2HTM | Genus

Total Genus 74

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	74
sequence length	241
structure length	234
Chain Sequence	MDTWKVGPVELKSRLILGSGKYEDFGVMREAIAAAKAEVVTVSVRRVEGLLEALEGVRLLPNTAGARTAEEAVRLARLGRLLTGERWVKLEVIPDPTYLLPDPLETLKAAERLIEEDFLVLPYMGPDLVLAKRLAALGTATVMPLAAPIGSGWGVRTRALLELFAREKASLPPVVVDAGLGLPSHAAEVMELGLDAVLVNTAIAEAQDPPAMAEAFRLAVEAGRKAYLAGPMRP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Biosynthetic protein
source organism	Thermus thermophilus
publication title	Crystal structure of TTHA0676 from Thermus thermophilus HB8 rcsb
molecule keywords	Thiazole biosynthesis protein thiG
total genus	74
structure length	234
sequence length	241
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date	2006-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05690	ThiG	Thiazole biosynthesis protein ThiG

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2htmA00

3L21A 4XBSA 4K36A 3ABQA 3W84A 4LUIA 4EF8A 2Y70A 2WPBA 5F2GA 1JCYA 3A22A 1TQXA 2Y6ZA 4RZ5A 1OK6A 2Y7DA 4R53A 2HS8A 3DFOA 4UTWA 4BWLA 1K8ZA 1LBMA 1ZHAA 5D2VA 2QAFA 5F4SA 3W73A 4DF0A 1GVQA 4IJBA 4WX2A 3DENA 1PVNA 3OVPA 2QJIA 1FDYA 3NQVA 4EIVA 3NYZA 3M43A 3N9RA 4L4MA 4HHPA 3SW6A 3TA6A 4KFPA 5EPDA 4E2BA 2NWRA 3GKAA 3IIPA 4LC6A 4WXYA 5LSMA 5L9FA 2RKXA 3DFSA 4N4QA 2J9YA 1SFLA 4X2RA 1VHNA 2OT0A 4MPQA 2NUXA 4Z1CA 2J9XA 1J4EA 1RZMA 1I2QA 3M1ZA 3ZR4A 2W6RA 3CIWA 1LRTA 4X9SA 5KITA 3BVJA 1DHPA 1GWJA 4WY0B 1I2NA 5K9CA 4O14A 4UFHA 1OJXA 3P82A 3NPUA 2ATMA 2XN1A 3LV5A 1TO3A 2ZTKA 3GXNA 4JNMA 3LTYA 3EWZA 3HG5A 5CSRA 4O4WA 5G4EA 4NJIA 2LLEA 1TTQA 2J6XA 1ZAHA 2WSRA 3W1UA 3OVQA 3Q37A 4HNNA 3PAJA 5LHFA 2VEMA 1SQ7A 5AHMA 3MO7A 2QCDB 3MYOA 4NVTA 5EMUA 5KTLA 3PG8A 3A5VA 3O1NA 2B7NA 1OVDA 4DXVA 1H50A 2OCZA 3NG3A 4JTFA 1TSIA 2H3BA 5DELA 1TRDA 3BW2A 3UXAA 4HSNA 1PCKA 3STEA 1S5VA 1FWWA 1KLYA 1KTCA 1OYBA 3VFLA 2Z2UA 2V8ZA 3GNDA 5I3FA 1PHWA 3W2JA 3NEVA 1I45A 4Z0SA 3W70A 3E96A 5CG7A 3TMLA 5C5YA 3DZ1A 4UNKA 3OVRA 3QQ1A 1RVGA 2NV1A 3L2IA 5E0KA 4FNTA 3B4UA 5F2MA 2RDWA 4YMZA 3TNOA 3BGGA 3EEGA 3TW7A 2B7QA 2YR1A 4DEFA 4JY9A 3TJLA 3LHYA 4C1KA 3LB0A 3MP5A 4O28A 4ICNA 2NV2A 2VFGA 3C2OA 1TTJA 3CQ0A 2QCFA 2OJPA 3W22A 5FF0A 2Y7EA 3THAA 5D04C 4TO8A 5D2TA 2PURA 2A5HA 5K7JA 4IUOA 1AL7A 4LS0A 5F2LA 1TV7A 5CKSA 2FB3A 3WK2A 1FXPA 3UWQA 1TPDA 3NZ1A 3S5OA 4DO5A 4UFKA 4Q33A 1LROA 5D05A 3TKFA 1QO5A 3TFCA 1U83A 1ZFJA 4JGDA 3IVTA 3S9YA 4E0CA 4ADTA 3RFAA 3GZ3A 3W7KA 3CWNA 4MZYA 1K8YA 3BARA 3L0KA 2ZRWA 2VXNA 3TU9A 3IEBA 1MXSA 5CGQA 3CLMA 3S6DA 5G2WA 2BSLA 4Y6GA 2FPTA 4IMCA 3LHZA 1OABA 1VLIA 1H61A 2QAPA 2VEKA 3TROA 2GJNA 5G1YA 3WJYA 1QPOA 4HKPA 3W71A 3E9AA 5F2IA 2YW4A 3JS3A 2CZFA 3W1NA 3W3OA 2G95A 2V2CA 3G24A 4LVBA 1LBLA 1SR9A 5LNRA 2E68A 2H8XA 3G1DA 2IQTA 3NOEA 4NU7A 1X1ZA 3W7RA 1PV8A 3LRLA 3R13A 3A5FA 2X1TA 4DPQA 2VEPA 4Z1DA 3LRKA 4ADSA 7TIMA 1LP6A 2GVJA 3LBMA 5D38A 2P10A 3P60A 1Q6LA 5C55A 4FXSA 1Q3NA 1FCBA 3GKFA 3DFQA 2XN0A 1FCVA 2Q3OA 3PBUA 4FIRA 2BLEA 1EB3A 2ZCGA 4JDYA 1VJIA 3LTSA 1QNVA 3IRDA 1JR1A 2BZNA 1WOAA 1CX9A 5HUPA 1OG0A 2VENA 1R2TA 2QDHA 1I8JA 1KFJA 1AK5A 3H54A 2FDSA 3NQ8A 5HJLA 1ADOA 1JCNA 1B9BA 3MI6A 1Q6OA 4BFAA 4ML9A 1UB3A 4IX0A 5HUOA 3DKLA 2QCHA 1LOLA 3LTPA 2ZYFA 1PE1A 1FCQA 1SUXA 4NZJA 4UMBA 4AH7A 1WBJA 2WQPA 4DF2A 2NWSA 2E6FA 4MLJA 1OFRA 1AMKA 5A8GA 3D0CA 1B57A 2A21A 1B3OA 3C2VA 1SFJA 3T55A 2F84A 1JVNA 3LCGA 4N9BA 3IGUA 4O1BA 1ME7A 3KFTA 3S1VA 3FJ6A 3BG5A 3DGRA 3QQ0A 5BRBA 2YYTA 2EAWA 3W1QA 4UTWC 4N6FA 4BWLC 4Z08A 1LYXA 4K39A 1IXOA 5I3IA 2DZVA 1VGAA 4O13A 3W1RA 2Y88A 3PF3A 1P0NA 3EX6A 1TTPA 3ZWSA 4LTSA 2ZRUA 2NUYA 4IGHA 4Z1BA 2I1OA 1XUUA 1X7FA 4JTUA 2FQIA 1WAUA 1W54A 3W2KA 2GQ8A 4YCOA 5F4XA 5EY5A 3CEPA 3ABRA 4YCPA 3KRSA 3W7JA 3B0UX 4YWIA 3HJZA 4JX5A 1EIXA 3A24A 5DN1A 3N2MA 3V75A 3QZEA 5D32A 1KM2A 2A7NA 2Y63A 3LXAA 3QEZA 1O60A 1DOSA 3C6CA 1Z41A 3HGSA 1VYRA 5T26A 3W7QA 1TMHA 2EF9A 3O07A 3I65A 4M7TA 2TYSA 3S42A 1GG0A 1KM6A 5LGXA 1KM3A 4MFEA 3V1PA 5DBUA 3L0GA 4O17A 1Z48A 4GRSA 1H7OA 4RJEA 4YL2A 2FPYA 4UUIA 3G1VA 2VFEA 2EHHA 3HO8A 1XDLA 3LM7A 3PSVA 1M6JA 1AW2A 4A2RA 4UIOA 4EWND 1VZWA 4JY8A 2WOQA 3W85A 3GDKA 3FOKA 2ZRZA 4CCEA 1RD5A 1IIGA 1OX6A 4FNUA 3FLUA 1HO1A 4QNWA 4RXGA 2R91A 1TV5A 4UR8A 4NXKA 4IXHA 1OF8A 1W1ZA 4JTGA 3VNDA 2V0TA 3W7EA 4UTKA 1FUYA 4DELA 4LC8A 3QMSA 2W79A 3KVJA 1J2WA 1HO4A 5CZTA 2BXVA 4UCGA 3M9YA 1FWSA 1EPXA 4GWEA 3GXTA 2VFFA 3Q58A 4UFMA 1OHLA 3VE7A 4S2CA 4MY1A 4BK9A 3N34A 2FTPA 2RFGA 3T7VA 3P84A 4AHOA 1VS1A 3U8GA 4IPJA 3L68A 4KKXA 1SSGA 2NLIA 3P5YA 1KA9F 4LNYA 4UXDA 1OYCA 3P74A 3PY2A 4LW7A 4QQ3A 3QMTA 3TQ0A 3GAYA 3AO0A 1XM3A 3GR8A 1LCOA 3UNDA 4R34A 4UTLA 1GOXA 4RK8A 2QUVA 4U28A 3QJAA 3RF9A 3NQDA 1ZAIA 4MFDA 4MZ8A 5TIMA 2PRHA 4HNUA 1ICPA 1CW2A 5AHFA 3EX2A 3PR2A 3HG2A 3PB0A 4LRTA 4UFIA 4QNEA 5AN7A 1XBXA 1QOPA 4XKYB 1A5BA 2YXGA 1W5OA 2ZZ5A 3O15A 1RR2A 3LI0A 2H90A 1VYSX 1FDJA 1T0OA 3W1XA 1F05A 5DXXA 1W5NA 4AAJA 3MMTA 1H51A 1L6YA 3UY8A 4X3ZA 4ZVJA 4AHPA 4BI5A 5BOOA 2QCEA 3L67A 5HR7A 1TPH1 1VLWA 4JS3A 1TPWA 1K7FA 1WDWA 2I14A 3PUDA 4WQ6A 3CT7A 1VH7A 1GYLA 2E6DA 4RR4A 3HGOA 1H1YA 1WA3A 1J5TA 3L0NA 3MUXA 3QPYA 5HWJA 3S5ZA 2E77A 3W7MA 3FYPA 1FXQA 3LLDA 3I68A 3W7LA 5K9XA 5LNUA 1IXQA 2CLMA 3HOJA 3HG3A 3G1HA 4FO4A 3BLEA 3ZWTA 3HG4A 3I7RA 1YPIA 3B06A 1DJNA 1SZNA 5AC6A 3PC0A 1WXJA 1C8VA 2O7SA 2ZZ7A 3M41A 3P81A 1ONRA 3DH7A 3NO5A 3JRKA 3WJXA 4OWGA 3WK3A 1MO0A 1KBIA 2KZHA 1UCWA 3B0PA 5D09A 2CWNA 1H63A 3HPZA 3KAOA 3GVGA 1FWRA 3G22A 3T78A 5CPNA 2Y61A 4FF7A 1ICSA 4QM1A 4Y90A 3TC7A 3OIXA 1F2JA 1R47A 4WUIA 1GTHA 5F1UA 1P5BA 2FFCA 2FLIA 4PA8A 4ZZ9A 5K4XA 4HPJA 3LHVA 3AJXA 1OFEA 1ZY9A 2V9DA 3BW4A 3EXTA 4LWWA 4GE8A 1BKSA 1GVRA 3RLVA 1HL2A 3NQMA 2B7OA 4HNVA 1TPB1 3W86A 3UXDA 4PCFA 3STFA 1GPWA 3ATYA 3MHUA 4MZ1A 4WY0A 3HPXA 1UASA 1EP2A 2B7PA 4UTHA 3KVKA 1R2SA 1S5WA 3TIMA 1DJQA 1PIIA 2ISWA 3CU2A 1I2PA 3G8EA 4UR7A 2XN2A 3F1QA 5TBOA 3QH2A 4RKAA 1NAL1 3PS7A 1JCLA 3MP4A 2J88A 4JX6A 3SR7A 1KFKA 1G69A 6TIMA 4P61A 3P8JA 5EA9A 5AHNA 5LZLA 5K9DA 4C1LA 2J9ZA 1D9EA 1QPQA 3FKKA 1X8FA 1W8SA 3GIYA 3GR7A 3EWUA 1VCFA 4QAIA 3M16A 4GBUA 3G1SA 3W76A 4IQLA 2GQ9A 5KZDA 3B04A 3KHJA 3DI1A 5G2IA 4NNBA 4AF0A 3L9CA 4DPPA 3C4UA 4OBTA 2RHGA 3QYQA 4RZ4A 1SO5A 1ZALA 5CSSA 3BPWA 5KSWA 1T8XA 4MIMA 2ZA3A 2PC4A 4KWVA 1SO3A 3KVLA 3IGSA 5DXYA 1UUOA 1VPXA 4Z0JA 1EP3A 2ZZ4A 1OFDA 1Y0EA 4G1KA 3NAVA 5FEZA 1I4NA 1MSSA 2YX0A 3ABOA 5EBUA 1KM1A 2DZXA 4GUFA 3BO9A 3UWWA 3LBCA 3QSRA 5BNKA 3S1WA 3MBFA 3P80A 2GOUA 1QPNA 2DZWA 2YSWA 1JCJA 1DORA 1X1OA 4EVZA 1TPVA 3M5ZA 5DBTA 4CLMA 2TMDA 4JTLA 2CZEA 2HSAA 4MLRA 3CPRA 3I7QA 2QCNA 2ZA1A 3WJSA 1VR6A 4K8EA 4O1DA 3CIXA 5DCDA 4Y9AA 1L2UA 1FY6A 3N9SA 1TJRA 3G1FA 5FESA 1GEQA 2ZRXA 2ISVA 3TW6A 4A29A 1ALDA 1UBSA 1GZGA 2NUWA 5F1VA 1P4CA 3LCFA 4OHQA 4GXMA 5AYZA 1TCDA 3EKLA 2HTMA 1Q6RA 3F4WA 2VKZG 3M5VA 4DBDA 2ZDRA 2CZ5A 2E5BA 4ALDA 4DO4A 4PTNA 1SO4A 1BWLA 1R46A 2V82A 4JTTA 3NL3A 1B4EA 2FIQA 4ZQCA 4O12A 1UJPA 3W1LA 5H2ZA 1AG1O 1AW1A 4CQ9A 4Y96A 3PUOA 4CNNA 4N6EA 3MWAA 3NGJA 4A22A 1NF0A 2QCCA 1LTDA 2NZLA 1A50A 1WOBA 4HPXA 4A21A 1WX0A 3BGJA 2YFOA 2QEZA 2B0MA 3LOTA 1Q6QA 5SWUA 3QPZA 5FEXA 1ZJIA 3M5YA 2NX1A 1FDZA 4XQ6A 4FEZA 4K6AA 1K7EA 1OFPA 4Z1AA 1K8XA 5H91A 3RLUA 5C2XA 3A21A 1LBFA 1R30A 2Y7FA 5CPMA 5FF7A 4OGZA 2E09A 3WJWA 2Z6JA 4JYFA 4LVDA 3W7NA 2C18A 3NR0A 5AB3A 4GFSA 1FWTA 4I9AA 4OV4A 3W74A 2R8WA 2VEIA 1W5PA 4N9CA 4ZL1A 4PH6A 1F5ZA 2E5CA 1VCGA 3NVTA 2BWGA 2V5LA 3EB2A 3EX1A 2NXIA 3SI9A 2CLFA 4RLIA 4TMBA 1YADA 3LXBA 4UFLA 4ORMA 3SIZA 5HWMA 3BG9A 5AC8A 1OFQA 4O19A 4FHAA 4WOZA 1JRBA 1KV5A 5D37A 3LCWA 2YGYA 2AGKA 3IIZA 1TIMA 4POCA 4JD4A 1H7RA 2E6YA 2CFFA 8TIMA 3FS2A 1XUZA 3Q94A 4MYAA 4LT9A 2C14A 3DHFA 3R89A 1ZNNA 3W7PA 4O4VA 3N14A 2WNZA 3UWZA 3SJ3A 2JK2A 2OT1A 2X2GA 4QJ1A 4O1CA 1H62A 3M0ZA 3W2NA 3TXZA 3JR2A 4S2BA 3TR2A 3VI2A 4K37A 1O94A 3RU6A 3W7OA 1C29A 1JULA 5HWNA 2Z1BA 4AVFA 2A1YA 3W7DA 4JEQA 1JCXA 3BLFA 2A6LA 3I6RA 4NZFA 3O05A 5AFDA 3P7YA 1H7NA 2EPHA 5LHEA 2V5BA 4O54A 2Y85A 3DI0A 2DP3A 1PCWA 3ANYA 4IPIA 2WO5A 2E5DA 3IIOA 4GUIA 5I3HA 4I7UA 5EKYA 3KXQA 1KW1A 1GVOA 2ZZ1A 3G8RA 2B4GA 2X16A 2H8ZA 1RQHA 4FX8A 1THFD 3C61A 1T99A 1W31A 3LX9A 1W3NA 4NJGA 3W9ZA 1FCUA 4NT0A 3MI3A 1S5TA 2I9EA 4ZMGA 3GXPA 4O0KA 3W7CA 4NQ1A 5CZSA 1VQTA 1Z42A 1H5YA 1LOSA 2A85A 2ZFAA 3U6WA 2G97A 5G1TA 1KM4A 2Y89A 3KVMA 1BEUA 4N2YA 3PBYA 3GAKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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