3ATZA

Crystal structure of tcoye with phba
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
373
structure length
368
Chain Sequence
FPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural insight into the stereoselective production of PGF2(alpha) by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi
pubmed doi rcsb
molecule keywords Prostaglandin F2a synthase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 133
structure length 368
sequence length 373
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3atzA00
3C0JA 3K30A 2XN0A 2OCZA 4TU1A 4O4VA 4OHQA 3OVQA 5GVJA 6TIMA 1TPWA 1ZCOA 4JN6A 3FS2A 3QW4B 1DORA 4FNQA 3UNDA 2QDGA 5AHNA 1HO4A 4M19A 4LWWA 3QMSA 4PODA 3F4WA 2AQWA 1O94A 2A0NA 1MEWA 1LBLA 2W79A 5LHEA 5K3VA 1TV5A 3BW3A 2YFOA 3H53A 2FDSA 5IBXC 3HGJA 5G1TA 2X16A 4MYXA 5LHFA 1XUZA 3FJ6A 1MSSA 1LYXA 4X3ZA 2J9ZA 1L2UA 3TMQA 2G97A 1AW5A 1DQXA 1GVRA 2GVJA 3I7RA 2WV8A 3RNDA 1LRTA 3KRUA 1G69A 3CB8A 3LHYA 3A21A 2ZZ1A 3DENA 1OVDA 3P5YA 1VYRA 5EMUA 5F2IA 4ADSA 3UWVA 2TRSA 1LBMA 3DH7A 5FF2A 3STFA 1WAUA 3W7EA 1M7PA 4CCEA 1DJQA 1TPVA 4IPJA 2QEZA 1IXQA 5DN1A 4M6VA 5AN7A 4MLRA 3RLUA 4RLIA 4BI6A 4JTLA 4UCGA 1TTJA 3M43A 2Y89A 5AB3A 4AB4A 1Q6RA 2V81A 3HMJG 5AYYA 1KV5A 3W7NA 5HWJA 3DI1A 2Z2UA 5D03A 2OMAA 5L6UA 3AJXA 3LTPA 3P80A 3HB9A 3FFSA 3HF3A 3L0NA 3L5MA 4LS0A 4UTJA 2V5LA 4X9SA 3DFSA 1OJXA 1YXCA 4O8RA 4ZQMA 1H7OA 2RDWA 1KFLA 5LGXA 3IIXA 3HPSA 3CU2A 3W7LA 2FTPA 1S5WA 3UQNA 2O7QA 2NV2A 1XDLA 4KKXA 3TFCA 4WY0B 4HN4A 2VXNA 3B0PA 5FF3A 3W72A 1JCLA 5BW6A 2NX3A 4UFLA 3WJWA 3W74A 1K7FA 5KZMA 1TJPA 1CX9A 3O6YX 1PL9A 1SQ7A 1LRQA 3IEBA 3MI3A 3S0CA 2B7PA 3G3MA 3Q2DA 3TA6A 2QCLA 5TIMA 3LHUA 5FI8A 1KBJA 2V0TA 3T4CA 3BG5A 3ELFA 3NO5A 1Y0EA 1YDVA 2JGYA 4E2DA 3M41A 5D2VA 3DKJA 3W2UA 5LNUA 3E9AA 2C1HA 2JKEA 1TYGA 3A23A 1QOPA 4JTIA 3NM1A 1LM1A 3M6YA 1K03A 1KFEA 1A5CA 4K7VA 5F1UA 1RQBA 4R53A 3PS7A 1MEIA 2UV8G 1YXDA 5F4XA 1SW0A 3S5ZA 2BX7A 4HSOA 1OYBA 1XC4A 3W7OA 1KM6A 4N9DA 1JUKA 1SSGA 1FDZA 3M47A 3L67A 4AHOA 2FIQA 4GUFA 3O15A 2QF7A 3BG9A 3GDLA 3F03K 6ALDA 2Q8ZA 3U2OA 4CNPA 2X1UA 1ICPA 3TC7A 3FIGA 1JCJA 3GZ3A 3KVMA 1QNVA 1VGAA 3TQ0A 3UPBA 1KFBA 2OZ0A 3TAKA 4BWLA 4AHPA 4A2RA 3TKFA 4XKYB 2E68A 1KM3A 1OFDA 2VEIA 3B4UA 1TPC1 2CZDA 2X1RA 4RR4A 4HNVA 5AYZA 3QRHA 4MPQA 1VYSX 5EL1A 2XN1A 2B4GA 2RHGA 1WBJA 3KHJA 1TPEA 3EXRA 3SJ3A 4IX0A 3G1XA 1W1ZA 5J5DA 2QJGA 5HR6A 1SO6A 5DBTA 3R89A 1SW7A 2FJKA 3L66A 3TQKA 2OT1A 4XUGA 1ZNNA 3P62A 1GVFA 4HSNA 4O28A 2CLMA 3OA3A 4ZQCA 2PRLA 3S9YA 3W7IA 3H54A 1O4UA 1F2JA 2YSWA 4MUZA 4N02A 2NWSA 5E93A 3BLIA 1H7NA 1TMHA 3TSDA 5LNSA 2CU0A 2J24A 3UD6A 4KFNA 5F1VA 3UWZA 3N19B 4AWUA 2WNQA 4DPQA 1JUBA 5E0KA 3LTYA 1G4SA 3TIMA 3FKKA 1KM1A 5HUPA 4JY9A 1SZEA 3W1AA 5HWNA 1TCDA 1WQ5A 3NG3A 3RLVA 4ADUA 3ATYA 2FPYA 3TAOA 2FLIA 4ICNA 1SPQA 1NF0A 4MFEA 2QCDB 3OG3A 2FPVA 3S1XA 5HNRA 2PURA 2QUUA 5DCEA 1LP6A 2OX1A 5F2MA 4WXYA 2NXGA 1HFBA 1F74A 1VQTA 1YDOA 4DO4A 1E51A 4OT7A 3UPWA 4OGZA 2ZZ2A 3C52A 4IXXA 3FKRA 1ICSA 3LBCA 1JCXA 4C1KA 3W3OA 2Z0IA 3FOKA 1PVNA 4P61A 3PSVA 3W7DA 1R2SA 4RV8A 5AHFA 1FWTA 2X2GA 3LCHA 3U8GA 3ABQA 3G1DA 4UFHA 5BNKA 4Z1BA 1TQXA 1G4PA 2ISVA 1OX4A 3P5ZA 4PC8A 4ZL1A 3SZ8A 5CZTA 3W7JA 2QCFA 2Y88A 3GR7A 3C4UA 2E6AA 2RH9A 2A2IA 4PTNA 2V5BA 4JGDA 1RD5A 4NJGA 3TE9A 3ZR4A 1KLZA 1VRDA 5F4WA 3INPA 4GJ1A 3SW6A 1H61A 1FWRA 1NSJA 1XXXA 2CZFA 4POCA 2XN2A 1TV7A 3NQMA 4O18A 1TRIA 4Y6GA 2R91A 4ZMGA 4OBTA 1QPOA 1WX0A 3NZRA 4RCXA 4ZVJA 1LLZA 1JCNA 1ZENA 1T8XA 4S1FA 1G7VA 4BFAA 1DL3A 4NNCA 1I2NA 3O16A 1LOLA 1Z44A 3NL3A 3PBYA 4XZ9A 1WOAA 5I3KA 1FY6A 2QCMA 1KTNA 4CQAA 5CGQA 2TYSA 3KVJA 4IX2A 3W7KA 5DY2A 3DFOA 3HG5A 1GG0A 4ZQOA 2QCHA 3C2RA 3BLFA 2VEPA 3NZ1A 1T99A 3EX2A 4MVAA 3SECA 3NQVA 3W7CA 1BWLA 5K9DA 2RDUA 4FXRA 3G1VA 4FX7A 3DFNA 2PRHA 1RQEA 2Z6IA 4FNPA 5I3IA 1IXNA 2Y85A 1FUYA 1A53A 1VYPX 3LLFA 3LHZA 1XBYA 1GEQA 3HO8A 4FNUA 3S1WA 1PCKA 1OF8A 2C3ZA 4QQ3A 1JULA 2GJLA 1GWJA 2ZZ4A 5EPDA 3MW7A 4PL2A 1QPQA 2X30A 5LSMA 5KTLA 4LS2A 4JTKA 4UTWC 4FNRA 5K4ZA 3CQ0A 3WJXA 3THAA 3QPYA 1FCQA 3LOTA 1MXSA 3WK2A 1XBZA 1WA3A 4ZZ9A 1THFD 1FDYA 1H7PA 4G1KA 4NX0A 3C2OA 2WO5A 4JX6A 3G1HA 4UMCA 4D2JA 3LHWA 3WJSA 3P74A 2A1YA 3FYOA 2Q8LA 3W22A 3EXSA 4GUHA 3EWZA 1P1XA 3HG3A 1O95A 5AFDA 1YLVA 3OVRA 1H1ZA 1KFKA 2ZA2A 2F7FA 3GK0A 4NZJA 4NZFA 4LRSA 2Y7FA 4XTIA 1VJIA 1O60A 3C61A 1C9DA 3PUDA 3LHTA 1HG3A 2WSQA 3LXAA 1H5YA 2C18A 3NL2A 1AG1O 3EKLA 4Q33A 1R2TA 2ZTKA 4O17A 2YX0A 3JR2A 1FWNA 1GVSA 4M6PA 1KW1A 4JY8A 1OF6A 4A2SA 4EF9A 3EEGA 3GKAA 3QF0A 2E77A 5FEPA 1OG0A 4LOCA 4BK9A 4O16A 3W7PA 5G5IA 1VHNA 4MZYA 2E6YA 2HTMA 4RKAA 1O5KA 3W1PA 3B03A 4I7WA 2FPTA 4TMCA 2CLFA 1GQNA 4P2VA 1R2RA 1W3TA 5D32A 4AMAA 5D05A 1IF2A 3M5ZA 5D04C 3W23A 2QJIA 4QM1A 4HNTA 1HL2A 3C8FA 1Z48A 5H91A 4YCOA 1U5JA 3TCEA 1K02A 5AHMA 1GG1A 4XWUA 2E5CA 4KFOA 1W3IA 3CIWA 4UUIA 2EHHA 3S1VA 4LVGA 3O1NA 3PC0A 4MOZA 4IMCA 3RMJA 1QO2A 3S5YA 5HR7A 2Y6ZA 3PY2A 4IMEA 2A7NA 2QAPA 1TV8A 3USBA 1SW3A 4NNAA 4RK8A 3EWWA 2VFEA 1Q45A 2ZZ6A 4NNBA 4TIMA 1B3OA 1VCVA 2H8ZA 1TSIA 3GNNA 3KOFA 1KV8A 1IIGA 3HIJA 3LCLA 4NJHA 3HG4A 3LHVA 3EKZA 2H90A 2CLKA 5D38A 1TTPA 4ORIA 1SZGA 4UTKA 3NQ7A 5LKYA 2WJZA 2DZTA 4GUJA 3GDTA 2C14A 4BF9A 2QCGA 4WOZA 3LLDA 3QYQA 3M1ZA 3LBMA 3W6YA 4FX8A 4NT0A 1GVOA 3W7QA 2YGYA 4Y90A 3TX9A 3IVSA 5DELA 1XDMA 1WYIA 4A3UA 2X1SA 3R2GA 4FNTA 1XM3A 5BRBA 3L9CA 3FEMA 3PUEA 4WY0A 3C56A 1KM0A 5CPNA 3W85A 5LZLA 3O07A 5BMWA 2DU2A 3HJZA 1XL9A 3TROA 3N9SA 1QCWA 3B06A 3BGGA 1QO5A 3BVJA 1OYCA 3W1MA 3L5AA 4JYDA 1ZAIA 3TSMA 4LVAA 4L4MA 4O12A 3QEZA 4GRSA 1W8SA 4WD0A 2DP3A 1EEPA 4UFMA 3DBPA 3IGSA 4UTTC 3F1QA 5HUOA 1TIMA 1PHWA 5C5YA 4EF8A 3PB2A 4W9TA 1TPUA 3A5FA 3KX6A 3JS3A 1XBVA 4N9EA 2J6XA 4GUGA 3LB0A 3W84A 4DBEA 4UR8A 3KFTA 4QITA 4AWSA 3LXCA 3MYOA 4AVFA 1M7OA 2ZRZA 1SO5A 3C6CA 3GXNA 4MKNA 1DJNA 4ADTA 2I14A 4PH6A 2KZHA 3UWUA 3M5YA 3ABOA 1G4EA 4JTJA 3I65A 4JTGA 3CC1A 1H63A 4O19A 4IOTA 5HQEA 4KFPA 4N6EA 1ALDA 2P10A 4XKYA 1W5QA 3C2EA 4WJEA 4Q4KA 3O6CA 2Z1BA 4EIVA 1EP1A 3LCFA 3W73A 3TXVA 5E1QA 3VI2A 2EAWA 4XBKA 2Q3OA 3VE7A 4I7VA 5AOUA 3STEA 3QQ1A 2V30A 3T55A 2QCNA 3UXDA 1LZOA 1KA9F 1YTEA 3W9ZA 3EWBX 4YWIA 3TR2A 3NQ6A 1H7XA 1B4EA 2G96A 3RF9A 2WNNA 2HS6A 2J27A 3HG2A 2QKFA 1VR6A 1YTDA 4JXCA 2PC4A 2CFFA 1EIXA 2IQTA 3SR7A 4K38A 3EWUA 4K8HA 5I3HA 1K8ZA 3GDRA 1F6KA 1RQHA 3H55A 1XCFA 1UUMA 1ML1A 3LCIA 2FQIA 1FXPA 1FCBA 5FESA 4EVZA 5U7SA 4MZ1A 2E6DA 3G0XA 2QUVA 1H7WA 4NJIA 1DQWA 3P81A 1W0MA 2VEKA 2NUYA 2ZRXA 3RK8A 2DZXA 4O50A 1RPXA 3LI1A 1HO1A 2G5WA 3R13A 3LGEA 1ZAJA 4J9JA 3B04A 1JJKA 5I3JA 4HIBA 2GJNA 5MHBA 2HMCA 2NUWA 2QCDA 3CTLA 4LUJA 5G2WA 3PWAA 2NUXA 1OFPA 3IVTA 3W2JA 4HKPA 3M5XA 4Z1DA 4PA8A 4PL1A 4O52A 1NFBA 2VFIA 2WKJA 4PEKA 4I9AA 2WSYA 1GPWA 4MJMA 1X8FA 1NVMA 4GE8A 1DKWA 4FHAA 1VZWA 1JQXA 1SO4A 5HWMA 4BI5A 1OYAA 3TNOA 1ME8A 3NQAA 4LVBA 2W6RA 3G22A 4E0CA 1Q3NA 2FB3A 2AAMA 3I7SA 4CNOA 1EA0A 1ME7A 3N2MA 1BWKA 3W70A 1IIHA 2C13A 3VCRA 2YW3A 2BTMA 4A22A 1TPB1 1X1ZA 3MHGA 5KITA 4AF0B 2B0MA 1EWDA 1ICQA 4B5NA 3W2NA 3WK1A 1SU5A 4UNLA 3LM7A 1TTQA 3MHFA 4WZHA 3SGZA 2QCEA 1TPDA 4I7UA 3MI6A 1OX5A 4LV4A 4LUIA 2H8XA 1QOQA 1JCMP 1D3HA 2NWRA 4K36A 1SZNA 5G4EA 3A9IA 4GWEA 3OIXA 3ATZA 3W83A 1S5TA 1IXPA 4CQ8A 1OFAA 1XBXA 4XQ6A 1B9BA 3OVPA 1Z42A 2O7SA 1EP3A 3C2FA 3G1YA 1VHCA 3KVLA 4DEFA 1H7RA 2VFFA 3W7GA 2YW4A 3GX9A 3L2IA 2R94A 5D37A 5I3FA 1VLIA 3LRMA 4NU7A 1EWEA 5TBOA 1KTBA 1Q6QA 4JS3A 3G8EA 3THQA 3TUUA 1UJPA 3FJLA 3CLMA 3C2VA 1MO0A 5AC6A 2VOMA 1QFEA 1EUAA 1ZALA 2H3BA 1RV8A 2RFGA 1KTCA 1LCOA 3GYEA 3NA8A 2V2DA 4LVDA 2H6RA 4QIUA 4R33A 1GT8A 4O13A 4Y9AA 2YR1A 2GQAA 4QISA 4O1AA 1DOSA 2J88A 4TMBA 1J2WA 2RKXA 3WJYA 1LBFA 2QAFA 3MP3A 3IGXA 2ATMA 4QSHA 3DXIA 4FXSA 2A7PA 2I1OA 3BV4A 1ONRA 5G4WA 3LTSA 4MLJA 3P84A 3O6DA 4O0KA 4WXZA 4Z0JA 4MFDA 3KXQA 2V2HA 3V1PA 2ISWA 4DF1A 4OU1A 1XKYA 3DKLA 4AEOA 4O53A 3T44A 1BEUA 4UTHA 4NUWA 1SFLA 5KZEA 4HHPA 3WK0A 5EBUA 4LTSA 4X22A 4IPIA 4A29A 4U4MA 1I2QA 1F7BA 1VS1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TW9 A;  4GYJ A;  4O4V A;  1PYM A;  1G01 A;  6TIM A;  4MGG A;  2HWG A;  3TOY A;  1CXH A;  4GO9 A;  3QMS A;  4KEZ A;  1E6N A;  1PAM A;  4PMN A;  3AOF A;  3F4W A;  3T08 A;  3TJI A;  5LHE A;  5K3V A;  1E71 M;  1WDP A;  2YFO A;  4JQA A;  4MB3 A;  2X16 A;  3ALG A;  3R58 A;  3FJ6 A;  2C1I A;  5I00 A;  1DJG A;  4M1R A;  3AML A;  2J9Z A;  3D3F A;  3ECQ A;  1LWH A;  3FJ4 A;  1Q8J A;  2WJD A;  2WVS A;  2C1G A;  1LRT A;  2ZX9 A;  3TZF A;  4B91 A;  6REQ A;  4PMX A;  2JEP A;  3T0T A;  1VYR A;  4WDX A;  1M03 A;  5EMU A;  2PCE A;  5F2I A;  1RCO B;  3A4W A;  4G7E B;  4U10 A;  3BOL A;  1UA7 A;  4ADS A;  8CGT A;  2TRS A;  1LBM A;  2VZS A;  3DH7 A;  1DTN A;  1M7P A;  2ZID A;  2OEM A;  3WCZ A;  2QEZ A;  2ICS A;  1Q2S A;  5DN1 A;  3GY1 A;  5AN7 A;  1V93 A;  4QS5 A;  1E55 A;  2Y89 A;  3M43 A;  3OYX A;  4NI3 A;  1LF1 A;  2WZT A;  3NZG A;  3RPM A;  3OZP A;  3DI1 A;  3TQP A;  2PU0 A;  3AJX A;  3UXL A;  1NOF A;  5AYB A;  4QJ4 B;  3HB9 A;  3FFS A;  4A4A A;  1FWA C;  4M8U A;  3L0N A;  1GOK A;  1NDW A;  4U33 A;  3DFS A; 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