4DXCA

Crystal structure of the engineered mbp tem-1 fusion protein rg13, c2 space group
Total Genus 202
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
202
sequence length
637
structure length
624
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
molecule tags Sugar binding protein, hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 202
structure length 624
sequence length 637
ec nomenclature ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF13354 Beta-lactamase2 Beta-lactamase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA01
3.40.710.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Beta-lactamase DD-peptidase/beta-lactamase superfamily 4dxcA03
1TVFA 4ZEFA 2ZM8A 5EVIC 3VP0A 4WXJA 4KG6A 1GGGA 5CM6A 5I58B 3LEZA 3NI9A 3HLFA 3IOTA 1TEMA 1OVTA 1BP5A 1NZUA 2E1SA 3P09A 1SKFA 4FD8A 2BG1A 3O29A 4F3BA 1ES2A 2V1ZA 3UIFA 3IJOB 4XUZA 1BTLA 4NTLA 4R0QA 4WMCA 2WKEA 4OQHA 5DT6A 1MRPA 2DSFA 1R1NA 2RINA 3S22A 3V5MA 5DYHA 4HBTA 4AQ4A 3IR1A 4OEUA 1N9BA 1QULA 4N1XA 3RUMA 2PT2A 5EOOA 2UVGA 1Y3QA 5EUAA 1ZMGA 5H8NA 1MKIA 2ZC6B 1SBPA 4ZJ2A 5J8XA 4RY1A 3EN3A 2VD2A 2WGWB 3SEXA 1LI9A 4QFOA 3PUVE 1TFAA 4E6XA 3A3IA 2OWTA 2Y2QA 4WELA 4Y7PA 5A5XB 1DTGA 4QB8A 4R9FA 5TFQA 4ECFA 4Z0IA 4PFTA 2V93A 5F82A 3GBAA 4BLAA 1FQFA 2HZKA 4LZ8A 4WZ5A 2H9BA 1MG1A 4PM8A 5I57B 1B9JA 2DOJA 3T96B 1XP4A 1KE3A 3AGEA 3C7VA 2Y7PA 4PFUA 3DWZA 1NNTA 4DE2A 1NFTA 4BJPA 3ITBA 3JV9A 2RC8A 3RY3A 2PU4A 4OOMA 5A91A 3GR2A 2O69A 3MC2A 1IKGA 3IAZA 3KN7A 1NY0A 2QMWA 4HS7A 4YB7A 3T9XB 3BFFA 3N8LA 4RYAA 2JC7A 2A3UA 4NF6A 1L0EA 4H0WA 3CMZA 1Z6FA 1EWZA 3CVGA 3KEIA 1Z7NE 1SW1A 4Y0UA 3ZG9B 3KG2A 2R9JA 2UVJA 2OLUA 3Q26A 3RTFB 2Z2MB 4OETA 2RKMA 1AMFA 1QUJA 2ALUA 3ILUB 1S9TA 3C5AA 2WKHA 3HO7A 3UE3A 5BOHA 1FQGA 2HCAA 4OMBA 4G68C 3G3GA 3B6QA 4HTGA 3PPQA 1NH8A 3K2DA 3VVDA 3I5OA 2V20A 4FEDA 1NNFA 4QFKA 5KZHA 1IELA 4DDSA 4S2NC 2H0TA 3G3KA 3ZSFA 3C35A 2Y2HA 3H6VA 4ELPA 3LSLA 4R72A 1PIOA 1ANFA 1YT4A 3IWQA 5CGSA 1RCJA 4DE0A 2A5SA 2ZD8A 1TDLA 5E2GA 4S2OA 4O3AA 2Y2GA 4FH4A 3G2ZA 4E0WA 3MFDA 1QUIA 3IOWA 4BQMA 2ONKE 3ILTB 3PD8A 4GNUA 2O1LA 3HUMA 1DPEA 3IL1B 4NF5A 3UK4A 3NIAA 2ZQDA 4X68A 4Z7EA 5JEIA 3UN7A 4JDFA 1PEBA 4EXLA 1SD3A 1W79A 1N76A 4U22A 1GV8A 1NZOA 4DF6A 1AXBA 3BLMA 4U23A 3FWLA 4LVQA 5KCJA 3ZKKA 4F94A 3IB2A 1Z7ME 1L0FA 3O66A 5AQ9A 5EVIA 3FZVA 4OFJA 3VE1B 3OOAA 4O3CA 4PM7A 1JEVA 2XF3A 3VLWA 4QD4A 4QHCA 3D4FA 4H5GA 5ELVA 3Q1FA 1I5QA 3MVWA 1UTHA 4NETA 4P6BA 4EUZA 3U1OA 1M5BA 4YB5A 4BLMA 1PBPA 3C36A 4HW8A 3SKPA 3IORA 4IO4A 1K4EA 1POTA 2GFEA 4WYYA 4K0XA 3DM0A 2EX8A 1ZLQA 2RCBA 3N7WA 5HBCA 1YLTA 1Y54A 5DF7A 5FA7A 2FFFB 2DE2A 3MAMA 1FTOA 5AA2B 2GHAA 2UXAA 1US5A 5A93A 5TP9B 3O6HA 5I2NA 1PZOA 1NYMA 4U1ZA 3T9UA 5H8SA 4F39A 2W7YA 1B7UA 1BULA 3T9HB 5CHUA 1LL9A 2I6EA 4OTEA 1N4OA 4YICA 4H1XA 3N6TA 1JWPA 3CRBA 4GB7A 1ZIUA 4WEKA 5HPQA 3RGYA 1MWUA 4R3JA 3NDEA 2IA4A 1FQCA 3CG1A 2F7BA 1EI5A 1MQIA 1NNKA 3U72A 1HSEA 2Y2NA 4KG5A 4GVOA 4KZAA 1B3LA 1MY2A 3QXMA 3S9EA 4IGRA 1OQGA 2Y7KA 1OMPA 3PTEA 4PETA 3O86A 4Q8IA 3SDFA 3AGDA 1MDQA 1SDXA 3LCEA 3PGFA 3FV7A 1J1NA 3ZKLA 2PX1A 1P1QA 3O97A 3N94A 5CI5A 2HZLA 3PBTA 2F36A 4YFMA 3C7UA 1N3XA 3G7WA 1ZG6A 1D9YA 2KLFA 5CEBA 3IWOA 4KD5A 1I6AA 2QL3A 2Z8EA 5FDHA 3E2KA 1LI0A 3C31A 3FJMA 5KMWA 4NF8A 2D21A 2R9XA 1H44A 4LV0A 1MH4A 3V8XB 4H8IA 1LB9A 4C6YA 2AL4A 4N13A 2AYSA 3UN6A 3OENA 3SEVA 1FTKA 2ZYKA 3TTLA 4G68A 4X1DA 3TKDA 1R6ZA 3CSGA 2E0SA 3ZVTA 2OCUA 3MXSA 4S2NA 2F8DA 2ZQ9A 3IXHA 2XXVA 4WKMA 1SVXB 2I3VA 4RK2A 3ZGAB 4E6WA 2I4CA 5GHYA 3M2KA 1H45A 2DQVA 4JBZA 1OLCA 4NWCA 3D4CA 2Y2LA 3AGFA 3HV1A 4JLFA 1M40A 3VXCA 4MF3A 1ESUA 3W4OA 2G2WA 5JYOA 4P87A 4QU3A 3BFGA 1MXWA 4HESA 1N0TA 4KQQA 2DCFA 1SI1A 4JPMA 3S4XA 2ESNA 3HHGA 1JW4A 1GHIA 1MPBA 1H8ZA 4R6HA 4GOGA 3T93B 2F7AA 2XXQA 4F31B 3GZGA 5FHMA 1EZ9A 4GFRA 3NC8A 1XC1A 4IBXA 5FI6A 5GHXA 3TG9A 1BLSA 5G18A 3A3UA 2R6GE 4ZEDA 2ZJ9A 1L0DA 4YKIA 3M6HA 3FIRA 3N4IA 1Y9UA 1UIVA 4QSDA 4LENA 1MXYA 3GV9A 5I56B 4ID4A 3Q7VA 1NKXA 4OWDA 3OPLA 1H76A 3W9VA 4U1OA 3USDA 2F5XA 1MH3A 3PV0E 5F7VA 3U93A 4F18A 1FQEA 2ZM0A 2EX9A 3A09A 1QKAA 4YMBA 2V84A 1FCKA 1IEJA 2ONRA 3TTNA 1D3KA 3HVFA 5TPAA 3UE0A 1BZAA 2P9VB 3HLEA 5DTTA 3T9VA 3OZHA 1ZJLA 2X26A 1XS5A 4OFLA 2XXTA 1AIVA 4BL2A 4C1TA 1K57C 3I3VA 1A54A 1MQJA 4G8HA 1QW0A 2OSUA 5HARA 3Q28A 4BDNA 5JK4A 3WAEA 1IXCA 1L0GA 4KZ6A 3T22A 3ZG5A 3NDGA 2HP9A 2JCHA 4ELQA 3M2JA 1B32A 3UO9A 2F34A 5A90A 4PFYA 2DWJA 2ZYMA 4M4GA 3IT9A 3W15C 3IOVA 2XHDA 4PP0A 1H5XA 1MPCA 3SOIA 3G4PA 1PBQA 2QSXA 2XXYA 2ANJA 3E13X 5CXWA 3G32A 1Y4CA 1EZOA 1LLSA 2REGA 3MVXA 4OPQA 4XKQA 1FCMA 3HLDA 4KZ7A 2OWSA 1GVCA 3MUQA 4RPNA 4JKTA 4RXLA 3BEBA 2Y7IA 1DMBA 3QUJA 3FVNA 1FTLA 3OPRA 1WVJA 1MPDA 1SYIA 3I7JA 1IIWA 1JWZA 1Y1ZA 3C4PA 3ITAA 5E2EA 3OEKA 5A92A 3DELB 4YB6A 4OESA 2HDRA 1IXHA 4JB7A 4F3PA 1CI9A 1OLAA 3IB0A 4JWXA 1XGJA 2H5YA 2X02A 5CGWA 1BLCA 4KZBA 1MPLA 2J8YA 1PI5A 2WGVA 3MZBA 1B51A 1E3UD 2XLNA 4G4PA 2XX8A 3TSGA 1A8FA 2I0CA 2H25A 4I1DA 4P0IA 2H5SA 3Q07A 1RGZA 3KN8A 1A99A 4LA9A 1KE4A 1Q2QA 1JWVA 3FASA 2Q9MA 1MXXA 3MZ1A 4X1BA 1BLPA 5DTBA 4QRZA 1UTBA 2G93A 4P11A 4EBNA 3IH8A 3WS0A 3KSJA 1NH7A 3MWBA 2BJJX 4R2FA 1P1NA 4NF6B 3QYTA 4ZBEA 1WDNA 2FYIA 1EROA 5I59B 4OOYA 5HX9A 2ZC3B 2EX2A 3H06B 4P85A 1YLPA 4OONA 3ZG0A 4B88A 4YKPA 3LO7A 1XA7A 4MBHA 1Y1MA 4NF4A 2ZC4B 1HSJA 1MWTA 5B70A 4O7DA 1XXMA 1CE2A 4K91A 2VHAA 1BSGA 1ERMA 3BECA 2PVUA 1M5DA 3CZDA 1MQHA 3C4MA 3HLWA 4ZAMA 4ZS9A 3N6IA 4IBRA 1IKIA 5KSHA 4GL8A 4ESXA 4XKPA 1SCWA 4LUBA 4PE5B 2THIA 4GXSB 1G6AA 4L0LA 2J9PA 3H7MA 3D4GA 3FJ7A 1L5TA 1S6RA 3FXUA 1LLBA 5EOEA 4IO5A 4UA9A 2REJA 3IF6A 1K25A 4C1UA 3T66A 1FTMA 2Y7RA 4ZDMA 2GH9A 4HCWA 1MY1A 3ONMA 3LSXA 5H8QA 3OPPA 4X55A 4NF5B 2ZYNA 3MPKA 1KGFA 3RPWA 1B1HA 3FKWA 2RL3A 3BFUA 4H8RA 3O6IA 3QUFA 4X9TA 2P2AA 4QJGA 4XTCQ 5I2KA 4GLIA 3VMAA 1PWDA 1K57A 5EVIB 3GRJA 5HAPA 4LP2B 4KYDA 4RVAA 4DRTA 1C3BA 3TMGA 2LAOA 5EYFA 1D9VA 4HCYA 4ISUA 4JXWA 3MVZA 2VGQA 1ES4A 4EF1A 3Q82A 1B0HA 5DVJA 3SS3A 4IY5A 4ND9A 1ELJA 2HP6A 4QFLA 1UTHB 2RCAA 2FFYA 2WGIA 2M8CA 2ZQ7A 4N9LA 1GCEA 1LAXA 4HEFA 3SERA 1GR2A 2IEEA 1KVLA 2EX6A 3N26A 3MZDA 4B4XA 3RT8A 1B4ZA 5LOMA 4GDNA 1LFGA 3MP8A 4X56A 3UDIA 2IWBA 1BKAA 4WEPA 3K02A 4H6DA 1SW5A 4EQIA 2ZXTA 4H5FA 2DXYA 1DTZA 3PBNA 1O63A 2V3UA 2DWIA 4POXA 2O7IA 1SDEA 1JQFA 4S2JA 4X6TA 3R6UA 4N6PA 4EUOA 3RQTA 3G30A 1ZG4A 2VOZA 4Q8RA 2ZM2A 5AQAA 2JBFA 3G31A 3NBLA 4EDPA 5ICQA 1RP5A 1NRFA 3G3JA 4DXCA 4KYEA 5I58A 3K1NA 1YTVA 4G2ZA 5AA2D 1B7ZA 1QVSA 3Q27A 4GXAA 3UY6A 3PMXA 3G3FA 3BRMA 5CMMA 2XXXA 4H67A 4FCFA 3ZNYA 3WS2A 2Q9NA 1CEGA 3BFCA 5AQBA 4LV1A 3VP2A 4KG2A 2R71A 2ZMBA 5FSRA 1QJMA 1ZKJA 2Z8FA 4EQBA 5DVIA 3V39A 3SH8A 4FSFA 3QNBA 1PB7A 3FGSA 2XFTA 3IB1A 4MNRA 3BBRA 2Q2AA 3PMWA 1MY4A 3UA8A 1M5FA 3DP4A 1PB8A 5L9SA 3BFEA 1QMFA 3GQZA 4EXKA 1BTJA 2WGWA 1SW2A 2O84X 1XHYA 3OELA 4WEDA 1PWGA 1LGBC 1E3UA 4WEJA 4UACA 3AXFA 3UE1A 3VFFA 3SETA 1Y4TA 3K6VA 4MBPA 3ZFZA 5FHOA 4GDBA 4LCMA 1NMUA 4F1UA 3QAXA 2EFXA 4X53A 2QPQA 3SEUA 2HAVA 3TEPA 3ECRA 3TQLA 2WADA 5FATA 1B6HA 1M5EA 3QK6A 3V83A 3VFJA 3NCKA 5FTIA 3O87A 2X7QA 5I57A 4DE1A 2PYYA 3SS4A 1JVXA 3IO4A 4PPRA 4Q5TA 2XD1A 1HZOA 4KZ8A 2UYFA 2EXAA 1LAHE 1FR1A 2G2UA 3VLUA 2C5WB 5CERA 4AB5A 3M3LA 1LFHA 2ZC7A 2G29A 1NYYA 1HSLA 4LATA 4RX2A 3TDJA 1LBBA 4Q30B 3N5LA 2NUVA 4JXSA 1YM1A 2ZMAA 3DP6A 1MWSA 2DWHA 3W4QA 5EHMA 3C34A 4ZEKA 4WBGA 2O51A 2HQ0A 4E0XA 3K0VA 5HW3A 3MXRA 4UA8A 4ELRA 1KGEA 2XR0A 3MBPA 5ICTA 1FQAA 5HAIA 2NXOA 5TR7A 3MP6A 5HM4B 4FH2A 5DVAA 4FJPA 1CK3A 1MWRA 5ITPA 1P1UA 1D4NA 1I6BA 4U21A 3OCLA 4O3BA 2YLNA 4PM9A 4E3JA 1IXIA 3R7XA 1ES5A 4S2PA 2ZLYA 4R1GA 2OK2A 3LSWA 3MVYA 4MBKA 3U8QA 4S2IA 4BD0A 3K00A 3PBRA 1ONHA 4QY6A 2OLVA 3O28A 4KI0E 3A3DA 3PPNA 4EBPA 4YKKA 1I2WA 3PUWE 2WK0A 1DPPA 1MDP1 4E3LA 3ZG7B 3FZCA 2A5TB 2F97A 1KVMA 1Y3NA 3HSTA 3KJ7A 3SEWA 3VXBA 4OEVA 5CEDA 2Y84A 3RLFE 2IWDA 1ALQA 4KQRA 1WE4A 4NK3A 1MY3A 4IO3A 3CR9A 1DSNA 4OVDA 3OO7A 4S2KA 1SYHA 3E3KA 3O2AA 2Y2OA 2B3FA 3TUSA 4RA7A 1N04A 1WYBA 2XGNA 2XFSA 2ABHA 2ZQAA 1JTGA 4NMYA 4QSEA 5AE4A 3B6WA 3RJUA 4C3QA 4GF8A 2ZYOA 2H4IA 2QS1A 5F1FA 3EQ1A 2NWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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