4DXCA

Crystal structure of the engineered mbp tem-1 fusion protein rg13, c2 space group
Total Genus 202
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
202
sequence length
637
structure length
624
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein, hydrolase
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
publication title Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 202
structure length 624
sequence length 637
ec nomenclature ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF13354 Beta-lactamase2 Beta-lactamase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxcA01
3.40.710.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Beta-lactamase DD-peptidase/beta-lactamase superfamily 4dxcA03
2A5TA 4E6WA 4U0XA 1BUEA 4S2NA 4G68C 2WKEA 3FVOA 3JV9A 5GLBA 3GTCA 3NBLA 4RYEA 1RYOA 4U4SA 5E2EA 4EUOA 2PBWA 1Y1MA 1B40A 4NF6B 1XA1A 2H5YA 3PTEA 4OOMA 1N7XA 3G30A 4P6BA 3E2LA 3FVKA 4X69A 1LI9A 4RYAA 3TDJA 1O64A 3AGEA 5CGWA 3H7MA 3W8KA 1S50A 2V84A 1EZOA 4P11A 4Q30B 3VVEA 1MG1A 3MVXA 3PMVA 1MPBA 1QUJA 2H98A 5K2YA 4EWFA 3S9NC 1EH3A 4GD8A 5KSHA 1LB8A 4RXLA 1SW2A 4OLDA 3TZAA 2O1MA 4FEDA 4UA7A 3DWKA 4GQOA 1O63A 5FQMA 4G68B 2X71A 1LFHA 2F8DA 1GHMA 1B2HA 1DPPA 2ALUA 2R71A 1MY4A 1LFGA 4PM8A 3EPEA 1FQAA 1MPLA 3RQTA 4LA9A 1PIOA 2REGA 3EHSA 3MZBA 4NF4B 1CI8A 3W4OA 3DTMA 3G35A 4U22A 1VQQA 4IBXA 4NEDA 3UNWA 2QPNA 5G18A 5FAOA 3BFGA 3PD8A 1SQYA 4ECFA 4YB6A 1JTGA 1FR1A 1A40A 4PFWA 1IUDA 2HZLA 2Y7WA 4RX3A 2EX6A 5I57B 3TCGA 4U0TA 1P1NA 4DF6A 4O3BA 4JXVA 1L0GA 5CBSA 2DP8A 2HP9A 5M1AA 4PM9A 3HN0A 4DDSA 1JW4A 2ZC3B 5FTHA 1YMXA 3G4PA 5CTNA 1US4A 4S2OA 3M2KA 5CECA 1IYSA 2OLVA 1KE3A 1W8QA 3C34A 3VLWA 3KN8A 2XLNA 2Y59A 2ZM0A 2H0YA 2OJTA 4D2OA 4IO7A 1D4NA 3PMWA 4WEKA 3A3JA 3IF6C 2PU2A 4RY1A 1UQWA 4IO6A 2WUQA 1BT5A 1PB9A 2ZYMA 1PWGA 5M19A 4DE3A 4EF1A 3IQAA 4R2BA 3HL9A 5H8HA 1T0KA 2QJEA 3KN7A 4LVQA 2XF3A 4LV1A 2C5WB 4F22A 2PU4A 3TYHA 3H6TA 3LSFB 3FASA 4PPRA 4O3AA 1LAGE 3PUZE 4MLVA 1NY0A 2OSUA 1H8YA 3B6WA 3IWQA 3IT9A 1P1QA 4OEVA 4R75A 1GVCA 3RY3A 3V3RA 2F35A 3MKFA 5EVIC 3DP4A 3IF6B 2QSXA 3G3HA 5FI7A 3NIAA 3GBBA 5H8QB 3MW0A 3D4GA 4OQIA 4XUXA 3H06B 3B6QA 2O69A 2HPBA 1YCJA 1R9QA 3G34A 3A3FA 5TP9B 3DP6A 1RGZA 1DJCA 2JCHA 4K0WA 3UN7A 2XFTA 5A93A 3ECRA 2DRWA 1XXMA 4Z9QA 4Y0OA 1E3UD 1KGEA 3F11A 2DVCA 4GN2A 1B1XA 5E2HA 4F2OA 1D9VA 1LCTA 2IWCA 4C1TA 1NNKA 2OK2A 4UA9A 1QKAA 5I2KA 3BM6A 4MBKA 1JWVA 4ZEFA 3ZSFA 4ZEDA 5EVIB 5AA2A 5D3OA 5IHVA 4X48A 4G8HA 4OMBA 1J1NA 1ZG6A 2QRYA 1RCJA 4QFKA 4IY6A 3ZVWA 1WE4A 4OETA 2A3UA 4YAHX 4LCLA 4R2FA 4HTGA 3UA8A 3MP8A 4G77A 1AIVA 3FJMA 3UDIA 4WMCD 4YKKA 3TUSA 4MH5A 5CC2A 1LBCA 4DCXA 4JXGA 5FSRA 4LZ7A 3TQWA 3N7WA 2DYXA 1NNPA 4E3JA 1LBBA 3DM0A 4QFPA 3TTMA 5L2FA 2Y4AA 4R3JA 3WWXA 1YT4A 4IEDA 4ZTKA 3U8QA 4X56A 3CSBA 1VM1A 4HBTA 2WGVA 3CSGA 4FJPA 4OEUA 5CI5A 3S1YA 4OPYA 3THIA 4KHZE 1XOCA 5DF8A 4FEBA 2DWIA 4IVIA 3ZVTA 3DW0A 2PT1A 1B7ZA 3HSTA 5AQBA 5DTBA 3G2YA 1SDNA 1NFTA 5DF9A 5KSCA 3H4ZA 2AL4A 1PI5A 2Q2CA 2WAEA 1XT8A 1QVSA 2ONRA 1M40A 2F5XA 2G2UA 3HO7A 3IB0A 2Z8FA 3KN3A 3RXXA 5I2NA 2DWHA 5DTKA 5CMCA 3V8XB 1Z7ME 2ZQAA 4EQBA 1QKBA 3SH8A 4GRKA 3DLNA 3QHYA 2OCUA 2CMOA 1IKGA 3C7VA 4I1DA 1MY2A 4EXLA 1PW1A 3LBSA 1R9LA 4ELRA 2I49A 1MXVA 2V3QA 2R9WA 1H8ZA 3VV5A 2EX2A 5EHSA 1TXFA 1EI5A 1JEUA 2VGQA 3IXHA 1ZMGA 3FGSA 1D3KA 4OP5A 4A5RA 2ZC6B 4UA6A 3O9PA 3G7WA 3FVNA 4EQ7A 1EZPA 5FHOA 4DZ1A 4DDYA 1IXHA 5DF7A 4NF8A 2Y2IA 3FVGA 4QB8A 3TQLA 1S0WA 3P09A 4WM9A 4S2KA 5EOEA 2DCFA 4QY5A 4TOZA 5TPAB 2QS3A 4H8IA 3R6UA 2ZC7A 4ZJ1A 4B4ZA 2NWJA 4MEZA 2M8CA 1W5DA 4DXCA 2RL3A 2DE2A 3NDGA 3MXSA 4CPKA 1XS5A 3TELA 3ZHHA 2O7UA 4NF5B 2QL3A 3VP0A 3TTLA 2P1SA 1AL3A 4LATA 3QXMA 1Y4TA 3SEXA 3CIJA 5L8DA 1UTHA 3K02A 1MWTA 1K55A 4F3PA 5FAQA 2D5WA 2Q8JA 2I4CA 5F1GA 1H3DA 4ISUA 1FQCA 3VVFA 5KDTB 4FORA 2O1LA 4OOLA 3ZG8B 1B51A 4JWXA 4YKPA 1XX2A 1IXCA 1VE4A 1C3BA 4R6YA 1MWSA 3O88A 3MVWA 5CEBA 4AB6A 1N3WA 3CMZA 2HFBA 2HDRA 1USYH 1JVJA 4HS7A 3VP4A 3FUZA 4DE2A 2WZXA 3GV9A 1B3EA 1NZUA 3SH9A 4HCWA 4ZZAA 2VD3A 1WDNA 1MXYA 4E3LA 4O7DA 2THIA 5IKBA 1ZU0A 4OPQA 4OERA 2ZXTA 2Y2QA 2YPNA 3VP1A 4OFOA 1K56D 1BTJA 1Y1ZA 2Q9NA 4F39A 1IKIA 3JYIA 1MY0A 5FI6A 3HBRA 3I6VA 4WZ4A 4UACA 4FSFA 4X6TA 1MQDA 3Q07A 4UA8A 4Y0UA 2UXAA 3PMXA 3BRMA 3SDFA 3TCFA 3BLMA 2I6EA 3K01A 3MZFA 4QY6A 2RC9A 4X55A 4GNUA 3N8SA 1PEBA 1M5CA 3MPKA 3Q29A 2LAOA 3IXBA 5A92A 3ZG7B 1FQFA 5JTYA 4YICA 2R9JA 4R4RA 2HEUA 5AA4B 1HSJA 4THIA 4IO4A 3RLFE 1L2SA 2Z23A 3DWZA 4BDRA 1MH3A 3IB2A 1JEVA 3HLDA 3VP3A 4ZS9A 1FCNA 2GHAA 5JEIA 2ZC4B 4N9LA 4Q8IA 4C0RA 1SI0A 1M5DA 4G2ZA 1FCKA 3OSQA 3R26A 1MM6A 1IYOA 3FWLA 2RF1A 2B65A 2Y2JA 4YU0A 4LV2A 3FATA 2Y2PA 3ILUB 4GB7A 1N4OA 3M2JA 3HUOA 3HPIA 1PBQA 3C7UA 4TQUQ 1S9TA 1Y4CA 2IWBA 1DTGA 5FQKA 1Y9UA 3G32A 4KZ7A 4P0IA 4GVOA 5EHMA 3Q27A 1POTA 2A5SA 3VFJA 3G3GA 1WVJA 2XXIA 2XDMA 3OO7A 4QSCA 1K4FA 4PETA 1A55A 4DE8A 5HW3A 2J8YA 4F3SA 3A3EA 1BIYA 2XX7A 4ZJ2A 1JNFA 1H44A 2VHAA 5ELVA 1IEJA 2O7IA 2XXTA 1SBPA 3MVYA 4FH2A 4H5FA 3MVZA 1MKIA 1OMEA 1FTLA 3HV1A 5FQIA 1SW1A 3HUMA 4PFYA 4H65A 2G2WA 3OEKA 3B3XA 4ZAMA 3RT8A 2H4IA 1Z7NE 3I5OA 3OMBA 4BD1A 4OVJA 1ZJLA 3C5AA 3VLVA 3IO6A 1LFIA 4BLAA 1Z6FA 2RINA 3C4PA 4U1OA 3AXFA 4I8CA 5DEXA 3GRJA 2DE4A 2OLBA 3HLFA 5H8NB 3V39A 1GV8A 5FDHA 5ICQA 3OPRA 1HTZA 3PBTA 4OFLA 5AE4A 1BLFA 5FHNA 5HX9A 4Z7EA 1J9MA 3N6TA 3ILTB 1FSWA 3U92A 1OLCA 3G2ZA 4GLIA 2DS9A 3PPQA 1DY6A 3N94A 3C33A 4DDDA 3QUJA 3JYRA 3QIMA 3MZEA 4QD4A 1UIUA 3PGFA 1NH7A 4KG6A 1I6QA 1MPCA 3MUQA 3K1PA 4G8MA 2XR0A 1SW5A 4N9KA 5FQ9A 5CMMA 2Y2MA 3BYDA 2Z2LB 3FJ7A 4KYSA 4KZAA 3BFCA 4IB2A 3H03A 1YMSA 1B0LA 3TSGA 4NTLA 1N7WA 2I3VA 1B58A 1B5HA 1ONGA 2V1ZA 3OCLA 5CHJA 1IZ1A 5CM6A 4S2NC 1IYQA 4DIGA 1GTKA 4HW8A 4MFIA 5HM4B 2XD1A 4YB7A 1E3UA 3T9XB 2R6GE 4QJGA 1N04A 2QMIA 3E4RA 1SCWA 3IJXB 2OBGA 1I2SA 1P1WA 2QS1A 2F7AA 1I69A 5JK4A 3VFFA 2EFXA 4OPRA 4GXSB 2J9PA 4FATA 4ZZEA 2WGWA 5A90A 4PFUA 1ESUA 3FZCA 4IVKA 2XXXA 3KJTA 4QF9A 3PD9A 3WRTA 3T93B 4PP0A 3UIFA 1NJ4A 4KCCA 3OOAA 5I59B 2A5TB 3BFFA 5AA3A 5FASA 2Y7RA 1VSOA 4O3CA 2XXRA 2X7QA 2ZYOA 1FTMA 1PI4A 3UE1A 3WS1A 3G3IA 4EDPA 4WMCA 5FA7A 2PYYA 3UN6A 4OOYA 4R6HA 2F36A 5GL9A 3UPPA 2F6PA 4KENB 1YLJA 1PDAA 3M8UA 4Y7PA 1B3HA 1B46A 2V20A 3OPHA 3TTRA 4BD0A 3ITAA 3OO8A 2WKIA 2GRVA 3ZCZA 3Q25A 4XXUA 2I3WA 3MAMA 4E0XA 4EXKA 3N8RA 1B4ZA 1TT1A 4BENA 3KEIA 3QUFA 1UTBA 3U1OA 4OESA 3P98A 3LR1A 5K2XA 2F7BA 1YPNA 4GWOA 2V3UA 4IBRA 4GF8A 3TAJA 3IO4A 2UYFA 1SDEA 4WZ5A 3IR1A 3OCNA 3WS2A 4ID4A 2O68A 3GBAA 4I62A 2ZQ9A 1BZAA 3HLBA 2ZNSA 4DRTA 3ZFZA 4N92A 4S2MA 3S9LC 4EQIA 1MS7A 2UYEA 1K4EA 4PQJA 1M5FA 1D9YA 4KCDA 1OIBA 1RKMA 3MZ1A 5I94A 5CRYA 5DTSA 4R9FA 4X1DA 1GR2A 4JPMA 4KZ8A 1BKAA 4C75A 4ZECA 2ONKE 3LY4A 2H25A 5AA1A 1SW4A 1LI0A 1M5EA 3W15C 5DVAA 2VOZA 3K6VA 5M2VA 1NYMA 4XKRA 4QU3A 1FOFA 3OEMA 2HP6A 2QMWA 4NE4A 4OP8A 2FFFB 3FXUA 3V83A 1O07A 1NH8A 3C4MA 1ALQA 3WS4A 1LGBC 3QK6A 1ZG4A 1TWYA 3KZGA 1E4DA 3T9VA 1BTLA 1NYYA 2HAUA 4U4XA 4WEDA 1FQGA 4ND9A 3OSRA 5JYPA 1URSA 1B9JA 1YAEA 3IX1A 1NXYA 4WXJA 3CVGA 3IXDA 3PBNA 4F31B 4KYDA 1GCEA 5I56A 2XEPA 3GLBA 2OZZA 5H8HB 4S2PA 2PBYA 1W8YA 1I6AA 1A7LA 2AYSA 5J8XA 4MBFA 3VLUA 3IORA 3VMAA 1Q1KA 4F1YA 4OQOA 1WODA 1POY1 2WAFA 5F1FA 4NWCA 3TFLA 2Y2NA 2ZQDA 4IGTA 3PPPA 3MXRA 1MXOA 3PUYE 2NUVA 3PPNA 1SYIA 3UP9A 5HAPA 1MXXA 2RKMA 2Y7PA 4R0QA 3NI9A 1ANFA 5BUUA 1I2WA 2XXQA 1YM1A 1N76A 3E13X 4K91A 1MBLA 3H3GA 3K6UA 1HVBA 3N4IA 1PYYA 4OH0A 3EHTA 1HSEA 2Y2LA 2ZQ7A 2I0BA 5A91A 3SETA 2DSFA 2B3FA 4DCYA 1CEGA 3MPLA 2DVZA 4HEFA 4GL0A 3R7XA 1PWDA 5CGXA 1DSNA 1GGGA 3KSJA 2I58A 5EVID 2Y84A 1QULA 3OO9A 3SS4A 1LCFA 3L6HA 2AL5A 4JDFA 1KDWA 3K4UA 5I2KB 4RK2A 1K56A 1SKFA 2QZ6A 1M6KA 3PUVE 3K00A 5AA2B 1ZLQA 1NRFA 5HAIA 4ZDXA 2ZMAA 1SI1A 4YMBA 1SHVA 1K54A 3GMWA 1L0EA 1PWCA 1AOVA 1ZC2A 4FIMA 2XXVA 5U47A 2ANJA 5CRFA 1LHYA 1Y3QA 1Q2PA 1H5XA 3ZGAB 1MWUA 1B7UA 2FNCA 1OVBA 4IGRA 3OXNA 2R9XA 4OTEA 5FQJA 3LSXA 4QRZA 5FQQA 1L0DA 2XXUA 2XD2A 1ES2A 3Q82A 2DXYA 1MWRA 1DJBA 4H5GA 3AGDA 4I9DA 1S7YA 4M3KA 4U3TA 1OLAA 4YKIA 3GVBA 3MQ9A 3HHGA 4H0WA 5FI2A 3OPPA 1LAXA 3KOTA 4GDBA 4AB5A 5L9OA 1YLTA 1BLPA 2BLSA 2O84X 4JXIA 4P0MA 3FV7A 3MJNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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