2J7VA 1FTMA 1IUDA 3ISGA 1YM1A 2A49A 4S2LA 2BLSA 4RK9A 5F1GA 3QNCA 2WGVA 3VE1B 3PUXE 1L2SA 2XD1A 4E0WA 3E3KA 2ZJ9A 3IHBA 3ZG5A 2PU4A 3WS0A 4KYDA 3HLWA 5U47A 1QUJA 3Q1FA 3ZG8B 4LV3A 3BLSA 4AQ4A 4XXUA 1ZLQA 1LLSA 3UGWA 3HLBA 3O6IA 1GHIA 3KBRA 3QHYA 3IL1B 2UVGA 5L9OA 5EOOA 1AMFA 3M3LA 5F83A 3VP0A 1N0TA 3U92A 3DP8A 1B32A 1FQAA 2QS1A 5A90A 3LR1A 1GA0A 5TFQA 4IO4A 3OZHA 4U1ZA 4IGTA 4Y7PA 3BFCA 3C7UA 3PBQA 3TSGA 1B3FA 4BQMA 3HREA 3WS2A 2GRVA 3IXDA 1VSOA 1NYMA 4OYVA 3TUSA 3KFMA 2DNSA 4FSFA 1FQCA 2XH9A 4FJPA 5DVIA 2HDQA 4KQQA 5L9MA 3TCFA 4S2NA 4KCDA 4PM7A 3H6UA 1ZU0A 4GXAA 3I7JA 3PBTA 2H4IA 3O66A 1UTBA 5HL1A 4HW8A 2XX7A 1USYH 4X56A 3VOYA 1MS7A 1EROA 1IXIA 1SYHA 2E1SA 3N6TA 1A55A 3CFLA 3T96B 2ZQAA 3TTLA 3FVKA 1SW4A 2O6AA 3A3CA 3MQ9A 3PD8A 4OOLA 2ZYKA 4FECA 5EE8A 5E2FA 1PC3A 3S9LC 4H8IA 3C5AA 3W4PA 3EHTA 3V5AA 3FJMA 1CEFA 1HSLA 1FR1A 3O6GA 5CMMA 4XUZA 1II5A 2B5RA 4RPNA 2Z8DA 4Q30B 3GQZA 5HM4B 2R9WA 4GFRA 1JVJA 2VOZA 4MBKA 4GLIA 1UTHA 3MKFA 3QSLA 1K56D 4OEUA 4OPQA 5CI5A 1XA1A 4F3SA 4DXBA 3TFLA 1R9QA 1NNPA 1B05A 2ZYMA 2XFSA 4BLAA 1EWZA 4Z7EA 1HVBA 5CXWA 2NOOA 3IJXB 4UA9A 4MLVA 4C75A 1LI0A 1TT1A 1SW1A 2H5YA 3D4FA 3K1NA 5F82A 3CI8A 4GRKA 4ZJ2A 4U4SA 1YLJA 4QFNA 1ES4A 1XT8A 1IKGA 3HO7A 1B3HA 3V39A 4WELA 5GLDA 2HFBA 5DVAA 1FOFA 1YLPA 4R4RA 5I94A 4LENA 5FHOA 4H67A 3VMAA 1GV8A 2P9VB 1P1WA 3IHAA 5DTKA 3BLMA 3JYRA 2RC9A 1RKMA 4KZAA 5CMKA 3V89B 3QIMA 1Z6FA 2UYEA 2PU2A 4LQ2A 4F3PA 4NMYA 3HUNA 3BFUA 2O7IA 3IB2A 4E3MA 4IO2A 1YTVA 3ZDJA 2F6GA 3BKIB 5CC2A 3IR1A 2WYXA 4N9KA 5DF8A 1VFDA 4WEKA 5JYPA 2V3QA 4RX3A 1O63A 4S2NC 3RT8A 1EU8A 3G7WA 2XFTA 1L0EA 1IXGA 5I2NB 2I58A 3SH7A 1LL5A 2IWCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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