1A53 | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with substrate analogue, substrate, and product. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INDOLE-3-GLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags	Synthase
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	96
structure length	247
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	1998-02-19

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1a53A00

4JYDA 3HGOA 3CLMA 2C3ZA 1F05A 1YXYA 1WBHA 4JX6A 4O1CA 1LM1A 3S5ZA 3RLUA 3BG5A 3KAOA 5T26A 3N14A 2VKZG 3GR7A 3H54A 3NNTA 3TR2A 2ISWA 2ZA2A 2H8ZA 1UJPA 4JDBA 1FX6A 3P80A 3M5ZA 4UMBA 3ATYA 3MI3A 3A9IA 1LBMA 3PR2A 3IIZA 5CPNA 5HINA 3IGSA 3UWVA 3PVFA 1HO1A 4Z08A 4BWLA 3G1XA 1HUVA 1HFBA 2QCDB 3NL3A 3BGGA 4UTTA 1H7WA 1SSGA 2ATMA 2GQ9A 4KFNA 1W5OA 3STCA 1GT8A 3EX2A 1OHLA 2PRMA 1FXPA 4ML9A 4ADTA 2ZCGA 3W71A 1GQNA 1TV8A 3L21A 4Y9AA 1FDZA 3FOKA 1G69A 1KV8A 1LLZA 3LHTA 4A22A 4AAJA 4A21A 2ZRUA 3GXNA 5FESA 1SSDA 4FXRA 4GBUA 3SSJA 3LV6A 3QJAA 3QW3A 1W31A 3M47A 2OX1A 5CKSA 1LOQA 1OFRA 2FB2A 2CLEA 3HJZA 2YGYA 1EIXA 1KFLA 4UTUA 2C1HA 4UTWC 5CPOA 3PF3A 4O14A 3DFTA 1TB3A 2OT0A 4FNRA 1KBIA 3W07A 3L9CA 1WAUA 4X2RA 3RF9A 2PC4A 1GG0A 1XC4A 4GJ1A 1K7EA 3CQ0A 2Y85A 3W2MA 3QQ0A 1TTPA 5I3FA 1IXNA 2Z1BA 3F03K 3MYOA 2A5HA 3GKFA 3PSWA 3HBLA 1G67A 4TO8A 4UXDA 3NQGA 4GWEA 3B04A 1KM1A 1OX4B 1Q6OA 4TMBA 3MI2A 3UPBA 1O60A 5D2YA 5AHLA 1W1ZA 1LDCA 1DOSA 3NGJA 2BTMA 4TIMA 1O94A 2B0MA 5D04C 1LRTA 1ME9A 3W7OA 2E68A 2EKCA 3DHFA 4ZQPA 3MHGA 1W37A 1GYNA 1JUEA 4LVGA 1DQWA 2DZXA 4DF1A 3UXDA 4NZFA 3OA3A 3IGXA 1JCLA 4EWND 4QITA 4AHPA 2QJGA 2A2IA 4OE7A 3LCWA 2GPTA 4JIPA 1SW7A 2YPIA 3GDMA 2YYUA 3PWAA 4P2VA 3LTYA 1X8FA 4O10A 4JEQA 3VNDA 1HO4A 5F1VA 3P5ZA 3EEGA 4LVAA 3N2XA 3GKAA 1EX5A 4KKXA 1P5BA 4MUZA 1TPB1 4FIRA 5DCBA 1JCMP 3EX4A 2WSRA 3M0ZA 1VCVA 2Q3OA 3IIOA 3UNDA 3MP5A 4CCCA 4LWWA 3NZ1A 1I8JA 4O17A 4BR1A 2ZRWA 1GZGA 1A53A 3SGZA 3F4WA 3MP3A 2VOMA 3NR0A 5A5WA 3WK1A 5F4SA 4UFMA 2PRLA 4N9CA 3TXVA 2V2HA 4UTJA 4XKYB 4GC4A 4BI5A 2Z2UA 1QMLA 1YPIA 7TIMA 5HUOA 4K37A 5EL1A 3TW7A 3WJZA 1G4EA 2A6LA 2WNQA 1VYPX 4CQ9A 3NM3A 2VEPA 1TYGA 3O6YX 4FEZA 4LV9A 4LUIA 4RZ6A 1KM5A 1D3GA 1K3UA 4DO6A 2YCEA 1LCOA 1OX6A 2DZUA 4ADUA 2NWRA 1KA9F 5C6MA 1OYCA 1ZCOA 4IJBA 3L65A 2VFDA 1QOQA 1SO5A 1ZALA 4AVFA 1XUZA 2NLIA 1SZGA 3QEZA 5IBXC 4PC8A 4HPJA 3LCHA 4RJEA 3C4UA 1IGSA 4AWTA 3ANYA 1A5AA 5FI8A 4JYEA 1EP3A 3C56A 4N9DA 4JTTA 2JKEA 3BG9A 1ZY9A 4UFIA 2EGZA 1W3IA 4HN4A 3LI1A 5DCDA 3I7RA 1SZNA 1CX9A 4KWVA 3C2OA 5U7SA 3MWAA 5IM51 1AK5A 3W1XA 3O16A 3LERA 2Q3RA 3B03A 3S5OA 1AW1A 2W6RA 4HPXA 3WJSA 3LOTA 4LU0A 1QPQA 3G1VA 4AH7A 3HO8A 4HSNA 4J9JA 2DZPA 2XN2A 3CB8A 4E2BA 4FIQA 1WQ5A 3KOFA 5E1QA 1TPH1 4QIUA 3DENA 4Q4KA 4CLMA 5KMYA 2FJKA 2BXVA 3GZ3A 2J24A 1MO0A 3F4NA 4LS0A 1TV5A 3W88A 3EX3A 4GXMA 1SUXA 1SO3A 4OT7A 4XBKA 1Q6RA 2V0TA 1I2QA 5FF0A 5FF3A 4K36A 3NQ7A 4TMCA 2QAPA 5LNVA 4NJGA 4JTJA 3U8GA 4IMFA 4IMCA 3E96A 1K7FA 1SW3A 2O7QA 2I1OA 3GAYA 2FFCA 1DORA 4DO5A 2ISVA 3LXBA 5HR6A 5FEZA 3TQ0A 1NVMA 4NJHA 1B4KA 1LBLA 3FJ6A 4YMZA 3TCEA 1F2JA 4UFJA 4ONVA 4K38A 2ZRZA 5FEPA 3V1PA 4U4MA 2GVLA 3CWNA 3P5YA 3HG3A 4GFSA 1VYRA 4O8RA 2NUXA 4M5PA 1QOPA 1LLWA 3H55A 3GYEA 4HHPA 4JGDA 3TAKA 2ZBTA 4UMAA 4JICA 3U6WA 4K39A 5LNRA 5FF7A 3O6DA 2DP3A 1VH7A 2NX1A 4IXXA 1S3HA 3LHVA 3TIMA 1H7XA 4L4LA 2D73A 3W7IA 3GDRA 3W1RA 3F1QA 1K03A 3ZWTA 3SR7A 1JRCA 2A21A 3IEBA 1W56A 2XN0A 4DQWA 2V30A 1TPUA 4FNUA 3GNNA 1WYIA 3TX9A 3TKFA 3KVJA 3NQVA 5D03A 3W7JA 2FLIA 1S5WA 2E6DA 3G3MA 4O1BA 4NJJA 1EWDA 4R7JA 1NFBA 3HF3A 2WSYA 4UUIA 1I4NA 1XDMA 2WO5A 3L0KA 4O52A 2XN1A 2B4GA 4WZHA 1FWTA 5D05A 2PURA 1OYAA 1OFQA 2ZRXA 1KBJA 4FO4A 2FB3A 1VRDA 1GVFA 4NNAA 4QM1A 2J88A 1BWLA 4I7WA 1PV8A 2EF9A 2ZFAA 5U4NA 3EX1A 1W5NA 3ELFA 4JTSA 3NPVA 3NQDA 1ONRA 3L0GA 4FNSA 4AF0A 3NEVA 3L67A 3T78A 4UMCA 3GB6A 1RQBA 4XZ9A 4ICNA 4K8HA 5G4WA 3E49A 4ORIA 2WJZA 1Z41A 2EHHA 1W3TA 5I3GA 1U5JA 2Y63A 1E51A 1T8XA 3I7SA 1D3HA 1VGAA 4QQ3A 4R34A 4RZ5A 5H91A 4A29A 3HIJA 3NL5A 5DXYA 3M7WA 5G2WA 4MFDA 2ZZ3A 1RZMA 4IXHA 4M7SA 2WQPA 1FXQA 4BK9A 4ADSA 4ZQOA 5BNKA 2YXGA 3TA6A 4UFHA 1TPVA 1YTDA 1X1ZA 2VFGA 3MI6A 3S0CA 3N19B 2RDTA 3CTLA 3P74A 4PODA 4Z1CA 1ZJIA 4O0KA 5ABTA 1LTDA 2GQAA 3TSBA 4JTUA 3A23A 4WXZA 3NOEA 4JTIA 3FFSA 4UTWA 1KTBA 4K6AA 4CCDA 4O28A 4LVFA 1YXDA 3NDOA 2VC6A 3Q94A 2G97A 4I7VA 4LS1A 4N2YA 1O5XA 1NF7A 5G4EA 5AC7A 2ZZ4A 1TTJA 1SR9A 4UFKA 4FX6M 4JIQA 2RHGA 2V5BA 2G5WA 6ALDA 3I68A 4LVDA 1S5VA 5EPDA 1TTQA 4JX5A 3UD6A 5DY3A 1R46A 2JGQA 3DFQA 4CNNA 2Y7GA 3DI1A 5LHEA 5I3IA 2HS6A 4A2RA 2QUTA 2JKPA 1R2RA 3HPZA 3W1TA 3NL6A 4XUGA 3SW6A 5KZEA 3O1NA 1KLYA 1H50A 3NPXA 3PG8A 1X6UA 1XM3A 1OFBA 5KZDA 3TMLA 5J5RA 2OJPA 4N02A 2VEIA 3QZEA 4JYFA 1C8VA 1H1ZA 2E09A 2J27A 4JY8A 5LGZA 1FDJA 4NUWA 1F5ZA 3SY5A 1G7VA 3E0IA 4C1LA 2Y88A 2RKXA 1K8XA 2BWGA 3P8IA 4M6VA 1G4SA 1GWJA 3A24A 4RV8A 3PUEA 3I6RA 4FNQA 3P67A 3TSMA 2QUUA 4AWSA 1EP2A 3L5LA 5HJLA 5FF4A 3OVPA 5D32A 4OU1A 4MZYA 1FCUA 3I7QA 4GUFA 3O15A 2CLKA 2JKAA 3WJYA 4I9AA 3L66A 3M5VA 5BMXA 2H8XA 1YDVA 3W2KA 3TQKA 2NXIA 3HQ1A 4IMEA 1KM3A 2GJLA 2ZZ7A 1RPXA 4MLJA 1F6KA 3EKLA 2RH9A 2V8ZA 1ICSA 2ATSA 3IV3A 2B7PA 1JVNA 2ZDRA 1TV7A 3N2MA 1NEYA 3W1AA 1TJPA 3DFOA 3G8RA 2PRHA 4WY0F 4AHQA 1RQEA 4NJIA 2EAWA 5DN1A 1QPRA 3E02A 2E5BA 5D37A 5D09A 2HS8A 2CLOA 2C13A 3B06A 3BV4A 2HSAA 3LLFA 2F84A 3NA8A 5HWJA 4QSHA 1H5YA 3W9ZA 5H2ZA 3GAKA 3RLVA 3BW4A 2V9DA 1AG1O 5CZJA 1N7KA 4CCEA 4LNYA 4IQLA 1MZHA 4DPPA 4KFOA 4JTFA 1XI3A 5AYXA 3G1FA 4IMGA 1FWRA 2FPVA 3FA5A 2OZ0A 3W1NA 1VLWA 4E0CA 3QRHA 4UNKA 1OYBA 4RLIA 2Y70A 3QMSA 4JDYA 2DZSA 4GUHA 4NNCA 3ZS4A 3LB0A 4MY1A 4CNPA 2G96A 1VR6A 3G3DA 1UUMA 2CW6A 4JTHA 4NNBA 3DZ1A 4GE8A 3DKLA 3GLCA 1L6SA 5IBXA 2X1UA 3Q37A 3OEXA 4IGHA 3UXAA 3S5NA 2Q8ZA 4DF0A 4JNMA 3O6CA 2NXGA 4RKAA 3S1UA 3HPXA 2X30A 3LDVA 3QYQA 2X2GA 4O4VA 2AAMA 2E6YA 1OFAA 5KITA 4RX0A 2J9YA 4YL2A 3TJXA 3W7HA 1W3NA 3UY7A 2C6QA 1C9DA 2NUWA 1QO2A 5AFDA 3PAJA 4NZJA 1H7PA 1OX5A 1Q6LA 2E6AA 2A7RA 3L0NA 3QF0A 1JUBA 4NXSA 3TMQA 3S1WA 3B05A 5F2MA 3G0UA 2ZYFA 5AHFA 4Z1DA 3FKRA 1G4PA 1W0MA 1MEHA 2ZRYA 3G0XA 2QCLA 2H90A 3IGUA 2LLEA 2V2DA 3N3MA 4Z0JA 1SPQA 4O53A 3L5MA 3S1XA 3W7RA 1KLZA 4QNWA 3Q58A 4GUGA 3MHUA 1VZWA 3M41A 3T4CA 1KM4A 5D02A 5HMSA 1XUUA 1FCBA 3NYZA 4ZQMA 3BGJA 3NPWA 2R91A 2QF7A 1GG1A 2ABAA 1HG3A 4WQ6A 3B0VC 1OK6A 4N4QA 2A1YA 4PA8A 1VHCA 5FEXA 2O7SA 2TRSA 3FYOA 1UBSA 1A5SA 1ALDA 3M1ZA 4O15A 4RXFA 2X1RA 3BW3A 3PUDA 3G1HA 4O11A 2X16A 1WX0A 5K7JA 1DKWA 3SGUA 1JCJA 4C1KA 1XXXA 5EY5A 4WOQA 1V7YA 1EP1A 1T99A 3W7CA 3M5YA 3GNDA 3P84A 4JX4A 5LKYA 2E5DA 2P10A 4O19A 4XBSA 1EUAA 3UWYA 3M16A 4CNOA 1ZAIA 2A0NA 1QR7A 1K02A 3LI0A 4FNTA 2NX3A 4RCXA 5F4XA 4R33A 1H7RA 3U2OA 4S2CA 3AJXA 4ZQCA 3MBFA 4K8EA 4QISA 3L5AA 1QPNA 3KHJA 3LHZA 3O06A 1F6PA 4L4MA 5AHMA 1WOAA 1PIIA 1PCWA 6TIMA 5HWMA 1M5WA 3TH6A 2QKFA 4A3UA 3N9SA 4CQ8A 1LYXA 3DKJA 4YXGA 1AL7A 2E5CA 4AF0B 3BG3A 4LVBA 2ZA3A 3SJ3A 3KVLA 5G5IA 2C18A 4E38A 3LBMA 3OBKA 5CZTA 1IIGA 2NUYA 4O57A 1H51A 1FBAA 3QMTA 1FUYA 2TYSA 4IUOA 3GDLA 3DAQA 4FF7A 3KVKA 4WX2A 1QO5A 2BLEA 3W83A 2GUUA 2A7PA 2GVGA 1EPXA 5G2IA 1KM2A 1R47A 3C8FA 5FF2A 3C2RA 4DO4A 1NAL1 4LW7A 1OFDA 3R5EA 2Y89A 3NO5A 1I2PA 5CG7A 2Y7DA 1B3OA 3MJYA 1U83A 2TSYA 3CT7A 3INPA 4LUJA 4FHAA 1B9BA 3S8HA 1SO6A 3HGJA 5TBOA 3C0JA 1G4TA 4ZQNA 3RFAA 2NZLA 2WNZA 4JTGA 3WK3A 1EUNA 1WOBA 2YR1A 3VFLA 1G6CA 3BLFA 3DI0A 3THQA 3ABOA 3N34A 3KRUA 2QJHA 1ADOA 1OJXA 1X7FA 3B8DA 3NM1A 3VKJA 4S1FA 5LHFA 3TNOA 2A6NA 2WV8A 1OFOA 3OG3A 3PBUA 1JCNA 1VQTA 4FNPA 3T55A 3W2LA 2CLFA 3LCXA 4N6EA 2C0AA 2CZFA 1Y0EA 1YDOA 2CLHA 4Z0SA 1I45A 1IXOA 3CC1A 3CHVA 3PBVA 4TX9A 3W1QA 1TPC1 2NX9A 2E1DA 2J6XA 3A22A 3W1PA 1DJQA 3A21A 4NT0A 5AC8A 1S5TA 4IPIA 3NQMA 2YZRA 3WJXA 1O5KA 3Q2DA 3RU6A 3W1LA 3LBCA 1IXQA 3NQ2A 5C55A 3GXTA 3DH7A 2QAFA 3HG4A 1WV2A 2RFGA 1JQVA 1OFEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1A53A

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