5E93A

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with neq0071
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi strain cl brener
publication title Exploring Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Active Site Plasticity for the Discovery of Potent and Selective Inhibitors with Trypanocidal Activity
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 110
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 5e93A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5e93A01
4DELA 1K8ZA 2DZUA 4HSOA 2B0MA 4BK9A 1ME8A 5AC8A 3M5VA 4O11A 2Q3RA 4RLIA 4FNPA 2DZPA 1EWDA 2JKEA 4CNNA 1ALDA 3G1FA 3W72A 4LT9A 4ADUA 2Z0IA 2CZDA 3T55A 1JRCA 3L68A 2Z2UA 3G3MA 1XFBA 2FTPA 2BWGA 3PM6A 3UWUA 4ZMGA 5HUPA 4UFLA 1DQXA 2ZYFA 3GX9A 2ZZ7A 3DHDA 5DY3A 1VC4A 1QMLA 5TIMA 3S1UA 2QCNA 1H50A 5DCBA 2WKJA 2Z6JA 3DENA 3DU0A 1P5BA 3HJZA 3QH2A 3GVGA 2OT1A 3QPZA 3RLUA 4HNTA 4ZQCA 1EEPA 4WXZA 1MSSA 3KRUA 3TC7A 3F1QA 3N34A 1GZGA 1BWKA 1Z48A 1SO5A 5K9DA 3I7SA 4UIOA 5DCEA 2G95A 4N9BA 3CEPA 1T0OA 4K37A 2QCGA 3QFEA 3KVLA 3GIYA 5LHEA 3GDKA 3WK0A 1FCQA 3TMQA 5CG7A 3W1TA 3EKLA 2TMDA 2XFWA 3L5AA 3NQMA 3UWYA 3NQCA 4YWIA 3IIZA 1A53A 1P1XA 3W7OA 5F4WA 4ZQNA 2E6AA 3M9YA 4MPQA 4U4MA 5CZ0A 2VEIA 2GVJA 4KFPA 1B3OA 3LHZA 3W7NA 3LHWA 1GVRA 2A7RA 4PC8A 3W07A 3MHGA 1LP6A 4XTDA 5G1YA 1TB3A 1PCKA 2DJXA 4X3ZA 1AG1O 4P2VA 1RV8A 2VFIA 2ZTKA 3TAOA 2VFFA 5EA9A 1QNVA 3CHVA 1ME9A 3PC0A 4JTSA 3DKLA 2P1FA 4Z1DA 1VYSX 3TQKA 1FX6A 1N55A 1SW7A 5E1QA 1X6UA 4K8HA 3OEXA 1EUAA 1K3UA 3NQGA 4NJHA 3PBUA 1EP2A 2YX0A 4BF9A 3S0CA 3W1AA 3P80A 3OHIA 1TV7A 1JCJA 3FOKA 1LM1A 1KW1A 3ATYA 3TUUA 2YW4A 1YPIA 4AHOA 1VLIA 1VCFA 2VEPA 3R13A 3T7VA 4WY0B 1FXPA 4ZQRA 2A5HA 1E51A 4NJIA 1KFEA 1OF8A 4MOZA 3F03K 2QUTA 1FWNA 5DXYA 2G97A 5D2WA 3LGEA 4LUIA 3G1XA 2BLEA 3PBWA 4AMAA 1NF0A 2TPSA 3W1QA 4JX5A 2A6LA 4EF9A 4LVDA 3C4UA 5AHEA 1FWTA 4HT3A 2PC4A 3LTSA 3L66A 3LTPA 4MKNA 4AH7A 3IV3A 4N4QA 3KAOA 4UTMA 2QAFA 3MYPA 1TPFA 5HINA 2CLLA 3T44A 5G1TA 5BRBA 1XC4A 2GQ8A 2ISVA 3W85A 3W6YA 4X9SA 2OZ0A 1OX5A 1XDLA 3PBVA 3G1HA 2YXGA 4KFNA 2DZXA 3AJXA 3QRHA 1IIHA 3W74A 2NUWA 3GB6A 3RU6A 3DKJA 3HPZA 2YZRA 3THAA 3NA8A 4IUOA 3MHUA 5K3VA 4QITA 1OYAA 4NNAA 2V2CA 1TJRA 3V1PA 4O16A 2W6RA 4B5NA 3O05A 1K03A 1QOQA 3DH7A 1VHCA 4R7JA 3N9SA 3I7RA 2Q8LA 3Q37A 2HSAA 3MI6A 1YLVA 3PB0A 2EHHA 3A9IA 3M6YA 3GLCA 4O13A 1H62A 2V0TA 1VLWA 5FEWA 4QIUA 4LWWA 4JTJA 3BV4A 5G4EA 1I8JA 3PAJA 4UTTC 1JUEA 4PODA 3NDOA 4KFOA 1LRQA 1LTDA 3TA6A 5D2YA 1YXDA 1FUYA 4FNQA 3LTYA 2AQWA 1SZNA 3PG9A 4UTKA 5CKSA 3GXTA 2Q8ZA 3A24A 1TPB1 2J88A 4YL2A 4AXKA 4MJZA 3VE7A 2H8ZA 3MMTA 4OGZA 1O4UA 3CM4A 3LI1A 3HF3A 4WY0F 1H7PA 2B7OA 3O6YX 3C0JA 2ZBTA 1ZFJA 4DF2A 3QSRA 1H7NA 5FESA 4LV9A 4N4PA 1FDJA 3NGJA 2QCFA 3CT7A 2J27A 4UTTA 3RLVA 3B03A 4HHPA 2E6DA 1B57A 1KBIA 1TMHA 3G1VA 4UXDA 3W9ZA 2TYSA 1AW2A 1WXJA 3UZJA 1FCUA 1MXSA 4TMCA 4ZL1A 3SFKA 1NVMA 5LNRA 1JQXA 1TPUA 4CCDA 2WNQA 3HG2A 4ZQPA 2OMAA 1JR1A 4JX4A 2O7QA 3DI1A 3MUXA 1AK5A 1HL2A 2X1RA 4GUGA 5AHNA 3LHVA 2GOUA 2Y85A 2J9YA 3FJ6A 3QF0A 3TJLA 3UZ5A 5D04C 1QDSA 5D30A 1JCXA 3DFSA 3G1DA 1EA0A 1WYIA 1O95A 2ATSA 4FO4A 4HSNA 2NLIA 5DBTA 1YTKA 2PE4A 2WQPA 4O0KA 5AYXA 3I6RA 6ALDA 4DBEA 1EIXA 3EKZA 3CWNA 1AW1A 3L0GA 1IGSA 1YADA 3DGRA 4ALDA 4MUZA 3LRKA 3EX2A 3RF9A 1IF2A 2GPTA 3QZEA 3S1XA 3TNOA 1TRDA 1R2TA 2VEKA 3L2IA 3SSJA 3FKRA 5LKYA 3P5YA 2X1SA 4JIPA 4N9CA 2NWRA 5KMYA 3W7LA 3LV5A 1G7UA 3B8DA 1H1ZA 4R53A 2Y7DA 4FB7A 4O10A 1S5TA 3W7HA 3DAQA 1S3HA 3O63A 3P67A 4FNUA 4O12A 3NZRA 4LUJA 3EB2A 4GE8A 4L4LA 3TH6A 5BNKA 3W76A 2QR6A 4ML9A 3CWOX 3GAKA 4O14A 5FF3A 3TR2A 3PUEA 3UNDA 3LOTA 3LV6A 4E2DA 1DQWA 4I7WA 4NUWA 3ABSA 2RDUA 3E12A 3KVMA 2FQIA 2Y88A 1JCMP 2ISSA 3L67A 2ZZ4A 1RR2A 4MLRA 2HS8A 3GYEA 2J9ZA 1H5YA 3PBYA 4GUFA 3HO8A 1B4EA 2C18A 3NNTA 3LRMA 2YPIA 1O5XA 4Q4KA 5BW6A 4MJMA 3TCEA 4LV4A 3HG4A 2NX3A 2A1YA 5K4XA 2YCEA 4NZFA 4AWTA 3L0NA 4O18A 1D3GA 3NQ2A 1YTDA 2ZZ6A 3PSVA 3UWVA 3BLFA 4YCOA 2R94A 2VEMA 4QISA 4DBDA 4BWLC 2H6RA 2W0UA 4IGHA 1KM3A 4YXGA 5KTLA 5GVJA 5J5RA 4EVZA 3FJLA 4M19A 3I68A 4X22A 1TREA 3GDTA 4TMBA 1TYGA 4TX9A 5HWNA 4GBUA 3P82A 3HB9A 1F6PA 4JTKA 2BX7A 1G7VA 3C2RA 1UBSA 2C6QA 1VR6A 3LX9A 1SSGA 4K7YA 4NX5A 3QMSA 4NNCA 3CIWA 2YYUA 2C3ZA 3FYOA 3FYPA 4BI7A 1H1YA 3HPSA 3GDRA 1W3TA 2DORA 3V75A 1UUMA 3UWWA 4AB4A 4BI5A 3WK2A 3W3OA 4JTIA 4BWLA 5AC6A 4LRTA 5DLCA 3W2JA 3TK7A 3OVRA 2YFOA 2E1DA 2Y7FA 1FWSA 2Y7GA 3NR0A 6TIMA 4K36A 3G1SA 1SFLA 2B7NA 4CCEA 1QOPA 1TCDA 4I9AA 3MJYA 4M6VA 2VFDA 4FIQA 5U7SA 4JICA 3QW3A 1EB3A 1TPWA 1LOQA 4ONVA 1GG0A 4L4MA 1X8FA 2ZZ3A 1TIMA 4UCGA 3UD6A 3ZR4A 4Z1AA 1RD5A 1VCGA 4RJEA 3MYOA 1QAPA 1ZAJA 2A7PA 3S42A 1NAL1 1OFEA 3G1YA 1JULA 3VE9A 4XZ9A 1JQVA 1IXNA 3C2EA 5TQLA 3O16A 4UTIA 4LVGA 1LOSA 1M7PA 2CLIA 4FXRA 3NG3A 1KFBA 2P10A 1SW0A 4HPJA 4MZYA 2A6NA 2X16A 1P0NA 5F1UA 1K8XA 3BLIA 3W7JA 1T8XA 1GVQA 4DXVA 3ZFHA 4E2BA 5CPMA 1SSDA 2VFHA 4JY9A 3KXQA 3FIGA 4O4VA 5KSWA 1G4SA 1CX9A 1J2WA 1A50A 2C19A 5EMUA 3BPWA 4LW7A 1LRTA 4LVAA 3FEMA 2QJIA 3OVQA 3GXNA 4RXGA 5AYZA 1T96A 3WK3A 3QJAA 2ZRZA 1SR9A 2QJGA 1HFBA 1FCVA 2QAPA 1N7KA 1C29A 2DZSA 1L9WA 4NXSA 3ABOA 3CQ0A 4JTLA 4FNTA 1BEUA 1GTHA 3UXAA 4M7TA 4AEOA 5IBXA 3NQEA 4GUIA 2QJHA 1RQEA 3PB2A 3TU9A 5T26A 1VYPX 1VYRA 4FEZA 3U6WA 4UFIA 2PRLA 3NEVA 1UJPA 4NJGA 3STEA 3TSDA 5CPOA 4IMCA 4M6QA 2YSWA 4IPJA 4XBSA 3TMLA 5SWUA 5FEZA 2ZZ1A 3PULA 2CLFA 4M6PA 4M5PA 1DV7A 4WOQA 4DPQA 3Q94A 2Y6ZA 3OA3A 1SQ7A 2QDHA 1G4EA 4WJEA 2X1UA 3BO9A 3TDFA 2P0OA 3TX9A 4MIMA 1ADOA 1H61A 3FS2A 1OFOA 1Q45A 3W2MA 1GQNA 1OHLA 4WQ6A 1Z42A 3NOEA 4UTLA 1KM1A 3KVJA 1OK6A 4IMGA 2CWNA 1G4PA 4JTEA 4R34A 1MEHA 3C52A 3TFXA 5HMSA 3S1VA 4JS3A 3NPWA 2XN0A 3CLMA 2BXVA 3L0KA 5DCDA 3ZWSA 5LZLA 5HWJA 3CU2A 4Q32A 2CLMA 3C8FA 1ZENA 3HG3A 3EX1A 4FXSA 3HGRA 4WXYA 4GC4A 5CZTA 1VJIA 2FDSA 2OX1A 1A5CA 4PCFA 3C2VA 1W3NA 2C14A 2DJLA 2QCDA 3INPA 2WSYA 1XBYA 1KFJA 3QC3A 1TTQA 4ORMA 4NVTA 4ZQOA 2Z1BA 2ATMA 2HMCA 1W5OA 2RHGA 2V81A 5ABTA 5LNWA 1KBJA 3NM1A 1Q6LA 5F1VA 5K7JA 3P60A 2GUUA 1DL3A 3QYQA 4EIVA 2ALDA 3I65A 5AHIA 1X7FA 3GDMA 1MEIA 5CZJA 1UB3A 4ADSA 1D3HA 4O54A 2D73A 1AW5A 1OFQA 1DBTA 3OVPA 4FX7A 1A5SA 1RPXA 4DO5A 3VNDA 5C5YA 3NL3A 4GUJA 4O1BA 1K7EA 4MFEA 1F76A 3A5FA 3E49A 3UY7A 4IQLA 3E02A 3KHJA 2JGYA 3PWAA 4Y96A 2XN2A 5DXXA 1XDMA 2QCDB 2CLEA 3C61A 3WJZA 3IVUA 1OJXA 1I2RA 1CI1A 2QEZA 3QM3A 3JS3A 2ZRXA 2ZDRA 1Z44A 2WNNA 3GK0A 1XCFA 1QCWA 1L6SA 2Q3OA 3JRKA 3HGSA 1S5WA 3O6CA 3N73A 4NQ1A 4QSHA 5BMWA 1R2SA 4N02A 5I3FA 2AAMA 1PL9A 2HS6A 5HR6A 1V7YA 2JK2A 1G4TA 3NQ6A 3O8AA 1UASA 3I7QA 3M41A 3PS7A 4LC8A 1K7XA 1GTEA 2RH9A 3B05A 1HO4A 4LC6A 4FX8A 4JIQA 1QPOA 1PCWA 3FKKA 2ABBA 4AHPA 2A7NA 5DY2A 4Z0SA 1XUUA 3PR2A 5LHFA 3U2OA 2CW6A 3QQ1A 5F2LA 2R8WA 5I3HA 1GWJA 3CIXA 4CNPA 3A21A 2ZRYA 1OF6A 4JNMA 5HJLA 3C3NA 3ATZA 3S1WA 3STFA 1HUVA 5MHBA 2ZRWA 1IXQA 4N6FA 4JGDA 4ORIA 3S5ZA 4HNUA 3GDLA 1EX5A 1YPFA 3N9RA 1MEWA 2H3BA 1H7RA 4K8EA 3W71A 1KFKA 4H3DA 4I7UA 4A29A 5KZMA 1KTCA 4Y9AA 4GUHA 1QWGA 3QMRA 4BI6A 2A0NA 1LBLA 1XXXA 3STCA 3R5EA 1F05A 4N6EA 3B06A 1DJNA 4HN4A 2PURA 3TE9A 2CLHA 3BG9A 2KZHA 2QCEA 1WA3A 4M7SA 3E96A 2A4AA 4OV9A 3OBKA 3TQ0A 3MHFA 3ZWTA 1PS9A 3LCXA 3LHTA 4PL2A 3NQVA 1KM2A 3L9CA 3VCRA 1TJPA 5EYWA 2E09A 2J9XA 2ZFAA 4D2JA 5LGXA 3UY8A 4LOCA 2R91A 2A21A 3BARA 2OJPA 3NL6A 3TSBA 4Z08A 4DEFA 1TO3A 2NXIA 3T4CA 1LZOA 3SGZA 3MP4A 3GKFA 5G2HA 3W7EA 4CQ8A 1WV2A 4WOZA 3S6DA 1I2NA 4TU1A 1FCBA 5DN1A 2FPVA 4RZ4A 3HOJA 3SW6A 3DZ1A 1QO2A 4X2RA 3LDVA 4HNNA 3CB8A 3G0UA 1LRNA 2G5WA 1LOLA 3W2UA 2EF9A 3P74A 3WFAA 2NZLA 5FF2A 1C9DA 5K4ZA 2FFCA 3B0PA 1R47A 1G6CA 1Z41A 1ZAHA 3W83A 3HGOA 1KLZA 5HQEA 4O1AA 2XN1A 3UQNA 3EWYA 1EP3A 3G18A 2GJLA 4O52A 1H63A 3O6DA 2I1OA 1WQ5A 3BG5A 4GRSA 1JUBA 1WBHA 5D2TA 5DELA 3M5YA 3QEZA 5FF4A 5E0KA 3GAYA 4GWEA 3W1XA 3HGJA 1THFD 1Q6QA 2NX1A 2V2HA 4DO4A 3EWWA 2DZWA 4IXXA 3SECA 5D38A 2FB2A 1TV5A 5E93A 1TTJA 3G22A 5U4NA 4ICNA 4UNKA 1I2OA 4FNSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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