3CUIA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylotetraose
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
total genus 133
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cuiA00
3W37A 3WQ8A 1H49A 4UQDA 4OKDA 1BG4A 1AMYA 2WB5A 5A6MA 1WAWA 4W85A 1KWKA 3SUUA 4BQ5A 2YL8A 4ZE5A 3WH8A 1FHLA 2XWDA 1KQYA 2CHOA 1IZKA 1QI3A 1LWJA 4H2CA 4JKMA 3DYOA 1UOKA 4KGLA 1HKJA 1KWGA 1B9ZA 2J25A 4EE9A 1W9DM 1ZBCA 5BRPA 3LPGA 4ZFMA 1F4AA 1HX0A 1QNSA 3UG3A 2CBVA 4J3VA 1OCQA 1AQMA 1B0IA 1HKIA 3VMNA 4CGTA 5A2AA 4UTFA 4PMNA 1GQIA 3CBWA 2HVMA 2G4FA 4W5UA 3QOMA 2WLZA 1JYVA 4AZIA 2XG9A 4GI8A 1JL8A 3K8KA 1HL8A 2J78A 4H7VA 2X09A 5E9AA 3WY1A 4MB4A 3MS8A 2X2YA 4P7NA 4PMQA 3QHOA 2UY2A 3CHCA 1WZKA 1JGIA 1MYRA 4H8HA 2GJPA 2IUZA 3EDKA 1EH9A 3WN6A 1I75A 3AHTA 4HP5A 3M6DA 3GXDA 2VVNA 2V3FA 1MW2A 3FHQA 3RM9A 1B1YA 3KE0A 4MAVA 2X0HA 1N82A 4W7VA 1E43A 2BHYA 1HJVA 2B31A 2DIJA 3G6MA 4DM1A 4Z2JA 4D72A 1E0XA 5ABGA 2CYGA 5A69A 2V38A 5I6SA 3WBEA 3AIQA 4KWUA 3U5YA 4ACZA 1BGGA 5A6BA 3NDYA 2J7HA 1GOMA 1E4LA 3SCRA 1DTUA 2J4GA 1JNDA 3VU2A 3DECA 3WH5A 4EANA 1LQ0A 2IXVA 5JIWA 4U31A 1XH2A 1TVNA 4QLJA 3SCPA 1V0KA 4CUCA 3WNOA 3WNKA 1UKOA 3ZR6A 1UR8A 2A3CA 2XYLA 1J18A 2EPKX 2G3IA 5HBFA 2VR4A 3WEOA 1WZLA 2DGAA 2D3LA 4KRUA 5CQ1A 2BY2A 3AXHA 1HP4A 2PB1A 2WZIA 3IAPA 3WD2A 1XH0A 3AIUA 1C8XA 2HISA 3FN9A 3B9DA 3AHZA 1GOWA 3UG5A 3WDPP 3PZMA 4AD3A 3EMZA 2JEQA 4XX6A 3AS2A 3B9EA 4UR9A 5D9OA 1JFHA 2QPSA 2VZVA 1Q4NX 1J0HA 2XGBA 2FGLA 4JL1A 1RPKA 3EDDA 3K4DA 1JD7A 2WXDM 1HKKA 2CETA 4D71A 1UKTA 1ODZA 2AMGA 2ZICA 1UKSA 4B3LA 3N15A 4GZIA 2E9LA 1FP8A 4V2XA 3VIIA 1UQZA 1A3HA 4PMDA 1O6IA 1GQLA 1QNQA 1E3ZA 5FOOA 3U7BA 3ZQ9A 3T2QA 4GPNA 1V3MA 4F66A 5D8WA 2VQUA 3AZTA 1NWSA 4OJYA 3PTMA 2J74A 3IANA 3VX0A 2G8ZA 2WBGA 1JI1A 1B3WA 2DEPA 1EHAA 3A3HA 5LYRA 4MDPA 1CENA 1EO5A 2XVKA 4LYQA 1LLOA 2VNCA 3VINA 4X9YA 4H8UA 4YHGA 1FH9A 5IHRA 1ISXA 2G41A 3MV11 4PCTA 5M17A 3VIOA 3WBAA 4XZBA 1UWTA 3PZQA 3MMUA 1XD1A 3GNPA 2NSXA 3EBVA 1BVNP 1QI2A 1W3JA 4R5EA 1JYNA 1NWUA 3POCA 1E15A 2WVUA 1GOOA 3OLDA 2XVGA 4FF5A 2W91A 4B16A 1JIBA 1EIBA 1J0JA 3SCTA 3FNDA 4PCSA 2VT0A 2G3JA 3QHMA 4PMVA 3E1F1 3ARUA 2XVNA 4FLRA 1ESWA 1QW9A 2WMIB 2DH2A 1K9DA 1RH9A 3VIKA 2E40A 1E5JA 4BS0A 2WVVB 3BH4A 4HMDA 1NP2A 3CTTA 3BSGA 1W9PA 3GYCA 5FKYA 4ZE4A 4HOZA 4UQ9A 4CD6A 4BA0A 1IZJA 1J0KA 4UQEA 5AC5A 1OD0A 2J7BA 3AROA 4LYRA 3WQ4A 2WK2A 2D24A 1B3YA 4GINA 4JIEA 2YL9A 5TD4A 1KXHA 5A6SA 2ZWYA 4PMRA 4X0VA 3AIVA 3VM5A 1TZ7A 1PIGA 1B3XA 1KBBA 4TVCA 2BHZA 4LXFA 3POHA 2VURA 1WO2A 1R87A 3L4VA 3WMSA 3AIBA 2WSKA 1B3VA 4LQ1A 4U3CA 1C7SA 1ITXA 2G3MA 4TTGA 3THDA 3KEHA 3OGVA 3RJYA 1VBUA 4JKKA 2OWXA 1GOKA 2WHMA 4Y7EA 5HNNA 4PMOA 3GXMA 3ZJ8A 5A6AA 4AZ7A 1E9LA 2E9MA 4PTVA 3RCNA 1QNPA 1UWRA 2J7GA 2XIBA 3II1A 1UR1A 1VEPA 3TOPA 5I24A 4J28A 3VIJA 3MSGA 3NJ3A 4R27A 3WF4A 4PTMA 1NQ6A 1GJWA 2ZUWA 1E40A 1U2YA 3W27A 3ZJ7A 2CXGA 3CZEA 3HU7A 1PIFA 2YDSA 5CPTA 5CSUA 2W67A 1V03A 3CH9A 4B3KA 2VZSA 1KR1A 2CBJA 3O6AA 3K46A 2WMKA 1B31A 4W89A 5DO8A 1E4NA 1B3ZA 2WW5A 1VFOA 3CMGA 4WLCA 4ZEPA 1CBGA 3B9AA 4MNKA 1VEMA 3MU7A 1G0CA 5IFPA 4MJ4A 2W4XA 3IJ8A 3GH4A 1UQYA 1KFWA 3SCQA 1V6WA 3WMCA 1L0PA 2CIPA 1EDQA 4JL2A 2WZEA 3WNLA 3PBGA 3ARPA 1ZB5A 3S6TA 3EYPA 3WL0A 1VBRA 3VVGA 1KGXA 1V6UA 1FP9A 4PMUA 2DSKA 4AEEA 2QV4A 2D0GA 1HVXA 1E5NA 2A3BA 5A2CA 4GZEA 3ZO9A 1EQPA 1BYBA 1J10A 3TTSA 1KGWA 2PBOA 3AYSA 1W1TA 5I2UA 1MQPA 4AD4A 3UR7A 2GK1B 3ZJ6A 4CD7A 5EB8A 1WE5A 2CESA 2WPGA 5KEZA 3FHAA 1G5AA 2VRQA 2EPMX 4E2OA 1TFVA 1J0ZA 2O9PA 5A8QA 1XYZA 5ABFA 2D20A 9CGTA 4Z2IA 1H1NA 4W93A 2WC7A 4E4PA 4XB3A 5BYWA 2D0HA 3AQUA 1G94A 1E6RA 4AZCA 1W2PA 3ZM8A 2DSZA 4N42A 1GNXA 1HXJA 2W63A 2Y2WA 1US3A 2JF6A 3KL5A 1ZBWA 3AI0A 3AFBA 1FFQA 1W9BM 1GZJA 1V6XA 3WH9A 4GIAA 5A6LA 1Y7VA 4RE2A 4WKFA 3VGGA 5DEZA 3DHPA 3VIHA 4B9ZA 1R8LA 4WSJA 4M8UA 4PUEA 3BAKA 2BVDA 3PZUA 1XSIA 2EPLX 5CZKA 3CZKA 1HNYA 4AYSA 3WFZA 5ABFB 1UKQA 3AMGA 1XGZA 2W92A 5CPQA 3D5HA 1A47A 1CTNA 4HPGA 4ML4A 4PTWA 4QFUA 3VKKA 5A6KA 4XUYA 1TUXA 1BYDA 1OGGA 4AZCB 2VX6A 2BY0A 1QVBA 1R85A 2UY3A 5CG0A 3UERA 1W9UA 3CHDA 3WQWA 1QNRA 3CZGA 1US2A 4HOWA 5D4YA 4DWSD 3ARRA 4Z2HA 2J79A 4D6EA 4DM2A 4J3TA 2V3EA 3N04A 4JCMA 3SCWA 2Z1KA 3SCOA 2C8NA 3ARYA 4AZ6A 2GJXA 5E0CA 4AY1A 4MPKA 1M03A 4ZXOA 3SURA 1TA3A 1BGAA 3DYMA 3CIVA 4U2ZA 3UG4A 1MFUA 1W1PA 3ARTA 1Q6CA 1CWYA 2VX5A 2YBUA 2CCRA 3CZLA 1GJUA 1LWHA 1V6YA 4CCCA 1QI4A 2GJRA 3BAIA 1JDAA 4LYPA 3BAXA 5LA2A 3WDHA 1V3LA 2VJXA 3T2OA 3WFLA 3G6LA 2EBNA 1VB9A 2VI0A 1LG1A 2VO5A 3WSUA 4F9DA 4D6DA 3T2PA 1HJQA 5AC4A 4Z2KA 5AYIA 4JKLA 2ZUUA 2WVSA 3VOCA 3WF0A 1V02E 2JIEA 3F4VA 3CGTA 4DWSC 2VRJA 4F8XA 1V3KA 1QHZA 2GSJA 1JFXA 1QI0A 3TTYA 5I23A 4D6FA 1WZAA 3N12A 2GJXB 3S2CA 2WHKA 1CGUA 3WDRA 1TA3B 4E8DA 3VDAA 1M04A 1OGSA 2JIWA 1UWUA 5A8OA 1CZ1A 3CUFA 3O2LA 4WJXA 3RM4A 7CGTA 3RM8A 4MNMA 2EPOA 4W87A 2XWEA 1DEDA 2E9BA 3ARVA 3SEPA 4UQCA 4QLKA 2BS9A 1C92A 1TMQA 1BF2A 2OWCA 4U2YA 1HIZA 3W4RA 2QHAA 3QOKA 1UR9A 3AXXA 2ZX8A 2C7FA 3DHUA 3A4WA 1HN1A 3RIKA 4NSBA 1V3JA 2J7DA 4UOZA 4S3KA 1JAKA 1EGZA 1JF5A 1GUVA 4ATDA 2Z1SA 1JXJA 2IXUA 3W38A 3MUAA 1VAHA 3BLKA 3HN3A 4MB5A 2CEQA 1CDGA 4ACYA 2PWGA 2Y8VA 2ZXQA 3TONA 1JDDA 1Q6EA 3VD7A 4EK7A 4OOUA 3AS0A 4HPHA 3ZMRA 3RJXA 4TX8A 5JBEA 3WQ5A 2ZWZA 2GDVA 3BMWA 4M24A 3GNOA 1TR1A 3VX1A 1X6LA 1UYQA 2CITA 2OSYA 3MMWA 2CBUA 2A3EA 2G3NA 4WKAA 1V3IA 3WNNA 3UESA 1EQCA 2PWFA 1MQRA 2XM1A 4CVWA 3TP4A 2VL4A 3CUJA 4WKHA 3GM8A 3N13A 3BAWA 1J0IA 2UY5A 1H11A 1V6VA 2GDUA 3PZIA 1PPIA 5IHSA 2TAAA 5BRQA 3LMYA 4CVUA 2YDRA 5A8PA 3OIHA 4UFLA 4J27A 2YL6A 1G01A 2WKLA 5BROA 4NI3A 1XC6A 3OG2A 2NT0A 4WF7A 1VFUA 2JEPA 1KXVA 3W28A 4UNIA 5A94A 4JCLA 2GVYA 4UQAA 4BQ2A 3PZ9A 1UD6A 1R7OA 1SMDA 5I78A 3MANA 2J77A 1CLVA 4AXNA 1OIFA 1XSKA 3VIGA 4OIFA 4W86A 5BCAA 3EDFA 3LPOA 2ZUTA 1OINA 4AZ5A 1Z32X 4GKLA 4U5IA 2Y5EA 4M56A 3AZSA 6CGTA 3VD4A 4TVUA 3WNMA 3ALGA 4AD0A 3WUGA 4TXEA 4F79A 4URIA 2BXZA 2FH6A 2YIHA 1KBKA 3M07A 1TVPA 2D0FA 2CERA 3K1DA 4TUFA 3UCQA 3K8LA 1K9EA 1XRVA 2VVSA 4B9YA 1KCLA 2XFYA 2WMIA 1R7AA 3ARWA 1OBAA 1GCYA 2F2HA 3EMQA 2WVVA 4AZHA 1W9VA 1JAEA 3W24A 4NRRA 2EEXA 4P7QA 2VOTA 5CXPA 4Q22A 1CGYA 4YHEA 1K9FA 4HOXA 4H04A 4PUDA 2XSAA 3WIJA 1E6ZA 3NUKA 3FAWA 4P7RA 1XCWA 2F61A 5M03A 1OD8A 2X05A 1JZ7A 2BVTA 1E73M 5HPOA 4CN6A 3AHXA 2V3GA 2E4TA 4L4OA 5F7UA 3HMCA 3MV01 4YN5A 4D1IA 1UZ1A 2WMJA 3PZNA 3I3EA 4CKQA 5FL1A 5CJ5A 2WLYA 5HXMA 2YBTA 1CXIA 2J7EA 4RE3A 5C70A 4MTVA 1V0MA 1TG7A 1OWQA 1JDCA 3CUGA 4M1RA 3UETA 2CBIA 3PZVA 4NRSA 6A3HA 1K6AA 2YOCA 4FMVA 2PWEA 4DWSA 1UZ4A 2YL5A 4AC1X 4D6GA 1GOQA 4MNLA 1UWQA 3VM7A 2VUYA 4PMYA 3EDEA 2PBGA 5JBFA 1UHVA 1QBBA 4WIWA 3VUPA 5EBAA 4GQQA 1NOWA 1UH2A 3W6LA 4C7GA 1B2YA 1UWSA 1VIWA 1EOKA 3GZAA 1UH4A 5AYBA 1GONA 4MDOA 1RD6A 1BYAA 3WL1A 3WF3A 1KXQA 1CGWA 1JYWA 1ITCA 1QBAA 1J12A 4J3XA 3BXWA 2ZX5A 1CXHA 1GPFA 2ZUSA 2V5CA 1AVAA 3JUGA 3AMDA 1V3HA 1DWHM 3AICA 1CGTA 2YA0A 3WD4A 1HJUA 3A4AA 4DWSB 1W3HA 1E72M 1IV8A 4AZBA 1UUQA 4BCEA 4M81A 1E70M 1XV8A 3N11A 4AZGA 2OSWA 3SCUA 1QHOA 4HU8A 4CU8A 3CZJA 1EXPA 3D3AA 3OLEA 2CHNA 1B90A 1UR4A 1UR0A 1NOUA 1MWOA 3FY1A 4M82A 3VO0A 1MVYA 1XHGA 5I3DA 4GO9A 2D3NA 2FH8A 2W5FA 5DT7A 2DT1A 4BZYA 5JIPA 2EQDA 2MANA 4PBGA 1X1NA 4UFKA 2GK1A 2VCAA 5LA1A 2ZE0A 2DT0A 1IT0A 4JHZA 3MSDA 4UFIA 3T09A 1C93A 1QW8A 2JF7A 5GQBA 2ZXBA 4W7WA 2J75A 2EO7A 1V02A 3N17A 4UFMA 3KL0A 1GHSA 3VGHA 2J7CA 5DF0A 3OLIA 1H09A 4HTYA 4TOQA 1RP9A 3ARQA 3ZJKA 1UWIA 5CPSA 5GPRA 3NSXA 2JALA 3B8SA 2WC3A 1VENA 4IPLA 4IISA 4AWEA 2BVYA 4FLSA 2O9OA 4E8CA 2VMFA 1KCKA 4F9JA 1VFFA 2WCAA 1CXFA 3WD1A 3VMPA 4RE4A 3F5LA 4W8BA 3VIPA 3NCOA 4BF7A 3LPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W37 A;  3WQ8 A;  1H49 A;  4UQD A;  4OKD A;  1BG4 A;  1AMY A;  2WB5 A;  5A6M A;  1WAW A;  4W85 A;  1KWK A;  3SUU A;  4BQ5 A;  2YL8 A;  4ZE5 A;  3WH8 A;  1FHL A;  2XWD A;  1KQY A;  2CHO A;  1IZK A;  1QI3 A;  1LWJ A;  4H2C A;  4JKM A;  3DYO A;  1UOK A;  4KGL A;  1HKJ A;  1KWG A;  1B9Z A;  2J25 A;  4EE9 A;  1W9D M;  1ZBC A;  5BRP A;  3LPG A;  4ZFM A;  1F4A A;  1HX0 A;  1QNS A;  3UG3 A;  2CBV A;  4J3V A;  1OCQ A;  1AQM A;  1B0I A;  1HKI A;  3VMN A;  4CGT A;  5A2A A;  4UTF A;  4PMN A;  1GQI A;  3CBW A;  2HVM A;  2G4F A;  4W5U A;  3QOM A;  2WLZ A;  1JYV A;  4AZI A;  2XG9 A;  4GI8 A;  1JL8 A;  3K8K A;  1HL8 A;  2J78 A;  4H7V A;  2X09 A;  5E9A A;  3WY1 A;  4MB4 A;  3MS8 A;  2X2Y A;  4P7N A;  4PMQ A;  3QHO A;  2UY2 A;  3CHC A;  1WZK A;  1JGI A;  1MYR A;  4H8H A;  2GJP A;  2IUZ A;  3EDK A;  1EH9 A;  3WN6 A;  1I75 A;  3AHT A;  4HP5 A;  3M6D A;  3GXD A;  2VVN A;  2V3F A;  1MW2 A;  3FHQ A;  3RM9 A;  1B1Y A;  3KE0 A;  4MAV A;  2X0H A;  1N82 A;  4W7V A;  1E43 A;  2BHY A;  1HJV A;  2B31 A;  2DIJ A;  3G6M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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