3TTQA

Crystal structure of leuconostoc mesenteroides nrrl b-1299 n-terminally truncated dextransucrase dsr-e in orthorhombic apo-form at 1.9 angstrom resolution
Total Genus 348
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
348
sequence length
1044
structure length
1036
Chain Sequence
GLRQDSNGKLRYFDLTTGIQAKGQFVTIGQETYYFSKDHGDAQLLPMVTEGHYGTITTAWVYRDQNNTILKGLQNINGTLQFFDPYTGEQLKGGVAKYDDKLFYFESGKGNLVSTVAGDYQDGHYISQDGQTRYADKQNQLVKGLVTVNGALQYFDNATGNQIKNQQVIVDGKTYYFDDKGNGEYLFTNTLDMSTNAFSTKNVAFNHDSSSFDHTVDGFLTADTWYRPKSILANGTTWRDSTDKDMRPLITVWWPNKNVQVNYLNFMKANGLLTTAAQYTLHSDQYDLNQAAQDVQVAIERRIASEHGTDWLQKLLFESQNNNPSFVKQQFIWNKDSEYHGGGDAWFQGGYLKYGNNPLTPTTNSDYRQPGNAFDFLLANDVDNSNPVVQAENLNWLHYLMNFGTITAGQDDANFDSIRIDAVDFIHNDTIQRTYDYLRDAYQVQQSEAKANQHISLVEAGLDAGTSTIHNDALIESNLREAATLSLTNEPGKNKPLTNMLQDVDGGTLITDHTQNSTENQATPNYSIIHAHDKGVQEKVGAAITDATGADWTNFTDEQLKAGLELFYKDQRATNKKYNSYNIPSIYALMLTNKDTVPRMYYGDMYQDDGQYMANKSIYYDALVSLMTARKSYVSGGQTMSVDNHGLLKSVRFGKDAMTANDLGTSATRTEGLGVIIGNDPKLQLNDSDKVTLDMGAAHKNQKYRAVILTTRDGLATFNSDQAPTAWTNDQGTLTFSNQEINGQDNTQIRGVANPQVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAATTTENHDGKVLHSNAALDSNLIYEGFSNFQPKATTHDELTNVVIAKNADVFNNWGITSFEMAPQYRSSGDHTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGFNTPTKYGTDGDLRATIQALHHANMQVMADVVDNQVYNLPGKEVVSATRAGVYGNDDATGFGTQLYVTNSVGGGQYQEKYAGQYLEALKAKYPDLFEGKAYDYWYKNYANDGSNPYYTLSHGDRESIPADVAIKQWSAKYMNGTNVLGNGMGYVLKDWHNGQYFKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Dextransucrase
publication title Functional and structural characterization of alpha-(1-2) branching sucrase derived from DSR-E glucansucrase
pubmed doi rcsb
source organism Leuconostoc mesenteroides
total genus 348
structure length 1036
sequence length 1044
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.270.10 Mainly Beta Ribbon left handed beta-beta-3-solenoid Cholin Binding 3ttqA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ttqA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 3ttqA04
1WKYA 2FH6A 1TVNA 3OGVA 4GI6A 3S6TA 3W29A 4GQQA 1WCGA 1ITXA 1KBKA 1WZLA 1CXIA 2A3EA 3VX1A 3BAIA 4MPKA 2JF7A 4KRTA 4H8VA 1JYWA 2WM0A 4PBGA 3PN8A 1VF8A 3AOFA 2CPUA 1E43A 4ZXOA 1CGXA 1E70M 5GNZA 1W9BM 2W4XA 2V5CA 1J10A 1C91A 3VUPA 1J0HA 4MB1A 1LLOA 3HU7A 3RDKA 3VD3A 3UR8A 1OIMA 4AZCB 3GM8A 1IV8A 3ARWA 1BTCA 4EANA 3ARVA 2E3ZA 1BYBA 3WUBA 3A47A 5EFDA 1J0KA 1E4NA 2WMIB 5I24A 2VURA 4ATLA 2GJRA 2PWHA 4M29A 1V6UA 1TA3B 4HZ8A 3PBGA 2V3DA 1HJXA 1HVXA 5C8BB 3PTMA 2X8RA 4FF5A 2ZX7A 1K9TA 4OIFA 1F4HA 5EMYA 4LQ1A 1ESWA 1JL8A 1QI0A 3RJYA 1W9PA 1UA3A 3VIKA 3EYPA 1E6XM 1MQRA 3MV01 4BZYA 5CPSA 5CJ5A 3MV11 3TTQA 1QNQA 2GDVA 4D71A 2ZUVA 2ZXQA 2VO5A 2VMFA 4MDPA 1P6WA 3U7VA 3VDBA 3OLDA 2XIIA 2ZUTA 4UOZA 2DQXA 5I3DA 1ISVA 4V28A 5I23A 3WF1A 2CKSA 1JXJA 3ARXA 5A6LA 4AWEA 2EPKX 4QFUA 1FOBA 2WKLA 3MSGA 6CGTA 3EDEA 3L4VA 2WBKA 2WVTA 3IAQA 2WWCA 4HU8A 5DT7A 4XV0A 3VIPA 3B9AA 3VOCA 3FY1A 4E8CA 1H0IA 4OBRA 4M56A 4GPNA 2WC3A 3SCVA 3BCDA 1J01A 2XHYA 1CENA 3NDZA 5IFPA 3WF2A 1H5VA 1A47A 2X1IA 3CTTA 4D6FA 4DWSA 2UY3A 4QLKA 1GORA 1E1EA 4H41A 1UYQA 1G5AA 3GBDA 4YHEA 4HPGA 3VO0A 3WMSA 2WLZA 1BF2A 3AICA 4TOQA 5A6SA 1H1NA 2G3JA 1MW2A 4HZ7A 5BWFA 3ARUA 3VMNA 5E6ZA 1JYXA 3K8LA 2OLHA 1JNDA 4PMNA 3KEHA 1EGZA 3RO8A 4W89A 1EO5A 5GNYA 3SUWA 3W6LA 3ZSSA 5A8QA 5KEZA 4AZGA 4CD7A 4BA0A 1JFXA 1UH2A 1FP9A 3W38A 1E6NA 1EA9C 4NC2A 1LF1A 3NYDA 5IHRA 3W0KA 4JCLA 1GONA 2VQTA 1QVBA 3GTNA 2VRKA 1W1TA 1OCQA 4LYPA 3HMCA 1I1XA 3MUAA 3MUZ1 1GPFA 1W1PA 3WH5A 1DWJM 4P7NA 3APGA 3VPLA 2WAGA 3WQ8A 3L4YA 3SCPA 1NOFA 2CNCA 4JIEA 1FH7A 5D9PA 1JDAA 1E6SM 3QHMA 1ISXA 1KWGA 2Y4SA 2J7BA 1Y7VA 4DWSD 1V02E 4PUDA 4U31A 5DEZA 4W5UA 1UD8A 4P7QA 4PYSA 2ZUWA 2VOTA 4LYRA 3QOMA 1E73M 1UWRA 4CU7A 1JNEA 4TX6A 2W63A 4OKDA 4PSPA 1K9DA 1GQJA 1J9YA 2GSJA 3L4XA 3WNPA 2WVUA 2GJXA 2D3LA 4YPJA 4JZ5A 3WBAA 1TUXA 5ABEA 1HJUA 3ARSA 2XVGA 3N12A 4CKQA 4MNLA 3GH5A 4L4OA 1CXFA 1OT2A 1UA7A 4UOQA 1ISYA 3DYPA 1JDDA 1VBRA 5CSUA 1LJYA 4QDMA 4WSKA 4AYSA 1W1VA 1UR8A 4V27A 1PAMA 2J74A 1W3LA 1Q6FA 3BH4A 2DSUA 4E2OA 5CSYA 3VKKA 3CZJA 3VX0A 1E3XA 2YJQA 3B9EA 3CUJA 1BFNA 1NOUA 1PZ2A 2FHCA 1BVZA 4H04A 1B3XA 1DWGM 2CYGA 1GCYA 2OSXA 1JF5A 6TAAA 3CO4A 3T2PA 4H8HA 4QLJA 4KRUA 2VZVA 3CBWA 4JKKA 5A6AA 3AXHA 2OYMA 4NZCA 2V3GA 3VGEA 2NW0A 2V38A 4IM4A 3UEQA 1V0KA 4M80A 1UR0A 4PTWA 3W6MA 3GXFA 3WD3A 4JKMA 3IJ7A 1QW8A 1JGIA 2X09A 1H2JA 1X6NA 3IJ9A 2Y8VA 2WCGA 3AMCA 3QR3A 3M46A 3GZAA 3UETA 4EAMA 3QHOA 2VL4A 3LMYA 4S3JA 4PN2A 1TMQA 3VDHA 3VD7A 1VJZA 1TVPA 1CGUA 4RE4A 1C8YA 1CXHA 1V6VA 5I0DA 1RPKA 4X9YA 1JD9A 3TTOA 2JFEX 1E5JA 1UKPA 1UR4A 1WDSA 1Q6EA 2VNCA 4HU0A 5IFTA 1PIGA 1UWTA 3AMLA 3WEMA 1EHNA 4Z2JA 4MB4A 7A3HA 1HCXA 4AYGA 4H7VA 3TOPA 3L4UA 2QHAA 2XPKA 2XG9A 2DH2A 3VIIA 1E6PA 3ALFA 3WD1A 4Z2GA 4MB5A 3TONA 2D3NA 2BVYA 4HA4A 5LA1A 1US2A 4AISA 1BG9A 1UR1A 3WH8A 2BY0A 4C7FA 3WDPP 1WE5A 1QHPA 2JEPA 2VYUA 1MW0A 5GNXA 4WJXA 1S46A 3AS0A 4AZ7A 5E70A 4F8XA 3AS3A 4V2XA 2NT0A 3L2LA 4GKLA 4HOXA 4AZIA 5M03A 2FH8A 3DHUA 3L2MA 2Z1KA 1XH1A 3BSGA 1D7FA 4QCFA 5A8NA 3OGSA 2YL8A 1GOOA 2OWXA 3IJ8A 3WH6A 1R86A 2W66A 1HKKA 1MWOA 1I1WA 1ZBWA 3BLPX 3VGGA 3ZJ6A 2IXVA 4GO8A 4YN5A 4IISA 2E9MA 4UR9A 1JZ4A 2EJ1A 3OLIA 3OLGA 2FHFA 2BMLA 4PRWA 4B3KA 3EBVA 3KL5A 4UFLA 1CGWA 3IAPA 4NF7A 5DF0A 4MNKA 2VVNA 3ZJ7A 3RIKA 1O7AA 1V3KA 4GZIA 1X6LA 4TVUA 4B15A 1LQ0A 4PTXA 5D9OA 1B90A 1UWSA 2QMKA 3MSDA 4UFHA 4ZE5A 4B3LA 4E8DA 4GI9A 1E72M 3MUY1 3ZJ8A 4AZ6A 3VGFA 1LWHA 1SR0A 1MQPA 2D20A 1HJSA 3AIWA 1JZ8A 2VX7A 2BY2A 3WEZA 2QV4A 5IXEA 3PZIA 3W25A 3AQUA 5M17A 5A6JA 1HJWA 5CPQA 2D23A 2J7GA 2J25A 1KQYA 1UKOA 1GJWA 4FLOA 2XWEA 2VZTA 1JI2A 3CUIA 2WZHA 2CITA 4XUYA 3ZT7A 1QI4A 3WKZA 1XYZA 3N18A 1UHVA 1GQIA 1GVIA 5D8WA 1V0LA 4WF7A 4PTVA 3A4AA 3PHAA 1F4AA 2ZE0A 2G3NA 3CGTA 2Z1SA 2XVKA 1NP2A 3ZR6A 5FL0A 5LYRA 1M7XA 1G01A 1H11A 2BHUA 4CGTA 3VIFA 1WPCA 3SCQA 3GH4A 3DECA 4UZSA 3GBEA 4ATDA 5A6KA 2NSXA 4CD5A 2EQDA 1PJ9A 3CHDA 4W5ZA 4CD4A 1TZ7A 1N82A 2WMHA 1ECEA 4TVCA 1XSIA 3A4XA 3NDYA 1UG6A 1HXJA 4ATWA 2QPSA 1OINA 1XSJA 3FAWA 3BMVA 3ARZA 4HTYA 1PBGA 3WQWA 4BQ5A 5I78A 4B16A 5BXRA 3FN9A 1E9LA 4AZHA 3EMZA 3VINA 5A2BA 1L8NA 1V3JA 4IPLA 4TXEA 1TE1A 1VEPA 2HISA 3WSUA 1J12A 1E5NA 5HPCA 2XVNA 1FHDA 1XD1A 2DT1A 4MNJA 2J77A 1PX3A 3CZGA 3AYRA 3GNPA 2W67A 2VI0A 1LL7A 3K4DA 2PWGA 2VTFA 1BQCA 2WBGA 3WH7A 1UKQA 4B9ZA 4AMCA 1JG9A 1NP0A 1HP4A 1GOKA 2UWFA 5ABGA 1B9ZA 4U2YA 1HP5A 2YA0A 4AD2A 2WMKA 1UD6A 3CIVA 1B2YA 1ISZA 4EK7A 1E6RA 1A3HA 1R87A 2C8NA 4UTFA 1W3JA 3F5JA 2XIBA 5A3HA 2DSZA 5GPRA 4U5IA 4UFIA 3LPOA 3WDJA 1QI5A 1B3VA 4P8XA 2FGZA 4UQDA 3ZSTA 2OYKA 2V04A 2UY2A 3WL1A 2J78A 4F9DA 3AHZA 1W9DM 1NWTA 3J7HA 1DEDA 4RE2A 2YBTA 1CIUA 3LPFA 2CKRA 2IXUA 2RGMA 1H4PA 4KH2A 1HKJA 1PEZA 4CVUA 5HPOA 3LPGA 2VCBA 2GVYA 3WY1A 4W88A 4AZBA 3GDBA 1UWIA 5E0CA 4ZE4A 1XRVA 3UG4A 2DSVA 2YKKA 4UFKA 3VILA 2GUYA 3VNYA 3UESA 4HP5A 1V6XA 4F9JA 4P7LA 2CBJA 2W61A 1KXHA 3BAXA 2V05A 2XFRA 5BRQA 3NIYA 3WNLA 2CXGA 3B9DA 3N9KA 4JHZA 3GXDA 1H09A 5ABFA 5CLWA 5M3WA 2IUZA 1UKSA 2YDRA 4Z2IA 3WD4A 4TVDA 4XZBA 2WHKA 3ZO9A 4L4PA 4W87A 4WLCA 2WB5A 4PCSA 2F61A 1DWFM 2AOSA 1K9FA 4A3YA 3WQ5A 1GQLA 3QOKA 1NWRA 1KGWA 2VCAA 2W62A 5IDIA 3SEPA 1B31A 1KGXA 4U2ZA 4JFTA 1CLVA 3D5HA 4GZJA 2J7DA 2ZX9A 4HA3A 1W2VA 1UD4A 4Z2KA 1ITCA 1OBAA 2D0GA 2QPUA 4OBSA 2OWWA 3CHFA 2WHLA 2UY4A 3I3BA 3II1A 4TUFA 1GNXA 1V6YA 1VB9A 3WNNA 2CHNA 3AS2A 2WLYA 7CGTA 1FFRA 4X36A 3BAYA 2CERA 1DHKA 1C92A 3U7BA 3AROA 4J27A 5A2CA 5A6BA 2YLAA 4R27A 3WF3A 3ZIZA 5I6SA 2YL9A 4U3AA 1VENA 2CCRA 5KZ6A 4UNIA 1AMYA 4GINA 2A3CA 4AD1A 1HF6A 2F6EA 3MS8A 2DIJA 4MAVA 4DM1A 3FHQA 2CIPA 4ZFMA 1TG7A 1NM9A 1GUVA 1UR9A 2GK1A 4MTVA 1QNSA 5AYIA 4TTUA 4CVWA 3ARRA 1NH6A 2ESCA 5AY7A 5EFFA 1AQMA 2VUYA 2F8QA 5E09A 1R7OA 4MNMA 4J3UA 3AIQA 3M6DA 3POHA 1V6WA 2BVTA 2VR4A 5I79A 3F5LA 4QLLA 4AW7A 1US3A 5ABFB 2OSWA 1OIFA 4H8UA 2Y24A 3WNKA 5I5RA 4W8BA 2V3EA 3WDQA 3BAWA 3JUGA 2J75A 2MANA 2A3AA 1QNOA 2E9LA 4OOZA 1VJSA 2TAAA 3W24A 1B0IA 4PMZA 1VIWA 4OOUA 2JALA 1R8LA 4JAWA 4ZENA 1Z32X 3AIRA 3FNDA 2O9RA 2XVPA 2ZWZA 3WDIA 1D2KA 4XX6A 1R7AA 2Q8XA 2XSBA 4JFSA 5FOOA 2F2HA 1GJUA 4W84A 2EPNA 3ARYA 2NT1A 5A95A 3FXYA 2J7FA 3VD9A 4GZEA 5A6BD 2VZUA 4X0NA 2YDSA 2GJPA 4DWSB 4M1RA 1GHRA 3S2CA 1CBGA 1VRXA 4AZ5A 1XHGA 1C3FA 1UD5A 1BLIA 4D6HA 3T08A 1DTUA 1PX4A 1QPKA 2CEQA 2FGLA 2X05A 3OLEA 1EIBA 1E6QM 4MAZA 1WZKA 3AYSA 1KXVA 1H8GA 4QAWA 1KCLA 5D9MA 2DT3A 4AEFA 1FHLA 1CDGA 1Q6DA 5E0FA 3T0BA 1UQZA 3NSMA 3OBAA 1JFHA 3VIHA 2WMFA 5AC4A 3AHXA 5DFAA 3RPMA 3OZOA 4PMVA 4UQEA 5E6YA 3UG5A 1G9HA 1E40A 3DYMA 2J8FA 3VM7A 4GO9A 1ZBVA 2O9OA 4XZWA 3BMWA 3ZM8A 2VC9A 2BHZA 4P7OA 2JIWA 2V5DA 1BSIA 1W3HA 5FL1A 4D6EA 4AY1A 2PI6A 1C7SA 4ACZA 3ARPA 3K8KA 1IT0A 2DEPA 3B8SA 3VU2A 5A1AA 3ZR5A 3RMEA 3VIOA 1V08A 2O9TA 1J0ZA 1U30A 2BXZA 2D0FA 5LA0A 4PTMA 3AIBA 3KL0A 4S3KA 3VMPA 8CGTA 2ZX5A 2WNWA 3WF0A 2D1ZA 3W82A 2XUCA 3EMCA 1MFVA 2QMJA 5D9NA 5BCAA 3BGAA 1V0NA 4DWSC 1OGSA 1BYDA 1ZU8A 2GJXB 4TX8A 3ZMRA 4W8LA 1LL4A 4BCEA 3WEOA 4CD8A 5F7UA 5I77A 2ZIDA 2J7EA 2WCAA 5GQBA 1IZJA 1G94A 2UY5A 3VM5A 4AIEA 4AD4A 5A94A 5A8OA 2WSPA 1YQ2A 1AVAA 3AS1A 2D0HA 1W32A 4HOZA 3I3DA 3MU7A 1WAWA 4PEEA 4Y7EA 4PMRA 4M8UA 2JE8A 4PCTA 2X8PA 3CZ8A 2BS9A 1HL8A 3DHPA 2QF8A 2ZUSA 8A3HA 1QNPA 5CPTA 3N11A 1HL9A 3AMKA 2PB1A 3AZRA 2XM2A 4GI8A 5CQ1A 4FK9A 1MYRA 3AXIA 1CTNA 2WCSA 3WF4A 1M53A 2PWEA 3VGHA 4JCMA 4CU6A 2XJ7A 2ZX8A 1WDRA 5AYBA 3AMGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WKY A;  2FH6 A;  1TVN A;  3OGV A;  4GI6 A;  3S6T A;  3W29 A;  4GQQ A;  1WCG A;  1ITX A;  1KBK A;  1WZL A;  1CXI A;  2A3E A;  3VX1 A;  3BAI A;  4MPK A;  2JF7 A;  4KRT A;  4H8V A;  1JYW A;  2WM0 A;  4PBG A;  3PN8 A;  1VF8 A;  3AOF A;  2CPU A;  1E43 A;  4ZXO A;  1CGX A;  1E70 M;  5GNZ A;  1W9B M;  2W4X A;  2V5C A;  1J10 A;  1C91 A;  3VUP A;  1J0H A;  4MB1 A;  1LLO A;  3HU7 A;  3RDK A;  3VD3 A;  3UR8 A;  1OIM A;  4AZC B;  3GM8 A;  1IV8 A;  3ARW A;  1BTC A;  4EAN A;  3ARV A;  2E3Z A;  1BYB A;  3WUB A;  3A47 A;  5EFD A;  1J0K A;  1E4N A;  2WMI B;  5I24 A;  2VUR A;  4ATL A;  2GJR A;  2PWH A;  4M29 A;  1V6U A;  1TA3 B;  4HZ8 A;  3PBG A;  2V3D A;  1HJX A;  1HVX A;  5C8B B;  3PTM A;  2X8R A;  4FF5 A;  2ZX7 A;  1K9T A;  4OIF A;  1F4H A;  5EMY A;  4LQ1 A;  1ESW A;  1JL8 A;  1QI0 A;  3RJY A;  1W9P A;  1UA3 A;  3VIK A;  3EYP A;  1E6X M;  1MQR A;  3MV0 1;  4BZY A;  5CPS A;  5CJ5 A;  3MV1 1;  3TTQ A;  1QNQ A;  2GDV A;  4D71 A;  2ZUV A;  2ZXQ A;  2VO5 A;  2VMF A;  4MDP A;  1P6W A;  3U7V A;  3VDB A;  3OLD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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