4DXCA

Crystal structure of the engineered mbp tem-1 fusion protein rg13, c2 space group
Total Genus 202
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
202
sequence length
637
structure length
624
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
molecule tags Sugar binding protein, hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 202
structure length 624
sequence length 637
ec nomenclature ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF13354 Beta-lactamase2 Beta-lactamase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA01
3.40.710.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Beta-lactamase DD-peptidase/beta-lactamase superfamily 4dxcA03
2A5TA 3MZ9A 1A7LA 3S4XA 2C5WB 4QY5A 3KSXA 4Z0IA 5DTBA 4LCMA 4IY6A 5KSHA 4B88A 1K57A 2WYXA 3PUWE 2JBFA 5CRFA 4JWXA 4H1XA 4PETA 2BLSA 4S2JA 3N8LA 1U60A 4D2OA 1US4A 2OWTA 1I6QA 1WODA 2F6PA 2R6GE 3FATA 4FECA 2F7AA 4ZBEA 4ONYA 5CEDA 3JYRA 3Q7ZA 4N6PA 4H5FA 3CSBA 1WVJA 4PFUA 4OYVA 5FQQA 2I3WA 1B7UA 1N76A 3M8UA 1A40A 3HCQA 2OLUA 3BFFA 2WGIA 2XD5A 4ZJ2A 5JYPA 1YAEA 5FQIA 4BENA 2Y2QA 4WKMA 4C1TA 4HBUA 3PUXE 3S2VA 4EWFA 4NF6B 3ONMA 4S2NC 1YLYA 3PAEA 1BZAA 5H8HA 4IO2A 2XXUA 4DIGA 3E2KA 3O6GA 4YB7A 1QUIA 4QSDA 4GD5A 3C33A 3VP1A 1EH3A 1NZOA 4QHQA 1FQDA 4JB7A 2I4CA 1FTKA 3LO7A 2G2UA 4O3CA 1Z7NE 3RTFB 5FDHA 1R1NA 2UYFA 4TQUQ 3UP9A 2F34A 1FR6A 3ZFZA 3PV0E 1SHVA 1ES2A 3MP8A 1MWRA 3VMAA 1XXMA 1MXXA 1GA0A 2Y2HA 4PM6A 5CC2A 1XGIA 4K91A 2G93A 3V3SA 4U2RA 3ZDJA 4RK9A 1M5FA 1IIWA 3S9MC 5EVIA 4GOTA 3DM0A 3KN3A 1USYE 4HW8A 4QSEA 4RXLA 2XXTA 2UVJA 4G77A 5FAQA 3HL9A 1ERMA 1B58A 1XS5A 4KZAA 4DXUA 4X69A 1NMUA 4HCYA 4OQOA 1BLFA 3UA8A 4OQHA 1LFGA 1OVTA 4OFOA 1DPEA 4N1HA 4MH5A 4UA9A 4ZEKA 1B3GA 3NDEA 4EUOA 3C31A 4KHZE 1ANFA 4QFLA 4FEBA 4AQ4A 1OLAA 2GFEA 3N6TA 1LCTA 2CC1A 4S2PA 3H06B 4WMCD 1H43A 3MZDA 4OETA 4X48A 5FAOA 3TPAA 3FVKA 4E0XA 3VFFA 4IO4A 4JDFA 3SOIA 1IUDA 5EOOA 1BSGA 2Q2AA 2IWBA 1IQ7A 1I2WA 3LY3A 1G68A 3A3DA 3NI9A 3UE3A 1PB8A 2HDRA 1SI1A 2XF3A 1K4EA 3EQUA 5GHYA 2ZXTA 4OWDA 5EECA 3CG3A 3H4ZA 4OP5A 1QUJA 1EZPA 1SW2A 3DLNA 4GVOA 2F78A 1AOVA 4XUXA 4X55A 3VOYA 4F3PA 4R1GA 4RNSA 3IHAA 4F1UA 4OHNA 3UY6A 4JF6A 5I56A 3U94A 3G7WA 2HCAA 4DKIA 5AA2B 2ZC4B 3WRTA 4KZ4A 5CXWA 2XXYA 3TCFA 4JLFA 5F83A 5DVAA 4RX2A 3QXMA 1Z6FA 4JF5A 3N6IA 3SEYA 3PD8A 2NOOA 4OPZA 3RT8A 5I2NB 2V3TA 2NWJA 1MXVA 3IF6C 4A5RA 3C34A 3A3JA 1POY1 1B3EA 5CMBA 3QAXA 5I59A 3VLWA 2HFBA 2O7UA 2HXWA 4X9TA 1XX2A 4ZTKA 3MVXA 4R9GA 2QJEA 3BFTA 1NZUA 1UQWA 2ZMBA 4IY5A 3VXBA 3TUSA 1OVBA 1DTGA 1QW0A 3R26A 3I3VA 1PWGA 4S2NA 2R71A 4RYAA 4U0XA 2NUVA 1DOTA 2JCHA 1JQFA 4YU0A 1Y20A 3QNBA 2WADA 3QUFA 1H44A 1NYYA 4PFYA 3T96B 3M6HA 3V5AA 1GV8A 2Z2LB 2V2FF 1A54A 1J1NA 5E2GA 1ERQA 5A90A 2OK2A 3D4FA 1MG1A 5EHMA 3DTMA 3Q7VB 5HAPA 4GDNA 1ATGA 2ZYOA 2ONRA 3MVZA 1LBBA 1GA9A 3C4OA 3IXGA 1URSA 4E3MA 1FQFA 4M4GA 4NK3A 3TTLA 3L6GA 3MZBA 5DTSA 2ZD8A 2O84X 4QFOA 5I58B 3NDGA 3G3HA 3OO6A 2ZM0A 3WS5A 1ONGA 5DEXA 1SKFA 4GDBA 2DQVA 1K54C 3SH8A 1TDLA 1M5EA 3HLFA 4ISUA 2Y2MA 3A3UA 3BLSA 3UORA 4ZEDA 2Z8FA 2HPBA 2WKHA 4U21A 3UDIA 5L8DA 5CBRA 4LVQA 4LATA 3VSKA 2ZQAA 2VHAA 5E2EA 2OSUA 1P1NA 5F1QA 4Z7EA 4N92A 3O6IA 2DP8A 4UACA 3LSLA 1USYH 1PWDA 2RCAA 2OLBA 1SVXB 2O6AA 4S2MA 3W4OA 2PVUA 1JWVA 1NYMA 4XIGQ 5FI6A 1ESIA 1L0GA 4Q5TA 1FTJA 4E6WA 3UPNA 1LCFA 5CMMA 4XKNA 1ZKJA 1BP5A 1JW5A 1VSOA 4MBHA 3K6WA 3B6QA 3Q29A 1H8ZA 3GLBA 3V5MA 5FHOA 5HL1A 1LB9A 5FA7A 2Y91A 4ZS9A 2X7QA 2B65A 1YLWA 3FASA 3UN7A 1KDSA 3A09A 4ZECA 3O2AA 4M1VA 2WK0A 5A5XA 1SBPA 5F1FA 2Y2JA 4OVDA 4Y0OA 1ZU0A 2WKYA 4NF4B 3T9XB 2I49A 2NXOA 1MM7A 5K2YA 4FH4A 4PPRA 1N7XA 2HEUA 2ZM8A 4WEPA 4ZEIA 3R6UA 5FI7A 1YPNA 1B5JA 2BG1A 1CI8A 4POXA 1CK3A 5CERA 1H5XA 4KENB 2XDMA 5I2KA 4QY6A 1MWUA 1RYXA 1K57C 2I0BA 3W15C 2Q88A 5FSRA 2XXXA 3FVOA 1ZIUA 1H8YA 3I7JA 4U0TA 3IJOB 5ICTA 1JVJA 3CIJA 1TEMA 4G8NA 2Q9MA 3QNCA 1NL5A 3GVBA 1E3UD 5FI2A 4WEJA 3FZVA 3GXAA 4B4ZA 3I6VA 3G34A 4OKPA 4NF8B 2DVCA 3V89B 1LB8A 2F36A 1K55C 1N84A 3FXRA 3HVFA 1F9BA 3Q25A 3RTWB 3KZGA 2ZYMA 2P1SA 2DXYA 4N9LA 5TP9A 5EVLA 2X26A 3O28A 2Y7KA 4G4PA 2ABHA 2RINA 1BULA 4TOZA 3DELB 5LOMA 1LL5A 1IITA 3FKVA 3SEUA 1US5A 5ISUA 3K00A 4I1DA 2HQ0A 2GHBA 3K0VA 4Z9QA 3QUJA 5HARA 3EHTA 1IXGA 1M6KA 1MRPA 4QSCA 2XLNA 1LLSA 1BUEA 1NNFA 1B05A 3M6BA 1IXCA 3OSRA 3VP0A 4DDYA 4YMBA 3B6TA 4C0RA 3N8SA 1E4DA 4E3NA 3LEZA 4PM9A 1MY2A 5JTYA 5U47A 3M2KA 4IVKA 5CHMA 2ZNSA 5HM4B 2DNSA 2Q9TA 3IWOA 5GHXA 5D3OA 4BDNA 4JBZA 2ZC5B 4YKPA 4HBTA 4ZDXA 2DWIA 1FCOA 3RXXA 4R4SA 3LUYA 4OLDA 4QB8A 4NF5A 4KQPA 1MY3A 3HHFA 4KZ8A 4RA7A 3SKPA 1OMPA 1XVXA 5H8FA 3E4RA 3AGEA 1NH8A 3UDFA 3RT6B 2EFUA 3V39A 3OPPA 2Z8DA 5AQBA 3BKIB 4EBNA 3U1OA 4CPKA 4GLIA 5FATA 2ZM2A 1GVCA 4YKIA 4WYYA 1D4NA 3VE1B 5F1GA 4OH0A 1XVYA 3RGYA 4KG6A 4OOLA 3TTMA 5E2HA 3FV2A 1BT5A 3OEMA 3MZFA 1FQCA 1PW1A 3FWLA 2REGA 4O3BA 1JEVA 4X56A 3W4PA 1AXBA 1LAXA 2HZLA 5CBSA 2YLNA 3S9LC 2OZZA 3AGFA 4N1XA 2YJPA 1AIVA 5I57A 1VE4A 2QL3A 5FHNA 1QKAA 4G8MA 2HZKA 1ZKBA 3P7IA 4EF2A 2H5YA 5FQMA 1B32A 4H5GA 3HLBA 2ZYNA 3KFMA 3H03A 5L9SA 2F7CA 5CEBA 4YAHX 1FQGA 1FOFA 5EVIB 2F5XA 4H67A 4ZE9A 2DE4A 1XP4A 4C6YA 4JXGA 1B52A 4ZE8A 2DE2A 3O29A 4DZ1A 3IX1A 2UYEA 3ZVTA 3EHUA 1S50A 3DP6A 5AQAA 3CFXA 3OELA 1IYQA 1BLPA 2ZQ8A 5FQJA 2P0SA 1WYCA 2AYSA 4F22A 3G31A 4IO7A 3KBRA 1C3BA 3TCHA 3B6WA 4R0QA 1BIYA 4LZ7A 2Y59A 3O88A 4K0XA 1MDQA 1N9BA 1PW8A 5CHUA 3RNNA 3IJXB 1N4OA 4HESA 3ZHHA 1QULA 2P9VA 1S9TA 5TGFA 3TTRA 5A91A 4OEUA 2O69A 5B7DA 2I72A 3HHGA 1MXYA 4JSOA 3G3JA 1K56D 1YLTA 1PEBA 2WGVA 4KQQA 1LFIA 4F19A 1JTDA 3MVWA 3HUMA 3OPLA 3BLMA 3V83A 3VV5A 3FXUA 3BBRA 1FSWA 3N26A 4KYDA 3IH9A 1K55A 4KQRA 3M3KA 3IR1A 2ZQ7A 1Y3NA 5H8NA 4CJNA 3CJMA 4G68A 1URDA 1IZ1A 3MWBA 5CGSA 1TFDA 2E0SA 3PPRA 1MY1A 4YKKA 4C1UA 2ZYKA 2GHAA 2OCUA 2V3UA 5EHSA 4LUBA 3RJUA 3ZS6A 1A8FA 1M40A 5KCJB 1FTMA 3P09A 4OP8A 2RC7A 3CFZA 3SEXA 1DTZA 4GQOA 1HZOA 2I0CA 3TMGA 3SDFA 4R4RA 1L2SA 1NNPA 3Q81A 1EZ9A 2EX9A 4KG5A 4MLVA 2H10A 4JKTA 3VLUA 3DWKA 5E43A 1VFDA 5DYHA 1I6BA 3OC2A 1OMEA 3IWQA 2HDSA 2IEEA 1B51A 1B3LA 4QRZA 3MKFA 4BD1A 4RPNA 4MLLA 1Y3PA 2XK1A 1B7HA 1Y4CA 1YLJA 3UK4A 3CR9A 4LENA 4BDOA 4EQ9A 1ZJLA 3HLGA 4ELPA 3FUZA 1KGEA 1WE4A 4WXJA 1N3WA 2VD2A 3G3GA 1QMEA 5TPAB 3UDXA 3C9HA 2ONSA 2DE3A 3VOZA 3TAJA 3GBAA 3HPIA 4RPOA 4KZ9A 1MXWA 4R6HA 4UA8A 1R6ZA 3L6HA 3PBQA 1LL9A 4DE2A 4DDSA 3FJMA 1TWYA 3G4PA 4RYEA 1FW0A 1YMXA 1B9JA 1P1QA 3V8XB 2NVUB 5CMCA 2X7PA 1B7ZA 3K4UA 4Y0TA 2WZXA 3UIFA 4Q0CA 1G6AA 1PYYA 4I8CA 2VGQA 4P11A 4E3JA 1TFAA 3RQTA 4ELRA 1UTHB 4GWOA 3OPRA 3IO4A 2M8CA 2G29A 1BTJA 1FTLA 1E25A 2H98A 3B7DA 1MY4A 5DEXB 3LR1A 3SESA 1M5CA 2VGKA 5HAIA 3QYTA 5H8QB 4JXVA 3LSFB 3Q26A 5AQ7A 1PBQA 3IOTA 4IVIA 3TODA 3OO7A 1PI4A 3KEIA 5AA4A 1D3KA 3FZCA 4NF6A 3VLVA 3C32A 3G3FA 3PUZE 5JK4A 3CG1A 5HPQA 1FTOA 1Q35A 4RK2A 4L17A 3BM6A 2RKMA 2QRYA 4JWYA 1W79A 2QMIA 3LBSA 3FD3A 3HLCA 2XXWA 2Q8JA 3LCEA 1LAFE 5CHJA 4R74A 4IBXA 1II5A 2FYIA 4GD8A 3IO6A 1YLPA 4IBRA 3K1MA 5BWJA 2WZZA 5HW3A 2HDQA 2ZMAA 2XD1A 4QFNA 2ZLYA 3ZKKA 1O63A 5AA2D 3VVEA 1YMSA 2XX7A 3FJ7A 1SYIA 3ZGAB 4ESWA 4Q30B 1NRFA 2XR0A 3Q1FA 4MBKA 5TR7A 5GLAA 1S6RA 4P0MA 3SS5A 3HO7A 3IQAA 4G8HA 1AMFA 3CZDA 4WMCA 3VP2A 4I9DA 4LV1A 1D9VA 3F11A 1HSLA 3D4GA 2PU2A 4U22A 4ELQA 2HP6A 2RCXA 4PP0A 2I3VA 1PB9A 2B5RA 2O7IA 1MKIA 5EPHA 3ISGA 2EXBA 1HTZA 3BFDA 2Z22A 1LAHE 3N94A 3CMZA 1D9YA 1IEMA 3CRBA 1JEUA 2Z8EA 1B2HA 1XPBA 5CI5A 1KWHA 3IB1A 3CI8A 3C5AA 1MPDA 3Q82A 2H0TA 3T22A 1LI0A 1KGGA 3IF6B 4N07A 4I62A 1SW5A 4OXVA 4U1ZA 3CFLA 4KZ7A 4X6TA 2ZC6B 3IB0A 2XXQA 3OD7A 5A92A 1MPCA 4JXWA 1L0FA 1L0DA 1UTBA 4HCWA 3G2ZA 4L0LA 5J8XA 3OMBA 1YLZA 2A49A 1K38A 4K3FA 3O86A 4LV0A 1CE2A 5KZHA 4KPTA 2Y55A 3GTCA 3IWIA 3UGWA 3K02A 1Q2QA 4OLGA 3EQVA 3IXBA 1RCJA 1B6HA 1AH5A 5CMKA 3A3FA 1SW4A 1YT4A 4F39A 4OQ0A 2XHDA 3IHBA 5AQ9A 3K01A 5KDTB 4IEDA 3E13X 4OTEA 1B0LA 3LC8A 4C75A 4OOMA 3SEWA 1O7TA 5I2NA 3FIRA 3VFHA 1QUKA 4KI0E 4HS7A 2PBWA 4OMBA 3IL1B 3O97A 3S9EA 4H8JA 1MQHA 1IELA 1W5DA 4MEZA 3PUYE 4LZ5A 4NF5B 3O87A 4FH2A 3NBLA 4WZ5C 3H6TA 2AL4A 1Q2PA 3JYIA 1A8EA 3IOVA 3V3RA 2XD2A 4IGRA 1JVXA 3DWZA 3HLDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ZNY A;  2P74 A;  2RC8 A;  5KZT A;  4Y7P A;  3MC2 A;  4OEV A;  4R2B A;  4HTG A;  4X1D A;  4DXB A;  3EQ1 A;  4LA9 A;  3KJT A;  1NJ4 A;  4KYE A;  1MQJ A;  3TQW A;  4EV4 A;  3G3K A;  3BFE A;  3THI A;  4FIM A;  4GF8 A;  4DE0 A;  1FR1 A;  1DJC A;  5BUU A;  3T93 B;  4E3L A;  4TLL B;  4XXU A;  4H8I A;  3PAG A;  4C3Q A;  4GIZ A;  2CMO A;  1PIO A;  2OLV A;  2ZNT A;  1FCN A;  3PMX A;  1HVB A;  4R2F A;  1Y1Z A;  4RJZ A;  4PM8 A;  1ESU A;  1H76 A;  1KVL A;  5FQ9 A;  3W9W A;  1QKB A;  3T9V A;  3M3L A;  3GQZ A;  2Y7I A;  4ZEB A;  2Y7W A;  3N7W A;  1SDX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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